Ppt cara penamaan enzim kel 3
-
Upload
welly-andrei -
Category
Education
-
view
1.310 -
download
6
Transcript of Ppt cara penamaan enzim kel 3
Biasanya diberi akhiran –ase pada nama substrat atau reaksi yang dikatalisis
Contoh:Alkohol dehidrogenase: oksidasi alkoholUrease: hidrolisis ureaDNA polimerase: polimerisasi nukleotidaProtease: hidrolisis peptidaMetiltransferase: transfer gugus metil
Prinsip Penamaan
Enzim dikelompokkan dan diberi nama menurut reaksi yang dikatalisisnya.
Hanya merujuk pada perubahan reaksi kimia yang disebabkan oleh enzim.
Mekanisme reaksi tidak dimasukkan dan juga gugus prostetik atau kofaktor tidak masuk dalam nama.
Enzim mempunyai nama sistematis dan nama trivial.Nama trivial: lebih pendek, mudah dan sering
digunakan
Tata Nama• Menurut Enzyme Commission (1961), enzim dibagi
atas enam kelas tergantung pada reaksi yang dikatalisis.
• E.C.a.b.c.d– a. Kelas enzim– b. subkelas enzim– c. Sub-sub kelas enzim– d.Sub-sub-sub kelas enzim
• Pengelompokan tidak berdasarkan urutan asam amino, struktur tiga dimensi dan juga tidak berdasarkan mekanisme reaksi
KELAS ENZIM BERDASARKAN REAKSI KIMIA Kelas Tipe katalisis reaksi kimia contoh
Oksidoreduktase ReduksiOksidasi, melepas/mendapat O2 dan Hidrogen
Cytochrome oksidase, laktate dehydrogenase
Transferase Transfer grup, seperti grup amino, grup acetyl, grup phosphat
Acetate kinase, alanin deaminase
Hydrolase Hidrolisis (penambahan air) Lipase, sukrase
Lyase pemindahan grup atom tanpa hidrolisis Oksalat decarboxylase, isocitrat lyase
Isomerase Penataan atom menjadi molekul Glikose-phosphate isomerase
ligase Menyatukan dua molekul (mengambil energi, dari turunan ATP)
DNA ligase
b. Sub Kelas Enzim
• Digit kedua: Hidrogen atau donor elektron 1. Alkohol 2. Aldehid atau keton 3. CH-CH 4. Amin primer 5. Amin sekunder 6. NADH atau NADPHc. Sub-Sub Kelas enzim
• Digit ketiga: Hidrogen atau akseptor elektron 1. NAD+ atau NADP+
2. Fe 3+
3. O2
99. Akseptor lain
OksidoreduktaseNama sistematik ditulis menurut: donor:akseptor oksidoreduktase
EC. 1.1.1 Nama Sistematik: Alkohol:NAD+ oksidoreduktaseNama Trivial: Alkohol dehidrogenase
(Nama trivial: Oksidase, transfer H ke O2; dan dehidrogenase, untuk transfer H ke akseptor selain O2)
TransferaseMengkatalisis reaksi pemindahan berbagai gugus
fungsi seperti amino, karboksil, karbonil, metil, asil, glikosil, atau fosforil
A – X + B A + B – X Nama trivial yang umum seperti aminotransferase
(transaminase), transkarboksilase
HidrolaseMengkatalisis pemutusan ikatan secara hidrolitik
pada C-C, C-N, C-O dan ikatan lainnya Nama-nama trivial seperti esterase, peptidase,
amilase, fosfatase, urease, pepsin, tripsin, kimotripsin
Liase• Mengkatalisis pemutusan ikatan C-C, C-O, C-N, C-S. • Nama sistematik ditulis menurut substrat gugus liase.• Nama trivial, misalnya dekarboksilase, aldolase,
dehidratase (eliminasi CO2, aldehid, dan air).
Isomerase
• Mengkatalisis penataan struktur atau geometri dalam molekul.
• Nama-nama trivial seperti epimerase, resemase, dan mutase
LigaseMengkatalisis pengikatan (penggabungan) dua molekul,
disertai dengan hidrolisis senyawa yang mempunyai ΔG besar untuk hidrolisis
Energi yang diperlukan untuk pembentukan ikatan tersebut sering berasal dari hidrolisis ATP
Nama trivial : tiokinase dan karboksilase