MACA SFCP mai 2012 SARCOMES Les bons réflexes Le point de vue du pathologiste.
L’apport du médecin pathologiste dans le développement de ...€¦ · Mise en réseau et...
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L’apport du médecin pathologiste dans le développement de nouvelles thérapies
Fabien Gaire, Roche pRED Research Innovation Center Munich
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Une grande diversité d'opportunités de carrières
PharmaceuticalsDiagnostics
Recherche de
nouvelles
technologiesDéveloppement -
Validation/
affaires
régulatoires
Essais
cliniques
Affaires
medicales
(support,
formation)
Validation de
nouvelles
cibles
Validation du
mode d’action
therapeutique
Strategies
biomarqueurs
Nouveaux
biomarqueurs/
Design
d’etudes
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Impact des evolutions recentes en strategies therapeutiques
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La compréhension moléculaire du micro- environnement de la tumeur est au coeur de la recherche pharmaceutique
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Nouvelle infrastructure IRIS pour la recherche chez Roche
∂
Annotation d
echantillonsColoration de lames et
acquisition d’image
standardisées et contrôlées
par pathologistes
Stockage des données
brutes
Mise en réseau et
connection de la base
de données
Etude de la biologie des
tumeurs et de l’effet des
therapies
Meilleure lecture de
pharmaco-dynamie
Visualisation et analyse
du comportement des
tumeurs sous
traitement
Echantillons &
metadata
Images, objets,
annotations Aggregation des
resultats
Résultats
détaillés et
calculés
Hypotheses de
combinaisons
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Nouvelle infrastructure IRIS pour la recherche chez Roche
∂
Annotation d
echantillonsColoration de lames et
acquisition d’image
standardisées et contrôlées
par pathologistes
Stockage des données
brutes
Mise en réseau et
connection de la base
de données
Etude de la biologie des
tumeurs et de l’effet des
therapies
Meilleure lecture de
pharmaco-dynamie
Visualisation et analyse
du comportement des
tumeurs sous
traitement
Echantillons &
metadata
Images, objets,
annotations Aggregation des
resultats
Résultats
détaillés et
calculés
Hypotheses de
combinaisons
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Mesures de standardization des analyses dans la chaîne analytique
log(Ki67/CD8)
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Exemple de l’analyse de patients en phase I
Patient 8 Patient 3Patient 5
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La base de données procure une référence pour l'analyse de patients individuels
Pt
#8Pt
#3
Pt
#5
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L’observation des images indique des changements migratoires de cellules LT CD8 Ki67
Tumor
Tumor
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Mise en place d’une analyse systématique de localisation cellulaire
Ki67 tumor cell
<radius >radius
CD8 T-cell Radius
Densites et distances inter-objets, e.g. cellules LT, cellules tumorales
Relations entre cellules, compartiments, structures.
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Intégration du contexte spatial avec les données de séquençage ARN
CD
8+
ce
ll d
en
sity (
fro
m IH
C)
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Application de la méthode à la caractérisation du mode d’action d’un traitement
CD8 Ki67
Tumeur
Tumeur1
2
1
2
Pro
xim
ite r
ela
tive (
%)
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Analyse retrospective de la base de donnees(N=354 patients)
Moderate
density,
Low relative
engagement
Excluded
Moderate density,
High relative local
engagement.
Non classical
Inflamed
Low density
Classical desert
High density
Classical inflamed
Equal contribution O. Grimm, F. Schmich, K. Korski, E. Andersson, F. Gaire RICM
*
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Développement de nouvelles methodes basees sur les analyses rétrospectives
CRC liver metastasis
CD8A
PDCD1
CD3E
MKI67
KRT
Dapi
M. Singer, S. Moosmann, N.Rieder PTA
Tumor Proliferation
Engagement
TCell proliferation
Activation/ exhaustion
Non-CD8: regulation?
Stroma organization
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L’apport de l’intelligence artificielle pour accélérer la compréhension de la morphologie
“Bags” of “Instances”
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Exemple d’application pour détecter les changements caractéristiques a l’IMS
Champs visuels de faible valeur Champs visuels de forte valeur
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L’apport du pathologiste en recherche therapeutique moderne
- Rôle d'intégrateur liant les résultats d’analyse biologique des tissus et l’effet therapeutique
- Le pathologiste est un acteur clé pour le développement de nouvelles technologies
d’analyse
- La pathologie digitale, les techniques avancées d’analyse de données et d’image
révolutionnent la pratique en industrie
- Le rôle du pathologiste médical évolue rapidement
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Doing now what patients need
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