Struttura e funzione della cellula batterica...2013/06/27 · Jean-Denis Docquier Laboratorio di...
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Jean-Denis Docquier
Laboratorio di Fisiologia e Biotecnologia dei Microrganismi Dipartimento di Biotecnologie
Policlinico "Le Scotte", Viale Bracci, II piano, V lotto Tel. 0577 23 3134
Batteriologia generale:
Struttura e funzione della cellula batterica
I° anno - Laurea Magistrale in Farmacia - 2012-2013
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Microbiologia
Batteriologia
Virologia
Micologia
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Batteriologia generale
Libro di riferimento:
Brock Biology of Microorganisms
Madigan, Martinko & Parker
(Ed. Prenctice Hall)
Capitoli 2, 3 e 4
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Batteriologia
Interesse dei batteri per la Chimica Farmaceutica: •Batteri patogeni come bersaglio di farmaci (farmaci
antibatterici)
•Batteri come strumento di lavoro (produzione e controllo di farmaci, altre applicazioni biotecnologiche)
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La cellula batterica
Cellula = unità di base della vita Batteri = organismi di piccole dimensioni (~1 μm) Organizzazione cellulare procariotica Organismi unicellulari Assenza di compartimentazioni intracellulari
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Organizzazione della cellula batterica
Cellula batterica Cellula eucariotica
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Organizzazione della cellula batterica
Alcune differenze con gli eucarioti:
Procariota Eucariota
Nucleo assente presente
Materiale genetico
1 cromosoma circolare
(con eccezioni)
cromosomi lineari
Dimensione genoma (bp)
5 x 105 - 8 x 106 1,5 x 107 - 5 x 109
Orgunali citoplasmatici
solo ribosomi presenti
Citoscheletro assente presente
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Dimensioni della cellula batterica
Generalmente comprese fra 1-10 μm (inferiori a cellula eucariotica)
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Morfologia della cellula batterica
Forma regolare della cellula dovuta alla presenza della PARETE CELLULARE rigida
(eccezione, micoplasmi)
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Cocchi
Cocchi (d = 0.5-1 m) Sferici od ovoidali aventi uno o differenti organizzazioni basate sui piani di divisione cellulare:
Divisione in un piano: Diplococchi (paia di cocchi), Streptococchi (catenella di cocchi) Divisione su due piani:
Tetradi (4 cocchi disposti a quadrato)
Divisione su tre piani:
Sarcina (8 cocchi disposti a cubo) Divisione su piani casuali:
Stafilococchi (ammassi irregolari)
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Bacilli
Bacilli (0.5-1 m x 1-4 m): Allungati, con estremità arrotondate Si dividono in un piano producendo: Bacillo (singolo) Streptobacillo (catena di bacilli) Cocco-bacillo (ovalare, simile ad un cocco)
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Spirale
Spirale (1 - >100 m): Vibrione (ricurvo, a virgola) Spirillo (ispessito, spirale rigida) Spirocheta (sottile, spirale flessibile)
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Composizione della cellula procariotica
cfr. Capitolo 3 per nozioni di base
(importanza dell'acqua,
legami idrogeno, aminoacidi, proteine, basi DNA)
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Componenti essenziali della cellula batterica
Membrana citoplasmatica Citoplasma Cromosoma Parete cellulare
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La membrana citoplasmatica
Barriera idrofobica altamente selettiva che trattiene proteine e soluti nel citoplasma
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La membrana citoplasmatica
Struttura trilaminare tipica delle membrane biologiche
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Composizione della membrana citoplasmatica
Sono presenti varie proteine di membrana (integrali e non) Gli opanoidi rinforzano la membrana (struttura piana rigida)
Fosfolipidi
Proteine Opanoidi
Diploptene
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Funzioni della membrana citoplasmatica
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Funzioni della membrana citoplasmatica
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Proteine di membrana
Svolgono varie funzioni: Trasporto (ioni, nutrienti) Enzimi per la replica del cromosoma Enzimi per il metabolismo energetico Sistemi di secrezione delle proteine Sintesi della parete cellulare Sensori per parametri ambientali
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Proteine di membrana: trasporto
Diffusione passiva attraverso la membrana molto lenta La presenza di permeasi accelera la diffusione di soluti (ioni, zuccheri)
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Proteine di membrana: trasporto
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Proteine di membrana: trasporto
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Sistemi di trasduzione del segnale
Ambiente esterno
Membrana
plasmatica
Citoplasma
Sensore
(kinasi)
Segnale ambientale
P
ATP
Promotore Sequenza
regolativa Gene
RNA
polimerasi
Attivazione o repressione
dell’espressione genica
P
Regolatore
della risposta
P
Due componenti: Sensore e regolatore
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Funzioni della membrana citoplasmatica
Forma di conservazione dell'energia generata dal metabolsimo
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Polarizzazione della membrana
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ATP sintasi e sintesi di ATP
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Componenti essenziali della cellula batterica
Membrana citoplasmatica Citoplasma Cromosoma Parete cellulare
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Composizione del citoplasma
Contiene: • cromosoma/i • sistemi enzimatici • ribosomi 70S
Può contenere: • plasmidi (elementi genetici accessori) • granuli di materiale da accumulo > glicogeno > polifosfati
Non contiene: • mitocondri, lisosomi, reticolo endoplasmico, app. Golgi
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Componenti essenziali della cellula batterica
Membrana citoplasmatica Citoplasma Cromosoma Parete cellulare
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Il cromosoma batterico
Localizzazione preferenziale in alcune zone della cellula (nucleoide)
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Il cromosoma batterico
Porta il corredo genico essenziale per la cellula
Costituito da DNA bicatenario
Struttura:
- circolare (nella maggior parte dei casi)
- lineare (es. borrelie, Streptomyces)
Generalmente unico
eccezioni:
- leptospire, brucelle, vibrioni (2 cromosomi circolari)
- Agrobacterium (1 cromosoma circolare e 1 lineare)
Condizioni di ploidia: APLOIDIA
Dimensioni: 0,5 - 8 milioni di coppie di nucleotidi
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Il cromosoma batterico
Le DIVERSE DIMENSIONI del genoma nelle varie specie batteriche riflettono DIVERSE ESIGENZE ADATTATIVE
Escherichia coli 4,64 4288 intestino mammiferi
ambiente
Haemophilus influenzae 1,83 1703 mucosa respiratoria
umana
Mycoplasma pneumoniae 0,82 677 mucosa respiratoria
umana, privo di parete
Specie genoma (Mb) n° geni habitat
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Il cromosoma batterico
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Il cromosoma batterico
Dominio di
superspiraliz-
zazione Proteine
Enzimi che intervengono
nella superspiralizzazione/
despiralizzazione:
DNA TOPOISOMERASI
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Altri acidi nucleici importanti
(a) mRNA (b) rRNA (ribosomes) (c) tRNA
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Componenti essenziali della cellula batterica
Membrana citoplasmatica Citoplasma Cromosoma Parete cellulare
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Organizzazione della parete batterica
Diversa per Gram positivi e Gram negativi
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Organizzazione della parete batterica
Citoplasma
Membrana plasmatica
Più strati di un POLIMERO RIGIDO detto PEPTIDOGLICANO
Batteri Gram-positivi
Batteri Gram-negativi
Citoplasma
Membrana plasmatica Uno (o pochi) strato(i) di PEPTIDOGLICANO
Struttura membranacea Detta MEMBRANA ESTERNA
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Gram positivi Gram negativi
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Gram positivi Gram negativi
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La colorazione di Gram (1853 – 1938)
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La colorazione di Gram
Bacillus anthracis in un campione di fluido cerebrospinale
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La colorazione di Gram
Escherichia coli
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La colorazione di Gram
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Il peptidoglicano
Componente costante della parete batterica
Polimero che conferisce rigidità alla parete (funzione essenziale per la elevata pressione osmotica presente nel citoplasma batterico)
Struttura esclusivamente presente nei Batteri (importante bersaglio per farmaci antibatterici, es. penicilline)
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Struttura del peptidoglicano
legame sensibile al
lisozima
zuccheri acetilati alternati
presenza di aminoacidi
non convenzionali
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Importanza del peptidoglicano
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Struttura del peptidoglicano
I legami incrociati conferiscono rigidità al polimero
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Struttura del peptidoglicano
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Natura e diversità dei legami incrociati
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La parete cellulare dei Gram +
Acidi teicoici: conferiscono carica negativa alla cellula tolleranza ai sali biliari attivazione complemento Proteine ancorate: adesione
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La parete cellulare dei Gram +
Le proteine di parete possono formare strutture fibrillari che sporgono dalla parete verso l’esterno e possono servire per l’ancoraggio delle cellule batteriche a strutture esterne
Peptidoglicano
Polisaccaride C
Membrana plasmatica
Proteina M Struttura della parete degli streptococchi
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La parete cellulare dei Gram -
Ancoraggio membrana esterna Ingresso nutrienti e altre molecole
LPS Altre proteine ("OMPs")
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Lipopolisaccaride (LPS)
Ruolo strutturale ma anche importante fattore di TOSSICITÀ per la maggior parte degli animali (ENDOTOSSINA)
Parte conservata Parte altamente variabile
Caratterizzato dalla presenza di: ketodeossi-ottonato e zuccheri a 7 C
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Le porine
Porine: proteine che formano canali trans-membranari permeabili ad acqua, ioni, piccole molecole idrofile
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Componenti accessori della cellula batterica
Capsula
Fimbrie
(pili)
Flagelli
Plasmidi
Strutture superficiali o localizzate internamente
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La capsula batterica
Strato di MATERIALE GELATINOSO (fortemente idratato) presente all’esterno della parete batterica
Struttura organizzata e difficile da rimuovere
Evidenziabile al MICROSCOPIO OTTICO mediante COLORAZIONE NEGATIVA con inchiostro di china
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La capsula batterica
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La capsula batterica
• Costituite generalmente da POLISACCARIDI (omo- o etero-polisaccaridi) Talvolta di natura proteica (es. Bacillus anthracis)
Carica elettrica negativa
Funzione: PROTEZIONE DA FAGOCITOSI
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Batteri penetrati
attraverso cute o mucose
La fagocitosi come difesa anti-batterica
Fagocita • Granulocita neutrofilo
• Monocita
Fagocitosi
Fusione con lisosoma
“killing” del batterio • Proteasi
• Lisozima
• Defensine
• Mieloperossidasi
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Azione antifagocitaria della capsula
Fagocita • Granulocita neutrofilo
• Monocita
Batteri non capsulati
Fagocitosi e “killing”
Batteri capsulati
I batteri non sono fagocitati,
possono sopravvivere e
moltiplicarsi nei tessuti
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Importanza della capsula batterica
La capsula può rappresentare una componente importante o essenziale per l’infezione
Capsula come FATTORE DI VIRULENZA
Altre funzioni: Prevenzione dell’essicazione Resistenza a composti tossici di natura idrofobica (detergenti)
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Componenti accessori della cellula batterica
Capsula
Fimbrie
(pili)
Flagelli
Plasmidi
Strutture superficiali o localizzate internamente
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Fimbrie o pili
Strutture filamentose rigide o flessibili che si impiantano sulla parete dei batteri Gram-negativi
Diametro: 4-8 nm (visibili solo al microscopio elettronico)
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Fimbrie o pili
I pili sono di natura proteica e generati dalla polimerizzazione di una proteina globulare (Pilina)
Proteine accessorie
Parete
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Funzione dei pili
Riconoscimento di recettori che si trovano alla superficie delle cellule eucariotiche
ADESIVITA’ BATTERICA
Diversi tipi di fimbrie possono condizionare il TROPISMO per epiteli diversi
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Importanza dei pili
colonizzazione batterica di certi distretti
Lume intestinale
Per mezzo delle fimbrie i batteri aderiscono all’epitelio intestinale e non sono rimossi con la peristalsi
Nella popolazione batterica esiste un EQUILIBRIO tra BATTERI FIMBRIATI e BATTERI NON FIMBRIATI che è importante per la colonizzazione stabile degli epiteli desquamanti
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Fimbrie o pili
Alcuni batteri per i quali i pili rappresentano un importante fattore di
virulenza
Neisseria gonorrhoeae (gonococco)
Escherichia coli uropatogeno (fimbrie P)
Altre funzioni: coinvolto nella coniugazione (scambio di materiale genetico fra batteri)
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Componenti accessori della cellula batterica
Capsula
Fimbrie
(pili)
Flagelli
Plasmidi
Strutture superficiali o localizzate internamente
![Page 86: Struttura e funzione della cellula batterica...2013/06/27 · Jean-Denis Docquier Laboratorio di Fisiologia e Biotecnologia dei Microrganismi Dipartimento di Biotecnologie Policlinico](https://reader035.fdocument.pub/reader035/viewer/2022070218/6124ad8df114bd4a32196734/html5/thumbnails/86.jpg)
Flagelli
Costituiti dalla polimerizzazione di una proteina globulare (flagellina)
• Strutture filamentose elicoidali impiantate sulla parete batterica
flagelli polari
flagelli peritrichi
• Diametro 20 nm; • Lunghezza qualche mm (più grandi e più lunghi dei pili)
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Flagelli
Flagello polare singolo
Flagelli peritrichi
![Page 88: Struttura e funzione della cellula batterica...2013/06/27 · Jean-Denis Docquier Laboratorio di Fisiologia e Biotecnologia dei Microrganismi Dipartimento di Biotecnologie Policlinico](https://reader035.fdocument.pub/reader035/viewer/2022070218/6124ad8df114bd4a32196734/html5/thumbnails/88.jpg)
Flagelli
![Page 89: Struttura e funzione della cellula batterica...2013/06/27 · Jean-Denis Docquier Laboratorio di Fisiologia e Biotecnologia dei Microrganismi Dipartimento di Biotecnologie Policlinico](https://reader035.fdocument.pub/reader035/viewer/2022070218/6124ad8df114bd4a32196734/html5/thumbnails/89.jpg)
Flagelli e motilità
![Page 90: Struttura e funzione della cellula batterica...2013/06/27 · Jean-Denis Docquier Laboratorio di Fisiologia e Biotecnologia dei Microrganismi Dipartimento di Biotecnologie Policlinico](https://reader035.fdocument.pub/reader035/viewer/2022070218/6124ad8df114bd4a32196734/html5/thumbnails/90.jpg)
Flagelli e motilità
![Page 91: Struttura e funzione della cellula batterica...2013/06/27 · Jean-Denis Docquier Laboratorio di Fisiologia e Biotecnologia dei Microrganismi Dipartimento di Biotecnologie Policlinico](https://reader035.fdocument.pub/reader035/viewer/2022070218/6124ad8df114bd4a32196734/html5/thumbnails/91.jpg)
Funzione dei flagelli
I flagelli permettono al batterio di spostarsi velocemente, in funzione di parametri ambientali (chemiotassi)
Movimento netto
![Page 92: Struttura e funzione della cellula batterica...2013/06/27 · Jean-Denis Docquier Laboratorio di Fisiologia e Biotecnologia dei Microrganismi Dipartimento di Biotecnologie Policlinico](https://reader035.fdocument.pub/reader035/viewer/2022070218/6124ad8df114bd4a32196734/html5/thumbnails/92.jpg)
Chemotassi
![Page 93: Struttura e funzione della cellula batterica...2013/06/27 · Jean-Denis Docquier Laboratorio di Fisiologia e Biotecnologia dei Microrganismi Dipartimento di Biotecnologie Policlinico](https://reader035.fdocument.pub/reader035/viewer/2022070218/6124ad8df114bd4a32196734/html5/thumbnails/93.jpg)
Chemotassi
![Page 94: Struttura e funzione della cellula batterica...2013/06/27 · Jean-Denis Docquier Laboratorio di Fisiologia e Biotecnologia dei Microrganismi Dipartimento di Biotecnologie Policlinico](https://reader035.fdocument.pub/reader035/viewer/2022070218/6124ad8df114bd4a32196734/html5/thumbnails/94.jpg)
Struttura e funzione del flagello
Utilizzo della forza “proton-motiva”
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Componenti accessori della cellula batterica
Capsula
Fimbrie
(pili)
Flagelli
Plasmidi
Strutture superficiali o localizzate internamente
![Page 96: Struttura e funzione della cellula batterica...2013/06/27 · Jean-Denis Docquier Laboratorio di Fisiologia e Biotecnologia dei Microrganismi Dipartimento di Biotecnologie Policlinico](https://reader035.fdocument.pub/reader035/viewer/2022070218/6124ad8df114bd4a32196734/html5/thumbnails/96.jpg)
I plasmidi
Elementi genetici extra-cromosomici
Plasmide (può essere in singola copia o in multicopia)
Cromosoma
Costituiti da DNA bicatenario circolare (raramente lineare)
Si replicano in maniera autonoma dal cromosoma
Più piccoli del cromosoma (da poche kbp a 100-200 kbp)
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Plasmidi di VIRULENZA Portano determinanti genetici
di VIRULENZA (es. pili)
I plasmidi portano DETERMINANTI GENETICI ACCESSORI
La loro presenza non è associata
ad alcun fenotipo evidente Plasmidi CRIPTICI
Portano determinanti genetici
di RESISTENZA agli antibiotici Plasmidi DI RESISTENZA
La loro informazione genetica non è essenziale per la cellula ospite ma può conferire un vantaggio selettivo in particolari condizioni
Plasmidi METABOLICI Portano determinanti genetici
per VIE METABOLICHE
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Alcuni plasmidi (detti plasmidi CONIUGATIVI)
hanno la capacità di trasferirsi da una cellula batterica all’altra
attraverso un meccanismo specializzato di scambio genico
detto CONIUGAZIONE
Cromosoma
Plasmide
coniugativo
Pilo F o
Pilo sessuale cellula F+
La cellula portatrice del plasmide coniugativo (donatore)
riconosce una cellula che ne è priva (ricevente)
mediante il pilo F
Proteina della
membrana esterna
cellula F+ cellula F-
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Pili F: presenti in numero di 1-10 per cellula, sono spessi 9-10 nm
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donatore
ricevente
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F+ F-
Viene trasferito un filamento singolo di DNA del plasmide. Nel ricevente e nel donatore vengono sintetizzati i filamenti complementari
F+
F+
Al termine del processo si hanno due cellule F+, ciascuna contenente il plasmide coniugativo, che possono fungere entrambe da cellule donatrici
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Caratteristiche dei plasmidi coniugativi:
• Possibilità di RAPIDA DIFFUSIONE
in una popolazione batterica
• Trasferimento di materiale genetico
tra specie anche molto diverse
• Ruolo molto importante nella DISSEMINAZIONE di
DETERMINANTI GENETICI di RESISTENZA e VIRULENZA
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Cromosoma
Plasmide
(non coniugativo)
Non può trasferirsi per coniugazione
Cromosoma
Plasmide
(coniugativo)
pilo F
Plasmide
(non coniugativo)
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Solo il plasmide coniugativo
si trasferisce
Entrambi i plasmidi si
trasferiscono (mobilizzazione del plasmide
non coniugativo)
Solo il plasmide
mobilizzabile si trasferisce (mobilizzazione del plasmide
non coniugativo)
Mobilizzazione plasmidica mediante coniugazione
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La spora (endospora) batterica
forma di resistenza (al calore, agli agenti chimici e fisici) metabolicamente inerte si genera mediante un processo di differenziazione cellulare (sporulazione) innescato da condizioni di carenza nutrizionale può nuovamente dare origine a forme vegetative (germinazione) in presenza di condizioni ambientali favorevoli
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Formazione delle spore
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Composizione della spora
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Composizione della spora
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Struttura della spora batterica
nucleoide condensato,
complessato con SASP (small acid-soluble spore proteins)
citoplasma parzialmente
disidratato
presenza abbondante di
dipicolinato di calcio
Cortex peptidoglicano
scarsamente
cross-linkato
Coat proteine
specifiche
della spora
Esosporio
"core" della spora metabolicamente inerte
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Struttura della spora batterica
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Germinazione delle spore
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Longevità delle spore
Cristalli di sale del Permiano (250 millioni di anni)
Spore di Clostridium aceticum del 1947