TAXONOMIA Bacterias

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TAXONOMIA

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TAXONOMIA

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PROCARIONTES (PRENUCLEO): BACTERIA Y ACHAEA

Dominio bacteria

Bacteria (procariotas unicelulares cuya pared celular contiene peptidoglucano)

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Aquifex

El género Aquifex es un hipertermófilo obligatoriamente quimiolitotrófica y autótrofa y es el más termófilo de todos los conocidos bacterias .

Aquifex es un género de bacterias, uno de los pocos en el filo Aquificae. Las dos especies generalmente clasificadas en Aquifex son A. pyrophilus y A. aeolicus. Ambas son altamentetermófilas, creciendo mejor en temperaturas acuáticas de 85 a 95 °C. Crecen a menudo cerca de los volcanes subacuáticos o fuentes hidrotermales.

Son las BACTERIAS MAS ANTIGUAS : Quimiolitotrofas, Autótrofas, LAS MASHIPERTERMÓFILAS del dominio BACTERIA , Aerotolerantes

Utilizan el Hidrógeno, el Azufre elemental y el Tiosulfato como donadores de electrones y como aceptores el Oxígeno y los Nitratos

Poseen un cromosoma pequeño (1,55 Mb : 1/3 del genoma de E. coli )

Géneros representativos: Aquifex, Hydrogenobacter ( aerobio)

Aquifex pyrophilus 

Thermodesulfobacterium

Las termodesulfobacterias (Thermodesulfobacteria) son un pequeño filo de bacterias reductoras de sulfato termófilas. Según la clasificación actual podemos encontrar dos géneros dentro de este filo de bacterias, Thermodesulfobacterium y Thermodesulfatator.

CARACTERISTICAS GENERALES

Bacterias aún mas antiguas

Anaerobios estrictos. Termófilos y Sulfatorreductoras

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Membrana Plasmática con lípidos típicos, comparte características de Arquea (enlace éter) y Bacteria (Ácidos grasos)

Género representativo : Thermodesulfobacterium

 

Thermodesulfobacterium mobile

Thermotoga

Thermotoga es típicamente un género bacilar de bacterias de la clase y philum thermotogae en el que sus bacterias están envueltas en una membrana externa de la célula (la “toga”). Son gram negativos. Las enzimas de Thermotoga se sabe que son activas a temperaturas muy altas, lo que le confiere estabilidad a esas temperaturas. Thermotogales es extremadamente termoestable y por lo tanto útil para muchos procesos industriales por ejemplo en sectores alimenticios. Son bacterias anaerobias, quimioorganotrofo , y además tiene organismo fermentativo que cataboliza azucares y polimeros como el almidón para producir lactato, acetato, CO2 y H2 como productos de su fermentación.

CARACTERISTICAS GENERALES

POSEEN UNA CUBIERTA EXTERNA ,“ TOGA”, que la recubre y que se extiendedesde cada extremo de la célula

Una de las ramas más antiguas

Anaerobias e hipertermófilas

Quimiorganotrofo. Fermentador

Genoma pequeño, 1,8 Mb

Hábitat terrestres, manantiales calientes y fuentes hidrotermales submarinas

Géneros representativos : Thermotoga, Geotoga

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Thermotoga maritima 

Bacterias verdes no del azufre

Son Anoxifotobacterias que utilizan como donadores de electrones SH2 y a veces SO4 2-

La mayoría autótrofos

Morfología muy variada: cadenas de cocobacilos, formando entramados ….

Mas antiguas que las Cianobacterias

Muy alejadas filogenéticamente de los otros dos grupos de anoxifotobacterias, Bacterias Púrpura y Heliobacterias

Poseen Bacterioclorofila a junto a c, d, o e y Carotenoides de color verde

El aparato fotosintético está localizado en Clorosomas y membrana plasmática

Viven a grandes profundidades

Algunas forman “Consorcios” con bacterias quimiorganotrofas

Géneros representativos: Chlorobium, Pelochromatium, Pelodictyon

 

Deinococci

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Estas bacterias tienen paredes celulares gruesas que les dan Gram-positivas manchas, pero que incluyen una segunda membrana y por lo tanto están más cerca en estructura a Gram-negativas bacterias. También se caracterizan por la presencia del pigmento carotenoide deinoxanthin que les dan su color rosa, así como una alta resistencia a la gamma y la radiación UV, por lo general se aíslan de acuerdo con estos dos criterios.

CARACTERISTICAS GENRALES

Son cocos que dan positiva la tinción de Gram pero su pared es diferente a la delgrupo de bacterias Gram positivas:

o Tiene varias capas, una similar a la Membrana externa de Gram negativas, sin lípido A

o Peptidoglucano con L- Ornitina

o Carecen de Ácidos Teicoicos

o Membrana Plasmática rica en Ácido Palmitoleico en lugar de fosfolípidos

La mayor parte son pigmentados, rosa, rojo, por la presencia de Carotenoides yforman tétradas

EXTREMADAMENTE RESISTENTES A LA RADIACIÓN Y A LA DESECACIÓN

Se aíslan de carne picada, heces, aire, agua ,suelos , pero su hábitat natural esdesconocido

Géneros representativos : Deinococcus y Thermus ( Gram negativa, termofílica, quimiorganotrofa y aerobia . De la especie T. aquaticus se obtiene la Taq polimerasa, termorresistente)

 

ESPIROQUETAS

Protozoario espiral de cuerpo delgado y flexible, que se desplaza por movimientos activos. Las espiroquetas son bacterias que poseen unas características morfológicas y unos órganos de locomoción que les diferencian del resto de las bacterias.

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FLAVOBACTERIAS

Género bacteriano perteneciente al grupo de las flavobacterias organotrofas. Se trata de

bacilos aerobios, inmóviles. Gram negativos. Típicos de agua dulce y salada, alimentos, y plantas

procesadoras. Es una especie comensal en ciertos animales acuáticos.

Existe asimismo alguna especie patógena oportunista de humanos y peces. Por

ejemplo, Flavobacterium psychrophilum causa la enfermedad del agua fría.

Algunas especies o géneros relacionados tienen carácter psicrófilo.

BACTERIAS VERDES DEL AZUFRE

Las bacterias verdes sulfurosas son un pequeño grupo fotolitroautrofos obligados que

usan H2S, S como donantes de electrones. Las estructuras donde se alamacenan los

pigmentos fotosintéticos se conocen como clorosomas o vesículas clorobiales. Estos

clorosomas contienen pigmentos bacterioclorófilos.

Estas bacterias se encuentran en las partes ricas de azufre y anaerobias de los lagos.

Algunas de estas bacterias contienen vesículas para ajustar su profundidad para conseguir

un óptimo de luz y H2S ya que estas bacterias no son móviles.

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Se encuentran unicelulares o en agregados, su movilidad es por deslizamiento, estructura fotosintética en clorosomas, crecimiento fototrófico bajo condiciones anaeróbicas (generalmente).

CHLAMYDIA

es un género de bacterias gramnegativas perteneciente a

la familia Chlamydiaceae, orden Chlamydiales , filo Chlamydiae.

Castellanizado como "clamidia", y genéricamente entendido como plural ("las clamidias") para

hacer referencia a Chlamydia spp., la taxonomía y nomenclatura de este grupo es un tema

controvertido sobre el cual no existe un total acuerdo entre los expertos (ver sección

Taxonomía más adelante), así como tampoco la forma de contagio. Con la información disponible

en la actualidad, taxonómica y sistemáticamente, el género Chlamydia incluye tres especies: C.

trachomatis, C. muridarum y C. suis.

PLANTOMYCES Planctomyces es una bacteria marina que se puede encontrar en varios hábitats en todo el

mundo. Planctomycetes en general son interesantes porque son las únicas bacterias libres

conocidos a la falta de peptidoglicano en sus paredes celulares. En muchos casos, su ADN

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está rodeado por una membrana similar a una eucariota "membrana nuclear," pero se

desarrolló de forma independiente.

PIRELLA

Los verrucomicrobios (Verrucomicrobia) son un filo recientemente descrito de bacterias. Este filo contiene sólo unas pocas especies, siendo Verrucomicrobia spinosum la que ha dado nombre al grupo. Las especies identificadas han sido aisladas del agua dulce, del suelo, agua de mar y heces humanas. Se aisló en aguas termales a Methylacidiphilum infernorum, un autótrofo-metanótrofo hiperacidófilo.

Cytophaga

Cytophaga es un género de bacterias Gram-negativas , deslizantes , bacterias con forma de varilla.

Defferibacter

Phylum 16 Defferibacter

Incluye especies anaeróbicas

facultativas.

Respiran anaeróbicamente.

Reduce metales en el exterior de la célula

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empleando diversos aceptores de e

-

: reduce

Fe

3+ y/o Mn

2+

.

Termofílica, se aísla de las profundidades

marinas de los ventos hidrotermales.

Flexistipes: presenta menos versatilidad en

aceptores de e

- dado su metabolismo

principalmente fermentativo.

PROTEOBACTERIAS

Contiene fotótrofos, litótrofos y organótrofos:

Rhodocyclus, fotótrofa.

Nitrosomonas, Spirillum, Bordetella, Neisserian, no

fluorescentes y Sphaerotilus, con vaina, oxidan

metales.

Thiobacillus, litótrofa, oxidan Fe y S.

Alcaligenes, litótrofa, oxidan H.

Neisseria, organótrofa oxidativa.

Algunas Pseudomonas, organótrofas, respiratorias.

Las proteobacterias (Proteobacteria) son uno de los principales grupos de bacterias. Incluyen una gran variedad de patógenos, tales como Escherichia, Salmonella, Vibrio,Helicobacter, Neisseria gonorrhoeae, la Burkholderia glumae y muchos otros.1

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Cinco clases de Proteobacterias

Phylum 1

Proteobacterias

La comparación de

secuencias muestra a

las mitocondrias como

representantes del

grupo

PROTEOBACTERIAS

como Escherichia (γ) y

Agrobacterium (α)

La mitocondria la cual

deriva de simbiontes

bacterianos, que se

especializaron por

coevolución con la

célula que los

hospedaba.

Nitrospira

Son quimiolitotrofas

Oxida nitroso a nítrico

Comparte nicho ecológico con las Proteobacterias nitrificantes

Filogenéticamente diferente a ellas y carece del sistema de membranas internas

Es la única bacteria nitrificante NO Proteobacteria

Leptospirillum

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Quimiolitotrofo

Oxida el hierro a pH ácido: convierte el Sulfato ferroso en férrico

Responsable del drenaje ácido de las minas

Comparte hábitat con Acidithiobacillus, una Proteobacteria

Thermodesulfovibrio

Es reductora de Sulfato

Termofílica : Manantiales de agua caliente

BACTERIAS GRAM POSITIVAS

Las bacterias gram positivas poseen paredes celulares gruesas hechas de polímeros complejos de azúcar y aminoácidos. Estas bacterias se pueden distinguir de las bacterias gram negativas, en que tienen paredes celulares más delgadas, mediante la absorción de tinte durante el método de tinción de Gram. Las bacterias gram positivas son responsables de la faringitis estreptocócica, la neumonía y el botulismo, así como de la producción de productos lácteos como el yogur.

Las Actinobacterias o actinomicetos son un grupo de bacterias Gram positivas. La

mayoría de ellas se encuentran en la tierra, e incluyen algunas de las más típicas formas de vida terrestre, jugando un importante rol en la descomposición de materia orgánica, tales como la celulosa y quitina. Estas bacterias renuevan las reservas de nutrientes en la tierra y son fundamentales en la formación de humus. Otras Actinobacterias habitan en las plantas y animales, incluyendo algunos patógenos, tales como las Mycobacterium.

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CIANOBACTERIAS. CARACTERISTICAS GENERALES

Morfología variada: unicelulares y filamentosas móviles por deslizamiento

Presentan diferenciaciones celulares: Heteroquistes y Acinetos

Realizan Fotosíntesis Oxigénica. Presentan Ficobilisomas

Fijan Nitrógeno, producen Geosmina y Toxinas

Se dividen por fisión binaria, gemación o fisión múltiple

Están presentes en numerosos hábitat: Superficie e interior de rocas, suelos desérticos, estanques y lagos, en simbiosis con Hongos, Protozoos y plantas...

Son componentes básicos de los Estromatolitos. Hay restos fósiles de mas de 3000 millones de años de antigüedad. Probablemente fueron los primeros organismos productores de Oxígeno

Actualmente 24 géneros: Chroococcus, Synechococcus, Anabaena, Spirulina, Nostoc, Oscillatoria...

 

DOMINIO ARCHAEA

Arquea (procariotas unicelulares cuya pared celular no contiene peptidoglucano)

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METAGONEGOS HALOFILOS

Las arqueas metanógenas son microorganismos procariontes que viven en medios estrictamente anaerobios y que obtienen energía mediante la producción de gas natural, el metano(CH4). Gracias a esta característica, este tipo de organismo tiene una gran importancia ecológica, ya que interviene en la degradación de la materia orgánica en la naturaleza, y en el ciclo del carbono.1

 organismos que viven en medios con presencia de gran cantidad de sales.

Ferroplasma

Ferroplasma es un género de microorganismos del dominio Archaea. Comprende solamente una especie, F. acidophilum, un acidófilo oxidante del hierro. Al contrario que otros miembros deThermoplasmata, F.acidophilum es un mesófilo que crece optimamente a una temperatura óptima de aproximadamente 35 ºC y a un pH de 1,7

Picrophilus

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Picrophilus es un género de microorganismos del dominio Archaea. Comprende dos especies de acidófilos extremos: P. oshimae y P. torridus. Estos microorganismos son los más acidófilos actualmente conocidos, con la capacidad de sobrevivir a un pH de 0.06. Son acidófilos obligados, pues son incapaces de mantener la integridad de su membrana a un pH mayor que 4. Filogenéticamente están relacionados con los otros miembros de Thermoplasmata, pero al contrario que Thermoplasma y Ferroplasma, Picrophilus tiene una pared celular del tipocapa S.

Thermoplasma

 Thermoplasma son anaerobios facultativos y respiran utilizando sulfuro de carbono y orgánicos. No contienen una pared celular pero contienen una membrana única compuesta principalmente de un tetraether lipoglycan atípica que contiene lípidos tetraether archaeal unido a una glucosa - y manosa que contiene oligosacárido. 

Methanospirillum

Methanosarcina es un género de microorganismos del dominio Archaea. Es el único metanógeno anaerobio conocido que produce metano usando las tres rutas metabólicas que se conocen para la metanogénesis [1] . La mayoría de los metanógenos generan metano a partir de dióxido de carbono e hidrógeno

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Natronococcus

Halococcus es un género de archaea extremadamente halófilas, es decir, que requieren altos niveles de sal, a veces tan altas como 32% de NaCl, para un crecimiento óptimo.

Euryarchaeota

Las euriarqueotas (Euryarcheota) o euriotas1 son un filo (y también un reino) del dominio Archaea. Es uno de los dos grupos principales de arqueas y originalmente fue separado del otro grupo (Crenarchaeota) basándose en las secuencias del ARNr. Son procariontes simples y abarcan un conjunto amplio y diverso de microorganismos.

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Archaeoglobus es un género de microorganismos hipertermófilos del dominio Archaea. Se compone de dos especies, A. fulgidus y A. profundus que fueron aisladas de fuentes hidrotermales. Archaeoglobus se puede también encontrar en los yacimientos de petróleo a alta temperatura donde puede contribuir a la descomposición del petróleo. El crecimiento óptimo de estos organismos se produce a aproximadamente 83 °C.

Methanobacterium

Methanothermus

Methanocaldococcus

es un género de cocoides metanógenos. Todos ellos son mesófilos, excepto el termófilo M. thermolithotrophicus y hyperthermophilic M. jannaschii.

Los termococos (Thermococci) son unan clase de arqueas del filo Euryarchaeota. Se incluye en el filo Euryarchaeota. Viven en ambientes extremadamente calientes como fuentes hidrotermales con una temperatura óptima de crecimiento superior a

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80 °C. Thermococcus y Pyrococcus (literalmente "bola de fuego") son ambos quimiorganotrofos anaerobios obligados.Thermococcus prefiere 70-95 °C, mientras que para Pyrococcus es 70-100 °C. Palaeococcus helgesonii es un microorganismo recientemente descubierto en el mar Tirreno, quimioheterótrofo aerobio  o microaerobio que crece a temperaturas de 45-85 °C con un óptimo de aproximadamente 80 °C. 

Methanopyrus

Methanopyrus es un género de microorganismos metanógenos del dominio Archaea.1 Comprende una única especie descrita, M. kandleri. Es un hipertermófilo descubierto en las paredes de una fuente hidrotermal en el Golfo de California a una profundidad de 2000 m y a temperaturas de 84-110 °C, llegando a alcanzar el récord de supervivencia a más alta temperatura, 122 °C.

Pyrodictium

Pyrodictium es un género de arqueobacterias hipertermófilos, quimiolitótrofos y anaeróbicos estrictos, que crecen a pH neutro en fuentes termales submarinas empleando azufre elemental como aceptor de electrones. Una característica sorpresiva de este género, que su temperatura óptima de crecimiento (105 °C) está por sobre la temperatura de ebullición de agua (a 1 atm), hecho no obstante, no exclusivo de este género (Pyrolobus crece a una temperatura de 113 °C).

En taxonomía , Thermoproteus es un género de la Thermoproteaceae . Estos procariotas son termófilas organismos de azufre-dependientes relacionadas con los géneros Sulfolobus , Pyrodictiumy Desulfurococcus . [ 1 ] Ellos son hidrógeno-azufre autótrofos y puede crecer a temperaturas de hasta 95 ° C.

Las crenarqueotas (Crenarchaeota), también llamadas crenotas1 o eocitos,2 son un filo (o también reino) de arqueas. Inicialmente se pensaba que incluía sólo organismoshipertermófilos, frecuentemente quimiosintetizadores dependientes del azufre

Sulfolobus es un género de arqueas del orden sulfolobales que crecen en aguas termales y lo hacen de manera óptima cuando hay un pH entre 2 y 3, y temperaturas de entre 75 a 80 °C, conviertiéndolas en acidófilas y termófilas respectivamente. Las células de Sulfolobus tienen formas irregulares y están flageladas.

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Desulfurococcus es un género de termófilo, arqueas anaeróbicas, aislados de los que se

encuentran en hábitats hipertermia, como chimeneas termales de aguas profundas y aguas

termales subterráneas. Su temperatura óptima de crecimiento es 85 º C. Tienen una interesante

estructura de proteínas cubierta celda de la red-como (ver la imagen).

Eukarya EUCARIONTES (todos los eucariotas)

DIPLOMONADAS

Los diplomonádidos (Diplomonadida) o trepomonádeos (Trepomonadea) son un orden de protistas flagelados de la clase eofaríngeos, la mayoría parásitos. Incluye Giardia lamblia, que causa la giardiasis en seres humanos, y Enteromonas hominis, que parasita el tracto digestivo de humanos y otros mamíferos. Es uno de los grupos basales de protistas, se clasifica en Metamonada y parece cercanamente emparentado con Retortamonadida.

Los microsporidios (Microsporidia) son un conjunto de microorganismos parásitos intracelulares

de animales. Hay descritas unas 800 especies.

En el pasado han sido considerados erróneamente protistas y más exactamente protozoos,

concepto que no tiene valor taxonómico actualmente. En realidad son un

grupo polifilético dehongos parásitos convergentes entre sí y con otros organismos.

PARABASALIDOS

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Parabasalida es un grupo de protistas flagelados, la mayoría de los cuales son simbiontes de animales. Incluye una gran variedad de especies encontradas en el tubo digestivo determitas y cucarachas, muchas de las cuales tienen bacterias simbióticas que les ayudan a digerir la madera. Algunas otras especies son patógenos de los seres humanos.

Los euglénidos (Euglenoidea o Euglenophyta) son uno de los más conocidos grupos de flagelados, comúnmente presentes en agua dulce, en especial cuando ésta es rica en materia orgánica. Sólo unos pocos miembros habitan aguas marinas o son endosimbiontes. Muchos euglénidos poseen cloroplastos y producen energía mediante fotosíntesis, mientras que otros se alimentan por fagocitosis o por pinocitosis. Se los ubica dentro del fila Euglenozoa, y su estructura celular es típica de dicho grupo.

Entamoeba histolytica es un protozoo parásito anaerobio con forma ameboide, como su nombre lo indica, dentro del género Entamoeba. Es patógeno para el humano y para los cánidos, causando amebiasis incluyendo colitis amébica y absceso hepático.

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Las amebas

son pequeños organismos que viven como parásitos intestinales en humanos y perros

En la clasificación científica de los seres vivos, el reino Animalia (animales) o Metazoa (metazoos) constituye un amplio grupo de organismos eucariotas, heterótrofos, pluricelulares ytisulares. Se caracterizan por su capacidad para la locomoción, por la ausencia de clorofila y de pared en sus células, y por su desarrollo embrionario, que atraviesa una fase de blástula y determina un plan corporal fijo (aunque muchas especies pueden sufrir posteriormente metamorfosis). Los animales forman un grupo natural estrechamente emparentado con los hongos. Animalia es uno de los cuatro reinos del dominio Eukaryota, y a él pertenece el ser humano.

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Los seres humanos son, desde el punto de vista biológico, una especie animal cuya denominación científica es Homo sapiens (del latín «homo», «hombre», y «sapiens», «sabio»). Pertenecen a la familia Hominidae (homínidos).