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Il cariotipo umano
Prof.ssa Flavia Frabettiaa. 2010-11
Il cariotipo di una cellula è il suo corredo, oassetto cromosomico
Citogenetica: branca della genetica che ha peroggetto lo studio morfologico cioè la struttura,la topologia/distibuzione e funzione deicromosomi
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ASSETTOCROMOSOMICO
n
CONTENUTOIN DNA
C= 23 = 3,5pg
CELL DIPLOIDI
2n 2C
CELL APLOIDI
n CGAMETI
2n
Ploidia è il numero di copie dell’assetto cromosomico
1) DNA2) nucleosomi(DNA + istoni)3) interfase con centromeri4) cromosoma dicromatidico in profase5) cromosoma dicromatidico in metafase
COME VARIA IL CONTENUTO DI DNA:
In pratica alla fine della interfase del ciclo cellulare,2n è 46 mentre il contenuto di DNA è 4C (14 pg)
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Come si ottiene
2) Stimolazione alla divisione cellulare (PHA o fitoemoagglutinina,una lectina mitogena )
sol. ipotonica
1) Scelta del tipo cellulare
4) Rottura delle cellule in sol. ipotonica
5) Fotografia ed analisi dell’immagine
3) Blocco in metafase (colchicina)
CARIOGRAMMA Homo sapiens
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46, XX46, XY
CARIOTIPO Homo sapiens
CORREDO CROMOSOMICO DIPLOIDE
IL CARIOTIPO E’ TIPICO DELLA SPECIE
39 X278
POLLO
19 X238
GATTO
25 X250
PESCE ZEBRA
Genomi molto simili per sequenza ed organizzazione:uomo e scimpanzèIl genoma di uomo e scimpanzè sono diversi per ~ l’1,3%46 cromosomi vs 48: il cromosoma 2 umano deriva dallafusione di due cromosomi dello scimpanzè (11 e 12)
Uomo e scimpanzè: inizio della divergenza ca. 6 x 106
anni fa
SCIMPANZE’
24 X2
48
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essenziale allasegregazione deicrom. durante lamitosi
centromero
telomero
FORMA DEL CROMOSOMA
- mantiene integrità cromosica - assicura replicazione delle estremità
Classificazione dei cromosoma per la formaIn base alla posizione del centromero (indice centromerico p/p+q)
1. Metacentrico2. Submetacentrico3. Acrocentrico4. Telocentrico (no
nell’uomo)1. 2. 3.
Cromosomi acrocentrici: 13-14-15, 21-22 e Y
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Gruppi di cromosomi umanisulla base di grandezza e forma
BANDEGGIOG: da Giemsa bande scure ricche in ATR: “reverse” denaturazione al calore in sol.salina poi col Giemsa ricche in GCQ: quinacrina (col.fluorescente) che si lega sempre a bande ricche in ATC: mette in rilievo l’eterocromatina costitutiva
http://www.pathology.washington.edu/research/cytopages/idiograms/human/
ideogrammi
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p
q
14q24.2
DIVERSO DAL“LOCUS GENICO”, una banda può contenereda decine a centinaia di geni
http://www.tokyo-med.ac.jp/genet/cki-e.htm
La bande e sottobande contengono in mediacirca 4x106 bp dunque non si possono studiare con il cariotipo mutazioni puntiformi ma solo grosse alterazioni