No Slide Title - University of Oulu...Biopankki Palautuva tutkimusdata Näytteen- hallintajärjes...
Transcript of No Slide Title - University of Oulu...Biopankki Palautuva tutkimusdata Näytteen- hallintajärjes...
Pohjois-Pohjanmaan sairaanhoitopiiri
Pohjois-Suomen biopankki
13.8.2013
Pia Nyberg, FT FinnTrials Tools- Vaativat biologiset näytteet, Tekes-hanke
PPSHP
Pohjois-Pohjanmaan sairaanhoitopiiri
Biopankkilaki 1.9.2013
• http://www.finlex.fi/fi/laki/alkup/2012/20120688 • Diagnostisten näytteiden kohdalla kudoslain
poikkeussäännöstä voi soveltaa 5 vuoden siirtymäajan, jos lääketieteelliseen tutkimukseen tarvittavia näytteitä ei ole saatavissa biopankista, mutta pääsääntöisesti siirto biopankkiin
• Tutkimusnäytteet: jos ei ole tarvetta näytteiden ja tietojen käyttöön primääritutkimuksen jälkeen, yksittäisen tutkimuksen osalta ei mikään muutu
• näytteiden laajemman jatkokäytön turvaaminen edellyttää biopankkisuostumusta (ja siis olemassa olevaa biopankkia)
• Valviran valvonta ja ohjaus
Pohjois-Pohjanmaan sairaanhoitopiiri
Biopankit apuna ’from bench to bedside’- prosessissa
Pohjois-Pohjanmaan sairaanhoitopiiri
Mitä sairaalabiopankki tarkoittaa?
Carpen & Kosma Duodecim 2012
Pohjois-Pohjanmaan sairaanhoitopiiri
Suomalaisten biopankkien vahvuuksia
• Homogeeninen väestöpohja (erityisesti Pohjois-Suomessa!)
• Kansalaisten myönteinen suhtautuminen tutkimukseen
• Korkealaatuinen julkinen terveydenhuolto
• Kansalliset rekisterit
Pohjois-Pohjanmaan sairaanhoitopiiri
Hyödyt terveydenhuollolle • Oikea hoito oikealle potilaalle • Uusien tutkimustulosten tehokkaampi siirto terveydenhoitoon
Pohjois-Pohjanmaan sairaanhoitopiiri
• Diagnostisten näytteiden tutkimuksellinen hyöty vähäinen ilman niihin liitettävää terveystietoa – Uudet tekniikat mahdollistavat
FFPE näytteiden monipuolisemman käytön, esim morfologian ja profiloinnin yhdistäminen
• Näytteiden ja niihin liittyvän kliinisen datan sekä kertyvän tutkimusdatan saatavuus
• Näytteiden laadukkuus (ammattimainen näytteiden ja tietojen säilytys)
• Vältetään päällekkäiset näytekeräykset
Hyödyt tutkijoille
Meriaux et al. J Proteomics 2010
Pohjois-Pohjanmaan sairaanhoitopiiri
Yritykset ja biopankki
• Kliiniset lääketutkimukset ovat vähentyneet Suomessa: trendi halutaan pysäyttää
• Public-private-partnership
Pohjois-Pohjanmaan sairaanhoitopiiri
Sairaalabiopankkien periaate
Biopankki
Palautuva tutkimusdata
Näytteen- hallintajärjes
telmä
Poimittu ja yhdistetty
tieto
Koodi- rekisteri
Suostumuk- sen hallinta
Tieto näytteestä
Potilastiedot tietovarastosta TAI suoraan eri järjestelmistä (qpati, Oberon, Esko jne)
Yhdistäminen rekisteri- tietoihin
Yhdistettyä potilasdataa voitaisiin käyttää sekä biopankkitutkimukseen että sairaan omiin tilastointeihin
Tutkija
Pohjois-Pohjanmaan sairaanhoitopiiri
Perustettavat sairaalabiopankit Auria (Turku)
Helsinki Tampere Kuopio Jyväskylä Oulu
Omistus TY 6/12 VSSHP 4/12 SaSHP 1/12 VSHP 1/12
HUS (valtuusto- päätös perustamisesta)
PSHP 40% TaY 30% Muut ERVA-SHP:t 30%
ISY KYS
KSSHP 70% JY 30%
PPSHP (tai PPSHP+ OY yhdessä?)
Organi- saatio
TYKS-SAPA liikelaitoksen patologian palvelualue
Patologian arkistosta pankki tai erillinen pankki arkiston yhteyteen
Oikeushlö PSHP: tiedekes-kukseen erillinen taseyksikkö
PSSHP:n alle?
KSSHP:n alle (patologia)
MRC:n alle
Hlökunta Professori, johtaja, laatuvastaa-va, 2 IT-asiantuntijaa, tutkimus- assistentti
Koordinaattori (aloittaa kesällä), prosessi-, IT ja tieteellinen työryhmä
Johtaja, koordinaattori, IT-henkilö, 1-2 tutkimushoitajaa
Projekti- päällikkö, ohjaus- ja projekti- ryhmät
Johtaja, Projekti- päällikkö, sihteeri, työryhmä
Projektipäällikkö, projektiryh-mä, ohjausryh-mä, 5/13-> 20% IT-hlö
=Auria pankki: toteutuma =muut biopankit: suunnitelma ja/tai väliaikainen ratkaisu
Pohjois-Pohjanmaan sairaanhoitopiiri
• Nostaa kliinisen tutkimuksen profiilia ja tasoa – Mahdollisuus hyödyntää ainutlaatuisia pohjoissuomalaisia
näytemateriaaleja • Lisätä ihmisperäisten näytteiden keräystä ja käyttöä perus-
ja soveltavassa tutkimuksessa – Patologian näytearkistot – Prospektiivinen keräys vaativille biologisille näytteille
Pohjois-Suomen biopankin tavoitteet
Pohjois-Pohjanmaan sairaanhoitopiiri
P-S biopankin infra ja organisaatio
• OY:n strategiarahaa biopankki-infraan 150 000 € – Yhteistyö: biopankki, Pohjois-Suomen
syntymäkohortit, DIPP-diabetestutkimus – Näytesäilytys ja tiedonhallinta – yhteistyössä OY:n tietojenkäsittelyopin
laitoksen Center for Advanced System Studies CASS:n kanssa
• Oulun biopankki kytkeytyy 2013 aloittaneeseen Medical Research Centeriin (MRC)
• ERVA-alueen shp:t voivat halutessaan liittyä mukaan
Pohjois-Pohjanmaan sairaanhoitopiiri
Patologian kudosarkisto biopankin perusmateriaaliksi: pilotti 2013 Turku ja Oulu
–myöhemmin muut shp:t • OYS:n patologian kudosarkistossa diagnostiikkaa varten
otettuja näytteitä vuodesta 1973 • Patologian kudosarkistossa n. 2,2 milj kudosblokkia noin
500.000 potilaasta • Vuosittain noin 20 000 biopsianäytettä (totaalimäärä 40
000) • Sähköinen järjestelmä käytössä 1999 → • Myöhemmin mukaan voidaan ottaa myös:
• Tuorekudosnäytteitä • verinäytteitä (n. 0,5 milj/v)
Pohjois-Pohjanmaan sairaanhoitopiiri OYS:n patologian arkiston pilotti: SNOMED koodien erot eri shp:eissa -> Harmonisointi: laadunparannus sekä biopankkidatalle että
myös diagnostiikalle
Pohjois-Pohjanmaan sairaanhoitopiiri
Mitä tietoa biopankkiaineistosta: Pahanlaatuiset kasvaimet elintyypeittäin
Olli Carpen, TYKS & TY
Pohjois-Pohjanmaan sairaanhoitopiiri
Mitä tietoa biopankkiaineistosta: Rintasyöpänäytteet: histologiset alatyypit ja esimerkkejä
ennusteellisista/hoitoa ohjaavista tekijöistä
Olli Carpen TYKS & TY
Pohjois-Pohjanmaan sairaanhoitopiiri
Mitä tietoa biopankkiaineistosta: Rintasyöpänäytteet: erilaistumisasteen korrelaatio kasvaimen kokoon
Olli Carpen TYKS & TY
Pohjois-Pohjanmaan sairaanhoitopiiri
Kiitokset
Aino-Liisa Oukka Juha Korpelainen Minna Mäkiniemi Paavo Pääkkö Petri Lehenkari Pekka Mattila Pasi Parkkila Eeva-Riitta Savolainen
• Turku: Tarja Laitinen, Heli Salminen-Mankonen, Olli Carpen, Panu Jaakkola, Päivi Rautava, Perttu Terho, Samu Kurki
• Kuopio: Veli-Matti Kosma, Arto Mannermaa, Hanna Tuhkanen
• Hki: Tuomas Mirtti • Tampere: Kimmo Savinainen, Jarkko
Penttinen • Jkylä: Marjukka Friman, Markku Kallajoki • FIMM: Juha Muilu, Kimmo Pitkänen • THL: Anu Jalanko, Sirpa Soini, Helena
Kääriäinen • Et al….
Pirjo Koistinen Merja Möttönen Roberto Blanco Kari Majamaa Johanna Uusimaa Juha Auvinen Et al…..