Плюрипотентность 101
-
Upload
bioinformaticsinstitute -
Category
Science
-
view
133 -
download
1
description
Transcript of Плюрипотентность 101
Плюрипотентность 101
Мария Шутова, к.б.н., н.с. ИОГен РАН
ЭСК
биология развития TF iPSCs
регенеративная медицина
редактирование генома
наследственные заболевания рак
эволюция
GEMMs
Клеточная теория строения организмов
• Все организмы сделаны из одной или более клеток
• Клетка является основополагающей функциональной единицей живых организмов
• Клетки происходят из предсуществующих клеток
эксперименты с пересадкой эмбриональных тканей = начало биологии развития
Нобелевская премия 1935 за открытие «организующих эффектов в эмбриональном развитии»
Возобновление специализированных клеток происходит за счет стволовых
Специализированная клетка
Клетка предшественник
Стволовая клетка
• Клетки, способные к самообновлению • Клетки, способные давать начало многим другим типам клеток
Типы стволовых клеток
Тотипотентные (полностью, лат) -‐ зигота
Плюрипотентные(много, греч.) – эмбриональные стволовые клетки
Мультипотентные (много, лат.) дифференцировка в ткани внутри зародышевых слоев
Пуповинная кровь, клетки костного мозга и тд.
Предшественники дифференцировка в определенные клетки в пределах определенной ткани
В процессе развития организма реализуется онтогенетическая программа разнообразия, в результате выполнения которой клетки постепенно утрачивают потенциал дифференцировки.
Технологии изучения биологии развития:
• моделирование процесса во взрослом организме
(клонирование) • моделирование процесса in vitro
(ЭСК)
ЭСК
биология развития TF iPSCs
регенеративная медицина
редактирование генома
наследственные заболевания
рак
эволюция
GEMMs
R. Briggs T.King
Технология переноса ядра Briggs& King 1952
Рождались живые головастики при переносе ядра эмбриональной клетки. Gurdon в 1962 г. использовал ядро из клетки кишечника взрослой лягушки
Клонирование приматов «Впервые эмбриональные стволовые клетки приматов клонированы
американскими учеными» , 2007
Producing primate embryonic stem cells by somatic cell nuclear transfer J. Byrne D. A. Pedersen L. Clepper, M. Nelson, W. G. Sanger, S. Gokhale, D. P. Wolf & S. M. Mitalipov Genotyping of Rhesus SCNT pluripotent stem cell lines David S. Cram, Bi Song & Alan O. Trounson
Роберт Эдвардс
ЭКО: 4 миллиона человек
Нобелевская премия по медицине 2010
Типы стволовых клеток
Тотипотентные (полностью, лат) -‐ зигота
Плюрипотентные(много, греч.) – эмбриональные стволовые клетки
Мультипотентные (много, лат.) дифференцировка в ткани внутри зародышевых слоев
Пуповинная кровь, клетки костного мозга и тд.
Предшественники дифференцировка в определенные клетки в пределах определенной ткани
ЭСК (плюрипотентность)
ЭСК (плюрипотентность)
плюрипотентность
самовозобновляемость
(Meregally 2011)
ЭСК (in vitro модель развития всего
организма)
Гомологичная рекомбинация в ЭСК
exon1 exon2 exon3 ген
exon1 exon3
exon1 exon2 exon3
exon1 exon3
/очередная/ Нобелевская премия (2007)
ЭСК
биология развития TF iPSCs
регенеративная медицина
редактирование генома
наследственные заболевания
рак
эволюция
GEMMs
Гены-‐ господа, гены-‐рабы (TF)
Ген транскрипционного фактора Pax6 дрозофилы, ответственен за формирование глаз
Если его заставить работать в другом месте, то там вырастет глаз
В 1986-‐89 гг. Harold Weintraub с коллегами показал, что фибробласты кожи могут быть перепрограммированы (конвертированы) в мышцы транскрипционным фактором MyoD
Биология развития TF
Биология развития TF
ЭСК
биология развития TF iPSCs
регенеративная медицина
редактирование генома
наследственные заболевания
рак
эволюция
GEMMs
В процессе развития организма реализуется онтогенетическая программа разнообразия, в результате выполнения которой клетки
постепенно утрачивают потенциал дифференцировки.
2n ДНК, 1 клетка
2n ДНК, 200 типов клеток 100 000 000 000 000 клеток
Клеточные программы реализуется на генетическом и эпигенетическом уровнях.
Waddington, Nature, 1957
Дифференцированные клетки
Плюрипотентная клетка
Epigenetic regulation of gene expression
Examples: Developmental and ~ssue specific gene expression X chromosome inac~va~on in female cells Transforma~on Aging
Histons modifications
CpG DNA methylation 5meC
Non coding RNA
Transcription factors
эпигенетика + TF
W. Reik 2007
Плюрипотентные клетки
iPS cells
разнообразие
потенциал
Онтогенетическая программа развития реализуется на генетическом и эпигенетическом уровне
Плюрипотентные клетки
=?
?
Pluripotent cells from somatic = reprogramming
CHIMERA
Shinya Yamanaka & Helen M. Blau; Nature|Vol 465|10 June
CHIMERA
CHIMERA
cytoplasmic
geneoc or direct
Yamanaka’s “magic cocktail”
In 1986-89 Harold Weintraub with co-workers demonstrated that skin fibroblasts can be converted (reprogrammed) into muscle by MyoD transcription factor overexpression
Клетки взрослого организма
Genetic reprogramming: induced pluripotent stem cells (iPSC)
15-30 дней
Стволовые клетки с индуцированной плюрипотентностью= эмбриональным стволовым клеткам
Belmonte et al., 2011. Nature Review Gene~cs.
Pluripotency a la carte
iPSCs были получены из: Mouse (Yamanaka et al., 2006) Humans (Yamanaka et al., 2007) Rhesus monkey (Liu et al., 2008) Rats (Liao et al., 2009; Li et al., 2009) Canine (Shimada, H. et al, 2010) Porcine ( Esteban, M. A. et al., 2009) Marmoset (Wu, Y. et al., 2010) Rabbit (Honda, A. et al., 2010) Equine (KrisOna Nagy et al., 2011 ) Avian (Lu et al., 2011)
4n
4n 2n
It is possible to reconstruct any organism from a single skin cell
плюрипотентность
самовозобновляемость
Эмбриональные стволовые клетки
(Meregally 2011)
• Natural cells? • Disease mechanism
studies • Drug screening for
toxicity and effectiveness
• Cell therapy
Pros and contra human ESC
Limited blastocyst availability
Immunological incompatibility with the recipient
Индуцированные плюрипотентные стволовые клетки
плюрипотентность
самовозобновляемость пациент-‐специфичность
(Meregally 2011)
Philonenko et al, 2011
• одинаковые свойства? “нормальность” • одинаковая эффективность дифференцировки? “удобство”
• безопасность использования в медицине? • “адекватность” использования iPS клеток как модели болезней?
идентичность ЭСК и iPS?
идентичность ЭСК и iPS?
(Narsinh 2011)
идентичность ЭСК и iPS?
(Yamanaka 2012) (Bock 2011)
Shown are the predic~on accuracy, sensi~vity, and specificity for iden~fying iPS cell lines (true posi~ves, TP) among ES cell lines (true nega~ves, TN), while minimizing the number of cell lines that are incorrectly predicted as iPS cell lines (false posi~ves, FP) or incorrectly predicted as ES cell lines (false nega~ves, FN).
commitment? (Bock 2011)
ЭСК
биология развития TF iPSCs
регенеративная медицина
редактирование генома
наследственные заболевания
рак
эволюция
GEMMs
(Sheng and Hong, 2013)
(Robinton 2012)
Практическое использование индуцированных плюрипотентных клеток
(Cherry and Daley, 2012)
RIKEN is pleased to announce the launch of a pilot study to assess the safety and feasibility of the transplanta~on of autologous induced pluripotent stem cell (iPSC)-‐derived re~nal pigment epithelium (RPE) cell sheets in pa~ents with exuda~ve (wet-‐
type) age-‐related macular degenera~on. (30 July 2013)
Dr Masayo Takahashi
• reprogrammed cells will trigger an immune reac~on
• reprogrammed cells might mul~ply uncontrollably and form tumors instead of healthy ~ssue
• a worry that the treatment, even if it proves harmless, might not be effec~ve
• the iden~ty of the cells might not be stable
???
ЭСК
биология развития TF iPSCs
регенеративная медицина
редактирование генома
наследственные заболевания рак
эволюция
GEMMs