Modelo de Watson y Crick - UGR...Modelo de Watson y Crick (semiconservativo) 2 Replicación del...
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1 Modelo de Watson y Crick (semiconservativo)
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1
Modelo de Watson y Crick (semiconservativo)
2
Replicación del cromosoma de E. coli
Cairns, 1963
3
La replicación es bidireccional a partir de un origen
Replicación del cromosoma de E. coli
4
La polimerización ocurre en sentido 5’3’
La ADN polimerasa sólo puede añadir nucleótidos al extremo 3’ de la cadena en crecimiento
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Síntesis continua y discontinua
Fragmento
de Okazaki
6
Replicación
7 Lobry, 1999
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>gi|16127994|ref|NC_000913.1| Escherichia coli K12, complete genome
AGCTTTTCATTCTGACTGCAACGGGCAATATGTCTCTGTGTGGATTAAAAAAAGAGTGTCTGATAGCAGC
TTCTGAACTGGTTACCTGCCGTGAGTAAATTAAAATTTTATTGACTTAGGTCACTAAATACTTTAACCAA
TATAGGCATAGCGCACAGACAGATAAAAATTACAGAGTACACAACATCCATGAAACGCATTAGCACCACC
ATTACCACCACCATCACCATTACCACAGGTAACGGTGCGGGCTGACGCGTACAGGAAACACAGAAAAAAG
CCCGCACCTGACAGTGCGGGCTTTTTTTTTCGACCAAAGGTAACGAGGTAACAACCATGCGAGTGTTGAA
GTTCGGCGGTACATCAGTGGCAAATGCAGAACGTTTTCTGCGTGTTGCCGATATTCTGGAAAGCAATGCC
AGGCAGGGGCAGGTGGCCACCGTCCTCTCTGCCCCCGCCAAAATCACCAACCACCTGGTGGCGATGATTG
AAAAAACCATTAGCGGCCAGGATGCTTTACCCAATATCAGCGATGCCGAACGTATTTTTGCCGAACTTTT
C
A
G
T
foreach $base (@bases) { if ( $base eq 'A' ) { $x = $x - 1 } ; if ( $base eq 'C' ) { $y = $y + 1 } ; if ( $base eq 'G' ) { $y = $y - 1 } ; if ( $base eq 'T' ) { $x = $x + 1 } ; print “$x $y” }
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open IN, "Ecoli.fasta" or die "No hay genoma\n";
open OUT, ">coordenadas.txt";
while (<IN>) {
@linea = split //;
foreach (@linea) {
$x ++;
$y ++ if /G/;
$y -- if /C/;
print OUT "$x $y\n" if $x % 1000 == 0;
}
}
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-20000
-15000
-10000
-5000
0
5000
10000
15000
20000
25000
30000
0 1000000 2000000 3000000 4000000 5000000
G (+1), C (-1)
G > C C > G G > C
13
LE:
G > C
LA:
C > G
14 Freeman et al., 1998
( A + G ) – ( C + T )
( G + T ) – ( A + C )
cod W – cod C
LE, G > C
LA, C > G
