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H. Gonsu
FMSB / CHUY
SALMONELLES
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Objectifs
Expliquer la taxonomie ancienne et rcente du genreSalmonella
Spcifier les caractres bactriologiques, biochimiques,pharmacologiques du genre Salmonella
Prsenter quelques donnes pidmiologiques
Expliquer les mcanismes de virulence des principauxpathognes
Prsenter les tableaux cliniques des fivres typhodes et
des autres salmonelloses
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Plan
I- Gnralits :
I-1- Dfinition et intrtI-2- Historique
I-3- Rappels sur les mthodes de diffrentiation infra- spcifique desespces
II- Taxonomie
III- Caractres bactriologiques
IV- Fivres typhodes
V- Salmonelloses non typhodiques
VI- Diagnostic biologique
VII- Traitement curatif et prvention
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Dfinition et intrt
Salmonella :
Genre bactrien de la famille des Enterobacteriaceae, constitu
de bacilles Gram ngatif, le plus souvent mobiles, pathognes
pour lhomme et les animaux
Intrt :
Ce genre regroupe de nombreuses espces pathognes pour
lhomme, agents des fivres typhodes, fivres paratyphodes,
et dautres salmonelloses communes lhomme et lanimal
Ces maladies sont des maladies du pril fcal et peuvent tre
prvenues par lapplication de mesures particulires dhygine
et salubrit
Elles sont responsables dpidmies parfois trs importantes
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Historique
1813 : individualisation de la fivre typhode sur la base des signes cliniques etlsions ulcreuses de lintestin par Petit et Serres
1868 : MEE du rle de leau de boisson dans sa dissmination parPettenkoffer
1880 : Dcouverte de lagent de la fivre typhode par Eberth, dans les coupeshistologiques de ganglions lymphatiques de malades morts de cette maladie
1884 : Culture de la bactrie par Gaffky
1896 : MEE de la diversit antignique des souches de salmonelles par Widal
1918 : Etude spare des Ag somatiques O, flagellaires H, et de surface Vi parWeil, Flix, Mitzemacher
1926 : Inventaire de la diversit antignique de ces bactries, maintenant
regroupes dans le genre Salmonella par White cette date. Kauffmann,puis Le Minor y ont contribu plutard
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Mthodes phnotypiques de diffrentiation
infra- spcifiques
Elles sont essentiellement voues au marquage pidmiologique etpermettent le diagnostic despce des bactries responsablesdinfection. Lon en dnombre plusieurs parmi lesquelles les 2dernires mthodes ci- dessous cites nous intressentparticulirement dans le cadre de cet expos
1- La biotypie : Consiste tudier pour 1 souche donne 1 crible decaractres biochimiques variables au sein de sa propre espce dontle profil dtermine 1 biovar
2- La bactriocynotypie : Limite quelques espces. Elle est basesur lutilisation de bactriocines (produits inhibiteurs voirebactricides, de nature protique ou peptidique (30 70 kDa),synthtiss par des bactries productrices insensibles leurs effetsmais actifs sur dautres souches de la mme espce ou despcesvoisines)
3-Analyses biochimiques particulires : ltude des constituants de la
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Mthodes phnotypiques de diffrentiation
infra- spcifiques
4- Srotypie :Mthode de marquage des espces bactriennes base sur la
dtermination dantignes de surface (capsulaires, paritaux ouflagellaires) laide dantisrum spcifiques.
Elle demeure encore la mthode de de choix du marquage infra-
spcifique des salmonelles (mais aussi du mningocoque,pneumocoque, et du bacille pyocyanique)
5- Lysotypie :
Permet de distinguer au sein d1 mme espce bactrienneprdfinie de bactriophages connus, l(es) ventuel(s)phage(s) susceptibles de lyser la souche tudie. Ces virusbactriens ont besoin pour leur attachement de rcepteursspcifiques gntiquement caractriss.
Elle consiste donc tudier la sensibilit ou la rsistance des
souches 1 srie de bactriophages slectionns
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Mthodes phnotypiques de diffrentiation
infra- spcifiques
Les phages utiliss peuvent tre ;
Virulents ou lytiques : linfection d1 cellule entrane lamort cellulaire et la production de nouveaux phages qui
rinfectent dautres cellules. Ceci se traduit par laformation de plage ou linhibition de la croissancebactrienne
Temprs : leur ADN intgre le gnome bactrien, serfrant ltat lysogne ; 1 petite portion de cellules htesinduisent naturellement les gnes du phage et la librationdes phages intervient.
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Mthodes phnotypiques de diffrentiation
infra- spcifiques
70% des isolats se rpartissent seulement en 3 lysotypes (A,E1, et C1)
Ce qui explique le systme de lysotypie complmentaire dusrotype typhimis au point par Nicolle, et compos de 13bactriophages non adapts Vi, subdivisant le groupe A, leplus frquent, en 10 sous- lysotypes
2me systme :
Publi en 1951 par Flix et Callow
Permet de typerSalmonella srotype paratyphi B
Compos de 12 bactriophages adapts et non adapts etreconnat 48 lysotypes
3me systme :
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Taxonomie
Rgne Bacteria
Embranchement Proteobacteria
Classe Gamma Proteobacteria
Ordre Enterobacteriales
Famille Enterobacteriaceae
Genre Salmonella
Espce 2 espces (actuellement) et plusieurs
sous- espces
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Entrobactries : Principaux genres
Salmonella
Shigella
Escherichia
Edwardsiella
Citrobacter
Klebsiella
Enterobacter
Hafnia
Panoea
Serratia
Proteus
Morganella
Providencia
Yersinia
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Genre Salmonella
Ancienne taxonomie ;
Base sur des tests biochimiques et de srotypie
En sappuyant sur les diffrents facteurs antigniques O (somatiquesparitaux) et H (flagellaires appartenant aux 2 phases possibles, H1et H2), Kauffmann et White ont propos 1 shma srotypique d1extrme richesse
Concept : 1 srotype, 1 espce propos par Kaufmann sur la basede lidentification srologique des antignes somatique O et flagellaireH
Ce type de classification conduisait reconnatre 2463 espces desalmonelles en 1998 et davantage aujourdhui car 26 srovars ontt identifis en 1999
La nomenclature complte des Salmonella se dcline en Genre,es ce trs nombreuses sous- es ce srovar
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Genre Salmonella : taxonomie
Nouvelle taxonomie :
Base sur des mthodes molculaires
Dfinit - 1 genre- 2 espces : S. enterica et S. bongori. Lespcebongori a pour habitat uniquement les animaux.
- 6 sous- espces de lespce enterica : S. enterica, S.salame; S. arizonae ; S. diarizonae; S. houtenae ; S. indica.
La 1re
a pour habitat lhomme et les animaux sangchaud, les 5 autres sont retrouves chez les animaux(vertbrs) sang froid
- Trs nombreux srotypes
Ex. Salmonella enterica, sous espce enterica, srotype typhi,
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Genre Salmonella : taxonomie
Nom complet Appellation du CDC Autre appellation
S. enterica subsp. enterica
ser. typhi
Salmonella ser typhi Salmonella typhi
S. enterica subsp. enterica
ser typhimurium
Salmonella ser typhimurium Salmonella typhimurium
S. enterica subsp. salamea
ser. greenside
Salmonella ser greenside S. II 50:z :e, n,x
Salmonella greenside
S. enterica subsp. arizonae
ser. 18 : Z4 Z23
Salmonella IIIa 18:Z4, Z23 Arizona hinshawii ser.
7a, 7b: 1,2;5
S. Bongori ser brookfield Salmonella ser brookfield S. V 66 :Z41 ;
Salmonella brookfield
S. enterica subsp.
Houtenae ser marina
Salmonella ser salmonella S. IV 48:g, Z51
Salmonella marina
S. enterica subsp. indicaser srinagar
Salmonella ser srinagar S. VI 11: b : e,n,xSalmonella srinagar
C t b t i l i d
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Caractres bactriologiques des
entrobactries
1- Morphologie :
Bacilles Gram - (BG- )
Ne forment pas de spores
Taille :de 2-4 microns x 0,4- 0,6 microns
Mobiles (ciliature piritriche) ou immobiles (Klebsiella,Shiguella et Yersinia pestis)
Quelques fois capsuls (Klebsiella)
C t b t i l i d
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Caractres bactriologiques des
entrobactries
2- Culture :
Poussent facilement sur les milieux usuels en 24H 37Cen arobiose et en anarobiose
Exigences nutritionnelles rduites. La plupart se multiplienten milieu synthtique avec 1 source de C simple comme leglucose
Croissance optimale sur le milieu Mac Conkey (milieucontenant 2 inhibiteurs de la flore Gram+ ; les sels biliaireset le cristal violet). Le caractre recherch dans ce milieutant la fermentation du lactose dont lutilisation est rvlepar lindicateur color du milieu, le rouge neutre
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Caractres bactriologiques des
entrobactries
Dveloppement pour la plupart sous forme de coloniesrondes, lisses (S), bords rguliers, de 2 3 mm dediamtre aprs 18H dincubation. Il existe des diffrences
dans la rapidit de dveloppement des colonies. Ex, cellesde Shiguella sont plus petites que celles de E. coli
Les colonies peuvent apparatre muqueuses avec 1
consistance glatineuse et 1 tendance la confluence etsouvent 1 diamtre double de celui des autresentrobactries >24H
Les colonies aspect rugueux ( R ) se rencontrent le plussouvent chez les cultures de collection la suite de
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Caractres bactriologiques des entrobactries
3- Biochimie :
o Utilisent le D-glucose et les autres sucres par fermentation avec productionde gaz plutt que par oxydation
o Rduisent les nitrates en nitrites (except certaines souches dErwinia et detrs rares mutants)
o Oxydase ngative
o Catalase + (except Shiguella dysenteriae srotype 1)
o Immobiles ou mobiles
o Aro- anarobies facultatifs
o Autres ; grande diversit antignique ( formation dindole, fermentation desglucides tels le lactose,)
C t b t i l i d
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Caractres bactriologiques des
entrobactries
4- Structure antignique :
Contiennent 1 Ag commun et possdent 1 GC% entre 39 et 59%
On distinguera surtout - les Ag O (Ag de paroi toujours prsents)
- les Ag H (Ag flagellaires)
-les Ag K, plus rarement (Ag de capsule oudenveloppe)
Antignes O :
- Sont thermostables (rsistant 2H 1 chauffage 100C)
- Sont 1 fraction protinique qui rend le complexe antignique
- Sont 1 fraction polyosidique qui dtermine la spcificit de lantigne
- Sont trs toxiques (1/20mg suffit pour tuer la souris en 24H) : 1fraction lipidique qui, lie au polyoside, est responsable de la toxicit(endotoxine). Inject lhomme ou lanimal, lantigne O provoque
de la fivre, 1 leucopnie suivi de leucocytose avec lymphopnie etosino hilie
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Caractres bactriologiques des
entrobactries
Antigne H :
De nature protique
Ag thermolabile, dtruit par lalcool 50% et par les enzymes
protolytiques Peuvent permettre lagglutination en prsence d1 immunsrum
spcifique
N.B; Les caractres ci- dessus numrs permettent dexclure de
la famille des Enterobacteriaceae dautres BG ;
Pseudomonas (arobies stricts et ont 1 mtabolisme oxydatif)
Vibrio
Aromonas
C t b t i l i G
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Caractres bactriologiques: Genre
Salmonella
Caractres morphologiques,culturaux et mtaboliquesidentiques celles des autresbactries de la famille des
enterobactries
Bacilles Gram ngatif
Taille ; (0,1 6 x 0,3) microns
Mobiles, except cellesappartenant 1 srovar aviare, et
de rares mutants paralyss
C t b t i l i G
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Caractres bactriologiques: Genre
Salmonella
Culture :
En aro- anarobiose
Se fait avant et aprs pr- culture sur milieux denrichissement
Les colonies sont bien visibles aprs 18 24H dincubation
En gnral, colonies de 3 4 mm de diamtre; certainescultures donnent des colonies naines (aspect constant chez lessrovars abortusovis, typhisuis, exceptionnellement chez lesmutants
Mur muqueux visible seulement aprs plusieurs jours.Exceptionellement, on peut isoler des souches de Salmonellapoussant sous forme de colonies muqueuses dont lesdimensions et laspect rappellent Klebsiella (cette aptitude seperd aprs quelques mois de conservation)
C t b t i l i G
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Caractres bactriologiques: Genre
Salmonella
La plupart sont prototrophes et produisent du gaz enfermentant le glucose
Les souches auxotrophes appartiennent aux srovars dont
le pouvoir pathogne est restreint 1 hte particulier
Ex. S. typhi, paratyphi A, sendai que lon nisole que chez
lhomme; abortusovis que lon ne trouve que chez les
ovins, gallanarum- pullorum chez les volaillesElles ne peuvent donc pas pousser sur le citrate de
Simmons qui ne contient pas de facteurs de croissance (le
citrate y est la seule source de C)
C t b t i l i G
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Caractres bactriologiques: Genre
Salmonella
Milieux denrichissement ;
Milieux denrichissement au slnite : milieu de Leifson
Milieux au ttrathionate : milieu de Muller- Kauffmann
Milieu Rappaport :
- composition : vert de malachite, MgCl2 et ph acide
- permettent lenrichissement en Salmonella, lexception
de S. typhi et S. paratyphi A,B, et C
C t b t i l i G
Slectivit/ composition Caractres Rsultatseu
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Caractres bactriologiques: Genre
Salmonella
Slectivit/ composition Caractres
recherchs
Rsultats
2 indicateurs prsents dans le
milieu:
Bleu de bromothymol (indicateur
de pH)Fuschine acide (se colore en
prsence daldhyde)
Production dH2S
partir de
thiosulfate
La fermentationou non de 3 types
de glucides ;
saliciline,
saccharose et
lactose
Suspicion de
Salmonella si
colonies bleu- vert
centre noir
Contient 3 inhibiteurs ;
-Sels biliaires
- vert brillant
- forte concentration en citrate de
Na+
Inhibition des G+ ; croissancedifficile des G- autres que
Salmonella et Shigella
Contient du
lactose pouvant
tre ferment
Contient du
thiosulfatepouvant donner
du H2S
Colonies incolores
(lactose -)
centre noir (H2S+)
Contient 2 colorants ; bleu de
mthylne qui inhibe majorit de
flore G+ (suf strptocoque D); Bien
que les entrobactries lactose-s develo ent les
Critre de
diffrentiation:
lactose
Colonies gristres
de 1 2 mm de
diamtre
transparentes ourises ambres:
eu
Hektoen
Glose SS
EMB
XLT4
C t b t i l i G
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Caractres bactriologiques: Genre
Salmonella
Autres milieux disolement utiliss pour Salmonella ;
NBG Rambach
Drigalski
DCLS
XLT4
ONP Glati btagl Alphaglut Malo galact L(+) - sorb Lyse
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Caractres bactriologiques: Genre
Salmonella
ONP
G
(2H)
Glati
nase
(36C)
btagl
ucuro
nidase
Alphaglut
amyl
transfras
e
Malo
nate
galact
urona
te
L(+) -
tartrat
e
sorb
itol
Lyse
par
phage
01
Subs.
Enterica
- - v V - - + + +
Subs.
Salama
e
- + v + + + - + +
Subs.Arizona
e
+ + - - + - - + -
Subs.
Diarizo
nae
+ + + + + + - + +
Subs.
Houten
ae
- + - + - + - + -
Subs.
Indica
v + v + - + - + +
- - - - -
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Ex. Salmonella enterica subs. Enterica :
Caractristiques ;
ONPG-. ADH-, LDC+, ODC+ (typhi ODC-, paratyphi LDC-),
citrate +,H2S+ (typhi citrate -, H2S traces),
urase-, TDA-, indole-, VP-, glatinase-sucres + sauf inositol, saccharose, amygdaline,
Hors API 20 E ; Gaz + (sauf typhi), souvent sensible phage 01
C G
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Caractres bactriologiques: Genre
Salmonella
Identification antigniquepratique :
Etape indispensable de
lidentification des Salmonella
Ractions dagglutination sur
lame avec culture humide,surtout pour la recherche des
Ag flagellaires H (aprs avoir
vrifi que la souche nest pas
auto- agglutinable, avec de
C b i l i G
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Caractres bactriologiques: Genre
Salmonella
Dtermination des Ag somatiques O :
Groupes Agniques O : caractriss par la prsence d1 Agsomatique commun (facteur O majeur)
A lintrieur du groupe, les diffrents srotypes se distinguentsurtout par les Ag flagellaires H
Dans certains cas, lAg somatique est cach par lAg Vi qui estuniquement retrouv chez S. typhietparatyphi Cet quelquesrares souches de Dublin
Seul S. typhi est O inagglutinable par la prsence d1 Ag Vi,mais ses caractristiques biochimiques remarquables (ODC-,citrate -, gaz-) permettent de ldentifier rapidement
Lagglutinabilit par le srum Vi et lagglutination somatique Oaprs chauffage d1 suspension pendant 10min 100C
permettent de confirmer le rsultat La lutination doit tre immdiate
C t b t i l i G
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Caractres bactriologiques: Genre
Salmonella
Dtermination des Ag flagellaires H :
La grande majorit des Ag H existent sous 1 forme biphasiquecd possdant 2 spcificits Agniques diffrentes. Sont
exceptionnellement triphasiques 2 gnes sont alternativement exprims : fliCet fljB
Celles-ci pourront tre MEE par les srums anti- Hcorrespondants
Dans certains cas, l1 des 2 spcificits est prpondrente,lautre ne pouvant tre dtecte quaprs essaimage sur 1glose molle contenant de lantisrum dirig contre la phase quisexprime (mthode de Sven Gard)
LAg H est recherch lorsque lAg O a t dtermin.
Les srum anti- O,45 06,7,8 - O9 (qui reprsentent 90% des
C t b t i l i G
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Caractres bactriologiques: Genre
Salmonella
La caractrisation lysotypique,
gnotypique dans des centresspcialiss permettent 1 bonne
identification
Genre Salmonella : gnralits sur
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Genre Salmonella : gnralits sur
lpidmiologie
Largement rpandus dans la nature, dans le tube digestif desmammifres domestiques ou sauvages, des reptiles, desoiseaux, des insectes
Sont la fois commensales et pathognes, causant 1 largespectre de maladies chez lhomme et lanimal
Certaines salmonelles tel S. typhi et S. paratyphi, sontparticulirement adaptes lhomme, nayant pas dautre
hte naturel connu, et sont responsables dinfections svres
Ces 2 dernires sont responsables des fivres typhodes
Dautres comme S. typhimurium ont de multiples htes naturels.
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Fivres typhodes : pidmiologie
S. typhi et S. paratyphi :
Responsables des fivres typhodes
Lhomme est le seul rservoir
Contamination par ingestion deau et daliments
contamins par les selles humaines (malade ou porteurasymptomatique)
Dans certains cas, sont mis en cause la contamination
daliments contamins responsables de cas groups ou de
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Fivres typhodes : pidmiologie
Colonisation de la vsicule biliaire, spcialement lorsquelle
est lithiasique et excrtion intermittente des salmonelles
dans le tube biliaire
Lapplication stricte des mthodes dhygine et de salubrit
par la population diminuent la prvalence des cas de
typhode
2O OOO OOO de cas chaque anne; 600 000 dcs
0,3 cas pour 100 000 habitants dans les pays dvelopps
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Fivres typhodes : pidmiologie
Reste endmique en Asie (incidence de 900 cas pour 100
000hbts), en Afrique et en Amrique centrale)
Facteurs favorisant la forte incidence dans ces rgions ;augmentation rapide de la population; urbanisation rapide;
Eau rare ; systmes de sant peu dvelopps
Depuis le dbut des annes 70, les souches de S. typhi
rsistant au chloramphnicol, lampicilline et au
cotrimoxazole par 1 mcanisme plasmidique posent 1
problme de sant publique dans les pays dendmie
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Fivres typhodes : physiopathologie
Lingestion d1 aliment contaminant peutconduire ou non 1 infection
Survenue de signes cliniques dpend de :
- limportance de linoculum
- la virulence de la souche : Facteurs de
virulence cods par des gnes prsents sur lechromosome (S. typhi), ce qui explique la
gravit constante de linfection
- les facteurs tenant lhte
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Fivres typhodes : physiopathologie
Aprs ingestion, colonisation de la muqueuse intestinale.Frquemment suivi d1 bactrimie
1 inoculum lourd (10 exposant5 7) habituellement
ncessaire pour 1 infection chez l immunocomptent
Hypo acidit gastrique (sujet g ou sous anti- H2); 1
diminution de la motilit intestinale (mdicaments, diabte)peuvent contribuer rendre pathognes des inoculum
faibles
Importance du terrain : diabte, personnes ges,
Fi t h d h i th l i
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Fivre typhode : physiopathologie
Aprs avoir gagn lintestin, pntration sans lsion de lamuqueuse par les bactries. Il sy trouve la 2me ligne dedfense reprsente par les IgA, le mucus intestinal et lesdfensines (peptides anti- microbiens permabilisant lesmembranes bactriennes)
Aprs avoir franchit le mucus, les salmonelles interagissentavec les entrocytes (induction d1 activit phagocytaire par lessalmonelles et les cellules M de la plaque de Peyer) quipermettent leur internalisation rapide et le contact avec lescellules immunocomptentes de la sous- muqueuse
(macrophages et lymphocytes)
Les salmonelles peuvent survivre lintrieur des macrophageset mme, induire leur apoptose.
Elles colonisent les macrophages tissulaires (rate, molle
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Fivre typhode : physiopathologie
Aprs traverse de la paroi intestinale, elles gagnent lesganglions msentriques o elles vont se multiplier
1 partie des Salmonella se lysent et librent leur endotoxine .Celle- ci provoque des signes cliniques (fivre,tuphos,bradycardie) et biologique (leucopnie) et 1 irritation desplaques de PEYER qui peuvent entraner des hmorragiesintestinales et des perforations.
A partir des gg msentriques, par le canal thoracique, desSalmonella gagnent le courant sanguin (hmoculture +), etdissminent dans tous les organes (reins, foie, vsicule biliaire.Finalement, lorganisme infect produit desAc contre les Agbactriens (srodiagnostic +), qui contribue la gurison
Fi t h d li i
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Fivres typhodes : clinique
Encore appeles fivres entriques
Incubation silencieuse : quelques jours
60jours (parfois diarrhe fugace dans les 12 48H suivant 1 repas contaminant)
Troubles peu spcifiques : constipation plusfrquente que diarrhe chez ladulte, cphales,
sensation de malaise, dcalage thermique
Fi t h d li i
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Fivres typhodes : clinique
Evolution :
Vers 1 tableau clinique svre en quelques jours
Augmentation typique de la temprature de 0,5C /jr pouratteindre 40C le premier septnaire ou fivre leve
demble. Fivre en plateau 39- 40C dans la deuxime
semaine
Classique dissociation pouls temprature dans 50% des
cas
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Fivres typhodes : clinique
Angine de Duguet (10% cas), ADP
Macules et/ou papules roses au niveau des paules, duthorax, de labdomen (tches roses lenticulaires dont lamise en culture permet disoler les salmonelles
Tuphos, tat domnibulation, somnolence
Complications digestives (hmorragies, perforations),myocardiques ou crbrales (encphalites)
N.B ; En labsence de traitement, 5% des maladesdeviennent des porteurs asymptomatiques, parfois duranttoute leur vie
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Fivres paratyphodes
o Ressemblent la fivre typhode
o Moins virulentes
o Causes parS. paratyphi A et B (S.
schottmuelleri) et plus rarement S. paratyphi C(S. hirschfeldii)
Salmonelloses non typhodiques :
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Salmonelloses non typhodiques :
pidmiologie Largement rpandues dans le rgne animal (ont pu tre isols
dans pratiquement toutes les espces)
Infections plus souvent lies leau et aux aliments contamins(ufs, volailles, viandes)
La surface des ufs est gnralement contamine par desfcs, des fissures permettant la contamination de luf lui-mme
Des pidmies ayant concern plus de 200 000 personnes sontds au dveloppement de lindustrie agro- alimentaire (laitpasteuris contamin secondairement, crmes glaces,dveloppement du commerce international de fruits et lgumes)
salmonelloses non typhodiques:
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salmonelloses non typhodiques:
physiopathologie
Bactrimies souvent prcoces mais, pas toujours prolonges( lexception de S. typhimurium et parfois S. enteridis quipeuvent donner des infections systmiques)
Se multiplient dans la lamina propria et entranent 1 diarrhe
par production de toxines et par linduction de marqueurs delinflammation modifiant le transport des lectrolytes et desliquides travers la muqueuse
Les facteurs de virulence sont cods par des gnes prsents
la fois sur le chromosome et sur 1 plasmide (Ex. S.typhimurium). Ceci explique que pour 1 mme srovar, 1souche soit plus ou moins pathogne
Facteurs de virulence dus des proprits particulires des
structures de surface (lipopolysaccharides, flagelles, antigneVi ou des facteurs cods ar des nes de virulence
7/29/2019 Salmon Elles
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Salmonelloses non typhodiques : clinique
Plusieurs cas de figure ;- Portage transitoire ou chronique asymptomatique
(persistance de salmonelles dans les urines ou dans les sellesau-del de 1 an aprs infection symptomatique. Il est favorispar la prsence d1 lithiase vsiculaire)
- gastro- entrite
- bactrimie (fait souvent suite gastro- entrite)
Complications possibles ; formes septicmiques et viscrales
(infections endovasculaires; colites; infections uro- gnitales,pneumonies et empymes; infections du SNC; manifestationsosto- articulaires, infections des parties molles, infectionssplniques, )
Ces dernires sobservent surtout chez des terrains particuliers
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Salmonelloses : terrains particuliers
Nourrisson et enfants :Fivre typhode peu frquente chez le trs jeune enfant (maladie de
ladulte et de ladolescent)
Salmonelloses non typhodiques habituelles en pdiatrie
Rle protecteur important de lallaitement maternel (immaturit
immunitaire digestive de lenfant)Infections du NNE par contamination maternelle au moment delaccouchement sont toujours svres. Elles peuvent se compliquerde mningites, et surtout dabcs crbraux
Drpanocytaire :
Il a 1 risque dinfection pneumocoque et salmonelles 20 100 foissuprieur celui de la population gnrale
Lasplnie fonctionnelle joue 1 rle, ainsi que des troublesdopsonisation
Frquence des ostomylites salmonelles favorises par des infarctusosseux, pouvant survenir au cours de bactrimies
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Salmonelloses : terrains particuliers
Immunodprims :Salmonelloses et VIH :
Linfection VIH, facteur de risque majeur de linfection salmonelles
Bactrimies rcurrentes en raison de laptitude de cessalmonelles coloniser de manire durable le tube digestifsouvent ls de ces patients
Lincidence de ces bactrimies a diminu depuis quelques
annes, du fait du recours au cotrimoxazole en prvention,et de lutilisation de zidovudine qui a 1 activitantibactrienne sur les salmonelles
Sujet g :
Di ti bi l i
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Diagnostic biologique
Repose sur ;
la MEE de la Salmonellaresponsable (diagnostic direct) par
hmoculture et/ ou par coproculture,
et/ ou sur la MEE dAc spcifiques
par le srodiagnostic (diagnostic
O i t ti li i
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Orientation clinique
Gastro- entrite fbrile : - en zone dendmie
- au cours d1 pidmie- chez 1 sujet vivant au contact d1 sujet
malade ou 1 porteur chronique
Episodes fbriles rcurrents- chez 1 sujet aux antcdents de lithiase (biliaires ou mme
rnales)
- chez 1 terrain particulier (immuno- dprim, drpanocytaire,
vieillard, nourrissons,)
Septicmie
Symptomatologie vocatrice ; dissociation pouls- temprature ,Tu hos, erforations di estives, abcs rofonds,
Prlvements et transport
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Prlvements et transport
Diffrents sites (ou types) de prlvements en fonction de la clinique
2 princiapux types de prlvement ;
- le sang (hmoculture) : 10 20ml (1 2 ml chez le NRS etlenfant) de sang dans le flacon. A effectuer de prfrenceconcomittement la fivre et avant dbut dATBiothrapie (sinon,fentre de 48 72H observer)
- les selles (coproculture) : dans 1 pot strile muni d1 cuillre oud1 spatule. Ecouvillonnage rectal possible chez lenfant
Autres types de prlvement ;
- Pus (si abcs)
- Urines : 2me
jet dans 1 flacon strile prvu cet effet
Transport:
- Doit seffectuer le plus rapidement possible afin que les selles soientimmdiatement techniques. Si ce nest pas possible, conserver +4C sans dpasser 12H.
- Transport immdiat du flacon dhmoculture au laboratoire
Diagnostic biologique : diagnostic direct
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Diagnostic biologique : diagnostic direct
1- Hmoculture :
Moyen essentiel de faire le diagnostic d1 fivre typhode
Rpter de prfrence les hmocultures comme il ya peude Salmonella dans le courant sanguin
En labsence dATBiothrapie, elles sont positives dans ;
- 90% des cas durant la 1
re
semaine de la maladie (1erseptenaire)
- 75% des cas durant la 2me semaine de la maladie (2meseptnaire)
- 40% des cas durant la troisime semaine de la maladie3me se tnaire
Diagnostic biologiq e diagnostic direct
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Diagnostic biologique : diagnostic direct
Devant toute suspicion de positivit avec le systme manuel ou
avec le systme automatique (dtection de production de CO2rflectomtrie ou fluorescence), procder lexamen du bouillonsuivant :
- Etat frais
- Coloration de Gram
La microscopie permet dorienter le choix du milieu ;
- milieux gloss non slectifs tel glose colombia avec 5% desang incub en arobiose 2 jrs et en anarobiose 5jrs
- milieux slectifs SS, Hekton
Identification par les caractres biochimiques
Lespce en cause est ensuite prcise par ses caractresantigniques
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Diagnostic biologique : diagnostic direct
1- Coproculture:
Il reste souvent ngatif et nest pas le meilleur
moyen de faire le diagnostic de la fivretyphode
Constitue 1 bon moyen de sassurer la fin dutraitement que le sujet nest pas devenu porteur
chronique de Salmonellaet donc, quil ne
constitue pas 1 source de contamination pour
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Diagnostic biologique : diagnostic direct
Principales tapes de lexamen bactriologique desselles :
Macroscopie: Toujours la noter.
Microscopie :
- Etat frais permet de dceler la prsence de leucocytes
et dhmaties (ventuellement de parasites), Salmonellatant 1 germe invasif
- Etalement sur lames + coloration au bleu de mthylne
ou au Giemsa (aprs schage) : permet de dceler la
prsence dhmaties
Diagnostic biologique : diagnostic direct
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Diagnostic biologique : diagnostic direct
Culture :
Se fait sur milieu slectif avant et aprs prculture sur milieuxdenrichissement
Milieux denrichissement :
- au slnite : milieu de Leifson
- au ttrathionate : Mueller- Kauffmann
- Y ajouter 0,5 mL de selles. A repiquer aprs 3 6H maximum dincubation 37C afin dviter la multiplication des bactries commensales mal inhibes au-del de ce dlai
Milieux slectifs pourSalmonella- Shigella ;
- glose Hektoen
- glose Salmonella Shigella (SS)
- milieux chromognes (permettent 1 diffrenciation plus aise des salmonelles(SM ID2, OSCM II,)
N.B ; - Incubation des diffrents milieux 37C
- Il nya pas de milieux denrichissement pourShigella
Diagnostic biologique : diagnostic direct
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Diagnostic biologique : diagnostic direct
Dmarche diagnostique :
1- Aspect des colonies :
Milieu Hektoen (aprs 24H 37C) : colonies lactose, etH2S+ (centre noir) sont suspectes
Glose SS : colonies incolores ou faiblement colores
avec ou sans centre noir sont 1 forte prsomption de
Salmonella
Milieux chromognes : dtection spcifique de l estrase
Di ti bi l i di ti di t
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Diagnostic biologique : diagnostic direct
2- Recherche de lurase(3 5 tubes dure lire en
15min 4H) : -
3- Mini- galerie :Caractre Salmonella Salmonella paratyphi
A
Glucose + +
Lactose - -
Indole - -
Gaz + +
H2S + + (le plus souvent)
Citrate - -
ONPG
LDC
-
+
-
-
Shigella
+
-
-
-
-
-
-
Di ti bi l i di ti di t
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Diagnostic biologique : diagnostic direct
N.B; - mobilit de S. typhifaible (aspect en houpe)- Le LDC fait la diffrence entre S. paratyphi A et les autresSalmonella
- Il existe des souches de Salmonella ayant acquis 1plasmide de mtabolisme du lactose. Ils ne sont isols surtout
que par hmoculture car sont ignors par la coproculture-A ce stade, ou beaucoup plus aprs diagnostic despce par
la galerie API 20E, on peut procder des agglutinations
4- Galerie API 20 E; lyse par les bactriophages spcifiques;
ATBiogramme
Diagnostic diffrentiel : Essentiellement avec ;
- Hafnia alvei
- Citrobacter freundii- +
i di t
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indirect
2- Srodiagnostic de la fivre typhode :
Se fait par le srodiagnostic de WIDAL et FELIX
(suspensions standardises 0 et H)
Permet de dtecter la prsence dans le sang dAc dirigs
contre les constituants des Salmonella
Les Ac anti- O apparaissent vers le 7- 8 jour ( srodg de
Widal ngatif lors de la 1re semaine), atteignant leur
maximum vers le 14mejour, restent en plateau jusqu la
4me semaine puis disparaissent rapidement. Ils
Di ti bi l i
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Diagnostic biologique
Les Ac anti- H apparaissent vers le 10me jour, montent
rapidement pour atteindre 1 maximum de 1/800me 1/
1600me vers le 14mejour, restent en plateau jusqu la
4me semaine et diminuent ensuite
A linverse desAc anti- O, ils ne disparaissent pas
compltement. Ils persistent toute la vie 1 taux de lordrede 1/ 200me
Ce test nest pas le meilleur moyen de faire le diagnostic
biologique de la fivre typhode et linterprtation des
Diagnostic biologique : fivre typhode
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Diagnostic biologique : fivre typhode
Sujet atteint de fivre typhode et ayant reu trs
prcocment des ATB : les Ac anti-O ne peuvent pas
apparatre et les Ac anti-H ne peuvent atteindre qu1 taux
faible. Parfois, ni les Ac anti-O, ni les Ac anti-H
nappairaissent
Des rcidives de fivre typhode peuvent sobserver mme
chez des sujets porteurs de taux levs dAc anti- O et
anti- H (la prsence dAc nassure pas toujours limmunit)
Le sujet vaccin peut avoir 1 persistance des Ac anti TH,
AH et BH. Cette signature srologique ne doit pas dans ce
cas, faire considrer le diagnostic comme positif
Diagnostic biologique des gastro- entrites
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Diagnostic biologique des gastro entrites
Salmonella
Il repose sur lisolement de la Salmonella par
coproculture ; les hmocultures et le
srodiagnostic sont ngatifs, la Salmonelle
restant purement digestive
Chez les terrains particuliers cits plus haut, les
Salmonella mineures sont susceptibles de
franchir la barrire intestinale, provoquer 1
septicmie et donner des hmocultures +
Traitement curatif
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Traitement curatif
ATB utilis doit avoir 1 activit bactricide rapide
ATB doit avoir des concentrations sriques et tissulaires
(intestin, ganglions lymphatiques msentriques, ),
intracellulaires et surtout intramacrophagiques suffisantes
Le chloramphnicol (notion de mylotoxicit), les
aminopnicillines, et le cotrimoxazole sont restslongtemps les traitements de rfrence
Lmergence de souches multirsistantes a conduit
valuer dautres schmas dantibiothrapie
Traitement curatif
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Traitement curatif
Autres ATB utiliss :
- Cphalosporines : C3G sont utiliss avec efficacit (les C1Get C2G ne doivent pas tre utiliss car bien qutant -actives invitro, nont pas montr defficacit suffisante dans le T3 des FT)
- Fluoroquinolones : efficacit remarquable du fait de leurexcellent pntration cellulaire et de leur forte concentrationbiliaire et intestinale
- Lazithromycine: bien quayant 1 activit modeste in vitro, a
1 bonne concentration intracellulaire et sest montr aussiefficace que la ciprofloxacine. Souvent utilise pour les souchesrsistantes aux fluoroquinolones
N.B ; Les gastro- entrites Salmonella gurissent le plus
souvent spontanment ; le T3 se rsume le plus souvent la
Traitement curatif
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Corticodes et T3 adjuvants :
Rhydratation + rgime sans rsidu indispensables
Corticodes rservs aux fivres typhodes dtat de choc ou detroubles de conscience pour 1 dure nexcdant pas 48H(risque de rechutes si ce dlai dpass)
Chirurgie : cas de perforation digestive et abcs
Antibiothrapie prolonge pour les atteintes osseuses
Porteurs chroniques: Difficults dradication de S. typhiquand il existe 1 lithiase vsiculaire ou rnale. 1 T3 paramoxicilline (6g/jr) pendant 6 semaines peut permettrelradication ou ciprofloxacine (1g/jr) ou (norfloxacine (800mg/jr)pendant 4 semaines peut permettre lradication . Lacholcystectomie tant discute en cas dchec
Prophylaxie
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ProphylaxieMesures gnrales ;
Distribution deau contrle bactriologiquement etassainissement de toutes les eaux de boissons
Traitement des eaux uses
Pasteurisation des aliments (ufs, beurre et lait enparticulier)
Eviction scolaire jusqu la gurison clinique Isolement des malades
Enqutes pidmiologiques (pidmies,) et dpistage desporteurs chroniques (3 coprocultures ngatives permettentde conclure larrt du portage)
Traitement des pisodes aiges et des porteurs chroniques
Surveillance pidmiologique nationale (restaurateurs,collectivits,)
Lavage des mains avant le repas
Utilisation de latrines bien construites et rpondant aux
Prophylaxie
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Prophylaxie
Vaccination :
En raison de sa tolrance mdiocre, le vaccin inertecomplet TAB, seul disponible pendant longtemps a t
abandonn malgr son faible cot
2 autres sont actuellement disponibles ;
- vaccin inerte fractionn (Typhim Vi par Aventis-
Pasteur; Typherix par GlaxoSmithKline)- vaccin vivant attnu (vivotif Berna Vaccine)
N.B; Elle est obligatoire pour lexercice de certaines
professions (militaires) et pour des sujets qui voyagent d1
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FIN
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