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UFRJ - UNIVERSIDADE FEDERAL DO RIO DE JANEIRO IMPPG - INSTITUTO DE MICROBIOLOGIA PAULO DE GÓES
PROFESSOR COORDENADOR: CARGA HORÁRIA/ CRÉDITOS: PERÍODO DE REALIZAÇÃO: Período Letivo Excepcional / 2020-4-0
CÓDIGO DISCIPLINA DURAÇÃO PROFESSOR RESPONSÁVEL
EMENTA DA DISCIPLINA
IMW015 ASP MORF E FUNC DO SIST IMUNOL
15H Profa Renata
Meirelles
Operacionalização das Práticas Remotas (ex. aulas demonstrativas gravadas, estudo dirigido, análises de bioinformática, etc):
IMM001
EPIDEMIOLOGIA MOLECULAR DE BACTÉRIAS DE
INTERESSE MÉDICO
30H Prof Tatiana Pinto
A disciplina abordará os princípios e aplicações dos principais métodos moleculares utilizados para caracterização epidemiológica de agentes bacterianos, assim como algumas das principais ferramentas disponíveis para interpretação e análise dos resultados. Serão apresentadas, de forma teórica e/ou demonstrativa, através de exercícios interativos, metodologias consideradas de referência para este propósito, assim como também serão apresentadas propostas mais recentes e metodologias consideradas emergentes em Bacteriologia. É aconselhável que o aluno tenha previamente noções de biologia molecular de bactérias. As aulas serão assíncronas.
IMW004
DIVERSIDADE
METABÓLICA DE MICRORGANISMOS
PROCARIOTOS
30H Profa Carolina
Kein
Temas: alimento, ecologia microbiana, deterioração, microrganismos indicadores, patogênicos e seus métodos de detecção, além dos métodos de controle microbiológico e garantia da qualidade na produção de alimentos. Enfocam-se as características microbiológicas de alimentos lácteos, cárneos, vegetais e bebidas, além de microrganismos probióticos e utilização de microrganismos na produção dos alimentos. São feitas visitas a indústrias de alimentos
IMW017
EVOLUÇÃO DO SISTEMA IMUNE
30H Profa Juliana
Echevarria
Estudo da origem e evolução do Sistema Imune em mamíferos através da comparação dos componentes da resposta Imune Inata e Adaptativa encontrados em invertebrados e vertebrados
IMW105
INTRODUÇÃO À BIOINFORMÁTICA E A FILOGENIA
30H Prof Andrew
Macrae
Esta disciplina tem como objetivo apresentar uma introdução à bioinformática, com teoria e prática com as ferramentas de bioinformática. O curso
MOLECULAR
aborda as bases biológicas de dados, tipos de alinhamentos, introdução ao Linux para execução de ferramentas de alta performance por linha de comando, montagem de genomas, transcritômica por RNA-seq, métodos para interpretação dos resultados de RNA-seq e filogenia e taxonomia molecular. A realização de aulas práticas em laboratório de computadores que permitam exercitar o conhecimento teórico adquirido também faz parte do conteúdo programático. A avaliação será realizada a partir da apresentação de seminários de artigos pelos alunos e da realização de trabalho prático durante as aulas.
IMW021
FUNDAMENTOS DE VIROLOGIA VEGETAL
30H Profa Maite Vaslin F Silva
Fundamentos da virologia vegetal dando uma visão geral sobre seus diversos aspectos incluindo: características gerais do vírus vegetais, transmissão, espalhamento no hospedeiro, mecanismos de expressão de seus genomas, respostas dos hospedeiros à infecções virais e mecanismos virais de evasão da resposta de defesa.
IMW202
MICROBIOLOGIA DA POLUIÇÃO AMBIENTAL
30H Profa Carolina
Keim
Estudo da poluição ambiental e ecotoxicologia, com ênfase nas interações dos microrganismos com poluentes químicos orgânicos e inorgânicos e na participação dos microrganismos nos processos de poluição e despoluição, assim como a sua utilização como indicadores de poluição.
IMW009 VACINAS 30H Profa Clarissa
Palatnik
Será analisado o impacto da utilização de vacinas em Saúde Pública e o desenvolvimento de vacinas contra infecções e câncer. Será estudada a evolução de vacinas compostas pelos germes vivos, atenuados, inativados, pelas suas toxinas e a sua evolução até vacinas com antígenos quimicamente definidos, recombinantes, vacinas gênicas e vacinas sintéticas. Serão estudados os formatos para avaliação da eficácia de vacinas em
testes clínicos Fase I, II, III e IV e o cálculo
de amostras. Será aprofundado o estudo dos mecanismos de ação de adjuvantes, de vacinas sem agulha, e da resposta vacinal associada com histocompatibilidade. Será dada especial atenção ao desenvolvimento de vacinas contra Influenza e contra COVID19. Os alunos receberão as aulas téoricas gravadas pelo Google classrooom e haver horários de trabalho em conjunto “live”
através do Zoom. Haverá uma aula pratica sobre imuno informática por Zoom. Os alunos apresentarão seminários através do Zoom. A Nota final se comporá da nota sobre o seminário apresentado, da assiduidade e participação nos seminários dos colegas e de um relatório final em word, encaminhado aos professores por email, sobre o seminário apresentado.
IMW001 INTRODUÇÃO À MICROSCOPIA
15H Profa Fernanda
Abreu
Conhecimentos básicos sobre microscopia de luz e microscopia eletrônica utilizados para microbiologia. Serão abordados a utilização dos princípios de física óptica e os procedimentos de preparo de amostras para a obtenção de informações microscópicas sobre espécimes microbianos.
IMW014
MICROBIOTA HUMANA NA SAÚDE E NA DOENÇA
45H Leandro Araujo Lobo e Rosana
Barreto Ferreira
Estudo da interação entre bactérias residentes da microbiota e o hospedeiro humano, incluindo: (i) conceitos de colonização e aquisição da microbiota e microbioma humano; (ii) papel da microbiota na saúde humana com exemplos de pesquisas com animais axênicos e transgênicos, além de humanos; (iii) métodos de estudo da microbiota. Ao final do curso, o aluno deverá ser capaz de compreender a natureza dualística da associação entre humanos e sua microbiota residente.
DATA HORÁRIO TIPO DE AULA
ASP MORF E FUNC DO SIST IMUNOL (IMW015)
TURMA PROFESSOR
Avaliação: Participação nas discussões; EDs; Apresentação de trabalho
Segunda-Feira 21/09/2020
10h às 12h
Síncrona Assíncrona
Introdução Aspectos Gerais da Resposta Imune
Renata
Frederico
Terça-Feira 22/09/2020
10h às 12h Assíncrona
Resposta imune a infeções Resposta Imune e a Tumores
Renata
Frederico
Quarta- Feira 23/09/2020
10h às 12h Assíncrona Diferenciação e exaustão de células T Renata
Quinta-Feira 24/09/2020
10h às 12h Síncrona Discussão e ED
Renata
Sexta-Feira 25/09/2020
10h às 12h Assíncronas Manipulação genética de células T em imunoterapias
Terapias baseadas em bloqueio de receptores inibitórios Renata
Segunda-Feira 28/09/2020
10h às 12h Síncrona Discussão e ED Renata
Terça-Feira 29/09/2020
10h às 12h Síncrona Apresentação de trabalhos sobre imunoterapia
DATA HORÁRIO TIPO DE AULA
EPIDEMIOLOGIA MOLECULAR DE BACTÉRIAS DE INTERESSE
MÉDICO (IMM001)
TURMA PROFESSOR
De 31/08/2020 às 11/09/2020 - Aulas gravadas e discussões em tempo real pela plataforma Google Classroom
Segunda-Feira 31/08/2020
9h às 12h Introdução ao tema: Conceitos e aplicações dos diferentes métodos aplicados a epidemiologia molecular de bactérias de interesse médico
Tatiana Pinto
Terça-Feira 01/09/2020
9h às 12h Métodos moleculares envolvendo sequenciamento de DNA bacteriano: MLST e variações, WGS.
Tatiana Pinto
Quarta-Feira 02/09/2020
9h às 12h Métodos moleculares baseados em amplificação de DNA bacteriano: RAPD.
Tatiana Pinto
Quinta-Feira 03/09/2020
9h às 12h Estudo dirigido e discussão das aulas.
Tatiana Pinto
Sexta-Feira 04/09/2020
9h às 12h Métodos moleculares baseados na análise de regiões repetitivas do DNA bacteriano: MLVA.
Tatiana Pinto
Terça-Feira 08/09/2020
9h às 12h Métodos moleculares baseados em sistemas de restrição: PFGE.
Tatiana Pinto
Quarta-Feira 09/09/2020
9h às 12h Estudo dirigido e discussão das aulas
Tatiana Pinto
Quinta-Feira 10/09/2020
9h às 12h Revisão da aulas
Tatiana Pinto
Sexta-Feira 11/09/2020
9h às 12h Avaliação
Tatiana Pinto
DATA HORÁRIO TIPO DE AULA
DIVERSIDADE METABOLICA DE MICRORGANISMOS PROCARIOTICOS
(IMW004)
AVALIAÇÃO DATA DE ENTREGA
PROFESSOR
Sexta-feira 28/8/2020
09 às 11hs síncrona Noções básicas de bioquímica do metabolismo microbiano google forms 04/09/2020
Caroline keim
Sexta-feira 4/9/2020
09 às 11hs Assíncrona Fotossíntese estudo dirigido
11/09/2020 Caroline keim
Sexta-feira 11/9/2020
09 às 11hs Assíncrona Fixação de CO2
produção de esquema
18/09/2020
Caroline keim
Sexta-feira 18/9/2020
09 às 11hs Assíncrona
Quimiolitotrofia; Oxidação de H2
estudo dirigido 25/09/2020
Caroline keim
Sexta-feira 25/9/2020
09 às 11hs Assíncrona
Oxidação de S e Fe
trabalho escrito 02/10/2020
Caroline keim
Sexta-feira 2/10/2020
09 às 11hs Assíncrona Oxidação de N
trabalho escrito 09/10/2020
Caroline keim
Sexta-feira 9/10/2020
09 às 11hs Assíncrona Respiração anaeróbia; Redução de N
Estudo Dirigido 16/10/2020
Caroline keim
Sexta-feira 16/10/2020
09 às 11hs Assíncrona Redução de Fe e Mn
trabalho escrito 23/10/2020
Caroline keim
Sexta-feira 23/10/2020
09 às 11hs Assíncrona Redução de S
trabalho escrito 30/10/2020
Caroline keim
Sexta-feira 30/10/2020
09 às 11hs Assíncrona Redução de CO2
trabalho escrito 06/11/2020
Caroline keim
Sexta-feira 06/10/2020
09 às 11hs Assíncrona Metilotrofia
trabalho escrito 13/11/2020
Caroline keim
Sexta-feira 13/11/2020
09 às 11hs Assíncrona Diversidade metabólica de microrganismos no ambiente
trabalho escrito 16/11/2020
Caroline keim
DATA HORÁRIO TIPO DE AULA
EVOLUÇÃO DO SISTEMA IMUNE (IMW017)
PROFESSOR
Segunda-Feira 24/08/2020
14h às 15h Síncrona
Assíncrona
Apresentação da disciplina.
Noções gerais da evolução. CRISPRs e a resposta imune em procariotos.
Juliana Echevarria
Segunda-Feira 31/08/2020
Assíncrona
Atividade sobre a aula CRISPRs e a resposta imune em procariotos.
Origem e evolução da imunidade Inata: Fagocitose
Juliana Echevarria
14h às 15h Síncrona TIRA DÚVIDAS
Segunda-Feira 07/09/2020
Assíncrona
Atividade sobre a aula sobre Evolução dos mecanismos de Fagocitose.
Origem e evolução da imunidade Inata: Peptídeos Antimicrobianos
Juliana Echevarria
14h às 15h Síncrona TIRA DÚVIDAS
Segunda-Feira 14/09/2020
Assíncrona
Atividade sobre a aula de Evolução dos Peptídeos Antimicrobianos.
Origem e evolução da imunidade Inata: Evolução dos Receptores de Padrões Moleculares de Patógenos
Juliana Echevarria
14h às 15h Síncrona TIRA DÚVIDAS
Segunda-Feira 21/09/2020
Assíncrona
Atividade sobre a aula de Evolução dos Receptores de Padrões Moleculares de Patógenos
Origem e evolução do Sistema Complemento
Juliana Echevarria
14h às 15h Síncrona TIRA DÚVIDAS
Segunda-Feira 28/09/2020
Assíncrona
Atividade sobre a aula de Origem e evolução do Sistema Complemento
Evolução da imunidade Adaptativa
Juliana Echevarria
14h às 15h Síncrona TIRA DÚVIDAS
Segunda-Feira 05/10/2020
Assíncrona
Atividade sobre a Evolução da imunidade Adaptativa
Evolução da imunidade Adaptativa
Juliana Echevarria
14h às 15h Síncrona TIRA DÚVIDAS
Segunda-Feira 12/10/2020
Assíncrona
Co-evolução dos mecanismos de patogenicidade e proteção
Avaliação
Juliana Echevarria
14h às 15h Síncrona TIRA DÚVIDAS
DATA HORÁRIO TIPO DE AULA
INTROUÇÃO À BIOINFORMÁTICA E A FILOGENIA MOLECULAR
PROFESSOR
Terça-Feira 25/08/2020
15h às 17h Síncrona
Google Meet
Aula 1: Introdução e histórico da bioinformática.
Andrew Macrae
Terça-Feira 01/09/2020
15h às 17h Síncrona
Google Meet
Aula 2: Bases de dados primárias e secundárias
Andrew Macrae
Terça-Feira 08/09/2020
15h às 17h Síncrona
Google Meet
Aula 3: Alinhamento global e local
Andrew Macrae
Terça-Feira 15/09/2020
15h às 17h Síncrona
Google Meet
Aula 4: Introdução ao Linux - aula 1
Andrew Macrae
Terça-Feira 22/09/2020
15h às 17h Síncrona
Google Meet
Aula 5: Introdução ao Linux - aula 2
Andrew Macrae
Terça-Feira 29/09/2020
15h às 17h Síncrona
Google Meet
Aula 6: Alinhamento de sequencias e Linux- Prática
Andrew Macrae
Terça-Feira 06/10/2020
15h às 17h Síncrona
Google Meet
Aula 7: Montagem de genoma
Andrew Macrae
Terça-Feira 13/10/2020
15h às 17h Síncrona
Google Meet
Aula 8: Transcritômica por RNA-seq
Andrew Macrae
Terça-Feira 20/10/2020
15h às 17h Síncrona
Google Meet
Aula 9: Interpretação de expressão diferencial, ontologia gênica e KEGG Aula 10: 2ª Avaliação (apresentação de trabalho prático)
Andrew Macrae
Terça-Feira 27/10/2020
15h às 17h Síncrona
Google Meet
Aula 10: Introdução a taxonomia e filogenia molecular – MEGA
Andrew Macrae
Terça-Feira 03/11/2020
15h às 17h Síncrona
Google Meet
Aula 11: Introdução a taxonomia e filogenia molecular – MEGA
Andrew Macrae
Terça-Feira 10/11/2020
15h às 17h Síncrona
Google Meet Aula 12: Apresentações e discussão final
Andrew Macrae
DATA HORÁRIO TIPO DE AULA
FUNDAMENTOS DE VIROLOGIA VEGETAL (IMW021)
TURMA PROFESSOR
Dinâmica: Aulas serão gravadas e envio de questões e artigos para discussão on line serão disponibilizadas pela plataforma Google Classroom. As discussões e Eds serão realizadas via plataforma Google Meet
Quarta-Feira 27/08/2020
08h às 12h
aula gravada
Introdução à virologia vegetal. Características dos vírus vegetais, morfologia, composição e estrutura. Doenças
causadas por vírus vegetais Maite Vaslin F Silva
10-12 h ED com alunos on line google meet
Quarta-Feira 02/09/2020
08h às 12h
aula gravada
Como se dá a infecção. Translocação e distribuição dos vírus vegetais pela planta. Espalhamento sistêmico e célula a célula.
Maite Vaslin F Silva
10-12 h ED com alunos on line google meet
Quarta-Feira 09/09/2020
08h às 12h
aula gravada
Síntese viral. Replicação, mecanismos de expressão de genomas RNA e DNA.
Maite Vaslin F Silva
10-12 h ED com alunos on line google meet
Quarta-Feira 16/09/2020
08h às 12h
aula gravada
Interação vírus:célula. Sítios de replicação, localização subcelular de ptns virais. Transmissão de vírus vegetais.
Maite Vaslin F Silva
10-12 h ED com alunos on line google meet
Quarta-Feira 23/09/2020
08h às 12h
aula gravada
Resposta do hospedeiro às infecções virais. Proteínas de defesa. RNAi. Proteínas supressoras de RNAi.
Maite Vaslin F Silva/Prof.
Régis L.orrêa
10-12 h ED com alunos on line google meet
Quarta-Feira 30/09/2020
08h às 12h
Epidemiologia de vírus vegetais e viroides. Detecção e identificação de vírus vegetais Perdas agronômicas associadas a
viroses no Brasil
Maite Vaslin de F Silva Roberto Tarazi
10-12 h ED com alunos on line google meet
Quarta-Feira 07/10/2020
08h às 12h
On line Google
Docs Prova I on line google docs Maite Vaslin F Silva
Quarta-Feira 14/10/2020
10h às 12h
On line Google
Docs Profa Final on line google docs Maite Vaslin F Silva
DATA TIPO DE AULA
MICROBIOLOGIA DA POLUIÇÃO AMBIENTAL
AVALIAÇÃO DATA DE ENTREGA
PROFESSOR
Terça-Feira 25/8/2020
Síncrona
Assíncrona Noções de ética ambiental
google forms 01/09/2020
Carolina Keim
Terça-Feira 01/09/2020
Assíncrona O que é Poluição; Excesso de nutrientes Trabalho Escrito
08/09/2020 Carolina Keim
Terça-Feira 08/09/2020
Assíncrona Poluentes inorgânicos (metais, gases inorgânicos, radionuclídeos) Trabalho Escrito
15/09/2020 Carolina Keim
Terça-Feira 15/09/2020
Assíncrona
Poluentes orgânicos
Trabalho Escrito 22/09/2020
Carolina Keim
Terça-Feira 22/09/2020
Assíncrona
Biodegradação de xenobióticos
Trabalho Escrito 29/09/2020
Carolina Keim
Terça-Feira 29/09/2020
Assíncrona Biorremediação Trabalho Escrito
06/10/2020 Carolina Keim
Terça-feira 06/10/2020
Assíncrona Distribuição de poluentes no ambiente Trabalho Escrito
13/10/2020 Carolina Keim
Terça-feira 13/10/2020
Assíncrona Efeitos de poluentes em organismos vivos e ecosistemas
Trabalho Escrito 20/10/2020
Carolina Keim
Terça-feira 20/10/2020
Assíncrona Tratamento de efluentes e resíduos sólidos
Trabalho Escrito 27/10/2020
Carolina Keim
Terça-feira 27/10/2020
Assíncrona Tratamento de água; Qualidade de água
Mudanças ambientais e doenças infecciosas; Microorganismos em
Google Forms 03/11/2020
Carolina Keim
Terça-feira 03/11/2020
Assíncrona aerosóis Trabalho Escrito
10/11/2020 Carolina Keim
Terça-feira 10/11/2020
Assíncrona Microrganismos e o aquecimento global Trabalho Escrito
17/11/2020
Carolina Keim
DATA HORÁRIO TIPO DE AULA
VACINAS ( IMW009)
PROFESSOR
Quinta-Feira 27/08/2020
13h às 17h
Teórica Gravada e
distribuição de
seminários online
Introdução. O que se espera de uma vacina eficaz?
Antígenos. Desenvolvimento de vacinas de primeira, Segunda e Terceira geração. Testes de FASE I,II,III,IV
CB Palatnik de Sousa
Quinta-Feira 03/09/2020
13h às 17h Gravada e
online
Ensaios clínicos e de campo com fins de registro. Cálculo de amostra
CB Palatnik de Sousa
Quinta-Feira 10/09/2020
13h às 17h Gravada e
online
Adjuvantes e o seu mecanismo de ação
CB Palatnik de Sousa
Quinta-Feira 17/09/2020
13h às 17h Gravada e
online
Vacinas sem agulhas. Imunização por via Mucosa
CB Palatnik de Sousa
Quinta-Feira 24/09/2020
13h às 17h Gravada e
online
Vacinas contra Influenza e COVID-19
CB Palatnik de Sousa José Nelson Couceiro
Quinta-Feira 01/10/2020
13h às 17h Gravada e
online
Escalonamento industrial de vacinas
Dirlei Nico
Quinta-Feira 08/10/2020
13h às 17h Gravada e
online
Desenvolvimento de vacinas sintéticas.
Dirlei Nico
Quinta-Feira 15/10/2020
13h às 17h Gravada e
online
Programa Nacional de imunizações
Dirlei Nico
Quinta-Feira 22/10/2020
13h às 17h Gravada e
online Prova final
CB Palatnik de Sousa Dirlei Nico
DATA HORÁRIO TIPO DE AULA
INTRODUÇÃO À MICROSCOPIA (IMW001)
PROFESSOR
Segunda-Feira 21/09/2020
09h às12h
Assíncrona Google
Classroom
Introdução à Microscopia de Luz
Fernanda Abreu
Segunda-Feira 28/09/2020
09h às12h
Assíncrona Google
Classroom
Microscopia eletrônica de transmissão:
Fernanda Abreu
Segunda-Feira 05/10/2020
09h às12h
Assíncrona Google
Classroom
Microscopia eletrônica de varredura
Fernanda Abreu
Segunda-Feira 19/10/2020
09h às12h
Assíncrona Google
Classroom
Métodos especiais em microscopia
Fernanda Abreu
Segunda-Feira 26/10/2020
09h às12h
Assíncrona Google
Classroom
Avaliação
Fernanda Abreu
DATA HORÁRIO TIPO DE AULA
MICROBIOTA HUMANA NA SAÚDE E NA DOENÇA ( IMW014)
PROFESSOR
Bem-vindxs alunas e alunos! As aulas gravadas serão disponibilizadas na plataforma google classroom
Em algumas datas (quarta-feira, às 13hs), nos encontraremos no google meet para atividades síncronas, incluindo a discussão dos artigos e respostas às perguntas postadas no google classroom. A participação nos encontros síncronos é altamente recomendada! Fiquem atentos para as datas.
A nota final será uma combinação entre a apresentação de um seminário e os exercícios propostos e corrigidos nas aulas síncronas.
PARTE I
Quarta-Feira 26/08/2020
09h às12h Síncrona
MODULO 1: Introdução ao Curso
Prof.Leandro Lobo e Profa Rosana Ferreira
Quarta-Feira 02/09/2020
09h às12h
Assíncrona
MODULO 2: Técnicas para o estudo da microbiota
Profa Karla Rodrigues
Quarta-Feira 02/09/2020
09h às12h
Assíncrona
MÓDULO 3: Modelos animais para o estudo da microbiota humana Profa Rosana Ferreira
Quarta-Feira 09/09/2020
09h às12h
Assíncrona
MÓDULO 4: Microbiota da cavidade oral Profa Talita Baeta
Quarta-Feira 09/09/2020
09h às12h
Assíncrona
MODULO 5: Microbiota da pele e trato respiratório
Profa Rosana Ferreira
Quarta-Feira 16/09/2020
09h às12h Síncrona Todos os professores da
Parte I
PARTE II
Quarta-Feira 23/09/2020
09h às12h
Assíncrona
MÓDULO 6: Microbiota do trato gastrointestinal Prof.Leandro Lobo
Quarta-Feira 23/09/2020
09h às12h
Assíncrona
MÓDULO 7: Microbiota do trato genito-urinário Prof. Felipe Teixeira
Quarta-Feira 30/09/2020
09h às12h
Assíncrona
MÓDULO 8: Micobioma e Viroma humano Prof. Leandro Lobo
Quarta-Feira 07/10/2020
09h às12h Síncrona Todos os professores da
PARTE II
PARTE III
Quarta-Feira 14/10/2020
09h às12h
Assíncrona
MÓDULO 9: O efeito de quimioterápicos e outras susbtâncias na microbiota Prof. Eliane Ferreira
Quarta-Feira 14/10/2020
09h às12h
Assíncrona
MÓDULO 10: Probióticos, prebióticos e simbióticos Prof. Leandro Lobo
Quarta-Feira 21/10/2020
Assíncrona MÓDULO 11: Bioprospecção da Microbiota humana Prof. Heidi Pauer
Quarta-Feira 04/11/2020
09h às12h Síncrona Todos os professores da
PARTE III
PARTE IV
Quarta-Feira 11/11/2020
09h às12h Síncrona MÓDULO 12: Apresentação de seminários Prof. Leandro Lobo e
Rosana Ferreira