染色体の構造と複製 - 京都大学...3. 染色体の構造 • 染色体はDNAとタンパク質の複合体である。• 染色体には一本のDNA分子しかない。–
1 DNA 2 DNA 2zen.shinshu-u.ac.jp/modules/0035000005/main/0035000005.pdf1:DNA分子の複製過程...
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1:DNA分子の複製過程 ��2本鎖DNAの解離 → プライマー合成 → 伸長反応
2:複製過程の特徴 ・半保存的複製 ・リーディング鎖とラギング鎖 ・末端の複製問題
3:関与する分子 �・(複製される)鋳型DNA分子 �・リボヌクレオチド �・デオキシリボヌクレオチド � �・酵素(タンパク質)
DNA合成酵素 / プライマーゼ RNA分解酵素 / リガーゼ ヘリカーゼ / 一本鎖DNA結合タンパク質 �
ボトムライン�DNA分子の複製�
5' 3'
3' 5'
伸長反応に伴ってRNAプライマーは除去され、DNA分子どうしが結合 (ライゲーション)�
ラギング鎖合成(不連続的伸長)�
リーディング鎖合成(連続的伸長)�
複製後の2つの2本鎖DNA
ACCGTTAAGG TGGCAAT
相補的ヌクレオチドの付加反応�
5' 3'
3' 5'
3' 5'
5' 3'
DNA分子複製の概要�
「逆」平行2本鎖�
5'
5'
5'
5'
3'
3' 3'
3'
この末端部分のRNAプライマーがDNAに置換されずに残る。 �
3'
3' 3'
5' 複製方向�
半保存的複製�
DNA分子の複製�
ヌクレオチド間の結合�
O C H H
C H
H C OH
C C H
1’
2’ 3’
4’ 5’
塩基(Base)
O C H H
C H
H C OH
C C H
1’
2’ 3’
4’ 5’
塩基(Base) O O O O-P-O-P-O-P-O- O O 0
O C H H
C H
H C
C C H
1’
2’ 3’
4’ 5’
塩基(Base) O O O O-P-O-P-O-P-O- O O 0
ホスホジエステル結合�
DNA合成酵素がこの結合の 形成反応を行う (RNA合成酵素も同様。ただし、 基質がRNA)
DNA分子の複製�
P P P
OH
HO
DNA分子の複製過程 1:二重鎖DNAの解離�
P
A
P
A
P
T T
P
P
A
P
G
P
T C
P
P
T
P
G
P
A C
P
P
C
P
T
P
G A
P
P
T
P
T
P
A A
P
P
G
P
G
P
C C
P
P
A
P
A
P
T T
P
P
A
P
C
P
T G
P
P
C
P
A
P
G T
P
P
A T
P
T A
P P P
P P P
OH
HO P
A P
A P
A P
G P
T P
G P
C P
T P
T P
T P
G P
G P
A P
A P
A P
C P
C P
A
P
T
P
P
A T
P
T A
P
T T P
P
T C P
P
A C P
P
G A P
P
A A P
P
C C P
P
T T P
P
T G P
G P P P
ヘリカーゼ(細胞内) (試験管内では高温か高pH)
DNA分子の複製�
DNA分子の複製過程 2:RNAプライマーの合成�
P P P
OH
HO P
A P
A P
A P
G P
T P
G P
C P
T P
T P
T P
G P
G P
A P
A P
A P
C P
C P
A
P
T
P
P
A T
P
T A
P
T T P
P
T C P
P
A C P
P
G A P
P
A A P
P
C C P
P
T T P
P
T G P
G
P P P
P
T T
P
T P P POH OH
P
G
P
A A P P P
HO
HO
DNA (Deoxyribonucleic Acid)�と�RNA (Ribonucleic Acid)
O C H H
C H
H C OH
C C H
1’
2’ 3’
4’ 5’
塩基(Base) O
C H H
C OH
H C OH
C C H
1’
2’ 3’
4’ 5’
塩基(Base) P P PP P P
RNA合成酵素 �
DNA分子の複製�
DNA分子の複製過程 3:DNA合成酵素による伸長反応�
P P P
OH
HO P
A P
A P
A P
G P
T P
G P
C P
T P
T P
T P
G P
G P
A P
A P
A P
C P
C P
A
P
T
P
P
A T
P
T A
P
T T P
P
T C P
P
A C P
P
G A P
P
A A P
P
C C P
P
T T P
P
T G P
G
P P P
P
T T
P
T P P P
P
G
P
A A P P P
HO
P
C A
P
C
OH P
P
G P
T
P
T G P
P
T
DNA合成酵素は ・足場となる2本鎖部分を必要とする (最初のヌクレオチドを持ってこれない) ・3’端にしか新規の付加反応をできない �→伸長方向の極性�
複製の進行方向�
DNA分子の複製�
塩基�
O
O O O O-P-O-P-O-P-0-C O O O
塩基�
OH
塩基�
OH
1’ 2’ 3’
4’
5’
3’
5’端�
3’端�
O O O O-P-O-P-O-P-0-C O O O
O P-0-C O
- O - P - O -
ホスホジエステル結合�
ヌクレオチドの付加反応�
5’
3’
2本鎖を形成している部分の3’-OHに対してのみ新しいヌクレオチドを付加できる�
DNA分子複製の伸長は1方向に限定される�
DNA分子の複製�
P P P
OH
HO P
A
P
A
P
T T
P
P
A
P
G
P
T C
P
P
T
P
G
P
A C
P
P
C
P
T
P
G A
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T
P
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G
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P P P
P P P
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A
P
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P
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P
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P
C
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P
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P
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P
A A
P
P
G
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G
P
C C
P
P
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A
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P
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P P P
P P P
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P
G
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C C
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P
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T G
P
P
C
P
A
P
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P
P
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P
T A
P P P
P P P
OH
HO P
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P
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T C
P
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P
G
P
A C
P
P
C
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P
G
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C C
P
P
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T T
P
P
A
P
C
P
T G
P
P
C
P
A
P
G T
P
P
A T
P
T A
P P P
DNA分子の複製過程 4:プライマーRNAの除去�
(ラギング鎖における)プライマーRNAの除去とDNの連結反応�
DNA分子の複製�
半保存的複製と保存的複製�
5' 3'
3' 5'
5'
5' 3'
5' 3'
5' 3'
3'
親鎖�
娘鎖x2
5' 3'
5' 3'
5' 3'
5' 3'
「保存的複製」のメリットとデメリット?�
DNA分子の複製�
DNA合成酵素とプライマーゼの性質�
逆平行2本鎖�5’
5’
3’
3’
5’
5’
3’
3’
最初のヌクレオチドを持ってこれない:2本鎖の足場が必要�
足場=RNAプライマー by プライマーゼ�
5’ 3’
5’ 3’
5’ 3’ 3’-OHにしかヌクレオチドを付加できない�
解離�
5’ 3’
DNA合成酵素は�
5’ 3’
5’ 3’
伸長方向の先にあるRNAプライマー部分を分解出来る�
5’ 3’
5’ 3’
DNA分子の複製�
リーディング鎖とラギング鎖�
5’
5’
3’
3’
5’
3’
3’
5’ 複製の進行方向�
合成反応の伸長方向�
不連続的伸長:ラギング鎖�
連続的伸長:リーディング鎖�
DNA分子の複製�
DNA分子の極性と複製の進行方向�
5' 3'
3' 5' 「逆」平行2本鎖�
5' 3'
5' 3' 「順」平行2本鎖�
5'
3'
5'
5'
5'
3'
3'
3'
3'
3'
複製の進行方向�
5' 3'
5' 3'
3'
5' 3'
5'
DNA分子の複製�
DNA分子の5'端と3'端�
5' 3'
3' 5' 「逆」平行2本鎖�
一方の鎖が切断される�5' 3'
3' 5' 5' 3'
5' 3'
3' 5' 5' 3' 3' 5'
DNA分子の複製�
直鎖DNA分子末端の複製問題�5’
5’ 3’
3’
5’
3’
3’
5’
DNA合成酵素はRNAを鋳型とできないので、この部分が複製されない�
DNA分子の複製�
複製の進行方向�
DNAの合成方向�
リーディング鎖�
ラギング鎖�リーディング鎖�
ラギング鎖�
両方向複製�
5’
5’
3’
3’
RNAプライマー�DNA複製装置(合成酵素)の エキソヌクレアーゼ活性によって除去される�
DNA分子の複製�
推薦図書�
それは失敗からはじまったー生命分子の合成に賭けた男�コーンバーグ / 新井賢一�他(訳) /羊土社(2001) �
DNA分子の複製�