Какие бывают РНК полимеразы. За что они отвечают.

У эукариот есть три различные РНК полимеразы - I, II и III, ответственные за транскрипцию с соответствующих промоторов

класс I =гены, кодирующие рибосомальные РНК

II =гены, кодирующие матричные РНК и некоторые малые ядерные РНК

III =гены, кодирующие транспортные РНК и оставшиеся малые ядерные РНК.

Эукариотические РНК полимеразы не способны сами по себе инициировать транскрипцию.

Для этого им необходимы вспомогательные белки - факторы инициации, формирующие совместно с полимеразами преинициаторные комплексы.

Типы транскрипционных факторовБазальные - включают Pol II + GTFsКо-факторы - взаимодействуют с регуляторами

Специфические - связываются с промоторами, энхансерами и

сайленсерами - регулируют транскрипцию отдельных генов

Базальные факторы Структура промотора эукариот

ТАТА – содержащие ТАТА – не содержащие

Базальные факторыИнициация на ТАТА

TFII (Transcription Factors of RNA polymerase II)

TFIID (TBP+TAFs)TBP (TATA Binding Protein)TAFs (TATA associated proteins)

TFIIATFIIBTFIIF + RNA polym IITFIIE – activates TFIIHTFIIH – helicase + kinase

Инициация на ТАТА-less промотерах

Схемы инициации для ТАТА содержащих и ТАТА-несодержащих промотеров

В ТАТА-несодержащих промотерах инициация идет при помощи белков TAFs комплекса TFIID

Базальные факторы

Базальная регуляцияTAF1 может связываться с ТАТА узнающей областью TBPЕще один из примеров мимикрии белков

TFIIA конкурирует в связывании TBP с TAF1

Также TFIIA стабилизирует комплекс ТBP-ТАТА

Базальная регуляция

TBP могут объединяться в гомодимеры, что препятствует их взаимодействию с ДНК

TFIIA провоцирует диссоциацию таких TBP-гомодимеров на мономеры

Базальная регуляция

Аналогично TAF1, BTAF1 мимикрирует ТАТА, не ингибируя связывание TBP c ДНК

Особенностью BTAF1 является способность одного из его доменов индуцировать диссоциацию комплекса TBP-ДНК

NC2NC2 cостоит из 2

субъединицОбразует кольцо,

блокирующее преинициаторный комплекс

Также может быть коактиватором для TATA-несодержащих промоторов

По отдельности субъединицы могут быть вовлечены в специфическую транскрипцию

Regulator-assotiated co-factors Адаптеры Модификатор

ы хроматина

Ко-репрессоры Ко-активаторы Ремоделируют нуклеосомы

HATs и HDACs

Медиатор. Кто это?Медиатор – мультибелковыйкомплекс из 20 белков

-Роль медиатора – перенос сигнала (как положительного, так и отрицательного) от специфического фактора транскрипции, связанного с энхансером, к РНК-полимеразе II.

Роджер Д. КорнбергНобелевская премия по химии за 2006 год присуждена Роджеру Д. Корнбергу “за фундаментальные исследования молекулярных основ транскрипции у эукариот”.

Медиатор.(MED)MED взаимодействует с не

фосфорелированной формой С-концевогоДомена полимеразы-2.(СTD)MED+СTD=holoenzymeMED взаимодействует с РНК-полимеразой2Только на стадии инициации. Затем MED

отсоединяется. Одна из причин этого – фосфорелирование CTD.

Отличается высокой консервативностьюОт дрожжей до человека.

Структурные части медиатора.Голова(Head)- образует

наибольшее количество контактов с полимеразой. Самая консервативная часть.Хвост(Tail) – платформа для

взаимодействия с ген -специфическими

активаторами. Наименее консервативная часть.

Тело(Middle)- соединительная функция