Módulo I.I – Biologia Molecular e Celular
CARDIOMIOPATIA HIPERTRÓFICA
Margarida Fernandes
Brandon Allan Carolina Medo
João Faria Daniel Carvalho2013/2014
Heterogeneidade génica Descrição da doençaManifestações clínicasHereditariedadeDiagnósticoMappingTratamentosDados populacionaisPateogénese
1. A) QUE INFORMAÇÕES SOBRE HCM SE PODEM OBTER NESTA BASE DE DADOS (OMIM OU GENETESTS)?
O QUE É UM SARCÓMERO?
Autossómica Recessiva.
1. c) Que gene ou genes se associam à doença e qual é a sua localização genómica?
21 genes, entre os quais TNNT2.
1. b) Que tipo de hereditariedade se associa a esta doença?
Proteína Gene LOCUS
Cadeia pesada β - miosina
MYH7 14q12
Proteína C que liga à miosina
MYBPC3 11p11.2
Troponina T cardíaca
TNNT2 1q32
Troponina I cardíaca TNNI3 19q13.4α-Tropomiosina TPM1 15q22.1Cadeia leve miosina reguladora
MYL2 12q24.11
Teletonina TCAP 17q12Troponina C TNNC1 3p21.1Titina TTN 2q31α2-Actina ACTN2 1q43Cadeia leve miosina essencial
MYL3 3p21.2-p21.3
α-Actina ACTC1 15q11-q14Cisteína e Glicina tipo 3
CSRP3 11p15.1
Cadeia pesada da α-miosina
MYH6 14q12
CONTINUAÇÃO 1.C)
1.B) QUE
PROTEÍNAS SÃO
CODIFICADAS POR ESTE OU
ESTES GENES?
Proteína Gene LOCUS
F actin binging protein
CMH20 1p31.1
Calreticulin 3 CALR3 19p13.11
Phospholamban PLN 6q22.31
Junctophilin 2 JPH2 20q13.12
Myozenin 2 MYOZ2 4q26
Vinculin CMH15 10Q22.2
2. RELATIVAMENTE AO GENE ASSOCIADO À DOENÇA EM ESTUDO (CONSIDERAR O GENE TNNT2 NA HCM), PROCURE-O NUMA BASE DE DADOS DE SEQUÊNCIAS GENÓMICAS, ENSEMBL OU NCBI.
2.1. EM QUE CROMOSSOMA ESTÁ ESTE GENE LOCALIZADO, NO GENOMA HUMANO?
2.2. EM QUE ESPÉCIES EXISTEM ORTÓLOGOS DO GENE SELECIONADO ?
55 espécies diferente
s
2.3. Quantos exões/intrões tem?
Este gene contém 16 exões e 15 intrões.
2.3.1. Qual é a estrutura deste gene?
TnC
Ião cálcio
TnT
TnI
2.4. Quantos transcritos alternativos estão descritos para o gene no genoma humano? Em que diferem estes transcritos?
12
3) PROCURE EM BASES DE DADOS (OMIM) AS MUTAÇÕES DO GENE SELECIONADO QUE
SÃO ASSOCIADAS COM FENÓTIPOS PATOLÓGICOS
QUE TIPOS DE MUTAÇÕES ESTÃO IDENTIFICADAS?
Mutações no gene TNNT2:•6 mutações cardiomiopatia dilatada•31 mutações cardiomiopatia hipertrófica•1 variante de efeito desconhecido•5 polimorfismos
EM QUE REGIÕES DO GENE SE LOCALIZAM ESSAS MUTAÇÕES?
4. CONSULTE UMA BASE DE DADOS DE PROTEÍNAS, UNIPROTKB
OU SWISS-PROT/EXPASY. PROCURE A INFORMAÇÃO RELATIVA À PROTEÍNA
CODIFICADA PELO GENE EM ESTUDO.
4.1. A PROTEÍNA CODIFICADA TEM DOMÍNIOS FUNCIONAIS DESCRITOS?
4.2.AS MUTAÇÕES ASSOCIADAS À DOENÇA EM ESTUDO LOCALIZAM-SE EM
ALGUM DOMÍNIO FUNCIONAL RECONHECIDO DA PROTEÍNA?
From:Circ Cardiovasc, Genet.Author manuscript; available in PMC 2010 AugustPublished in final edited form as:Circ Cardiovasc Genet. 2009 August; 2(4): 306–313.Published online 2009 May 15. doi: 10.1161/CIRCGENETICS.108.846733
4.1. A proteína codificada tem domínios funcionais descritos?
5. ESTRUTURA TRIDIMENSIONAL DA TNNT2
5.EXISTE ESTRUTURA TRIDIMENSIONAL DESCRITA PARA O PRODUTO DO GENE ?
Troponin C
Troponina I
Troponin T
Ião Cálcio
O arranjo tridimensional por vezes corresponde à estrutura que confere à
proteína uma função biológica específica
5. IMPORTÂNCIA DO CONHECIMENTO DE UMA ESTRUTURA TRIDIMENSIONAL
6. INTERACTOMA DA PROTEÍNA CODIFICADA PELO GENE ASSOCIADO À DOENÇA
As proteínas que acabou de identificar
têm alguma associação com a
patologia?
6. COM QUE PROTEÍNAS INTERAGE?
6. A REDE DE INTERAÇÕES DETERMINADA ESTÁ CONSERVADA EM OUTROS ORGANISMOS
6. A REDE DE INTERAÇÕES DETERMINADA ESTÁ CONSERVADA EM OUTROS ORGANISMOS
FIM
Top Related