NHIỄM VIRUS HÔ HẤP...2020/06/04  · Tác nhân nhiễm trùng hô hấp giữa Bệnh Virus Vi...

25
NHIỄM VIRUS HÔ HẤP CHẨN ĐOÁN VI SINH Ý NGHĨA LÂM SÀNG Phạm Hùng Vân

Transcript of NHIỄM VIRUS HÔ HẤP...2020/06/04  · Tác nhân nhiễm trùng hô hấp giữa Bệnh Virus Vi...

NHIỄM VIRUS HÔ HẤPCHẨN ĐOÁN VI SINHÝ NGHĨA LÂM SÀNG

Phạm Hùng Vân

Viêm mũi

Viêm amidan

Viêm nắp thanh quản

Viêm thanh khí quản

Bail

ey S

co

tt’ s D

iag

nosti

c M

icro

bio

log

y 1

3th

ed

itio

n 2

01

4.

pp

.91

0-1

8

Tác nhân nhiễm trùng hô hấp trên

Bệnh Tác nhân thường gặp

virus Vi khuẩn, vi nấm

Viêm mũi Rhinovirus, Adenovirus, Coronavirus, Parainfluenza virus, Influenza virus, RSV, Coxsackie A virus

Hiếm gặp

Viêm họngViêm amydale

Rhinovirus, Adenovirus, Influenza virus, Parainfluenza virus, HSV, Coxsackie A hay B virus, EBV

GAS, C. diptheriae, N. gonorrhoeae

Áp xe quanh amydale hay sau amydale

Không có GAS (đa số), VK kỵ khí họng(Fusobacterium), S. aureus, HIN (trẻ em)

Sherris MEDICAL MICROBIOLOGR, 6th Edition, 2014, pp. 914-918

Tác nhân nhiễm trùng hô hấp giữa

Bệnh Virus Vi khuẩn

Viêm nắp thanh quản Hiếm gặp H. influenzae, S. pneumoniae, C. diptheriae, N. meningitidis

Viêm và co thắt thanh quản

Coronavirus, Parainfluenza virus, Influenza virus, Adenovirus, đôi khi RSV, Metapneumovirus, Rhinovirus, Coronavirus, Echovirus

Hiếm gặp

% virus

90

10

Viêm khí quản Giống tác nhân viêm co thắt thanh quản

H. influenzae, S. aureus 90

Viêm phế quản và viêm tiểu phế quản

Parainfluenza virus, Influenza virus, RSV, Adenovirus, Measle virus

B. pertussis, H. influenzae, M. pneumoniae, C. pneuomoniae

80

Sherris MEDICAL MICROBIOLOGR, 6th Edition, 2014, pp. 914-918

Viêm phổiAbcess phổi

Mủ màng phổi

Sherris MEDICAL MICROBIOLOGR, 6th Edition, 2014, pp. 914-918

Hội chứng Virus Vi khuẩn thường gặp

Vi nấm Khác

Influenza, parainfluenza,adenovirus, respiratorySyncytial virus (TE, già), metapneumovirus

S. pneumoniae, S. aureus, H. influenzae, VK đường ruột, Legionella, VK kỵ khí(VP hít), P. aeruginosab

VP cấp Candida albicans,Aspergillus sp., Pneumocystisb

M. pneumoniae,C. trachomatis (TE),C. pneumoniae

VP mạn Hiếm M. tuberculosis,Mycobacteria khác (NTM),Nocardia

C. immitisa, B. dermatitidisa, H. capsulatuma, C. neoformans

Paragonimuswestermania

Abcess phổi Không gặp VK kỵ khí, Actinomyces,Nocardia, S. aureus,Enterobacteriaceae, P. aeruginosa

Aspergillus sp. E. histolytica

Mủ màng phổi

Không gặp VK kỵ khí, S. aureus,S. pneumoniae, Enterobacteriaceae, P. aeruginosa

Hiếm

aSuy giảm MD, suy kiệtbTuỳ địa dư

Tác nhân nhiễm trùng hô hấp dưới

NHIỄM VIRUS HÔ HẤP

§ Tác nhân rất thường gặp trong nhiễm trùng hô hấp trên (viêm mũi, viêm họng, viêm amydale)

§ Tác nhân không thể bỏ qua trong nhiễm trùng cấp t ính hô hấp dưới (viêm phổi cấp)

§ Là tác nhân khởi đầu cho các tác nhân vi khuẩn, nhất là các trường hợp viêm phổi

Rất dễ lây lan qua đường hô hấp

Cũng rất dễ lây lan qua tiếp xúc

NHIỄM TRÙNG DO VI KHUẨN

SỬ DỤNG KHÁNG SINH

NHIỄM TRÙNG DO VI KHUẨN + VIRUS

SỬ DỤNG KHÁNG SINH

NHIỄM TRÙNG DO VIRUS

KHÔNG KHÁNG SINH

PHÁT HIỆN TÁC NHÂN VIRUS SỬ DỤNG KHÁNG SINH

XÉT NGHIỆM PHÁT HIỆN TÁC NHÂN VIRUSKỸ THUẬT VI SINH KINH ĐIỂN

§ Nuôi cấy virus

Chỉ thực hiện tại các phòng TN nghiên cứu có BSIII, không hữu dụng vì do kết quả chậm

§ Huyết thanh phát hiện KT

Nếu KT tìm được là IgG thì phải làm XN huyết thanh kép (10-14 ngày)

Nếu KT tìm được là IgM thì chỉ là XN một lần, tuy nhiên độ nhạy không cao

§ Hóa MD phát hiện KN

Thường là nhuộm KT HQ, độ nhạy và độ đặc hiệu thấp, giá mắc

Tìm con đường mới!!

Virus (23 tác nhân)

Influenzavirus A

H1N1

H5N1

H7N9

Influenzavirus B

Influenzavirus C

Parainfluenzavirus 1

Parainfluenzavirus 2

Parainfluenzavirus 3

Rhinovirus

Adenovirus

Respiratory syncytial virus

Human metapneumovisus

Measle virus

Human coronavirus

Cytomegalovirus

Epstein barr virus

Bocavirus

Varicella/zoster virus

Rubella virus

SARS coronavirus-1

MERS coronavirus

QUỆT MŨI HẦU(QUỆT MŨI SAU)

ĐÀM

BỆNH PHẨMPCR PHÁT HIỆN TÁC NHÂN GÂY NHIỄM TRÙNG HÔ HẤP

Phát hiện

TÁC NHÂN GÂY VIÊM PHỔISO SÁNH HAP/CAP

1

2

GNR Trực khuẩn Gram [-] dễ mọcGPC Cầu khuẩn Gram [+] dễ mọcCA Vi khuẩn cộng đồngPNE S. pneumoniaeHI H. influenzaeKĐH Vi khuẩn không điển hìnhMY MycoplasmaMP M. pneumoniaeCP C. pneumoniaeBP B. pertussisLpne L. pneumophilaCa CandidaAsp AspergillusPjr P. jiroveciiMTB M. tuberculosis

1Nghiên cứu EACRI 20182Nghiên cứu HAP người lớn 2019

SO SÁNH HAP VỚI CAPTỶ LỆ PHÁT HIỆN TÁC NHÂN KHÔNG CẤY ĐƯỢC

MY MycoplasmaMP M. pneumoniaeCP C. pneumoniaeBP B. pertussisLpne L. pneumophilaFluA Influenza A virusFluB Influenza B virusPara1 Parainfluenza virus 1 Para2 Parainfluenza virus 2Para3 Parainfluenza virus 3Rhino RhinovirusRSV Respiratory syncytial virushMPV Human metapneumovirusAdeno AdenovirusCMV Cytomegalovirus

1

2

1Nghiên cứu EACRI 20182Nghiên cứu HAP người lớn 2019

SO SÁNH HAP VỚI CAPTỶ LỆ PHÁT HIỆN TÁC NHÂN CẤY ĐƯỢC

AB A. baumanniiPSA P. aeruginosaPS PseudomonasKLP K. pneumoniaeEco E. coliEcl E. cloacaeEag E.agglomeransPm P. mirabilisMor M. morganiiPrv ProvidenciaEm E. meningosepticaSmal S. maltophiliaEfi E. faeciumEfa E. faecalisSAU S. aureusSE S. epidermidis

PNE S. pneumoniaeHI H. influenzaeHIB H. influenzae bMC M. catarrhalisGAS Group A streptococciGBS Group B streptococciCa CandidaAsp AspergillusPjv P. jiroveciiMTB M. tuberculosis

1Nghiên cứu EACRI 20182Nghiên cứu HAP người lớn 2019

1

2

CAP-outpatient (232)1 HAP (158)2

CA 45.87 2.92

GNR/GPC 3.21 13.14

Virus 2.75 5.11

Fungi 10.22

CA+Virus 17.89 1.46

CA+Fungi 1.83

CA+Virus+Fungi 0.92

CA+MTB

CA+GNR/GPC 16.97

CA+GNR/GPC+Fungi 1.83

CA+GNR/GPC+MTB

CA+GNR/GPC+Virus 5.5 0.73

CA+GNR/GPC+Virus+Fungi 0.46 2.19

GNR/GPC+Fungi 1.38 19.71

GNR/GPC+Virus 0.46 13.87

GNR/GPC+Virus+Fungi 0.46 23.36

Virus+Fungi 0.46 7.299

SO SÁNH HAP VỚI CAPTỶ LỆ ĐA TÁC NHÂN

25.7% 41.6%t=4.475 P<0.001

1Nghiên cứu EACRI 20182Nghiên cứu HAP người lớn 2019

VAI TRÒ VIRUS TRONG HAP

CMV+GNR/GPC 37 78.72

CMV+Fungi 29 61.7

Total CMV 47 100

Not CMV+GNR/GPC 18 66.67

Not CMV+Fungi 15 55.56

Total Not CMV 27 100

Virus+GNR/GPC 55 74.32

Virus+Fungi 44 59.46Total virus 74 100

No virus+GNR/GPC 45 53.57

No virus+Fungi 41 48.81Total No virus 84 100

CMV+GNR/GPC 37 78.72

CMV+Fungi 29 61.7

Total CMV 47 100

No virus+GNR/GPC 45 53.57

No virus+Fungi 41 48.81

Total No virus 84 100

NotCMV+GNR/GPC 18 66.67

NotCMV+Fungi 15 55.56

Total NotCMV 27 100

No virus+GNR/GPC 45 53.57

No virus+Fungi 41 48.81

Total No virus 84 100

CMV+GNR/GPC vs not CMV+GNR/GPC t=1.143CMV+fungi vs not CMV+Fungi t=0.518

CMV+GNR/GPC vs no virus+GNR/GPC t=2.854CMV+fungi vs no virus+Fungi t=1.419

Virus+GNR/GPC vs no virus+GNR/GPC t=2.701Virus+fungi vs no virus+Fungi t=1.340

NotCMV+GNR/GPC vs no virus+GNR/GPC t=1.195notCMV+fungi vs no virus+Fungi t=0.610

VIÊM PHỔI NẶNG Ở TRẺ EMKẾT QUẢ PHÁT HIỆN TÁC NHÂN TRÊN 240 TRƯỜNG HỢP

GNR Trực khuẩn Gram [-] dễ mọcGPC Cầu khuẩn Gram [+] dễ mọcCA VKCĐ và VKKĐHVKCĐ Vi khuẩn cộng đồng (S. pneumoniae/

H. influenzae/M. catarrhalis)VKKĐH Vi khuẩn không điển hìnhAB-PSA A. baumannii và/hay P. aeruginosaEBAC Enterobacteriaceae

Nghiên cứu viêm phổi nặng ở trẻ em 2020

VIÊM PHỔI NẶNG Ở TRẺ EMKẾT QUẢ PHÁT HIỆN TÁC NHÂN VIRUS TRÊN 240 TRƯỜNG HỢP

Adeno AdenovirusEBV Epstein-Barr virusCMV CytomegalovirusRhino RhinovirusBoca BocavirusHCoV Human coronavirusInfA Influenza A virusInfB Influenza B virusInfC Influenza C virusPara1 Parainfluenza 1 virusPara2 Parainfluenza 2 virusPara3 Parainfluenza 3 virushMPV Human metapneumovirusRSV Respiratory syncytial virus

Nghiên cứu viêm phổi nặng ở trẻ em 2020

VIÊM PHỔI NẶNG Ở TRẺ EMKẾT QUẢ PHÁT HIỆN TÁC NHÂN VI KHUẨN TRÊN 240 TRƯỜNG HỢP

KLP K. pneumoniaeEco E. coliEaero E. aerogenesMorm M. morganiiProv ProvidenciaBcepa B. cepaciaAB A. baumanniiPSA P. aeruginosaSteno S. maltophiliaEli E. meningoseptica

MRSA S. aureus kháng MeMRSE S. epidermidis kháng MeMRSCN Staphylococci coagulase [-]

kháng MeEfaeca E. faecalisEfaeci E. faeciumGNR Gram [-] rodGPC Gram [+] cocci

Nghiên cứu viêm phổi nặng ở trẻ em 2020

Vai trò virus trong viêm phổi nặng trẻ emSO SÁNH VỚI VIÊM PHỔI NẶNG NGƯỜI LỚN

Người lớn Trẻ em t P

Virus 5.11 31.75 5.935 P<0.001Virus+CA 1.46 14.69 4.116 P<0.001Virus+Fungi 7.3 4.27 1.217 P>0.05Virus+Fungi+CA 1.9 Virus+GNR/GPC 13.87 16.59 0.684 P>0.05Virus+GNR/GPC+CA 0.73 3.32 1.574 P>0.05Virus+GNR/GPC+Fungi 23.36 10.43 3.255 P<0.001Virus+GNR/GPC+CA+Fungi 2.19 GNR/GPC+Fungi 19.71 1.42 5.938 P<0.001GNR/GPC+CA 1.9 GNR/GPC 13.14 8.06 1.54 P>0.05Fungi+CA 0.47 Fungi 10.22 1.42 3.72 P<0.001CA 2.92 3.79 0.435 P>0.05Tổng 100 100

Nghiên cứu viêm phổi nặng ở trẻ em 2020

KẾT LUẬN

§ Virus là tác nhân hàng đầu trong nhiễm trùng cấp hô hấp trên và là tác nhân phải để ý trong nhiễm trùng hô hấp dưới.

§ Trong các viêm phổi nặng ở trẻ em cũng như viêm phổi bệnh viện ở người lớn, virus là tác nhân rất quan trọng không thể bỏ qua

§ Khó có thể xác định được tác nhân virus gây nhiễm trùng hô hấp vì đa số không có triệu chứng đặc hiệu để nhận diện

§ Giải pháp sử dụng multiplex real-time PCR là giải pháp hữu hiệu và khả thi nhất nên được triển khai.