Pathway StudioTM

Pathway StudioTM는 PubMed 및 공공 데이터 소스에서 추출한 생물학적

관계의 시각적 상호작용 네트워크를 생성하여 연구에 대한 가설을 만들

수 있습니다.

Gene, protein, cellular processes, chemicals, diseases 사이의 publish

된 상호작용 정보들에 대해서 편리하게 접근이 가능하도록 구성되었

습니다.

Experimental data근본적인 생물학적 메커니즘을 찾기 위한 통계 분석, 그 이상을 수행할

수 있으며, 중요한 유전자와 이로 인해 영향을 받은 pathway를 확인할

수 있습니다. 또한 Regulator와 transcription factor를 찾아 연구자들의

experimental data를 기반으로 pathway를 그려주고, 이 결과물을 저장

및 공유할 수 있습니다.

Published literaturePublish 된 문헌정보들을 통해 연구자가 원하는 gene, protein, chemical

등등의 관계 정보들을 몇 번의 클릭만으로 찾을 수 있고, 새롭게 publish

된 요소들은 수시로 database에 업데이트됩니다.

ResNet Database familyResNet Mammalian database는 1,208개의 pathway, 3,099개의 cell

process, 3,456개의 functional class 등등의 많은 정보를 포함하고 있

습니다.(2016년 1월 기준)

Variant AnalysisPathway StudioTM에 Next Generation Sequecning (NGS)기반의 DNA

variation을 확인하고 필터할 수 있는 기능이 탑재되었습니다. 특정

mutation이 단백질 기능, 분자적 세포 상호작용과 질병 경과에 줄 수

있는 영향을 문헌정보의 결과와 비교할 수 있습니다.

MammalianPathway의 visualization을 책임집니다.

Copyrightⓒ2014. Insilicogen, Inc. l Pathway Studio® Mammalian 01

Key features

� Disease mechanisms� Cancer research� Receptors and signaling� Biomarkers� Toxicology� RNAi� Model organisms� And may others

DiseaseFx®

DiseaseFx®는 in silico상에서 biomarker의 발견과 임상 및 실험데이터의

pathway 분석을 지원하는 데이터베이스입니다. 또한 단백질 활동의

변화, 유전자 발현의 변화, 그리고 대사 산물의 농도 변화와 같은 분자

관찰과 인간 질병과 연결된 연구로부터 파생된 데이터베이스입니다.

Additional DiseaseFx® cartridgePathway StudioTM의 Mammalian database에 추가로 이용할 수 있는

cartridge로 database, MedScan Technology 등을 포함하고 있습니다.

ChemEffect®

ChemEffect®는 drug effects 연구를 위한 35,000개 이상의 compound,

chemical 정보 기반의 정보를 포함하고 있는 데이터베이스입니다. 연구자

들은 실험 데이터, reference 또는 proprietary pathway, 그리고 in silico

상에서 가설을 입증하기 위한 알고리즘을 사용할 수 있습니다.

Additional ChemEffect® cartridgePathway StudioTM의 Mammalian database에 추가로 이용할 수 있는

cartridge로 DiseaseFx®와 별도로 database, MedScan Technology 등

을 포함하고 있습니다.

Functional featuresChemEffect® 를 이용하여 아래와 같은 분석이 가능합니다.

� 유전자 발현, proteomics, metabolomics data의 분석 및 해석

� 시간에 따른 연구, 독성 기전 분석, siRNA 연구,

microRNA data의 분석

� Gene Set Enrichment Analysis(GSEA) 및 Sub-Network

Enrichment Analysis

� 다양한 시각화 및 network building 알고리즘

DiseaseFx® / ChemEffect®

Pathway의 visualization을 책임집니다.

Copyrightⓒ2014. Insilicogen, Inc. l Pathway Studio® DiseaseFx® / ChemEffect® 02

Key features Key features

� Changes in protein activity� Changes in gene expression� Changes in metabolite concentration� Gene mutations� Gene additions and deletions� Changes in epigenetic methylation

� Alternative indication� Efficacy information� Pharmacological landscape� Drug candidate

� Disease mechanism

� Potential drug development

소프트웨어 공급 서비스 문의

consulting@insilicogen.com생물정보 분석 서비스 문의

codes@insilicogen.com 031.278.0061