Download - PROTOZOONLARDA GEN SUSTURMA ve miRNA Dr. Yunus UYAR ERÜ Tıp Fak. Parazitoloji AD

Transcript
Page 1: PROTOZOONLARDA   GEN SUSTURMA  ve  miRNA Dr. Yunus UYAR  ERÜ Tıp Fak. Parazitoloji AD

PROTOZOONLARDA GEN SUSTURMA

ve miRNA

Dr. Yunus UYAR ERÜ Tıp Fak. Parazitoloji AD

Page 2: PROTOZOONLARDA   GEN SUSTURMA  ve  miRNA Dr. Yunus UYAR  ERÜ Tıp Fak. Parazitoloji AD

•Protozoon parazitler önemli mortalite ve morbidite etkenleri

Page 3: PROTOZOONLARDA   GEN SUSTURMA  ve  miRNA Dr. Yunus UYAR  ERÜ Tıp Fak. Parazitoloji AD

•1998 dsRNA’nın RNAi ile gen ekspresyonunun baskılanması

Page 4: PROTOZOONLARDA   GEN SUSTURMA  ve  miRNA Dr. Yunus UYAR  ERÜ Tıp Fak. Parazitoloji AD

•dsRNA: 20 ila 30 nükleotidden oluşan küçük, kodlama yapmayan,

çift iplikli RNA

Page 5: PROTOZOONLARDA   GEN SUSTURMA  ve  miRNA Dr. Yunus UYAR  ERÜ Tıp Fak. Parazitoloji AD

•RNAi yolakları protozoon hastalıklarının tedavisinde kullanılabilir mi?

Page 6: PROTOZOONLARDA   GEN SUSTURMA  ve  miRNA Dr. Yunus UYAR  ERÜ Tıp Fak. Parazitoloji AD

• T.brucei, T.cruzi, • L.brasiliense, L.major• P.falciparum, • T.gondii, • E.histolytica,• G.intestinalis.

Page 7: PROTOZOONLARDA   GEN SUSTURMA  ve  miRNA Dr. Yunus UYAR  ERÜ Tıp Fak. Parazitoloji AD

• Laboratuar koşullarında üretilebilmeleri,• Genetik manipülasyona uygun

olmaları,• Genom yapılarının bilinmesi.

Page 8: PROTOZOONLARDA   GEN SUSTURMA  ve  miRNA Dr. Yunus UYAR  ERÜ Tıp Fak. Parazitoloji AD

•RNAi’nin fonksiyonel olduğu gösterilen ilk protozoon parazit: T.brucei

Page 9: PROTOZOONLARDA   GEN SUSTURMA  ve  miRNA Dr. Yunus UYAR  ERÜ Tıp Fak. Parazitoloji AD

•Hedef mRNA’nın baskılanmasına ve sentezlenecek proteinin inhibisyonuna

Page 10: PROTOZOONLARDA   GEN SUSTURMA  ve  miRNA Dr. Yunus UYAR  ERÜ Tıp Fak. Parazitoloji AD

• T.brucei’de RNAi yolağının iki kolu mevcuttur. Bunlardan birisi nükleusta diğeri ise sitoplazmada bulunmaktadır.

Page 11: PROTOZOONLARDA   GEN SUSTURMA  ve  miRNA Dr. Yunus UYAR  ERÜ Tıp Fak. Parazitoloji AD

• Nükleer yolağın görevi baskılamayla genom stabilitesinin sağlanmasıdır.• Sitoplazmik yolak ise tam

olarak anlaşılamamıştır.

Page 12: PROTOZOONLARDA   GEN SUSTURMA  ve  miRNA Dr. Yunus UYAR  ERÜ Tıp Fak. Parazitoloji AD

• T.brucei’de bulunan endojen siRNA yolağı•Drosophila ve • Fare

Page 13: PROTOZOONLARDA   GEN SUSTURMA  ve  miRNA Dr. Yunus UYAR  ERÜ Tıp Fak. Parazitoloji AD

• T.brucei’de 210 gen analiz edilmiş•RNAi → %33 baskılama

Page 14: PROTOZOONLARDA   GEN SUSTURMA  ve  miRNA Dr. Yunus UYAR  ERÜ Tıp Fak. Parazitoloji AD

• RNAi’nin gen fonksiyonu analizinde bir araç olarak kullanılması için dsRNA’nın tetrasiklin aracılı ekspresyonundan faydalanılmaktadır

Page 15: PROTOZOONLARDA   GEN SUSTURMA  ve  miRNA Dr. Yunus UYAR  ERÜ Tıp Fak. Parazitoloji AD

• T.brucei ile ilgili ilk keşiften sonra bu konuda günümüze kadar 500’ün üzerinde daha makale yayınlanmıştır.

Page 16: PROTOZOONLARDA   GEN SUSTURMA  ve  miRNA Dr. Yunus UYAR  ERÜ Tıp Fak. Parazitoloji AD

• T.cruzi, L.major ve L.donovani’nin dsRNA’ya cevap verebilmesi

Page 17: PROTOZOONLARDA   GEN SUSTURMA  ve  miRNA Dr. Yunus UYAR  ERÜ Tıp Fak. Parazitoloji AD

•P.falciparum’da RNAi ile gen ekspresyonunun baskılanması

Page 18: PROTOZOONLARDA   GEN SUSTURMA  ve  miRNA Dr. Yunus UYAR  ERÜ Tıp Fak. Parazitoloji AD
Page 19: PROTOZOONLARDA   GEN SUSTURMA  ve  miRNA Dr. Yunus UYAR  ERÜ Tıp Fak. Parazitoloji AD
Page 20: PROTOZOONLARDA   GEN SUSTURMA  ve  miRNA Dr. Yunus UYAR  ERÜ Tıp Fak. Parazitoloji AD
Page 21: PROTOZOONLARDA   GEN SUSTURMA  ve  miRNA Dr. Yunus UYAR  ERÜ Tıp Fak. Parazitoloji AD

•Plasmodiumlarla ilgili gelecekteki RNAi çalışmaları yeni tedavilerin geliştirilmesi yönünde olabilecektir.

Page 22: PROTOZOONLARDA   GEN SUSTURMA  ve  miRNA Dr. Yunus UYAR  ERÜ Tıp Fak. Parazitoloji AD

•2004’te E.histolytica’da dsRNA’nın ekspresyonunun hedef mRNA’da baskılanma

Page 23: PROTOZOONLARDA   GEN SUSTURMA  ve  miRNA Dr. Yunus UYAR  ERÜ Tıp Fak. Parazitoloji AD

• L.brasiliensis RNAi yolağının kullanıldığı gösterilen protozoon parazitlerdendir. • Genom yapsının açıklığa

kavuşturulduğu 2007’de RNAi yolağı genlerinin varlığı da anlaşılmıştır

Page 24: PROTOZOONLARDA   GEN SUSTURMA  ve  miRNA Dr. Yunus UYAR  ERÜ Tıp Fak. Parazitoloji AD

• T.gondii’de gen ekspresyonunun baskılanmasında

dsRNA

Page 25: PROTOZOONLARDA   GEN SUSTURMA  ve  miRNA Dr. Yunus UYAR  ERÜ Tıp Fak. Parazitoloji AD
Page 26: PROTOZOONLARDA   GEN SUSTURMA  ve  miRNA Dr. Yunus UYAR  ERÜ Tıp Fak. Parazitoloji AD
Page 27: PROTOZOONLARDA   GEN SUSTURMA  ve  miRNA Dr. Yunus UYAR  ERÜ Tıp Fak. Parazitoloji AD
Page 28: PROTOZOONLARDA   GEN SUSTURMA  ve  miRNA Dr. Yunus UYAR  ERÜ Tıp Fak. Parazitoloji AD
Page 29: PROTOZOONLARDA   GEN SUSTURMA  ve  miRNA Dr. Yunus UYAR  ERÜ Tıp Fak. Parazitoloji AD
Page 30: PROTOZOONLARDA   GEN SUSTURMA  ve  miRNA Dr. Yunus UYAR  ERÜ Tıp Fak. Parazitoloji AD
Page 31: PROTOZOONLARDA   GEN SUSTURMA  ve  miRNA Dr. Yunus UYAR  ERÜ Tıp Fak. Parazitoloji AD
Page 32: PROTOZOONLARDA   GEN SUSTURMA  ve  miRNA Dr. Yunus UYAR  ERÜ Tıp Fak. Parazitoloji AD
Page 33: PROTOZOONLARDA   GEN SUSTURMA  ve  miRNA Dr. Yunus UYAR  ERÜ Tıp Fak. Parazitoloji AD
Page 34: PROTOZOONLARDA   GEN SUSTURMA  ve  miRNA Dr. Yunus UYAR  ERÜ Tıp Fak. Parazitoloji AD
Page 35: PROTOZOONLARDA   GEN SUSTURMA  ve  miRNA Dr. Yunus UYAR  ERÜ Tıp Fak. Parazitoloji AD
Page 36: PROTOZOONLARDA   GEN SUSTURMA  ve  miRNA Dr. Yunus UYAR  ERÜ Tıp Fak. Parazitoloji AD
Page 37: PROTOZOONLARDA   GEN SUSTURMA  ve  miRNA Dr. Yunus UYAR  ERÜ Tıp Fak. Parazitoloji AD

TEŞEKKÜR EDERİM