Türkçe Katalog PDF

İstanbul Üniversitesi Merkez Kampüsü34452 Beyazıt / Fatih-İstanbul+90 (212) 440 00 00 [email protected]

istanbul.edu.tr facebook.com/istanbuluniversitesi1453 twitter.com/istanbuledutr

İSTANBUL ÜNİVERSİTESİ ARAŞTIRMA LABORATUVARLARI2014

İçindekilerMADDE ve AKIL ETKİLEŞİMLERİ LABORATUVARI 10NÖROİMMÜNOLOJİ ve İMMÜNOGENETİK LABORATUVARI 11KOGNİTİF NÖROBİLİM LABORATUVARI 12MOLEKÜLER BİYOFİZİK LABORATUVARI 13ELEKTROENSEFALOGRAFİ LABORATUVARI 14TIBBİ GENETİK ARAŞTIRMA LABORATUVARI 15HİSTOLOJİ ve EMBRİYOLOJİ ARAŞTIRMA LABORATUVARLARI 16ÇOCUK SAĞLIĞI ve HASTALIKLARI BESLENME ve METABOLİZMA LABORATUVARI 17NÖROPSİKOLOJİ LABORATUVARI 18MİKROBİYOLOJİ ARAŞTIRMA LABORATUVARLARI 19ÇOCUK ENDOKRİNOLOJİSİ ARAŞTIRMA LABORATUVARI 20TIBBİ BİYOLOJİ LABORATUVARI 21BEYİN ve NÖRODEJENERATİF/NÖROGENETİK HASTALIKLAR LABORATUVARI 22İŞİTME ve KONUŞMA BOZUKLUKLARI MERKEZİ/ODYOLOJİ LABORATUVARI 23UYKU ve UYANIKLIK BOZUKLUKLARI BİRİMİ 24PEDİATRİK GENETİK LABORATUVARI 25TIBBİ MOLEKÜLER GENETİK LABORATUVARI 26ANALİTİK KİMYA ARAŞTIRMA LABORATUVARI 27FARMAKOGNOZİ ARAŞTIRMA LABORATUVARI 28FARMAKOLOJİ ARAŞTIRMA LABORATUVARI 29FARMASÖTİK TEKNOLOJİ ARAŞTIRMA LABORATUVARI 30FARMASÖTİK TOKSİKOLOJİ ARAŞTIRMA LABORATUVARI 31ISTE (HERBARYUM) 32ANDROLOJİ LABORATUVARI 33DNA ANALİZ LABORATUVARI 34FOSİL DNA LABORATUVARI 35GIDA BİLİMİ LABORATUVARLARI 36HÜCRE KÜLTÜRÜ LABORATUVARI 37IN VITRO FERTİLİZASYON ve EMBRİYO TRANSFER LABORATUVARI 38KARKAS ve ET KALİTESİ LABORATUVARI 39OSTEOARKEOLOJİ LABORATUVARI 40VİROLOJİ ARAŞTIRMA LABORATUVARI 41AKAN HÜCRE ÖLÇER LABORATUVARI 42

NADİR HASTALIKLAR ARAŞTIRMA LABORATUVARI 43MOLEKÜLER HEMATOLOJİ ARAŞTIRMA LABORATUVARI 44TÜBERKÜLOZ MOLEKÜLER EPİDEMİYOLOJİSİ LABORATUVARI 45DOKU KÜLTÜRÜ ve PROTEOMİK LABORATUVARI 46NÖROİMMÜNOLOJİ LABORATUVARI 47DENEY HAYVANLARI ÜRETİM, SAFLAŞTIRMA ve ARAŞTIRMA LABORATUVARI 48MOLEKÜLER METABOLİK ARAŞTIRMALAR LABORATUVARI 49LANGERHANS ADACIK İZOLASYON ve TRANSPLANTASYON ARAŞTIRMA LABORATUVARI 50HEMATOPOİETİK ve KANSER KÖK HÜCRE LABORATUVARI 51HULUSİ BEHÇET YAŞAM BİLİMLERİ ARAŞTIRMA LABORATUVARI 52GÖZLEMEVİ İST60 TELESKOBU 56GÜNEŞ GÖZLEMEVİ 57HÜCRE ve DOKU KÜLTÜRÜ LABORATUVARI 58MOLEKÜLER HÜCRE BİYOLOJİSİ ARAŞTIRMA LABORATUVARI 59BİYOKİMYA ARAŞTIRMA LABORATUVARI 60PRİMER-KÖK HÜCRE VE KANSER ARAŞTIRMA LABORATUVARI 61RADYOEKOLOJİ LABORATUVARI 62MOLEKÜLER KANSER BİYOLOJİSİ LABORATUVARI 63İMMÜNOHİSTOKİMYA ARAŞTIRMA LABORATUVARI 64FİZYOLOJİ ARAŞTIRMA LABORATUVARI 65MOLEKÜLER RADYOBİYOLOJİ ve BİYOMOLEKÜLER TEKNOLOJİ ARAŞTIRMA LABORATUVARI 66BİTKİ BİYOTEKNOLOJİSİ ve GENETİĞİ DEĞİŞTİRİLMİŞ ORGANİZMALAR LABORATUVARI 67ÇEVRE ve ENSTRÜMENTAL ANALİZ LABORATUVARI 68TEMEL ve ENDÜSTRİYEL MİKROBİYOLOJİ ARAŞTIRMA LABORATUVARI 69MOLEKÜLER RADYOBİYOLOJİ ve BİTKİ BİYOTEKNOLOJİSİ ARAŞTIRMA LABORATUVARI 70PLANKTON KÜLTÜR LABORATUVARI 71ISTF (HERBARYUM) 72NANO ve OPTOELEKTRONİK ARAŞTIRMA LABORATUVARI 73İLERİ LİTOGRAFİK YÖNTEMLER LABORATUVARI 74YÜKSEK MANYETİK ALAN ve DÜŞÜK SICAKLIK LABORATUVARI 75MOLEKÜLER SPEKTROSKOPİ LABORATUVARI 76LASER SPEKTROSKOPİ LABORATUVARI 77DİELEKTRİK SPEKTROSKOPİ LABORATUVARI 78NÜKLEER FİZİK ARAŞTIRMA LABORATUVARI 79

ANTİK DNA ARAŞTIRMA LABORATUVARI 80BİTKİ BİYOTEKNOLOJİSİ LABORATUVARI 81PROTEOMİK LABORATUVARI 82İNSAN HASTALIKLARINDA MOLEKÜLER TANI LABORATUVARI 83BİTKİ GENOMİK ARAŞTIRMALAR LABORATUVARI 84BİYOİNFORMATİK LABORATUVARI 85GENETİĞİ DEĞİŞTİRİLMİŞ ORGANİZMALAR LABORATUVARI 86BİTKİ PATOLOJİSİ LABORATUVARI 87BİTKİ SEKONDER METABOLİZMA MÜHENDİSLİĞİ LABORATUVARI 88MAYA GENETİĞİ, TEKNOLOJİSİ ve GENOMİK ARAŞTIRMALAR LABORATUVARI 89ATIK TEKNOLOJİSİ ARAŞTIRMA LABORATUVARI 90ORGANİK KİMYA ARAŞTIRMA LABORATUVARI 91GIDA ANTİOKSİDANLARI ÖLÇÜMÜ UYGULAMA ve ARAŞTIRMA MERKEZİ 92BİYOKİMYA ARAŞTIRMA LABORATUVARI 93PROSES ve REAKTÖR TASARIMI ARAŞTIRMA LABORATUVARI 94JEOKRONOLOJİK ÖRNEK HAZIRLAMA ve MİNERAL AYIRMA LABORATUVARI 95TOPRAK İLMİ ve EKOLOJİ LABORATUVARI 96NANOTEKNOLOJİ LABORATUVARI ve TERMAL ANALİZ LABORATUVARI 97PROF. DR. A. YILMAZ BOZKURT AĞAÇ MALZEME YANMA TEST ve ANALİZ LABORATUVARI 98YILLIK HALKA ARAŞTIRMALARI ve ODUN ANATOMİSİ LABORATUVARI 99PROF. DR. A. YILMAZ BOZKURT ODUN ANATOMİSİ LABORATUVARI 100ORMAN ÜRÜNLERİ KİMYASI ve TEKNOLOJİSİ ARAŞTIRMA LABORATUVARI ve SELÜLOZ,KÂĞIT KARTON ANALİZ LABORATUVARI 101HAVZA YÖNETİMİ LABORATUVARI 102ENSTRÜMANTAL ANALİZ LABORATUVARI 103EKOTOKSİKOLOJİ ve SİYANOTOKSİN LABORATUVARI 104TEKNOLOJİ TRANSFER UYGULAMA ve ARAŞTIRMA MERKEZİ MERKEZ ARAŞTIRMA LABORATUVARI (MERLAB) 105PRODÜKSİYON ve POST-PRODÜKSİYON LABORATUVARI 108PREHİSTORYA LABORATUVARI 109GEMİ KONSERVASYON ve REKONSTRÜKSİYON LABORATUVARI 110YENİKAPI BATIKLARI ARAŞTIRMA MERKEZİ LABORATUVARI 111

SUNUŞ

İstanbul Üniversitesi, 561 yıllık tarihinde sağlık, sosyal, fen ve mühendislik bilimleri ile kültür ve sanatta topluma yön veren Türkiye’nin ilk üniversitesi ve Avrupa’da kurulan ilk 10 üniversiteden birisidir. 20 Fakülte, 17 Enstitü, 3 Yüksekokul, 1 Konservatuar, 7 Meslek Yüksekokulu, 41 Uygulama ve Araştırma Merkezi ve 3 Bölüm ile 767 Diploma programını yürüten Türkiye’nin en büyük ve en köklü üniversitesidir. Her yıl yaklaşık 18.000 mezunuyla eşsiz bir eğitim ve öğretim potansiyeline sahiptir.

Son sekiz yıldır dünyanın en iyi 500 Üniversitesi ( ARWU sıralaması ) içinde yer alan İstanbul Üniversitesi’nin yakın gelecekteki hedefi dünyanın ilk 100 üniversitesi arasına girmek ve 1453 yılından beri geçmişimizin şekillenmesindeki büyük rolünü “ Tarihten Geleceğe Bilim Köprüsü “ olarak sürdürmektir.

İstanbul Üniversitesi, Türkiye’nin en çok yayın yapan üniversitesi olup, öğretim üyesi başına yayın sayısı her yıl yaklaşık olarak % 5 artış göstermektedir. Bu başarının ardında; bilim insanlarının uluslararası düzeydeki araştırma altyapı imkânlarının ve motivasyonlarının arttırılmasına yönelik ciddi destek gayretleri vardır. Temel bilim araştırmalarının desteklenmesi, ulusların bilimsel arenada ileri gitmesinde temel rol oynar. Ancak, globalleşen dünyada sürdürülebilir kalkınma, topluma yaygınlaşmış refah ve yaşanılabilir bir dünya geleceği için toplum hizmetindeki araştırmalar tek çaredir. Bu hedefe ulaşmanın yolu, temel bilim araştırmalarını ihmal etmeden uygulamalı bilimlerdeki araştırmaları tüm ilgili kurum ve kuruluşlarla işbirliği içinde yapmaktan geçer.

İstanbul Üniversitesi son 5 yılda araştırma kapasitesini bilimsel yayınların ötesine taşımayı, ülke, bölge ve dünya toplumunun sorunlarına çare üreten yeni teknoloji ve ürünlere dönüştürmeyi en önemli hedefi olarak kabul etmiştir. Topluma dokunan araştırmalarla çevre, enerji kaynakları, sosyal, sağlık ve kültür alanlarının problemlerine sürdürülebilir çözümler üretmek en önemli misyonumuz, bu hedefe ulusal, bölgesel ve küresel akademik işbirlikleri ile ulaşmak ve 10 yıl içinde bu süreci uluslararası akademik camianın dikkatini çekecek düzeye çıkarmak ise temel vizyonumuzdur.

İstanbul Üniversitesi Araştırma Laboratuvarları Kataloğu ile sağlık, sosyal, fen ve mühendislik alanlarında ulusal ve uluslararası paydaşlarımızla işbirliklerimizi arttırmak amacı ile araştırma envanterimizi ve üniversitemizin araştırma laboratuvarının imkânlarını üniversiteler, devlet kurumları, özel sektör kuruluşları ve toplumun dikkatine sunuyoruz.

Tanıtımını yaptığımız ve özellikle uluslararası işbirliğine uygun olanlarını seçtiğimiz araştırma birimleri ve birikimimizin gelecekte daha güzel bir dünyada yaşama kararlılığımız için yeni fırsat ve işbirliklerine hizmet etmesini gönülden dilerim.

Prof. Dr. Yunus SÖYLETİstanbul Üniversitesi Rektörü

SAĞLIK BİLİMLERİARAŞTIRMA LABORATUVARLARI

Laboratuvar Sorumlusu ve İletişim Bilgileri

Prof. Dr. Sacit Karamürsel0212 4142000 - [email protected]

Laboratuvar Araştırma Altyapısı

Kiplenmiş Kafatası Geçişli Elektriksel Uyarım Siste-

mi, EEG-Neurofeedback Sistemi, Görsel Uyarılma

Potansiyeli/Elektroretinografi Sistemi (8 kanallı po-

ligraf, analog/sayısal çeviriciler, Görsel uyaran sunum

sistemleri)

İşbirlikleri ve Projeler

Laboratuvar, Avrupa Birliği COST programı kap-

samında “Elektriksel Nöronal Osilasyonlar ve Kog-

nisyon” başlıklı projede yer almıştır. TÜBİTAK’ın

Makedonya-Türkiye ikili araştırma destekleri kapsa-

mında Makedonya Bilimler Akademisi ile EEG-Neu-

rofeedback konusunda ortak proje yürütülmektedir.

Kiplenmiş kafatası geçişli elektriksel uyarımın atılganlığa etkisi, elektrik-sel uyarımla duyu ve ağrı eşiği öl-

çüm çalışmaları, transkranyal elektriksel uyarımın duyu-ağrı eşiğine ve sempatik sistem üzerine etkisinin araştırılması, beyin ve sinir sistemi cerrahisi ameliyat-ları esnasında nöromonitorizasyon ile takip ve omurgasızlarda karşılaştırma-lı elektrofizyoloji çalışmaları yapılmakta ve bu deneysel çalışmalar için aygıt ta-sarımı, yapımı ve ölçüm teknikleri geliş-tirme çalışmaları sürdürülmektedir.

İSTANBUL TIP FAKÜLTESİ MADDE ve AKIL ETKİLEŞİMLERİ LABORATUVARI

10



Laminar akışlı kabin, CO2 İnkübatörü, İnvert mik-

roskop, Fluoresan mikroskop, ELISA okuma cihazı,

santrifüj, Termal döngü cihazı, Gerçek zamanlı ter-

mal döngü cihazı (Light Cycler), Nanodrop Spektro-

fotometre, Yatay elektroforez ekipmanları, Jel görün-

tüleme ve dokümantasyon cihazı.


Heidelberg Üniversitesi (Almanya), Mannheim Üni-

versitesi (Almanya) ve Patras Üniversitesi (Yunanis-

tan) ile işbirlikleri yürütülmektedir.

Otoimmun hastalıklar içinden ağır-lıkla sinir sistemi hastalıklarının immunolojik mekanizmaları araş-

tırılmaktadır. Öncelikle multipl skleroz ve myastenia gravis ve ilişkili diğer hasta-lık gruplarının biyolojik materyalleri ban-ka niteliğinde saklanmakta, değerlen-dirilmekte ve multidisipliner bir işbirliği ortamı olarak geliştirilmektedir. Araştır-malar hücresel immün yanıtın değerlen-dirilmesi ve genetik incelemelerle yürü-tülmektedir.

Prof. Dr. Güher Saruhan Direskeneli 0212 4142000 - [email protected]

İSTANBUL TIP FAKÜLTESİ NÖROİMMÜNOLOJİ ve İMMÜNOGENETİK LABORATUVARI

11


Prof. Dr. Tamer Demiralp0212 4142000 - [email protected]


EEG/OİP Laboratuvarı (elektromanyetik ve ses yalı-

tımlı oda, 32 ve 64 kanallı sayısal EEG yükselticileri,

Görsel-işitsel uyaran sunum sistemleri ve yazılımları,

EEG/OİP analiz yazılımları), MR ve TMS uyumlu

32 kanallı EEG/OİP Sistemi, Navigasyonlu Transk-

ranyal Manyetik Uyarım (TMS) Sistemi


Bremen Üniversitesi (Almanya), Münih Ludwig-

Maximillian Üniversitesi (Almanya), İnsan Kognis-

yonu ve Beyin Bilimleri için Max Planck Enstitüsü

(Leipzig, Almanya), Berlin Beyin ve Zihin Enstitü-

sü (Almanya) ve Küba Nörobilim Enstitüsü ile iş-

birlikleri ve ortak projeler yürütülmektedir. Ankara

Üniversitesi ile ortak TÜBİTAK projesi ve İstanbul

Şehir Üniversitesi ile ortak İSTKA projesi yapılmış,

Boğaziçi Üniversitesi ile ortak araştırmalar yürütül-

mektedir.

Elektroensefalogram (EEG) ve Olaya İlişkin Beyin Potansiyelleri (OİP) ve Navigasyonlu Transkranyal Man-

yetik Uyarım (TMS) yöntemleri kullanı-larak insanda algı, dikkat, bellek, dil gibi kognitif süreçler sırasında aktiflenen be-yin yapıları ve mekanizmaları araştırıl-maktadır. TMS ve Manyetik Rezonans Görüntüleme (MRI) uyumlu EEG/OİP sistemleri kullanılarak, fonksiyonel MRI (fMRI) veya TMS yöntemleri ile EEG/OİP ölçümlerinin entegrasyonu laboratuva-rın temel çalışma alanlarındandır. Labo-ratuvarda temel beyin araştırmalarının yanısıra Alzheimer ve Parkinson hasta-lığı başta olmak üzere çeşitli demansla-rın ve psikiyatrik hastalıkların nörobiyo-lojik mekanizmaları ve kognisyon için risk oluşturan kardiyovasküler faktörle-rin etkileri araştırılmaktadır.

İSTANBUL TIP FAKÜLTESİ KOGNİTİF NÖROBİLİM LABORATUVARI

12



Soğuk oda, Sıcak oda, Karanlık oda, Laminar akışlı

kabin, CO2 İnkübatörü, Ters mikroskop, Fluoresan

mikroskop, Termal döngü cihazı, Western Blot, Di-

key ve yatay elektroforez ekipmanları, Liyofilizatör,

Viskozimetre, Vorteks, Sıvı kromotografi saflaştırma

sistemi, Fluoresan spektrofotometre, UV-Vis spek-

trofotometre, Translüminatör, Elektroforez tankı.


MD Anderson Kanser Araştırma Merkezi (ABD) ve

Semmelweis Üniversitesi (Macaristan) ile işbirlikleri

bulunmaktadır.

Hücre ve doku kültürü, kök hücre konularında uzun yıllardan beri önemli çalışmalar yapmaktadır.

Hibridoma ve monoklonal antikor üre-timinde ülkemizde öncü rol oynamış-tır. Hücre ve dokulardan protein, nükle-ik asit (DNA-RNA) ve her türlü hücresel organel saflaştırılması, moleküler yön-temler kullanılarak (immünofluoresan) hücre ve doku düzeyinde görüntüleme, biyoteknolojik yöntemlerle rekombinant protein üretimi, poliklonal antikor geliş-tirilmesi, saflaştırılması, protein-prote-in/ protein-ligand etkileşimleri, hücre içi protein trafiği, in vitro protein sente-zi, post translasyonel modifikasyonlar (ADP-ribozillenme, fosforillenme) ay-rıca prokaryot ve ökaryot protein sen-tez mekanizmalarının açıklanmasında, konusunda önemli çalışmalar yürütül-mektedir. Apoptoz, oksidatif stres, anti-oksidanların oksidatif strese etkileri, mi-tokondriyal hasar, Ca++ metabolizması ve iyon kanalları konuları ile doku ve or-ganlardan mezenkimal kök hücre izo-

lasyonu, kültürü, hematopoetik kök hüc-re ve kanser kök hücre izolasyonu, doku mühendisliği üzerine çalışmalar yapıl-maktadır.

Prof.Dr. Muhammet Bektaş

0212 4142000 - [email protected]

Prof. Dr. Işıl Albeniz0212 4142000 - [email protected]

İSTANBUL TIP FAKÜLTESİ MOLEKÜLER BİYOFİZİK LABORATUVARI

13


Prof. Dr. Betül Baykal0212 41420000 - [email protected]


EEG, Video-EEG cihazı ve kısa süreli ve uzun süreli

devamlı Video-EEG cihazı.


Epicure 6. Çerçeve Avrupa Birliği Entegre projesi

kapsamında Almanya, İtalya ve Fransa başta olmak

üzere toplam 31 merkez ile Münih Ludwig Maximi-

lian Üniversitesi (Almanya) ile Danimarka Prof. Dr.

Wolf : “Reflex seizures in different epilepsies” başlıklı

proje ile Genoa Universitesi (İtalya) ile genetik epi-

lepsiler konusunda, İtalya ve Hollanda Prof. Kastele-

ijn-Nolst-Trenite başkanlığında Marie Curie kapsa-

mında: Fotosensitif epilepsiler konusunda çalışmalar

ve projeler yürütülmektedir.

Nörolojik hastalıkların tanı ve ayı-rıcı tanısına yönelik rutin ve acil EEG çekimleri yapılmaktadır. Hi-

perventilasyon ve fotik stimülasyon her hastada uygulanmaktadır. Gereğinde uyku çekimleri ve diğer refleks tetikleyi-ciler kullanılmaktadır. Video-EEG simul-tan çekimleri uzun ve kısa süreli olarak psödonöbet ve nöbet tipleri tanısı için kullanılmaktadır. Ayrıca epilepsi cerrahi-sine yönelik preoperatif monitorizasyon 24 saat ve sürekli olarak yapılmaktadır. Psikiyatrik ve ensefalopati gelişen ve dâ-hili hastalıklar için destekleyici yöntem olarak kullanılmaktadır. Tanısal amaç dı-şında araştırma amaçlı çekimler için bi-limsel proje bazında çalışılmaktadır.

İSTANBUL TIP FAKÜLTESİ ELEKTROENSEFALOGRAFİ LABORATUVARI

14



Steril çalışma kabini, İnvert mikroskop, Hibridizas-

yon cihazı, Mikrosantrifüj, Otomatik metafaz tara-

ma cihazı (Metaphase Finder), Fluoresan ataçmanlı

FISH mikroskobu, PCR cihazı, Hibridizasyon fırını,

manyetik karıştırıcı, Mikro array tarayıcı cihazı, Mik-

ro array kurutucu, Dizileme cihazı, Mikrosantrifüj,

Vortex, Plate santrifüj, Nanodrop Spektrofotometre,

Kuru ısıtıcı blok, DNA izolasyon cihazı.


CRANIRARE ve SBAG-ERA-NET uluslararası pro-

jeleri kapsamında Köln Üniversitesi (Almanya), Paris

Üniversitesi (Fransa), Duisburg Essen Üniversitesi

(Almanya) ve Hacettepe Üniversitesi ile işbirlikle-

ri yapılmaktadır. San Diego Üniversitesi (ABD) ile

merkezi sinir sistemi anomalileri ve ekson dizileme

konusunda ortak çalışmalar yürütülmektedir.

Postnatal ve prenatal tanı amacıyla, kısa ve uzun süreli hücre kültürle-ri ile kromozom eldesi, farklı doku-

larda kromozom analizi, FISH ve a-CGH analizleri, DNA izolasyonu, Sanger dizi-leme, MLPA, gerçek zamanlı PCR, en-zim kesim, hedef genlerde mutasyon, STR ve biyoinformatik analizleri gerçek-leştirilmektedir.

Prof. Dr. Seher Başaran0212 4142000 - [email protected]

İSTANBUL TIP FAKÜLTESİ TIBBİ GENETİK ARAŞTIRMA LABORATUVARI

15


Prof. Dr. Seyhun Solakoğlu0212 4142000 - [email protected]


Elektron mikroskobu (Jeol 1011), Ultramikrotom

(Leica EM-UC7), Doku takip cihazı (Leica EM-TP),

Knifemaker (Leica EM-KMR3), EM-Trim 2, Lami-

nar akışlı kabin, CO2 inkübatörü, İnvert faz kontrast

mikroskop, Fluoresan mikroskop, Cyto-counter.


Kan-beyin bariyeri üzerine Leibniz Moleküler Far-

makoloji Enstitüsü (Almanya), Açık Üniversite (Bir-

leşik Krallık) ve Karolinska Enstitüsü (İsveç) ile araş-

tırma projeleri yürütülmektedir.

Nefropatolojik hastalıkların ve der-matolojik büllöz hastalıkların ayırı-cı tanısına, primer silyer diskinezi

ile bazı metabolik nörodejeneratif has-talıkların tanısına ve spermatozoon kay-naklı infertilite olgularıyla malabsorpsi-yon sendromlarının etiyopatogenezine yönelik ayırıcı tanıya yardımcı analizler gerçekleştirilmektedir. Diş hekimliği ve ortopedi gibi alanlardaki uygulamalar-da kullanılan materyalin biyo-uyumlulu-ğuna yönelik ön testler ve genetik tanıya materyal sağlamak üzere primer fibrob-last kültürü gerçekleştirilmektedir.

Prof. Dr. Leyla Tapul0212 4142000 - [email protected]

Prof. Dr. Bülent Ahıshalı0212 4142000 - 32360

[email protected]

İSTANBUL TIP FAKÜLTESİ HİSTOLOJİ ve EMBRİYOLOJİ ARAŞTIRMA LABORATUVARLARI

16



HPLC sistemleri, Aminoasit analizörü, Tandem küt-

le spektrometrisi, Gaz kromatografi kütle spektro-

metrisi ve çeker ocak sistemleri.


European Research Network (İsviçre), Hastalık

Önleme ve Kontrol Merkezi (ABD), Screening-La-

bor Hannover (Almanya), Heidelberg Üniversitesi

(Almanya), Zürih Üniversitesi (İsviçre), Nijmegen

Üniversitesi (Amsterdam), Manchester ve Newcastle

Üniversiteleri (İngiltere) ile işbirlikleri bulunmakta-

dır.

Feniketonüri analiz biriminde; ta-rama, HPLC ile fenilalanin-tiro-zin tayini, BH4 yükleme testi, birin-

ci basamak metabolik testler biriminde; serumda biyotinidaz tarama, biyotidi-naz aktivitesi, Beutler testi, idrarda re-düktan madde, monosakkarit kromo-tografisi, oligosakkarit kromotografisi, metilmalonik asit tayini, nitroprussit tes-ti, dinitrofenilhidrazin testi, orotik asit ta-yini, sodyum hidroksit testi, FeCl3 testi, keton tayini ve ileri metabolik testler bi-riminde; tandem kütle spektrometri ile aminoasit ve asil karnitin incelemele-ri, HPLC ile kantitatif aminoasit ve kar-bohidrattan yoksun glikoprotein (CDG) analizleri, gaz kromatografi kütle spek-trometri ile organik asit analizi, enzim analizleri yapılmaktadır.

Prof. Dr. Gülden Gökçay0212 4142000 - [email protected]

Prof. Dr. Ümit D. Türkoğlu0212 4142000 - [email protected]

İSTANBUL TIP FAKÜLTESİ ÇOCUK SAĞLIĞI ve HASTALIKLARI BESLENME ve METABOLİZMA LABORATUVARI

17


Prof. Dr. Hakan Gürvit0212 4142000 - [email protected]


CANTAB ve komputerize Stroop WCST testleri.


Northwestern Üniversitesi (ABD) ve Rutgers Üniver-

sitesi (ABD) ile işbirlikleri bulunmaktadır.

Nöropsikolojik ve afazi değerlendir-me ile kognitif rehabilitasyonun yapıldığı Türkiye’nin ilk Nöropsi-

koloji laboratuarıdır. Değerlendirmeler hem geleneksel nöropsikolojik batarya-lar hem de komputerize testler ile yapıl-maktadır.

İSTANBUL TIP FAKÜLTESİ NÖROPSİKOLOJİ LABORATUVARI

18



Çeşitli derecelerde çalışan etüvler (inkübatörler),

Karbondioksitli etüv, Normal ve soğutuculu santri-

füjler, Normal ve çalkalayıcılı benmari, ELISA cihaz-

ları, Tam otomatik kan kültürü cihazı, Migit otoma-

tik tüberküloz cihazı, Fluoresan mikroskop, Karanlık

saha mikroskopu, Otomatik bakteri identifikasyon

sistemi, Light-cycler cihazı, Termal cycler, Pulsed Fi-

eld cihazı, Kültür koleksiyonları merkezinde liyofi-

lizasyon cihazı, Elektroforez cihazı, Translüminatör,

Biyogüvenlik kabinleri, Flow sitometre.


Türkiye Halk Sağlığı Kurumu ve Dünya Sağlık Ör-

gütü ile birlikte bulaşıcı hastalıklar ve antitüberkü-

loz ilaç direnci ile ilgili projeler yürütülmektedir.

Grip aktivitesi konusunda Ulusal Influenza Referans

Laboratuvarı ve Sağlık Bakanlığı ile Dünya Sağ-

lık Örgütü’ne veri iletilmektedir. Köln Üniversitesi

(Almanya) HIV ilaç direncinin tanısı konusunda iş-

birliği yapılmaktadır.

Bakteriyoloji laboratuvarı, mikoloji/mikobakteriyoloji laboratuvarı, pa-razitoloji laboratuvarı ve viroloji-im-

münoloji laboratuvarlarından oluşmak-tadır. Kan kültürü, steril vücut sıvıları, kistik fibrozlu hasta örnekleri, kan örnek-lerinde interferon gama salınım testi uy-gulamaları ile PCR işlemleri yapılmakta ve Echinococcus granulosus IgG, Ente-moeba histolytica IgG çalışılmaktadır. Otoantikorlara; ELISA, indirekt immün fluoresan ve immünblot yöntemi kulla-nılarak bakılmakta, immünfenotipleme testleri ve immünoyetmezlik paneli ça-lışılmaktadır.

Prof. Dr. Nezahat Gürler0212 4142000 - [email protected]

İSTANBUL TIP FAKÜLTESİ MİKROBİYOLOJİ ARAŞTIRMA LABORATUVARLARI

19



DNA ve RNA ayrıştırma robotu, PCR, Gerçek za-

manlı PCR.


Konjenital hiperinsülinizm ve yenidoğan diyabeti

vakalarında moleküler analiz için Exeter Üniversitesi

(İngiltere), Erken puberte vakalarında genetik analiz

Scheider Çocuk Medikal Merkezi (İsrail), Prag Üni-

versitesi (Çek Cumhuriyeti) ile çoğul hormon eksik-

liği genetik çalışması ve TÜBİTAK ile ortak çalışma-

lar yürütülmektedir.

Konjenital hiperinsülinizm, yenido-ğan diyabeti, obezite, konjenital adrenal hiperplazi, tiroid hastalıkla-

rı, tip 1 diyabet, MODY, çoğul hipofiz hor-mon eksiklikleri, idiyopatik boy kısalığı, aromataz fazlalığı, erken püberte tanısı almış hastalara ait kan örnekleri ve veri-ler toplanmaktadır. DNA, RNA, lökosit ve serum ayrıştırmaları yapılmakta ve bun-lar üzerinde çalışmalar yapılmaktadır.

Prof. Dr. Firdevs Baş0212 4142000 - [email protected]

İSTANBUL TIP FAKÜLTESİ ÇOCUK ENDOKRİNOLOJİSİ ARAŞTIRMA LABORATUVARI

20



CO2 inkübatörü, İnvert mikroskop, Fluoresan mik-

roskop, Termal döngü cihazları, Yatay elektroforez

ekipmanları, DNA dizileme cihazı, Flow sitometri

cihazı, Luminex cihazı.


European Federation for Immunogenetics (EFI) ta-

rafından akredite laboratuvar olarak kabul edilmiştir.

EFI Kalite kontrol komitesi hem de Sağlık Bakanlığı

İmmünoloji Bilim Kurulu tarafından HLA labora-

tuvarları arasında HLA kalite kontrol testlerini or-

ganize etmekle görevlendirilmiştir. Transplantasyon

İmmünoloji/Immünogenetiği ve Ageing alanında

uluslararası projeler yürütülmektedir.

Doku Tipleme ve İmmünogenetik Laboratuvarı; Seroloji, Hücre kül-türü, Flow Sitometri, Moleküler

Genetik, DNA Dizi Analizi ve İmmünoge-netik Laboratuvarları’ndan oluşmakta-dır. Solid organ ve kemik iliği/kök hücre nakline hazırlanan hasta/vericilerin HLA doku gruplarının düşük/yüksek çözünür-lükte analizleri ve otoimmün hastalıklar ile ilişkili olduğu düşünülen doku grupla-rı çalışılmaktadır. Canlı/kadavra kaynaklı vericiden nakil planlanan hasta/vericile-re nakilin başarısını öngörebilen cross-match testleri ve anti-HLA antikor tara-ma ve tanımlama testleri yapılmaktadır. Kök hücre nakli planlanan hasta ve ve-ricilere nakil öncesi HLA doku tipleme testleri ve nakil sonrası engreftman ta-kibinde kullanılan kimerizm tayini yapıl-maktadır.

Prof. Dr. Fatma Savran Oğuz


İSTANBUL TIP FAKÜLTESİ TIBBİ BİYOLOJİ LABORATUVARI

21



Class 100 oda içerisinde laminar akışlı kabin, CO2

inkübatörü, İnvert mikroskop, Fluoresan mikroskop,

Termal döngü cihazı, Gerçek zamanlı termal döngü

cihazları (Light Cycler 480, Light Cycler Nano), Pi-

codrop spektrofotometre, Western Blot için iBlot,

Dikey ve yatay elektroforez ekipmanları, Jel görün-

tüleme ve dokümantasyon cihazı.


Rutgers Üniversitesi (ABD), Angers Üniversitesi

(Fransa), Exeter Üniversitesi (Birleşik Krallık), Aris-

totle Thessaloniki Üniversitesi Tıp Fakültesi (Yuna-

nistan) ile işbirlikleri bulunmaktadır. Alzheimer ve

Parkinson hastalıkları ile ilgili yeni biyobelirteçler

bulunması konulu Avrupa Birliği projesi yürütül-

mektedir.

Primer nöron kültürü, gen ekspres-yon analizleri, siRNA ile gen sus-turma, qrtPCR metodları, polimor-

fizm analizleri, Western Blot ile protein analizleri, biyolojik sıvılardan ELISA me-todu ile sitokin, kemokin, hormon ana-lizi yapılmaktadır. Primer nöron kültürü kullanılarak oluşturulan nörodejeneratif hastalık modelleri ve gen susturma me-todları kullanılarak farklı genlerin hasta-lıklardaki rolleri belirlenmektedir. Alzhe-imer ve Parkinson hastalığının genetik temelleri ile nörodejenerasyonda rol oy-nayan moleküler mekanizmalar üzerin-de yoğunlaşılmaktadır.

Doç. Dr. Erdinç Dursun0212 414 2000 - [email protected]

Doç. Dr. Duygu Gezen-Ak0212 414 2000 - [email protected]

Prof. Dr. Selma Yılmazer0212 4143000 - [email protected]

CERRAHPAŞA TIP FAKÜLTESİ BEYİN ve NÖRODEJENERATİF/NÖROGENETİK HASTALIKLAR LABORATUVARI

22



Bilgisayarlı dinamik postürografi, Head impulse,

İşitsel kortikal potansiyel cevaplar ölçüm ekipmanı,

İşitsel beyinsapı cevapları ölçüm ekipmanı, Multifre-

kans immitansmetri, Ses analiz sistemi.


İstanbul Kalkınma Ajansı ile ortak yürütülen pro-

jeyle işitme kayıplı bireylerin desteklenmesine katkı

sağlanmaktadır. İstanbul Teknik Üniversitesi işbir-

liğiyle yürütülen TÜBİTAK projesinde de dinamik

vestibüler sistem analiz algoritması geliştirilmesi ve

denge tespit cihazı tasarımına yönelik tıbbi ekipman

geliştirme projesi bulunmaktadır.

Yenidoğan, çocuk ve yetişkin işitme testleri, konuşma-ses ve dil bozuk-luklarının tanı ve terapi programla-

rının, işitme kayıplı bireylerin eğitsel takip ve desteği, denge bozukluklarının teşhis ve rehabilitasyonları, gürültü ve işitme koruma programlarının yenidoğan, okul öncesi ve okul dönemi işitme tarama programlarının, işitme cihazı, orta kulak, iç kulak ve beyin sapı implantına yönelik çalışmalar yürütülmektedir.

Prof. Dr. Ahmet Ataş0212 4143000 - [email protected]

CERRAHPAŞA TIP FAKÜLTESİ İŞİTME ve KONUŞMA BOZUKLUKLARI MERKEZİ/ODYOLOJİ LABORATUVARI

23


Prof. Dr. Derya Karadeniz0212 4143000 - [email protected]


Tüm gece polisomnografisi amaçlı 3 kanal EEG [F4-

M1,C4-M1,O4-M1], İki kanal EOG, çene, sağ ve

sol tibialis anterior yüzeyel EMG, Vücut pozisyonu

sensörü, Oro-nazal termal sensör, Nazal basınç sensö-

rü, Torakal ve abdominal solunum hareketleri, EKG,

Solunum sesleri kaydı, O2 satürasyonu ve senkron

video kaydı.


Katapleksili narkoleptik hastalarda haftalık katap-

leksi atakları sıklığı ve gündüz aşırı uyku halinde iki

paralel grupta plasebo ile BF2.649’un (Pitolisant)

karşılaştırıldığı, randomize çift kör çalışma ile Avrupa

Birliği projesi kapsamında çok merkezli çalışma olan

uykuda ortaya çıkan kardiyak ve solunum olaylarının

polisomnografi dışında farklı bir cihazla belirlenmesi

amacı ile cihaz geliştirme projesi bulunmaktadır.

Uyku laboratuvarlarında uyku bo-zuklukları tanı ve tedavisi ile epilep-si ön tanısı amaçlı polisomnogra-

fik tetkikler yapılmaktadır. Avrupa Uyku Araştırmaları Birliği kriterlerine göre Av-rupa’da akredite edilen tek birim olup, Avrupa’dan gelen uzmanlara eğitim ve sertifika verme yetkisi bulunmaktadır.

CERRAHPAŞA TIP FAKÜLTESİ UYKU ve UYANIKLIK BOZUKLUKLARI BİRİMİ

24



Karyotek PSI Karyotip+FİSH analiz sistemi, İnkü-

batör, Mikroskop, Termo-Higrometre, Soğutmalı

santrifüj, CO2 inkübatörü, PH metre, Laminar akışlı

kabin, Hibridizasyon ünitesi, Spektrofotometre, de-

rin dondurucu.


Yale Üniversitesi, Nöroşirürji Anabilim Dalı, Nöro-

genetik programı ile ortak yürütülen farklı kalıtsal

hastalıklarda yeni genlerin tanımlanması (İngiltere);

Universite´ Paris Descartes- Sorbonne Paris Cite´,

Institut Imagine, Hospital Necker Enfants Mala-

Kan, cilt, kemik iliği ve prenatal ör-neklerden (fetal kan, amnion sı-vısı ve korion villus biopsisi) kro-

mozom analizi ve Fluoresan insitu hibridizasyon ile mikrodelesyonların ta-nısı yapılmaktadır.

Prof. Dr. Beyhan Tüysüz0212 414 3000 - [email protected]

des, Genetik Anabilim Dalı ile ortak yürütülen,

iskelet hastalıklarında genetik çalışmalar (Fransa);

University College London (UCL), Moleküler Tıp

Bölümü ve Doğum defektleri araştırma merkezi ile

ortak yürütülen “silya” bozukluklarının araştırılması

(İngiltere); Institut fuer Medizinische Genetik und

Humangenetik, Charité-Universitaetsmedizin Ber-

lin, Augustenburger Platz 1, Berlin ile ortak yürü-

tülen Cutis laxa grubu hastalıkların genetik altyapısı

çalışması, Dr. Martin Zenker Institute of Human

Genetics University Hospital Magdeburg Leipziger,

Almanya ile ortak yürütülen Noonan grubu (rasopa-

tiler) hastalıkların araştırılması (Almanya), Pediatric

Endocrinology and Metabolic Bone Diseases De-

partment of Pediatrics, Helsinki University Hospital

ile Osteoporozla seyreden hastalıkların araştırılması

(Finlandiya), Department of Molecular and Human

Genetics, Baylor College of Medicine, Houston ile

ortak yürütülen artrogyriposisler ve Cornelia de Lan-

ge grubu (ABD) çalışılmaktadır.

CERRAHPAŞA TIP FAKÜLTESİ PEDİATRİK GENETİK LABORATUVARI

25


Prof. Dr. Mustafa Özen0212 4143000 - [email protected]


37°C inkübatör, Light cycler 480 gerçek zamanlı

PCR cihazı, Termal döngü cihazı, Elektroforez ünite-

leri, Jel görüntüleme cihazı, Santrifüjler (soğutmalı,

vakumlu), DNA izolasyon cihazı, -20°C ve -80°C so-

ğutma dolapları, Mikrodalga, ırın, ABI 3500 sekans

analiz cihazı, Light cycler 2.0 Real Time cihazı, Pyro

Sekans (spesifik dizileme amaçlı), Rotor Gene (real

time cihazı), Laminar Air Flow kabin bulunmaktadır.


Devam eden TÜBİTAK destekli araştırma geliştirme

projeleri; İnsanarenks kanserinde miRNA ların araş-

tırılması, dil kanserlerine özgü miRNA ların belirlen-

mesi, deliryum hastalarında serumda miRNA ların

araştırılması.

Rutin olarak, tek gen hastalıkları ge-netiği, infertilite testleri, kanser ve lösemi genetiği olmak üzere bir-

çok hastalığın tanısına yönelik ve tedavi planlaması ile ilgili çalışmalar ve analiz-leriyle birlikte moleküler genetik ve hüc-re kültürü laboratuvarında, araştırma-geliştirme çalışmaları ile ilgili projeler yürütülmektedir.

CERRAHPAŞA TIP FAKÜLTESİ TIBBİ MOLEKÜLER GENETİK LABORATUVARI

26



Spektrofotometri, Spektroflorimetri, Akış enjeksiyon

sistemi, Yüksek performanslı sıvı kromatografisi (UV,

diod serili, fluoresans ve elektrometrik dedektörlü,

online SPE-LC, UPLC) ve gaz kromatografisi (alev

iyonlaşma ve kütle spektrometrik dedektörlü).


İstanbul Teknik Üniversitesi, Yıldız Teknik Üniver-

sitesi, Bezmi Alem Vakıf Üniversitesi, Yeditepe Üni-

versitesi, Anadolu Üniversitesi, Pamukkale Üniversi-

tesi, Namık Kemal Üniversitesi, Dicle Üniversitesi,

Batman Üniversitesi, Münih Üniversitesi (Almanya),

Barselona Üniversitesi (İspanya), Kahire Üniversitesi

(Mısır) ve Brüksel Serbest Üniversitesi (Belçika) ile

ortak çalışmalar yürütülmektedir. Bu çalışmaların

esasını yeni analitik teknikler ile metot geliştirme ve

validasyonu oluşturmaktadır.

İlaç endüstrisindeki Ar-Ge ve kalite kon-trol alanlarındaki çalışmalara temel teşkil eden ilaç analizleri, ilaç etken

maddelerinin ve safsızlıkların farmasö-tik preparatlarda ve biyolojik materyal-lerde kalitatif ve kantitatif analizleri için spektrofotometrik, yüksek performanslı sıvı kromatografik ve gaz kromatografik yöntemlerin geliştirilmesi ve validasyo-nu; uluslararası kılavuzlara göre metot validasyonu ve farmakope analizleri ya-pılmaktadır.

Prof. Dr. Serap Sağlık Aslan0212 4400000 - [email protected]

ECZACILIK FAKÜLTESİ ANALİTİK KİMYA ARAŞTIRMA LABORATUVARI

27



Yüksek performanslı sıvı kromatografisi (diod serili

ve fluoresan dedektörlü), Orta basınçlı sıvı kroma-

tografisi, Flaş kromatografi, Kromatotron, Vakum

sıvı kromatografi, Vakum hız yoğunlaştırıcı, Liyofi-

lizatör, Vakumlu etüv.


Anadolu Üniversitesi, Marmara Üniversitesi, Sa-

arland Üniversitesi (Almanya), Paris Üniversitesi

(Fransa), Mostaganem Üniversitesi (Cezayir), Berlin

Serbest Üniversitesi (Almanya) ve Leibniz Enstitüsü

(Almanya) ile işbirlikleri yapılmıştır. Bu işbirlikleri

dahilinde bitkisel kaynaklı etken bileşiklerin izolas-

yonu ve onların etkinliğinin ortaya konması kapsa-

mında çalışmalar gerçekleştirilmiştir.

Tıbbi bitkilerden izole edilen bile-şiklerin izolasyon ve yapı tayinle-ri kromatografik yöntemler kulla-

nılarak ve spektral analizleri yapılarak gerçekleştirilmektedir. Bitki ekstrelerinin ve izole edilen bileşiklerin çeşitli biyolojik aktiviteleri araştırılmaktadır.

Prof. Dr. Afife Mat 0212 4400000 - [email protected]

ECZACILIK FAKÜLTESİ FARMAKOGNOZİ ARAŞTIRMA LABORATUVARI

28



Organ banyosu sistemi, Miyograf sistemi, Yüksek

performanslı sıvı kromatografisi, (UV ve fluoresans

dedektörlü) katı ve sıvı faz ekstraksiyon sistemleri,

Langendorff sistemi, ELISA cihazı, Telemetri sistemi.


Ege Üniversitesi, Paris XI. Üniversite Biyolojik Ri-

timler ve Kanser Enstitüsü (Fransa) ve Paris Nord

Üniversitesi Inserm UMR-S698 (Fransa) ile ortak

çalışmalar yürütülmektedir. Bu işbirlikler dâhilinde

kardiyovasküler sistem farmakolojisi ve farmakokine-

tik alanlarında çalışmalar yapılmaktadır.

Kardiyovasküler sistem farmakolo-jisi (deneysel hipertansiyon, diya-bet, glokom modellerinde deney

hayvan ve insan kaynaklı izole damar ve kalp preparatlarda - aorta, mezen-terik arter, renal arter, retinal arter, ba-ziler arter, insan meme içi arteri, insan safen veni, insan radyal arteri, kalp vb); Gastrointestinal sistem farmakolojisi (örn. deneysel ülser modeli); Santral si-nir sistemi farmakolojisi (deneysel ve genetik olarak epileptik modeller) alan-larında ilaç ve bitkisel/sentetik kaynaklı etkin maddelerin etkilerinin incelenme-si ile birlikte farmakokinetik çalışmalar [P-glikoprotein ve ABC gen ailesine da-hil taşıyıcı proteinlerin, ilaçların farmako-kinetiğine olan etkilerinin, incelenmesi; İlaçların plazma ve diğer vücut sıvıların-daki düzeylerinin yüksek performanslı sıvı kromatografisi (HPLC) ile tayini] ve kronofarmakokinetik çalışmalar yapıl-maktadır.

Prof. Dr. Sönmez Uydeş Doğan


ECZACILIK FAKÜLTESİ FARMAKOLOJİ ARAŞTIRMA LABORATUVARI

29



Texture analizör, Dissolüsyon cihazı nano-zetasizer,

Liyofilizatör, Yüksek performanslı sıvı kromatografisi

(diod serili ve fluoresans detektörlü), Franz difüzyon

hücre sistemi, ATR-FTIR spektrometre, Hücre kül-

türü laboratuvar ekipmanları, Tevametre, Korneo-

metre, Deri pH-metre, sebumetre, Meksametre.


Marmara Üniversitesi, Londra Eczacılık Okulu (İn-

giltere), Bath Üniversitesi (İngiltere), Cardiff Üniver-

sitesi (İngiltere), Trinity Koleji Dublin Üniversitesi

(İrlanda), Pittsburg Üniversitesi (ABD) ve Innsbruck

Tıp Üniversitesi (Avusturya) ile işbirlikleri bulun-

maktadır. Bu işbirlikleri dâhilinde akciğerlere ilaç

hedeflendirme; transdermal ve dermal çalışmalar;

farmasötik hücre kültür çalışmaları; radyofarmasi

alanlarında çalışmalar yürütülmüştür. Euronanomed

projesi kapsamında antikanser ilaçların geliştirilmesi

ile ilgili çalışmalar tamamlanmıştır. Üniversite sanayi

işbirliği çerçevesinde yürütülen SANTEZ projesi ve

TÜBİTAK projeleri devam etmektedir.

İlaç formülasyonu çalışmaları(katı do-zaj şekilleri, dispers sistemler, topikal ve transdermal uygulanan ilaç taşıyı-

cı sistemler, ilaç taşıyıcı yeni sistemler (mikroküreler, veziküler taşıyıcı sistem-ler, katı lipid nanopartiküller, polimerik miseller), biyoadhesif sistemler, oküler, pulmoner, nazal, bukkal ilaç taşıyıcı sis-temler ve radyofarmasötikler, ilaç stabi-lite çalışmaları ve hedeflendirilmiş (be-yin, karaciğer, akciğer, kemik, kolon) ilaç taşıyıcı sistem çalışmaları yürütülmek-tedir.

Prof. Dr. Yıldız Özsoy Erginer


ECZACILIK FAKÜLTESİ FARMASÖTİK TEKNOLOJİ ARAŞTIRMA LABORATUVARI

30



Gerçek zamanlı termal döngü cihazı (RT-PCR), Ter-

mal döngü cihazları, Elektroforez ve jel görüntüleme

sistemleri, Fluoresan ataçmanlı mikroskop, Yüksek

basınçlı sıvı kromatografisi (diod serili ve fluoresans

dedektörlü), Hücre kültür laboratuvar ekipmanları.


Sabancı Üniversitesi, Boğaziçi Üniversitesi, New

Castle Üniversitesi (İngiltere), Würzburg Üniversitesi

(Almanya) ve Birmingham Üniversitesi (İngiltere) ile

işbirliğimiz bulunmaktadır. Bu işbirlikleri kapsamın-

da farmakogenetik çalışmalar ve epigenetik mekaniz-

malar üzerine araştırmalar yapılmaktadır.

Moleküler ve Analitik Toksikolo-ji, Genotoksisite, Hücre Kültü-rü Laboratuvarları ile Farmako-

genetik Tanı Birimi’nden oluşmaktadır. Ksenobiyotiklerin toksik etkilerinde rol oynayan mekanizmaların araştırılma-sı; genetik ve epigenetik mekanizma ça-lışmaları kapsamında DNA ve kromo-zomal hasarlarının, oksidatif hasarların, DNA metilasyonunun, histon modifikas-yonlarının, gen ve protein ekspresyon-larındaki değişimlerin tespiti in vitro ve in vivo düzeylerde yapılmaktadır. Mini-mum toksisite ile maksimum terapötik etkinliğin sağlanabilmesi amaçlanan “Bi-reye Özgü Tedavi” uygulamasında özel-likle kronik kullanılan ve/veya terapötik indeksi dar olan ilaçların hedefe taşın-ması ve metabolizmasında rol oynayan proteinlerdeki genetik farklılıkların tayini klinik birimlerle koordinasyonlu çalışma-lar ile yürütülmektedir.

Prof. Dr. Buket Alpertunga 0212 4400000 - [email protected]

ECZACILIK FAKÜLTESİ FARMASÖTİK TOKSİKOLOJİ ARAŞTIRMA LABORATUVARI

31



100’den fazla tipus ve 150’den fazla tip örneği fotoğ-

rafına sahiptir. Çizim tüplü ve digital ortama görüntü

aktaran stereo mikroskop; Kromozom analiz sistemi;

Buz mikrotomu (kriyostat).


Anadolu Üniversitesi ve Cumhuriyet Üniversitesi ile

işbirliklerimiz mevcuttur. Bu işbirlikleri dahilinde

Türkiye florasının tanınması korunması için çalışma-

lar gerçekleştirilmiştir. Biyolojik çeşitliliğin korun-

ması ve sürdürülebilir gelişmesi ile ilgili Avrupa Bir-

liği ve IUCN projeleri yürütülmektedir. “Euro-Med

Plant Base” ve “Atlas Florae Europaeae” kuruluşların-

da Türkiye temsilciliği yapılmaktadır. Ballı bitkiler ile

ilgili İstanbul Kalkınma Ajansı projesi, Türkiye ge-

ofitlerinin tanınması ve kromozomları ile ilgili TÜ-

BİTAK destekli KAMAG projeleri yürütülmektedir.

Türkiye bitkilerinin %70’ini barın-dıran, başta tıbbi bitkiler olmak üzere, İstanbul ve Trakya örnek-

leri açısından zengin (%90); Bazı önem-li tıbbi cinslerin de (Allium, Arum, Asp-hodeline, Cirsium, Colchicum, Crocus, Cyclamen, Euphorbia, Ferulago, Helich-rysum, Hypericum, Iris, Papaver, Rosa, Salvia, Sedum, Tulipa) çoğu türünü ba-rındıran önemli bir koleksiyona sahip-tir. 115.000’den fazla bitki örneği barın-dırmaktadır. Ayrıca tüm örnekler taranıp “ISTE Bilgi Sistemi” adlı veri tabanına ak-tarılmakta ve ISTE web sayfasından il-gililerin hizmetine sunulmaktadır. ISTE Türkiye Florasındaki monotipik endemik cinslerin tümünü bünyesinde barındır-maktadır.

Prof. Dr. Emine Akalın0212 4400000 - [email protected]

ECZACILIK FAKÜLTESİ ISTE (HERBARYUM)

32



Anadolu’ya özgü çiftlik hayvanı ırklarının korun-

ma altına alındığı Ulusal Yerli Hayvan Gen bankası

kurulumunda 5 koyun ırkına ait sperma örnekleri

dondurularak bankaya teslim edilme çalışması Ta-

rım Bakanlığı, TÜBİTAK-MAM GMBE, Ankara

Üniversitesi, Uludağ Üniversitesi, Selçuk Üniversitesi

ve Ortadoğu Teknik Üniversitesi işbirliğinde yürü-

tülmüştür. Koç spermalarının dondurulması DNA

Analiz Laboratuvar tekniğinin geliştirilmesi ve Tarım

Bakanlığı TAGEM bünyesindeki enstitülerde kulla-

nılabilecek dondurma tekniğinin geliştirilmesi ama-

cıyla, Tarım Bakanlığı, TÜBİTAK-MAM GMBE,

Uludağ Üniversitesi, Missuri Üniversitesi (ABD) iş-

birliğinde koç spermasının dondurulması çalışması

yapılmış ve uygun bir dondurma protokolü geliştiril-

miştir. Spermaların liyofilize edilerek saklanması ko-

nularında Uludağ Üniversitesi ile iş birlikleri ve proje

ortaklıkları sürmektedir.

Çiftlik hayvanları ve ev hayvanları-nın spermalarının dondurulması ve uzun süreli saklanması, sperma

dondurma tekniklerinin geliştirilmesi, kri-yoprezervasyon için yeni katkı maddele-ri ve yöntemler konusunda çalışmalar yürütülmektedir. Potansiyel fertilitenin belirlenmesi için yapay vaginal mukus ve yeni bir ölçümleme tekniği geliştiril-miştir. Dondurulmuş spermalarda ileri düzeyde analizler ve potansiyel fertilite-nin belirlenmesi ve korunması çalışma-ları yürütülmektedir. Laboratuvar aynı zamanda Tarım Bakanlığı’nın “Referans Laboratuvarı” olarak görev yapmakta ve yurt dışından ithal edilen spermaların it-halat izinlerinin alınabilmesi için gerek-li raporlama aşamaları da gerçekleştiril-mektedir.


Sperma analiz cihazı, Faz kontrast mikroskop (x40

– x1000 büyütme), Fluoresan ataçmanlı mikroskop

(x40 – x1000 büyütme), Sperma dondurma sistemi.

Prof. Dr. Alper Baran0212 4737070 - [email protected]

Prof.Dr. Kemal Ak0212 4737070 - [email protected]

VETERİNER FAKÜLTESİ ANDROLOJİ LABORATUVARI

33



Termal Döngü Cihazları, UV görüntüleme cihazı,

Mini ve Midi Submarine elektroforezler, Dikey elek-

troforez, Soğutmalı santrifüj, Mini santrifüj.


Avrupa Bilim Vakfı (Avusturya) ile genomik ve mito-

kondrial DNA analizleri konusunda çalışmalar yapıl-

maktadır. Yıldız Teknik Üniversitesi ve Ege Üniversi-

tesi ile işbirlikleri bulunmaktadır.

Evcil hayvanlarda genomik ve mito-kondrial DNA analizleri yapılmak-tadır. Özellikle evcil hayvanlarda

yer alan genlerdeki (Prion, GH, Prolak-tin, IGF-1, OPN, PIT-1, FASN, SCD, LEP, Süt Protein Genleri, Aguti vb.) polimorfi-zimler hem dizin analizi yöntemi ile hem de PCR-RFLP analizi yöntemi ile orta-ya çıkarılmaktadır. Bunun yanı sıra mito-kondrial DNA analizleri de yapılmaktadır.

Prof. Dr. Kemal Özdem Öztabak


VETERİNER FAKÜLTESİ DNA ANALİZ LABORATUVARI

34


Prof. Dr. Kemal Özdem Öztabak



Laminar akışlı kabin, UV sterilizasyon cihazı, Elek-

troforez, Termal Döngü Cihazları.


Van-Yoncatepe kalesi kazısından çıkarılmış keçi ke-

mikleri ile çalışılmıştır. York Üniversitesi (İngiltere)

ile Antik DNA Ekstraksiyon Yöntemleri üzerine araş-

tırmalar yapılmaktadır.

Arkeolojik kazı alanlarındaki evcil ve vahşi hayvan kemiklerinden DNA izolasyonu yapılmakta ve ya-

şayan evcil hayvanlarla mitokondriyal DNA’ları kıyaslanmaktadır.

VETERİNER FAKÜLTESİ FOSİL DNA LABORATUVARI

35



Soğutmalı ve normal santrifüjler, Manyetik ve nor-mal karıştırıcılar, Ultra santrifüj, Spektrofotometre, Evaporatör, PCR cihazları, Jel elektroforez, Jel gö-rüntüleme cihazları, Biyo-güvenlik kabinleri, Ho-mojenizatörler, ELISA okuyucu, Otomatik süt ana-liz cihazı, MAP, Vakum ve Streç Ambalaj Makinası, Gaz ölçüm cihazı, Tekstür analiz cihazı ve bu cihaza uygun bıçaklar, renk ölçüm cihazı, Etüvler, Ekim kabinleri, Stomacher, Blender ve öğütücüler, Spek-trofotometre, Soğutmalı Santrifuj, Aw-metre, Soxh-

Gıda Bilimi Laboratuvarları 30 yılı aşkın tecrübesi ile yaklaşık 2000 m2 kapalı alan içerisinde, hayvan-

sal gıdalar temel olmak üzere, gıda bilimi ve su hijyeni alanında, sanayi ve kamu-sal işbirlikleri içinde ulusal ve uluslarar-sı çalışmalar yürütülmektedir. Gıda Bili-mi Laboratuvarları; Gıda Mikrobiyolojisi Laboratuvarı, Gıda Kimyası Laboratuva-rı, Gıda Teknoloji Laboratuvarı, Molekü-ler Analiz Laboratuvarları, Pilot Araştır-ma Mezbahasından oluşmaktadır. Rutin analiz hizmetleri ile de sanayi ve kamu-sal kurumlara destek vermektedir.

Prof. Dr. Gürhan Çiftcioglu0212 4737070 - [email protected]

let cihazı, Trisinoskop, Gıda mikrobiyolojisi ve Gıda Teknolojisi analiz cihazları ve kitleri.


Ankara Üniversitesi, Uludağ Üniversitesi, Adnan Menderes Üniversitesi, Selçuk Üniversitesi, TÜBİ-TAK MAM, Gıda Tarım ve Hayvancılık Bakanlığı Pendik Veteriner Araştırma Enstitüsü, Avrupa Bir-liği Ortak Araştırma Merkezi, Viyana Üniversitesi (Avusturya), Münih Ludwig Maximillians Üniversi-tesi (Almanya), Bristol Üniversitesi (İngiltere), Sur-rey Üniversitesi (İngiltere), Thessaloniki Üniversitesi (Yunanistan), Joseph Fourier Üniversitesi (Fransa), Georgia Üniversitesi (ABD), Teksas A&M Üniversi-tesi (ABD), ABD Tarım Bakanlığı, Teksas Tarımsal Araştırma Merkezi (ABD) gibi birçok ulusal ve ulus-lararsı kuruluşlar ile işbirliği içinde gıda güvenilirliği, gıda güvenliği ve gıda orijini üzerine çalışmalar yap-maktadır.

VETERİNER FAKÜLTESİ GIDA BİLİMİ LABORATUVARLARI

36



Absorbans, Fluoresans ve luminesans ölçme özelli-

ğine sahip çok modlu okuyucu sistem, Hücre sayım

cihazı, CO2’li inkübatör, Western blot, Termal dön-

gü cihazı, İnvert mikroskop, Fluoresan mikroskop,

Liyofilizatör, Dual beam ve xenon lambaya sahip

spektrofotometre, Class II biyolojik güvenlik kabini,

Protein tayin cihazı, Dikey ve yatay jel elektroforez,

Ultrasaf su sistemi.

Yeni ilaç veya ilaç adayı molekülle-rin sağlıklı ve kanser hücre hatla-rı üzerindeki farmakolojik etkileri,

etki mekanizmalarının aydınlatılmasına yönelik moleküler teknikler kullanılarak incelenmektedir. Ayrıca, ilaç hammad-desini oluşturan çeşitli bitki ekstrelerinin farmakolojik etkilerinin belirlenmesine yönelik moleküler düzeyde araştırma-lar yürütülmektedir. Bileşiklerin genotok-sik etki potansiyelleri çeşitli genotoksisi-te (comet ve mikronükleus testi) testleri kullanarak belirlenmektedir.

Prof. Dr. Tülay Bakırel0212 4737070 - [email protected]


TÜBİTAK ve biogaz konulu COST projeleri kapsa-

mında araştırmalar yapılmaktadır. Etken maddelerin

kanser hücrelerindeki farmakolojik etkinliklerinin

moleküler düzeyde araştırılması, bitki ekstrelerinin

farmakolojik özelliklerini ve biyolojik etkinliklerini

belirlemeye yönelik çalışmalar ve yaygın olarak kulla-

nılan bir veteriner antibiyotiğinin hayvan dışkısından

biyogaz üreten havasız çürütme sistemlerine etkisinin

araştırılması ve alıcı ortamlardaki akibetinin belirlen-

mesi Spesifik Rumen Bakteriler ve Hidroliz Enzimle-

ri Kullanılarak Anaerobik Çürütücülerdeki Biyome-

tan Verimliliğinin Arttırılması gibi çalışmalar farklı

üniversitelerin değişik bölümleri ile yürütülmektedir.

VETERİNER FAKÜLTESİ HÜCRE KÜLTÜRÜ LABORATUVARI

37



Fluoresan ataçmanlı invert mikroskop, Mikromanip-yasyon sistemi, Pieso mikroenjeksiyon mikromanip-lasyon sistemi, Hücre elektrofüzyon sistemi, Oksijen ve CO2’li inkübatörler.


Tarım Bakanlığı, TÜBİTAK-MAM GMBE, Ankara Üniversitesi, Uludağ Üniversitesi, Selçuk Üniversitesi ve Ortadoğu Teknik Üniversitesi işbirliği ile Anado-lu’ya özgü çiftlik hayvanı ırklarının korunma altına alındığı Ulusal Yerli Hayvan Gen bankası kurulu-munda 5 koyun ırkına ait embriyolar dondurularak bankaya teslim edilmiştir. Uludağ Üniversitesi ile li-yofilize sperma kullanılarak ICSI tekniği ile embriyo üretimi çalışmaları ve Fatih Üniversitesi ile fare emb-riyonik kök hücre transfeksiyonu çalışmaları devam etmektedir. Hawaii Üniversitesi (ABD) ile transgenik hayvan üretimi konusunda işbirlikleri, Fatih Üniver-sitesi ile fare embriyonik kök hücre transfeksiyonu çalışmaları devam etmektedir. Üremenin kontrolü ve üreme biyolojisi ile ilgili araştırmalar yapılmış ve yürütülen projeler sonucunda östrus senkronizas-yonu konusuna yeni yöntem geliştirilmiş ve bunun yanında koyun östrus senkronizasyonu amacıyla kul-lanılabilecek olan vaginal tablet geliştirilmiş, TPE ve EPO’da patent başvurusu yapılmıştır.

İleri üreme biyoteknolojisi alanında Tür-kiye’de in vitro fertilizasyonla üretilen ilk çiftlik hayvanı olan kuzular 2000,

Türkiye’nin ilk klon hayvanları 2007, ilk klon Boz ırk boğa 2009 ve ilk klon Boz ırk dişiler 2010, intrasitoplazmik sperm enjeksiyonu yöntemi ile ilk kuzular 2010, ilk transgenik tavşanlar ve ilk transgenik kuzu 2013 yıllarında bu laboratuvarda dünyaya gelmiştir. Çiftlik hayvanların-da östrus senkronizasyonu teknikleri-nin geliştirilmesi, çiftlik, ev ve laboratu-var hayvanlarında oosit eldesi, in vitro fertilizasyon, in vitro kültür ortamları-nın iyileştirilmesi, oosit ve embriyoların dondurulması ve uzun süreli saklan-ması, koyunlarda ve kedilerde klonlama tekniklerinin geliştirilmesi, embriyonik kök hücre, transgenik hayvan elde et-mek amacıyla gen taşıma sistemlerinin geliştirilmesi, ICSI transgenesis, Sperm madieted transgenesis ve pronuklear gen enjeksiyonu teknikleri konularında yoğun olarak çalışılmaktadır.

Prof. Dr. Sema Birler


Prof. Dr. Serhat Pabuccuoğlu

0212 4737070 [email protected]

VETERİNER FAKÜLTESİ IN VITRO FERTİLİZASYON ve EMBRİYO TRANSFER LABORATUVARI

38



Texture analiz cihazı ve bu cihaza uygun Warner-

Bratzler bıçağı, kromametre.


Uludağ Üniversitesi, Kafkas Üniversitesi, Çanakkale

Onsekiz Mart Üniversitesi, Mustafa Kemal Üniver-

sitesi, Ondokuz Mayıs Üniversitesi’den araştırmacı-

larla çeşitli türlerden çiftlik hayvanlarının Türkiye’de

uygulanan farklı üretim sistemlerinde karkas ve et

kalitesi özelliklerini ortaya koymaya yönelik TÜBİ-

TAK ve Gıda Tarım Hayvancılık Bakanlığı’ndan des-

tek alınarak ortak çalışmalar yürütülmüştür. Avrupa

Zootekni Federasyonu (İtalya) ile kaliteli et üretimi

üzerine çalışmalar yapılmaktadır.

Etin tüketici beğenisini belirleyen renk, yumuşaklık, sululuk gibi özel-likleri güvenilir bilimsel yöntemlerle

analiz edilmektedir. Et örneklerinde tex-ture analizi, et ve karkas rengi analizle-ri, pasif su kaybı analizi, su tutma kapa-sitesi ölçümü, pişirme kaybı ölçümü, et lezzet panel değerlendirmesi yapılmak-tadır. Ayrıca karkas kalitesini (karkas öl-çülerinin alınması, kas alanı belirlen-mesi, karkas bileşiminin (et, kemik, yağ oranı) belirlenmeye yönelik araştırmalar yürütülmektedir.

Dr. Hülya Yalçıntan0212 4737070 - [email protected]

Prof. Dr. Bülent Ekiz0212 4737070 - [email protected]

VETERİNER FAKÜLTESİ KARKAS ve ET KALİTESİ LABORATUVARI

39


Arkeolojik kazı alanlarından gelen arkeozoolojik malzemeler ince-lenmektedir. Tür teşhisleri, modi-

fikasyonlar, patolojiler ve arkeozoolojik malzeme üzerindeki tüm iz ve kalıntı-lar incelenerek geçmiş toplumlardaki in-san-hayvan ilişkisi başta olmak üzere birçok soruya yanıt aranmaktadır.

Prof. Dr. Vedat Onar0212 4737070 - [email protected]


Referans koleksiyonlar.


Metro ve Marmaray Kazısı-Yenikapı, Kuşadası-Ka-

dıkalesi (Anaia), Amasya-Oluz Höyük, Van Kalesi

Höyüğü ve Yoros Kalesi kazı çalışmaları malzemeleri

incelenmesi üzerine bilimsel projeler üretilerek ulusal

ve uluslararası işbirliği yapılmaktadır. Kazı başkanlık-

ları ve Arkeoloji Müzeleri ile işbirliği ile kazı analizleri

yapılmaktadır. Wroclaw Üniversitesi (Polonya), Tra-

kia Üniversitesi (Bulgaristan), Doğal Bilimler Ensti-

tüsü (Belçika) ile yapılan işbirliği çerçevesinde hem

projeler üretilmekte hem de laboratuvar bünyesinde

yabancı bilim adamları ile ortak çalışmalar yürütül-

metedir.

VETERİNER FAKÜLTESİ OSTEOARKEOLOJİ LABORATUVARI

40


Hayvanlarda görülen viral hasta-lıklar ve viral zoonozların serolo-jik tanısı, virüsların üretilme yön-

temleri, moleküler tanı ve gen analizi çalışmaları yürütülmektedir. Ayrıca viral hastalıklarla ilgili koruma kontrol ve era-dikasyon yöntemlerine yönelik çalışma-lar yapılmaktadır.

Prof. Dr. Hüseyin Yılmaz0212 4737070 - [email protected]


CO2’li inkübatör, İnverted mikroskop, Çalkalamalı

inkübatör, kuluçka makinası, Soğutmalı ve normal

mikro santrifüjler, Ultra santrifüj, Spektrofotometre,

Gerçek zamanlı PCR cihazları, Jel elektroforez, Jel

görüntüleme cihazı, Bio II güvenlik kabinleri, Ho-

mojenizatörler, Termobloklar, Western blot, ELISA

okuyucu, Liyoflizatör.


Kansas Eyaleti Veterinerlik Okulu (ABD), Liverpool

Veteriner Okulu (İngiltere), Bristol Veteriner Okulu

(İngiltere), Ohio Veteriner Okulu (ABD), Madrid

Veteriner Fakültesi (İspanya), Macaristan Tıp Okulu

(Macaristan), Bari Veteriner Fakültesi (İtalya), Atina

Veteriner Fakültesi (Yunanistan), Nippon Enstitü-

sü (Japonya), Queensland Üniversitesi (Avustralya),

Wageningen Veteriner Enstitüsü (Hollanda), Loffler

Enstitüsü (Almanya) ile işbirlikleri bulunmaktadır.

TÜBİTAK projeleri kapsamında Hepatit A ve E nin

çevrede ve sularda saptanması ve COST projesi kap-

samında kanatlılarda infeksiyoz bronşitis virusunun

araştırılması konularında projeler devam etmektedir.

VETERİNER FAKÜLTESİ VİROLOJİ ARAŞTIRMA LABORATUVARI

41


İmmün sistem hücrelerinin varlığı ve fonksiyonları saptanmakta, hücre yü-zeyinde veya içinde sunulan proteinler

ve hücre fonksiyonları fluoresan işaretli monoklonal antikorlar kullanılarak gös-terilmekte ve özgün hücre popülasyon-ları saflaştırılabilmektedir.

Prof. Dr. Günnur Deniz0212 4142000 - [email protected]


FACSCalibur Akan hücre ölçer cihazı (aynı anda

4 farklı renkte fluoresan işaretli antikorla boyanan

hücre alt gruplarının 4 renkli analizi), FACSAria

II Akan hücre ölçer cihazı (aynı anda hücrelerin 10

renkli analizi) Soğutmalı santrifüj cihazı, Laminar

akışlı kabin.


Giessen Üniversitesi (Almanya), Allerji ve Astım

Araştırma Merkezi (İsviçre), St. Anna Çocuk Hasta-

nesi (Avusturya), Uludağ Üniversitesi, Medipol Üni-

versitesi, Marmara Üniversitesi, Bezm-i Alem Vakıf

Üniversitesi, Kocaeli Üniversitesi, Ankara Üniversite-

si, Ege Üniversitesi, Selçuk Üniversitesi ve Yüzüncü-

yıl Üniversitesi ile işbirlikleri bulunmaktadır. TÜBİ-

TAK projeleri kapsamında Behçet, Multipl Skleroz,

allerji ve astım immünopatogenezinde rol oynayan

mekanizmalar araştırılmakta ve İnten C proje kapsa-

mında Tip 1 Diyabet tedavisinde yeni teknolojilerin

geliştirilmesi üzerine projeler yürütülmektedir.

DENEYSEL TIP ARAŞTIRMA ENSTİTÜSÜ AKAN HÜCRE ÖLÇER LABORATUVARI

42


Akraba evliliği ve geleneksel olarak birden çok çocuk sahibi olma du-rumu sonucu ülkemizde sık göz-

lenen nadir hastalıklar, beyin gelişimi ile ilişkili epilepsi, ataksi gibi durumlar ayrı-ca tanı almamış hastalıkların araştırma ve tanısı için gereken araştırma teknik-leri geliştirilmekte ve uygulanmaktadır. Birden çok konjenital anomali ve/veya mental retardasyona sahip bireysel va-kalarda SNP-array tabanlı moleküler karyotipleme yaklaşımı ile araştırmalar gerçekleştirilmektedir. Ailesel çalışma-larda, SNP genotiplemesi, tüm genom bağlantı ve haplotip analizlerini esas alan tüm genom metilasyon ve tüm ge-nom ekzom dizilemesi gibi yeni nesil tekniklerden elde edilen verilerin analiz-leri yapılmaktadır. Kalıtımsal nadir nö-rolojik hastalıklara sahip bireylere ilişkin referans olarak kullanabilecek zengin bir envanter olan DNA bankası oluştu-rulmaktadır. Nadir Hastalıklar Araştırma Laboratuvarı Türkiye’de Orphanet’in ko-ordinatörüdür.


454 GS FLX Dizileme cihazı, GS Junior Sistemi,

Konfokal mikroskop.


Avrupa FP6 entegreli epilepsi (EPICURE) proje-

si kapsamında epilepsi hastalarından DNA bankası

oluşturulmuş ve hastaların klinik karakterizasyonu

İstanbul Üniversitesi İstanbul Tıp Fakültesi ve Cer-

rahpaşa Tıp Fakültesi’nde alanında uzman nörolog-

larla birlikte gerçekleştirilmiştir. Uluslararası IntenC

projesi Türk (DETAE, Boğaziçi ve Sabancı Üniver-

siteleri) ve Alman (Köln Genomik Merkezi) ortak-

lığında yürütülmekte ve TÜBİTAK projeleri kapsa-

mında çalışmalar yapılmaktadır.

Doç. Dr. Sibel Uğur İşeri0212 4142000 - [email protected]

Prof. Dr. Uğur Özbek0212 4142000 - [email protected]

DENEYSEL TIP ARAŞTIRMA ENSTİTÜSÜ NADİR HASTALIKLAR ARAŞTIRMA LABORATUVARI

43


Tüm genom ekspresyon ve meti-lasyon array analizleri ve ampli-kon derin dizi uygulamalarını kul-

lanarak lösemi gelişiminde rol oynayan sinyal yolları ve akut lösemilerde prog-nostik öneme sahip genlerin araştırıl-ması, Türkiye’de yüksek akraba evliliği oranlarına bağlı olarak sık görülen pri-mer immün yetersizlik hastalıklarının in-celenmesi konularında çalışılmaktadır. Türkiye’de SCID, CVID ve XLA gibi pri-mer immunyetersizlik hastalıkları için moleküler tanı hizmeti sunan ilk ve tek merkez olup, XLA fare modellerinde gen tedavisi çalışmaları Avrupa Lösemi Ağı (ELN) üyesidir ve BCR/ABL tespitinde Türkiye’deki tek IS sertifikalı referans la-boratuvarıdır.


454 GS FLX Dizileme cihazı, GS Junior sistemi,

Yüksek güvenlikli hücre kültürü laboratuvarı ve ka-

binleri, Bakteri kültürü laboratuvarı, Konfokal mik-

roskop ve Fluoresan mikroskop, Mikroplak lumine-

sen okuyucu.


Avrupa Lösemi Ağı bünyesinde IRON II ve IRON

III projeleri kapsamında çalışmalar yapılmakta ve

Roche Life Sciences ile birlikte derin dizi analizleri

yürütülmektedir. TÜBİTAK ve Türk Hematoloji

Derneği Araştırma Fonu destekli disiplinlerarası pro-

jeler İstanbul Tıp Fakültesi, Cerrahpaşa Tıp Fakülte-

si, Marmara Üniversitesi, Hacettepe Üniversitesi, Ege

Üniversitesi, Kocaeli Üniversitesi vb. üniversitelerle

sürdürülmektedir. Erasmus Tıp Fakültesi (Hollanda),

Heidelberg Üniversitesi (Almanya) ve St Jude Çocuk

Araştırma Hastanesi (ABD) ile ortak çalışmalar yü-

rütülmektedir.

Prof. Dr. Uğur Özbek0212 4142000 - [email protected]

Doç Dr. Müge Sayitoğlu0212 4142000 - [email protected]

DENEYSEL TIP ARAŞTIRMA ENSTİTÜSÜ MOLEKÜLER HEMATOLOJİ ARAŞTIRMA LABORATUVARI

44


İstanbul ve çevresinde tüberküloza ne-den olan suların moleküler yöntemler-le DNA parmakizlerini saptayarak böl-

gedeki karışmış dinamiklerini belirleme ve moleküler mikobakteriyoloji araştır-maları yapılmaktadır. ESAT6 ve CFP10 antijenleriyle uyarılmış tam kan örnek-lerinde IP10 düzeylerinin belirlenerek, latent TB tanısı yapan bir IG(P)RA testi geliştirilmiştir. Yeni bir mikobakteri türü “Mycobacterium celeriflavum sp. nov” tanımlanmış olup, ilaçlara hızlı direnç ve identifikasyonu aynı anda yapabilen kitlerin geliştirilmesine yönelik çalışma-lar sürmektedir. İstanbul Verem Savaşı Derneği ve İstanbul Üniversitesi Rektör-lüğü arasında imzalanan bir protokolle İstanbul Verem Savaşı Derneği Üst Se-viye Laboratuvarı olarak hizmet vermek-tedir.


Işık/fluoresan mikroskobu, DNA fragman analizi

ve dizi analizinde kullanılan kapiler, Elektroforez ve

Dizi analizi cihazı.


San Raffaele Bilim Enstitüsü (İtalya) ile yeni miko-

bakteri türlerinin tanımlanması, St. Petersburg Pas-

teur Enstitüsü (Rusya) ile Pekin genotipi tüberküloz

suşlarının ülkemizde saptanması ve bölge insan po-

pulasyonlarına adaptasyonu, Gıda ve Sağlık Güven-

liği Ajansı (Avusturya) ile Mycobacterium caprae’ni

genotipik çeşitliliği ve insanda oluşturduğu hastalığın

özellikleri konularında ortak projeler yürütülmekte-

dir.

Doç. Dr. O. Kaya Köksalan0212 4142000 - [email protected]

DENEYSEL TIP ARAŞTIRMA ENSTİTÜSÜ TÜBERKÜLOZ MOLEKÜLER EPİDEMİYOLOJİSİ LABORATUVARI

45


Hücre ve doku kültürü teknolojisi kullanılarak sitogenetik, biyokim-ya, moleküler alanlarda çok çe-

şitli araştırma projeleri, protein analiz çalışmaları yürütülmektedir. Farklı kan-ser türlerinde, obezite, diyabet gibi çe-şitli metabolik bozukluklarda hücre veya dokularda meydana gelen değişiklikle-re paralel olarak gen ve protein ekpres-yon düzeylerinde, hücre yaşam dön-güsünde, sinyal yolaklarında görülen değişiklikler incelenmekte ve miRNA, protein mikrodizin analizleri yapılmakta-dır. Aynı zamanda birçok farklı madde-nin hastalıkların etiyolojisi ve prognozu üzerindeki etkileri araştırılmaktadır. Çe-şitli biyolojik materyallerdeki proteinle-rin miktarlarının belirlenmesi, işlevlerinin aydınlatılması ve yapısal özelliklerinin belirlenmesi amacıyla araştırmalar yü-rütülmektedir.

Prof. Dr. Oğuz Öztürk0212 4142000 - [email protected]


Fluoresan Mikroskop, Işık mikroskobu, Karbondiok-

sit etüv, Laminar akışlı kabin, Parçacık sayım cihazı,

Hücre canlılık ölçüm cihazı, Fluorometre, Western

Blot cihaz ve ekipmanları.


De Montford Üniversitesi (İngiltere), Sabancı Üni-

versitesi, İstanbul Teknik Üniversitesi ile ulusal ve

uluslararası işbirlikli çalışmalar yürütülmektedir. Ay-

rıca Devlet Proje Teşkilatı, İstanbul Kalkınma Ajansı

ve TÜBİTAK tarafından desteklenen çok sayıda di-

siplinlerarası projeler sürdürülmektedir. BAL-DER

gibi bazı sanayi ve endüstriyel alanda faaliyet gösteren

çeşitli kurum ve kuruluşlarla ortak çalışmalar yürü-

tülmektedir.

DENEYSEL TIP ARAŞTIRMA ENSTİTÜSÜ DOKU KÜLTÜRÜ ve PROTEOMİK LABORATUVARI

46


Hücre kültürü ve moleküler biyolo-ji yöntemleri kullanılarak multipl skleroz, nöromiyelitis optika, oto-

immün ensefalit ve nöro-Behçet has-talıklarının patogenezinin aydınlatılması ve yeni biyobelirteçlerinin tanımlanma-sına yönelik çalışmalar yürütülmektedir. Miyastenia gravis hastalığının immüni-zasyon temelli deneysel hayvan modeli kullanılarak aralarında mezenkimal kök hücre uygulamasının da olduğu çeşitli tedavi yöntemleri denenmektedir. Fark-lı otoimmün nörolojik hastalıklara ait doku örneklerinde gen ve protein eks-presyon düzeyleri ve sağkalım/apop-toz sinyal yolaklarında ortaya çıkan de-ğişiklikler incelenmektedir. Primer nöron kültürü hücreleri, transfekte hücreler ve protein makroarray yöntemleri ile oto-immün nörolojik hastalıklarda yeni oto-antikor tanımlama çalışmaları yürütül-mektedir.

Doç. Dr. Erdem Tüzün 0212 4142000 - [email protected]


Işık mikroskobu, Laminar akışlı kabin, Western Blot,

İmmünhistokimya; ELISA cihazı ve ekipmanları.


Teksas Üniversitesi (ABD) ile deneysel miyastenia

gravis çalışmaları, Baylor College (ABD) ile nö-

ro-Behçet hastalığında barsak mikrobiyom analizi

çalışması ve Patras Üniversitesi (Yunanistan) ile nö-

romiyelitis optika olgularında yeni otoantikorların

tanımlanmasına yönelik uluslararası ve ulusal işbir-

likli çeşitli çalışmalar sürdürülmektedir.

DENEYSEL TIP ARAŞTIRMA ENSTİTÜSÜ NÖROİMMÜNOLOJİ LABORATUVARI

47


Laboratuvar hayvanlarının barındırıl-ması, bakımı ve üretimi ile araştır-ma deneylerinin gerçekleştirilmesi

ve takiben hayvanların post-operatif ba-kımlarının yapılması gibi alanlarda çeşit-li projeler yürütülmektedir.


Bireysel havalandırmalı kafes sistemi, Ameliyat mik-

roskobu, Mikroskoba bağlı görüntüleme sistemi ve

kayıt cihazı, İnfüzyon pompası, Basınçlı yıkama ma-

kinası (90 L kapasiteli), Işık mikroskopları, Sıçan-fa-

re-tavşan kan alma kutuları, İzolatör.


Leibniz Moleküler Farmakoloji Enstitüsü (Almanya)

ve Karolinska Enstitüsü (İsviçre) ile bir projede işbir-

liğinde bulunulmakta, tavşanlarda gen aktarımı ile

ilgili bir COST projesine katkı sağlanmaktadır. Star

blok-kopolimer kaplanmış kürküminin nöro koru-

yucu özelliklerinin araştırılması ile ilgili bir TÜBİ-

TAK projesi yürütülmektedir.

Yard. Doç. Dr. Mutlu Küçük0212 4400000 - [email protected]

DENEYSEL TIP ARAŞTIRMA ENSTİTÜSÜ DENEY HAYVANLARI ÜRETİM, SAFLAŞTIRMA ve ARAŞTIRMA LABORATUVARI

48



Gerçek zamanlı polimeraz zincir reaksiyon cihazları,

Western Blot cihaz ve ekipmanları, Luminex, atomik

absorbsiyon cihazı, ELISA okuyucu, ELISA yıkayıcı,

Kemilüminesans.


Casablanca Hassan II Üniversitesi (Fas), İstanbul

Tıp Fakültesi, Cerrahpaşa Tıp Fakültesi, İstanbul

Üniversitesi Diş Hekimliği Fakültesi, Bezm-i Alem

Üniversitesi, Fatih Üniversitesi, İstanbul Teknik

Üniversitesi, Uludağ Üniversitesi Tıp Fakültesi Bi-

yokimya Anabilim Dalı ve daha birçok üniversite ile

işbirlikleri içerisindedir. Ayrıca TÜBİTAK tarafından

desteklenen disiplinlerarası projeler devam etmektir.

Uludağ Üniversitesi ile işbirlikli olarak Teknokent

projesi çerçevesinde kanser hastaları için kemoterapi

uygulamalarının kişiye özel yapılabilmesine yardımcı

olacak kombine kit geliştirilmesi araştırması sürdü-

rülmektedir.

Multifaktöriyel hastalıkların etyo-patogenezi ile bireysel ve/veya çevresel varyasyonların meta-

bolizma üzerindeki etkilerinin araştırıl-masına yönelik metabolizmada yer alan çeşitli biyolojik molekül ve metabolit analizleri yapılmaktadır.

Prof. Dr. İlhan Yaylım0212 4142000 – [email protected]

DENEYSEL TIP ARAŞTIRMA ENSTİTÜSÜ MOLEKÜLER METABOLİK ARAŞTIRMALAR LABORATUVARI

49


1990’lı yıllardan beri deney hayvan-larından deneysel adacık izolasyon ve transplantasyon çalışmalarına

öncülük etmiştir. Türkiye’de insan pank-reaslarından Langerhans adacık izolas-yonları gerçekleştiren ilk kuruluş olma özelliğini taşımakta olup klinikte transp-lantasyon yapılmasının temelini atmış bulunmaktadır.


50 m2 büyüklüğünde sınıf 100.000/10.000 pozitif

basınçlı laminer akışlı steril oda, Sınıf II güvenlik ka-

bini, Pankreas sindirim haznesi (Ricordi’s Chamber),

Enzim perfüzyon cihazı, Peristaltik pompa, Diseksi-

yon mikroskobu, Adacık saflaştırma cihazı.


TÜBİTAK (INTEN-C) projesi kapsamında Giessen

Üniversitesi (Almanya) ile birlikte Tip 1 diyabet’in

rejeneratif tedavisi, pankreatik beta hücre proliferas-

yonuna yönelik yeni teknoloji geliştirilmesine ilişkin

araştırmalar sürdürülmektedir.

Prof. Dr. M. Temel Yılmaz0212 4142000 - [email protected]

DENEYSEL TIP ARAŞTIRMA ENSTİTÜSÜ LANGERHANS ADACIK İZOLASYON ve TRANSPLANTASYON ARAŞTIRMA LABORATUVARI

50



Koagülometre cihazı, Laminar akışlı kabin, Hücre

kültürü laboratuvarı, Mikrosantrifüj, PCR cihazı.


Mount Sinai Tıp Fakültesi (ABD) ve Bilimler Aka-

demisi (Bulgaristan) ile ortak çalışmalar sürmektedir.

TÜBİTAK projeleri kapsamında yürüyen miyelop-

roliferatif hastalıklarda kanseri başlatan hücrelerin

karakterizasyonu ve fonksiyonel analizinin araştırıl-

dığı projemiz ve COST projeleri kapsamında JAK-

2V617F mutasyonunun endotel hücre fonksiyonları

üzerindeki etkilerinin incelendiği bir projemiz mev-

cuttur.

Çeşitli mutasyonların etkisiyle kan-ser kök hücresine dönüşen he-matopoietik kök hücrenin değişen

yapısını, karakterini ve fonksiyonlarını anlamaya yönelik projeler yürütülmekte-dir. Hematopoietik kök hücre ve kanser kök hücresi, endotel progenitor ve endo-tel hücrelerinin trombozdaki yeri, hema-tolojik malignitelerden myeloproliferatif hastalıklar ve sık görülen mutasyonlar araştırılmaktadır.

Yard. Doç. Dr. Selçuk Sözer Tokdemir


DENEYSEL TIP ARAŞTIRMA ENSTİTÜSÜ HEMATOPOİETİK ve KANSER KÖK HÜCRE LABORATUVARI

51


HUBAL, Kalkınma Bakanlığı tarafın-dan desteklenen bir proje ile İs-tanbul Üniversitesi bünyesinde

yaşam bilimleri araştırmaları için gerek-li büyük alt yapı ve cihazların yer aldığı multidisipliner, merkezi araştırma labo-ratuvarıdır. Genombilim, Nörobilim, Bi-yoteknoloji, İlaç Araştırmaları/Farmasö-tik alanlarında faaliyet gösteren birimler 2014 yılı içinde tamamlanmış, bu alan-larda çok sayıda proje başlatılmıştır. Kurulan altyapı ile dönüşümsel (trans-lasyonel) sağlık araştırmalarına katkı ve-rilmesi hedeflenmektedir. HUBAL, İstan-bul Üniversitesi araştırmacılarının yanı sıra diğer üniversite ve araştırma ku-rumlarının projelerine de cihaz parkını kullandıracak şekilde yapılandırılmıştır.


3.0 Tesla Manyetik Rezonans Görüntüleme (MRI)

Sistemi; Fonksiyonel MR (fMRI) Eklentisi (görsel,

işitsel uyaran sunum sistemi ve yanıt butonları); MR

Uyumlu Sayısal EEG Sistemi, Laser Taramalı Konfo-

kal Mikroskop; Ultrasantrifüj, Gerçek Zamanlı Poli-

meraz Zincir Reaksiyonu Cihazı, Piezo Impact Mik-

romanipülatör, Dikey Hava Akımlı Çalışma Kabini,

Sıvı Azot Saklama Sistemi; CO2’li İnkübatör, Bireysel

Havalandırmalı Pleksiglas Hayvan Kafesleri.


Bezmialem Üniversitesi, Bilgi Üniversitesi, Marma-

ra Üniversitesi ve Boğaziçi Üniversitesi ile biri AB

(JPND), ikisi COST, ikisi TÜBİTAK ARDEB ile

desteklenen projeler yürütülmektedir. Max Planck

Enstitüsü (Almanya); Berlin Brain and Mind Institu-

te (Almanya) ve Cuban Neuroscience Center (Küba)

ile işbirlikleri başlatılmıştır. Üniversite-Sanayi İşbirli-

ği kapsamında İlaç Araştırma/Farmasötik Birimi ile

Novartis arasında protokol oluşturulmuştur. Boğaziçi

Üniversitesi Yaşam Bilimleri ve Teknolojileri Uygu-

lama ve Araştırma Merkezi ile koordinasyon içinde

çalışılmaktadır.

Prof. Dr. Zeynep Çiğdem Kayacan


HULUSİ BEHÇET YAŞAM BİLİMLERİ ARAŞTIRMA LABORATUVARI

52

FEN ve MÜHENDİSLİK BİLİMLERİARAŞTIRMA LABORATUVARLARI


Çift yıldızların, asteroidlerin ve baş-ka yıldızların etrafında dolanan ge-zegenlerin (ötegezegen) fotometrik

gözlemlerinin yapılması, konumlarının ve yörünge elemanlarının belirlenmesi amaçlı çalışmalar yürütülmektedir. Öte-gezegen sistemlerinde bulunan ancak doğrudan gözlemlerle belirlenemeyen gezegenlerin belirlenmesi için düzenlen-miş uluslararası kampanya gözlemleri-ne katkıda bulunulmaktadır. Dünya için tehdit oluşturabilecek asteroidlerin keş-fedilmesi veya keşfedilmiş olanların yö-rüngelerinde değişim olup olmadığının belirlenmesine yönelik projelere katkıda bulunulmakta ve astrofiziksel bilgilerin çok önemli bir kısmına kaynaklık eden çift yıldız sistemlerinin yörünge dönemi değişimlerinin takibi yapılmaktadır.


Ana aynası 60 cm çapında olan Ritchey-Chrétien ta-

sarımlı optik teleskop, E2V serisi (CCD42-10) yon-

gası 13,5 × 13,5 μm büyüklüğünde 2048 × 2048 sıra-

lı piksellerden oluşan Alta U42 model CCD kamera,

9 yuvalı filtre tekerleği, Bessel UBVRI ve Strömgren

uvby-Hβ filtre setleri ve meteoroloji istasyonu.


Bu gözlemevi, Çanakkale Onsekiz Mart Üniversitesi

ile yapılan gözlem zamanı paylaşımı esaslı bir anlaş-

maya dayanılarak, Çanakkale Ulupınar Astrofizik

Gözlemevi yerleşkesinde İstanbul Üniversitesi’nin

olanakları ile kurulmuştur. Cote d’Azur Gözlemevi

(Fransa) ile Haziran 2014’de başlamış olan galaksi-dı-

şı astronomi, kozmoloji, görüntülerin ve astronomik

katalogların analizi ve yıldız astrofiziği konularını

içeren 5 yıllık bir bilimsel çalışma protokolü imza-

lanmıştır. Ayrıca TÜBİTAK projeleri bulunmaktadır.

Prof. Dr. A. Talat Saygaç0212 4440000 - [email protected]

Prof. Dr. Adnan Ökten0212 4440000 - [email protected]

FEN FAKÜLTESİ GÖZLEMEVİ İST60 TELESKOBU

56



Açıklığı 30 cm ve odak uzaklığı 150 cm olan astrog-

raf, açıklığı 13 cm odak uzaklığı 200 cm olan fotosfer

dürbünü, açıklığı 12 cm odaklığı 232 cm olan kro-

mosfer dürbünü, 6562,8 Å dalgaboyunda geçirgenlik

aralığı 0,3 Å olan interferans filtresi, diyagonal açı-

lır-kapanır aynalı göz merceği, SBIG-STL serisinden

(11000M) birinci sınıf yongalı 4008 × 2672 piksel sı-

ralı astronomik CCD kamera, meteoroloji istasyonu.


Elde edilen fotosferik veriler, güneş lekeleri indeksi

üzerine Güneş Etkileri Veri Analiz Merkezi (Belçika)

ile paylaşılmaktadır. Ricerche Solari Locarno Ensti-

tüsü (İsviçre) ile Mart 2014’den itibaren güneş fiziği

konularını içeren 5 yıllık bir bilimsel çalışma proto-

kolü imzalanmıştır.

Güneş Gözlemevi’nde ana gövde-yi oluşturan bir astrografa bağlı iki ayrı teleskop düzeneği ile gün-

lük güneş gözlemleri yapılmakta, başlı-ca güneş lekeleri ve parlamalarına da-yalı olarak, çevrimsel özellik gösteren güneş aktivitesi takip edilmektedir. Göz-lem düzeneklerinden biri, fotosfer (ışık küre) tabakasının elde edilen izdüşüm görüntüsünden itibaren, güneş lekele-rinin çizimlerinin yapılması ve evrimle-rinin takibi için kullanılmaktadır. İkinci düzenek ise kromosfer (renk küre) taba-kasının Hα CCD görüntülemesi ve takibi amaçlıdır. Elde edilen veriler sayısal ve fi-ziksel olarak arşivlenmektedir.

Yard. Doç. Dr. Mevlânâ Başal


Doç. Dr. Nurol Al


FEN FAKÜLTESİ GÜNEŞ GÖZLEMEVİ

57


Çevresel faktörlerin erkek üreme sis-temine ve gelişimine etkileri in vit-ro olarak incelenmektedir. Arsenik

ve florür gibi beslenme yolu ile bilerek ya da akrilamid gibi bilinmeden alınan çe-şitli maddelerin, üreme hücreleri üzerine agonist ve antogonist etkileri, metabolik ürünleri, reseptörlere bağlanma seviye-leri, hormonları inhibe ve indükleme yol-ları araştırılarak erkek üreme sisteminin gelişimi ve sağlığı ile ilgili çeşitli araştır-malar yapılmaktadır. Erkek üreme siste-mine ait TM3 (Leydig) ve TM4 (Sertoli) gibi hücre soyları ile yapılan araştırma-larda çevresel faktörlerin, erkek üreme sisteminin gelişimi sırasında hangi me-tabolik yolları etkilediği ve bu yolların bir-birleriyle kesişme noktaları ortaya çıka-rılmaktadır. Ayrıca in vivo çalışmalarda farklı canlıların embriyonal dönemlerin-de gelişimi incelenmektedir.


Laminar akışlı kabin, Fluoresan ataçmanlı invert

mikroskop ve görüntüleme sistemi, Karbondioksitli

inkübatör, –80ºC derin dondurucu, Ultrasonikatör,

Multiskan spektrum spektrofotometre, Homojeniza-

tör.


Çanakkale Onsekiz Mart Üniversitesi, Yeni Yüzyıl

Üniversitesi, Dresden Teknik Üniversitesi (Alman-

ya), Porto Üniversitesi (Portekiz) ile xenobiyotikler,

infertilite ve kök hücreden olgun sperm üretimi ko-

nularına yönelik işbirlikleri ve projeler yürütülmek-

tedir.

Prof. Dr. Melike Erkan0212 4555700 - [email protected]

FEN FAKÜLTESİ HÜCRE ve DOKU KÜLTÜRÜ LABORATUVARI

58



Laminar akışlı kabin, Ultrasonik su banyosu, PCR

cihazı, Fluorimetre, Soğutmalı santrifüj, Homoje-

nizatör, Dikey ve yatay elektroforez sistemleri, IEF

sistemi, Jel görüntüleme cihazı, Fluoresan ataçmanlı

invert mikroskop.


İstanbul Teknik Üniversitesi, Marmara Üniversitesi,

Helmholtz Akciğer Hastalıkları Araştırma Merke-

zi (Almanya), Ulusal Özerk Meksika Üniversitesi

Moleküler Hücre Fizyolojisi Enstitüsü (Meksika),

Maryland Üniversitesi (ABD) ile işbirlikleri bulun-

maktadır. TÜBİTAK destekli Ar-Ge projeleri yürü-

tülmektedir.

In vivo ve in vitro çeşitli deneysel has-talık modellerinde ve insan hasta-lıklarında hücre ölüm, hasar ve ona-

rım mekanizmaları moleküler düzeyde araştırılmaktadır. Apoptoz, nekroz, oto-faji, hücre çoğalması, doku rejenerasyo-nu, fibrozis, çeşitli büyüme faktörleri ve sitokinler ile ilişkili sinyal yolakları, gliko-biyoloji: lektin-karbonhidrat etkileşimleri ve bazı moleküllerin antikanser aktivite-leri üzerinde moleküler çalışmalar yapıl-maktadır. DNA ve RNA izolasyonu, ana-lizi ve görüntülenmesi, gen ekspresyon analizleri: RT-PCR, in-situ hibridizasyon, çeşitli glikan saptama ve analiz yön-temleri, tekli ve çoklu immunohistokim-yasal ve immunofluoresan yöntemler, immunpresipitasyon, 1D ve 2D protein elektroforezi ve western blotlama yön-temleri uygulanmaktadır.

Prof. Dr. Şehnaz Bolkent0212 4555700 - [email protected]

FEN FAKÜLTESİ MOLEKÜLER HÜCRE BİYOLOJİSİ ARAŞTIRMA LABORATUVARI

59


Çeşitli deneysel hastalık modellerin-de ve insan hastalıklarında hüc-re ölüm, hasar ve onarım me-

kanizmaları biyokimyasal düzeyde araştırılmakta ve terapötik amaçlı yeni moleküllerin biyolojik aktiviteleri incelen-mektedir. Hayvan doku homojenatların-da, hücre lizatlarında, kan, serum, plaz-ma ve bronşoalveolar sıvılarda protein izolasyonu ve saflaştırılması, proteinle-rin miktar tayini, enzim aktivite tayinle-ri, oksidan/antioksidan parametrelerin, apoptotik ve nekrotik belirteçlerin ve inf-lamatuvar/antiinflamatuvar aracıların, çeşitli büyüme faktörleri ve sitokinlerin ELISA, spektrofotometrik, kolorimetrik ve elektroforetik yöntemlerle analizleri gerçekleştirilmektedir.


Spektrofotometre, ELISA okuyucu, Soğutmalı san-

trifüj, Homojenizatör, Yatay ve dikey elektroforez

sistemleri, Transluminatör, Ultrasaf su cihazı, -86°C

derin dondurucu, Vorteks.


Çeşitli hastalık modellerinde terapötik amaçlı yeni

moleküllerin etki mekanizmaları ile ilgili TÜBİTAK

destekli Ar-Ge projeleri yürütülmektedir. Ayrıca,

bazı akciğer hastalıklarının tedavisinde kullanılması

önerilen yeni bir molekül ile ilgili ulusal ve ulusla-

rarası patent başvuruları yapılmıştır. Marmara Üni-

versitesi ile Helmholtz Akciğer Hastalıkları Araştırma

Merkezi (Almanya), Antwerp Üniversitesi (Belçika),


maktadır.

Yard. Doç. Dr. Pelin Arda Pirinççi


Doç. Dr. Füsun Öztay0212 4555700 - [email protected]

FEN FAKÜLTESİ BİYOKİMYA ARAŞTIRMA LABORATUVARI

60



Laminar akışlı kabin, Ultrasonik su banyosu, İnvert

mikroskop, Otoklav, UV kabin, -152˚C derin don-

durucu, Flow sitometri cihazı.


Helmholtz Akciğer Hastalıkları Araştırma Merke-

zi (Almanya), Ulusal Özerk Meksika Üniversitesi

Moleküler Hücre Fizyolojisi Enstitüsü (Meksika),


maktadır. TÜBİTAK destekli Ar-Ge projeleri yürü-

tülmektedir.

Bu Laboratuvar; Primer Kök Hüc-re ve Kanser Araştırma Laboratu-varlarından oluşmaktadır. Primer

- Kök Hücre ve Kanser Araştırma Labo-ratuvarı’nda Türkiye’de ilk kez pankreatik beta hücreleri izole edilmiş ve uzun sü-reli kültür uygulamaları ile tek hücre dü-zeyinde çalışmalar yapılmıştır. Diyabet hastalığında hücre ölüm, hasar ve ona-rım mekanizmalarını moleküler düzey-de çözmeye çalışarak, diyabette beta hücrelerini etkileyen moleküler meka-nizmalar araştırılmaktadır. In vivo de-neysel hiperglisemik ve diyabetik hay-vanlardan izole edilen primer pankreatik β-hücreleri ve pankreatik adacık kökenli mezenkimal kök hücreler ile in vitro ça-lışılarak, insan sağlığına yönelik terapö-tik yaklaşımlara temel katkı sağlanması, temel ve klinik bilimler arasında köp-rü oluşturacak çalışmaların uygulama-ya geçirilmesi hedeflenmektedir. Ayrıca cGRP ve GRP ile uyarılan insan akciğe-ri primer fibroblast hücre ve fare primer tip II pnömosit kültüründe fibrozis süre-

cine katkı sağlayabilecek mekanizmalar da araştırılmaktadır. Kanser Hücre Kül-türü Araştırma Laboratuvarı’nda İnsü-linoma hücre soyu (INS-1), pankreatik duktal hücre soyu ARIP, pankreatik asi-nar hücre soyu AR42J, meme kanseri hücre soyları (MCF-7 ve MDA-MB 231), C6 glioma hücre soyu, foliküler, papiller ve anaplastik tiroid karsinoma soyları ile araştırmalar yapılmaktadır.

Doç. Dr. Engin Kaptan

0212 4555700 - 15089 [email protected]

Doç. Dr. Selda Gezginci Oktayoğlu


FEN FAKÜLTESİ PRİMER-KÖK HÜCRE VE KANSER ARAŞTIRMA LABORATUVARI

61


Karasal ve denizel örneklerde gama (137Cs, 40K, 232Th ve 238U serisi) ve alfa yayan (210Po) radyonüklidle-

rin kalitatif ve kantitatif analizleri yük-sek saflıkta Ge dedektörlü gama spek-trometreleri ve alfa spektrometresi ile yapılmaktadır. Biyoizleme çalışmaların-da sediment karot, sediment tuzağı ve midye transplantasyonu metotları uy-gulanmaktadır. Ayrıca radyonüklidlerin ve metallerin deniz omurgasızlarında-ki biyobirikim kinetikleri yüksek CO2 salı-nımı şartları (küresel ısınma ve okyanus asitlenmesi) oluşturularak çalışılmakta-dır.


Gama spektrometresi (yüksek saflıkta Ge dedektör-

lü), alfa spektrometresi (sekiz adet iyon implante

silikon yüklü 300 mm2 aktif alanlı alfa dedektörlü).


TÜBİTAK projesi kapsamında İstanbul Teknik Üni-

versitesi Maden Fakültesi Jeoloji Bölümü ve Kocaeli

Üniversitesi Fen Fakültesi Biyoloji Bölümü ile Ha-

liç’de kirleticilerin (radyonüklid, metal ve organik)

aktif biyoizleme yöntemleriyle belirlenmesi kap-

samında çalışmalar yürütülmektedir. La Rochelle

Üniversitesi (Fransa) ve Monako Çevre Laboratuvarı

(Monako) ile deniz omurgasızlarında yüksek CO2

şartlarında radyonüklid biyobirikimi, Lizbon Üniver-

sitesi Teknik Bilimler Enstitüsü (Portekiz) ile denizel

organizmalarda 226Ra, 238U, 232Th, 238+239Pu, 210Po öl-

çümleri konusunda işbirlikleri bulunmaktadır.

Doç. Dr. Önder Kılıç0212 4555700 - [email protected]

Doç. Dr. Murat Belivermiş0212 4555700 – [email protected]

FEN FAKÜLTESİ RADYOEKOLOJİ LABORATUVARI

62



Optik mikroskop (faz-kontrast ve fluoresan), Lami-

nar akışlı kabin, CO2’li etüv, Soğutmalı santrifüj,

PCR cihazı, Elektroforez sistemi, Qiaxcel görüntü-

leme cihazı (3-5 baz çiftine kadar düşük konsantras-

yonlarda, 96 örneğe kadar analiz yapabilmektedir).


Amerikan Bilim İlerlemesi Kuruluşu (ABD), Avrupa

Kanser Araştırma Birliği (İngiltere) ve Migal-Galilee

Araştırma Enstitüsü (İsrail) ile ortak projeler yürü-

tülmektedir.

Normal ve tümöral hücre soyları-nın rutin pasajları sürdürülmekte olup, hücresel ve moleküler baz-

da analizler yapılmaktadır. Klinikte kul-lanılan çeşitli antineoplastik ajanların ve bitki ekstrelerinin hücre ve doku kül-türünde sitotoksisite analizleri, hücre ki-netiği parametreleri (Mitotik indeks, İşa-retlenme indeksi ve Apoptotik indeks), DNA hasar ve onarım sinyal yolakları, hücre siklusu ve hücre ölüm tiplerinde rol alan genlerin anlatımları ile radyodu-yarlılık ve kemoduyarlılık çalışmaları sür-dürülmektedir.

Doç. Dr. Gül Özcan Arıcan

0212 455 57 00 - [email protected]

FEN FAKÜLTESİ MOLEKÜLER KANSER BİYOLOJİSİ LABORATUVARI

63


Fare ve sıçanlarda oluşturulan diya-bet, sepsis, epilepsi ve kanser baş-ta olmak üzere farklı deneysel mo-

dellerde, amaca uygun olarak belirlenen dokularda immünohistokimyasal ola-rak enzim ve hormon işaretlemeleri ile apoptotik hücrelerin gösterildiği TUNEL yöntemi ile ilgili çeşitli çalışmalar yürü-tülmektedir.


Rotary Mikrotom cihazı, Mikroskobik görüntü ana-

liz sistemi.


Amsterdam Üniversitesi Akademik Tıp Merkezi

(Hollanda), Bezmialem Vakıf Üniversitesi ve Gire-

sun Üniversitesi ile işbirlikleri bulunmaktadır. TÜ-

BİTAK Projeleri kapsamında, farklı deneysel model-

lerden alınan çeşitli dokularda immünohistokimyasal

yöntemlerin yapıldığı projeler yürütülmektedir.

Prof. Dr. Cihan Demirci Tansel

0212 4555700 – [email protected]

Prof. Dr. Kadriye Akgün Dar

0212 4555700 – 15101

[email protected]

FEN FAKÜLTESİ İMMÜNOHİSTOKİMYA ARAŞTIRMA LABORATUVARI

64



Langendorff izole kalp sistemi, Homojenizatör, Ul-

trasaf su cihazı, Powerlab 8Sp Recorder Chart ve

Scope Software, bio amplifier, bridge amplifier, Kan

basıncı dönüştürücüsü, Kan akış ölçer, Fine needle

probe, İnfüzyon pompası, Ventilatör, Sterotaksi cer-

rahi sistemi.


Amsterdam Üniversitesi Akademik Tıp Merkezi

(Hollanda), Bezmialem Vakıf Üniversitesi, Gire-

sun Üniversitesi ve Karadeniz Teknik Üniversitesi

ile işbirlikleri bulunmaktadır. TÜBİTAK Projeleri

kapsamında Langerdorff izole kalp sisteminde çeşit-

li ajanların etkileri ile In vivo Elektrofizyolojik Veri

Kazanım Sistemi’nde septik şok ve farklı deney mo-

dellerinde dolaşım ve böbrek fonksiyonlarına yönelik

projeler yürütülmektedir.

Farklı hayvan modellerinde (sep-sis, diyabet, hipertansiyon, hiperg-lisemi, epilepsi, hemorojik şok vs.)

anestezi altında, gerçek zamanlı ölçüm-lerle yapılan fizyolojik araştırmalar, dola-şım ve sinir sistemi uygulamaları, mik-rosirkülasyon çalışmaları, Langendorff İzole Kalp Sistemi’nde akut ve/veya kro-nik iskemi/reperfüzyon hasarına karşı çeşitli endojen ve eksojen ajanların et-kilerinin incelenmesi ve kardiyak para-metrelerin belirlenmesi, nörodejeneratif hastalıklar ile ilgili çeşitli çalışmalar yü-rütülmektedir.

Prof. Dr. Cihan Demirci Tansel


FEN FAKÜLTESİ FİZYOLOJİ ARAŞTIRMA LABORATUVARI

65


Preklinik kanser araştırmalarında kanserin kemoterapötik ajanlarla ve çeşitli ekstrelerle tedavi yöntem-

lerinin yanında hücresel yaşlanma, aro-mataz inhibitörleri, nanoteknolojik ilaç-lar ve hipertermi ile kanser tedavilerinin düzenlenmesi konularında araştırmalar yapılmaktadır. Hücre kinetiği parametre-lerinden Labelling indeks, Mitotik indeks, Apoptotik indeks, Hücre indeksi ve Mi-tokondrial dehidrogenaz aktivitesi anali-zi ile tirozin kinaz aktivitesi analizi, hiper-termi uygulamaları ve değerlendirilmesi konularında araştırmalar sürdürülmek-tedir.


Laminar akışlı kabin, İnvert mikroskop, Optik mik-

roskop, Santrifüj, -20oC derin dondurucu, -70oC

derin dondurucu, Hassas terazi, Distile su cihazı,

xCELLigence gerçek zamanlı hücre analiz sistemi,

CO2’li inkübatör, Çalkalayıcılı inkübatör, MagCel-

lect cihazları.


Marmara Üniversitesi, Amerikan İleri Bilim Toplu-

luğu (Amerika), Amerikan Terapötik Radyoloji ve

Onkoloji Topluluğu (Amerika) ve Avrupa Terapötik

Radyoloji ve Onkoloji Topluluğu (Belçika) ile ortak


Yard. Doç. Dr. Mehmet R. Topçul


FEN FAKÜLTESİ MOLEKÜLER RADYOBİYOLOJİ ve BİYOMOLEKÜLER TEKNOLOJİ ARAŞTIRMA LABORATUVARI

66



Gerçek zamanlı PCR, Nanodrop 2000 spektrofoto-

metre, Geliance 200 görüntüleme sistemi, 3-30 K

Ultrasantrifüj.


Koç Üniversitesi ile ortak beslenme, endüstriyel ve

ekonomik açıdan önemli nişasta sentezinin bitkiler-

de artışına yönelik moleküler yaklaşımlar, Ege Üni-

versitesi ile Türkiye’de Campanula Seksiyonlarının

Taksonomik Revizyonu ve Filogenetik İlişkileri ve

Safranda SSR Markörlerin Geliştirilmesi, Yeni Ne-

sil Sekanslama Metodu ile Safran ve Akraba Türle-

rinin Kloroplast DNA’sının Sekanslanması ve Filo-

genetik Analizlerde kullanılması konulu TÜBİTAK

ve COST projeleri ile AB destekli diğer işbirlikleri

devam etmektedir. Bu laboratuvar GDO analizleri-

ni rutin yürütme potansiyeli de taşımaktadır. Ulusal

Bilimsel Tarım Araştırma Enstitüsü (Fransa) ile yeni

GDO analiz yöntemlerinin geliştirilmesine yönelik

çalışmalar yapılmaktadır.

Genetiği değiştirilmiş organizmala-rın (GDO) kalitatif-kantitatif analizi, belirli gen bölgelerinin çoğaltılma-

sı, işlevsel genlerin kantitatif tayini, gen ekspresyonunun belirlenmesi ve spe-sifik genlerin analizi gerçekleştirilmek-tedir. Ayrıca DNA, RNA, protein izolas-yonları, Southern, Northern ve Western blotlama, protein ve nükleik asitlerin jel elektroforezleri ve görüntülenmesi, en-demik ve tehdit altındaki bitkilerin doku kültürü yöntemiyle mikro üretimi, tür-ler arasındaki polimorfizm ve filogenetik ilişkilerin moleküler belirteç teknikleri ile belirlenmesi çalışmaları yapılmaktadır.

Prof. Dr. Mahmut Çalışkan0212 4555700 - [email protected]

Prof. Dr. Gül Cevahir Öz0212 4555700 – [email protected]

FEN FAKÜLTESİ BİTKİ BİYOTEKNOLOJİSİ ve GENETİĞİ DEĞİŞTİRİLMİŞ ORGANİZMALAR LABORATUVARI

67


Bitki, toprak, su ve sediment örnekle-rindeki element miktarının belirlen-mesi, saflaştırmalar, peptid ve pro-

teinlerin karakterizasyonu, aminoasit, vitamin gibi moleküller, pestisit ve poli-siklik aromatik bileşikler gibi kirleticilerin, fraksiyonlama işlemleri yapılmış örnek-lerde uçucu yağlar, yağ asitleri gibi çeşit-li kimyasal bileşiklerin ve yüksek mole-kül ağırlıklı biyopolimerlerin saptanması çalışmaları gerçekleştirilmektedir.


ICP-optik emisyon spektrofotometresi, Ultra yüksek

performanslı sıvı kromatografisi, Gaz kromatografi

kütle spektrometresi, Mikrodalga fırın sistemi, Yağ

ekstraksiyon cihazı.


TÜBİTAK, Yıldız Teknik Üniversitesi, Orléans Üni-

versitesi (Fransa), Bielefeld Üniversitesi (Almanya),

Oslo Üniversitesi (Norveç) ve Debrecen Üniversitesi

(Macaristan) ile işbirlikleri mevcuttur. Üniversite-

Sanayi işbirliği kapsamında Ar-Ge projeleri yürütül-

mekte olup, laboratuvar altyapısının rutin analizleri

gerçekleştirme potansiyeli bulunmaktadır.

Doç. Dr. Gülriz Bayçu Kahyaoğlu


Prof. Dr. Gül Cevahir Öz


FEN FAKÜLTESİ ÇEVRE ve ENSTRÜMENTAL ANALİZ LABORATUVARI

68



Bakterilerin tanımlanması (Epifluoresan mikroskop,

Gradient PCR), Komünite analizi (Denatüre grad-

yan jel elektroforezi), Anaerobik kültür yöntemleri

(Glovebox cihazı), Elektrokimyasal mikrobiyolojik

korozyon deneyleri (Potansiyostat-Galvanostat ciha-

zı), çevresel moleküler mikrobiyoloji çalışmaları (Na-

nodrop spektrofotometre, ELISA okuyucu), mikro-

biyolojik hava kalitesi ölçümü (Hava örnekleyici).


Yıldız Teknik Üniversitesi, Boğaziçi Üniversitesi,

Trakya Üniversitesi, Delft Teknoloji Üniversitesi

(Hollanda), Flinders Üniversitesi (Avustralya), TPAO

ile akademik işbirlikleri bulunmaktadır. TÜBİTAK

projeleri kapsamında; Türkiye’de üretilen petrolün

mikrobiyolojik karakterizasyonu, soğutma kulelerin-

deki metallerin mikrobiyolojik korozyonuna yönelik

projeler yürütülmekte, anti-biyofilm özellikli nano-

teknolojik kaplamalar konusunda ticarileşme ve pa-

tent hazırlıkları yapılmaktadır.

İnsan yapımı su sistemlerinde Legio-nella, sülfat indirgeyen, kükürt okside eden bakterilerin, özgür yaşayan amip-

lerin izolasyonu ve tanımlanması, mikro-biyolojik korozyon, antibakteriyel aktivite tayini, dezenfektan etkinlik çalışmaları (süspansiyon, biyofilm), mikrobiyolojik gıda analizi, petrolden sülfat indirgeyen bakteriler ve metan üreten bakterilerin izolasyonu, çeşitli ürünlerin mikrobiyo-lojik kalite tayini, mikoloji, aerobiyoloji, iç ve dış ortam hava kalitelerinin belirlen-mesi, su kirliliği, quorum sensing, biyo-film testleri ve karakterizasyonuna yö-nelik çalışmalar yürütülmektedir.

Prof. Dr. Ayşın Çotuk0212 [email protected]

FEN FAKÜLTESİ TEMEL ve ENDÜSTRİYEL MİKROBİYOLOJİ ARAŞTIRMA LABORATUVARI

69


In vitro ortamda gama radyasyonu ile çeşitli abiotik stres faktörlerine (kurak-lık, tuzluluk, herbisitler vb.) dirençli yeni

bitki soyları geliştirilmekte, bu geliştirilen mutant bitkilerin moleküler ve biyokim-yasal analizleri yapılmaktadır. Ayrıca ta-rımsal ve ekonomik öneme sahip çeşitli bitkilerin doku kültürü teknikleri ile çoğal-tılması gerçekleştirilmektedir.


Laminar akışlı kabin, Etüv, Hassas terazi, Termal cyc-

ler, Nanophotometer, Büyüme kabini (Nüve), Büyü-

me kabini (Sanyo), Santrifüj, Jel yürütücü dikey ve

yatay elektroforez tankları.


Birleşmiş Milletler’e bağlı Uluslararası Tarım ve Gıda

Organizasyonu ile Uluslararası Atom Enerjisi Ajansı

ortaklığı ile kurulan Bitki Islahı ve Genetiği Labora-

tuvarı (Avusturya) ile ortak çalışmalar yapılmaktadır.

Yard. Doç. Dr. Sema Alikamanoğlu


FEN FAKÜLTESİ MOLEKÜLER RADYOBİYOLOJİ ve BİTKİ BİYOTEKNOLOJİSİ ARAŞTIRMA LABORATUVARI

70



Etüv, Otoklav, Ultrasonik banyo, Hassas terazi, Işı-

kölçer, Optik mikroskop ve Görüntüleme sistemi.


TÜBİTAK-GSRT (Yunanistan) ortaklı “Microalgae

resting cysts in recent marine sediments and the-

ir role in establishment of Harmful Algal Blooms

(HABs) in three eutrophicated bays in Grecee and

Turkey” isimli uluslararası ikili işbirliği projesi ger-

çekleştirilmiştir.

Sularımızdaki mikroskobik canlıla-rın laboratuvar ortamında üretil-mesi ve kültüre alınmasına yöne-

lik, özellikle deniz sedimanında bulunan dinoflagellat kistlerinin teşhis ve üretimi ile ilgili çalışmalar yürütülmektedir.

Yard. Doç. Dr. Benin Toklu Alıçlı


Prof. Dr. Neslihan Balkıs


FEN FAKÜLTESİ PLANKTON KÜLTÜR LABORATUVARI

71


1956 yılında Index Herbariorum’a kaydolmuş olan uluslararası bir herbaryumdur. Her yıl yurtiçinden

ve yurtdışından araştırmacılar, içinde ta-rihi ve bilimsel değeri yüksek örneklerin de bulunduğu 40000’i aşkın bitki üzerin-de bilimsel çalışmalar yapmak için, her-baryumu ziyaret etmektedir.


Taramalı elektron mikroskobu (Jeol JCM 5000

Neoscpe Benchtop), Fotomikroskop ve stereomik-

roskop (Olympus SZX16)/Fotoğraflama ve ölçüm,

Mikroskop ve diseksiyon malzemeleri.


Dünyadaki resmi ve kayıtlı tüm herbaryumlar ile iliş-

ki halindedir ve ziyaretçileri kabul etmektedir.

Doç. Dr. Osman Erol0212 4555700 - [email protected]

FEN FAKÜLTESİ ISTF (HERBARYUM)

72



200 -10 μm dalgaboyu aralığında sıcaklığa bağlı (2 -

300 K) optik karakterizasyon (spektral fotoiletkenlik,

spektral fotovoltaj, yansıtma, modülasyon spektros-

kopisi, fotolüminesans), Elektriksel karakterizasyon

(a.c. ve d.c. Akım-Voltaj ölçüm seti), Hall Olayı öl-

çüm seti (2,3 T, 10 - 300 K) Magnetotransport deney

seti (7 T, 4 - 300 K), Kusur spektroskopisi (PITS), 40

lt/gün üretim kapasiteli sıvı azot üreteci.

Yarıiletken malzeme ve elektronik/optoelektronik aygıtların 2 – 300 K sıcaklık ve 200-10 μm dalga-

boyu aralığında optik ve sıcaklığa bağlı elektriksel karakterizasyonu, katı malze-melerde yük taşınım olaylarının magne-totransport ile incelenmesi, yarıiletken-lerde kusur seviyelerinin belirlenmesi, nanoyapıların sentezlenmesi ve karak-terizasyonu, yarıiletkenlerin manyetik özelliklerinin incelenmesine yönelik ça-lışmalar yürütülmektedir.

Prof. Dr. Ayşe Erol



Anadolu Üniversitesi, Cumhuriyet Üniversitesi, Sa-

karya Üniversitesi, Akdeniz Üniversitesi, Essex Üni-

versitesi (İngiltere), Tampere Teknik Üniversitesi

(Finlandiya), LAAS (Fransa) ve Victoria Üniversitesi

(Kanada) ile işbirlikleri bulunmaktadır. TÜBİTAK

projeleri kapsamında yeni yarıiletken alaşımların

elektriksel/optik özellikleri, IR bölgede çalışan de-

dektörlerin karakterizasyonu ve optik haberleşme için

fotodedektör tasarımı ve karakterizasyonu, COST

projeleri kapsamında yarıiletkenlere dayalı yeni nesil

malzeme/aygıtların geliştirilmesi ve THz bölgede ça-

lışan aygıtlara yönelik projeler yürütülmektedir.

FEN FAKÜLTESİ NANO ve OPTOELEKTRONİK ARAŞTIRMA LABORATUVARI

73


Kalkınma Bakanlığı destekli altyapı projesi olarak 2014 yılında kurulu-mu tamamlanmış olan İleri Litog-

rafik Yöntemler Laboratuvarı, 100 m2 alanda 10, 100 ve 1000 sınıfı temiz oda ortamında, elektronik/optoelektronik ay-gıtların nano/mikro boyutta fotolitografi ve kuru aşındırma teknikleriyle fabrikas-yonu, nanolitografi, katıların yüzey ve ke-sitlerinin nanometre skalasında görün-tülenmesi, malzemelerin bileşimlerinin belirlenmesine yönelik araştırmalar ya-pılmasına uygun donanıma sahiptir.


100 sınıfı sarı odada fotolitografi prosesi donanımı

(10 sınıfı laminar akışlı, döndürerek kaplama, sıcak

tabla, ultrasonik temizleyicili kimyasal tezgâh, Maske

hizalayıcı (SUSS MJB4), termal buharlaştırma siste-

mi (VAKSIS), profilometre (KLA Tencor P6)), tel

bağlayıcı sistem (Kulicke & Soffa), 1000 sınıfı temiz

odada kuru aşındırma prosesi donanımı (FEI Versa

3D Dual Beam Odaklanmış iyon/elektron demeti),

SEM/EDS (FEI), AFM (Park Systems).


Anadolu Üniversitesi, Cumhuriyet Üniversitesi, Sa-

karya Üniversitesi, Akdeniz Üniversitesi, Essex Üni-

versitesi (İngiltere), Tampere Teknik Üniversitesi

(Finlandiya), LAAS (Fransa) ve Victoria Üniversitesi

(Kanada) ile optoelektronik/elektronik aygıt fabri-

kasyonu ve karakterizasyonuna yönelik işbirlikleri ve

projeler yapılması hedeflenmektedir.



FEN FAKÜLTESİ İLERİ LİTOGRAFİK YÖNTEMLER LABORATUVARI

74


Laboratuvar altyapısı ve cihaz dona-nımı İstanbul Üniversitesi desteği ile sağlanarak 2012 yılında kurulmuş

olan laboratuvar, katı malzemelerin ve yarıiletken aygıtların değişken manye-tik alan ve düşük sıcaklıklarda yük taşı-nım mekanizmalarının incelenmesi, ilet-kenliğin manyetik alana bağlı değişimi, klasik Hall Olayı ve kuantum Hall Olayı, elektriksel karakterizasyon ve manyetik özelliklerin incelenmesine dayalı çalış-malar yürütülmesine uygun donanıma sahiptir.


Seyreltme soğutucu sistemli (10 mK) 18/20 T süpe-

riletken magnet sistemi, helyum geri dönüşüm ve 18

lt/gün kapasiteli helyum sıvılaştırıcı sistemi.


Essex Üniversitesi (İngiltere), Tampere Teknik Üni-

versitesi (Finlandiya), LAAS (Fransa), INSA (Fransa)

ve Victoria Üniversitesi (Kanada) ile işbirlikleri kap-

samında yarıiletken malzemelerin manyetik özellik-

lerinin incelenmesi, klasik ve kuantum Hall olayı,

katılarda yük taşınımına dayalı projeler yürütülmesi

hedeflenmektedir.

Yard. Doç. Dr. Saffettin Yıldırım




FEN FAKÜLTESİ YÜKSEK MANYETİK ALAN ve DÜŞÜK SICAKLIK LABORATUVARI

75


Moleküler yapıların tanılanması ve karakterize edilmesi, fonksiyo-nel grupların belirlenmesi ve bu

yapıların kristal yapı özelliği sergileyip sergilemediklerinin tespiti üzerine çalış-malar yapılmaktadır. Bunlara ek olarak, çeşitli hastalıkların moleküler düzey-deki etkilerinin saptanması, kullanılan ilaçların yapı analizleri, ortamla olan et-kileşmelerinin spektroskopik inceleme-leri, arkeolojik buluntuların yapı analizleri ve yarıiletken alaşımların kimyasal bile-şimlerinin belirlenmesi çalışmaları ger-çekleştirilmektedir. Tüm bu deneysel çalışmalar moleküler simülasyon he-saplamaları ile de desteklenmektedir.


Fourier Transform Infrared spektrometre (Orta ve

yakın IR), Fourier Transform Raman spektrometre

(50-3600 cm-1 spektral aralığı, 1064 nm dalgaboylu

ve 1 W gücünde laser kaynak), Mikro Raman disper-

sif spektrometre (50-8000 cm-1 spektral aralığı, 785

nm ve 532 nm dalgaboylu ve 100 mW gücünde laser

kaynaklar).


Potsdam Üniversitesi (Almanya), Oral Roberts Üni-

versitesi (ABD) ve Uzhgorod Üniversitesi (Ukrayna),

Milano Politeknik Üniversitesi (İtalya) ile işbirlikle-

ri bulunmaktadır. TÜBİTAK Projeleri kapsamında

moleküler yapı ve titreşimsel analiz çalışmaları ve

TÜBİTAK Uluslararası İkili İşbirliği Projesi kapsa-

mında amorf katıların yapısal analizi ve elektronik

bant aralığı incelenmesine yönelik projeler yürütül-

mektedir.

Prof. Dr. Ayşen E. Özel0212 [email protected]

Prof. Dr. Elif Akalın0212 4555700 - [email protected]

FEN FAKÜLTESİ MOLEKÜLER SPEKTROSKOPİ LABORATUVARI

76



Laboratuvarda atomların aşırı ince yapısını incele-

mek ve yeni enerji seviyelerini bulmak için Laserle

Uyarılmış Fluoresans Spektrokopisi (LIF), Doymuş

Soğurma Spektroskopisi (SAS), Optogalvanik Spek-

troskopi (OGS) yöntemleri, 18 W optik güce sahip,

532 nm dalga boyunda, Cw katıhal laser ile pom-

palanan, taranabilir cw Titan Safir laseri (30 GHz

Sürekli taranabilen, 75 kHz çizgi genişliğinde de-

ğiştirilebilen ayna seçenekleri olan, 700 - 1100 nm

aralığında çalışan 4 W optik güce sahip) kullanılarak

uygulanmaktadır.

2012 yılında İstanbul Üniversite-si desteği ile kurulmuş olan Laser Spektroskopisi Laboratuvarı’nda

elementlerin atomik spektrumlarından aşırı ince yapı sabitlerinin belirlenmesi ve atomların bilinmeyen spektral çizgile-rinin tespiti çalışmaları yürütülmektedir. Aşırı ince yapı sabitleri astrofizik alanın-da da kullanıldığından, laboratuvar araş-tırma altyapısı disiplinlerarası çalışmaya uygundur.

Prof. Dr. Gönül Başar0212 [email protected]


HTW Berlin (Almanya), Latvia Üniversitesi (Litvan-

ya), Graz Teknik Üniversitesi (Avusturya), Poznan

Teknoloji Üniversitesi (Polonya) ile ikili işbirlikle-

rine dayalı projeler kapsamında atomların ince yapı

sabitinin deneysel ve teorik olarak belirlenmesi ve

atomların yeni enerjilerinin tespit edilmesine yönelik

çalışmalar yürütülmektedir.

FEN FAKÜLTESİ LASER SPEKTROSKOPİ LABORATUVARI

77


İstanbul Üniversitesi desteği 2012 yılın-da kurulmuş olan laboratuvarda yük-sek vakum ortamında elektron ışını,

termal buharlaştırma, RF ve Magnet-ron Saçtırma gibi farklı tekniklerle hedef-lenen kalınlıklarda iletken, oksit ve po-limer malzemelerin hazırlanması, külçe ve toz halindeki malzemelerle, ince film, polimer ve sıvı örneklerin dielektrik özel-liklerinin 3 μHz - 20 MHz frekans ve 173 K - 373 K sıcaklık aralığında dielek-trik özelliklerinin (kapasite, enerji kaybı, AC iletkenlik, rölaksasyon zamanı gibi) belirlenmesi, külçe ve ince film halinde-ki malzemelerin DC iletkenlik ölçümleri-ne dayalı çalışmalar yürütülmektedir.


Kalınlık monitörü içeren ve 10-6 Torr vakum sağla-

yabilen vakum sistemi, 3 μHz - 20 MHz frekans ve

173 K - 373 K sıcaklık aralığında çalışan Dielektrik

İletkenlik and Empedans Ölçüm Sistemi, ELGA Pu-

relab Options-S7/15 su arıtma cihazı.


Marmara Üniversitesi ve Bahçeşehir Üniversitesi ile

sanayi ihtiyaçlarına yönelik malzemelerin üretimi ve

karakterizasyonlarının belirlenmesi ve biyolojik sıvı-

larla ilgili çalışmalar devam etmekte olup, Charles

Üniversitesi (Çek Cumhuriyeti) ile işbirliği bulun-

maktadır.

Prof. Dr. Deniz Değer Ulutaş


FEN FAKÜLTESİ DİELEKTRİK SPEKTROSKOPİ LABORATUVARI

78


2014 yılında İstanbul Üniversite-si desteği ile kurulan laboratuvar, Gama Spektroskopi Laboratuva-

rı ve Radon Ölçüm Laboratuvarı’ndan oluşmaktadır. Gama Spektroskopi La-boratuvarı çevresel örneklerde, çeşit-li gıda ve yiyeceklerde (çay, fındık vb.), endüstriyel hammadde ve ürünlerinde (gübrelerde, kömür, çimento, seramik, mermer, granit gibi yapı malzemelerin-de) her türlü radyoaktivite analizlerini ya-pacak donanıma sahiptir. Radon Ölçüm Laboratuvarı’nda deprem ile radon gazı arasındaki ilişkiye yönelik çalışmalar ve Türkiye’nin çeşitli il ve ilçelerinde toprak-ta, havada ve suda radon gazı ölçümleri yapılması hedeflenmektedir.

Doç. Dr. Latife Şahin Yalçın0212 4555700 - [email protected]


Gama spektroskopi sistemi (40 keV - 10 MeV ara-

lığında çalışan %35 verimli, p-tipi koaksiyel Ge

(HPGe) dedektörlü), AlphaGuard radon ölçüm sis-

temi, nükleer iz kazıma detektörleri.


Laboratuvar ulusal ve uluslararası işbirliklerine uy-

gun bir donanıma sahiptir.

FEN FAKÜLTESİ NÜKLEER FİZİK ARAŞTIRMA LABORATUVARI

79


Arkeolojik kazılardan çıkartılan fo-sillerden (insan, hayvan, bitki vb.) DNA izolasyonları ve sonraki aşa-

malarda cinsiyet tayini, mitokondriyal, X ve Y kromozomu dizi analizleri gerçek-leştirilmektedir. Elde edilen dizi bilgileri biyoinformatik olarak değerlendirilmek-te ve Haplo-grup çalışmaları yapılmak-tadır.


Gradient PCR ve klasik PCR cihazı, Bilgisayarlar ve

biyoinformatik yazılımları.


Trakya Üniversitesi, Süleyman Demirel Üniversitesi,

Uluslararası Bilgisayar Temelli Biyoloji Birliği (İtal-

ya), Uluslararası Genetik Mühendisliği ve Biyotek-

noloji Merkezi (İtalya) ile işbirlikleri bulunmakta

olup, Bilim, Sanayi ve Teknoloji Bakanlığı projeleri

yürütülmektedir.

Doç. Dr. Ercan Arıcan0212 4555700 - [email protected]

FEN FAKÜLTESİ ANTİK DNA ARAŞTIRMA LABORATUVARI

80


Bitkiler açısından model organiz-ma olan arpa (Hordeum vulga-re L.), ekmeklik buğday (Triticum

aestivum L.), pirinç (Oryza sativa L.) tü-tün (Nicotiana tabaccum L.) ve ayçiçeği (Avena sativa L.) türleri ile kültür koşul-larında çalışmalar yapılmaktadır. Arpa bitkisinde doku kültürü koşullarında so-matik varyasyonlar özellikle transpozon düzeyinde, transgenik tütün bitkilerinde gen anlatım analizleri, transpozon ana-lizleri, arpa, buğday ve ayçiçeği bitkile-rinde abiyotik stres koşullarında (tuzlu-luk ve ağır metal vb.) fenolojik, fizyolojik ve genomik yanıtlar ve bu yanıtların bit-ki hormonları ile düzeltilmesi genetik ve epigenetik yöntemlerle araştırılmakta-dır. Pirinç bitkisinde GDO analizleri ya-pılmaktadır. Değişik düzeylerde mikros-kopik analizler gerçekleştirilmekte ve insanda yaşlılıkla ilgili genlerin genetik ve epigenetik analizleri yapılmaktadır.

Prof. Dr. Nermin Gözükırmızı



Kontrollü bitki iklimlendirme kabinleri, Yatay elek-

troforez sistemleri, PCR cihazları (klasik ve gerçek

zamanlı), Otoklavlar, Optik mikroskop, Fluoresan

mikroskop, Konfokal mikroskop.


Genetik Mühendisliği ve Biyoteknoloji Enstitüsü

(Bosna-Hersek), Sofya Üniversitesi (Bulgaristan),

Marmara Üniversitesi ile işbirlikleri vardır.

FEN FAKÜLTESİ BİTKİ BİYOTEKNOLOJİSİ LABORATUVARI

81


Çeşitli biyolojik materyallerde (bit-kiler, mayalar, hayvan hücreleri, kök hücreler vb.) ve klinik örnekler-

de proteomik analizler (1D, 2D Elektro-forez ve MS analizleri) yapılmaktadır. Protein ve peptidlerin (özellikle HSP’ler, allerjenik polen proteinleri, süt protein-leri ve hidroliz ürünlerinin) biyoaktivite-leri belirlenmekte, elektroforetik/kroma-tografik ayırımı ve Western-blot analizi gerçekleştirilmektedir. SOD, katalaz, pe-roksidaz, IMPDH, kaspazlar gibi çeşitli enzimlerin aktiviteleri ölçülmektedir. Ge-netik mühendisliği teknikleriyle geliştiri-len rekombinant hücrelerde ve klinik ör-neklerde oksidatif stres ve apoptoz ile ilişkili genlerin ekspresyonu incelenmek-te ve protein profilleri karşılaştırılmakta-dır.


Dikey ve yatay elektroforez sistemleri, HPLC, İzo-

elektrik odaklama cihazı, Microrototor fraksiyonla-

ma cihazı, Jel görüntüleme sistemleri, Jel kurutma

sistemi, Otomatik elektroforez sistemi (Experion),

Protein saflaştırma sistemi (Profinia), Spektrofloro-

metre, Qubit spektroflorometre, Soğutmalı Santri-

füj, Transblotter, Western-Blot Sistemi, Dijital PCR

aleti, Fluoresan mikroskop, Liyofilizatör.


Edinburgh Üniversitesi (İskoçya), Joseph Fouri-

er Üniversitesi ve Promethee Proteomik Platformu

(Fransa), Köln Üniversitesi (Almanya), Marmara

Üniversitesi, Ege Üniversitesi, Adıyaman Üniversi-

tesi, Kocaeli Üniversitesi KABİ Proteomiks Labora-

tuvarı, TÜBİTAK-MAM Gen Mühendisliği ve Bi-

yoteknoloji Enstitüsü ile işbirliği bulunmakta olup,

TÜBİTAK destekli projeler yürütülmektedir.

Yard. Doç. Dr. Evren Önay Uçar


Prof. Dr. Nazlı Arda


FEN FAKÜLTESİ PROTEOMİK LABORATUVARI

82


Fetal genomik analiz yöntemleri ile doğum öncesi tanı çalışmaları ko-nusunda yoğun araştırmalar yapı-

lan laboratuvarda fetal fizyoloji aydın-latılmaya çalışılmaktadır. Mikroarray teknolojisi ile non-invaziv (girişimsel ol-mayan) doğum öncesi tanı koyulabile-cek genetik hastalıklar araştırılmaktadır. Genetik kökenli hastalıkların tanı ve te-davisine yönelik moleküler genetik ana-lizler yürütülmektedir. Özellikle preek-lampsi gibi gebelik komplikasyonlarında tanı koyulabilecek yeni moleküler belir-teç bulma araştırmaları devam etmek-tedir. Amniyotik sıvıdan bebeğin kan grubunun tayini yapılmakta ve anne ka-nında bebeğin RHD geninin varlığı (kan uyuşmazlığı) tespit edilebilmektedir. Uz-man hekimlerle işbirliği içinde amniyotik sıvıdan eşeye bağlı hastalıkların ve anne kanından cinsiyete bağlı hastalıkların ta-nısı yapılmaktadır. Ayrıca genomdaki polimorfizmlerin ve spora yatkınlık gen-lerinin analizi ile spora ve egzersiz bilimi-ne katkı sağlamaya çalışılmaktadır.

Doç. Dr. Tuba Günel0212 4555700 - [email protected]


Gerçek zamanlı PCR cihazları, Mikrosantrifüj, Hib-

ridizasyon fırını, Pikofüj, Mikodizilim tarayıcısı, Bi-

yoanalizör, DNA/RNA ekstraksiyon cihazı.


İsveç Genom Merkezi (İsveç) ile bazı özel klinikler

ve KOBİ’lerle işbirliği mevcuttur. TÜBİTAK destekli


FEN FAKÜLTESİ İNSAN HASTALIKLARINDA MOLEKÜLER TANI LABORATUVARI

83


Tahıllar için model organizma olan arpa (Hordeum vulgare L.), Hor-deum spontaneum ve Brachypo-

dium türleri ile çalışmalar yapılmaktadır. Bitkilerin stres koşullarındaki fenolojik, fizyolojik ve genomik yanıtları molekü-ler yöntemlerle incelenmektedir. Kurak-lık, tuzluluk ve kombine stres koşulların-da farklı yolaklardaki genlerin anlatımları ve allelik varyasyonlar incelenmektedir. Agrobacterium tumefaciens aracılı gen transferi ile monokot hücrelerinde trans-formasyon frekansının artırılmasına yö-nelik çalışmalar yürütülmektedir. Ülke-miz kökenli patojen ve endofit Fusarium türlerinde IGS-RFLP ve SSR belirteçle-rine dayalı polimorfizm çalışmaları ya-pılmakta, yayılım, patojenite seviyeleri ve endofitlerin tarımda kullanımı araş-tırılmaktadır. Fusarium enfeksiyonunun arpa köklerinde meydana getirdiği deği-şimler fizyolojik ve genomik araçlarla in-celenmektedir.


Kontrollü bitki iklimlendirme kabinleri, Elektropo-

ratör, Osmometre, İletkenlik-ölçer, İnkübatör, Mik-

roskop.


Perugia Üniversitesi (İtalya), Ondokuz Mayıs Üni-

versitesi, Ebittek Biyoteknoloji AR-GE Ltd. Şti. ile

işbirliklerimiz çerçevesinde COST projeleri yürütül-

mektedir.

Prof. Dr. Filiz Gürel0212 4555700 - [email protected]

FEN FAKÜLTESİ BİTKİ GENOMİK ARAŞTIRMALAR LABORATUVARI

84


Maya (S. cerevisiae ve S. pombe) genomunda farklı DNA yapıları-nın (Z-DNA, G-Quadruplex vb.)

araştırılması ve ilgili yapılar ile gen fonk-siyonları arasındaki etkileşimlerin belir-lenmesi, mitokondriyal genom X ve Y kromozomları dizi karşılaştırılmaları ve elde edilen bilgiler ışığında, filogenetik bilgilerin değerlendirilmesi çalışmaları yürütülmektedir. Bitkilerde biyoinforma-tik destekli moleküler belirteç tanımla-ma konusunda da çalışmalar yapılmak-tadır.

Doç. Dr. Ercan Arıcan0212 4555700 - [email protected]


Gradient PCR ve klasik PCR cihazı, Bilgisayarlar ve

biyoinformatik yazılımları.




noloji Merkezi (İtalya) ile işbirlikleri bulunmaktadır.

Bilim, Sanayi ve Teknoloji Bakanlığı projeleri yürü-

tülmektedir.

FEN FAKÜLTESİ BİYOİNFORMATİK LABORATUVARI

85


Genetiği değiştirilmiş organizmalar-dan bitkilerin yanısıra, mikroorga-nizmalarda yabancı genler üzerin-

de moleküler çalışmalar yapılmaktadır. Bitkisel sistemde GDO tanısına yöne-lik olarak işlenmiş ve işlenmemiş gıda maddelerinden DNA izolasyonu, kalita-tif ve kantitatif PCR ile yabancı gen ta-raması, yabancı genin miktar tayini ve yabancı genin tiplendirilmesi gerçekleş-tirilmektedir. Ayrıca, bitkilerde ve bitkisel ürünlerde gen anlatımının değişimine yönelik yapılmış manipülasyonları geno-mik düzeyde belirleme çalışmaları yürü-tülmektedir. Biyogüvenlik kapsamında, bitkisel organizmalardan hayvanlara ve toprak mikroorganizmalarına yatay gen geçişi çalışmaları için mikrobial sistem modellerinde transformasyon frekansı belirleme çalışmaları yürütülmektedir.


PCR cihazı, Dikey ve yatay jel elektroforezi sistem-

leri.


Avrupa Birliği Birleşik Araştırma Merkezi (İtalya),

Biyogüvenlik Kurulu, Türkiye Tohumcular Birliği,

Gıda Tarım ve Hayvancılık Bakanlığı Tarla Bitkileri

Merkez Araştırma Enstitüsü Biyoteknoloji Araştırma

Merkezi ile işbirlikleri bulunmakta, TÜBİTAK des-

tekli projeler yürütülmektedir.

Dr. Özgür Çakır0212 4555700 - [email protected]

Prof. Dr. Şule Arı0212 4555700 - [email protected]

FEN FAKÜLTESİ GENETİĞİ DEĞİŞTİRİLMİŞ ORGANİZMALAR LABORATUVARI

86


Farklı coğrafik bölgelerin arpa, buğ-day ve mısır bitkilerinde başak ya-nıklığı ve kök boğazı çürükçülü has-

talığı oluşturan Fusarium cinsine ait 4 türden 70’in üzerinde izolat ile çalışma-lar gerçekleştirilmektedir. RAPD, CAPS, PZR-RFLP, SCAR, ISSR, SSR molekü-ler belirleme teknikleri kullanılarak izo-latların (kromozomal ve mitokondriyal) genotiplendirme çalışmaları sürdürül-mektedir. Mantarlarda kemotiplendirme çalışmaları kapsamında; mantarların mikotoksin üretme potansiyelleri geno-mik (PZR temelli) ve transkriptomik dü-zeyde (RT-PZR ve Gerçek zamanlı-PZR) analiz edilmekte, üretilen mikotoksinle-rin varlığı ise ince tabaka kromatografi-si analizi ile tayin edilmektedir. Fusarium türlerinde gen susturma çalışmaları kap-samında toksin üretimiyle ilişkili genlere özgün sentetik siRNA molekülleri tasar-lanmakta, ayrıca bu genlerin kopyaları-nı taşıyan susturma vektörleri geliştiril-mektedir. Fusarium türlerinde genetik manipülasyonlar birlikte-transformas-

Doç. Dr. Gülruh Albayrak0212 4555700 - [email protected]


Laminar akışlı steril kabin, Sıcaklık ve ışık kontrollü

büyütme kabini, Çalkamalı inkübatör, PCR cihazı,

Elektroporasyon cihazı, Optik mikroskop.


İsfahan Teknoloji Üniversitesi (İran) ile işbirliği bu-

lunmaktadır.

yon düzeyinde gerçekleştirilmekte ve transformantlar; morfolojik, genomik, transkriptomik, metabolomik, spektrof-luorimetrik düzeylerde incelenmektedir.

FEN FAKÜLTESİ BİTKİ PATOLOJİSİ LABORATUVARI

87


Biyolojik aktif ilaç hammaddesi özel-liğindeki bitkisel sekonder metabo-litlerin fazla miktarda üretimi için

kallus, hücre süspansiyon ve saçak kök kültürlemeleri ve genetik transformas-yon (Agrobacterium aracılı ve elektro-porasyon) çalışmaları yapılmaktadır. Pi-lot düzeye fenolik maddelerin üretimi için fiziksel-kimyasal kültürleme koşul-larının optimizasyonu ve elisitasyon ile biyoteknolojik üretim çalışmaları sür-dürülmektedir. Bitkisel sekonder meta-bolitlerin antioksidan ve sitotoksik vb. aktivitelerinin belirlenmesi için enzim ak-tivite testleri ve moleküler analizlerin ya-nısıra sekonder metabolit tanımlanma-sına yönelik analizler proje ortakları ile gerçekleştirilmektedir. Ayrıca antikanser özellikteki bileşenlerin üretildiği selenyu-mun metabolizması fizyolojik, genetik (selenyum metabolik yolunda iş gören genlerin tanımlanması, klonlanması), genomik ve biyoinformatik düzeyde ça-lışılmaktadır.


PCR cihazı, Ultra saf su cihazı, Nanodrop spektrofo-

tometre, Çalkalamalı etüv.


East Carolina Üniversitesi (ABD), TÜBİTAK ve Bi-

lim, Sanayi ve Teknoloji Bakanlığı destekli projeler

yürütülmektedir. Ege Üniversitesi, Koç Üniversitesi,

Sabancı Üniversitesi ve İstanbul Üniversitesi Tekno-

kent NGS Biyoteknoloji ve Sativa Biyoteknoloji Şir-

ketleri ile işbirlikleri sürdürülmektedir.

Yard. Doç. Dr. Neslihan T. Kara


Prof. Dr. Şule Arı


FEN FAKÜLTESİ BİTKİ SEKONDER METABOLİZMA MÜHENDİSLİĞİ LABORATUVARI

88


Ökaryotik hücrelerin çevrelerini na-sıl algıladıkları ve buna yanıt olarak biyolojik süreçlerini nasıl düzenle-

dikleri sorgulanmaktadır. Bu kapsamda, glukozun algılanması, hücre içine taşın-ması, sinyal iletimi, stres yanıt yolakları, depo karbonhidratlarının sentez ve yıkı-mı, tiamin ve purin metabolizması gibi metabolik yolaklar gen, genom ve biyo-kimyasal düzeylerde klasik maya gene-tiği yöntemleri ve moleküler tekniklerin birleştirilmesi ile araştırılmaktadır. Kro-nolojik yaşlanma süreçlerinin hücresel metabolizma düzeylerinde araştırılması sürdürülmektedir. Ayrıca tekstil endüs-trisinde kullanılacak enzimlerin fermen-tasyonla üretimi için optimizasyon ça-lışmaları yürütülmektedir. Çeşitli genler bakımından S. pombe delesyonlu ırk kü-tüphanesi oluşturulmasına yönelik ça-lışmalar yürütülmektedir. Ayrıca, çeşitli metabolik yolakların aydınlatılmasında,


Ökaryotik hücre sayım cihazı, Gerçek zamanlı PCR

cihazı, Klasik PCR cihazı, Fermentör, Hücre parçala-

ma aletleri, Jel görüntüleme sistemleri, UV ile sterili-

zasyonu sağlanan çalışma kabini.




noloji Merkezi (İtalya) ile işbirlikleri bulunmaktadır.

TÜBİTAK destekli projeler ve KOBİ’lerle ortak ça-

lışmalar yürütülmektedir.

Yard. Doç. Dr. Semian Karaer Uzuner

0212 4555700 [email protected]

Doç. Dr. Bedia Palabıyık


hayvansal ve bitkisel kaynaklı genlerin işlevlerinin belirlenmesi için heterolog gen anlatımı çalışmalarında konak ola-rak ta kullanılmaktadır.

FEN FAKÜLTESİ MAYA GENETİĞİ, TEKNOLOJİSİ ve GENOMİK ARAŞTIRMALAR LABORATUVARI

89


Maden atıklarının yerüstünde ve yeraltında güvenli ve stabil bir şekilde depolanabilmesine yö-

nelik çalışmalar yürütülmektedir. Bu bağlamda atık malzemelerin tane boyut dağılım analizi, kimyasal element içerik analizi, tane şekli, kompaksiyon eğrileri ve optimum yoğunluk analizi, likit limit analizi, porozite, geçirimlilik, slump ve su içeriği, çöktürme ve filtrasyon, boru içi akış testleri, kanal içi akış testleri, akma gerilmesi, basma dayanımı, kes-me gerilmesi, proses suyu kalite anali-zi, viskozite, sıvılaşma, konsolidasyon, kuruma çatlaklarının yoğunluğu analizi, su tutma eğrileri analizleri bu laboratu-var kapsamında gerçekleştirilen analiz-lerdir. Aynı zamanda macun malzeme-nin depolandığı yerdeki davranışlarının simule edilmesi için, laboratuvar atık ka-binlerinde saha koşulları oluşturularak laboratuvar ortamında ölçümler ve ana-lizler yapılmaktadır.


Basma-çekme dayanım cihazı, Zemin kompaktör

cihazı, Zemin numune alma seti, Atterberg kıvam

limitleri deney seti, Düşen seviyeli permeabilite de-

ney seti, Kesme kutusu deney cihazı, Konsolidasyon

deney seti, CBR deney cihazı, çeşitli ebatlarda atık

kabinleri, Sıcaklık,-hacimsel su içeriği sensörleri, Su

emme potansiyeli sensörleri, Oksijen sensörleri, Ele-

mentel analiz (XRF) cihazı, Reometre cihazı, Kür ka-

bini, Laboratuar tipi mikser, Slump deney seti.


Quebec Üniversitesi (Kanada) ile işbirlikleri bulun-

maktadır.

Prof. Dr. Ataç Başçetin0212 4737070 - [email protected]

MÜHENDİSLİK FAKÜLTESİ ATIK TEKNOLOJİSİ ARAŞTIRMA LABORATUVARI

90


Polihalojenli bileşikler ve halokinon-ların amin, alkol ve tiyollerle deği-şik çözücülerde (protik, aprotik..vb)

asit ya da baz varlığında vermiş oldu-ğu reaksiyonlar incelenerek yeni orga-nik bileşiklerin sentezlenmesi, sentezle-nen bileşiklerin kromatografik kimyasal ve fiziksel özelliklerinin incelenmesi, yapı aydınlatma çalışmaları yapılmaktadır.


FTIR (400-4000 cm-1), potantiyostat/ galvanostat /

ZRA Sistemi (60 pA - 600 mA) , UV-Vis spektro-

metre (200 - 900 nm), Fluoresans spektrofotometresi

(200 - 900 nm), Polarimetre, yatay ya da dikey kon-

denserli döner buharlaştırma sistemleri, Mikrodesti-

lasyon ünitesi, Platolu saflaştırma cihazı.


Uluslararası dış kaynaklı TÜBİTAK projesi kapsa-

mında Lviv Politeknik Üniversitesi (Ukrayna) ile

yeni biyolojik aktif bileşiklerin sentezi, karakterizas-

yonu ve aktivite özelliklerinin incelenmesi projesi

gerçekleştirilmiştir. Ayrıca bu konularda DPT proje-

leri tamamlanmıştır.

Prof. Dr. F. Serpil Göksel0212 4737070 – [email protected]

MÜHENDİSLİK FAKÜLTESİ ORGANİK KİMYA ARAŞTIRMA LABORATUVARI

91


Ülkemizde üretilen ve işlenen besin kaynaklarının (her türlü katı/sıvı gı-daların) toplam antioksidan kapa-

site değerlerinin raporlandırılması, Türk Gıda Kodeksi Yönetmeliğine göre etiket-lenmesi, gıda antioksidanlarının reaktif oksijen türlerini süpürme aktivite tayin-leri yapılmaktadır. CUPRAC antioksidan kapasite/aktivite tayin yöntemi yardı-mıyla gıda ürünlerinin antioksidan içeri-ği açısından raporlandırılması ve etiket-lenmesi gerçekleştirilmektedir. Gıdaların antioksidanca zengin fraksiyonlarının tanınması ve ayrılması yoluyla bu bile-şiklerin bolca bulunduğu yeni beslenme önerileri oluşturulmaktadır.


HPLC (UV-Vis, fluoresans ve PDA dedektörlü ve

kolon sonrası türevlendirme sistemli), Elektrokim-

yasal potansiyostat-galvanostat, civa damla elektrot

hücre seti, Döner disk elektrot hücre seti, UPLC/

MS/MS (Kütle-Kütle triple kuadrupol) (kütle ölçüm

aralığı 2 - 2000 a.m.u. ve tarama hızı 10000 a.m.u./

Prof. Dr. Reşat Apak0212 [email protected]

sn olan Elektrospray (ESI) iyon kaynağı ve Multimod

(ESI ve APcI) iyonizasyon yapabilen iyon kaynaklı,

Otomatik örnekleyici ve PDA dedektörlü), UV-Vis

Spektrometre (190-900 nm, çift ışın yollu).


T.C. Gıda Tarım ve Hayvancılık Bakanlığı Tarımsal

Araştırmalar ve Politikalar Genel Müdürlüğü, İstan-

bul Teknik Üniversitesi, Malatya Pazarı Kuruyemiş-

çilik San. ve Tic. A.Ş., Melodi Çikolata ve Gıda San.

Ltd. Şti. ile işbirlikleri bulunmaktadır. Polifenollerin

hipokloroz asit süpürme aktivitelerinin ölçümü için

sesorsinol problu yeni bir spektroflorometrik yöntem

geliştirilmesine yönelik TÜBİTAK projesi yürütül-

mektedir. Gıda maddelerinin antioksidan içerikle-

rine göre sınıflandırılması ve değerlendirilmesi ile

antioksidan enzim aktivite ölçümü için sensör geliş-

tirilmesine yönelik çalışmalar sürdürülmektedir.

MÜHENDİSLİK FAKÜLTESİ GIDA ANTİOKSİDANLARI ÖLÇÜMÜ UYGULAMA ve ARAŞTIRMA MERKEZİ

92


Hayvan doku ve serum örneklerin-de enzim aktivite tayinleri ve çe-şitli biyokimyasal parametrelerin

miktar tayinleri, enzim inhibisyon de-neyleri, çeşitli bitki ekstreleri ve kimyasal maddelerde antioksidan aktivite tayinle-ri, enzim saflaştırılması, enzim immobili-zasyonu, sentez edilen çeşitli anorganik ve organik maddelerin enzim aktiviteleri üzerine etkileri, deneysel diyabet, çeşitli kimyasal maddelerin ve bitkisel ekstre-lerin deneysel olarak oluşturulan tok-sisite modellerinde koruyucu etkisinin incelenmesi, hiperlipidemi, bitki ekstrak-larının içeriğinin saptanmasına yönelik çalışmalar yapılmaktadır.

Prof. Dr. Refiye Yanardağ 0212 4737037 - [email protected]


HPLC, Spektrofotometre, Spektrofluorometre, Elek-

troforez cihazı, Jel görüntüleme cihazı, Soğutmalı

santrifüj, -80°C buzdolabı, Liyofilizatör, Eliza cihazı.


Marmara Üniversitesi, Yıldız Teknik Üniversitesi,

Giresun Üniversitesi, İnönü Üniversitesi, İstanbul

Aydın Üniversitesi.

MÜHENDİSLİK FAKÜLTESİ BİYOKİMYA ARAŞTIRMA LABORATUVARI

93


Doğalgazdan katalitik hidrojen üre-timi, oksidatif propan dehidroje-nayonu, metan çiftleşmesi gibi

katalitik reaksiyonların incelenmesi, ka-talizör geliştirilmesi, polimer elektrolit yakıt hücreleri, katı oksit yakıt hücrele-ri gibi yakıt hücresi teknolojileri yanı sıra membran sentezleri, değişik katalizör hazırlama teknolojileri üzerine çalışma-lar yapılmaktadır.


Gaz kromatografisi, Mikro reaktör-kütle spektro-

metresi kombine sistemi, Elektrokimyasal impedans

spektroskopisi (30 MHz - 1 mHz), Taramalı elektron

mikroskobu (SEM), UV spektrofotometresi, Katı

oksit yakıt hücreleri ve polimer elektrolit yakıt hücre-

leri (PEMFC) için test istasyonları, Termogravimet-

rik analiz-diferansiyel termal analiz simultane ölçüm

cihazı (maksimum sıcaklık 1200oC), Temas açısı öl-

çüm cihazı, Ultrases sağlayıcı, Sınırlı yüksek sıcaklık

fırınları (maksimum sıcaklıklar 1750°C, 1300°C,

1000°C) ve kurutma fırınları, BET Yüzey Alan ciha-

zı, Ultrases Cihazı (40 kHz).

Prof. Dr. M. Ali Gürkaynak

0212 4737070- [email protected]


Metandan sentez gazı üretimi, polimer elektrolit

membran tasarımı ve katı oksit yakıt hücreleri için

anot ve elektrolit geliştirilmesi üzerine devam eden

ve tamamlanan DPT ve TÜBİTAK projeleri bulun-

maktadır. Ayrıca bu çalışma konularında Gebze Yük-

sek Teknolojiler Enstitüsü, Yıldız Teknik Üniversitesi

ve Marmara Üniversitesi ile ortak çalışmalar yürütül-

mektedir. Tufts Üniversitesi (ABD), Utrecht Üniver-

sitesi (Hollanda), Köln Üniversitesi (Almanya) ve

Siegen Üniversitesi (Almanya) ile işbirlikleri devam

etmektedir.

MÜHENDİSLİK FAKÜLTESİ PROSES ve REAKTÖR TASARIMI ARAŞTIRMA LABORATUVARI

94


Radyokronolojik analizler için ka-yaç örneklerinin mineral ayırma ve zenginleştirme gibi işlemlerden

geçirilmesi, yaş tayinine konu olan zir-kon, ksenotim, amfibol, lavsonit, granat, monazit, mika vb. minerallere ayrılması ve analizlere hazır hale getirilmesine yö-nelik çalışmalar yürütülmektedir.

Yard. Doç. Dr. Namık Aysal



Manyetik ayırıcı, Ağır sıvılar ve mineral yüzdürme-

çöktürme sistemleri.


Çukurova Üniversitesi, Fırat Üniversitesi, İstanbul

Teknik Üniversitesi, Bulgar Bilimler Akademisi (Bul-

garistan) ile işbirlikleri bulunmaktadır ve TÜBİTAK

projeleri yürütülmektedir.

MÜHENDİSLİK FAKÜLTESİ JEOKRONOLOJİK ÖRNEK HAZIRLAMA ve MİNERAL AYIRMA LABORATUVARI

95


Bitki, torf, toprak ve su örneklerin-de pH, elektriksel iletkenlik, karbon, azot ve diğer element analizleri ile

toprakta tekstür, kalsiyum karbonat, su tutma kapasitesi gibi analizler yapılmak-ta ve orman ekosistemlerinin tanınma-sına yönelik çalışmalar yürütülmektedir. Ayrıca orman ekosistemlerinin izlenme-si, ekosistemlerde besin maddesi dön-güleri, dağ ekosistemleri, orman toprak-larının haritalanması, bitki beslenmesi, maden sahalarının rehabilitasyonu, top-rak kirliliği, fitoremediasyon, hava kir-liliğinin ormanlar üzerindeki etkilerinin belirlenmesi ile ilgili araştırmalar da ya-pılmaktadır.


C/N elementel analiz cihazı, ICP-OES, mikrodalga

örnek parçalayıcı, UV spektrometre, Akış enjeksiyon

cihazı, Azot/protein cihazı, Santrifüj cihazı, Soğut-

malı inkübatör, Stereo mikroskop, pH ve EC-metre.


Kore Üniversitesi (Kore), Debrecen Üniversitesi (Ma-

caristan) ve İstanbul Teknik Üniversitesi, Dokuz Ey-

lül Üniversitesi, Süleyman Demirel Üniversitesi gibi

çok sayıda üniversite ile ortak araştırmalar gerçekleş-

tirilmektedir. Orman ve Su İşleri Bakanlığı’na bağlı

Ormancılık Araştırma Enstitüleri ile ortak çalışmalar

yürütülmektedir. TÜBİTAK projeleriyle iklim deği-

şikliğine bağlı olarak orman ekosistemlerinde toprak

ve bitkisel kütlede depolanan karbon miktarlarının

araştırılmasına yönelik çalışmalar yapılmaktadır.

Yard. Doç. Dr. Serdar Akburak


ORMAN FAKÜLTESİ TOPRAK İLMİ ve EKOLOJİ LABORATUVARI

96


Türkiye’nin orman endüstrisi ala-nındaki (ahşap, ahşap kompozit malzemeler, biyomalzemeler, ter-

moset/termoplastik tutkallar, mobilya) ilk Nanoteknoloji Laboratuvarı ve Termal Analiz Laboratuvarı olma özelliğini taşı-maktadır. Nanobilim ve nanoteknoloji-nin ahşap endüstrisindeki uygulamaları üzerine ARGE ve inovasyon çalışmaları ve malzemelerin termal karakterizasyo-nu yapılmaktadır. Yeni nesil, çevre dos-tu ahşap kompozitlerin geliştirilmesi; formaldehit emisyonu azaltılmış kom-pozitlerin geliştirilmesi; mukavemeti ve termal stabilitesi yükseltilmiş kompozit-lerin geliştirilmesi; biyomalzemelerin, bi-yokompozitlerin ve nanokompozitlerin geliştirilmesi ve karakterizasyonu ile ilgi-li bilimsel ve endüstriyel çalışmalar de-vam etmektedir.


Termogravimetrik Analiz/Diferansiyel Termal Ana-

liz (TGA/DTA) Cihazı, Dinamik Mekanik Termal

Analiz/Termomekanik Analiz (DMTA/TMA) Ciha-

zı, Vakum fırını, Ultrasonik homojenizatör, Viskozi-

metre.


Maine Üniversitesi (ABD), Louisiana Devlet Üniver-

sitesi (ABD), Tennessee Üniversitesi (ABD), Bangor

Üniversitesi (İngiltere) ve Beijing Ormancılık Üni-

versitesi (Çin Halk Cumhuriyeti) ile işbirlikleri bu-

lunmakta olup, ortak araştırma ve geliştirme çalışma-

ları yürümektedir. Ayrıca Nanoteknoloji ve kompozit

malzemeler ile ilgili Avrupa Birliği COST aksiyonla-

rında üyelikler bulunmaktadır. Sabancı Üniversitesi,

İstanbul Teknik Üniversitesi, Bursa Teknik Üniversi-

tesi gibi pek çok üniversite ve sivil toplum kuruluşları

ile ortak çalışma ve işbirlikleri bulunmaktadır.

Prof. Dr. Nusret As0212 3382400 - [email protected]

ORMAN FAKÜLTESİ NANOTEKNOLOJİ LABORATUVARI ve TERMAL ANALİZ LABORATUVARI

97


Ağaç malzemede yanma esnasın-da ortaya çıkan kütle kaybı mik-tarını ve ısı yayılma hızının ölçül-

mesi, yanma testleri, ağaç malzemede termal analizlerin yapılması, odun ve odun esaslı ürünlerin ve odun dışı tüm yapı malzemelerinin yangına karşı per-formanslarının incelenmesine yönelik çalışmalar sürdürülmektedir.


Kütle kaybı kalorimetresi, Tek alev kaynağı ile tutu-

şabilirlik analiz cihazı, Fourier Transform Infrared

spektrometre (FT-IR).


Ormancılık Servisi Orman Ürünleri Laboratuvarı

(ABD) ve Yıldız Teknik Üniversitesi ile orman ürün-

leri endüstrisinde henüz yer edinmemiş çeşitli bor

ürünleri ve yanmayı geciktirici katkı maddesi olarak

bor ürünlerinin sentezi konuları üzerinde ortak araş-

tırma projeleri yürütülmektedir.

Araş. Gör. Evren Terzi 0212 3382400 - [email protected]

Prof. Dr. S. Nami Kartal0212 3382400 - [email protected]

ORMAN FAKÜLTESİ PROF. DR. A. YILMAZ BOZKURT AĞAÇ MALZEME YANMA TEST ve ANALİZ LABORATUVARI

98


Türkiye’de ilk kurulan ve halen yıl-lık halka araştırmaları konusun-da tek olma özelliğini koruyan bir

laboratuvarıdır. Bu anlamda ormancı-lık, iklim bilimleri, coğrafya, arkeoloji, sa-nat tarihi, mimarlık vb. disiplinlere veri üretmektedir. Laboratuvarda birbirinden ayrı düşünülmeyecek “ağaç yıllık halka-sı” ve “odun anatomisi” araştırmaları bir-likte yürütülmektedir. Anadolu’nun iklim tarihi ortaya konmakta, doğal ağaç tür-lerimize ait yılık halka veri setleri oluştu-rulmaktadır. Ayrıca tarihi yapılar ve arke-olojik alanlardan elde edilen ahşapların teşhisleri yapılmakta ve yıllık halka ana-lizlerine dayanarak kullandıkları dönem, bina yapım ve/veya onarım tarihleri be-lirlenmektedir. Çığ, heyelan vb. olayların sıklığı ve sınırlarının belirlenmesine yö-nelik dendrojeomorfolojik araştırmalar yürütülmektedir. ISTO Herbaryumu’nun bir parçası olarak çalışan bu laboratu-var, ekolojik odun anatomisi araştırma-larının yanında, odunsu bitkilerin tak-sonomik revizyon çalışmalarında odun


Lineer tablalı ve bilgisayar destekli Yıllık Halka Öl-

çüm Sistemleri, Mikroskoplar, Mikrotomlar, Farklı

boylarda artım burguları ve temizleme setleri.


Arizona Üniversitesi (ABD), Columbia Üniversitesi

(ABD), Purdue Üniversitesi (ABD) ile dendrokro-

noloji, dendroklimatoloji, dendroarkeoloji, dend-

roekoloji ve dendrojeomorfoloji konularında ortak

araştırmalar yürütülmektedir. Ayrıca yurtiçinde İs-

tanbul Teknik Üniversitesi, Ege Üniversitesi, Bartın

Üniversitesi gibi çeşitli üniversiteler ve Ormancılık

Araştırma Enstitüleri ile işbirlikleri bulunmaktadır.

Doç. Dr. Nesibe Köse0212 3382400 - [email protected]

anatomisi ayağının gerçekleştirildiği yer-dir ve güncel ve petrifiye odunlara ait önemli bir koleksiyon bulunmaktadır.

ORMAN FAKÜLTESİ YILLIK HALKA ARAŞTIRMALARI ve ODUN ANATOMİSİ LABORATUVARI

99


Ticareti yapılan hammadde, yarı mamul ve son üründe yerli ve eg-zotik ağaç türü tespiti, restoras-

yon/konservasyon çalışmalarında ve arkeolojik ahşap objelerde ağaç türünün tespiti, hammadde odunun kullanım ye-rinde istenilen kalite özelliklerinin ana-tomik yapıya bağlı olarak belirlenmesi, Orman Ürünleri Endüstrisinde anato-mik yapıya bağlı olarak oluşan malzeme kaynaklı problemlerin tespiti ve çözüm önerilerinin geliştirilmesi, ağaç malze-mede oluşan kalite kayıplarının anato-mik yapının incelenerek belirlenmesi, oduna uygulanan endüstriyel işlemlerin başarı derecesinin, anatomik yapıda ne-den oldukları değişikliklere bağlı olarak değerlendirilmesine yönelik çalışmalar sürdürülmektedir. Ayrıca eğitim, bilimsel araştırma, odun teşhisi ve endüstriyel hizmet amaçlı Uluslararası Ksilaryumlar (INDEX XYLARIUM) arasına girmiş ilk ve tek koleksiyon olan Prof. Dr. Adnan BER-KEL Ksilaryumu (ISTUFw Ksilaryumu) da yer almaktadır.


Stereo mikroskop, Polarize ve fluoresan donanımlı

dijital görüntüleme sistemli ışık mikroskopu, Kızaklı

mikrotom.


T.C. Kültür ve Turizm Bakanlığı İstanbul Resto-

rasyon ve Konservasyon Merkez Laboratuvar Mü-

dürlüğü, Ulusal Ahşap Birliği, İstanbul Büyükşehir

Belediyesi Koruma Uygulama ve Denetim Müdür-

lüğü, Kültürel Özellikler Ulusal Araştırma Enstitüsü

(Japonya), Doğal Kaynaklar ve Uygulamalı Yaşam

Bilimleri Üniversitesi (Avusturya) ile işbirlikleri bu-

lunmaktadır. Marmaray Projesi kazılarından çıkarı-

lan arkeolojik ahşap malzemelerde anatomik ve mik-

robiyolojik özellikler, ısıl işlemin ahşabın anatomik

yapısı üzerine etkisi, TÜBİTAK projesi kapsamında;

Ege Bölgesi arkeolojik ahşap buluntularında ağaç

türü teşhisi üzerine projeler gerçekleştirilmiştir.

Araş. Gör. F. Diğdem Tuncer0212 3382400 - [email protected]

Doç. Dr. Ayşe Dilek Doğu0212 3382400 - [email protected]

ORMAN FAKÜLTESİ PROF. DR. A. YILMAZ BOZKURT ODUN ANATOMİSİ LABORATUVARI

100


Odun ve odun dışı lignoselüloz esaslı maddelerin kimyasal yapı-larının aydınlatılması, bu madde-

lerin kimyasal dönüşümleri sonucunda üretilen yeni ürünlerin yapı ve özellikleri-nin belirlenmesi ve kullanım alanlarının saptanması ile ilgili çalışmalar yürütül-mekte ve endüstriyel hizmetler kapsa-mında selülozun üretiminden kâğıdın son kullanım alanına kadar geçen sü-reçler ile ilgili analizler ve kalite testleri, odun ve odun esaslı malzemelerin yapı-sal analizleri yapılmaktadır.


HPLC, UV-Vis spektrometre, GC-MS, Fourier

Transform Infrared spektrometre (FT-IR), Viskozi-

metre, Reometre, TMA, üniversal test cihazı (kağıt

ürünleri için), Spektrofotometre (Elrepho), Kuşe

kaplama cihazı, Değişik standartlara uygun elde kağıt

yapma cihazları.


Yıldız Teknik Üniversitesi, Kastamonu Üniversitesi,

Gebze Yüksek Teknoloji Enstitüsü, Dokuz Eylül Üni-

versitesi, İzmit Kavakçılık Araştırma Enstitüsü, Wes-

tern Michigan Üniversitesi (ABD), North Caroline

Üniversitesi (ABD) ile işbirlikleri bulunmaktadır.

Özel sektör kuruluşları ile ortak çalışmalar yapılmak-

ta ve TÜBİTAK projeleri yürütülmektedir.

Prof. Dr. Celil Atik0212 3382400 - [email protected]

ORMAN FAKÜLTESİ ORMAN ÜRÜNLERİ KİMYASI ve TEKNOLOJİSİ ARAŞTIRMA LABORATUVARI ve SELÜLOZ, KÂĞIT KARTON ANALİZ LABORATUVARI

101


Su ve toprak analizlerinin yapıldı-ğı iki ayrı alt birime ayrılan labora-tuvarlar; kamu ve özel sektörden

gelen talep ve ihtiyaçlar doğrultusun-da sunulan yeni nesil detaylı analizler ve uluslararası metotlar ile havza, hidroloji, hidroekoloji, toprak vb. araştırma konu-larında hizmet sağlamaktadırlar.


Kjeldahl yarı otomatik azot tayin cihazı, Santrifüj

cihazı, Türbidimetre, İyonmetre, Spektrofotometre,

pH ve EC-metre, Çözünmüş oksijen tayin seti, Su

bulanıklığı ölçer, Toprak nemi cihazı, Permeabilite

cihazı, Penetrometre, Lizimetre.


Massachusetts Üniversitesi (ABD), Amerika Birleşik

Devletleri Tarım Departmanı Güney Araştırma İstas-

yonu (ABD), Çankırı Karatekin Üniversitesi, Süley-

man Demirel Üniversitesi ve Ormancılık Araştırma

Enstitüleri ile işbirliği devam etmekte olup, havza

yönetimi, iklim değişikliği kapsamında yarı kurak

alanlar, mera ıslahı gibi konularda araştırmalar yapıl-

maktadır.

Prof. Dr. Kamil Şengönül0212 3382400 - [email protected]

ORMAN FAKÜLTESİ HAVZA YÖNETİMİ LABORATUVARI

102


Su ürünlerinin, avlanmasından tü-ketimine kadar olan tüm aşama-larında kalite kontrolü, hijyen ve

sanitasyonu, su ürünleri toksikolojisi, gıda güvenliği ve ürün geliştirme konu-ları üzerinde çalışılmaktadır. Laboratu-varda yağ asidi, aminoasit, trimetilamin azot ve tiobarbitürik asit indeksi belirle-me analizleri, 4-hexylresorcinol ve biyo-jen amin miktarlarının belirlenmesi, su ürünlerinde renk ölçümü ve doku ölçü-mü analizleri yapılmaktadır.


Gaz kromatografisi, Yüksek basınçlı likit kromatog-

rafi, UV-Vis spektrometre, Ultrasonic su banyosu,

Tekstür ölçüm cihazı, Renk ölçüm cihazı ve Soğut-

malı santrifüj bulunmaktadır.


TÜBİTAK ve diğer dış kaynaklı projeler kapsamında

su ürünlerinin korunması, raf ömrünün uzatılması

üzerine çeşitli projeler gerçekleştirilmiş olup, akua-

kültürde gıda güvenliği açısından izleme sistemleri-

nin oluşturulmasına yönelik bir Avrupa Birliği proje-

si yürütülmektedir.

Prof. Dr. Özkan Özden0212 4555700 - [email protected]

SU ÜRÜNLERİ FAKÜLTESİ ENSTRÜMANTAL ANALİZ LABORATUVARI

103


Siyonabakteriler tarafından üreti-len siyonotoksinlerin su canlıla-rında birikimi, siyanotoksin üreten

genlerin tespiti, siyanotoksin üretimine çevresel baskıların etkisi, ağır metallerin besin zincirinde birikimi, taşınımı, orga-nizma grupları için letal doz çalışmala-rı, canlılarda ve suda pestisit birikimi ile PAH analizleri yapılmaktadır.


HPLC, ICP-MS, GS-MS, Gerçek zamanlı PCR, Gö-

rüntüleme cihazı, Liyofilizer, Siyanobakteri kültür

odası, TOC ölçer, Laminar akışlı kabin, Ultrasonika-

tör, Spektrofotometre, Filtrasyon sistemi, Araştırma

mikroskopları.


Siyonotoksinlerin iç su ve denizlerimizde incelenmesi

ve etkilerinin belirlenmesine yönelik üç Avrupa Birli-

ği projesi yürütülmektedir.

Doç. Dr. Reyhan Akçaalan Albay


SU ÜRÜNLERİ FAKÜLTESİ EKOTOKSİKOLOJİ ve SİYANOTOKSİN LABORATUVARI

104


İstanbul Üniversitesi birimleri, diğer kamu ve özel kuruluşların talepleri doğrultusunda ana-lizler yapmak üzere kurulmuştur. Organik bile-

şiklerin (sentetik organik bileşikler, doğal orga-nik bileşikler, organometalik bileşikler, organik metal kompleksleri, polimerler vb.) yapı aydınla-tılması, eser element tayini, organik bileşiklerin tanımlanması, katı veya sıvı organik bileşiklerin element yüzdelerinin yakma yoluyla belirlenme-si, anorganik kompleksler ve organik bileşiklerin kalitatif ve kantitatif olarak incelenmesi, katı, toz ve sıvı numunelerin içerdiği elemanların nitel ve nicel analizleri, tek kristal – toz kristal yapıların incelenmesi, küçük moleküllerin molekül yapı-larının çözümü ve molekül modellemesi, kalita-tif mineral analizine yönelik hizmetler verilmek-tedir.


• Nükleer Manyetik Rezonans Spektrometresi (Va-rian UNITY INOVA 500MHz, 1D ve 2D NMR, APT, DEPT)

• Elemental Analiz Cihazı (Thermo Finnigan Flash EA 1112 Serisi)

• İndüktiv Kapling Plazma-Kütle Spektrometresi (Thermo Elemental X Serisi 2)

• FT-IR Spektrometresi (Perkin Elmer, 450 - 4000 cm-1, ATR üniteli)

Doç. Dr. Hasret Demircan Yardibi


• X-Işını Toz Kristal Difraksiyonu (Rigaku D, yük-sek sıcaklık fırın üniteli, Cu kaynaklı, grafit monok-romatörlü)

• X-Işınları Tek Kristal Difraktometresi (Rigaku R-Axis Rapid-S)

• X-Işınları Fluoresans Spektrometresi

• Likit Kromatografisi – Kütle Spektrometresi

• Gaz Kromatografisi (Thermo Finnigan Trace GC Ultra) - Kütle Spektrometresi (Thermo Finnigan Trace DSQ)

• Kütle Spektrometresi (Thermo Finnigan Trace LCQ)

• Ultraviyole Visible Spektrometre (190 - 600 nm)

• Atomik Absorpsiyon Spektrofotometresi (Analyst 200 flame, Analyst 600 Grafit fırın ve Perkin Elmer Hidrür sistemleri).


Max Planck Enstitüsü (Almanya) ve Rikagu/MSC Woodland Texas Laboratuvarı (ABD) ile X-ışını dif-raksiyonu konusunda güncel metot çalışmaları yapıl-maktadır. Varian Uygulama Laboratuvarı (Almanya) ile güncel NMR ve Elemental Analiz metot çalışma-ları yapılmaktadır.

TEKNOLOJİ TRANSFER UYGULAMA ve ARAŞTIRMA MERKEZİ MERKEZ ARAŞTIRMA LABORATUVARI (MERLAB)

105

SOSYAL BİLİMLERARAŞTIRMA LABORATUVARLARI


Dijital video çekimlerinin kurgu, composite ve renk düzenleme iş-lerinin yapıldığı, kabul görmüş bü-

tün profesyonel yazılımlar yer almak-tadır. 6 adet odadan oluşmaktadır. Bu odaların dördü offline kurgu odası, biri ses kayıt odası, biri de final miksin yapıl-dığı ve “Da Vinci Resolve” odasıdır. Sağ-lıklı ve güvenilir bir çekim sonrası iş akışı için dünya standartlarında bir alt yapıya sahiptir. Teknik açıdan güven verici, hız-lı ve kullanıcı bağlamında da yaratıcıdır.


Tangent Device - DA VINCI Kontrol Ara Yüzü,

LYNX HILO – Analog Dijital, Dijital Analog Ses

Çevirici, BON 24 inch Grade 1 Monitör, MAC OS

Workstation tabanlı kurgu sistemi, FCP X, AVID,

ADOBE, DA VINCI, WINDOWS Workstation

tabanlı kurgu sistemi EDIUS ve ADOBE, Ana De-

polama Ünitesi (50 TB), SAS Depolama Ünitesi (16

TB) saniyede 1 GB üzerinde veri hızı, Gerçek Za-

manlı H.264 Çevirici, FOCAL CMS 65 Referans

Monitörleri, ART TPS II – Mikrofon Preamp.

Yard. Doç. Dr. İlkay Nişancı0212 4400000 - [email protected]


Kamilet isimli kısa metraj belgesel filmin kurgusu,

renk düzenlemesi ve ses miksi. 2014 Trento Dağ

Filmleri Festivali (İtalya), Antigoni isimli orta metraj

belgesel filmin kurgusu, renk düzenlemesi ve ses mik-

si 2013 Antalya Film Festivali Finalisti, Umut Kaya,

isimli ünlü Rock müzisyeninin yeni albümünün

vokal kayıtları ve miksi, Hemşirelik Fakültesi Bece-

ri Videoları, Florance Nightingale Vakfı tarafından

desteklenen 200’e yakın beceri videosunun kurgu-

su, YEKÜV tarafından desteklenen ve üniversitemiz

BAP ile birlikte yürütülen “Demokrasi” projesinin

kurgusu.

İLETİŞİM FAKÜLTESİ PRODÜKSİYON ve POST-PRODÜKSİYON LABORATUVARI

108


Farklı bölge ve dönemlere ait, ça-nak çömlek, taş, kemik ve kil bulun-tular tipolojik, teknolojik ve işlevsel

açıdan incelenmekte ve bu buluntuların analizleri yapılmaktadır. Türkiye’nin en kapsamlı arkeolojik malzeme arşivine sahiptir. Referans koleksiyonu niteliğin-deki arkeolojik arşivde 1645 höyük, ören ve buluntu yerinden gelen malzeme, yüze yakın arkeolojik yerleşime ait sis-tematik – tabakalı- örnekleme, Yakındo-ğu ve Balkanlar’daki tarihöncesi kültür-lere ait malzeme örnekleri, Batı Avrupa Paleolitik Dönem yontmataş buluntuları, Türkiye, Ege ve Akdeniz’deki tüm obsid-yen kaynaklarından gelen örnekler gibi malzeme grupları bulunmaktadır.


Çok büyütmeli metalürjik mikroskoplar, Stereo mik-roskoplar.


Connecticut Üniversitesi (ABD), Arizona Üniversite-si (ABD), Cornell Üniversitesi (ABD), Paris Üniver-sitesi (Fransa), Ulusal Doğal Tarih Müzesi (Fransa), Ulusal Fransa Bilimsel Araştırma Merkezi (Fransa), Lyon Üniversitesi(Fransa), Eberhard Karls Tübingen Üniversitesi (Almanya), Ludwig-Maximilian Üni-versitesi (Almanya), Münih Arkeoloji Müzesi (Al-manya), Alman Arkeoloji Enstitüsü, Bergbau Alman Maden Müzesi (Almanya), Karlsruhe Üniversitesi (Almanya), Köln Üniversitesi (Almanya), Avusturya Bilim Akademisi (Avusturya), Viyana Üniversitesi (Avusturya), Yeni Bulgar Üniversitesi (Bulgaristan), Sozopol Sualtı Arkeolojisi Merkezi (Bulgaristan), Çek Cumhuriyeti Bilim Akademisi (Çek Cumhuri-yeti), Prag Üniversitesi (Çek Cumhuriyeti), Doğa Tarihi Müzesi (İngiltere), Groningen Üniversitesi (Hollanda), Atina Klasik Çalışmalar Amerikan Oku-lu (Yunanistan), İstanbul Teknik Üniversitesi, Hacet-tepe Üniversitesi, Koç Üniversitesi, Eskişehir Anado-lu Üniversitesi.

Yard. Doç. Dr. Eylem Özdoğan


EDEBİYAT FAKÜLTESİ PREHİSTORYA LABORATUVARI

109


Harç ve sıva analizleri, gemi model-leri, konservasyon ve restorasyon işlerinde gerekli olabilecek çeşit-

li kimyasal deneyler yapılmaktadır. Su-altından çıkarılan eserlerinin koruma – onarım çalışmaları yapılmaktadır.


Isıtma sistemli paslanmaz çelik PEG emdirme tan-

kı, Çeker ocaklar, Etüv, Mikroskoplar, Gemi model

aletleri:


Bizans ve Bizans Dönemi Sonrası Anıtları Araştırma

Merkezi (Yunanistan), T.C. Cumhurbaşkanlığı ile or-

tak çalışmalar sürdürülmektedir.

Araş. Gör. Taner Güler0212 4555700 - 16017 [email protected]

EDEBİYAT FAKÜLTESİ GEMİ KONSERVASYON ve REKONSTRÜKSİYON LABORATUVARI

110


Batık gemilerin konservasyon, res-torasyon, 3 boyutlu çizim, fotoğ-raf ve fotomozaik çalışmaları ya-

pılmaktadır.


FaroArm 3D digitizer cihazı, Paraflaş sistemli fo-toğraf düzeneği, Saf su cihazı, Suya doymuş ahşap konservasyonunda kullanılan büyük ölçekli fırın ve dondurarak kurutma cihazı.


Bizans ve Bizans Dönemi Sonrası Anıtları Araştırma Merkezi (Yunanistan), T.C. Cumhurbaşkanlığı, Ros-kilde Müzesi (Danimarka) ile ortak çalışmalar sürdü-rülmektedir.

Araş. Gör. Namık Kılıç

0212 [email protected]

EDEBİYAT FAKÜLTESİ YENİKAPI BATIKLARI ARAŞTIRMA MERKEZİ LABORATUVARI

111

Türkçe Katalog PDF

Documents

Transcript of Türkçe Katalog PDF