Somatische Hypermutation (SH) Genkonversion (GC) und Klassenwechsel (class-switch) -Rekombination...
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Somatische Hypermutation (SH)
Genkonversion (GC) und
Klassenwechsel (class-switch)-Rekombination (CSR)
ReviewsKapitel 1- Genetik der Rekombination, Hypermutation und des Klassenwechsel
F.N. Papavasiliou and D.G. Schatz (2002). Somatic hypermutation ofImmunoglobulin genes: Merging mechansims for genetic diversity.Cell 109, S35-S44.
S. Longerich et al. (2006). AID in somatic hypermutation and class switch recombination. Curr. Opinion in Immun.18, 164-174.
V.H. Odegard and D.G. Schatz (2006). Targeting of somatic hypermutation.Nature Rev. Immun. 6, 573-583.
gemeinsamer Basismechanismus für SHM, GC, CSR
Activation-induced cytidine deaminase(only lymphocyte-specific factor required for SHM, GC, CSR)
Homologie zu RNA editierendes Enzym C to U deamination in vitropreferentially expressed in secondary lymphoid organsDefizienz: keine CSR und SHMIn Chicken/Rabbits keine Genkonversion
direkte Aktivität auf dC in DNA U-G Mismatch Läsionen: C-T and G-A Transitionenbase excision Reparatur - jedes Nukleotidmismatch Reparatur mit Polymerase mit hoher FehlerquoteTemplate-vermittelte Reparatur mit Sister-Chromatid oder V-PseudogenLäsion in switch site: Reparatur mit anderer switch site
Affinitätsreifung
Somatische Mutationen in Ig V GenenMutations clustered in CDRs(complemetarity determining region)
Kd: dissociation constant
Modell für somatische Hypermutation:
Promoter bestimmt RegionEnhancer lizensiert Locus
„Mutatorsome“
A. Ig Enhancer bindet Mutator-Faktor (rot)B. Enhancer-Promoter Interaktion C. Mutator-Faktor bei TICD. Transkription ist wichtig
Mutator-Faktor fährt mit TC mitE. Assymetrischer DSBF. 5´-end Resektion, 3´-overhang lagert sich an intaktes Sister Chromatid Reparatur durch homologe RekombinationG. DNA Synthese führt zu Punktmutationen Polymerase mit hoher Irrtumsrate vermutlich DNA Pol.-iota
M
M BER: base excision repairMMR: mismatch repair
AID: activation-induced cytidine deaminase
Target ist DNAdC - deamination U - G mismatch
No repair: C - T, G - A transitionExcision repair with error prone Polymerase: U excised
Replaced by any other (transition and transversion)
UNG: Uracil N-Glycosylase
removes the U residue, leaving abasic site
B Zellselektion in „germinal centers“der LymphknotenundDifferenzierung zu Ak-sezernierenden Plasmazellen
Klassenwechsel der schweren Ketten
AID und „germline“ Transkription führen zu DoppelstrangbrüchenIn „switch“ Regionen
Modell:AID Funktion imersten Schritt:Initiierung des Doppelstrangbruches
SHM CSR
Hauptwege der DSB Reparatur:
homologe Rekombinationmutations-assoziierte Brüche normalerweise durch homologe Rekombination repariert
oder
nicht-homologes end-joining: NHEJist Mechanismus bei VDJ Rekombinations-Joining
CSR und SHM - ähnliche DNA-Spaltung- verschiedene Reparatur: NHEJ bzw. homol. Rek.
Wichtig für Lymphomagenese
Die meisten Lymphome entstehen in den Germinal Centersaus B Zellen
50 % zeigen translocation break points innerhalb der Targetsequenzen für CSR, die anderen dürften mit Fehlern bei SHM zusammenhängen
SHM kann auch auf Protoonkogene in Tumorzellen übergreifen,In gleichen Regionen: Translokationen und MutationenAuch ohne Translokation
Fehler im Targeting der SHM und CSR Mechanismenoder in der Reparatur der DNA Brüche ?
M