IhoKeuhkotSuolistoSukuelimetSuuNapajne..
http://www.advisoranalyst.com/glablog/2013/11/25/thehumanmicrobiome.html
300400 neliömetriäsuoliston pintaaruuansulatukseen
http://blog.prestonbailey.com
Auawise at en.wikipedia
Brysselin torin kukkamatto
Suolistomikrobiston metagenomi~ 1 0^1 4 bakteeria (1 0 x)
~ 3.3 miljoonaa geeniä (1 50 x)
~ 500 miljardia DNA-emäsparia
~ 600,000 bakteerigeeniä/hlö (30x)
- plastinen ja muovautuva
Ihmisen perimä~ 1 0^1 3 solua
~ 22,000 geeniä
~ 3 miljardia DNA-emäsparia
- staattinen ja muuttumaton
Mikrobiekosysteemi virtuaalinen elin
gutpower.com
> ihminen on 90% bakteereita!~ 5,000–10,000 suoliston bakteeri"lajia"(>97% samankaltaisuus perimässä)~ 5001,000 lajia / hlö
Zulut (< 5:1 00,000)
Amerikan afrikkalaiset(65:1 00,000)
Lihansyönti nostaapaksusuolen syövän riskiä
Mikrosirut mittausvälineinä
Mikrosiru mittaa bakteerien 16S rRNAgeeniä>1000 bakteeri"lajia" (>98% sequence identity)
> 130 sukua (>90% sequence identity)> 23 pääjaksoa (70%)
RajilicStojanovic et al. Environ Microbiol 2009Rajilic–Stojanovic et al. Gastroenterology 2011Zoetendal et al. Mol Microbiol 2006
Geenisekvensointi mittausmenetelmänä:miljoonan palan palapeli
http://www.nimr.mrc.ac.uk/millhillessays/bringingitallbackhomenextgenerationsequencingtechnologyandyou
Suolistomikrobiston kartoitus
1 000 bakteeria ~ 5000 ihmistä ~ 1 0,000 sirua
5000 ihmistä
10
00
ba
kte
eri
a
-> Mikrobikoostumus on yksilöllinen ja vaihtuva !
Ihmisten kolme ryhmää?
Universaalit 'enterotyypit'
Ekosysteemin vaihtoehtoisettasapainotilat
- Jensen-Shannon divergence asdissimilarity measure
- Kalinski-Harabash index to determinecluster number
Nature 473, 174–180 (12 May 2011)
Suolistomikrobistoon vaikuttaminen?- Ruokavalio, elintavat, perimä
- Antibiootit (tappaa pahikset ja muita)
- Probiootit (= hyviä mikrobeja)
- Prebiootit (edistää hyvisten kasvua)
- Ulosteensiirto (ekosysteemin vaihto)
Ekosysteemin hoivaaminen:antibiooteista luonnolliseenhoitoon ja vahvistamiseen
Els van Nood et al., NEJM 368(5) 201 3
Ulosteensiirto erittäin tehokasekosysteeminen hoito Clostridiumdifficileripulipotilailla !
Potilaalle kehittyyluovuttajan bakteerikanta
-> Luovuttajafarmit !?
Estää uusiutumisenparemmin kuin antibiootit !
Blaser et al. Nature 201 1
Antibioottien käyttö lapsena lisää suolistontulehdussairauksien riskiä
Suolistoon kytkeytyvät sairaudet ovatlisääntyneet nopeasti viime vuosikymmeninä?
Bach NEJM 2002
"Hunajan prebiootit,kuidunkaltaisethiilihydraatit. edistävätterveyttätasapainottamallasuolistomikrobistoa. Lisäksiprebiootit tehostavatkivennäisaineiden, kutenkalsiumin, magnesiumin jaraudan imeytymistäohutsuolesta."
Prebiootit: ravintoahyville mikrobeille
Probiootit: hyvät mikrobitosana ruokavaliota
(Lactobacillus rhamnosusGG-seurantatutkimus)
Lahti et al. PeerJ 201 3
Lisää luettavaa
Suolistomikrobit ja niiden merkitys terveydelle. Airi Palva. Duodecim 2009;1 25(6):685-94
Tanssii bakteerien kanssa; Pentti Huovinen 201 2 (kirja)
Mind-altering microorganisms: the impact of the gut microbiota on brain and behaviour
http://www.nature.com/nrn/journal/v1 3/n1 0/abs/nrn3346.html (Cryan & Dinan Nature
Reviews Neuroscience 1 3, 701 -71 2 (October 201 2))