Mikrobiologi

(AET 1203P)

Dosen Pengampu

1. Prof. Ir. T. Sabrina, M.Sc., Ph.D

2. Dr. Ir. Hasanuddin, MS

3. Ir. Hardy Guchi, MS

4. Ir. Mukhtar Iskandar Pinem, M.Agr.

5. Dr. Lisnawita, S.P., M.Si.

6. Irda Safni, S.P., MCP, Ph.D (Koordinator)

7. Amelia Zulianti Siregar, S.Si., M.Sc., Ph.D

8. Mariani Sembiring, S.P., M.P,

9. Benny Hidayat, S.P., M.P.

KELAS HARI WAKTU RUANG TIM

AET 1 Kamis 08.00-09.40 Pustaka 1 1. Irda Safni

2. T. Sabrina

AET 2 Kamis 10.00– 11.40 Pustaka 1 1. Ameilia Zulianti Siregar

2. Benny Hidayat

3. Hasanuddin

AET 3 Jum’at 08.00 – 09.40 Pustaka 1 1. Irda Safni

2. Hardy Guchi

AET 4 Jum’at 10.00 – 11.40 Pustaka 1 1. M.Lisnawita

2. Mariani Sembring

AET 5 Jum’at 14.00 – 15.40 Pustaka 1 1. M.I. Pinem

2. Mariani Sembiring

Rencana Pembelajaran Semester (RPS)

I. Pengantar mikrobiologi:

a. Pengertian

b. Ruang lingkup

c. Sejarah perkembangan

Bentuk pembelajaran: ceramah, diskusi

II. Sistematika mikroorganisme:

a. Klasifikasi

b. Taksonomi Poliphasic (Identifikasi dan deskripsi bakteri)

Bentuk pembelajaran : ceramah, diskusi, tugas

III. Struktur dan fungsi sel mikroba: Archaea dan Bakteri

Bentuk pembelajaran: ceramah, diskusi

IV. Struktur dan fungsi sel mikroba: Eukaryotik – Protista dan Jamur

Bentuk pembelajaran: ceramah, diskusi

V. Virologi:

a. Pengenalan virus

b. Klasifikasi virus (kisaran inang, ukuran, struktur, siklus hidup)

Bentuk pembelajaran: ceramah, diskusi, pemutaran video + tugas

rangkuman pemutaran video

VI. Nutrisi dan kultur mikroorganisme:

a. Nutrisi dan kimia sel

b. Media kultur

Bentuk pembelajaran: ceramah, diskusi

VII. Pertumbuhan populasi mikroba:

a. Konsep pertumbuhan populasi, kurva pertumbuhan

b. Pengukuran pertumbuhan mikroorganisme:

- Secara langsung: Plate counts, Filtration, MPN, Direct microscopic

count

- Secara tidak langsung : Turbidity, Aktifitas mikroorganisme, berat

kering

Bentuk pembelajaran : ceramah, diskusi

VIII. Metabolisme mikroorganisme:

a. Sekilas tentang metabolisme, katabolisme, anabolisme, ATP,serta reaksi

oksidasi-reduksi

b. Sintesis ATP

Bentuk pembelajaran: ceramah, diskusi

UJIAN TENGAH SEMESTER ( 21 Okt -1 Nop 2019)

IX. Keragaman mikroorganisme:

a. Bakteri Prokaryota dan Archaea

b. Mikroorganisme Eukaryota

Bentuk pembelajaran: ceramah , diskusi

X. Keragaman mikroorganisme (lanjutan)

Bentuk pembelajaran: Tugas presentasi pembuatan video

XI. Keragaman mikroorganisme (lanjutan):

Bentuk pembelajaran: Tugas presentasi pembuatan video

XII. Genetika mikroorganisme:

a. Struktur genom dan informatika genetika

b. Struktur dan replikasi DNA; PCR

c. Konsep gen

d. Struktur dan ekspresi gen

Bentuk pembelajaran: ceramah, diskusi, pemutaran video

XIII. Pengelolaan dan Pengendalian Mikroorganisme

Bentuk pembelajaran: ceramah, diskusi

XIV.Peran mikroba di alam: Ekologi mikroba dan Mikrobiologi lingkungan:

a. Teknik pada ekologi mikroorganisme

b. Habitat mikroorganisme

c. Simbiosis mikroorganisme

Bentuk pembelajaran: Problem Based Learning (PBL)

XV. Peran mikroba di alam:

a. Aplikasi mikrobiologi dalam bidang pertanian dan bioteknologi

b. Penggunaan pupuk hayati berbasis mikroorganisme

Bentuk pembelajaran: ceramah, diskusi

XVI. Peran mikroba di alam:

a. Penggunaan mikroba sebagai pengendali hama dan penyakit tumbuhan;

Plant Growth Promoting Rhizobacteria (PGPR)

Bentuk pembelajaran: ceramah, diskusi

UJIAN AKHIR SEMESTER (6 – 17 Jan 2019)

KULIAH I

PENGANTAR MIKROBIOLOGI

PENGERTIANMikrobiologi

Mikro = kecil

Bio = hidup

Logos = ilmu

Arthropoda

Cacing

Protozoa

Jamur

Virus

Bakteri

Mikroba

• Mikroorganisme adalah organisme hidup yang pertama kali di planet bumi, hidup di mana pun selama kehidupan memungkinkan, lebih banyak dibandingkan organisme lain, dan mungkin penyusun terbesar komponen biomasa bumi

• Mikrobiologi mempunyai imbas terhadap banyak bidang di antaranya kedokteran, pertanian, ilmu pangan, ekologi, genetika, biokimia, dan biologi molekuler

Mikroorganisme & Mikrobiologi

• Mikroorganisme • Mikrobiologi

Makhluk hidup yang secara

individual sangat kecil untuk

dilihat dengan mata telanjang.

Yang termasuk

mikroorganisme:

– Bakteri (eubacteria,

archaebacteria)

– Jamur (yeasts, molds)

– Protozoa

– Microscopic algae

– Virus

– Berbagai cacing parasit

Ilmu yang mempelajari tentang

miroorganisme

Dasar dari Bioteknologi modern

Berbagai cabang ilmu mikrobiologi:

Virologi, Mikologi, Bakteriologi,

Immunologi,

Ecologi Mikroba, Mikrobiologi

Bioteknologi, Mikrobiologi

Lingkungan, Mikrobiologi Makanan,

Mikrobiologi Forensik, Molekuler

Biologi

Cakupan Mikrobiologi

Mikrobiologi Umum : mempelajari sifat mikroba pada umumnya

Mikrobiologi Kedokteran : Mempelajari mikroba yg berhubungandgn penyakit pd manusia

Mikrobiologi pertanian : Mempelajari mikroba yg berhubungan dgnpenyakit tanaman & hewan, serta kesuburan tanah

Mikrobiologi Industri : Mempelajari mikroba yg berhubungan dgnkegiatan industri

Mikrobiologi Makanan & susu : Mempelajari mikroba ygberhubungan dgn pembuatan & pengawetan makanan

Mikrobiologi

Dua tema utama yang berhubungan dengan mikrobiologi

1- Dasar – proses sel

2-Terapan- berhubungan dengan pertanian, industri dan kesehatan

Mikroba dalam

kehidupan kita

• Ada yang bersifat patogenik (penyebab penyakit)

• Mendekomposisi sampah organik

• Menghasilkan fotosintesis (cth. Bakteri Sulfur Ungu (Purple

sulphur bacteria) harus memperbaiki CO2 untuk hidup)

• Memegang peranan di bidang industri (cth. fermentasi untuk

menghasilan etanol and acetone)

• Menghasilkan makanan berfermentasi (cuka, keju & roti)

• Menghasilkan produk yang digunakan pabrik (sellulase) dan

pengobatan (insulin)

Mikroba dan makanan

1) Mencegah pembusukan (tempe, ikan asin)

2) Membantu dalam menghasilkan makanan

Mikroba dan energi

1) Gas alam (methane)

2) Ethanol (biofuel)

3) Bioremediasi

Mikroba dan masa depan

1) Bioteknologi (produksi makanan, obat-obatan,

vaksin)

2) Teknik Genetika

(rekombinasi DNA)

Sejarah Mikrobiologi

Dasar sejarah mikrobiologi

Penemuan-penemuan terkenal, di antaranya :

Mikroskop

Metode ilmiah

Pengembangan mikrobiologi kedokteran

Teknik-teknik mikrobiologi

Periode Perkembangan Mikrobiologi(3 periode)

1. Periode perintis/zaman pra sejarah, teoriabiogenesis / generatio spontanea, mahlukhidup terjadi dari benda mati (air, daging)

2. Periode keemasan,

– Robert Koch (1881), metoda isolasi (pemisahan)

– Petri (asisten Koch), penemu cawan petri

– Gram (1844), penemu teknik pewarnaan Gram

– Chamberland (1887), penemu sterilisasi secara fisik, metode filter

Anthony van Leeuwenhoek (1632-1723)

Pedagang kain dari Belanda

Orang pertama yang mengobservasi mikroba hidup

Menemukan lens tunggal dengan magnifikasi sampai 300X

Insert figure 1.8

Insert figure 1.9 (a)microscope

Robert Koch (1843-1910)

Menemukan Teori PostulatKoch- suatu eksperimen yang membuktikan Teori Penyebab penyakit (Germ Theory of Disease).

Mengiidentifikasi penyebab anthrax, TBC, dan kolera.

Mengembangkan Metode Kultur Murni.

Insert figure 1.12

Louis Pasteur (1822-1895)

Menunjukkan mikroba menyebakan fermentasi dan pembusukan.

Mematahkan pendapat generatio spontaneamikroorganisme (teori Abiogenesis).

Mengembangkan Pasteurisasi. Menemukan Teori Penyebab

Penyakit (Germ Theory of Disease ).

Insert figure 1.11

Periode Keemasan menjawab4 masalah pokok

1). Penggolongan mikroba: Mikroskop, bentukmikroba ditemukan yaitu bakteri, jamur, virus

2). Asal-usul mikroba : Louis Pasteur, merobohkanteori abiogenesis, dengan penemuan teoribiogenesis bahwa jasad renik berasal dari jasadrenik induknya

3). Penyebab mikroba penyebab penyakitdijawab oleh Postulat Koch

4). Mikroba pada fermentasi anggur dijawaboleh hasil riset L. Pasteur

3. Periode modern (1910 – sekarang), – Adanya peralatan modern/mutakhir, mikroskop

elektron, khromatografi, komputer, autoclave dll

– Masalah yang pelik dapat dipecahkan, virus

– Pasteur dan Koch sudah mulai melakukan penelitiantentang virus

– Iwanowski (1892), mengungkap masalah virus, TMV (tobacco mosaik virus)

– Peraih nobel, • Domagk (1939) penemu obat sulfa utk infeksi bakteri,

• Fleming, Florey &Chain (1945) penemu penisilin

• Waksman (1952), penemu streptomisin

• Stanley (1946), penemu protein murni virus

• Enders, Weller & Beadle (1954), penemu virus poliomyelitis, vaksin polio

Postulat Koch

1. Mikroba penyebab penyakit harus ada pada individuyang sakit dan tidak terdapat pada individu yang sehat

2. Mikroba penyebab penyakit tsb, harus dapatdiisolasi/dibiakkan secara murni

3. Mikroba dari biakan murni tsb, bila diinfeksikan kembalipada individu yang sehat, akan menumbulkan gejalapenyakit yang sama

4.Mikroba yang telah diinfeksikan kembali tsb, dapatdiisolasikan kembali dan akan mempunyai bentuk yang sama seperti asalnya

Postulat Koch

TERIMA KASIH