LE BASI - Unife · LE BASI DELL’ORGANIZZAZIONE ... La vita ha 3,5 avuto origine . Evoluzione in...
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LE BASI
DELL’ORGANIZZAZIONE
BIOLOGICA
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La Terra nei primi miliardi della sua esistenza era un posto violento con eruzioni
vulcaniche, lampi e piogge torrenziali. L’atmosfera conteneva poco o niente
ossigeno libero e consisteva principalmente di CO2 e di N2 oltre a piccole
quantità di gas quali H2, H2S (acido solfidrico), e CO.
EVOLUZIONE DELLA CELLULA
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HCHO formaldeide
HCOOH acido formico
HCN acido cianidrico
CH2COOH acido acetico
NH2CH2COOH glicina
CH2CHCOOH acido lattico
OH
NH2CHCOOH alanina
CH3
NH–CH2COOH sarcosina
CH3
NH2-C-NH2 urea
O
NH2CHCOOH acido aspartico
CH2
COOH
Presenti nelle cellule odierne
Esperimento di Stanley Miller (anni ’50)
Dimostra la formazione spontanea di molecole organiche:
amminoacidi, zuccheri, purine e pirimidine
COMPOSTI
PRODOTTI
COMPOSTI
PRODOTTI
EVOLUZIONE DELLA CELLULA
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Il passaggio successivo nell’evoluzione è stato la formazione di macromolecole.
Replicazione di una sequenza polinucleotidica di RNA (Negli anni ’80 si è scoperto che l’RNA è in grado di catalizzare alcune reazioni
chimiche, compresa la polimerizzazione di nucleotidi)
Si presume che la prima cellula abbia avuto origine quando l’RNA in grado di autoreplicazione è venuto ad essere circondato da una membrana composta da
fosfolipidi.
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LA CLASSIFICAZIONE DEGLI ORGANISMI
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La teoria dell’evoluzione
…attraverso secoli le specie accumulano delle differenze: ne risulta che nuove
specie si formano e le specie discendenti sono diverse da quelle ancestrali..
The origin of species (published in 1859)
Meccanismo di evoluzione è la selezione naturale. Gli organismi competono
per sopravvivere e così gli organismi che hanno un vantaggio in un determinato
ambiente sopravvivono si riproducono trasmettendo le loro caratteristiche alla prole.
Domanda: Assistiamo ancora oggi ad evoluzione?
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Se paragoniamo l’età
della terra ad un giorno,
l’uomo sarebbe
comparso alla
mezzanotte del giorno
stesso!
miliardi di
anni fa
presente 0
1
2
3
4
organismi
multicellulari
Primi eucarioti
Metabolismo
ossidativo
Fotosintesi
Prime cellule
Formazione Terra 4,6
5
3,8 3,5 La vita ha
avuto origine
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Evoluzione in atto
Trasferimento della resistenza agli
antibiotici tra batteri- trasformazione
o coniugazione
Mutazioni a carico di geni che
rendono il batterio resistente!
Cellule tumorali- la resistenza
al farmaco che insorge in quanto
cambia la composizione delle
cellule di un tumore in seguito
al trattamento
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Come si studiano le cellule e le macromolecole La microscopia
Cellula vegetale
Cellula animale
Batterio
Virus, ribosoma
Proteina globulare
Piccola molecola
Atomo
OC
CH
IO N
UD
O
MIC
RO
SC
OP
IO O
TT
ICO
MIC
RO
SC
OP
IO E
LE
TT
RO
NIC
O
Il potere di risoluzione
Le dimensioni delle cellule e dei loro componenti su scala logaritmica; si indicano le dimensioni degli oggetti che possono essere facilmente risolti ad occhio nudo, nel microscopio ottico 0.2 micrometri) e in quello elettronico (0.1 nanometri) . mm (micrometro) = 10-6 m nm (nanometro) = 10-9 m Å (ångström, non più in uso nel S.I.) = 10-10 m
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RELAZIONI DI PARENTELA TRA I BATTERI ODIERNI
ARCHEBATTERI
(procarioti)
EUBATTERI
(procarioti)
PROCARIOTA
ANCESTRALE
vivono in condizioni acide a
temperature elevate
(es.: solfobatteri)
vivono in condizioni saline
estreme (alofili estremi)
anaerobi che riducono la
CO2 a metano (metanogeni)
batteri gram negativi o positivi
batteri fotosintetici verdi
(anaerobi)
cianobatteri (alghe blu-verdi)
batteri fotosintetici porpora
batteri gram negativi
spirochete
PROCARIOTI
• Morfologia
• Comportamento colorazione di Gram
• Esigenze metaboliche (aerobici- anaerobici)
• Localizzazione cellulare o extracellulare
Cianobatteri : dalla fotolisi di molecole di H2O con produzione di O2 sintetizzano molecole organiche.
Fotosintesi: sostanze organiche – principalmente carboidrati – a partire dall'anidride carbonica atmosferica e
dall'acqua metabolica, in presenza di luce solare. Come sottoprodotto della reazione si producono sei molecole di
ossigeno, che la pianta libera nell'atmosfera attraverso gli stomi che si trovano nella foglia.
Batteri azoto fissatori : Fissazione dell’azoto: N2 + 8H+ + 6e ® 2NH4+
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LA CELLULA PROCARIOTICA
Cocchi:
Gli stafilococchi sono batteri aerobi ospiti abituali della cute, cioè della pelle, e delle mucose (soprattutto nel rinofaringe, cioè naso e gola);
in genere penetrano nell’organismo attraverso lesioni cutanee.
Gli Enterococcus faecalis trovano normalmente nell’intestino dell’uomo e di vari animali.
Bacilli: Clostridium tetani
Spirocheti- responsabili della sifilide e della malattia di Lyme
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LA CELLULA PROCARIOTICA
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LA CELLULA PROCARIOTICA !!!!La penicillina agisce solo sui Gram Positivi!!!
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Clonaggio di un gene
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Urolitina A
Protegge la muscolatura
i batteri buoni:il microbiota
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There is a growing evidence of a microbial gut-brain
axis in which bacteria can influence the brain, and vice
versa.
Researchers from Canada found that mice from a
particularly shy species became more active and
curious after receiving a gut microbial transplant from
less inhibited mice. We know that some strains of
intestinal bacteria produce compounds that have an
effect on the nervous system: neurotransmitters, for
example, or metabolites that alter the blood-brain
barrier (a barrier which filters the molecules passing
from the body to the brain circulation - ed. note). We
don’t yet know the precise mechanisms, but it’s quite
clear that the gut microbes can influence mood and the
behavioural patterns.
Read more:
http://www.youris.com/Health/Immunology/Do-
Microbes-Control-Our-Mood.kl#ixzz4O4gZT6jb
Do microbes control our mood?
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La cellula eucariotica
Ribosomi
Nucleo Nucleolo Mitocondri
Citoscheletro
Apparato
del
Golgi
Reticolo
endoplasmatico
rugoso
Reticolo
endoplasmatico
liscio
Centrioli
Perossisomi
Membrana
citoplasmatica
Lisosomi
Membrana
nucleare Pori
nucleari
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LA CELLULA EUCARIOTICA
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Il corpo umano è composto
da più di 200 tipi diversi di
cellule che sono componenti
di 5 tipi principali di tessuti:
tessuto epiteliale, tessuto
connettivo, sangue, tessuto
nervoso e muscolo.
Sviluppo di
organismi
multicellulari
EPITELIALE
squamoso colonnare cuboide
MUSCOLO (scheletrico)
CONNETTIVO cartilagine
tendini
SANGUE
Matrice extracellulare
Citoplasma
Osso
Legamenti
Tessuto adiposo
Nervoso
serie bianca
serie rossa piastrine
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TABELLA: Le caratteristiche delle cellule procariotiche ed eucariotiche
PROCARIOTI EUCARIOTI
Organismi batteri e cianobatteri protisti, funghi, piante, animali
Diametro cellulare da 1 a 10 μm da 5 a 100 μm
Metabolismo anaerobio o aerobio aerobio
Organelli nessuno nucleo, mitocondri, cloroplasti,
reticolo endoplasmatico, ecc.
DNA DNA circolare nel citoplasma molecole molto lunghe di DNA lineare
contenenti molte regioni non codificanti;
circondate da un involucro nucleare
RNA e proteine RNA e proteine sintetizzate RNA sintetizzato ed elaborato nel nucleo;
nello stesso compartimento proteine sintetizzate nel citoplasma
Citoplasma assenza di citoscheletro; niente flussi citoscheletro composto da filamenti proteici;
citoplasmatici, endocitosi e esocitosi flussi citoplasmatici; endocitosi ed esocitosi
Divisione cellulare cromosomi separati mediante attacco cromosomi separati da un fuso di
alla membrana plasmatica citoscheletro
Organizzazione cellulare in genere unicellulare in genere multicellulare, con
differenziamento di molti tipi cellulari
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Glicolipide
Doppio
strato
lipidico
Acido grasso Regione
ad a-elica
di proteina
transmembrana
Proteina
periferica di
membrana
Proteina integrale
di membrana
Carboidrati proteine
MODELLO A MOSAICO FLUIDO
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Mobilità delle proteine
di membrana
Cellula umana Cellula di topo
Fusione
Cellula ibrida
Proteina
umana Proteina
di topo
Tempo: 0 minuti dalla fusione cellulare
Tempo: 40 minuti dalla fusione cellulare
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Membrane e meccanismi di trasporto
Diffusione semplice, facilitata, trasporto attivo
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Il nucleo funge da centro di informazioni
eterocromatina
complesso del
poro nucleare doppia membrana
nucleare
Pori nucleari:
strutture
ottagonali
La membrana nucleare
granulo
Continuità
della m.n. con
quella del
RER
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La lamina nucleare conferisce rigidità strutturale
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Nucleolo: sintesi dell’RNA ribosomale
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DNA: strategie di compattamento Una delle più sorprendenti caratteristiche di virus, cellule batteriche e
cellule eucariotiche, è l’enorme discrepanza esistente tra la
lunghezza del loro DNA e lo spazio, estremamente limitato, in cui
tale DNA deve essere accolto.
Per es: il DNA del batteriofago T4 ha una lunghezza di 60 x 10-6
metri, mentre la testa ha un diametro pari a 80 x 10-9 metri. Il DNA
per essere contenuto nella testa deve essere ridotto di 1000 volte.
Una cellula di Escherichia coli, di dimensioni pari a 1 nm x 1
nm x 4 nm, contiene tutto il proprio programma genetico in
una singola molecola di DNA le cui dimensioni, in forma
completamente distesa, corrispondono a circa 1 mm; vale a
dire che la molecola del DNA è circa 250 volte più lunga
della cellula che la contiene.
Il nucleo di una cellula somatica umana dal diametro medio
di circa 5 mm, contiene una quantità di DNA (3 x 109
nucleotidi) che, in forma completamente distesa, avrebbe
una lunghezza pari a 1,7 metri, cioè 350.000 volte
superiore al diametro del suo contenitore.
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DNA: strategie di compattamento negli eucarioti
Cromatina I complessi tra DNA eucariotico e proteine si chiamano
cromatina.
Le proteine principali della cromatina sono gli istoni.
1. H1
2. H2A
3. H2B
4. H3
5. H4
contengono un’alta % di
aminoacidi basici, come lisina
e arginina, che facilitano il
legame alla molecola di DNA
carica negativamente.
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Cromatina
DNA: strategie di compattamento negli eucarioti
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DNA: strategie di
compattamento negli
eucarioti
Cromatina
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L’entità della condensazione della cromatina varia durante il ciclo vitale della cellula. Nelle cellule
in interfase (che non si dividono) la maggior parte della cromatina, denominata eucromatina, è
relativamente decondensata e distribuita per tutto il nucleo. Durante questa fase del ciclo cellulare,
i geni sono trascritti e il DNA viene replicato in preparazione della divisione cellulare.
Eucromatina
Nucleolo
Eterocromatina
Circa il 10% della cromatina interfasica, detta eterocromatina, è in uno stato molto
condensato che rassomiglia molto a quello della cromatina durante il processo di mitosi.
L’eterocromatina è trascrizionalmente inattiva e contiene sequenze di DNA altamente
ripetute, come quelle presenti nei centromeri e nei telomeri.
DNA: strategie di compattamento negli eucarioti
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DNA: strategie di compattamento nei procarioti
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pro
cariotici
eucario
tici
Ribosomi: sede della sintesi proteica
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Gra
die
nte
di s
accaro
sio
(%)
frazionamento
Frazionamento dei ribosomi
S = Svedberg coefficiente di sedimentazione
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Reticolo endoplasmatico rugoso per la presenza dei ribosomi sul
versante citoplasmatico:
Sintesi delle proteine che verranno esportate ai diversi organelli/membrane
Abbondante nelle cellule esocrine del pancreas che producono enzimi per
la digestione.
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L’AGGIUNTA COVALENTE DI ZUCCHERI ALLE PROTEINE (GLICOSILAZIONE) E’ UNA DELLE PRINCIPALI FUNZIONI DEL
RE.
La maggior parte delle proteine sintetizzate nel
RE ruvido sono glicosilate mediante l’aggiunta
di un oligosaccaride comune legato a N
catena
laterale
di
asparagina
glucosio
mannosio
N-acetilglucosammina
N
oligosaccaride precursore trattenuto nella
membrana del RE da una molecola lipidica
chiamata dolicolo
catena polipeptidica
in crescita
RE ruvido
CITOSOL
LUME RE
Reticolo endoplasmatico rugoso
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Reticolo endoplasmatico liscio Nelle sue membrane sono inclusi diversi enzimi che intervengono
sintesi di steroidi a partire dal colesterolo (abbondante nelle cellule
endocrine che producono ormoni steroidei: testicolo, corteccia
surrenale) di fosfolipidi, glicolipidi presnti nelle membrane.
Nelle cellule epatiche è molto sviluppato perché detossificante.
Farmaci, come anfetamine, morfina barbiturici oppure tossine,
pesticidi, erbicidi ecc. vengono resi meno dannosi grazie all’enzima
ossidasi presente sulle membrane che con reazioni di
idrossilazioni favorisce la solubilità delle sostanze permettendone
il trasporto ai reni e la secrezione con le urine. In alternativa, si
depositerebbero nei grassi corporei.
Accumula ioni Ca++ (molto sviluppato nelle cellule muscolari che
richiedono ioni per avviare la contrazione muscolare).
Degrada glicogeno a glucosio
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Apparato del Golgi: Glicosilazione (modifica piu comune) di proteine e
lipidi e smistamento agli organelli /membrane di competenza
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Lisosomi sono vescicole che derivano dall’apparato del Golgi
IDROLASI
ACIDE nucleasi proteasi
glicosilasi lipasi
fosfatasi solfatasi
fosfolipasi
CITOSOL
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Lisosomi: Degradano organelli e molecole vecchie oltre a cellule
fagocitate- granulociti.
Sono note patologie causate da mutazioni di un singolo gene deputati alla
funzione lisosomiale- Tay-Sachs- accumulo di glicolipide cellule nervose
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TRAFFICO VESCICOLARE NELLE VIE ENDOCITICHE: pinocitosi e fagocitosi
endocitosi
fagocitosi
autofagia
batterio fagosoma
membrana
cellulare
ENDOSOMA
TARDIVO LISOSOMA
R. E. mitocondrio
autofagosoma
Endosoma precoce
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Perossisomi nella degradazione delle purine e nella ossidazione degli
acidi grassi
Contengono
1) urato ossidasi che catalizzano le ossidazioni partendo da ossigeno molecolare e producendo acqua
ossigenata
2) catalasi decompongono l’acqua ossigenata, che è tossica per le cellule cellule, in ossigeno e acqua.
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Mitocondri: i generatori della cellula
Carboidrati, aminoacidi e acidi grassi introdotti come alimento dentro le cellule vengono assorbiti
dai mitocondri che li ossidano fino ad CO2 e H2O, e utilizzano l’energia ricavata per convertire
adenosin-difosfato (ADP) in adenosin-trifosfato (ATP) mediante l’aggiunta di fosfato inorganico,
ricostituendo così la tipica molecola responsabile dei trasferimenti di energia del mondo vivente.
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Mitocondri
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Il citoscheletro è una rete di fibre proteiche presente nel citoplasma
7 nm
8-12 nm
25 nm
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Microfilamenti mediano il movimento cellulare
Contrazione- strisciamento- strozzatura termine
mitosi
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Microtubuli sono formati da 13 filamenti costituiti da eterodimeri di tubulina
alfa e beta
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Il centrosoma (contiene i centrioli costituiti da 9 triplette di microtubuli)
organizza il fuso mitotico che è costituito dai microtubuli
I microtubuli intervengono nella mitosi per la separazione dei cromosomi
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La disposizione di un microtubolo in un CIGLIO o FLAGELLO.
Disposizione caratteristica di 9+2 a formare l’assonema.
L’assonema è il nucleo del ciglio o flagello e provoca
il movimento.
raggio
guaina interna
micro-tubulo
centrale singolo
membrana
plasmatica
tubulo A tubulo B doppietto esterno di microtubuli
braccio interno di dineina
nessina
braccio esterno di dineina
Microtubuli sono alla base della struttura di ciglia e flagelli
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Microtubuli consentono il trasporto di molecole, come su binari dei treni
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Filamenti intermedi: gli elementi più duraturi e formati da proteine
fibrose. Interferiscono con lo stiramento della cellula (tendini)
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I filamenti intermedi sono connessi ai desmosomi o giunzioni di ancoraggio
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Tutti i filamenti sono connessi attraverso la plectina