Taxonomia Microbiana

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TAXONOMIA BACTERIANA TAXONOMIA BACTERIANA Departamento de Ciencias Microbiológicas Departamento de Ciencias Microbiológicas Facultad de Veterinaria. UdelaR. Facultad de Veterinaria. UdelaR. Curso 2014 Curso 2014 Foto Dr. Milton Caáneo 2005

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  • TAXONOMIA BACTERIANATAXONOMIA BACTERIANA

    Departamento de Ciencias MicrobiolgicasDepartamento de Ciencias MicrobiolgicasFacultad de Veterinaria. UdelaR.Facultad de Veterinaria. UdelaR.

    Curso 2014Curso 2014

    Foto Dr. Milton Cattneo 2005

  • Taxonoma:

    Del griego taxos, estructuracin u orden; nomos, ley Es la ciencia que estudia la clasificacin biolgica

    Taxonoma

  • Breve Historia de la Taxonoma Hacia el 350 A.C., al filsofo griego Aristteles dividi a los

    organismos en dos grupos: animales y vegetales, introdujo el trmino especie. Teora de la Generacin espontnea; Refutada por Louis Pasteur en 1868.

    Siglo XVIII, Carlos Linneo. Asign a cada organismo a una categora grande: al reino vegetal o al reino animal.

    subdividi cada categora en categoras progresivamente ms pequeas-Introduce el concepto de REINO-Actualmente se usa una clasificacin modificada : se incluye DOMINIO

  • Breve Historia de la Taxonoma Ernst Haeckel en 1894, nuevo reino, el de los Protistas, en el cual

    incluy, algas, hongos, protozoos y bacterias. Protistas superiores e inferiores.

    R. Murray en 1968: reino, Procariotas y eucariotas (Microscopio)

    Whittaker en 1969, cinco reinos: Animalia, Plantae, Fungi, Protista (eucariotas unicelulares) y el reino Monera (bacterias)

    Woese en 1977 agrupa los seres vivos en seis Reinos: Eubacterias, Arqueobacterias, Protista, Fungi, Vegetal y Animal.

    En 1990 propone tres Dominios: Bacterias, Arqueas y Eucariotas.

    El Dominio es de categora taxonmica superior al Reino

  • rbol filogentico universal

    Qca. Etchebehere, Ctedra de Microbiologa, Facultad de Qumica.

    Tres Dominios, diferencias rRNA y lpidos de membrana

  • Por qu es importante la taxonoma?

    Permite organizar el conocimiento. Inferencias e hiptesis sobre nuevos

    organismos. Comunicar en forma eficiente. Caracterizar aislamientos (ej. Patgenos). Estudios evolutivos Microbiologa clnica: tratamiento

  • Taxonoma Taxonoma

    - comprende tres partes independientes pero relacionadas: Clasificacin:Clasificacin: estructuracin de organismos en grupos o

    taxones en base a similitudes o parentesco evolutivo.

    Nomenclatura: Nomenclatura: asignacin de nombres a los taxones.

    Identificacin:Identificacin: determina a que taxones pertenece un organismo que se aisl (lado prctico).

  • Clasificacin

    C. Fenotpica: a partir de propiedades observables fenotpicas compartidas. Ej. Gram negativas, enorme grupo de cientos de m.o. que pueden no estar relacionados pero comparten esta caracterstica.

    C. Filogentica: Agrupa a los m.o. de acuerdo a su relacin gentica.

  • Enfoque gentico o molecular de la taxonoma Determinar el grado de relacin gentica de

    diferentes organismos:

    Composicin de bases del ADN o del ARN r

    Hibridizacin y homologa de cidos nuclecos

    Homologa entre protenas

    Recombinacin gentica

  • TAXONOMA CLSICA MORFOLGICASForma celularTamao de las clulasMorfologa de las coloniasCaractersticas ultraestructuralesTincinCilios y flagelosMecanismo de movilidadForma y localizacin de endoesporasInclusiones celularescolor

    FISIOLOGICAS Y METABLICAS

    Fuentes de C y NComponentes de la pared celularFuentes de energaProductos de fermentacinTipo nutricionalTemperatura de crecimientoLuminiscenciaMecanismo de conversin de energaMovilidadTolerancia osmticaRelaciones con el oxgenopH ptimo de crecimientoPigmentos fotosintticosNecesidad y tolerancia a la salMetabolitos secundariosSensibilidad a antibiticos

    ECOLGICAS

    Ciclo vitalRelaciones simbiticasPatogenicidadPreferencia de hbitatNecesidad de temperatura; pH;Necesidad de oxgenoNecesidad de concentracin osmtica

    GENTICAS

    Posibilidad de recombinacin porConjugacin oTransformacin

    Plsmidos

    Taxonoma en plena ebullicin debido al auge de la biologa molecular.

  • ClasificacinClasificacin

    Procariotes EukariotesProcariotes Eukariotes

  • CLASIFICACINBACTERIA : incluyen bacterias patgenas ARCHAEA : bacterias presentes en el ambiente, diferencia en lpidos y aspectos genticos BACTERIA+ ARCHAEA= PROCARIOTES

    PROCARIOTES son unidades no compartimentadas, no presentan : membranas nucleares, mitocondrias, SRE, aparato de Golgi, ni lisosomas, con respecto a los EUCARIOTES.

    Ribosoma procariotas (70S) (eucariotas 80S)La 30S tiene un ARN de 16S (importante para estudios filogenticos) y la 50S contiene ARN 23S y 5S.

  • Estudio ARNr 16S Estudio ARNr 16S Moraxella bovisMoraxella bovis

    Ladd

    er

    EV45

    0A

    EV45

    0B

    SJ02

    SJ03

    A

    NIN

    1

    NIN

    9

    Ladd

    er

    2439

    -2

    SES

    BM

    3B

    2358

    LC27

    47

    Fs34

    7

    Fs33

    0

    Ladd

    er

    Epp6

    3

    Fs32

    7

    Fs32

    8

    Fs34

    3

    3346

    -II

    2419

    TT3

    EV36

    6

    Ladd

    er

  • Dentro de los PROCARIOTES, estudiamos cuatro categoras. A saber:

    1. Bacterias Gram -, con pared celular. Se caracterizan por poseer una pared celular compleja con peptidoglicanos y cido murmico en su composicin. Morfolgicamente : encontramos bacterias redondeadas o cocceas, bacilos rectos o curvos, helicoidales o filamentosos. Se reproducen por fisin binaria o biparticin y algunos por brotes o gemacin. (Escherichia, Salmonella)

    2. Bacterias Gram +, con pared celular. Presentan una pared celular netamente diferente a los anteriores, desde el punto de vista de su composicin y organizacin. La morfologa y la reproduccin es similar al grupo anterior. Algunas presentan esporas. (Bacillus y Clostridium)

  • 3. Bacterias que carecen de pared celular. En este grupo, encontramos bsicamente a los Mycoplasmas que carecen de pared celular y no sintetizan peptidoglicanos. Son clulas pleomrficas. Son inmviles y las colonias bacterianas que desarrollan sobre medios de cultivo apropiados, semejan un huevo frito.

    4. Archaea. Son m.o. terrestres y acuticos con determinadas caractersticas similares a los 3 grupos anteriores, que no los tenemos en cuenta por no ser m.o. patgenos.

  • TaxonesDominioPhylumClaseOrdenFamiliaGneroEspecie

    Sub-especie

    importancia en estudiosclnicos y ecolgicos

    Cepa: Cepa: Poblacin de organismos quePoblacin de organismos quedescienden de un nico organismo descienden de un nico organismo o de un aislamiento en cultivo puro.o de un aislamiento en cultivo puro.

    Los m.o. se sitan en un pequeo grupo homogneo que pertenece a grupos mas amplios siguiendo una estructura jerrquica sin superposiciones.

    Rangos taxonmicos

  • Gnero

    Grupo bien definido de una o ms especies que esta claramente separado de otros gneros.

  • Definicin de especie procariota

    1. Coleccin de cepas que comparten numerosas propiedades estables y que difieren significativamente de otras grupos de cepas.

    2. Especie (genomoespecie) es una coleccin de cepas que tienen una composicin de G + C similares y una similitud de un 70% o superior en base a experimentos de hibridacin de ADN

    Actualmente el criterio es POLIFSICO (combinacin de caractersticas fenotpicas, genmicas y filogenticas)

  • Secuenciacin 16S Secuenciacin 16S Moraxella Moraxella spp.spp.

    Aislamiento Homologa Max. Ident

    Epp63M. bovoculi 99 %

    M. ovis 98 %

    M. bovis 97 %

  • Categoras de clasificacin a nivel desubespecie(tipificacin):

    Biovariedad: variantes de cepas procariotas caracterizadas por diferencias bioqumicas y fisiolgicas .

    Fagovariedad: tipificacin por fagos.

    Patovariedad: patogenicidad.

    Morfovariedad: diferencias morfolgicas.

    Genomovariedad: grupos con ADN similares.

    Serovariedades: diferencias antignicas diferentes.

  • ESTRUCTURACIN JERRQUICA EN TAXONOMA

    Rango Nombre taxonmico

    DominioPhylum o ReinoClaseOrdenFamiliaGneroEspecie

    BacteriaProteobacteria

    -ProteobacteriaEnterobacterialesEnterobacteriaceaeShigellaS. dysenteriae

  • Nomenclatura: Sistema binomialBotnico Sueco Carl von Linn o LinneoNombre latinizado

    Gnero: Primera letra en mayscula. Ej: EscherichiaEspecie: minscula. Ej: coli

    Escrito en bastardilla o cursiva (subrayado si es manuscrito)Ej: Escherichia coli o Escherichia coliAbreviado: E. coli

    Castellanizacin: Estafilococo dorado

    El epiteto de especie es estable , el gnero puede cambiar Gnero Streptococcus

    Ej: Streptococcus faecalis Enterococcus faecalis

    EnterococcusLactococcus

  • A recordar:

    Estructura taxonmica Procariotes Genero, especie, cepa y subespecie Nomenclatura

  • Bergeys: Manual de sistemtica Bergeys: Manual de sistemtica bacteriolgicabacteriolgica

    Primeas ediciones : clasificacin fenotpica , en funcin de forma, tincin de Gram, relacin con el oxigeno y motilidad

    Edicin Actual: clasificacin filogentica: 2 dominios y 25 phyla.

  • Bibliografa:

    MICROBIOLOGIA. Prescott, Ed. Interamericana, 5ta edicin, capitulo 19, (pg.456-484).

  • Gracias!!!!

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