Titre, tableaux et diagrammesPage 1 Le titre, les tableaux et les graphiques Professeur François...
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Titre, tableaux et diagrammesPage 1
Le titre, les tableaux et les graphiques
Professeur François Kohler Septembre 2007
F. KohlerTitre, tableaux et diagrammesPage 2
Le titre
• Une gageure avec une apparente contradiction :– Court– Simple– Complet
• Pour relever le défi :– Pas de bois mort– Position forte respectée
F. KohlerTitre, tableaux et diagrammesPage 3
Un bon titre
• Commence par les mots importants
• Contient (uniquement) les mots indispensables
• Dit l’essentiel=> Choisir les mots clés
F. KohlerTitre, tableaux et diagrammesPage 4
Exemple
• Devenir des femmes fistuleuses. Notre expérience sénégalaise.
• Suivi sur 5 ans d’une cohorte de 250 femmes fistuleuses sénégalaises.
F. KohlerTitre, tableaux et diagrammesPage 5
Exemple
• Les bandelettes urinaires dans le diagnostic de l’infection du liquide d’ascite
• Caractéristiques diagnostiques de la bandelette urinaire par rapport à l’examen cytobactériologique dans l’infection du liquide d’ascite. Etude cas témoins sur 200 sujets.
F. KohlerTitre, tableaux et diagrammesPage 6
Présentation des résultats : Tableaux et paramètres
• Les distributions de fréquences• Les paramètres statistiques
– Une moyenne, un pourcentage seul ne veulent rien dire.
– Ils doivent être accompagnés :• De l’effectif • D’un paramètre de variabilité
F. KohlerTitre, tableaux et diagrammesPage 7
Distribution Distribution des 200 poids observés
Poids (kg) Effectif FréquenceEffectifCumulé
FréquenceCumulée
52 1 0,01 1 0,01
53 5 0,03 6 0,03
54 8 0,04 14 0,07
55 10 0,05 24 0,12
57 12 0,06 36 0,18
58 15 0,08 51 0,26
59 18 0,09 69 0,35
60 22 0,11 91 0,46
61 25 0,13 116 0,58
63 21 0,11 137 0,69
64 18 0,09 155 0,78
65 16 0,08 171 0,86
67 10 0,05 181 0,91
68 8 0,04 189 0,95
69 5 0,03 194 0,97
70 3 0,02 197 0,99
71 2 0,01 199 1,00
72 1 0,01 200 1,00
F. KohlerTitre, tableaux et diagrammesPage 8
Table de contingence
• Ethylisme et tabac
Cancer du
poumon + Cancer du
poumon - Total
Ethylisme +
73
927 1 000
Ethylisme -
37
963 1 000
Total
110 1
890 2 000
F. KohlerTitre, tableaux et diagrammesPage 9
Table de contingence
• Pour une case– Effectif de chaque case– Pourcentage en ligne– Pourcentage en colonne– Fréquence
• Notion d’indépendance• Reproductibilité/Indépendance
F. KohlerTitre, tableaux et diagrammesPage 10
Table de contingence
• Fréquences relatives– Cancer chez les éthyliques : R1 = 73/1000– Cancer chez les non éthyliques: R0 = 37/1000
• Risque relatif – RR = R1/R0 = 0,073/0,037 =1,97
• Cote (Odds) (cf course de chevaux)– Chez les éthyliques R1/(1-R1) = 0,79– Chez les non éthyliques R0/(1-R0) = 0,038
• Odds ratio ou rapport de cotes– OR = 0,79/0,038 = 2,05
• L’OR est souvent utilisé en épidémiologie. Si la fréquence de la maladie est faible, les valeurs de OR et de RR sont très proches.
F. KohlerTitre, tableaux et diagrammesPage 11
Table de contingence Les effectifs sont donnés
dans chaque caseCancer dupoumon +
Cancer dupoumon - Total
Tabagisme +
Ethylisme +
70
630 700
Ethylisme -
30
270 300
Total
100
900 1 000
Tabagisme -
Ethylisme +
3
297 300
Ethylisme -
7
693 700
Total
10
990 1 000
Total
10 1 890 2 000
F. KohlerTitre, tableaux et diagrammesPage 12
Table de contingence• Chez les fumeurs, la fréquence du cancer est de 100/1000 = 0,1 contre 10/1000
= 0,01; RR = 10– Le tabagisme est un facteur de risque pour le cancer du poumon, car les fumeurs ont 10
fois plus de risque de développer un cancer du poumon que les non-fumeurs.
• Quel est le RR d'être alcoolique pour les fumeurs par rapport aux non fumeurs ?RR = 700/1000 / 300/1000 = 2,3
– Il existe une association entre le tabagisme et l'éthylisme. Les fumeurs ont 2,3 fois plus de chance d'être alcooliques que les non-fumeurs.
• Le tabagisme est un facteur de confusion dans cette étude, les données doivent être analysées en tenant compte de cette variable.
• Calculer le RR (éthylisme) dans chaque strate ?Tabagisme+ RR = 70/700 / 30/300 = 1Tabagisme - RR = 3/300 / 7/700 = 1
• L'association entre éthylisme et cancer du poumon dans les données brutes (RR = 1,97) est le produit d'un biais de confusion. Car à l'intérieur des différentes strates du "tabagisme" il n'existe aucune association entre éthylisme et le cancer du poumon : RR = 1.
Intérêt des études multivariées
F. KohlerTitre, tableaux et diagrammesPage 13
Les paramètres• De position
– Moyenne arithmétique– Médiane– Quartiles et percentiles– Fréquence (relative) : pourcentage
• De dispersion– Amplitude– Variance et écart type (es, sd)– Ecart type de la moyenne– Coefficient de variation– Ecart type de la moyenne (esm, sdm)
• L’intervalle de confiance
• RR et OR
• Dans le paragraphe matériel et méthodes on précise ce qui est fourni :– « Les moyennes sont accompagnées de l’écart type de la moyenne »
F. KohlerTitre, tableaux et diagrammesPage 14
Les tableaux de paramètres
• Résument les résultats• Vérifier que pour chaque
paramètre – Les effectifs sont fournis. Attention au
pb des valeurs manquantes s’ils ne sont pas égaux
– Les moyennes sont accompagnées d’un paramètre de dispersion
F. KohlerTitre, tableaux et diagrammesPage 15
P : degré de signification
• Risque alpha (1ére) et beta (2ième espèce)
• p• Puissance d’un
test
Réalité
= #
Test =
Beta
#
Alpha
F. KohlerTitre, tableaux et diagrammesPage 16
Tableau de paramètres
F. KohlerTitre, tableaux et diagrammesPage 17
Tableau de paramètres
Facteurs de risque significativement associés au décès en analyse multivariées
Eléments de comparaison OR* IC 95%** p
Age (années) 1,14 1,06-1,22 0,0001
Sexe masculin 3,62 1,40-9,33 0,0070
Escarre (présence) 2,96 1,17-7,40 0,0200
Sonde à demeure (présence) 3,44 1,00-11,8 0,0500
Préalbumine (mg/L) 1,42 0,71-2,32 0,0600
Comorbidités 1,60 1,00-2,23 0,0500
SAMR 6,14 1,69-10,3 0,0020
* Odds Ratio ajusté sur l'ensemble des facteurs présents dans le modèle
** Intervalle de confiance à 95%
F. KohlerTitre, tableaux et diagrammesPage 18
Graphiques
• Histogramme• Diagramme sectoriel• Nuage de points• Courbe de survie• Box plot• Pareto courbe ABC• …
F. KohlerTitre, tableaux et diagrammesPage 19
Histogramme
• Variable quantitative mise en classe• Rectangle dont la surface est
proportionnelle à l’effectif (ou l’effectif cumulé ou la fréquence ou la fréquence cumulée de la classe)– => La hauteur est proportionnelle à ni/i
• Excel® ne fait pas d’histogramme si les classes ne sont pas de même amplitude
F. KohlerTitre, tableaux et diagrammesPage 20
HistogrammeClasse Effectifs Densité (*10)
[140-160[ 10 5
[160-165[ 20 40
[165-170[ 30 60
[170-175[ 45 90
[175-180[ 40 80
[180-185[ 35 70
[185-190[ 15 30
[190-200[ 5 5140 160 170 180 190
010
20
3040
50
60
7080
90
200
F. KohlerTitre, tableaux et diagrammesPage 21
Diagramme sectoriel
Groupe EffectifsA 35B 9O 40AB 16
A
BO
AB
F. KohlerTitre, tableaux et diagrammesPage 22
Quel objectif ?
• Un tableau
0 + ++ Total
Groupe A
20
10
5
35
Groupe B
10
5
40
55
Total
30
15
45
90
Intensités des cuti réactions dans chaque groupe (effectifs)
F. KohlerTitre, tableaux et diagrammesPage 23
Une représentation
0+++
Groupe A
0+++
Groupe BGroupe A Groupe B
0 + ++
F. KohlerTitre, tableaux et diagrammesPage 24
Une autre
0 + ++0
10
20
30
40
50
Groupe AGoupe B
F. KohlerTitre, tableaux et diagrammesPage 25
Une dernière
0 + ++0
100
200
300
400
500
600
700
800
900
1000
0
50
100
Goupe BGroupe A
Où est le piége
Valeur
Gou
pe B
Gro
upe
A
F. KohlerTitre, tableaux et diagrammesPage 26
Nuage de points
F. KohlerTitre, tableaux et diagrammesPage 27
Nuages de points/Régression-corrélation
F. KohlerTitre, tableaux et diagrammesPage 28
Courbes de survie
Kapla – Meier. Les intervalles de confiance à 95% sont indiqués par les barres verticales
F. KohlerTitre, tableaux et diagrammesPage 29
Box Plot / Moyenne et IC
71 210 268 342 741
A B C D
mg/L
100
50
0
F. KohlerTitre, tableaux et diagrammesPage 30
Courbe ABC et Pareto
Effectif % de anomaliesDossier comportant des piéces non "signées" 180 39,74%Délai de la lettre de sortie noin respecté 150 33,11%Absence d'une piéce réglementaire 80 17,66%Doosier ne permettant pas de retrouver la démarche clinique 30 6,62%Dossier comportant des piéces sans identification du patient 10 2,21%Dossiers non retrouvés 3 0,66%Total 453 100,00%
0,00%
10,00%
20,00%
30,00%
40,00%
50,00%
60,00%
70,00%
80,00%
90,00%
100,00%
Dossiercomportant des
piéces non"signées"
Délai de la lettrede sortie noin
respecté
Absence d'unepiéce
réglementaire
Doosier nepermettant pasde retrouver la
démarcheclinique
Dossiercomportant des
piéces sansidentification du
patient
Dossiers nonretrouvés
Anomalies rencontrées lors du contrôle de qualité des dossiers médicauxNombre de dossiers analysés = 200, Nombre d’anomalies trouvées = 453
F. KohlerTitre, tableaux et diagrammesPage 31
Recommandations générales
• Tableaux et figures– Doivent être compréhensibles indépendamment du
texte (titre, légendes, unités,…)– Ne doivent pas dupliquer l’information fournie dans
le texte– Ne doivent pas se dupliquer les uns les autres– Doivent apparaître au bon moment– Doivent être appelés dans le texte– Doivent respecter les règles de mise en forme
(alignement décimal, NA ou DM,…)– Doivent respecter les règles usuelles de présentation
• En colonne Malades/Non Malades, en ligne Test +/ Test – ou facteur d’exposition + et - …