MEMORIA TÉCNICA OpenREDBAG

ASOCIACIÓN IBERO-MACARONÉSICA DE JARDINES BOTÁNICOS

C/ Beato Gaspar de Bono, 646008, ValenciaValencia (ESP)

CIF: G96614045Cód. Identif.: DOC20090082

MEMORIA TÉCNICA

OpenREDBAG

PLATAFORMA DE ACCESO A DATOS DE RECURSOS FITOGENÉTICOS SILVESTRES CONSERVADOS EN BANCOS DE GERMOPLASMA DE LA REDBAG (Red Española de Bancos de Germoplasma de Plantas

Silvestres y Fitorrecursos Autóctonos)

CÓDIGO DE PROYECTO: PRCV00115CONVOCATORIA AYUDAS: 2013PERIODO EJECUCIÓN: 2014

www.redbag.es/openredbag

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MEMORIA TÉCNICA

Convocatoria de Ayudas de la Fundación Biodiversidad, en Régimen de Concurrencia Competitiva, para la Realización de Actividades en el Ámbito de la Biodiversidad Terrestre, Biodiversidad Marina y Litoral, el Cambio Climático y la Calidad Ambiental.

Título del proyecto: OpenREDBAG “Apertura de datos de la Red Española de Bancos de Germoplasma de Plantas Silvestres y Fitorre-cursos autóctonos”Referencia del proyecto: PRCV00115Beneficiario: Asociación Ibero-Macaronésica de Jardines BotánicosLínea de actuación: Biodiversidad Terrestre (BT)Programa de la actuación: Apoyo al conocimiento y la innovación de la biodiversidad terrestre y los servicios de los ecosistemas (BT1). Año de la convocatoria: 2013Año de realización: 2014

Redacción: J. Ignacio Alonso Felpete ([email protected]). Jardín Botánico Atlántico, Gijón. Universidad de Oviedo

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TABLA DE CONTENIDOS

Introducción 7Introducción 8

¿Qué es openREDBAG? 8

¿Qué es la AIMJB y REDBAG? 9

Objetivos del proyecto 9

Evaluación de las actuaciones 13PT0. Coordinación y gestión del proyecto 14

T0-1. Coordinación del proyecto 14

Descripción de las actuaciones 14

Detalle del Desarrollo 15

Evaluación de la actuación 15

T0-2. Gestión Técnica del Proyecto 15




T0-3. Gestión de la calidad del Proyecto 22




PT1. Estado del arte, requisitos generales, mejora y adecuación de BABILONIA a la gestión de RRFFSS 23

T1-1.Definición de Estado del Arte y Análisis de requisitos de MAGRAMA y CCAA 24


T1-2. Desarrollo de la Arquitectura de alto nivel del proyecto 29

T1-3. Especificación de vocabularios para el proyecto y adecuación de la plataforma BABILONIA 30



PT2. Adecuación e importación de datos de RRFFSS dentro de la plataforma BABILONIA 32

T2-1. Recopilación de conjuntos de datos disponibles en REDBAG y otras instituciones, adaptación de datos y mejora de los mismos. 32



Resultados 35

T2-2. Adaptación nomenclatural a los catálogos de protección de CCAA, nacional e internacional 36



Resultados 38

T2-3.Volcado de conjuntos de datos, instituciones y personas implicadas en la gestión de RRFFSS a BABILONIA. 39



PT3. Desarrollo del Portal Nacional de Acceso a Datos Abiertos sobre RRFFSS y publicación de datos 42

T3-1. Implementación del Portal de acceso a RRFFSS 43



Resultados 48

T3-2. Sistema de consulta y generador de informes con indicadores 49



Resultados 64

PT4. Difusión y explotación de los resultados del proyecto 65

T4-1 Plan de comunicación del proyecto 65

T4-2 Divulgación de la plataforma por parte de REDBAG 67

Conclusiones y valoracion final 69Obstáculos encontrados 73Dificultades en el periodo de ejecución estimado 74

Obstáculos en el acceso a la información 74

Dificultades técnicas 75

Anexo de documentos 77

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LISTADO DE ACRóNIMOS UTILIzADOS EN EL TExTO

ABS: Access and Benefit Sharing.

AFA: Atlas de Flora Amenazada.

AIMJB: Asociación Íbero-Macaronésica de Jardi-nes Botánicos.

API: Application Programming Interface.

BG: banco de germoplasma.

CCAA: Comunidades Autónomas.

CNRF: Centro Nacional de Recursos Fitogenéti-cos.

EU: European Union (Unión Europea, UE).

FAO: Food and Agriculture Organization.

GBIF: Global Biodiversity Information Facility.

GSPC: Estrategia Global para la Conservación de Plantas.

IEPNB: Inventario Español del Patrimonio Natu-ral y la Biodiversidad.

INIA: Instituto Nacional de Investigación y Tec-nología Agraria y Alimentaria.

IPT: Integrated Publishing Toolkit.

JB: Jardín botánico.

MAGRAMA: Ministerio de Agricultura, Alimen-tación y Medio Ambiente.

REDBAG: Red Española de Bancos de Germo-plasma.

RRFF: recursos fitogenéticos.

RRFFSS: Recursos Fitogenéticos Silvestres.

SIG: Sistema de Información Geográfica.

LISTADO DE hIPERVíNCULOS MENCIONA-DOS EN EL TExTO

Grupo de google del proyecto: https://groups.google.com/forum/?hl=es#!forum/openred-bag

Presentación final del proyecto a MAGRAMA: http://slides.com/nachofelpete/openredbag/live

Página web del proyecto: www.redbag.es/op-enredbag

Librería javascript de conversion de coordena-das: http://proj4js.org/

Plataforma BABILONIA: http://aimjb.net/babilo-nia

Servidor IPT de la AIMJB: http://www.aimjb. net:8080/ipt/

Sitio web del proyecto Anthos: http://anthos.es

Portal de acceso a datos del proyecto OpenRE-DBAG: http://redbag.es/openredbag/portal

Página con información de centros con RRFFSS: http:// redbag.es/openredbag/centros.php

Presentación del proyecto en el XIII Simposio de la AIMJB, Lisboa 22-26 de septiembre 2014: http://html5slides.pageforest.com/docs/na-chofelpete-3087/slides - 1

Introducción

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Introducción

La conservación ex-situ de Recursos Fitogenéticos Silvestres (RRFFSS) se postula como una herramienta eficaz contra la lucha ante la pérdida de biodiversidad. Los bancos de germoplasma o bancos de semillas (si su función es el almacenamiento de estas formas de multiplicación), son los centros en los que se lleva a cabo este tipo de medidas, junto con los jardines botánicos que se encargan del mantenimiento y multiplicación de ejemplares vivos.

A diferencia de otros Estados miembros de la Unión Europea (EU), la conservación de los RRFFSS en España no está gestionada directamente por una única institución sino que son las Co-munidades Autómas (CCAA) las que tienen en último término el poder de legislar y asegurar que su patrimonio genético sea conservado. Sobre las CCAA recae, de este modo, la responsabilidad directa de conservación de su biodiversidad, sin menoscabo de las normativas nacionales, euro-peas e internacionales que regulan del mismo modo en sus respectivos marcos competenciales.

En el Estado español, la conservación de los RRFFSS se lleva a cabo por diferentes centros sin que exista, salvo concretas excepciones, un control adecuado ni un conocimiento actualizado sobre aquello que se está conservando en cada momento, ya que la comunicación entre centros de conservación y organismos responsables de su gestión se realiza de manera muy diferente en cada CCAA sin que exista homogeneidad en la información gestionada por cada administración.

Conscientes de este hecho y de la urgente necesidad de facilitar las herramientas necesarias que permitan conocer de primera mano el material genético que se conserva en los bancos de semillas nacionales, surge la idea de promover desde la Red Española de Bancos de Germoplasma (REDBAG) incluida dentro de la Asociación Íbero-Macaronésica de Jardines Botánicos (AIMJB) el desarrollo de un portal de acceso a la información que se gestiona desde estos centros de con-servación. Esto facilitará a las instituciones responsables, investigadores y público en general, la información necesaria que permita conocer en cada momento el estado actual de conservación de nuestro patrimonio genético vegetal y sobre todo aquel al que tiene que ver con especies de flora que, por diversos motivos, se encuentra amenazada o está sujeta a protección en el territorio español.

Esta facilitación de la información contenida en los bancos de germoplasma de la REDBAG justifica el empleo del nombre OpenREDBAG, en alusión a la apertura de datos que desde esta asociacón se pretende realizar.

¿Qué es openREDBAG?

OpenREDBAG es un proyecto de la Asociación Ibero-Macaronésica de Jardines Botánicos (AIMJB) de-sarrollado a través de la Red Española de Bancos de Germoplasma de Plantas Silvestres y Fitorrecursos Au-tóctonos (REDBAG).

El proyecto busca hacer accesible, mediante el de-sarrollo de un portal Web, la información que se tiene

en los bancos de germoplasma sobre los recursos fitogenéticos silvestres que se están conservan-do en los bancos de esta red.

Este proyecto, que se ha desarrollado durante el año 2014, cuenta con el apoyo del Ministerio de Agricultura, Alimentación y Medio Ambiente a través de la Fundación Biodiversidad y se ha

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financiado con el apoyo obtenido a través de la Convocatoria de ayudas 2013 de esta fundación.

¿Qué es la AIMJB y REDBAG?

La AIMJB es una asociación que agrupa a la mayoría de Jardines Botánicos de España y Portu-gal (Península Ibérica y archipiélagos macaronési-cos) que tiene como finalidad potenciar y promo-ver a los JBs como centros de conservación de la biodiversidad, educación ambiental, investigación, cultura y patrimonio; así como su divulgación en la sociedad. Esta asociación se fundó en el año 1985 y a ella pertenecen tanto socios numerarios (aquellos que cumplen con las condiciones estableci-das en su reglamento) como socios colaboradores y honorarios (no necesariamente jardines botá-nicos pero sí instituciones que comparten objetivos de conservación vegetal). La AIMJB ha desa-rrollado en los últimos años una plataforma Web que permite, a sus socios y a otras instituciones, la informatización de sus colecciones de biodiversidad (entre ellas los bancos de germoplasma) bajo criterios comunes. Esta plataforma ha recibido el nombre de BABILONIA y servirá de base al desarrollo del proyecto openREDBAG.

La REDBAG es una red de trabajo constituida dentro del seno de la AIMJB que agrupa a los miembros españoles de la AIMJB que tengan un Banco de Germoplasma (BG), así como por aque-llos Bancos que dependientes de otras instituciones distintas a Jardines Botánicos sean igualmen-te activos en la gestión de Especies Silvestres y otros recursos fitogenéticos (RRFF).

Objetivos del proyecto

Los objetivos específicos del proyecto se pueden resumir del siguiente modo:

Este primer objetivo específico del proyecto OpenREDBAG tiene que ver con la necesidad de desarrollar una iniciativa común en lo relativo a la gestión de los RRFFSS en España que surge de la AIMJB y de la REDBAG, como actor clave en el desarrollo de los indicadores que se proponen en el componente 3.a Inventario Español de Bancos de Material Biológico y Genético referido a Especies Silvestres según se cita en el Informe 2012 sobre el estado del patrimonio nacional y la biodiversidad en España, en los siguientes términos:

“La Asociación Íbero-Macaronésica de Jardines Botánicos cuenta con la Red Española de Bancos de Germoplasma de Plantas Silvestres (REDBAG), formada por los miembros que tienen un banco de germoplasma y por otros bancos. Esta Red constituye una referencia fundamental ya que agrupa las principales instituciones implicadas en la conservación ex situ de la diversidad vegetal silvestre en Es-

OE1. Identificar, solucionar y mejorar los procesos de manejo de datos sobre RRFFSS para el desarrollo del Inventario Español de Bancos de Material Biológi-co y Genético de Especies Silvestres y el cumplimiento de los objetivos naciona-les de acuerdo a la Estrategia Global para la Conservación de Plantas (GSPC).

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paña.”

De acuerdo a los términos de ese mismo informe y a lo recogido en la normativa que lo regula el Inventario Español de Bancos de Material Biológico y Genético de Especies Silvestres se estable-ce como una red con información relativa a los centros oficiales que albergan material biológico y genético de especies silvestres, al catálogo del material genético y biológico existente en cada banco y a los listados de taxones silvestres para los que existe material biológico y genético con-servado.

Se establece como prioritaria la integración de material biológico y genético de taxones au-tóctonos de flora y fauna silvestres amenazadas, tomando como referencia el Listado de Espe-cies en Régimen de Protección Especial y el Catálogo Español de Especies Amenazadas. Dentro de este grupo de especies, tendrán especial atención para la reserva de material genético y bioló-gico las especies y subespecies endémicas a distinto nivel regional o estatal.

El inventairo se estructura como una base de datos registrada. Su actualización será conti-nua, y las comunidades autónomas suministrarán la información pertinente con una periodicidad de, al menos, 5 años.

Este segundo objetivo específico dentro del proyecto OpenREDBAG constituye la base sobre la que se asienta el mismo. La corriente opendata que impregna toda la información que se ge-nera desde las instituciones públicas también llega a los generadores de información básica sobre biodiversidad (colecciones biológicas entre ellas) y la REDBAG entiende que la publicación y facili-tación del acceso a estos datos registrados en sus colecciones supondrá una ayuda en la toma de decisiones de los gestores de la biodiversidad dentro del ámbito de los RRFFSS.

Proyectos como BABILONIA, una aplicación generada desde la AIMJB para la gestión de colec-ciones biológicas en Jardines Botánicos, pretendían del mismo modo la unificación de herramien-tas y criterios a la hora de informatizar los datos de las colecciones biológicas, con el ánimo de que esta uniformización de criterios facilitara en el futuro, como es el caso, la apertura y difusión de la información contenida en sus colecciones. La AIMJB y la REDBAG no son ajenos tampoco a otras iniciativas de caracter supranacional que tienen como finalidad la apertura de información sobre datos de biodiversidad, como es el caso de GBIF (Global Biodiversity Information Facility). En el marco de OpenREDBAG se ha hecho uso de la tecnología que esta iniciativa ha puesto a dis-posición de todos los usuarios para buscar, en la medida de lo posible, la mayor sinergia entre ini-ciativas nuevas e iniciativas ya consolidadas, como GBIF, en el ámbito de la publicación de datos.

En este sentido la AIMJB ha puesto a punto su propio Integrated Publishing Toolkit (IPT) que permite dara acceso a los datos de las colecciones de germoplasma, de los miembros de la RED-BAG.

OE2. Disponibilizar de manera abierta los datos de las instituciones implica-das en la conservación de RRFFSS dentro de la REDBAG.

OE3. Desarrollo de un Portal Nacional de Acceso a RRFFSS que ayude a resol-ver las necesidades que MAGRAMA, CCAA y otros organismos puedan tener en este dominio.

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El tercer objetivo de OpenREDBAG desarrolla la herramienta que servirá para facilitar el acce-so a la información que se tiene sobre el material biológico conservado en bancos de germolasma.

Esta herramienta, desarrollada con aplicaciones y sotware openSource, hace uso de moder-nas tecnologías web que permiten un uso adapatativo en diferentes dispositivos (responsive web) y de bases de datos no relacionales que dan flexibilidad a la hora de utilizar la información propor-cionada por las diferentes instituciones que participan en el proyecto. El desarrollo del software que da soporte al portal de acceso a datos ha sido encargado a la empresa TRIARI Labs. con expe-riencia en la creación de herramientas de visualización de datos y en el manejo de información de diferentes fuentes, mediante la integración de APIs de terceros.

Evaluación de las actuaciones

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PT0. Coordinación y gestión del proyecto

El paquete de actividades de gestión y coordinación del proyecto PT0 se han llevado a cabo desde el Jardín Botánico Atlántico (Gijón) ya que en esta institución recae acualmente la presiden-cia de la AIMJB y desde ella se han llevado a cabo la redacción de la propuesta inicial, el seguimien-to de las acciones y la redacción del presente informe.

La gestión organizativa ha recaído en Álvaro Bueno Sánchez, presidente por delegación de la AIMJB y J.I. Alonso Felpete (ambos pertenecientes al Jardín Botánico Atlántico-Universidad de Oviedo) y a Inmaculada Porras, en calidad de coordinadora de la REDBAG y miembro del Real Jar-dín Botánico de Alcalá.

La gestión técnica del proyecto la ha llevado a cabo J.I. Alonso Felpete, del Jardín Botánico Atlántico-Universidad de Oviedo.

La gestión de la calidad del proyecto se ha llevado a cabo de manera coordinada entre J. Ig-nacio Alonso Felpete y diferentes miembros de la AIMJB a través los canales de seguimiento del proyecto establecidos en la fase de evaluación y prototipado del portal y que se han centrado en la creación de un espacio de trabajo compartido mediante la herramienta Google Groups.

El grupo de trabajo creado es un espacio administrado, es decir, requiere petición y admisión dentro del grupo para participar en sus debates y es accesible a través del siguiente recurso:

https://groups.google.com/forum/?hl=es#!forum/openredbag

A continuación se describen las actuaciones previstas, se detalla el desarrollo de las mismas y se evalúan los resultados obtenidos.

T0-1. Coordinación del proyecto

Las actividades de coordinación se han llevado a cabo durante todo el tiempo de ejecución del proyecto y han estado enfocadas a su gestión y a la consecución de los objetivos propuestos inicialmente.

Descripción de las actuaciones

1. Reunión inicial de coordinación con el Ministerio de Agricultura, Alimentación y Medio Ambiente celebrada el día 4 de febrero de 2014 en las dependencias de la Dirección Ge-neral de Medio Ambiente. Asistentes: Alvaro Bueno Sánchez, Inmaculada Porras, J.I. Alon-so Felpete, Daniel Serrano Gadea, Juan Manuel Villares y Tania López-Piñeiro.

2. Asistencia a la reunión informativa sobre los procedimientos de seguimiento y justifica-ción técnica y económica con la Fundación Biodiversidad el día 5 de febrero de 2014.

3. Coordinación entre los miembros de la REDBAG para la realización de este proyecto me-diante la firma de un acuerdo entre diferentes Jardines de la AIMJB y en el que se vincula a personal de cada uno de estos centros con las tareas a desarrollar.

4. Invitación a participar en la reunión inicial del Grupo de Trabajo de Conservación Vegetal en el seno del Comité de Flora y Fauna de la Comisión Estatal para el Patrimonio Natural y la Biodiversidad para presentar el proyecto OpenREDBAG a las CCAA, celebrada el día 29 de abril de 2014.

5. Redacción de un dossier sobre el proyecto OpenREDBAG que ha sido difundido en el Gru-

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po de Trabajo de Conservación Vegetal en el seno del Comité de Flora y Fauna de la Comi-sión Estatal para el Patrimonio Natural y la Biodiversidad.

6. Solicitud de datos del proyecto “Atlas de Flora Amenazada de España” a la Subdirección General del Medio Natural para su integración en el portal de datos.

7. Comunicación con la Fundación Biodiversidad para la introducción de modificaciones en el título del proyecto, resolución de problemas encontrados durante la ejecución del mis-mo y apoyo en el proceso de justificación económica.

8. Contratacion externa para la realización de las acciones.

9. Comunicación con centros de conservación de RRFFSS no incluidos en la AIMJB para pro-mover su integración en esta red y/o su participación en el proyecto OpenREDBAG.

10. Solicitud de datos a la Junta de Andalucía para su integración en el portal de datos.

11. Reunión final de presentación de resultados y obtención de feedback ante el MAGRAMA, celebrada el día 12 de diciembre de 2014. La presentación realizada puede consultarse en el siguiente link http://slides.com/nachofelpete/openredbag/live .

Detalle del Desarrollo

No se precisan.

Evaluación de la actuación

Esta actividad de coordinación ha supuesto un gran esfuerzo debido al gran número de par-ticipantes y a la propia naturaleza de la AIMJB. En términos generales se evalúa positivamente el desarrollo de coordinación por el grado de compromiso alcanzado entre todos los socios y por la apertura de canales de comunicación con MAGRAMA que facilitan el acercamiento entre necesidades de gestión y proveedores de información, para dar respuesta a las necesidades que demanda el Inventario Español de Bancos de Material Biológico y Genético de Especies Silvestres.

El proyecto OpenREDBAG ha sido dado a conocer a las administraciones públicas competen-tes en la gestión de RRFFSS, esto es CCAA y MAGRAMA.

Se ha conseguido la participación e integración de nuevos miembros dentro de la REDBAG movidos por el deseo de participar en el proyecto OpenREDBAG, lo cual pone de manifiesto el interés por los miembros de esta asociación en hacer públicos los datos de las colecciones de germoplasma. Estos nuevos centros son: IMIDA (Instituto Murciano de Investigación y Desarrollo Agroalimentario), la Estación Biológica de Torretes (dependiente de la Universidad de Alicante y el Ayuntamiento de Ibi) y el CIALE (Instituto Hispano-Luso de Investigaciones Agrarias) que dispone del Banco de Germoplasma de la Universidad de Salamanca.

Resultados

No cuantificables en términos numéricos.

T0-2. Gestión Técnica del Proyecto

La gestión técnica del proyecto ha permitido la comunicación entre la AIMJB y el equipo de desarrollo del portal de acceso a datos. El traslado de información y de necesidades se ha reali-zado en diferentes reuniones técnicas que se han hecho más numerosas durante la fase final de desarrollo del proyecto.

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Organizan Con el apoyo de

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DOSSIER INFORMATIVO PROYECTO openREDBAG1: Plataforma de acceso a datos de recursos fitogenéticos silvestres conservados en bancos de germoplasma de la REDBAG.

1.-‐¿Qué es openREDBAG?

openREDBAG es un proyecto de la Asociación Ibero-‐Macaronésica de Jardines Botánicos (AIMJB) desarrollado a través de la Red Española de Bancos de Germoplasma de Plantas Silvestres y Fitorrecursos Autóctonos (REDBAG).

Busca hacer accesible, mediante el desarrollo de un portal Web, la información existente sobre los recursos fitogenéticos silvestres que se están conservando en los bancos de germoplasma esta red.

Este proyecto, que se desarrollará durante el año 2014, cuenta con el apoyo del Ministerio de Agricultura, Alimentación y Medio Ambiente a través de la Fundación Biodiversidad.

Se financia a través de la Convocatoria de ayudas 2013 de la Fundación Biodiversidad.

2.-‐¿Qué es la AIMJB y REDBAG?

La AIMJB es una asociación que agrupa a la mayoría de Jardines Botánicos de España y Portugal (Península Ibérica y archipiélagos macaronésicos) que tiene como finalidad potenciar y promover a los jardines botánicos como centros de conservación de la biodiversidad, educación ambiental, investigación, cultura y patrimonio.

Esta asociación se fundó en el año 1985 y a ella pertenecen tanto socios numerarios (aquellos que cumplen con las condiciones establecidas en su reglamento), como socios colaboradores y honorarios (no necesariamente jardines botánicos pero sí instituciones que comparten objetivos de conservación vegetal).

1 http://redbag.es/openredbag

Figura1. Dossier informativo del proyecto presentado al MAGRAMA y a las CCAA en el seno del Grupo de Trabajo de Conservación Vegetal del Comité de Flora y Fauna de la Comisión Estatal para el Patrimonio Natural y la Biodiversidad.

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La REDBAG es una red de trabajo constituida dentro del seno de la AIMJB que agrupa a los miembros españoles de la AIMJB que tengan un Banco de Germoplasma (BG), así como a aquellos Bancos que, dependientes de otras instituciones distintas a Jardines Botánicos, sean igualmente activos en la gestión de Especies Silvestres y otros recursos fitogenéticos (RRFF).

Los bancos que componen la REDBAG son:

-‐ Jardín Botánico Canario Viera y Clavijo (Gran Canaria). -‐ Banco de Germoplasma Vegetal Andaluz (Córdoba). -‐ Jardí Botànic de Sóller (Mallorca). -‐ Jardí Botànic de la Universitat de València (Valencia). -‐ Real Jardín Botánico de Madrid (Madrid). -‐ Banco de Germoplasma Vegetal de la Universidad Politécnica de Madrid

(Madrid). -‐ Jardí Botànic “Marimurtra” de Blanes (Girona). -‐ Jardín Botánico de la Universidad de Alcalá (Alcalá de Henares). -‐ Jardín Botánico Atlántico (Gijón). -‐ Jardín Botánico de Castilla-‐La Mancha (Albacete). -‐ Jardín Botánico de Barcelona (Barcelona). -‐ Jardín Botánico de Olarizu (Vitoria-‐Gasteiz). -‐ Banco de Germoplasma del País Vasco (Jardín Botánico de Iturrarán, Guipúzcoa) -‐ Jardín Botánico “La Concepción” (Málaga). -‐ Estación Biológica de Torretes (Alicante) -‐ Jardín Botánico de la Orotava (Tenerife) -‐ A este proyecto se ha unido el IMIDA (Murcia)

La naturaleza jurídica de estos bancos es muy diversa, encontrando en la Red bancos cuya gestión depende directamente de una comunidad autónoma [p.ej. Banco de Germoplasma Vegetal Andaluz], de una entidad municipal [p.ej. Jardín Botánico Atlántico o Jardín Botánico de Olarizu] o, en muchos casos, de fundaciones [p.ej. Jardí Botànic Marimurtra] u otro tipo de entidades como diputaciones [p.ej. Banco de Germoplasma del País Vasco].

3.-‐¿Qué busca el proyecto openREDBAG?

La AIMJB ha desarrollado en los últimos años una plataforma Web que permite a sus socios y a otras instituciones la informatización bajo criterios comunes de sus colecciones de biodiversidad (entre ellas los bancos de germoplasma). Esta plataforma ha recibido el nombre de BABILONIA y servirá de base al desarrollo del proyecto openREDBAG.

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openREDBAG plantea un sistema de acceso a la información, que será público y estará basado en la integración de diferentes conjuntos de datos permitiendo el enriquecimiento de los mismos.

Con ello, se contribuirá a conocer la situación real del actual estado de conservación de material genético de especies vegetales silvestres en los bancos de germoplasma nacionales, representados mayoritariamente por la REDBAG.

Esta información será de gran utilidad para, entre otros, orientar los esfuerzos en materia de conservación ex situ, evaluar la eficacia de las acciones emprendidas, conocer las necesidades reales de gestión de cada taxón, optimizar las inversiones y cubrir los vacíos existentes.

4.-‐¿Cuál es el objetivo general del proyecto openREDBAG?

El proyecto desarrollará una plataforma de datos abiertos para hacer accesible información sobre el material vegetal silvestre conservado en los bancos de germoplasma de la REDBAG.

El principal objetivo consiste en la apertura de datos sobre recursos fitogenéticos silvestres para poder utilizarlos con distintos fines.

La mejora en la accesibilidad a los datos puede proveer servicios de valor añadido para, por ejemplo, distintos usuarios (administraciones, investigadores, etc).

Con este proyecto se avanzará significativamente en el desarrollo y aplicación del artículo 60 de la Ley 42/2007, de 13 de diciembre, del Patrimonio Natural y de la Biodiversidad.

5.-‐¿Qué se puede conseguir con openREDBAG?

Una vez se hayan hecho accesibles los datos sobre los recursos fitogenéticos silvestres conservados en bancos de germoplasma se podrá, entre otros:

• Evaluar el grado de conocimiento disponible sobre los recursos fitogenéticos silvestres conservados, así como su calidad (nº de taxones, diversidad genética, poblaciones conservadas, cantidad de material conservado, disponibilidad, conocimientos sobre su propagación, etc.).

• Optimizar los esfuerzos de las administraciones en materia de conservación de flora.

• Disponer de un sistema con información actualizada sobre las necesidades de gestión de cada especie.

• Nutrir los componentes del inventario Español de Patrimonio Natural y la Biodiversidad.

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• Contribuir a la conservación de la suficiente diversidad genética en base al número de poblaciones silvestres cuyo material genético está siendo conservado en la actualidad.

• Proveer servicios de valor añadido basados en función del usuario (diferenciando el uso que se pueda hacer de los datos en función de sus características).

• Facilitar la reutilización de la información generada (mediante el uso de identificadores de recursos únicos).

• Contribuir a la difusión y concienciación del valor de los recursos genéticos, incluyendo aspectos relativos a su acceso y al reparto de beneficios derivados de su utilización.

6.-‐Principales resultados esperados

(1) Datasets con información relativa a los bancos de germoplasma y a los taxones conservados, así como información asociada.

(2) Adaptación de la plataforma BABILONIA para la mejor integración de los datos de las accesiones custodiadas en los Bancos de Germoplasma y su publicación de acuerdo a estándares. (BABILONIA es una herramienta on line desarrollada por la AIMJB para la informatización de colecciones biológicas).

(3) Conseguir que al menos el 25% de las muestras de conservadas en losa bancos de la REDBAG esté disponible a través del portal.

(4) Directorio actualizado y registro de organizaciones y personal vinculado a la gestión de estos recursos en España (instituciones científicas, administraciones).

(5) Portal de Acceso a Datos sobre Recursos Fitogenéticos Silvestres conservados en los bancos de la REDBAG, que permita la publicación de los datos incorporados a la plataforma BABILONIA y su utilización por parte los interesados (administraciones, comunidad científica, etc.).

(6) Herramientas de visualización basadas en indicadores para valorar aspectos relacionados con la conservación vegetal.

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Enlaces WEB

(openREDBAG) Sitio web del proyecto (http://redbag.es/openredbag)

(AIMJB) Asociación Ibero-‐Macaronésica de Jardines Botánicos (http://jbotanicos.org/)

(REDBAG) Red Española de Bancos de Germoplasma de Plantas Silvestres y Fitorrecursos Autóctonos (http://www.redbag.es/)

Contactos

J. Ignacio Alonso Felpete (Jardín Botánico Atlántico): Responsable técnico del proyecto [email protected]

Álvaro Bueno Sánchez (Jardín Botánico Atlántico): Presidente de la Asociación Ibero-‐Macaronésica de Jardines Botánicos [email protected]

Inmaculada Porras Castillo (Real Jardín Botánico Juan Carlos I): Coordinadora de la Red Española de Bancos de Germoplasma de Plantas Silvestres y Fitorrecursos Autóctonos [email protected]

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1. Definición de requisitos mínimos del portal de acceso a datos, recogido en los contratos realizados con las empresas externas de desarrollo.

2. Solicitud de información a MAGRAMA sobre la posibilidad de alojamiento de la aplicación en el servidor de MAGRAMA. Petición de requisitios técnicos para valorar esa posibilidad y evaluación de la respuesta.

3. Búsqueda de alternativas para la correcta gestión de los datos procedentes de las colec-ciones de germoplasma gestionadas por los bancos de la REDBAG.

4. Reuniones de coordinación con las contratas externas para el desarrollo de las operacio-nes de mejora en la plataforma Babilonia y para el desarrollo del portal.

5. Establecer enlaces de comunicación entre GBIF España y el equipo de desarrolladores de TRIARI Labs para resolver problemas técnicos con el uso de las API de GBIF.

6. Evaluación del uso de Integrated Publishing Toolkit (IPT) externo o de la instalación de un IPT en el servidor de la AIMB.

7. Desarrollo del portal OpenREDBAG para dar a conocer el proyecto. El sitio web del pro-yecto se ha subordinado al dominio redbag. Es accesible a través del siguiente link: http://www.redbag.es/openredbag

8. Desarrollo del espacio de trabajo https://groups.google.com/forum/?hl=es#!forum/op-enredbag para maneter informados a los participantes en el proyecto y recoger sus dudas y sugerencias.


No se precisan.


La gestión técnica del proyecto se ha desarrollado desde el Jardín Botánico Atlántico, a través del personal científico de la Universidad de Oviedo vinculado al mismo. Los resultados de la ges-tión has sido satisfactorios, habida cuenta que el objetivo último de desarrollo de una herramienta web para conocer el estado de conservación ex-situ del patrimonio vegetal, se ha logrado.

El éxito obtenido en esta tarea ha estado condicionado por el conocimiento previo adquirido dentro del grupo de trabajo Bases de Datos y SIG de la AIMJB, que ha dado soporte al proyecto. El conocimiento de las herramientas de partida, como la aplicación BABILONIA y la experiencia de los equipos externos contratados para el desarrollo del portal de datos han facilitado la gestión técnica del proyecto. La proximidad espacial ha permitido el desarrollo de numerosas reuniones técnicas para definir y aclarar conceptos sobre biodiversidad, de dificil compresión en entornos ajenos a los de este ámbito.

Cabe destacar dentro de esta actividad el apoyo prestado por el nodo nacional de GBIF, del que es responsable el Dr. Franciso Pando. En todo momento OpenREDBAG ha contado con el so-porte y apoyo de GBIF-España para la resolución de problemas de índole técnico y ha facilitado las herramientas y mecanismos para la puesta en funcionamiento del IPT de la AIMJB (ver Anexo 6).

Resultados

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T0-3. Gestión de la calidad del Proyecto

Dentro de esta acción se incluyen todas las actividades relacionadas con la validación de los datasets que se han utilizado en el proyecto y la evaluación de la calidad de los resultados espera-dos, incluido el portal de acceso a datos.

Esta labor ha sido llevada a cabo por el personal de los diferentes Jardines Botánicos involu-crados en el desarrollo del proyecto y por el responsable técnico del mismo.


1. Validación de la información proporcionada por el MAGRAMA en la base de datos resul-tante del proyecto Atlas de Flora Amenazada de España (AFA).

2. Revisión y validación de los datasets relativos a los catálogos de protección de flora vascu-lar de las diferentes CCAA, del Estado Español, de la Directiva Hábitats y de las listas rojas incorporadas a la base de datos del proyecto.

3. Revisión nomenclatural e incorporación de sinonimias a la base de datos incorporada al proyecto.

4. Revisión de los datasets proporcionados por los diferentes Jardines Botánicos a través de la plataforma BABILONIA y por otros medios (hojas de cálculo, bases de datos externas, etc.).

5. Revisión y validación de datos georreferenciados incluidos en los datasets facilitados por los diferentes Jardines e instituciones implicados.

6. Revisión del módulo de conversión de datos geográficos incorporado a la aplicación BA-BILONIA.

7. Revisión de los nuevos campos de información incorporados a BABILONIA para cumplir con la información requerida por el standard DarwinCore.

8. Generación y revisión de las consultas efectuadas a BABILONIA para la generación de los datasets que son facilitados a través del IPT de la AIMJB.

9. Información sobre el uso de herramientas de validación de calidad de los datos para su uso por los gestores de colecciones de RRFFSS.

10. Revisión y validación de los metadatos incorporados a cada una de las colecciones que publican sus datos a través del IPT de la AIMJB.

11. Revisión y testeo del portal de acceso a información sobre RRFFSS generado por el pro-yecto.

12. Revisión, validación y corrección de la nomenclatura incorporada al portal de accceso a información sobre RRFFSS para su correcta interpretación desde el portal de GBIF. Esta fase implica la asignación de códigos de identificación (NUBS) a aquellos táxones que no


No se precisan.


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La gestión de la calidad del proyecto se ha realizado de manera continuada durante todo el periodo de ejecución del mismo con el fin de minimizar las posibles deficiencias en cada una de las fases de desarrollo.

La evaluación de esta actuación puede considerarse satisfactoria si tenemos en cuenta las numerosas correcciones que se han llevado a cabo sobre los datasets y sobre los productos finales generados. La calidad del proyecto en lo que se refiere a las tecnologías aplicadas para el desarro-llo del portal de acceso a datos es muy alta ya que el equipo de desarrollo ha integrado herramien-tas que permiten la gestión de grandes cantidades de datos sin que ello repercuta sensiblemente en la velocidad de respuesta desde el servidor al cliente.

El alojamiento de la aplicación, también en aras de dar una mayor calidad, se ha realizado en un servidor con altas prestaciones, lo que facilita también el desarrollo de consultas a gran velo-cidad.

Los diferentes jardines botánicos han participado en el seguimiento de la calidad del proyec-to realizando propuestas de mejora en la fase de testeo que han sido incorporadas en la fase de producción final de la aplicación.

Resultados


PT1. Estado del arte, requisitos generales, mejora y ade-cuación de BABILONIA a la gestión de RRFFSS

El paquete de trabajo PT1 se centra en el estudio del estado del arte, fijar los requisitos gene-rales del proyecto, analizar la situación actual y acometer las necesidades de mejora y adecuación de la plataforma BABILONIA a la gestión de los RRFFSS mediante la incorporación de herramientas que permitan gestionar desde BABILONIA la integración de los Jardines Botánicos al IPEN (sólo si dispone de reglamentación necesaria), para cumplir con los criterios acceso y reparto de bene-ficios (Access and Benefit Sharing, ABS) y desarrollo una arquitectura de alto nivel para todo el proyecto.

Las actividades concretas en PT1 se definieron del siguiente modo:

(T1-1) Definición de Estado del Arte y Análisis de requisitos de MAGRAMA y CCAA: mediante una reunión en Madrid con representantes del MAGRAMA (gastos incluidos en viajes y dietas) se analizarán y documentarán las necesidades concretas de MAGRAMA de acuerdo a lo recogido en el Informe 2011 sobre el estado actual del IEPNB. Mediante el envío de encuestas a las diferentes CCAA se obtendrá información sobre las necesidades de gestión de las mismas en este dominio y sobre la existencia de Bancos de Germoplasma gestionados por la propia administración (a incluir en el listado de centros y personas).

(T1-2) Desarrollo de la Arquitectura de alto nivel del proyecto OpenREDBAG: en base a la in-formación obtenida por las diferentes administraciones se documentará la arquitectura de la pla-taforma de manera que en este documento de requisitos quede reflejado el contenido del portal de acceso a RRFFSS de la REDBAG.

(T1-3) Especificación de vocabularios para el proyecto y adecuación de la plataforma BABILO-NIA, de manera que se definan los estándares básicos para homogeneizar la información utilizada por el Portal de Acceso a RRFFSS y se mejore la herramienta Babilonia para facilitar su explotación.

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T1-1.Definición de Estado del Arte y Análisis de requisitos de MAGRAMA y CCAA

Esta tarea ha seguido el programa establecido y se han analizado las necesidades de MA-GRAMA a través de varias reuniones con los responsables técnicos de la Subdirección General del Medio Natural con relación al desarrollo del Inventario Español de Bancos de Material Biológico y Genético de Especies Silvestres.

Durante el período de ejecución del proyecto OpenREDBAG, el Estado Español ha ratificado (junio de 2014) la firma del Protocolo de Nagoya realizada el 21 de julio de 2011. Para dar cum-plimiento a algunas de las disposiciones del Protocolo, desde la Unión Europea se ha definido el Reglamento 511/2014 del Parlamento Europeo y del Consejo, de 16 de abril de 2014, relativo a las medidas de cumplimiento de los usuarios del Protocolo de Nagoya sobre al acceso a los recursos genéticos y participación justa y equitativa en los beneficios que se deriven de su utilización en la Unión.

Sin ser determinantes en el desarrollo de OpenREDBAG durante esta primera fase, se ha te-nido en cuenta el futuro uso que se pueda dar a la herramienta, dentro de las necesidades de gestión que la entrada en vigor del citado reglamento, en octubre de 2014, pueda tener sobre los RRFFSS conservados en los bancos de la REDBAG.


Las actividades llevadas a cabo dentro de esta tarea se pueden resumir en los siguientes pun-tos:

1. Reunión en Madrid con los responsables del MAGRAMA para exponer el proyecto Open-REDBAG y recoger sus necesidades.

2. Análisis de la situación actual de la plataforma BABILONIA para detallar las necesidades de mejora.

3. Análisis de las posibilidades de acceso a la información de las colecciones de REDBAG para plantear diferentes opciones al equipo de desarrollo informático.

4. Elaboración de borrador de requisitos de alto nivel que quedó plasmado en el contrato de asistencia externa con los equipos de desarrollo informático.

5. Asistencia y participación en las I Jornadas sobre ABS en España organizado por la Cate-dra Unesco para explicar el papel de los Jardines Botánicos y la REDBAG en la conserva-ción ex-situ de RRFFSS y el desarrollo de OpenREDBAG (ver anexo 1)


Estas tareas iniciales, previstas según el cronograma inicial en los primeros meses de proyec-to, han permitido definir desde el principio los niveles alcanzables por el portal de acceso a datos de RRFFSS.

La puesta en marcha del Grupo de Trabajo de Conservación Vegetal en el seno del Comité de Flora y Fauna de la Comisión Estatal para el Patrimonio Natural y la Biodiversidad ha permitido que la comunicación con las CCAA se lleve a cabo directamente desde el MAGRAMA.

Se ha constatado mediante las reuniones mantenidas con diferentes representantes de las CCAA, que la situación inicial de partida es bastante heterogénea.

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7 de 10

ANEXO I: ALCANCE Descripción del Proyecto “openREDBAG” “openREDBAG: una plataforma de acceso a datos sobre Recursos Fitogenéticos Silvestres conservados en Bancos de Germoplasma” es un proyecto de la Sección española de la Asociación Ibero-Macaronésica de Jardines Botánicos que ha sido financiado por la Fundación Biodiversidad para hacer accesible datos sobre las especies que se conservan en los bancos de germoplasma de la REDBAG1. El proyecto pretende desarrollar una plataforma de datos abiertos para hacer accesible información sobre el material conservado en los bancos de germoplasma de la Asociación Iberomacaronésica de Jardines Botánicos (AIMJB) incluidos dentro de la REDBAG (Red Española de Bancos de Germoplasma de Plantas Silvestres y Fitorrecursos Autóctonos) y, en la medida de lo posible, de otras instituciones implicadas en la conservación de flora silvestre; para contribuir de este modo al desarrollo del Inventario Español de Patrimonio Natural y de la Biodiversidad (IEPNB). El principal objetivo consiste en la apertura de datos sobre Recursos de Flora Silvestre, para que una vez publicados se pueda evaluar el grado de conocimiento que se tiene sobre los mismos (calidad), se mejore el acceso a los mismos y se puedan proveer servicios de valor añadido basados en el contexto del usuario (diferenciando el uso que se pueda hacer de los datos en función sus características: CCAA, MAGRAMA, Comunidad Científica, etc.). El pilar fundamental sobre el que se basa el proyecto es la plataforma Babilonia2 que surge de la necesidad de integrar, bajo una misma aplicación informática, la gran cantidad de información que es generada en los Jardines Botánicos en materia de biodiversidad. Esta herramienta informática es una base de datos on-line que permite el intercambio de información sobre los ejemplares registrados en instituciones botánicas que, en el mejor de los casos, forman una red de trabajo conjunta o tienen necesidad de conocer e intercambiar información sobre sus colecciones botánicas. Babilonia se ha desarrollado en un entorno multiplataforma mediante el uso combinado del servidor de bases de datos relacionales MySQL y la programación de páginas web en lenguaje PHP.

Objetivos específicos de Triari Labs Los objetivos específicos de Triari Labs es la ejecución del reto 5 del proyecto openREDBAG, que consiste en: ● Diseñar e implementar el Portal Nacional de Acceso a Datos sobre Recursos

Fitogenéticos Silvestres conservados en la REDBAG que permita, al menos, la publicación y visualización de datos incorporados a la plataforma Babilonia y su utilización por parte de las CCAA, MAGRAMA y comunidad científica.

1 http://redbag.es/openredbag/ 2 http://www.aimjb.net/babilonia/

Figura2. Anexo I del Contrato con TRIARI LABS donde se desarrolla la arquitectura de alto nivel para el Portal de Acceso a Datos de RRFFSS

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8 de 10

Tareas de Triari Labs dentro del proyecto “openREDBAG” A continuación se describen las tareas técnicas a realizar por TRIARI y que delimitan el alcance técnico del Proyecto objeto de este Contrato: T1. Integración de los datos de Babilonia y, en la medida de lo posible, de otras fuentes de información implicadas en la conservación de flora silvestre en el portal de datos openREDBAG. Como parte del proyecto, AIMJB desplegará localmente la plataforma Integrated Publishing Toolkit (IPT) para registrar de manera automática los datos de Babilonia en el portal de datos de la organización internacional GBIF. Este IPT también se habilitará externamente para que otras instituciones que dispongan de fuentes de información relevantes para el proyecto puedan integrarlas en el proyecto. La herramienta exporta la información en archivos de datos descritos mediante el estándar Darwin Core. La tarea de TRIARI será acceder a través del IPT a los datos sobre Recursos Fitogenéticos Silvestres en formato Darwin Core e integrar las diferentes fuentes de información para su posterior explotación en el portal. La herramienta IPT es una aplicación Java de código abierto que no dispone de API para facilitar acceso programático a los datos. Se barajan las siguientes opciones en el siguiente orden:

1. Modificar el código de la aplicación IPT para acceder de manera programática a los datos.

2. En caso de que no sea posible esta opción, se accederá directamente a los archivos Darwin Core que genera IPT para su publicación. Estos ficheros se procesarán para su carga en el portal.

3. Si por razones de despliegue y de disponibilidad de hardware, no se puede acceder al directorio donde IPT guarda internamente los archivos, los datos se integrarán desde la base de datos de Babilonia. Esta última opción elimina la posibilidad de integrar fuentes de terceros dentro del portal openREDBAG.

T2. Enriquecimiento de los datos de conservación de flora silvestres. Uno de los objetivos de este proyecto es mejorar la calidad de la información geográfica actualmente disponible en Babilonia para su consulta y visualización desde el portal de datos openREDBAG. Este enriquecimiento se realizará mediante una fuente de datos geográfica enlazada. Se ha seleccionado como primera opción el repositorio GeoNames que proporciona identificadores unívocos para entidades geográficas de cualquier división administrativa: países, regiones, ciudades, etc.; etiquetas en diferentes idiomas y enlaces directos con la Wikipedia y otras fuentes alternativas. De manera adicional, también se estudiará cómo enriquecer los datos de Babilonia con otros recursos específicos del campo de la biodiversidad, como es el caso de:

1. Índice Internacional de Nombres de Plantas (The International Plant Names Index);

2. Catálogo de especies amenazadas elaborado por la propia AIMJB. Esta información tiene gran valor para las autoridades competentes a la hora de planificar y establecer políticas de protección de flora en riesgo de extinción.

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9 de 10

El enriquecimiento de la información se realizará en el propio portal openREDBAG, por lo que no afecta a las fuentes originales: ya sea la base de datos de Babilonia o los ficheros Darwin Core generados por IPT. T3. Análisis y diseño del portal openREDBAG Esta tarea se desglosa en los siguientes puntos:

1. Análisis de los requisitos funcionales y no funcionales para el desarrollo del portal openREDBAG.

2. Análisis de los datos de flora silvestre a partir de Babilonia y del estándar de intercambio de publicación de información de biodiversidad: Darwin Core.

3. Estudio de las necesidades de representación gráfica de los datos y la definición de los indicadores más relevantes para su presentación en el portal. Esto implica el diseño de las visualizaciones y el grado de interacción deseado para el usuario: como, por ejemplo, filtros de datos, búsquedas, cambios de gráfica, etc.

4. Diseño y arquitectura del portal web de datos openREDBAG, teniendo en cuenta los requisitos identificados anteriormente y siguiendo el estudio de necesidades de representación.

T4. Construcción del portal openREDBAG El portal de datos openREDBAG se desarrollará como una aplicación web node.js con una base de datos no relacional (MongoDB) como mecanismo de persistencia, siguiendo el diseño realizado en la tarea T3. En este respositorio se almacenarán los datos resultantes de la integración realizada en la tarea T2. El portal de datos se desarrollará a partir del framework de visualización Tabulae, propiedad de TRIARI, y cuyo uso está recogido en los términos de licencia de la clásula 8ª del Contrato. La parte cliente del portal estará basada en tecnología HTML5 y Javascript, mediante el desarrollo sobre el framework AngularJS. En el caso de las visualizaciones, se utilizará tecnología vectorial SVG, que garantiza el reescalado de las representaciones sin pérdida de calidad. Además el portal openREDBAG será multidispositivo, por lo que se garantiza el acceso y el consumo a la información y las visualizaciones desde cualquier tipo de dispositivo: bien sea una tablet, un móvil o un ordenador de escritorio. Desde el punto de vista de información geográfica y mapas, el portal permitirá lo siguiente: ● El uso de capas de información geográfica (polígonos): unidades

administrativas, zonas protegidas, hábitats específicos, etc., que proporcionará AIMJB.

● Operaciones de cálculo espacial de inclusión de un punto en un polígono, en casos que no se puedan resolver por la jerarquía de GeoNames, para agregación de datos en una zona.

● Ofuscación de la posición geográfica de ciertas especies amenazadas, bien mediante distorsión de las coordenadas, bien mediante agregación de varios puntos en una zona.

T5. Publicación de los datos de conservación de flora silvestre Esta tarea consiste en hacer disponible la información del portal openREDBAG mediante los principios de “datos abiertos” para su reutilización por parte de

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terceros. Esta tarea se realizará mediante la integración de la aplicación IPT dentro del propio portal. Será necesario adaptar el estilo y diseño de la página web del IPT a la estética del propio portal, de manera que el usuario perciba esta funcionalidad de manera transparente al resto del portal. T6. Despliegue y puesta en producción del portal de datos de conservación de flora silvestre: openREDBAG Esta tarea consiste en desplegar en los servidores que gestiona AIMJB (o una entidad colaboradora) y poner en producción la aplicación del portal de datos openREDBAG. Para la correcta ejecución de la tarea, TRIARI deberá tener acceso a los servidores para realizar el despliegue o, en caso de que esto no sea posible por cuestiones de seguridad, TRIARI deberá proporcionar a AIMJB el software y las instrucciones de manera que puedan desplegar openREDBAG de manera autónoma.

Entregables Los productos finales que TRIARI deberá aportar a AIMJB son los siguientes: ● Portal web de datos que permita, al menos, la publicación y visualización de

información de flora silvestre incorporada a la plataforma Babilonia Cronograma A continuación se desglosa el calendario de ejecución, dentro del año 2014

Tareas Junio Julio Agosto Sept. Octubre Nov. Dic.

T1 X X

T2 X X

T3 X

T4 X X X X X X

T5 X X X

T6 X X

Se establece un dos hitos en el proyecto:

1. H1 (15 de septiembre de 2014): primera versión y despliegue del portal de datos.

2. H2 (15 de diciembre de 2014): versión final y despliegue del portal de datos.

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Se han podido recoger la principales necesidades de gestión de información sobre RRFFSS que se establecen en el Inventario Español de Bancos de Material Biológico y Genético de Especies Silvestres y las prioridades de actuación.

De acuerdo a las necesidades expresadas por MAGRAMA y también recogidas en el Inven-tario, el proyecto OpenREDBAG se ha centrado fundamentalmente en poder dar respuesta a las necesidades de gestión que se tienen sobre la flora protegida a nivel nacional, regional y a la flora amenazada del territorio nacional.

A propuesta de MAGRAMA se modificó el título del proyecto especificando cláramente que el portal nacional de acceso a los RRFFSS conservados es realmente un portal de acceso a la infor-mación sobre esos RRFFSS, evitando de este modo malas interpretaciones.

En términos generales podemos decir que la evaluación de esta actuación ha sido positiva.

Resultados


T1-2. Desarrollo de la Arquitectura de alto nivel del proyecto

Durante esta fase se establecen los requisistos de alto nivel de la aplicación que luego se plas-marán en el contrato de asistencia externa con las empresas de desarrollo informático.

Las actividades desarrolladas en esta tarea se resumen en los siguientes puntos:

1. Elección de un sistema de acceso a los datos y lenguaje de programación.

2. Elección de sistema de base de datos para gestionar la información.

3. Redacción de necesidades básicas del portal de acceso a datos.

4. Definición de cronograma de trabajos de acuerdo a la arquitectura propuesta.

Figura3. Extraco de la hoja de datos sobre la que se ha trabajado para determinar los campos del esquema DarwinCore que era necesario incorporar a BABILONIA. La columna “mapped to “ hace referencia a campos existentes y la columna “create into” define la tabla y nombre de campo a incorporar.

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La arquitectura de alto nivel se ha definido de acuerdo a las necesidades técnicas del portal de acceso a datos de RRFFSS y a las necesidades de gestión propuestas por MAGRAMA, esto es, dando prioridad a la información relativa a taxones incluidos en el catálogo nacional y en catálo-gos autonómicos.

Tal y como se tenía previsto en esta arquitectura se recogen los requisitos del portal de acceso a datos de RRFFSS.

El diseño de la arquitectura inicial se ha modificado a lo largo de la ejecución del proyecto para dar respuesta a necesidades concretas de adaptación de la plataforma y para adecuar la pro-puesta económica final a plazo de ejecución previsto en el cronograma.

Resultados

Los requisitos de alto nivel se han plasmado en el Anexo I: Alcance, incluido en el contrato establecido con Triari Labs. En la figura 2 se extracta parte del contrato con Triari Labs en el que se especifican esos requisitos y los compromisos a alcanzar, de manera que se pueda validarse la consecución de objetivos.

Este documento de requisitos se puede considerar como fuente de información R1-F1 inclui-do en el marco lógico reformulado de la propuesta (p. 2).

T1-3. Especificación de vocabularios para el proyecto y adecuación de la plata-

forma BABILONIA

A través de esta actividad se ha revisado el vocabulario DarwinCore utilizado por la platafor-

Figura4. Ventana de la aplicación BABILONIA desde la que se gestiona la introducción de localidades de recogida del material incorporado en las colec-ciones de germoplama. Ver que los campos latitud y longitud muestran la información en grados decimales, generada a partir de los datos introducidos en el campo Sistema de Coordenadas.

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ma GBIF para adecuar la estructura de la base de datos BABILONIA a este vocabulario y así facilitar la generación de las consultas a la base de datos que permitan el mapeado automático de los campos que requieren las ocurrencias de GBIF.

También se ha incorporado a BABILONIA una herramienta de conversión de coordenadas que permite automáticamente transformar las coordenadas originales en coordenadas en grados decimales.


1. Revisión de tablas y campos en la base de datos BABILONIA

2. Revisión de los campos DarwinCore y adecuación, cuando es posible, a cada uno de los campos de BABILONIA

3. Incorporación de campos inexistentes en BABILONIA necesarios en el estandard Darwin-Core.

4. Realización de mejoras para la conversión de coordenadas desde la plataforma BABILO-NIA y de este modo poder extraer directamente las coordenadas en grados decimales, a partir de información proporcionada en sistemas Military Grid System (MGRS), Universal Transverse Mercator (UTM) o coordenadas geográficas.


Las actuaciones se han llevado a cabo mediante el trabajo coordinado del gestor técnico de Babilonia y la contrata externa encargada del desarrollo de BABILONIA. El mapeado de los campos se ha realizado mediante comparación de las definiciones de cada uno de los campos DarwinCore y los campos incorporados en BABILONIA a través de una hoja de cálculo.

En el caso de que no existiera coincidencia en la definición de los campos se ha procedido a su incorporación dentro de las tablas de BABILONIA.

En el desarrollo del conversor de coordenadas se ha utilizado la librería javascript proj4.js (http://proj4js.org/) y código propio en lenguaje php para la extracción de variables de las coor-denadas introducidas por el usuario.

La ventana de introducción de información sobre localidades de recogida incluye igualmente la posibilidad de incorporar el datum y la proyección utilizadas para realizar una mejor conversión de las coordenadas (ver figura 4).


Con esta actividad se ha conseguido incorporar a BABILONIA los campos necesarios que per-miten la publicación de datos en el entorno de GBIF y la conversión de coordenada automática a partir los datos introducidos por el usuario en BABILONIA sea cual sea su formato.

De este modo se da solución a un problema general y muy común en las bases de datos de colecciones de biodiversidad, ya que muchas de estas bases no realizan la conversión adecuada de coordenadas lo que dificulta en gran medida el uso de la información de georreferenciación incorporada a los ejemplares de colección.

Los miembros de REDBAG que no utilizan BABILONIA y que han proporcionado sus datos a partir de hojas de cálculo modificadas y adaptadas a la estructura DarwinCore han tenido que realizar la conversión de coordenadas mediante aplicaciones externas. En el peor de los casos la información de georreferenciación no puede ser ofrecida en grados decimales y ello provoca que

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los registros no puedan visualizarse o aparezcan como no georreferenciados.

Resultados

La verificación de estos resultados alcanzados puede realizarse mediante el acceso a la plata-forma babilonia (http://aimjb.net/babilonia) y la realización de búsquedas de registros georrefe-renciados.

La consulta al IPT instalado en el servidor de la AIMJ también permite confirmar que los cam-pos incorporados a BABILONIA hacen posible el mapeado automático frente al estandar Darwin-Core. La herramienta BABILONIA puede considerarse una fuente de información R2-F2 para vali-dar la consecución del resultado esperado R2 recogido en el modelo de marco lógico.

PT2. Adecuación e importación de datos de RRFFSS dentro de la plataforma BABILONIA

El objetivo de este paquete de trabajo (PT2) es la adquisición, adecuación y volcado de datos de RRFFSS dentro de la plataforma BABILONIA de acuerdo a las metodologías consensuadas en la REDBAG y a las necesidades de gestión del IEPNB y CBD, con la participación de todos los Jardines Botánicos e instituciones interesadas que conservan RRFFSS.

También se incorporan en este paquete de trabajo las tareas de depuración de datos propios dentro de cada institución con especial atención a la información sobre georreferenciación de accesiones.

Las actividades concretas en PT2 serán:

• (T2-1) Recopilación de conjuntos de datos disponibles en REDBAG y otras instituciones, adaptación de datos y mejora de los mismos: los diferentes JB’s de la REDBAG adaptarán la información recogida en sus bases de datos para adaptarse correctamente al vocabulario y esquema definido en (T1-3).

• (T2-2) Adaptación nomenclatural a los catálogos de protección de CCAA, nacional e inter-nacional: se creará un grupo de expertos dentro de REDBAG encargado de revisar la no-menclatura utilizada en los catálogos de protección (nacionales y regionales) para adap-tarlos a las posibles sinonimias utilizadas en los diferentes conjuntos de datos incluidos en la aplicación, para alcanzar R1.

• (T2-3) Volcado de conjuntos de datos, instituciones y personas implicadas en la gestión de RRFFSS a BABILONIA: los datasets de cada cada institución serán volcados a la aplica-ción Babilonia. Se establecerá un proceso de volcado y posterior revisión para mejorar la calidad de los datos. Esta actividad se encamina a la consecución de R3.

T2-1. Recopilación de conjuntos de datos disponibles en REDBAG y otras insti-tuciones, adaptación de datos y mejora de los mismos.

El desarrollo de esta acción se ha realizado por los diferentes miembros de los Jardines Botá-nicos implicados en el proyecto OpenREDBAG y responsables de la informatización de sus colec-ciones de germoplasma.

La instalación del Integrated Publishing Toolkit (IPT) en el servidor de la AIMJB ha permitido

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dar de alta numerosas colecciones de germoplasma para su posterior publicación a través de la plataforma GBIF, a la cual se accede para obtener la información requerida en el portal de datos.

El acceso al IPT de la AIMJB se puede realizar desde el siguiente link: http://www.aimjb.net:8080/ipt/

Figura5. Captura de pantalla del IPT de la AIMJB en el que se muestran parte de las colecciones dadas de alta para su posterior publicación a través de GBIF.

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Las actividades llevadas a cabo se pueden resumir en los siguientes puntos:

1. Generación de ejemplares de colección por los diferentes Jardines de la AIMJB y la RED-BAG con bancos de germoplasma.

2. Georreferenciación de las localidades de recogida y conversión de coordenadas a partir de las mejoras realizadas en Babilonia. El uso de la herramienta de conversión de coorde-nadas ha permitido obtener los datos de longitud y latitud en grados decimales para más de 70000 registros (incluidos registros no sólo de bancos de germoplasma).

3. Revisión de datasets no generados a través de la plataforma BABILONIA, validación y adaptación de la información al formato DarwinCore.

4. Actualización de metadatos de las colecciones en el IPT.


El trabajo se ha organizado, en lo relativo a la actualización de la información de las coleccio-nes de germoplasma, por cada uno de los jardines implicados. En la fase final del proyecto este trabajo se ha visto apoyado mediante la contratación de personal específico para la depuración de datos. Este es el caso del Jardín Botánico de Soller, el Jardín Botánico Viera y Clavijo y el Jardín Botánico de Córdoba.

El resto de Jardines y éstos mismos han utilizado también sus recursos propios para llevar a cabo la adaptación de la información a las necesidades del proyecto. Entre estos Jardines se encuentran el Jardín Botánico de Madrid (a través de la plataforma Babilonia), el Jardín Botánico

Figura6. Captura de imagen del IPT de la AIMJB con algunas de las colecciones que se están publicando desde esta plataforma.

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Atlántico (a través de la plataforma Babilonia), el Jardín Botánico de Iturrarán (mediante la adap-tación de hojas de datos), el Real Jardín Botánico de Alcalá de Henares (a través de la plataforma Babilonia), por citar algunos ejemplos.

Desde el equipo de coordinación se han generado permisos de acceso a datos a los respon-sables de cada una de las colecciones de germoplasma incorporadas en Babilonia. Los responsa-bles de estas colecciones han actualizado la información de los datos de sus colecciones para que pueda ser consultada desde la plataforma de GBIF.


Los resultados de esta acción han sido muy desiguales, condicionados en buena medida a la disponibilidad de recursos humanos suficientes para el desarrollo de las tareas de digitalización y depuración de los datos existentes.

A pesar de todo, desde la dirección del proyecto se ha observado una creciente partipación de todos los miembros de REDBAG y de otros miembros que han solicitado su integración en esta red para poder participar en el proyecto.

A los datos ya accesibles a través de GBIF (Banco de Germoplama del Jardín Botánico de Bar-celona, Banco de Germoplasma “César Gómez Campo” de la Universidad Politécnica de Madrid, el Banco de Germoplasma de la Universidad Rey Juan Carlos) se unen ahora los datos de los si-guientes Jardines (ver figura 6): Jardín Botánico de Soller (Banc de Germoplama Vegetal de les Illes Ballears), Jardín Botánico Atlántico (Banco de Germoplasma del Jardín Botánico Atlántico), Real Jardín Botánico Juan Carlos I (Banco de Germoplasma del Real Jardín Botánico Juan Carlos I), Real Jardín Botánico de Madrid-CSIC (Banco de Germoplasma del Real Jardín Botánico RJB-CSIC) y Jardín Botánico de Iturrarán (Banco de Germoplasma Vegetal del a Diputación Foral de Gipuzkoa).

Actualmente se está procesando la información de otros Bancos de Germoplasma y Jardines Botánicos que se han unido con posterioridad al proyecto o que no han podido actualizar su in-formación en el periodo acordado.

Resultados

A partir de la información disponible en GBIF, es posible establecer que el número de regis-tros que actualmente se pueden consultar supera el 25% estimado en esta primera fase. El Banco de Germoplasma de la UPM con más de 9000 accesiones ocupa el primer lugar en cuanto a publia-ción de datos. El Banco de Germplasma del Jardín Botánico de Barcelona está publicando cerca de 3000 registros. El Banco de Germoplasma de les llles Ballears cerca de 4000 registros. El Banco de Germoplasma del Jardín Botánico Atlántico algo más de 2000 registros. El Real Jardín Botánico de Madrid cerca de 2000, el Banco de Germoplasma de Real Jardín Botánico Juan Carlos I, cerca de 1000 y Banco de Germoplasma de la Diputación de Gipuzkoa, algo más de 1000.

El Banco de Germoplasma Vegetal Andaluz está llevando a cabo las acciones necesarias para publicar sus datos y con esta incorporación se alcanzará facilmente cerca del 70% de las accesio-nes consevadas en los bancos de germoplasma de la REDBAG. Otros bancos como el que se loca-liza en el Jardín Botánico Viera y Clavijo también se encuentran realizando labores de adecuación para poder ofrecer los datos en el menor tiempo posible.

La fuente de verificación R3-F3 puede ser la propia plataforma GBIF, mediante consulta a los datasets de las diferentes colecciones.

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T2-2. Adaptación nomenclatural a los catálogos de protección de CCAA, na-cional e internacional

El trabajo de recopilación de la información contenida en los diferentes catálogos de protec-ción autonómica y nacional ha ocupado gran parte de la dedicación de los miembros de lo Jardi-nes Botánicos. Actualmente se ha generado una base de datos con toda la información contenida en dichos catálogos y se ha realizado una revisión histórica que permite consultar la información contenida en cada uno de los catálogos y analizar su evolución.


1. Recopilación bibliográfica de catálogos regionales.

2. Recopilación bibliográfica de listas rojas regionales.

3. Generación de bases de datos con toda la información contenida en los catálogos regio-nales, nacionales y de la directiva hábitats.

4. Incorporación a la base de datos de la información generada por el proyecto Atlas de Flo-ra Amenazada de España.

5. Revisión y corrección nomenclatural para su adaptación al tesauro taxonómico de GBIF (Backbone).


Se ha generado una base de datos en formato Access que recoge para cada uno de los catá-logos regionales publicados, la siguiente información:

• id_taxon = identificador del taxon• Rank = rango taxonómico• NomComple = nombre completo con autorías• canonicalname = nombre canónico sin autorías• genero = género• especie = epíteto específico• infrank = rango infraespecífico• infra = epíteto infraespecífico• Id_taxon_categoria = identificador único de cada entrada• id_catalogo = identificador numérico del catálogo o lista roja• catalog_abrev = abreviatura dada al catálogo• catalog_nomcomple = nombre completo del catálogo o lista roja• link = enlace a recurso electrónico• iso_ccaa = código ISO de la CCAA• catalogoVigente = estatus del catálogo• ambito = nacional, regional, europeo• status_catalogo = modificado, derogado, vigente• titulo boletin = título del boletín de publicación• boletin_numero = número del boletín de publicación• fecha_publicacion = fecha de publicación del catálogo o lista

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• paginas = número de páginas• Tipo = lista roja, catálogo de protección• id_categoria = identificador de la categoría de prortección• categoria_abrev = categoría de protección abreviada• categoria_completa = denominación de la categoría de protección• Criterios = criterios de amenaza según IUCN• Poblacion = población sobre la que tiene vigencia el catálogo• Observaciones = campo de observaciones• categoriavigente = categoría en vigencia antes de su aparición en el catálogo• TipoCambio = inclusión, exclusión o modificación• Cambio_catalogo = catálogo al que se modifica• Status_categoria = vigente o no vigente• Autores = autoría de la publicación• Editorial = editorial en la que se publica la lista roja o catálogo de amenaza• Revista = nombre de la revista o publicación que recoge la lista roja

La base de datos, todavía no concluida incorpora la totalidad de los catálogos de protección regionales, nacionales y europeos. Se está actualizando la información de las listas rojas. En la actualidad se han registrado más de 7500 entradas en la base de datos correspondientes a cerca de 3300 taxones que se encuentran protegidos a nivel nacional o están incluidos bajo alguna ca-tegoría de amenaza en alguna lista roja.

En relación a la revisión de los nombres utilizados se ha llevado a cabo la revisión de los cerca de 3300 nombres incluidos en la base de datos para su adecuación la nomenclatura seguida por GBIF. En algunos casos GBIF no recoge los nombres utilizados y se informará al nodo de GBIF en Copenhagen para solicitar su inclusión.

Los datos desde la base de datos relacional han sido transferidos a una base de datos no rela-

Figura7. Captura de imagen del IPT de la AIMJB con algunas de las colecciones que se están publicando desde esta plataforma.

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cional MongoDB release 3.0 que es la que utiliza el portal de acceso a datos. Esta base de datos se encuentra alojada en el servidor de la AIMJB.


De acuerdo a la propuesta y necesidades de MAGRAMA se puede concluir que OpenREDBAG ha satisfecho el que sea accesible la información de las especies que están protegidas en el terri-torio nacional.

Otras iniciativas similares como Phyteia, integrada ahora en el portal Anthos (http://anthos.es) incluye esta información pero la ofrece de manera que el usuario debe buscar una especie para poder obtener información sobre su estado de protección. Sin embargo, en la plataforma de acceso a datos se da la posiblidad al usuario de realizar búsquedas complejas sobre diferentes catálogos o listas rojas para obtener información sobre las especies que en ellos están incluidas.

Entendemos que esta información puede ser de gran ayuda a los gestores de los RRFFSS por-que facilita la comparativa entre diferentes catálogos y listas rojas y no se centra únicamente en la situación particular de cada una de las especies.

En cualquier caso, el usuario que precise de información sobre una especie en concreto pue-de obtener esa información realizando una búsqueda directa del nombre que le interese y Open-REDBAG devolverá la información sobre su situación de protección.

Resultados

Los resultados de esta acción pueden seguirse a partir de la consulta al portal de acceso a datos OpenREDBAG, a través del siguiente link: http://redbag.es/openredbag/portal. En la figura 7 puede observarse el número de taxones sobre los que actualmente trabaja el portal de acceso a datos: 3273.

Figura8. Captura de pantalla en la que se muestra la ventana del listado de centros http://redbag.es/openredbag/centros.php

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T2-3.Volcado de conjuntos de datos, instituciones y personas implicadas en la gestión de RRFFSS a BABILONIA.

A través del portal de difusión del proyecto se puede acceder a la información recopilada so-bre centros y personas implicadas en la gestión de RRFFSS. El portal de información del proyecto se encuentra en el siguiente link: http://rebag.es/openredbag.

Esta acción tenía como compromiso el desarrollo de un sistema actualizado sobre centros que en territorio nacional conservan RRFFSS y un directorio de personas relacionadas con la ges-tión de recursos fitogenéticos silvestres.

Figura9. Captura de pantalla en la que se muestra la posibilidad de edición de información de un centro.

Figura10. Ventana de edición de datos de usuarios registrados en la plataforma.

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Se ha generado una base de datos cosultable a través del portal del proyecto que permite acceder a la información de los centros recopilados por la REDBAG.


Las actuaciones llevadas a cabo se resumen en los siguientes puntos:

1. Recopilación de datos propios de la REDBAG sobre sus miembros.

2. Recopilacion de datos proporcionados por otros organismos como FAO en los que se re-coge información sobre centros que gestionan RRFFSS.

3. Adecuación de la información recopilada y generación de la base de datos sobre MySQL que se ha hecho accesible desde el portal del proyecto, a través del siguiente link: http://redbag.es/openredbag/centros.php

4. Generación de base de datos que permite el registro de individuos para crear un directorio de personas implicadas en la gestión de RRFFSS y publicación a través del portal del proyecto.

Figura11. Captura de pantalla en la que se puede obervar el acceso a los registros de la colección del Jardín Botánico Atlántico. En el panel superior izquier-do se ofrece un resumen numérico de los datos contenidos en el banco.

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5. Desarrollo de consultas y acceso a los datos almacenados en BABILONIA para cada uno de los centros que utilizan esta aplicación para informatizar sus colecciones. El acceso a estos datos necesita de registro del usuario en la página web del sitio del proyecto.


La recopilación de información se ha realizado desde el Real Jardín Botánico Juan Carlos I, donde está la dirección de la REDBAG y desde el Jardín Botánico Atlántico. Una vez generado el primer borrador de listado de centros, el resto de Jardines Botánicos han podido acceder a la in-formación almacenada y corregir a través del uso compartido de una hoja de datos, la información que pudiera estar desactualizada.

Para cada uno de los centros incluidos en la base de datos se ha recogido la siguiente infor-mación que se muestra en el listado de centros (ver figura 8):

• Acrónimo del centro: abreviatura empleada para designar el centro• Centro: nombre del centro de referencia• Código FAO: código utilizado por FAO para referirse ha este centro• Dirección: dirección actualizada de contacto• CCAA: comunidad autónoma en la que se encuentra• Tipo: tipología de institución• Permisos: gestiona la obtención de permisos de recolecta de germoplasma• Redbag: está incluida en REDBAG• BG: tiene banco de semillas sí / no• web: enlace url al sitio web del centroDesde la propia aplicación es posible añadir nuevos centros o editar la información existen-

te de cada uno de ellos (ver figura 9). De este modo se facilita la actualización de la información, permitiéndose únicamente la edición de los centros por usuarios que se han dado de alta en la aplicación.

La gestión de usuario (ver figura 10) permite incorporar información detallada sobre las per-sonas que se dan de alta en el portal: nombre y apellidos, centro al que pertenecen, dirección, teléfono de contacto, email, información personal.


Esta accción va a permitir disponer de un listado actualizado de centros y personas relacio-nadas con la conservación de RRFFSS que podrá ir incrementándose en el futuro con más infor-

Figura12. Captura de pantalla en la que se puede obervar el menú de acceso a información sobre el proyecto OpenREDBAG y e listado de de centros y personas.

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mación. El directorio actual cuenta con 246 centros entre los que se encuentran todos aquellos integrados dentro de la REDBAG y aquellos que se han podido extraer del Centro Nacional de Recursos Fitogenéticos (CNRF) dependiente del Instituto Nacional de Investigación y Tecnología Agraria y Alimentaria (INIA).

El inventario de personas no está actualizado a la espera de que se pueda desarrollar una campaña que invite a los diferentes stakeholders a darse de alta en el portal.

Además de esta información, también se puede obtener información sobre los recursos fi-togenéticos de aquellas insitituciones que están utilizando BABILONIA como herramienta de in-formatización. Desde la ventana de Listado de accesiones, un usuario se pueden realizar opera-ciones de búsqueda sobre diferentes campos y puede visualizar información resumida sobre las características de la colección (ver figura 11) a la que accede.

Los datos del inventario de instituciones se completará en el futuro con el listado oficial de centros de referencia sobre el que trabaja actualmente el MAGRAMA en colaboración con las CCAA.

También se tiene previsto que en sucesivas fases sobre esta acción iniciada, se pueda asociar a cada centro información que permita el acceso a los documentos de solicitud de permisos de recolecta (para aquellas instituciones públicas que los gestionan), las principales lineas de trabajo de ese centro y enlazar cada una de estos centros con el listado de usuarios, de manera que este espacio se pueda convertir en un sitio de referencia en la búsqueda de centros de conservación de RRFFSS en España y del personal asociado a ellos.

Resultados

Los resultados de esta acción pueden evaluarse a través del acceso al sitio web del proyec-to mediante el siguiente link: http://redbab.es/openredbag, y accendiendo al menú desplegable proyecto (ver figura 12). De esta manera el indicador de resultados R4-I1 se ha completado satis-factoriamente.

PT3. Desarrollo del Portal Nacional de Acceso a Datos Abiertos sobre RRFFSS y publicación de datos

El paquete de trabajo PT3 ha permitido dar respuesta al objetivo específico OE3 del proyecto: Desarrollo de un Portal Nacional de Acceso a RRFFSS que ayude a resolver las necesidades que MAGRA-MA, CCAA y otros organismos puedan tener en este dominio.

El desarrollo del portal se ha realizado mediante la asistencia externa de una empresa de de-sarrollo de aplicaciones en la que se han utilizado modernas tecnologías web de visualización que dan respuesta a las demandas incluidas en el documento de requisitos.

Desde la dirección técnica de OpenREDBAG se ha trabajado conjuntamente para realizar la-bores de asesoramiento, análisis de procesos, generación de datos y puesta a punto de casos de usos concretos que han servido para testar la aplicación.

El Portal Nacional de Acceso a RRFFSS es accesible desde el portal web del proyecto Open-REDBAG a través del siguiente link: http://redbag.es/openredbag/portal aunque se considera necesario que en fases posteriores de desarrollo se deba dotar al portal de un dominio propio.

Las acciones concretas en PT3 se plantearon del siguiente modo:

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(T3-1) Implementación del Portal de acceso a RRFFSS: mediante subcontratación externa a una empresa de desarrollo web se creará el portal de acceso a RRFFSS de la REDBAG. La platafor-ma cumplirá con lo especificado en el documento de requisitos redactado a partir de los conteni-dos derivados de T1-1 y T1-2. La plataforma obtendrá datos directamente desde la base de datos de BABILONIA y se intentará desarrollar un módulo de importación de datos externos. En esta fase se desarrolla el prototipado 1.

(T3-2) Sistema de consulta y generador de informes con indicadores: la consulta a los datos se hará de manera gráfica mediante el uso de servicios de visualización de mapas y también me-diante la visualización de gráficos estadísticos que den respuesta a los indicadores propuestos. En la medida de lo posible se desarrollará un sistema que permita exportar la información que se visualiza a un formato reutilizable. Los datos primarios de los diferentes bancos de germoplasma también podrán ser descargados para su reutilización por terceros. En esta fase se desarrolla el prototipado 2.

(T3-3) Revisión de implementación y desarrollo final del portal: de manera conjunta a las ta-reas finales de difusión y explotación de la herramienta (T4-2) se abrirá la plataforma en fase beta para poder ser analizada por los usuarios potenciales y administraciones. Con las aportaciones externas se desarrollará el producto final.

T3-1. Implementación del Portal de acceso a RRFFSS

Dentro de esta acción se engloban todas las tareas iniciales de puesta a punto del IPT, defini-ción de acceso a la información a través de la API de GBIF, generación de sistemas de exportación de datasets de BABILONIA al IPT y prototipado incial.


Las principales actividades llevadas a cabo se pueden resumir en los siguientes puntos:

1. Discusión sobre opciones de acceso a la información: acceso a los datos mediante su in-

Figura13. Captura de pantalla del sitio http://www.gbif.org/developer/summary en la que se puede obervan las diferentes capacidades del API de GBIF para realizar operaciones de consulta sobre datasets (Registry), especies (Species), registros (Ocurrence), mapas (maps) y noticias (news).

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corporación directa a la aplicación o publicación y reutilización de la información a través de la plataforma GBIF.

2. Revisión de las posibilidades de uso de la extensión Germplasm Bank de Darwin Core para ofrecer información concreta sobre registros de colecciones de Germoplasma.

3. Implementación del motor de base de datos sobre un modelo no relacional. El motor elegido ha sido Mongodb por su gran aceptación, versatilidad en el almacenamiento de información no estructurada y la rapidez de resolver peticiones sobre un gran número de registros.

4. Revisión e implementación en la aplicación de los servicios que proporciona la API de GBIF sobre: acceso a datos de especies, acceso a datos de fuentes de información (data-sets) y acceso a datos de de ocurrencias (registros) de una colección.

5. Desarrollo de herramientas de visualización de la información georreferenciada a través de mapas de calor y mapas de cluster.

6. Desarrollo de herramientas que visualización de la información proporcionada por el MA-GRAMA derivada del proyecto AFA (cuadrículas 10x10 km) de presencia de poblaciones de táxones amenazados.

7. Desarrollo de herramientas de solapamiento de información entre datos AFA y datasets proporcionados por los bancos de germoplasma.

8. Desarrollo de herramientas de ocultación de registros que puedan estar mal georreferen-ciados, mal identificados o mal interpretados para depurar errores procedentes de fuen-tes externas que no se pueden modificar.


El desarrollo de una aplicación que permite el acceso distribuido a varios datasets puede realizarse de varias maneras. La primera de las actividades fue la elección del sistema de almace-

namiento de los datos procedentes de bancos de germoplasma.

La opción inicial que se basaba en la importación de los datasets dentro de la aplicación Op-enREDBAG se desechó finalmente por los siguientes motivos:

• Imposibilidad de dar autonomía a los publicadores de datos para que actualizaran la in-formación de sus bases de datos directamente en OpenREDBAG.

• Imposibilidad de dar homogeneidad a los datasets de publicadores que no estuvieran utilizando BABILONIA.

Figura14. Información proporcionada en el sitio http://tools.gbif.org/dwca-validator/extensions.do sobre la extensión Germplasm accession. Se observa en la definición el enfoque de la extensión sobre RRFF con interés agrícola, incorporando descriptores de PGRFA y Multi-Crop passport (FAO).

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• Existencia de alternativas como la plataforma GBIF que permite resolver la publicación de datos al tiempo que el esfuerzo de publicación permite que otras iniciativas, más allá de OpenREDBAG puedan hacer uso de la información publicada.

Así pues se ha optado por permitir que los diferentes bancos de germoplasma publiquen sus datos a través de la plataforma GBIF y después mediante la utilización del ser-vicio de acceso a datos que proporciona la plataforma GBIF (http://gbif.org) a través de su API, poder hacer llamadas

a esos datos y facilitar su descarga en la base de datos de OpenREDBAG. La API de GBIF permite hacer llamadas tanto a los registros publicados, información de especies e información sobre los publicadores (ver figura 13).

La publicación de datos de los diferentes bancos de germoplasma dentro de la plataforma GBIF puede hacerse de los siguientes modos:

1. Bancos que gestionan las colecciones a través de la plataforma BABILONIA, mediante la consulta de sus datos a través del IPT de la AIMJB. Los proveedores de datos pueden igual-

mente seleccionar la periodicidad con que los datos son actualizados en GBIF, proceso que es realizado de manera automática y sin intervención del usuario.

2. Bancos que no gestionan sus colecciones a través de BABILONIA, publicando los datos de las colecciones de germoplasma en GBIF, bien mediante la instalación de un IPT propio, bien a través del nodo nacional de GBIF (en nuestro caso GBIF-España) o bien adecuando los datos del sistema de informatización propio a la estructura Darwin Core Archives y utilizando el IPT de la AIMJB (en este caso la actualización de datos no es automática).

Como ya se ha explicado anteriormente, la AIMJB ha instalado en sus servidores la aplicación IPT (ver figura 6) que permite la publicación de datos de bancos de germoplasma bien a través de conexión directa a BABILONIA, bien mediante la subida de los datos (en diferentes formatos) por cada uno de los bancos.

La segunda de las actividades a analizado la posibilidad, barajada inicialmente, de utilización de la extensión DarwinCore Germplasm extension, por sus afinidades con el tipo de recursos que se sirven desde OpenREDBAG.

Analizada en detalle esta extensión (ver definicion en figura 14 y enlace relacionado) hemos comprobado que, aunque gran parte de ella podría servir para la publiación de información sobre la calidad de los datos de los bancos de germoplasma (cantidad, resultados de ensayos realizados sobre el material conservado, etc.) su orientación está claramente enfocada a los recursos fitoge-néticos con interés para la agricultura.

Por otro lado los servicios API de GBIF todavía no permiten hacer llamadas para recuperar información de esta extensión, por lo que el esfuerzo de publicación de datos utilizando Germ-plasm Bank Extension no serviría para poder acceder a los mismos a través del portal de RRFFSS de OpenREDBAG.

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Se han mantenido comunicaciones escritas con el equipo de desarrolladores de la API de GBIF y nos ha informado que en el futuro y si existe una demanda suficiente de utilización, podrían incorporar ese servicio a la API. Desde la dirección técnica de OpenREDBAG se ha preferido espe-rar a que los datos de la extensión sean accesibles antes de incorporar nuevos desarrollos.

Desde el punto de vista técnico podemos señalar las siguientes cuestiones en cuanto a la elección de la tecnología desarrollada en las actividades 4 a 7.

El portal openREDBAG requiere el uso de un sistema de almacenamiento escalable y robusto con un conjunto de características muy específicas que permitan abordar tanto sus requisitos fun-cionales como los no funcionales. El objetivo es dotar a la aplicación de fiabilidad y garantizar una respuesta rápida (en términos de rendimiento) a los usuarios.

Algunos de los requisitos de openREDBAG no encajan del todo bien con el uso de los siste-mas de almacenamiento tradicionales, como es el caso de las bases de datos relacionales. El prin-cipal inconveniente es la necesidad de una estructura de los datos flexible, que además permita modificar la estructura de sus datos a lo largo del tiempo, permitiéndole añadir nuevas columnas o propiedades a sus datos, modificando su tipo, etc. Esto es fundamental para los procesos de enriquecimiento de datos, tanto los presentes como los futuros que se pudiesen plantear. Esta flexibilidad choca con la necesidad de definir un esquema en las bases de datos relacionales. Afor-tunadamente en los últimos años han aparecido en el mercado un conjunto de soluciones para el almacenamiento de datos que difieren del modelo clásico y con unas características muy diversas.

Estas tecnologías se engloban generalmente bajo el término NoSQL clasificándose en varios gru-pos según su modelo de datos: orientadas a documentos, orientadas a columnas, de clave-valor y en grafo. Después del estudio de cada una de las alternativas y de valorar su adaptación al pro-yecto, se ha llegado a la conclusión de que las bases de datos orientadas a documentos son un candidato ideal para la implementación de la aplicación. De entre todas ellas MongoDB ofrece un conjunto de funcionalidades que como veremos a continuación encajan perfectamente con las necesidades del proyecto.

Figura15. Ventana emergente que permite la ocultacion de registros (baneado) y la elección del motivo que provoca el mismo y observaciones.

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MongoDB es una base de datos de código abierto orientada a documentos que permite el almacenamiento de información en colecciones como estructuras de datos de documentos de tipo JSON. Al evitar la necesidad de definir un esquema para los datos ofrece una gran flexibilidad, tanto para modificar y enriquecer la estructura de los objetos creados, como para adaptarse a nue-vos requisitos e implementar nuevas funcionalidades. MongoDB encaja además a la perfección en la pila tecnológica empleada para la implementación de openREDBAG:

• PlataformaNode.js

• Express.js:frameworkdeaplicacionesparaNode.js

• FrameworkJavascript:AngularJS.

Todas estas tecnologías pueden trabajar nativamente con JSON, lo que facilita la incorpora-ción de nuevas funcionalidades en tiempo récord. El uso de estas tecnologías de forma conjunta se ha popularizado en los últimos años conociéndose como MEAN stack (iniciales de MongoDB, Express, AngularJS y Node.js) debido a las facilidades que permiten al ofrecer un desarrollo unifi-cado y ágil entre el back-end y el front-end.

A continuación se describen varios aspectos técnicos por los que se ha escogido MongoDB.

• MongoDBfacilitalaredundanciadelosdatosparaqueenelcasodequeunservidorfalleel sistema siga respondiendo y no haya una pérdida de datos mediante lo que denomina “Repli-ca Sets”. Una “Replica Set” consta de un nodo maestro que recibe las escrituras de datos y varios nodos esclavos que replican los datos del maestro y que pueden ocupar su lugar en el caso de producirse un error. Además como los nodos esclavos disponen de la misma información que el nodo maestro MongoDB ofrece la posibilidad de leer de estos nodos, lo que le permite atender un gran número de peticiones simultáneas. MongoDB ofrece además la posibilidad de particionar (“sharding”) las colecciones de datos en el caso de una gran demanda de escrituras que pudiesen sobrecargar de forma excesiva el nodo maestro.

• MongoDBofreceunframeworkdeconsultaparaagregacionesdedatosyconsultascom-plejas (“aggregation framework”) que encaja perfectamente con esta necesidad. Además el len-guaje de consulta utilizado por el “aggregation framework” está basado en un flujo de operacio-nes definidas mediante un lenguaje JSON, lo que facilita la generación automática de consultas.

• Muchasdelasoperacionesarealizarsobrelosdatosrequierenladefinicióndeíndicesquepermitan trabajar con grandes volúmenes de datos. Una de las ventajas de MongoDB frente a otros sistemas es que la creación de estos índices se puede realizar en “background” mientras la base de datos continúa realizando otras tareas, de esta forma el usuario puede comenzar a jugar con sus datos inmediatamente después de su subida a la plataforma. Esto es importante para los procesos de actualización de datos desde GBIF, ya que no interrumpen la disponibilidad del servi-cio openREDBAG.

• OtradelascaracterísticasqueconviertenaMongoDBenunsistemadebasededatosmuyadecuado para Tabulae es su funcionalidad para el manejo de datos geográficos en formato Geo-JSON, utilizado por OpenREDBAG para visualización de información espacial.

Las herramientas de ocultación de datos (baneado) llevadas a cabo en la útima de las activi-dades listadas permiten a los usuarios registrados eiliminar de las visualiaciones y de las consultas determinados registros que presentan errores. El baneado de registros (ver figura 15) guarda in-formación sobre el usuario que ha ocultado el registro y el motivo que le ha llevado a modificar las opciones de visualización, al tiempo que permite la incorporación de información adicional que pueda servir para la correción posterior de esos registros.

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Los motivos que pueden causar la ocultación de un registro son:

• Asignación de coordenadas erróneas (puntos que aparecen mal ubicados en el mapa)

• Identificación errónea del registro (se conoce que un registro está mal identificado o GBIF ha realizado una asociación errónea de nombres).

• Otros motivos.


En términos generales esta actuación concluyó con una versión 1 de prototipado que incluía la mayor parte de las funcionalidades de portal.

El mayor de los problemas encontrados ha sido la imposibilidad de utilizar la extensión de germoplasma para almecenar información sobre la calidad de los registros de los bancos de ger-moplasma, que se abordará en una segunda fase de desarrollo.

El servicio de publicación de datos a través del IPT de la AIMJB ha empezado a funcionar en diciembre de 2014, previa aceptación de las condiones impuestas por GBIF España para otorgar el preceptivo endorso o aval que permite a la AIMJB publicar datos directamente.

La descarga de datos directa no se ha implementado todavía en la aplicación, haciéndose posible la misma a través del portal de datos de GBIF y la aceptación de las políticas de privacidad y uso que debe aceptar el usuario.

El uso por parte de terceros, en este caso OpenREDBAG, de datos que se hacen accesibles a través de GBIF debe estar sujeto a las mismas normas de atribución de datos y por ello, hasta futu-ros desarrollos, la descarga de datos se ha dejado en manos de GBIF.

Resultados

Los resultados obtenidos con esta acción pueden evaluarse directamente desde el Portal de Acceso a datos del proyecto Openredbag mediante el link: http://rebag.es/openredbag/portal

Figura16. Ventana inicial del portal mostrando la totalida de las especies incorporadas en la aplicación y el número de catálogos y listas rojas consultados.

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T3-2. Sistema de consulta y generador de informes con indicadores

Con esta segunda acción se definió el sistema de filtrado de datos y se implementaron las ventanas de información dentro de la aplicación.

De manera general se ha optado por un sistema de consulta que ofrece la información a par-tir de 3 pestañas de búsqueda:

• Búsqueda por especies (pestaña Species)

• Búsqueda por registros (pestaña Occurrences)

• Búsqueda por proveedores de datos (pestaña Datasets)


Las actividades llevadas a cabo en esta acción se resumen en los siguientes puntos:

1. Definición de filtros por catálogos de protección y listas rojas, a utilizar dentro de cada una de las secciones de la aplicación.

2. Incorporación de filtrado taxonómico a partir de la información proporcionada por GBIF.

Figura17. Detalle de la información suministrada para cada especie en el listado asociado a cada pestaña de búsqueda. Los iconos de la parte superior derecha permiten acceder a diferente información: descripción de la especies, tabla de ocurrencias y mapa de visualización.

Figura18. Detalle de la información suministrada para cada registro de colección desde la pestaña de ocurrencias. Los iconos de la parte superior derecha permiten acceder a diferente información sobre la totalidad de los registros mostrados: tabla de ocurrencias y mapa de visualización.

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3. Visualización de información de ocurrencias en formato tabulado y en la vista mapa.

4. Desarrollo y visualización de las ventanas de información de especies.

5. Desarrollo de la ventana de administración y rutinas de actualización de datos.

6. Desarrollo final del front-end.


La ventana inicial del portal de acceso a datos presenta directamente las opciones de bús-queda de información organizada por 3 grande apartados: especies (species), registros (ocurren-ces) y conjuntos de datos (datasets) , según se puede ver en la figura 16.

La organización de las búsquedas iniciales a partir de estas 3 pestañas responde a las dife-rentes necesidades que puedan tener los usuarios y para buscar una similitud con las búsquedas generales que ofrece la plataforma GBIF, a las que pueden estar acostumbrados los usuarios de esta aplicación.

La ventana inicial muestra actualmente información sobre 3289 taxones que se encuentran protegidos o amenazados en nuestro país. El listado de taxones resume los datos aparecidos en los diferentes catálogos y listas rojas analizados, así como los taxones incluidos dentro del proyec-to Atlas de Flora Amenazada de España (AFA).

Desde cualquiera de las pestañas de especies y registros se puede hacer una búsqueda inicial por especie. Desde la pestaña de conjuntos de datos, la búsqueda general permite introducir el nombre de un dataset para acceder a sus registros.

Por debajo del panel de búsqueda y filtrado se muestra el listado de la información, que será distinta según sea l a pestaña inicial desde la que se ha realizado la búsqueda. Si la búsqueda se realiza desde la pestaña species o datasets, se mostará un listado de especices y si la búsqueda se realizad desde occurrences, se mostrará un listado de registros de colecciones.

Figura19. Detalle del resultado devuelto por el portal de datos sobre una búsqueda que busca coincidencias entre los catálogos del Principado de Asturias y de Cantabria.

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Busqueda por especies y datasets

Los datos que se muestran para cada especie que aparece en el listado son (ver figura 17):

• Nombre del taxon

• Jerarquía taxonómica hasta nivel de género

• Catálogos de protección europeo, nacional y autonómico en los que está presente

• Botones para acceder a la información de la especie, acceder a información tabulada so-bre registros de colecciones correspondientes a esa especie y acceso a la visualización del mapa de ocurrencias.

Busqueda por ocurrencias

El listado de registros que se muestra desde la pestaña de ocurrencias devuelve registros de colecciones con la siguiente información (ver figura 18):

Figura20. Detalle del resultado devuelto por el portal de datos sobre una búsqueda que busca coincidencias entre los catálogos del Principado de Asturias y de Cantabria.

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• Número de ocurrencias devueltas en la consulta

• Nombre científico de la especie en cada ocurrencia

• Jerarquía taxonómica hasta el rango de género

• Número de registro en el catálogo de origen

• Localización

• Provincia

• Coordenadas geográficas de procedencia del registro expresadas en grados decimales

• Recolectores del taxon para ese registro

• Dataset de origen con hipervínculo hacia la fuente de datos

• Tipo de registro

• Fecha de recolecta

El Filtro de búsqueda dentro de catálogos vigentes (current catalogues)

Para cada una de las diferentes pestañas, la aplicación utiliza diferentes filtros que permiten acotar las búsquedas que realiza el usuario.

La búsqueda de especies presentes en los catálogos vigentes se puede realizar desde las pes-tañas species y datasets. Se han incorporado dos tipos de búsqueda de este tipo:

Figura21. Detalle del resultado devuelto por el portal de datos sobre una búsqueda utilizando los filtros de categoría de protección (en el ejemplo se ha seleccionado “En peligro de extinción” y catálogo a mostrar “Principado de Asturias”.

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• Búsqueda aditiva que devuelve los registros de todos los catálogos seleccionados (show all values in selected catalogues).

• Búsqueda de coincidencias que únicamente devuelve los registros comunes a varios ca-tálogos (show only common values in selected catalogues).

Figura22. Pestaña desplegada que muestra los filtros disponibles dentro de la pestaña de Especies. La búsqueda en catálogos publicados (search in publi-shed catalogues) y listas rojas o libros rojos (red lists / books) permite seleccionar catálogos y listas tanto vigentes como derogadados o modificados.

Figura23. Detalle del resultado devuelto por el portal de datos sobre una búsqueda utilizando criterios taxonómicos sobre el catálogo nacional de espeies amenzadas. El filtro a incluido la categoría taxonómica “Asteraceae” dentro del rango de familia y el resultado devuelve 51 especies.

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Esta potente herramienta de búsqueda permite dar respuesta a preguntas cómo ¿cual es el número de especies que están protegidas bajo la legislación del Principado de Asturias y de Can-tabria? o ¿qué especies tienen en común los catálogos del Principado de Asturias y de Cantabria?.

A la primera de las preguntas, el número devuelto es de 246 y en segundo caso sólo 10 espe-cies (ver figura 19).

La búsqueda comparada permite también realizar consultas que comparen catálogos de pro-tección de difente ámbito, por ejemplo autonómico y nacional. Así podemos preguntarnos ¿que especies están incluidas en el catálogo del Principado de Asturias y también están protegidas dentro del Catálogo Nacional de Especies Amenazadas?.

En este caso la respuesta es que 9 especies (ver figura 9) están protegidas bajo ambas nor-mativas. Como se puede apreciar en la figura si analizamos en detalle la información suministrada para cada especie, se puede ver que en todos los casos aparecen citados el catálogo nacional (Na-tional catalogues) y el catálogo del Principado de Asturias (Regional catalogues), en el que también se incluye la categoría de protección.

El Filtro de búsqueda dentro de categoría de protección (conservation status)

También es posible añadir como criterio de búsqueda la categoría de protección bajo la que se incluye un grupo de especies dentro de uno o más catálogos. En este filtro se pueden incluir tantas categorías como se deseen de las que aparecen en los diferentes catálogos de protección publicados.

Una pregunta habitual como ¿cuántas especies están incluidas dentro de la categoría “en pe-ligro de extinción” dentro del catálogo regional del Principado de Asturias?. La figura 21 muestra el resultado de esa búsqueda que devuelve 5 especies. Este filtro está disponible en las pestañas Species y Datasets.

Filtros de búsqueda en catálogos (search in published catalogues) y listas o libros rojos

Figura24. Detalle del resultado devuelto por el portal de datos sobre una búsqueda utilizando la pestaña datasets, que devuelve el número de especies incluidas en catálogos o listas rojas que están representados en el Banco de Germoplasma de la Universidad Politécnica de Madrid.

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(red lists / books)

Además de las búsquedas en los catálogos vigentes, OpenREDBAG permite realizar búsque-

da en cualquier catálogo regional publicado (sin importar su grado de vigencia) y en listas rojas, libros rojos o cualquier otro listado que se haya introducido en la aplicación en el que se incluya algún tipo de categorización para las especies incluidas.

Actualmente se ha introducido información sobre algunas listas rojas y se ha incorporado

Figura25. Detalle del resultado de una búsqueda sobre la pestaña ocurrences utilizando los filtros de especie, con el valor Centaurium somedanum y dataset con el valor “Banco de Germoplasma del Jardín Botánico Atlántico”. La consulta devuelve 53 accesiones dentro del banco.

Figura26. Detalle del resultado devuelto por el portal de datos sobre la consulta mostrada en la figura 25, a la que se ha añadido el criterio de búsqueda espacial por Comunidad Autónoma, asignando el valor “Castilla y León”. La aplicación devuelve 16 registros de esa especie recogidos en esa CCAA.

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la información del proyecto AFA dentro de la aplicación. Tanto catálogos como listas se ordenan según el ámbito de aplicación de los mismos, por lo que podemos realizar la búsqueda por catá-logos o listas rojas europeas, nacionales o regionales.

En la figura 22 se muestra el desplegable que permite seleccionar el filtro a aplicar y dentro de cada uno de ellos se muestran las diferentes opciones de búsqueda. Para cada una de los filtros a utilizar se pueden añadir de manera aditiva tantas opciones como se desee, lo cual permite la realización de múltiples consultas sobre toda la base de datos.

Filtros de búsqueda por categoría taxonómica (taxonomy hierarchy)

OpenREDBAG también permite la búsqueda facetada por categorías taxonómicas. La infor-mación taxonómica para cada uno de los registros de los bancos de germoplasma es incorporada a partir de la información contenida en el tesauro nomenclatural de GBIF (Backbone), de manera que no es posible corregir o modificar la ubicación taxonómica de un taxon desde la aplicación.

Esta herramienta de búsqueda facilita la realización de consultas del tipo: ¿Cuántas especies de la familia “Compositae se encuentra incluidas en el Catálogo Español de Especies Amenazadas?.

La figura 23 muestra el resultado devuelto por OpenREDBAG a esta pregunta, de manera que según los datos incorporados a la aplicación, 51 especies o subespecies de esta familia están incluidas en el citado catálogo.

Filtros de búsqueda por nombre del juego de datos (Datasets)

Este filtro que está disponible desde las pestañas Ocurrences y Datasets, y permite filtrar la información devuelta para uno o varios conjuntos de datos.

Esta herramienta de consulta está especilamente pensada para evaluar el número de taxones protegidos o amenazados que se conservan en cada uno de los bancos de la REDBAG o institu-ciones partipantes o también para dirigir la búsqueda sobre un dataset concreto que contega información sobre cualquiera de las especies incluidas en OpenREDBAG y que esté publicando sus datos a través de la plataforma de GBIF.

La pestaña de búsqueda por nombre de dataset organiza la información en dos bloques de datos: organizaciones pertenecientes a la REDBAG (colecciones de germoplasma) y el resto de publicadores de datos (herbarios, colecciones de observaciones procedentes de inventarios, bús-quedas bibliográficas, etc.).

En la figura 24 se muestra el resultado de una búsqueda en la pestaña datasets en la que se ha utilizado filtrado el número de especies incluidas en el banco de germoplasma “Cesar Gómez Campo” de la Universidad Politécnica de Madrid. La consulta devuelve 628 taxones representados.

En la figura 25 se muestra el resultado de una búsqueda de registros de la especie “Centau-rium somedanum” dentro del Banco de Germoplasma del Jardín Botanico Atlántico. En este caso se ha utilizado el filtro datasets dentro de la pestaña de Ocurrences. La consulta devuelve un total de 53 accesiones.

Filtros de búsqueda Comunidad Autónoma en la que se realiza la recolecta (Regions)

Este filtro permite realizar búsquedas espaciales sobre las Comunidades Autónomas en las que se han realizado las recolectas. La información que se utiliza en esta búsqueda no procede de la información original proporcionada por el proveedor de datos. A partir de los datos georre-ferenciados, OpenREDBAG realiza una operación de asignación de CCAA en la que se localiza un

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punto dado y actualiza esa información en la base de datos propia.

Este tipo de consultas puede resultar muy interesante para los gestores de RRFFSS de las administraciones regionales que desean conocer que recolectas realizadas dentro de una deter-minada Comunidad Autónoma están conservadas en los bancos de germoplasma de la REDBAG.

En la figura 26, sobre el ejemplo de la fitura 25, se ha incoroporado el filtro espacial de la Co-munidad Autónoma de Castilla y León, de manera que es posible determinar que en el Banco de Germoplama del Jardín Botánico Atlántico se conservan un total de 19 accesiones de Centaurium somedanum recogidas en la citada Comunidad Autónoma.

Visualizado de registros desde las diferentes ventanas de búsqueda

Junto a la herramienta de búsqueda de registros a través de diferente filtros, OpenREDBAG permite visualizar espacialmente toda la información procedente de las pestañas de consulta. En función de la pestaña de partida, la información mostrada en el mapa es distinta.

De manera general la ventana de mapa muestra dos paneles laterales.

El panel de la derecha muestra la siguiente información:

• Pestaña de filtro utilizado (lupa) desde la que se puede acceder a los criterios de selección elegidos y acceder a la ventana de modificación de los mismos.

• Pestaña de imágenes, que permite visualizar imágenes sobre el taxon seleccionado (sólo en el caso de consulta desde la pestaña Species o Datasets).

• Pestaña con información taxonómica y/o de registros, en función de la búsqueda de par-tida.

• Botón de acceso directo a tablas de datos

• Botón de acceso directo a registros de una institución (sólo en búsquedas de ocurrencias)

Figura27. Mapa de ocurrencias sobe la consulta mostrada en la figura 26

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• Información Taxonómica de la especie mostradas (sólo en búsquedas de especies)

• Información sobre el número de registros devueltos y sobre éstos número de registros georerenciados.

• Información sobre número de familias, géneros y especies mostrados (sólo en búsqueda de ocurrencias)

El panel de la izquierda controla las opciones de visualización general del mapa, incluye:

• Selección de tipo de mapa base a utilizar

Figura29. Mapa de la especie Glaucium flavum que muestra los registros del Banco de Germoplasma del Jardín Botanico Atlántico (en verde) y el detalle de la información de uno de ellos.

Figura28. Mapa de cuadrículas 10x10 procedentes de la información generada en el proyecto AFA para la especie Centaurium somedanum

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• Selección de superposición de provincias y/o comunidades autónomas

• Selección de tipo de mapa generado (cluster o mapa de calor)

• Selección de tipo de información a mostrar (registros procedentes de GBIF, registros pro-cedentes de AFA y registros solapados de las poblaciones AFA con datos de los bancos de germoplasma).

En el interior del mapa se muestra información referida a la posición de los registros geo-rreferenciados, cuadrículas 10x10 del dataset AFA, cuadrículas 10x10 de puntos procedentes de datasets de GBIF y cuadrículas de solapamiento entre datos.

Cuando se selecciona un punto sobre el mapa correspondiente a un registro se muestra un banner con información sobre ese registro. Cuando se selecciona una cuadrícula sobre el mapa se muestra un banner con información agrupada sobre el número de registros incluidos en esa cuadrícula.

Visualizado de ocurrencias

La información mostrada en un mapa de ocurrencias es la siguiente (ver figura 27) es la si-guiente, basada sobre la consulta mostrada en la figura 25.

El mapa muestra destacado en rojo las Comunidades Autónomas en las que el taxon seleccio-nado Centaurium somedanum está protegido. El panel de la derecha tiene desplegada la pestaña de datos que muestra el número de registros devueltos (53) y el número de registros georreferen-ciados (52).

El acceso a la tabla de ocurrencias se puede realizar desde el menú superior (Table) o hacien-do click sobre el icono del panel derecho.

También sobre el panel lateral derecho se proporciona información taxonómica sobre los re-gistros seleccionados. En nuestro caso una única familia, un único género y una única especie. En el caso de que se realice una selección múltiple de ocurrencias, por ejemplo todas las contenidas en un dataset, esta información permite resumir la información contenida en la selección.

La siguiente información mostrada en el panel derecho es la lista de especies selecciondas y el número de registros de esa especie. En el ejemplo de la figura 27 sólo se muestra una única especie.

Por debajo de esta información se situa la información de los juegos de datos que proveen información al mapa. Éstos datasets se ordenan en dos grupos: datasets de la REDBAG y resto de datasets. En el ejemplo, ya que se había realizado un filtrado de datos del Banco de Germoplasma del Jardín Botánico Atlántico, solo aparece un registro. Al lado del nombre del dataset se muestra el número de registros con los que contribuye al mapa final.

En el interior del mapa se visualizan, en función de las características de visualización elegi-das, la posición de los registros georreferenciados. En el ejemplo se muestra un a visualización agrupada de los datos que se desagrupa en función del nivel de zoom.

Es posible observar en el ejemplo un registro mal georreferenciado que se localiza en el área del sistema Pirenaico. Ese registro puede ser ocultado haciendo click sobre el mismo y pulsando la opción “ban”.

Visualizado de datos AFA

Cuando la consulta de partida se realiza a partir de la pestaña Species, el mapa generado es distinto. En el ejemplo de la figura 28 se muestra una visualización de la especie Centaurium some-

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danum en la que haciendo uso de las opciones de visualización, únicamente es está mostrando la información de cuadrículas del proyecto Atlas de Flora Amenazada de España.

La información que se muestra en el panel derecho controla las opciones de visualización. En el ejemplo se ha seleccionado una base de mapa básico sobre el que se han superpuesto las CCAA. Nuevamente la información en rojo de estas CCAA señala que en ellas esa especie está protegida. La información de georreferenciación se ha simplificado al máximo para mostrar únicamente las cuadrículas de10x10 km en las que se ha constatado su presencia.

En el panel de la derecha se muestra información sobre los datasets que contienen informa-ción sobre ese taxon, junto con el número de registros que ofrece cada uno de ellos. Los datasets

Figura30. Visualización completa de la información de un registro procedente de un banco de germoplasma, en este caso la accesión 030914-01

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aparecen agrupados, en primer lugar los centros de la REDBAG y después el resto de fuentes de datos. En la parte superior del panel se ofrece información taxonómica y un botón que permite acceder a la información de la especie (icono de hoja de papel).

Filtrado de datos desde mapa de especies e información sobre cada punto

A partir de un mapa de ocurrencias en el que se muestra el número de registros que propor-ciona a la aplicación cada uno de los datasets, es posible filtrar visulmente la información que procede de cada uno de ellos haciendo click sobre el número que acompaña al nombre del juego de datos.

En la figura 29 se ha filtrado visualmente la información de los registros que proceden del Banco de germoplasma del Jardín Botánico Atlántico y se ha hecho click sobre uno de los puntos georreferenciados para mostrar la información concreta de ese registro.

Es posible apreciar en la figura cómo el resto de fuentes de datos mantienen el número que los acompaña con un color gris, mientras que los datos seleccionados se visualiza en verde.

En este ejemplo se puede visualizar también una imagen de la especie seleccionada Glau-cium flavum y la pestaña de imágenes (icono de cámara de fotos) que da acceso a la galería de imágenes de esa especie.

Visualizado de información de cada registro

Es posible acceder a información detallada de cada uno de los registros haciendo click sobre el texto “View full description”.

La información mostrada en la descripción completa del registro (ver figura 30) incluye los siguientes datos:

• Nombre científico de la especie y jerarquía taxonómica

• Aclaraciones relativas a la asignación taxonómica dada por GBIF y a posible errores en la georreferenciación (generalización de datos etc.).

Figura31. Captura de pantalla de la vista tabla de datos que muestra los registros seleccionados. Esta vista permite filtrar los registros georreferenciados y los registros que se han ocultado.

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• Tipología de registros

• Información geográfica sobre el lugar de recolección (país, provincia, lugar exacto, coor-denadas geográficas en grados decimales y elevación)

• Recolectores

• Fecha de la recolecta

• Imágenes de la especie a la que hace referencia el registro

• Nombre del dataset con hipervínculo hacia la fuente de datos en el portal internacional de GBIF

• Información relativa a la situación de protección de la especie en diferentes catálogos, con detalle del nombre del catálogo o lista roja, estatus del catálogo (vigente, modificado o derogado), ambito de aplicación del catálogo (regional, nacional, europeo) y categoría de protección y vigencia de la misma asignada en cada catálogo.

• Mapa de visualización detallada del registro (en el caso de que esté georreferenciado) en el que se destacan en diferente color las CCAA en las que la especie está protegida.

La generación de esta información hace uso de las APIs de GBIF y de información propia con-tenida en el motor de base de datos.

Visualizado de información tabular

La visualización de los registros seleccionados también puede hacerse en forma de tabla pul-sando sobre el icono “table” en el menú superior o pulsando sobre el mismo icono en el panel lateral de la vista mapa. También desde la ventana de búsquedas, en cualquiera de sus pestañas, es posible visualizar los datos tabulados pulsando sobre el mismo icono.

La visión de datos en forma tabla muestra la siguiente información (ver figura 31):

Figura32. Captura de pantalla del panel de administración de OpenREDBAG.

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• Nombre científico asignado a cada uno de los registros según el esquema nomenclatural de GBIF (Scientific Name).

• Nombre de la fuente de datos a la que pertenece cada uno de los registros, con hipervín-culo hacia el dataset en el portal de GBIF.

• Localidad de recogida del registro y coordenadas (location).

• Tipo de registro (type).

• Registro oculto (true / false) (banned).

• Fecha de recolecta o fecha de observación (date).

La ventana de datos en forma de tabla permite realizar un filtrado de los datos para visualizar únicamente los registros georreferenciados, los registros que no están georreferenciados o todos los registros.

También existe la posibilidad de realizar un filtrado de datos para mostrar únicamente los registros que están ocultos o para mostrar todos los registros, se hayan o no ocultado por algún motivo.

Desde cada uno de los registros mostrasdos se puede acceder a la visualización detallada de una ocurrencia, pulsando sobre el nombre científico de la ocurrencia.

Administración de la aplicación mediante login

La aplicación permite que los usuarios logeados puedan realizar labores de administración sobre los datasets utilizados y actualizar los datos de la base de datos con información actualizada.

Desde la esquina superior izquierda se puede hacer login en la aplicación y entrar en el panel de administración pulsando sobre el icono “admin”.

La ventana de administración (ver figura 32) permite añadir nuevos usuarios y cambiar la con-traseña del usuario logeado. Desde esta ventana se accede a las operaciones de refresco de datos (refresh data) o de actualización de ficheros de datos externos (update external data files).

El refresco de los datos permite, a su vez, que los registros de ocurrencias sean remplazados completamente o que se unan nuevos atributos.

Las operaciones de refresco están organizadas por tareas (T1-T6) que pueden ejecutarse o no en función de si se hace click sobre ellas. La aplicación guarda la fecha y hora de la última ejecució de las actualizaciones y refresco de los datos, que es mostrada en la parte superior del panel de administración.

Las tareas que pueden realizarse son:

• Refrescar especies incluidas en el proyecto AFA.

• Refrescar poblaciones incluidas en el proyecto AFA.

• Depuración de datos del proyecto AFA.

• Errores encontrados en los datos del proyecto AFA.

• Refresco de datos procedentes de catálogos.

• Refresco de datos de la Jerarquía Taxonómica aplicada a las especies.

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• Descarga de ficheros de datos desde GBIF.

• Parseado de los datos obtenidos a partir de las descargas anteriores.

Las operaciones de actualización de datos externos permiten subir nuevos archivos en for-mato de hoja de datos de los siguientes conceptos:

• Hoja de dato de errores de asignación de nombres por parte de GBIF.

• Hoja de datos de asignación de nombre de GBIF revisada.

• Esquema de las ocurrencias / registros.

• Hoja de datos con nuevos catálogos / listas rojas.

Las operaciones de refresco pueden cancelarse durante el proceso de ejecución pulsando so-bre el botón “Cancel update.” El proceso de recarga de nuevos ficheros de datos externos se realiza pulsando sobre el botón “Update files”.

Con el panel de control se asegura la autonomía del proyecto en cuanto a su capacidad para actualizar la información sobre el grado de protección y amenaza de la flora del Estado español y en cuanto a la participación de nuevos centros que conservan RRFFSS.


Esta acción ha centrado el desarrollo del portal de Acceso a datos de RRFFSS y los resultados obtenidos han sido muy satisfactorios. El desarrollo de la aplicación cumple con los requisitos de alto nivel definidos inicialmente y permite que la información se pueda escalar en el futuro con nuevos desarrollos.

La incorporación de indicadores visuales se realizará en fases posteriores de desarrollo, una vez se haya encontrado la solución más idónea para compartir información de detalle sobre la ca-lidad del material conservado, a través de la extensión Darwin Core Germplasm bank extension, si GBIF internacional es capaz de desarrollar las herramientas de explotación necesarias a través de nuevas APIs.

La puesta en marcha del portal y la capacidad de que parte de los indicadores del inventario sean consultables y actualizables dinámicamente da respuesta a los resultados esperados y a los indicadores de evaluación propuestos.

Resultados

El resultado de esta acción se corresponde con R5 y R6 previstos en el marco lógico del pro-yecto y los siguientes dos indicadores: R5-I1 y R6-I1. Las fuentes de información R5-F5, R6-F6, R6-F7, R6-F6 y R6-F9 se localizan en el propio portal de acceso a RRFFSS de España.

T3-3. Revisión e implementación finalEsta acción se ha realizado por todos los socios de la AIMJB que han accedido a la versión en

pruebas de la aplicación durante los meses finales de desarrollo.

Los comentarios y sugerencias se han hecho públicos a través del espacio de trabajo creado en google groups: https://groups.google.com/forum/?hl=es#!forum/openredbag o a través del envío de correos directamente a la dirección técnica del proyecto, que han sido discutidos y trasladados al equipo de desarrollo.


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Las actividades llevadas a cabo se resumen en los siguientes puntos:

1. Revisión por parte de los diferentes Jardines Botánicos de las funcionalidades de la apli-cación.

2. Revisión final de las operaciones de matching realizadas por GBIF sobre los nombres utili-zados por los distitntos Jardines Botánicos en sus colecciones de germoplasma.

3. Implentación de las correcciones popuestas

PT4. Difusión y explotación de los resultados del proyecto

Este paquete de trabajo se ha centrado en dar a conocer el proyecto a los principales actores implicados dentro de la REDBAG y a la Subdirección General del Medio Natural del MAGRAMA. La difusión del proyecto se ha centralizado en la creación de un subdominio dentro de la página web de la redbag, accesible desde el siguiente link: http://redbag.es/openredab. En este subdominio se ha creado la página web del proyecto donde se puede acceder a toda la información del mismo.

T4-1 Plan de comunicación del proyecto

El cronograma propuesto desarrollaba estas acciones en los primeros y últimos meses del proyecto. En los primeros meses se desarrolló la página web de OpenREDBAG para permitir dar alojamiento a algunos de los resultados de otras actividades propuestas y se mantuvo una reu-nión con el MAGRAMA para poner en común necesidades y propuestas que podrían ser resueltas durante la ejecución de OpenREDBAG.

También durante los primeros meses se contactaron centros no pertenecientes a REDBAG para conocer su interés por el proyecto y ampliar el número de participantes dentro de esta red de trabajo.

Figura33. Portada inicial del sitio web del proyecto OpenREDBAG

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Las principales actividades llevadas a cabo dentro de esta acción son:

1. Reunión con MAGRAMA al inicio de proyecto para dar a conocer su dimensión.

2. Comunicación del proyecto a las CCAA mediante un dossier difundido en la reunión del Grupo de Trabajo de Conservación Vegetal en el seno del Comité de Flora y Fauna de la Comisión Estatal para el Patrimonio Natural y la Biodiversidad en el que están representa-das las CCAA, celebrada el día 29 de abril de 2014.

3. Desarrollo del portal web del proyecto OpenREDBAG.

4. Difusión y avance del proyecto en reuniones científicas.

5. Reunión final de evaluación de objetivos alcanzados con la Subdirección General del Me-dio Natural del MAGRAMA en diciembre de 2014.


Al comienzo del proyecto y coincidiendo con fechas con la reunión de presentación de los proyectos finanaciados por Fundación Biodiversidad en la convocatoria 2013, se mantuvo una reunión en dependencias del MAGRAMA con los técnicos de la Subdirección General del Medio Natural para dar a conocer el proyecto y recoger las necesidades más urgentes a cubrir por parte del Ministerio, en relación al Inventario Nacional de Recursos Fitogenéticos.

Pasadas unas semanas de comunicación por correo electrónico con esta administración, se desarrolló un dossier que resumía los objetivos del proyecto. Este dossier fue difundido en la pri-mera reunión reunión del Grupo de Trabajo de Conservación Vegetal en el seno del Comité de Flora y Fauna de la Comisión Estatal para el Patrimonio Natural y la Biodiversidad, de manera que las CCAA recibieran de primera mano información puntual sobre el inicio del proyecto y su posible implicación en el desarrollo del mismo.

Durante los primeros meses del proyecto se puso en marcha el desarrollo de la página web del proyecto, para disponer de un espacio desde el que dar a conocer a potenciales usuarios y participantes los objetivos de OpenREDBAG. El sitio web (ver figura 33) incluye información sobre:

• Información sobre la AIMJB y REDBAG.

• Bancos de Germoplasma incluidos en REDBAG con participación en el proyecto.

• Página de acceso a información sobre el proyecto OpenREDBAG (objetivos, resultados, cronograma, tareas, etc.)

• Página de acceso a listado completo que conservan RRFFSS en España.

• Página de acceso a usuarios registrados en la aplicación que sirve de germen del directo-rio de personas relacionadas con la conservación de RRFFSS en España.

• Página de links y descarga de documentos, con acceso a información organizada por CCAA sobre listados de protección vigentes e históricos.

• Página de Contacto para participar en OpenREDBAG y recibir feedback de los usuarios.

• Página de login y acceso a datos de RRFFSS almacenados en la plataforma BABILONIA (sólo para usuarios registrados en BABILONIA).

• Página de noticias

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T4-2 Divulgación de la plataforma por parte de REDBAG

La divulgación de la plataforma se ha realizado fundamentalmente a través del sitio web del proyecto.

Dentro de REDBAG la difusión del proyecto se ha realizado mediante la publicación de un artículo sobre el proyecto en la Revista El Botánico / O Botânico, publicado en el número 8 del año 2014, pp. 25-28 firmado por J. Ignacio Alonso Felpete e Inmaculada Porras (ver Anexo 2).

El portal fue dado a conocer a los miembros portugueses de la AIMJB durante el XIII Simposio celebrado en Lisboa del 22-26 de Septiembre de 2014, donde se presentó una comunicación so-bre el grado de implementación del proyecto y se celebró una sesión del grupo de trabajo Bases de Datos y SIG, específica sobre el proyecto OpenREDBAG.

En los últimos meses de desarrollo se creo el grupo de google “openredbag” para crear un es-pacio de trabajo común donde poder plasmar las observaciones y evaluaciones de la aplicación. En este espacio se hizo público, por primera vez, el sitio web OpenREDBAG.

Conclusiones y valoracion final

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Conclusiones y valoración general

OpenREDBAG ha permitido sentar las bases de acceso a la información contenida en los ban-cos de germoplasma de la REDBAG y ha establecido mecanismos de comunicación con las insti-tuciones implicadas en la gestión de los RRFFSS en España, que sobrepasan el propio ámbito de este proyecto.

Desde el punto de vista técnico la AIMJB se encuentra muy satisfecha con los resultados ob-tenidos y entiende que este proyecto debería tener continuidad en el corto plazo para consolidar definitivamente los mecanismos de actualización y publicación de datos que se han puesto en marcha y, sobre todo, para concluir el desarrollo de las herramientas de explotación de la infor-mación generada para facilitar, más alla del simple acceso a los datos, la toma de decisiones en materia de gestión de RRFFSS.

En cuanto a la consecución de objetivos se puede concluir que OpenREDBAG ha sasisfecho los objetivos iniciales (pp. 5-7) estableciendo cauces de comunicación con el Ministerio de Agricul-tura, Alimentación y Medio Ambiente y, concretamente, con la Dirección General de Conservación de la Biodiversidad, manteniendo siempre informado a los responsables de esta institución sobre los avances del proyecto y recogiendo, en la medida de lo posible, el feedback proporcionado por la administración en lo relativo a las necesidades y prioridades que deberían abordarse desde el dominio de la gestión de los RRFFSS.

Con la puesta en marcha de este proyecto entendemos que en los próximos meses se podrá progresar adecuadamente en la consecución de los objetivos del nventario Español de Bancos de Material Biológico y Genético de Especies Silvestres, al menos en lo relativo a los siguientes puntos:

• Desarrollo de una base de datos registrada con información sobre los indicadores del in-ventario.

• Desarrollo de listado de táxones que se están conservando en los bancos de germoplas-ma de la REDBAG.

• Desarrollo del catálogo de material biológico y silvestre almacenado en cada banco.

• Listado de centros con material genético y biológico conservado.

Uno de los éxitos de este proyecto radica en la continuidad temporal del mismo y en la parti-cipación de un gran número de actores implicados en la conservación de RRFFSS. La continuidad temporal viene avalada por el trabajo contínuo de los bancos de germoplasma y por el desarrollo de unos mecanismos que van a permitir dar autonomía a cada institución para publicar su infor-mación a través del IPT de la AIMJB y que ésta pueda ser reutilizada por la plataforma OpenRED-BAG en el desarrollo de indicadores de interés en la gestión de RRFFSS.

La AIMJB, beneficiaria de este proyecto evalua muy positivamente que OpenREDBAG haga uso de herramientas cuyo desarrollo también ha sido financiado por la Fundación Biodiversidad en otras convocatorias. La base de datos en linea BABILONIA ha facilitado enormemente que este proyecto pudiera llevarse a cabo, ya que un gran número de instituciones ya han empezado esta plataforma para informatizar sus colecciones biológicas de germoplasma, herbario y/o planta viva, y este hecho hace posible que los desarrollos que se han hecho sobre BABILONIA hayan be-neficiado a un gran número de usuarios.

Desde la AIMJB y la REDBAG se sigue apostando, no sin dificultades, por la puesta en común

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de herramientas comunes que, por un lado afianzan el trabajo en red de diferentes organizacio-nes y, por otro lado, facilitan la publicación de información bajo unas condiciones de homogenei-dad mínimas.

El futuro más inmediato de OpenREDBAG se centrará en:

• Completar el número de colecciones de germoplasma que sirven sus datos y publican su información bien a través de las herramientas que proporciona la AIMJB o bien a través del soporte que GBIF España ha brindado en todo momento a través de su propio IPT.

• Refinar los sistemas de consulta y seguir recibiendo feedback de los usuarios para poder implementar nuevas funcionalidades en el portal.

• Completar el número de listas rojas y otros documentos clave sobre protección de espe-cies en el portal OpenREDBAG.

• Depurar las georreferenciaciones de los registros para obtener mejores resultados.

• Discutir necesidades concretas del MAGRAMA en lo relativo a la implementación del pro-tocolo de Nagoya dentro del ordenamiento jurídico nacional, de manera que toda la información que se precise para dar cumplimiento a los compromisos adquiridos pueda recopilarse directamente desde el portal OpenREDBAG.

• Seguir incorporando nuevos miembros a la REDBAG.

• Buscar nuevas sinergias con otros proyectos relacionados con la conservación de RRFFSS en España.

• Incrementar la información suministrada por los bancos de semillas de la REDBAG en lo relativo a la calidad de las especies conservadas.

• Desarrollar un plan de comunicación del portal OpenREDBAG acorde a los objetivos al-canzados por el proyecto, una vez se haya conseguido una versión estable que ofrezca información sobre más del 75% de los RRFFSS conservados en bancos de la REDBAG.

Obstáculos encontrados

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Obstáculos encontradosUn proyecto de este tipo en el que intervienen tantos actores y que cuenta con un plazo

de ejecución tan corto no puede estar exento de dificultades y problemas durante su ejecución. Desde el punto de vista económico OpenREDBAG ha tenido dificultades para seguir el modelo de justificación de gastos propuesto en las bases de la convocatoria, debido a que la propia naturale-za de la AIMJB como asociación de instituciones hace difícil que el gran número de personas par-ticipantes, vinculadas contractualmente a instituciones que no se corresponden con el organismo solicitante del proyecto, puedan justificar económicamente su dedicación de horas al desarrollo de este proyecto.

El actual modelo de justificación de gastos propuesto en las bases reguladoras dificulta la participación de organismos como la AIMJB en este tipo de convocatorias.

Al margen de los asuntos económicos, los principales problemas encontrados en la ejecución de OpenREDBAG se pueden agrupar en los siguientes apartados:

• Dificultades en el periodo de ejecución estimado

• Obstáculos en el acceso a información

• Dificultades técnicas

Dificultades en el periodo de ejecución estimado

A pesar de los logros conseguidos, OpenREDBAG no puede considerarse como un proyecto que haya alanzado su fin durante la ejecución de esta primera fase inicial. El periodo de ejecución de 12 meses ha permitido desarrollar una plataforma que ya es capaz de servir información inédi-ta sobre los RRFFSS que se conservan en la Red Española de Bancos de Semillas, sin embargo va a ser necesario completar el trabajo realizado con nuevos desarrollos que definan todavía más la explotación final de los resultados y se desarrolle una campaña de publicidad del proyecto acorde a sus espectativas finales de uso por parte de las administraciones públicas.

Obstáculos en el acceso a la información

Como ya se adelantaba en el marco lógico, el acceso a la información de los diferentes jar-dines botánicos ha sido un proceso dificultoso, a pesar de la muy buena predisposición incial de todas las instituciones involucradas.

En la propuesta incial del proyecto se incluía una partida de gasto dedicada a proveer de re-curos económicos a los diferentes Bancos de Germoplasma para que pudieran adaptar la informa-ción de sus colecciones, sobre todo aquellos centros que no participan de la iniciativa BABILONIA, a las necesidades mínimas de publicación de datos de biodiversidad.

La gran variedad de formatos utilizados por los bancos de la REDBAG y de otros centros ad-heridos al proyecto OPENREDBAG ha hecho que se tuvieran que destinar demasiados recursos humanos a la labor de asesoría y apoyo en la adecuación de los sistemas de almacenamiento requeridos.

Un problema todavía mayor, que se ha podido subsanar en parte con la contratación de per-sonal por diferentes instituciones, es la calidad de la información de georreferenciación de los registros o accesiones conservadas en los bancos. En muchas ocasiones esta información es insu-ficiente o no está adaptada a los requerimientos de visualización exigidos que permitan mostrar

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la información espacial de las recolecciones en visores web. Este hecho se ha convertido en un importante obstáculo a la hora de la publicación de datos dentro de una aplicación que pretende extraer información espacial sobre aquellas especies amenazadas que están conservadas en ban-cos de germoplasma.

Hay que entender que la REDBAG necesita de un apoyo para conseguir que las colecciones de germoplasma actualicen la información de sus accesiones de tal manera que las herramientas de solapamiento de poblaciones conocidas con recolectas, mediante operaciones de geoproce-samiento espacial, ofrezcan resultados veraces.

El acceso a la información de las recolectas de algunos bancos de la REDBAG ha precisado de la petición formal, por mediación del MAGRAMA, de un permiso para que los datos pudieran ser utilizados en el marco de este proyecto. En este sentido, se remitió una solicitud de uso de los datos del Banco de Germplasma Vegetal Andaluz al Jefe de Servicio de Geodiversidad y Biodiversi-dad de la Dirección General de Gestión del Medio Natural de la Junta de Andalucía, con resolución favorable.

Dificultades técnicas

Las principales dificultades técnicas encontradas proceden del hecho de que gran parte de los registros publicados carecen de información precisa sobre su georreferenciación. Este proble-ma se está solucionando con el esfuerzo de los técnicos de los bancos por actualizar y mejorar esta información.

Hay que tener en cuenta que la información que se ofrece desde el portal de datos pue-de considerarse como información sensible, al tratarse de información sobre especies que están amenazadas o se encuentran catalogadas. En cualquier caso, creemos que la información publica-da debería poder ofrecerse con una precisión de cuadricula 1x1 km.

Otras fuentes de datos están generalizando demasiado la información proporcionada y ello dificulta en gran medida la posibilidad de utilizar estadísticos espaciales que den respuesta a pre-guntas clave para la conservación de nuestros RRFFSS.

Otro problema encontrado que ha minorizado los resultados esperados en cuanto a la publi-cación de información sobre la calidad de las muestras conservadas es la falta de soporte técnico que, a día de hoy, nos permita poder acceder a través de las APIs de GBIF a información que se publique mediante la extensión Germplasm Bank de Darwin Core. A la espera de que GBIF in-ternacional pueda proporcionar los servicios de consulta de esos datos, desde REDBAG se está intentando dar homogeneidad a la información de calidad de las muestras, atendiendo a unos mínimos, para así buscar una solución futura que permita el acceso a este tipo de datos.

En cualquier caso, las conversaciones con los equipos de desarrollo de GBIF siguen abiertas a la espera de una posible solución que permita utilizar nuevas APIs.

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Anexo de documentos

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RELACIÓN DE DOCUMENTOS INCLUIDOS EN ANExOS

Anexo 1 Actuación 6 del plan de publicidad. Programa de las I Jornadas ABS en España organizadas por la Cátedra Unesco de Territorio y Medio Ambiente celebradas en la Universidad Rey Juan Car-los el 16/09/2014 con la participación de I. Porras y A. Bueno.

Anexo 2 Actuación 1 del plan de publicidad. Artículo publicado en la revista El Botánico / Ô Botánico bajo el título “OpenREDBAG: apertura de datos de Recursos Fitogenéticos Silvestres dentro de la REDBAG” por J. I. Felpete e I. Porras Castillo.

Anexo 3 Actuación 3 del plan de publicidad. Noticia pubicada en la web del Jardín Botánico Atlántico el 28 de agosto de 2014 sobre el desarrollo del proyecto OpenREDBAG.

Anexo 4 Actuación 5 del plan de publicidad. Presentación realizada en el XIII Simposio 2014 de la AIMJB, sobre el desarrollo del proyecto OpenREDBAG.

Anexo 5 Actuación 8 del plan de publicidad. Presentación de la evaluación final del proyecto Open-REDBAG durante la reunión mantenida con el MAGRAMA en diciembre 2014.

Anexo 6 Solicitud formal de Endoso realizada a GBIF-España para que la AIMJB pueda publicar sus datos a través del IPT instalado en sus servidores. En las fases de desarrollo se trabajó con una instalación del IPT en modo de pruebas.

Anexo 7 Esquema de datos utilizado en la informatización de Catálogos y Listas Rojas sobre el que se basan algunas consultas del portal de acceso a datos del proyecto OpenREDBAG. La base de datos se ha creado en soporte Microsoft Access y se ha volcado a partir de archivos csv a la base de datos MongoDB sobre la que trabaja el portal.

Anexo 8 Tabla resumen de cumplimiento del proyecto OpenRedbag (Anexo VI)

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CÁTEDRA UNESCO TERRITORIO Y MEDIO AMBIENTE UNESCO CHAIR FOR THE ENVIRONMENT Universidad Rey Juan Carlos (c/ Tulipán s/n- MÓSTOLES 28933(SPAIN) ) Edificio Departamental II. Oficina 241. Teléfono: 91 488 7113. Fax: 91 488 7338. E-mail: [email protected]

ACCESO Y UTILIZACIÓN DE LOS RECURSOS GENÉTICOS Y REPARTO JUSTO Y EQUITATIVO DE LOS BENEFICIOS (ABS)

EN ESPAÑA

I JORNADA SOBRE ABS EN ESPAÑA UNIVERSIDAD REY JUAN CARLOS

ESCUELA SUPERIOR DE CIENCIAS EXPERIMENTALES Y TECNOLÓGICAS CAMPUS DE MÓSTOLES

MARTES 16 DE SEPTIEMBRE DE 2014

PROGRAMA 10.00 Bienvenida y apertura 10.15 La regulación internacional del acceso a los recursos genéticos y el reparto justo y

equitativo de los beneficios derivados de su utilización (ABS, de Access and Benefit-Sharing). En particular el Protocolo de Nagoya. (Alejandro Lago Candeira. Director Cátedra UNESCO de Territorio y Medio Ambiente. URJC)

10.40 El Tratado Internacional sobre recursos fitogenéticos para la alimentación y la agricultura

de la FAO (José Esquinas Alcázar. Ex-Secretario de la Comisión sobre Recursos Genéticos de la FAO)

11.00 Reglamento Europeo 511/2014 relativo a las medidas de cumplimiento de los usuarios

del Protocolo de Nagoya sobre el acceso a los recursos genéticos y participación justa y equitativa en los beneficios que se deriven de su utilización en la Unión (Presentación de la Comisión Europea pero sin representante)

11.30 La Regulación de ABS en España:

Ley 42/2007 del Patrimonio Natural y la Biodiversidad (Tania López-Piñeiro. Jefa de Área de Estrategias y Planes de Conservación. Dirección General de Medio Natural. MAGRAMA)

Ley 3/2000 de régimen jurídico de la protección de las obtenciones vegetales y Ley 30/2006 de semillas y plantas de vivero y de recursos fitogenéticos (Luis Salaices. Jefe de Área de registro de variedades. MAGRAMA)

12.15 Pausa café

12.30 La Regulación de ABS en España (cont.): Conocimientos tradicionales asociados a recursos genéticos en España (Esteban

Hernández Bermejo)

Tratamiento de los conocimientos tradicionales asociados a los recursos genéticos por parte de la legislación de patentes (Enrique Alonso García. Consejero Permanente. Consejo de Estado)

Anexo1. Actuación 6 del plan de publicidad. Programa de las I Jornadas ABS en España organizadas por la Cátedra Unesco de Territorio y Medio Ambiente celebradas en la Universidad Rey Juan Carlos el 16/09/2014 con la participación de I. Porras y A. Bueno.

80

CÁTEDRA UNESCO TERRITORIO Y MEDIO AMBIENTE UNESCO CHAIR FOR THE ENVIRONMENT Universidad Rey Juan Carlos (c/ Tulipán s/n- MÓSTOLES 28933(SPAIN) ) Edificio Departamental II. Oficina 241. Teléfono: 91 488 7113. Fax: 91 488 7338. E-mail: [email protected]

Normativa y experiencias autonómicas:

o Comunidad Valenciana: “Dificultades administrativas y normativas en la aplicación práctica del acceso a los recursos genéticos” (Emilio Laguna. Jefe de Sección de Protección de los Recursos Naturales Servicio de Vida Silvestre Generalitat Valenciana)

Debate

14.30 Comida 15.30 La experiencia y visión de las instituciones ex situ e instituciones de investigación:

Situación de los Recursos Fitogenéticos en España (Representante del INIA)

Bancos de germoplasma. (Inmaculada Porras Castillo, Coordinadora de la Red Española de Bancos de Germoplasma de Plantas Silvestres y Fitorrecursos Autóctonos (REDBAG), Real Jardín Botánico Juan Carlos I de la Universidad de Alcalá).

Jardines botánicos. (D. Álvaro Bueno Sánchez, Jardín Botánico Atlántico, Asociación Ibero-Macaronésica de Jardines Botánicos)

Colección de cultivos tipo de Valencia (CECT) (Rosa María Aznar, Directora del Centro Español de Cultivos Tipo de la Universidad de Valencia-CECT)- Proyecto Microbial Resources Research Infrastructure (MIRRI) (Aurora Zuzuarregui Gestora de Calidad CECT y Gestora proyecto MIRRI)

Banco Español de Algas (BEA) (Representante por confirmar)

17.00 La experiencia y visión de la industria biotecnológica en relación a la implementación de

la normativa de ABS La Biodiversidad Marina como fuente de nuevos compuestos para el tratamiento

contra el cáncer (Santiago Bueno Horcajadas. Jefe del Departamento de Colección de Organismos Marinos. Pharma Mar SAU)

La experiencia de la Fundación Medina como centro de investigación público-privado (Olga Genilloud, Directora Científica)

Empresas productoras de semillas (Concretar representantes: ANOVE, EUROSEMILLAS, APROSE)

18.30 Retos identificados en la jornada y próximos pasos de la regulación del acceso y

utilización de los recursos genéticos en España (Debate) 18.45 Cierre de la jornada

81

25

Gestão/Gestión

Los objetivos openREDBAG (redbag.es/op-enredbag) se alinean con los compromisos adquiridos por el Estado Español en rela-ción a la Estrategia Mundial para la Conser-

vación de Especies Vegetales (CBD), los acuerdos del Protocolo de Nagoya en materia de acceso y reparto de beneficios (ABS) y los componentes del Inventario Español de Patrimonio Natural y de la Biodiversidad (IEPNB). De manera transver-

sal también lo hace con los objetivos del Marco de Acción Prioritaria para la Red Natura 2000 en

openREDBAG: apertura de datos de Recursos Fitogenéticos Silvestres dentro de la AIMJB

J. Ignacio Felpete, Inmaculada Porras Castillo

El proyecto surge del compromiso de la AIMJB de colaborar con en el desarrollo del Inventario Nacional de Bancos de Material Biológico y Genético de Especies Silvestres, dando a conocer los RRFFSS conservados en bancos de semillas de REDBAG y otras instituciones que conservan ex situ la flora amenazada. La información contenida en BABILONIA servirá de soporte inicial

JB ATLÁNTICO / RJB JUAN CARLOS I

El 100% de los taxones incluidos en alguna categoría de protección legal serán evaluados e incluidos de manera prioritaria en el caso de que se disponga de material conservado

Tubos termosellados para la conservación de semillas en el Banco de Germoplasma del JB de Olarizu, Vitoria-Gasteiz

Anexo2. Actuación 1 del plan de publicidad. Artículo publicado en la revista El Botánico / Ô Botánico bajo el título “OpenREDBAG: apertura de datos de Recursos Fitogenéticos Silvestres dentro de la REDBAG” por J. I. Felpete e I. Porras Castillo.

82

26

Gestão/Gestión

España para el periodo de financiación 2014-2020 en materia de conservación de especies.

Así, openREDBAG plantea un sistema de acceso a la información público y basado en la integra-ción de diferentes conjuntos de datos, permi-tiendo su enriquecimiento. Ello contribuirá a dibujar un escenario real sobre el actual estado de conservación de material genético silvestre en los bancos de germoplasma nacionales, re-presentados mayoritariamente por la REDBAG, y evaluar si los esfuerzos para lograr el objetivo de [...] conservación de la diversidad biológica y genética de las especies [...] recogido en la Ley

42/2007 y en el plan Estratégico de Patrimonio Natural y de la Biodiversidad 2011-2017 están siendo eficaces.

El acceso a estos datos será desde un Portal de Acceso a Información sobre RRFFSS de España, que contará con un conjunto de herramientas de visualización y generación de informes. El principal objetivo del proyecto openREDBAG consiste en la apertura de datos sobre RRFFSS, para que una vez publicados se pueda:

Evaluar el grado de conocimiento que se tiene

Modelo de utilización del Portal de acceso a datos de RRFFSS de España [1] carga de datos a través de BABILONIA, [2] enriquecimiento de los datos aportados por la AIMJB, [3] participación de las CCAA en la generación de información, [4] explotación de las CCAA de los datos existentes, [5] ge-neración de informes para las CCAA, [6] comunicación de las CCAA a MAGRAMA sobre el estado de conservación de sus RRFFSS, [7] elaboración de MAGRAMA del Inventari, [8] resolución de compromisos con UE y con CBD.


83

27

Gestão/Gestión

de ellos (nº de taxones, diversidad genética, po-blaciones, cantidad de material conservado, dis-ponibilidad, etc.).

Optimizar los esfuerzos de las administraciones tanto en el cumplimiento del CBD (MAGRA-MA) como en materia de conservación de flora (CCAA) sobre la base de un sistema que propor-cione información actualizada de las necesida-des de gestión de cada especie.

Contribuir al desarrollo de los componentes del IEPNB en el campo de los RRFFSS.

Facilitar herramientas que garanticen la conser-vación de la suficiente diversidad genética en base al número de poblaciones silvestres cuyo material genético está siendo conservado en la actualidad.

Proveer servicios de valor añadido basados en el contexto del usuario, diferenciando el uso que se pueda hacer de los datos en función sus ca-racterísticas.

Facilitar la reutilización de la información gene-rada.

Y difundir, divulgar y fomentar la concienciación pública sobre el valor de los RRFFSS, en especial dentro del marco del ABS.

La información contenida en la aplicación BABI-LONIA, una herramienta on line para la gestión de colecciones de biodiversidad promovida por la AIMJB, servirá de soporte inicial al conteni-do del proyecto openREDBAG, manteniendo la información actualizada a medida que se van incrementando los RRFFSS conservados en los bancos de germoplasma.Y es que openREDBAG pretende impulsar el en-riquecimiento y la interoperabilidad de datos

mediante el uso de identificadores globales de recursos (URIs) y la aplicación de los principios de Open Data y Linked Data al campo de la ges-tión de los RRFFSS. En este sentido se pretende que la nomenclatura botánica haga uso de Life Science Identifiers (LSIds) para favorecer la inte-roperabilidad con otras fuentes de datos. El apo-yo de MAGRAMA al proyecto se cristaliza en la cesión de los datos del proyecto Atlas de Flora Amenazada de España (AFA) para poder vincu-lar las localidades de recolecta de los ejemplares conservados con las poblaciones AFA identifica-das durante el desarrollo de dicho proyecto. Se pretende, de este modo, mostrar el número de accesiones disponibles de cada una de las po-blaciones conocidas y detectar posibles necesi-dades de recolección, optimizando la diversidad genética conservada en los bancos.

La “apertura de los datos” a la que hace refe-rencia el open se traduce en la capacidad de exportar la información visualizada a diferen-tes formatos, así como de generar y publicar los conjuntos de datos en formato RDF (Resource Definition Framework) para su integración y reu-tilización en plataformas semánticas, open data y otros portales de biodiversidad.

Dentro del proyecto se priorizará la incorpora-ción de los RRFFSS de aquellos taxones que es-tán incluidos en el Catálogo Español de Especies Amenazadas (flora), en los Catálogos Regionales de protección de flora y en la Lista Roja Nacio-nal de Especies Amenazadas. También aquellos recogidos en la Directiva Hábitats (especies de flora incluidas en los anexos II, IV y V) dentro de las regiones biogeográficas Alpina, Atlántica, Macaronésica y Mediterránea, de manera que el 100% de los que se incluyen en alguna categoría de protección legal serán evaluados e incluidos de manera prioritaria en el caso de que se dis-ponga de material conservado.

La REDBAG ha asumido el compromiso de que al menos el 25% de los RRFFSS conservados estén incluidos en BABILONIA, para evaluar un proto-tipo disponible en septiembre de 2014. Con este fin se están incorporando en BABILONIA la tota-lidad de los catálogos regionales de flora ame-nazada, para filtrar aquellos táxones objeto de análisis en una primera fase.


Difundir, divulgar y fomentar la concienciación pública sobre el valor de los Recursos fitogenéticos silvestres también está entre los objetivos de openREDBAG

84

28

Gestão/Gestión

El MAGRAMA, responsable último en nuestro país del cumplimiento de los compromisos adquiridos tras la adhesión a la Estrategia Global para la Con-servación Vegetal, se beneficiará directamente de los resultados de este proyecto, al tiempo que las Comunidades Autónomas, responsables de la gestión de la flora amenazada en cada una de sus jurisdicciones, podrán encontrarán una fuente de información valiosa para conocer el estado real de conservación de sus RRFFSS.

El hecho de que gran parte de los RRFFSS con-servados en bancos de germoplasma se hayan recolectado en espacios naturales protegidos, hacen que el proyecto pueda servir de apoyo a la gestión de dichos espacios, disponiendo de listados actualizados del material genético con-servado que se ha obtenido en ellos. Otros es-pacios no incluidos en la Red Natura 2000, así como programas europeos como LIFE+, podrán usar los resultados del proyecto para evaluar la necesidad de mejora de la conservación ex situ

de sus recursos o la utilización del germoplasma conservado en programas de restauración de sus hábitats.

La falta de financiación para acometer este pro-yecto en un solo año obliga a plantear una se-gunda fase de openREDBAG, que completaría sus objetivos globlales, a finales de 2016 en el mejor de los casos. A pesar de todo, creemos que estamos ante un gran reto de compromiso y esfuerzo por parte de la AIMJB que, sin duda, ayudará a realzar la importancia de los Jardines Botánicos y de sus Bancos de Germoplasma, ha-ciendo de ellos un punto de referencia en mate-ria de conservación.

openREDBAG se está desarrollando durante el año 2014, con el apoyo del Ministerio de Agri-cultura, Alimentación y Medio Ambiente a tra-vés de la Fundación Biodiversidad, gracias a la convocatoria de ayudas de 2013.

Sitio web del proyecto www.redbag.es/openredbag


85

Anexo3. Actuación 3 del plan de publicidad. Noticia pubicada en la web del Jardín Botánico Atlántico el 28 de agosto de 2014 sobre el desarrollo del proyecto OpenREDBAG.

86

Anexo4. Actuación 5 del plan de publicidad. Presentación realizada en el XIII Simposio 2014 de la AIMJB, sobre el desarrollo del proyecto OpenREDBAG

89

Anexo5. Actuación 8 del plan de publicidad. Presentación de la evaluación final del proyecto OpenREDBAG durante la reunión mantenida con el MAGRAMA en diciembre 2014

93

Anexo6. Solicitud formal de Endoso realizada a GBIF-España para que la AIMJB pueda publicar sus datos a través del IPT instalado en sus servidores. En las fases de desarrollo se trabajó con una instalación del IPT en modo de pruebas.

94

id_taxon Rank NomComple canonicalname genero especie infrank infra Id_taxon_categoria id_catalogo catalog_abrev catalog_nomcomple link iso_ccaa catalogoVigente ambito status_cata-logo titulo boletin boletin_numero fecha_publicacion paginas Tipo id_categoria categoria_abrev categoria_completa Criterios Poblacion Observaciones categoriavigente TipoCambio Cambio_catalogo Status_categoria Autores Editorial Revista

2855 SPECIES Abies nebrodensis Abies nebrodensis Abies nebrodensis 8134 51 Directiva Hábitats Directiva 92/43/CEE del Consejo, de 21 de mayo de 1992, relativa a la conservación de los hábitats naturales y de la fauna y flora silvestres (con ampliaciones) #http://eur-lex.europa.eu/legal-content/ES/TXT/PDF/?uri=OJ:L:1992:206:FULL&-from=ES# TRUE EUROPEO VIGENTE Directiva 92/43/CEE del Consejo, de 21 de mayo de 1992, relativa a la conservación de los hábitats naturales y de la fauna y flora silvestres DOCE L 206 22/07/92 7-50 CAT 37 ANNEX IV Anexo IV TRUE 2855 SPECIES Abies nebrodensis Abies nebrodensis Abies nebrodensis 7511 51 Directiva Hábitats Directiva 92/43/CEE del Consejo, de 21 de mayo de 1992, relativa a la conservación de los hábitats naturales y de la fauna y flora silvestres (con ampliaciones) #http://eur-lex.europa.eu/legal-content/ES/TXT/PDF/?uri=OJ:L:1992:206:FULL&-from=ES# TRUE EUROPEO VIGENTE Directiva 92/43/CEE del Consejo, de 21 de mayo de 1992, relativa a la conservación de los hábitats naturales y de la fauna y flora silvestres DOCE L 206 22/07/92 7-50 CAT 36 ANNEX II Anexo II TRUE 2855 SPECIES Abies nebrodensis Abies nebrodensis Abies nebrodensis 8878 51 Directiva Hábitats Directiva 92/43/CEE del Consejo, de 21 de mayo de 1992, relativa a la conservación de los hábitats naturales y de la fauna y flora silvestres (con ampliaciones) #http://eur-lex.europa.eu/legal-content/ES/TXT/PDF/?uri=OJ:L:1992:206:FULL&-from=ES# TRUE EUROPEO VIGENTE Directiva 92/43/CEE del Consejo, de 21 de mayo de 1992, relativa a la conservación de los hábitats naturales y de la fauna y flora silvestres DOCE L 206 22/07/92 7-50 CAT 39 PRIORITY Priorizado TRUE 11 SPECIES Abies pinsapo Boiss. Abies pinsapo Abies pinsapo 6457 19 Andalucía 2003 Catálogo Andaluz de Especies Amenazadas #http://www.juntadeandalucia.es/boja/2003/218/1# ES-AN FALSE COMUNIDAD AUTÓNOMA DEROGADO Ley 8/2003, de 28 de octubre de la flora y la fauna silvestres. B.O.J.A. núm. 218, de 12 de noviembre de 2003 BOJA 218 12/11/03 23790-23810 CAT 2 EN En Peligro de Extinción Anexo II FALSE DEROGADO 11 SPECIES Abies pinsapo Boiss. Abies pinsapo Abies pinsapo 11 1 Andalucia 2012 Listado Andaluz de Especies Silvestres en Régimen de Protección Especial que incluye el Catálogo Andaluz de Especies Amenazadas #http://www.juntadeandalucia.es/boja/2012/60/d6.pdf# ES-AN TRUE COMUNIDAD AUTÓNO-MA VIGENTE Decreto 23/2012, de 14 de febrero por el que se regula la conservación y el uso sostenible de la flora y la fauna silvestres y sus hábitats BOJA 60 27/03/12 114-163 CAT 2 EN En Peligro de Extinción TRUE VIGENTE 11 SPECIES Abies pinsapo Boiss. Abies pinsapo Abies pinsapo 6549 21 Andalucía 1994 Catálogo Andaluz de Especies de la Flora Silvestre Amenazada #http://www.juntadeandalucia.es/boja/1994/107/1# ES-AN FALSE COMUNIDAD AUTÓNOMA DEROGADO Decreto 104/1994, de 10 de mayo por el que se establece el Catálogo Andaluz de Especies de la Flora Silvestre Amenazada. BOJA 107 14/07/94 7948-7953 CAT 2 EN En Peligro de Extinción Anexo I FALSE DEROGA-DO

Anexo7. Esquema de datos utilizado en la informatización de Catálogos y Listas Rojas sobre el que se basan algunas consultas del portal de acceso a datos del proyecto OpenREDBAG. La base de datos se ha creado en soporte Microsoft Access y se ha volcado a partir de archivos csv a la base de datos MongoDB sobre la que trabaja el portal.

95

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