POPULAČNÍ GENETIKA 3 Pravděpodobnost v genetice populací

POPULAČNÍ GENETIKA POPULAČNÍ GENETIKA 33

Pravděpodobnost v Pravděpodobnost v genetice populacígenetice populací

Prof. Ing. Václav Řehout, CSc. Prof. Ing. Václav Řehout, CSc.

(magisterské studijní obory JU)(magisterské studijní obory JU)


• Jevy jisté:Jevy jisté:– pravděpodobnost 100%pravděpodobnost 100%

• Jevy nemožné:Jevy nemožné:– pravděpodobnost 0%pravděpodobnost 0%

• Genetické jevy:Genetické jevy:– pravděpodobnost 0-100%pravděpodobnost 0-100%


• Cíl genetického prognózování:Cíl genetického prognózování:– zpravidla stanovit pravděpodobnost zpravidla stanovit pravděpodobnost

výskytu výskytu určitého defektu, anomálie, určitého defektu, anomálie, abnormality a abnormality a jiné geneticky podmíněné jiné geneticky podmíněné vadyvady

• Východisko gen. prognózování:Východisko gen. prognózování:– populačně genetické a statistické studiepopulačně genetické a statistické studie– informace o frekvencích genů, četnostech informace o frekvencích genů, četnostech

výskytu jednotlivých genotypů, znaků, výskytu jednotlivých genotypů, znaků, vlastností apod.vlastností apod.

Pravděpodobnost v gen. populaci

P = 1 = jistota v gen. výjimečněP = 1 = jistota v gen. výjimečně

P = 0 = nemožnostP = 0 = nemožnost

PravděpodobnostPravděpodobnost

P =n příznivých jevů

n možných jevů

Pravděpodobnost v gen. populaci

1)1)nezávislé jevy (nezávislé jevy (nevylučují senevylučují se):):

PP(AB)(AB) = P = P(A)(A) . P . P(B)(B)

2)2)disjunkční jevy (disjunkční jevy (vylučují sevylučují se):):

PP(A(AUB) B) = P= P(A) (A) + P+ P(B)(B)

Základní pravidla (věty):Základní pravidla (věty):

Aplikace pravděpodobnosti do genetiky

P =P =n n příznivých jevůpříznivých jevů

n n možných jevůmožných jevů


P (A) = P (A) = P (a) = P (a) = p qp q

P(Aa) = P(A) . P(a) P(aA) = P(A) . P(a)P(Aa) = P(A) . P(a) P(aA) = P(A) . P(a) pq = p . q qp = p . qpq = p . q qp = p . q

P(AaP(AaUUaA) = P(Aa) + P(aA) aA) = P(Aa) + P(aA) = pq + qp = 2pq= pq + qp = 2pq

Model 1 alelického páru:Model 1 alelického páru:

♂♂ ♀♀ ♂♂♀♀

1122

1122


Model 1 alelického páru:Model 1 alelického páru:

P(AA) = P(A) . P(A) = p . p = pP(AA) = P(A) . P(A) = p . p = p22

P(aa) = P(a) . P(a) = q . q = qP(aa) = P(a) . P(a) = q . q = q22

AA pp aa qq

A A pp pp22 pqpq

aa q q qpqp qq22

♂♂♀♀

pp2 2 + 2pq + q+ 2pq + q22= 1= 1


PP(AA(AAUAaAaUaa)aa) = P = P(AA)(AA) + P + P(Aa)(Aa) + P + P(aA)(aA) + + PP(aa)(aa)

1 = p1 = p22 + pq + qp + q + pq + qp + q22

1 = p1 = p22 + 2pq + q + 2pq + q22

(p + q)(p + q)22 = p = p22 + 2pq + q + 2pq + q22 = 1 = 1

Typy křížení – příklad Typy křížení – příklad výpočtuvýpočtu

PP (AA) (AA) . P. P (AA) (AA) == PP(AA x AA) (AA x AA) pp2 2 . p. p2 2 = p= p4 4

odvozená výsledná odvozená výsledná pravděpodobnost pravděpodobnost

pravděpodobnostpravděpodobnost

♂♂ ♀♀

Typy křížení a jejich Typy křížení a jejich pravděpodobnostipravděpodobnosti

TypTyp PravděpodobnostPravděpodobnost Pravděpodobnost genotypPravděpodobnost genotypůů potomstva potomstva

kříženíkřížení OdvozenáOdvozená VýslednáVýsledná AAAA AaAa aaaa

AA . AAAA . AA pp22 . p . p22 pp44 p4p4

44

AA . AaAA . Aa pp22 . 2pq . 2pq4p4p33qq

2p3q2p3q 2p3q2p3q

Aa . AAAa . AA 2pq . p2pq . p22 1 : 11 : 1

aa . AAaa . AA qq22 . . pp22

2p2p22qq22 2p2q22p2q2

AA . aaAA . aa pp2 . 2 . qq22 44

Aa . AaAa . Aa 2pq . 2pq2pq . 2pq 4p4p22qq22pp22qq22 2p2p22qq22 p2qp2q22

11 : 2: 2 : 1: 1

Aa . aaAa . aa 2pq . q2pq . q22

4pq4pq33 2pq2pq33 2pq2pq33

aa . Aaaa . Aa qq22 . 2pq . 2pq 1 : 11 : 1

aa . aaaa . aa qq22 . q . q22 qq44 qq44

44

Pravděpodobnost výskytu Pravděpodobnost výskytu jedin. genotypů u dihybidajedin. genotypů u dihybida

AABBAABB = 0,16 . 0,49 = 0,0784= 0,16 . 0,49 = 0,0784AABb = 0,16 . 0,42 = 0,0672AABb = 0,16 . 0,42 = 0,0672Aabb Aabb = 0,48 . 0,09 = 0,0432= 0,48 . 0,09 = 0,0432AaBB AaBB = 0,48 . 0,49 = 0,2352= 0,48 . 0,49 = 0,2352AaBb AaBb = = Aabb Aabb = = aaBB aaBB = = aaBb aaBb = = aabb aabb = =

ΣΣ = 1 = 1

např.:např.: A = pA = pAA = 0,4 B = p = 0,4 B = pBB = 0,7 = 0,7

P(AABB) = P(AA) . P (BB) = pP(AABB) = P(AA) . P (BB) = p22AA . p . p22

BB

POPULAČNÍ GENETIKA 3 Pravděpodobnost v genetice populací

Documents

Transcript of POPULAČNÍ GENETIKA 3 Pravděpodobnost v genetice populací