PUBMED
生物醫學文獻資料庫
©臺北醫學大學圖書館
Ver. 2020.03
關於Pubmed…
由美國國家醫學圖書館(NLM)的美國國家生技資訊中心(NCBI)所建置
收錄有超過3,000萬篇生物醫學與健康領域的相關文獻的書目資訊
Who
What
誰做的??
內容範圍??
2
Medline
PMC (Pubmed Central)
Bookshelf
1. 佔比最大(86.8%) 2. 期刊為主 3. 所有書目皆有MeSH
1. 佔比第二 2. 免費期刊/資源 3. 由NLM補助之研究(含DataSet)
1. 佔比最少 2. 免費電子書、報告或檔案
關於Pubmed…
3
透過北醫的Pubmed連結查詢,無論在校院內外,你都能在每篇文獻細目中看到北醫圖示↓↓。
點擊後可再確認是否能取得全文,如果你人在校院外記得先設定校院外連線,否則只能取得本來就公開取用的文章。
校院外連線>> http://bit.ly/30yGYVC
提供部份可取得全文的連結 (不是所有查得書目都有提供)
⒜ 本身就是免費公開取用的文章 →校院內外皆能直接下載
⒝ 圖書館有訂購的期刊/資料庫 →校院內外需設校院外連線才能下載
⒞ 圖書館沒有訂購的期刊 →無論在校院內外都無法下載
How 全文如何取得??
Part 1. 操作介面
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北醫專用網址 http://bit.ly/381mKXM
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5
1
➊ 基本檢索 ➋ 使用說明與教學 ➌ 快速/特定查詢工具 ➍ 其他資源 ➎ 最近新增文章 / 期刊
首頁
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10
9
8 7
6
➏ 基本檢索 ➐ 儲存/匯出書目 ➑ 排序方式/頁面筆數設定 ➒ 篩選條件(Filters) ➓ 查尋結果
查詢 結果
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➊ 回到檢索結果清單頁 ➋ 書目資訊及摘要 ➌ 儲存/匯出書目 ➍ 全文連結1(出版社/PMC/北醫探索) ➎ 至前一筆/後一筆 ➏ 引文格式 ➐ 社群分享/固定連結 ➑ 頁面快速導覽
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5 5
7
8
4
6
單一 書目1
8
⑨ 相似文章
⑩ 被引用文章(資料來源為PMC)
⑪ MeSH標題詞, 讓你快速了解該文獻探討的文章類型、主題及對象
⑫ 全文連結2 / 更多連結 (資料庫/學術社群等)
不同文章提供的詳細項目不一,非每篇文章都會有Cited by, MeSH terms等項目
單一書目2
9
10
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12
Part 2. 建議的檢索步驟
適用各資料庫 尤其是有提供標題表查詢的資料庫,如Medline, Embase, Cochrane Library, CINAHL
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確定檢索主題 將問題拆解成個別主題概念 (例如利用PICO方式)
利用標題表 透過標題表(如MESH)以”主題”查尋,檢視需求輔以”關鍵字”查尋
個別檢索 利用MESH個別檢索主題詞,可確切掌握檢索歷程,並可隨時調整查尋用詞
合併查尋 利用”進階查詢”,將各筆查尋結果合併
篩選結果 利用”Filter”加上適用的條件,挑出所需資料
1
2
3
4
5 10
About PICO…
Question : 一個問句簡潔有力表達臨床特定問題
P Patient/Problem
I Intervention
C Comparison
O Outcomes
誰是病人: 性別, 年齡, 種族, 懷孕, 病史…
何種疾病或症狀
關注的 治療:方式, 劑量, 頻率…
診斷工具
對照的 治療:方式, 劑量, 頻率…
診斷工具
臨床關注、對病患有意義可測量的結果
安全性: 死亡, 副作用…
有效性: 改善症狀, 增加存活, 避免危險因子…
Adapted from 方靜如 (2011),實證醫學文獻搜尋Acquire,實證醫學文獻搜尋暨圖書館推廣經驗分享討論會。 11
Part 3. 醫學標題表 MeSH
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關於MeSH
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醫學標題表,全名是Medical Subject Headings, 簡稱MeSH /mεʃ/。為樹狀結構從廣義到狹義組合而成 (圖見下一張),每個主題詞都代表一個特定的主題範疇。
MeSH是什麼??
跟 Pubmed、Medline一樣,都由美國國家醫學圖書館 (NLM)建置,每年都會因應現狀更新、增刪、調整主題詞表。
誰負責建置+維護的??
查詢時: 將同概念(≠同義詞)的詞彙們建立關連,讓 你可以用「主題」檢索,而較不需煩惱還 有哪些關鍵字可以加入查詢
閱讀時: 可快速了解文章內容所探討的主題及面向
MeSH的好處??
並沒有。 Pubmed上有近90% 書目有MeSH,本身沒有收入Medline、新加入Pubmed或正在加工中的文章不會有MeSH。
Pubmed上所有書目都有加上MeSH嗎??
從廣義到狹義組合而成的樹狀結構
廣義
**以查詢Cancer為例
14
←樹狀結構
它呈現了主題之間的關係;愈上層主題涵蓋範圍越大,愈下層的主題涵蓋範圍則越精細。
狹義
Cancer在這裡
同概念詞彙之間的串連整理
**以查詢Cancer為例
Neoplasms 腫瘤
Malignant Neoplasm
惡性腫瘤
Benign Neoplasm
良性腫瘤
Malignancy 惡性腫瘤
Tumor 腫瘤
Cancer 癌症
MeSH 標題表的主題詞彙
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MeSH term vs. Keyword
兩者比較 Keyword 關鍵字 MeSH term 醫學標題詞
是否出現在內文中 是 不一定
標註者 作者 NLM聘請之學術專家
代表文章概念 不一定 可 有區分主要概念 (Major Topic打*號) 或次要概念
重點: 用MeSH檢索 = 用主題查詢 較不用擔心漏掉同義詞或同概念詞彙的問題
BUT!!! 若查找主題或關鍵字不常見、或搜尋到的文獻非常少時,不適用MeSH檢索
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利用MeSH來檢索文獻就夠了嗎??
17
當然不夠!! 因為…
1) 你會找不到最新加入Pubmed的文章
2) 你會找不到本身就沒有MeSH的文章
3) 你會找不到還在加工(增加MeSH)的文章
4) 你不見得能找到適合所需主題的主題詞彙
因此實際檢索時還是要配合一般關鍵字(自然語言)檢索文獻,才能降低遺漏的筆數。
18 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/mesh/
點擊進入MeSH 資料庫
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↑MeSH資料庫首頁
直接輸入想到的主題詞彙,查看是否能得到適合的主題詞。(MeSH檢索畫面請參考後續檢索範例)
此資料庫是查「詞彙」而非「文章」
由於此資料庫全名與簡稱對應不完整,建議以全名查詢,不要用簡稱或縮寫
2
1
3 限定只找出重點討論此標題的文獻
不把狹義詞加入檢索 20
➊ 主題詞的定義
➋ 相關面向,勾選帶入Pubmed查詢可查得更精準
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5
4 ➍ 同概念的主題詞彙
➎ 從廣義到狹義組合而成的樹狀結構
Neoplasm的Entry Terms中有良性腫瘤及惡性腫瘤,由此可知,為何我們強調是「同概念」的彙整,而非「同義詞」的彙整。
不同的標題表,詞彙的涵蓋範圍也不同,應用時請特別注意此差異。
+表示此主題還有狹義
Part 4. 進階查詢 (合併查詢)
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各頁面檢索區下方皆有 Advanced 點擊即可進入進階查詢
首頁↓
檢索結果頁↓
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以下三個位置連結皆可進入Advanced Search
24
1
2
➊ 可限制查詢欄位的關鍵字檢索列 ➋ 檢索策略框,可從➊和➌代入,亦可自行輸入字詞 ➌ 檢索歷史,可代入➋與其他條件/紀錄合併查詢
進階 檢索
3
25
1
2
點擊 可依需求套用AND / OR / NOT
點擊 可選擇查詢後進入檢索結果頁或直接代入檢索歷史
A B A B A B
A AND B A OR B A NOT B
布林邏輯運算元
26
3
A
B
點擊Results的數字可直接進入檢索結果,不需重新輸入檢索策略
點擊 A 展開Search Detail, 確認Pubmed實際查詢的檢索策略
點擊 B 可下拉選擇以AND/OR/NOT代入➋(前一頁), 與其他關鍵字 或紀錄合併查詢
每次的檢索,系統都會產生一個檢索號碼,本區可看到所有的檢索步驟歷史紀錄
將自動移除重覆的檢索策略,並將相同檢索紀錄移至History最上方
此處紀錄在系統未運作八小時後將被系統消除
檢索歷史可顯示最新查詢的100筆紀錄
檢索技巧
使用AND, OR, NOT增加關鍵字縮小檢索範圍
注意事項
AND, OR, NOT需大寫
使用2個以上此指令請加 ( ), 以便系統判定執行先後
運算優先順序: ( )>NOT>AND>OR
檢索範例: kangaroo care AND father
利用切截 Truncate (在字根後輸入星號* )
注意事項
檢索的字根至少4字母,如低於4個字母系統會有警示
適用於新穎的主題、想增加檢索量
關鍵字若超過1個字或為片語可於前後加”“ 或以-連接
檢索範例: “breast feed*” breast-feed*
限制關鍵字的排列 (前後加上雙引號)
注意事項
適用於關鍵字超過1個字或為片語
Pubmed不會將帶有雙引號的關鍵字轉成MeSH關鍵字進行查詢(可查看search detail)
檢索範例: kangaroo care v.s. “kangaroo care ”
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Part 5. 檢索範例
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各頁面檢索區下方皆有 Advanced 點擊即可進入進階查詢
Exercise
蔓越莓是否預防女性泌尿道感染?
P patient/problem
女性 female 泌尿道感染 UTI (Urinary Tract Infection)
I Intervention
吃蔓越莓 eat cranberry
C Comparison
不吃蔓越莓 doesn’t eat cranberry
O Outcome
感染率 Infection
限制查找實證文獻的資料類型
Systematic Review(SR), Meta Analysis(MA), Randomized Controlled Trial(RCT)
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1. 進入MeSH資料庫
2. 輸入主題詞查詢
1
2
30
4
5
3
3. 依據定義判斷哪一個主題詞符合所需 點擊主題詞進入細目 沒有特別的面向(subheading)要選,可 於此頁直接代入Pubmed檢索框
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6 6. 自動返回Pubmed首頁,再次進入MeSH Database (位置請看Step➊)
7 7. 輸入第二個主題詞 (以全稱查詢結果較理想)
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8. 若查詢的詞彙只有一筆結果會直接 進入該詞彙的細目 有適用的Subheadings可自行勾選
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8
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10. 進入Advanced 進階檢索
10
35
合併檢索策略 11. 點擊 展開選單 12. 選擇Add query 加入上方的檢索框 (Query box)
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12
檢索框在這裡
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13
14
合併檢索策略 13. 點擊 展開選單 14. 依個人需求選擇AND / OR / NOT 加入上方的檢索框 (Query box)
#2 #1
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16
17
18
篩選結果 16. 點擊 開啟選單
17. 依個人需求勾選欲套用的篩選條件 18.勾選完畢後點 , 會回到檢索結果頁
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19
篩選結果 19. 個別勾選欲套用的篩選條件
當勾選任一項時,資料庫會立即套用此條件
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查詢新的關鍵字/策略前記得清除前一次套用的Filters, 否則會自動延用前一次使用的Filters
文章標題前後有 [ ]表示其本文語言不是英文
這篇是義大利文
這篇是西班牙文
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圖書館網址 http://library.tmu.edu.tw
ELIS館藏(書刊)查詢系統 https://libelis.tmu.edu.tw/
電子資源查詢系統ERM http://diglib.tmu.edu.tw/
文獻查詢及檢索相關問題, 歡迎來電圖書館參考服務台 (週一至週五 10:00-17:00)
參考服務諮詢台 電話: 02 2736-1661 ext.2515 位置: 醫學綜合大樓後棟三樓 Mail : [email protected]
課後問卷
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