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Sistemática de carnívoros nos últimos 30 anos: resolução ... · hedgehog shrew mole mouse rat...
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Sistemática de carnívoros nos últimos 30
anos: resolução de velhos problemas e
descoberta de novas questões
Eduardo Eizirik
Faculdade de Biociências, PUCRS, Brasil
Instituto Pró-Carnívoros, Brasil
8º Congresso Brasileiro de Mastozoologia
João Pessoa, PB - 28/09/2015
SIMPÓSIO: Avanços em estudos sistemáticos de Mamíferos Brasileiros 2
Sistemática de carnívoros nos últimos 30 anos:
resolução de velhos problemas e descoberta de
novas questões.
Eduardo Eizirik
Faculdade de Biociências, PUCRS, Brasil
Instituto Pró-Carnívoros, Brasil
A ordem Carnivora
287 espécies
Distribuição: Holártica, Etiópica, Neotropical, Oriental
Problemas prevalentes nos anos 1980-1990
1. Posição filogenética de Carnivora dentro de Placentalia.
2. Composição das famílias; relações filogenética entre as famílias.
3. Monofilia dos pinípedes (carnívoros marinhos); onde se colocam na
filogenia dos carnívoros ? Posição da morsa (Odobenidae)?
4. Taxa enigmáticos: panda gigante, panda vermelho, civeta das
palmeiras africana, fossa, ‘stink badgers’.
hedgehog
shrew mole mouse
rat
O.W. hystricognath
caviomorph sciurid
rabbit
pika
flying lemur
tree shrew
strepsirhine
human
sloth
anteater
armadillo
s.e.elephant shrew
l.e.elephant shrew
tenrec
aardvark
sirenian
hyrax
elephant
opossum diprotodontian
flying fox
rousette fruit bat phyllostomid bat
rhino
tapir
horse
cat caniform
pangolin
whale
dolphin
hippo
ruminant
pig llama
I
II
III
IV
Perissodactyla
Carnivora
Pholidota
Cetartiodactyla
Chiroptera
Eulipotyphla
Rodentia
Lagomorpha
Dermoptera
Scandentia
Primates
Xenarthra
Macroscelidae Afrosoricida Tubulidentata Sirenia Hyracoidea Proboscidea
Marsupialia
Bore
oeuth
eria
Afrotheria
Murphy et al. 2001. Science.
Filogenia dos
mamíferos
placentários.
Meredith et al. 2011.
Science.
Novo conjunto de
dados:
26 genes
35 kb
11.000 aa
Problemas prevalentes nos anos 1980-1990
1. Posição filogenética de Carnivora dentro de Placentalia.
2. Composição das famílias; relações filogenética entre as famílias.
3. Monofilia dos pinípedes (carnívoros marinhos); onde se colocam na
filogenia dos carnívoros ? Posição da morsa (Odobenidae)?
4. Taxa enigmáticos: panda gigante, panda vermelho, civeta das
palmeiras africana, fossa, ‘stink badgers’.
Felidae
Hyaenidae
Viverridae
Herpestidae
Canidae
Ursidae
Procyonidae
Mustelidae
Otariidae
Phocidae
Odobenidae
Feliformia
Caniformia
Ordem Carnivora: Famílias tradicionais (até fim dos anos 1990)
Felidae
Hyaenidae
Viverridae
Herpestidae
Canidae
Ursidae
Procyonidae
Mustelidae
Otariidae
Phocidae
Odobenidae
Feliformia
Caniformia
38 espécies
Felidae
Hyaenidae
Viverridae
Herpestidae
Canidae
Ursidae
Procyonidae
Mustelidae
Otariidae
Phocidae
Odobenidae
Feliformia
Caniformia
4 espécies
Felidae
Hyaenidae
Viverridae
Herpestidae
Canidae
Ursidae
Procyonidae
Mustelidae
Otariidae
Phocidae
Odobenidae
Feliformia
Caniformia
34 espécies
Felidae
Hyaenidae
Viverridae
Herpestidae
Canidae
Ursidae
Procyonidae
Mustelidae
Otariidae
Phocidae
Odobenidae
Feliformia
Caniformia
37 espécies
Felidae
Hyaenidae
Viverridae
Herpestidae
Canidae
Ursidae
Procyonidae
Mustelidae
Otariidae
Phocidae
Odobenidae
Feliformia
Caniformia
35 espécies
Felidae
Hyaenidae
Viverridae
Herpestidae
Canidae
Ursidae
Procyonidae
Mustelidae
Otariidae
Phocidae
Odobenidae
Feliformia
Caniformia
8 espécies
Felidae
Hyaenidae
Viverridae
Herpestidae
Canidae
Ursidae
Procyonidae
Mustelidae
Otariidae
Phocidae
Odobenidae
Feliformia
Caniformia
19 espécies
Felidae
Hyaenidae
Viverridae
Herpestidae
Canidae
Ursidae
Procyonidae
Mustelidae
Otariidae
Phocidae
Odobenidae
Feliformia
Caniformia
65 espécies
Felidae
Hyaenidae
Viverridae
Herpestidae
Canidae
Ursidae
Procyonidae
Mustelidae
Otariidae
Phocidae
Odobenidae
Feliformia
Caniformia
14 espécies
Felidae
Hyaenidae
Viverridae
Herpestidae
Canidae
Ursidae
Procyonidae
Mustelidae
Otariidae
Phocidae
Odobenidae
Feliformia
Caniformia
18 espécies
Felidae
Hyaenidae
Viverridae
Herpestidae
Canidae
Ursidae
Procyonidae
Mustelidae
Otariidae
Phocidae
Odobenidae
Feliformia
Caniformia
1 espécie
Início dos anos 2000
1. Expansão de estudos moleculares (focos geralmente separados em
Caniformia e Feliformia).
2. Contínua controvérsia sobre as relações filogenética entre as famílias.
3. Progressiva resolução de alguns problemas (p.ex. monofilia dos
pinípedes).
4. Proposta de novas linhagens em 2003.
Gaubert & Veron 2003. Proc R. Soc. B Yoder et al. 2003. Nature
Felis Acinonyx Leopardus Lynx Panthera Prionodon Crocuta Hyaena Parahyaena Proteles Suricata Herpestes Ichneumia Rhynchogale Helogale Cryptoprocta Galidia Fossa Civettictis Genetta Paradoxurus Nandinia Canis Nyctereutes Urocyon Mephitis Spilogale Conepatus Mydaus Eira Martes Enhydra Lontra Ictonyx Mustela Meles Taxidea Bassariscus Procyon Nasua Bassaricyon Potos Ailurus Arctocephalus Zalophus Odobenus Phoca Mirounga Ailuropoda Ursus Manis
Felidae
‘Prionodontidae’
Hyaenidae
Herpestidae
Eupleridae
Viverridae
Nandiniidae
Canidae
Mephitidae
Mustelidae
Procyonidae
Ailuridae
Otariidae
Odobenidae
Phocidae
Ursidae
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60 50 40 30 20 10 0 Million Years Ago
Paleoc. Eocene Oligocene Miocene Pi Pe
18.2
3.5
14.8
20.7
13.1
9.2 20.0
7.8
28.6
19.6
8.7
7.2
10.3 33.3
32.2
38.6
37.4
32.0
30.0
40.5
42.6
Filogenia molecular da
ordem Carnivora (supermatriz de
14 genes nucleares)
Eizirik et al. 2010. Mol. Ph. Evol.
Felis Acinonyx Leopardus Lynx Panthera Prionodon Crocuta Hyaena Parahyaena Proteles Suricata Herpestes Ichneumia Rhynchogale Helogale Cryptoprocta Galidia Fossa Civettictis Genetta Paradoxurus Nandinia Canis Nyctereutes Urocyon Mephitis Spilogale Conepatus Mydaus Eira Martes Enhydra Lontra Ictonyx Mustela Meles Taxidea Bassariscus Procyon Nasua Bassaricyon Potos Ailurus Arctocephalus Zalophus Odobenus Phoca Mirounga Ailuropoda Ursus Manis
Felidae
‘Prionodontidae’
Hyaenidae
Herpestidae
Eupleridae
Viverridae
Nandiniidae
Canidae
Mephitidae
Mustelidae
Procyonidae
Ailuridae
Otariidae
Odobenidae
Phocidae
Ursidae
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60 50 40 30 20 10 0 Million Years Ago
Paleoc. Eocene Oligocene Miocene Pi Pe
18.2
3.5
14.8
20.7
13.1
9.2 20.0
7.8
28.6
19.6
8.7
7.2
10.3 33.3
32.2
38.6
37.4
32.0
30.0
40.5
42.6
Filogenia molecular da
ordem Carnivora
Eizirik et al. 2010. Mol. Ph. Evol.
Felis Acinonyx Leopardus Lynx Panthera Prionodon Crocuta Hyaena Parahyaena Proteles Suricata Herpestes Ichneumia Rhynchogale Helogale Cryptoprocta Galidia Fossa Civettictis Genetta Paradoxurus Nandinia Canis Nyctereutes Urocyon Mephitis Spilogale Conepatus Mydaus Eira Martes Enhydra Lontra Ictonyx Mustela Meles Taxidea Bassariscus Procyon Nasua Bassaricyon Potos Ailurus Arctocephalus Zalophus Odobenus Phoca Mirounga Ailuropoda Ursus Manis
Felidae
‘Prionodontidae’
Hyaenidae
Herpestidae
Eupleridae
Viverridae
Nandiniidae
Canidae
Mephitidae
Mustelidae
Procyonidae
Ailuridae
Otariidae
Odobenidae
Phocidae
Ursidae
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60 50 40 30 20 10 0 Million Years Ago
Paleoc. Eocene Oligocene Miocene Pi Pe
18.2
3.5
14.8
20.7
13.1
9.2 20.0
7.8
28.6
19.6
8.7
7.2
10.3 33.3
32.2
38.6
37.4
32.0
30.0
40.5
42.6
Filogenia molecular da
ordem Carnivora
Eizirik et al. 2010. Mol. Ph. Evol.
Felis Acinonyx Leopardus Lynx Panthera Prionodon Crocuta Hyaena Parahyaena Proteles Suricata Herpestes Ichneumia Rhynchogale Helogale Cryptoprocta Galidia Fossa Civettictis Genetta Paradoxurus Nandinia Canis Nyctereutes Urocyon Mephitis Spilogale Conepatus Mydaus Eira Martes Enhydra Lontra Ictonyx Mustela Meles Taxidea Bassariscus Procyon Nasua Bassaricyon Potos Ailurus Arctocephalus Zalophus Odobenus Phoca Mirounga Ailuropoda Ursus Manis
Felidae
‘Prionodontidae’
Hyaenidae
Herpestidae
Eupleridae
Viverridae
Nandiniidae
Canidae
Mephitidae
Mustelidae
Procyonidae
Ailuridae
Otariidae
Odobenidae
Phocidae
Ursidae
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60 50 40 30 20 10 0 Million Years Ago
Paleoc. Eocene Oligocene Miocene Pi Pe
18.2
3.5
14.8
20.7
13.1
9.2 20.0
7.8
28.6
19.6
8.7
7.2
10.3 33.3
32.2
38.6
37.4
32.0
30.0
40.5
42.6
Filogenia molecular da
ordem Carnivora
Eizirik et al. 2010. Mol. Ph. Evol.
Felis Acinonyx Leopardus Lynx Panthera Prionodon Crocuta Hyaena Parahyaena Proteles Suricata Herpestes Ichneumia Rhynchogale Helogale Cryptoprocta Galidia Fossa Civettictis Genetta Paradoxurus Nandinia Canis Nyctereutes Urocyon Mephitis Spilogale Conepatus Mydaus Eira Martes Enhydra Lontra Ictonyx Mustela Meles Taxidea Bassariscus Procyon Nasua Bassaricyon Potos Ailurus Arctocephalus Zalophus Odobenus Phoca Mirounga Ailuropoda Ursus Manis
Felidae
‘Prionodontidae’
Hyaenidae
Herpestidae
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Nandiniidae
Canidae
Mephitidae
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Procyonidae
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Otariidae
Odobenidae
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Paleoc. Eocene Oligocene Miocene Pi Pe
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37.4
32.0
30.0
40.5
42.6
Filogenia molecular da
ordem Carnivora
Eizirik et al. 2010. Mol. Ph. Evol.
Felis Acinonyx Leopardus Lynx Panthera Prionodon Crocuta Hyaena Parahyaena Proteles Suricata Herpestes Ichneumia Rhynchogale Helogale Cryptoprocta Galidia Fossa Civettictis Genetta Paradoxurus Nandinia Canis Nyctereutes Urocyon Mephitis Spilogale Conepatus Mydaus Eira Martes Enhydra Lontra Ictonyx Mustela Meles Taxidea Bassariscus Procyon Nasua Bassaricyon Potos Ailurus Arctocephalus Zalophus Odobenus Phoca Mirounga Ailuropoda Ursus Manis
Felidae
‘Prionodontidae’
Hyaenidae
Herpestidae
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Nandiniidae
Canidae
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Procyonidae
Ailuridae
Otariidae
Odobenidae
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Paleoc. Eocene Oligocene Miocene Pi Pe
18.2
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20.7
13.1
9.2 20.0
7.8
28.6
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8.7
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10.3 33.3
32.2
38.6
37.4
32.0
30.0
40.5
42.6
Filogenia molecular da
ordem Carnivora
Eizirik et al. 2010. Mol. Ph. Evol.
Felis Acinonyx Leopardus Lynx Panthera Prionodon Crocuta Hyaena Parahyaena Proteles Suricata Herpestes Ichneumia Rhynchogale Helogale Cryptoprocta Galidia Fossa Civettictis Genetta Paradoxurus Nandinia Canis Nyctereutes Urocyon Mephitis Spilogale Conepatus Mydaus Eira Martes Enhydra Lontra Ictonyx Mustela Meles Taxidea Bassariscus Procyon Nasua Bassaricyon Potos Ailurus Arctocephalus Zalophus Odobenus Phoca Mirounga Ailuropoda Ursus Manis
Felidae
‘Prionodontidae’
Hyaenidae
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Paleoc. Eocene Oligocene Miocene Pi Pe
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8.7
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32.2
38.6
37.4
32.0
30.0
40.5
42.6
Filogenia molecular da
ordem Carnivora
Eizirik et al. 2010. Mol. Ph. Evol.
Felis Acinonyx Leopardus Lynx Panthera Prionodon Crocuta Hyaena Parahyaena Proteles Suricata Herpestes Ichneumia Rhynchogale Helogale Cryptoprocta Galidia Fossa Civettictis Genetta Paradoxurus Nandinia Canis Nyctereutes Urocyon Mephitis Spilogale Conepatus Mydaus Eira Martes Enhydra Lontra Ictonyx Mustela Meles Taxidea Bassariscus Procyon Nasua Bassaricyon Potos Ailurus Arctocephalus Zalophus Odobenus Phoca Mirounga Ailuropoda Ursus Manis
Felidae
‘Prionodontidae’
Hyaenidae
Herpestidae
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Nandiniidae
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Odobenidae
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Paleoc. Eocene Oligocene Miocene Pi Pe
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13.1
9.2 20.0
7.8
28.6
19.6
8.7
7.2
10.3 33.3
32.2
38.6
37.4
32.0
30.0
40.5
42.6
Filogenia molecular da
ordem Carnivora
Eizirik et al. 2010. Mol. Ph. Evol.
Felis Acinonyx Leopardus Lynx Panthera Prionodon Crocuta Hyaena Parahyaena Proteles Suricata Herpestes Ichneumia Rhynchogale Helogale Cryptoprocta Galidia Fossa Civettictis Genetta Paradoxurus Nandinia Canis Nyctereutes Urocyon Mephitis Spilogale Conepatus Mydaus Eira Martes Enhydra Lontra Ictonyx Mustela Meles Taxidea Bassariscus Procyon Nasua Bassaricyon Potos Ailurus Arctocephalus Zalophus Odobenus Phoca Mirounga Ailuropoda Ursus Manis
Felidae
‘Prionodontidae’
Hyaenidae
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8.7
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10.3 33.3
32.2
38.6
37.4
32.0
30.0
40.5
42.6
Filogenia molecular da
ordem Carnivora
Eizirik et al. 2010. Mol. Ph. Evol.
Felis Acinonyx Leopardus Lynx Panthera Prionodon Crocuta Hyaena Parahyaena Proteles Suricata Herpestes Ichneumia Rhynchogale Helogale Cryptoprocta Galidia Fossa Civettictis Genetta Paradoxurus Nandinia Canis Nyctereutes Urocyon Mephitis Spilogale Conepatus Mydaus Eira Martes Enhydra Lontra Ictonyx Mustela Meles Taxidea Bassariscus Procyon Nasua Bassaricyon Potos Ailurus Arctocephalus Zalophus Odobenus Phoca Mirounga Ailuropoda Ursus Manis
Felidae
‘Prionodontidae’
Hyaenidae
Herpestidae
Eupleridae
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Canidae
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Mustelidae
Procyonidae
Ailuridae
Otariidae
Odobenidae
Phocidae
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13.1
9.2 20.0
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32.2
38.6
37.4
32.0
30.0
40.5
42.6
Filogenia molecular da
ordem Carnivora
Eizirik et al. 2010. Mol. Ph. Evol.
Felis Acinonyx Leopardus Lynx Panthera Prionodon Crocuta Hyaena Parahyaena Proteles Suricata Herpestes Ichneumia Rhynchogale Helogale Cryptoprocta Galidia Fossa Civettictis Genetta Paradoxurus Nandinia Canis Nyctereutes Urocyon Mephitis Spilogale Conepatus Mydaus Eira Martes Enhydra Lontra Ictonyx Mustela Meles Taxidea Bassariscus Procyon Nasua Bassaricyon Potos Ailurus Arctocephalus Zalophus Odobenus Phoca Mirounga Ailuropoda Ursus Manis
Felidae
‘Prionodontidae’
Hyaenidae
Herpestidae
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Paleoc. Eocene Oligocene Miocene Pi Pe
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13.1
9.2 20.0
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10.3 33.3
32.2
38.6
37.4
32.0
30.0
40.5
42.6
Filogenia molecular da
ordem Carnivora
Eizirik et al. 2010. Mol. Ph. Evol.
Felis Acinonyx Leopardus Lynx Panthera Prionodon Crocuta Hyaena Parahyaena Proteles Suricata Herpestes Ichneumia Rhynchogale Helogale Cryptoprocta Galidia Fossa Civettictis Genetta Paradoxurus Nandinia Canis Nyctereutes Urocyon Mephitis Spilogale Conepatus Mydaus Eira Martes Enhydra Lontra Ictonyx Mustela Meles Taxidea Bassariscus Procyon Nasua Bassaricyon Potos Ailurus Arctocephalus Zalophus Odobenus Phoca Mirounga Ailuropoda Ursus Manis
Felidae
‘Prionodontidae’
Hyaenidae
Herpestidae
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Viverridae
Nandiniidae
Canidae
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Procyonidae
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Filogenia molecular da
ordem Carnivora
Eizirik et al. 2010. Mol. Ph. Evol.
Felis Acinonyx Leopardus Lynx Panthera Prionodon Crocuta Hyaena Parahyaena Proteles Suricata Herpestes Ichneumia Rhynchogale Helogale Cryptoprocta Galidia Fossa Civettictis Genetta Paradoxurus Nandinia Canis Nyctereutes Urocyon Mephitis Spilogale Conepatus Mydaus Eira Martes Enhydra Lontra Ictonyx Mustela Meles Taxidea Bassariscus Procyon Nasua Bassaricyon Potos Ailurus Arctocephalus Zalophus Odobenus Phoca Mirounga Ailuropoda Ursus Manis
Felidae
‘Prionodontidae’
Hyaenidae
Herpestidae
Eupleridae
Viverridae
Nandiniidae
Canidae
Mephitidae
Mustelidae
Procyonidae
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Otariidae
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Paleoc. Eocene Oligocene Miocene Pi Pe
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13.1
9.2 20.0
7.8
28.6
19.6
8.7
7.2
10.3 33.3
32.2
38.6
37.4
32.0
30.0
40.5
42.6
Filogenia molecular da
ordem Carnivora
Eizirik et al. 2010. Mol. Ph. Evol.
Felis Acinonyx Leopardus Lynx Panthera Prionodon Crocuta Hyaena Parahyaena Proteles Suricata Herpestes Ichneumia Rhynchogale Helogale Cryptoprocta Galidia Fossa Civettictis Genetta Paradoxurus Nandinia Canis Nyctereutes Urocyon Mephitis Spilogale Conepatus Mydaus Eira Martes Enhydra Lontra Ictonyx Mustela Meles Taxidea Bassariscus Procyon Nasua Bassaricyon Potos Ailurus Arctocephalus Zalophus Odobenus Phoca Mirounga Ailuropoda Ursus Manis
Felidae
‘Prionodontidae’
Hyaenidae
Herpestidae
Eupleridae
Viverridae
Nandiniidae
Canidae
Mephitidae
Mustelidae
Procyonidae
Ailuridae
Otariidae
Odobenidae
Phocidae
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Paleoc. Eocene Oligocene Miocene Pi Pe
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38.6
37.4
32.0
30.0
40.5
42.6
Filogenia molecular da
ordem Carnivora
Eizirik et al. 2010. Mol. Ph. Evol.
Felis Acinonyx Leopardus Lynx Panthera Prionodon Crocuta Hyaena Parahyaena Proteles Suricata Herpestes Ichneumia Rhynchogale Helogale Cryptoprocta Galidia Fossa Civettictis Genetta Paradoxurus Nandinia Canis Nyctereutes Urocyon Mephitis Spilogale Conepatus Mydaus Eira Martes Enhydra Lontra Ictonyx Mustela Meles Taxidea Bassariscus Procyon Nasua Bassaricyon Potos Ailurus Arctocephalus Zalophus Odobenus Phoca Mirounga Ailuropoda Ursus Manis
Felidae
‘Prionodontidae’
Hyaenidae
Herpestidae
Eupleridae
Viverridae
Nandiniidae
Canidae
Mephitidae
Mustelidae
Procyonidae
Ailuridae
Otariidae
Odobenidae
Phocidae
Ursidae
CA
NIF
OR
MIA
F
EL
IFO
RM
IA
60 50 40 30 20 10 0 Million Years Ago
Paleoc. Eocene Oligocene Miocene Pi Pe
18.2
3.5
14.8
20.7
13.1
9.2 20.0
7.8
28.6
19.6
8.7
7.2
10.3 33.3
32.2
38.6
37.4
32.0
30.0
40.5
42.6
Filogenia molecular da
ordem Carnivora
Eizirik et al. 2010. Mol. Ph. Evol.
Idade das linhagens atuais de cada família de
carnívoros terrestres
Eizirik et al. 2010. Mol. Ph. Evol.
Novas questões
1. Refinamento da filogenia e datação molecular em cada uma
das famílias.
- Questões de discordância genealógica
2. Delimitação de espécies.
3. Refinamento da definição de distribuições geográficas.
4. Hibridação entre espécies próximas.
5. Definição de unidades infra-específicas.
O Grande Intercâmbio
Americano e a diversificação
dos carnívoros neotropicais
Meta-análise de filogenias e datações
moleculares empregando
supermatrizes de genes nucleares
Padrões contrastantes de
diversificação entre as famílias de
carnívoros.
Eizirik. 2012. in: Bones clones and biomes.
Univ. Chicago Press.
Oportunidade para
investigar processos
recentes de especiação e
testar critérios de
delimitação de espécies para
carnívoros.
Eizirik (2012)
O Grande Intercâmbio
Americano e a diversificação
dos carnívoros neotropicais
Meta-análise de filogenias e datações
moleculares empregando
supermatrizes de genes nucleares
Padrões contrastantes de
diversificação entre as famílias de
carnívoros.
Filogenia e filogeografia de Conepatus spp.
Manoel Fontoura-Rodrigues
(Dout., PUCRS, 2013)
Dados de mtDNA
(linhagens da Am. Sul)
Corroboração dos grupos
com dados nucleares
(microssatélites) e
morfométricos
Filogenia e filogeografia de Conepatus spp.
Manoel Fontoura-Rodrigues
(Dout., PUCRS, 2013)
Conclusões:
- Forte estruturação geográfica.
- Nome C. semistriatus inadequado para a
população presente no centro e nordeste
do Brasil.
- Necessidade de revisão taxonômica
integrada para o gênero.
Novas questões
1. Refinamento da filogenia e datação molecular em cada uma
das famílias.
- Questões de discordância genealógica
2. Delimitação de espécies.
3. Refinamento da definição de distribuições geográficas.
4. Hibridação entre espécies próximas.
5. Definição de unidades infra-específicas.
Eizirik (2012)
Interspecific divergence and hybridization in genus Leopardus
Leopardus tigrinus
Leopardus geoffroyi
?
L. colocolo
L. tigrinus
L. geoffroyi
Tatiane Trigo
Trigo et al. 2008. Mol. Ecol.
ML phylogeny
of mtDNA
haplotypes
(1,024 bp)
Microsatellites (9 loci)
Brazilian tigrinas
harbored mtDNA
from three different
species!
Costa Rica tigrina
Complex history of
hybridization and
divergence
- Ancient hybridization and
introgression from L.
colocolo into NE L. tigrinus.
- Ongoing hybridization
between SSE L. tigrinus
and L. geoffroyi.
- No hybridization between
L. colocolo and L. geoffroyi.
- No gene flow between NE
and SSE populations of L.
tigrinus !
Two species:
L. tigrinus
L. guttulus
Trigo et al. 2013. Curr. Biol.
Trigo et al. 2014. PLoS One
Trigo et al. 2014. PLoS One
Correlation of morphological,
genetic and spatial variables
among the male specimens
sampled in RS and vicinities.
(A–B) patterns of genetic (A)
and morphological (B) variation,
with individuals ordered on the
X-axis based on their ‘q’ values
estimated with STRUCTURE (in
A) or their PCI scores estimated
with the PCA (in B); (C)
correlation between genetic and
morphological variation; (D–E)
correlation between individual
‘q’ values (D) or PCI scores (E)
and spatial transects across the
hybrid zone. Geographical
distances used in the spatial
analyses were measured in km as
lines that were perpendicular to
the dashed line shown in Figure
4, with samples collected north
or east of this line (towards the
L. guttulus side) receiving a
positive value, and those
obtained south or west (towards
the L. geoffroyi side) receiving a
negative value
Trigo et al. 2014. PLoS One
OGE1
OGE.003
LGE0031
LGE0077
LGE0075
LGE0036
LTI0124
LTI0140
LTI0138
LTI0102
LTI0160
OGU.003
LTI1
LTI.6
LTI13
LCO.3
LPA.006
100
100
63 57
57
100
96
34
67
59 47
100
36
55
0.05
L. geoffroyi
L. guttulus
L. guigna
L. tigrinus (NE Brazil)
L. colocolo
L. pardalis
Costa Rica ‘tigrina’
Ongoing work: Genome-wide SNP array, GBS and WGS
Illumina custom array containing ~63K domestic cat SNPs
- 6,158 are variable within the genus Leopardus
- 3,371 are variable in the subset shown below
Filogeografia do gato palheiro
(Leopardus colocolo)
Anelisie S. Santos
(M.Sc. PUCRS, 2012)
- História evolutiva complexa
- Há estruturação geográfica recente
- Implicações taxonômicas
O gênero Lycalopex
L. culpaeus
L. griseus L. gymnocercus
L. sechurae
L. vetulus
L. fulvipes
Tchaicka et al. (in review)
• Filogenia: mtDNA
L. gymnocercus
L. fulvipes
L. griseus
L. culpaeus
L. vetulus
L. sechurae
• Árvore de NJ baseada em 588pb da
região controle.
• Suporte dos ramos:NJ.
O gênero Lycalopex
CE01 CE02 CE03
CE04 CE07
CE08 CE06
CE05 CE09
F01 (M) F02 (M)
F03 C01 (A) C03 (A) C05 (A) C04 (A) C08 (A)
C06 (A) C02 (A)
C14 C09 (A) C10 (A)
C11 (A) C13 (A)
C12 (B) C07 (A)
GR01 (N) * GR23 (BP) P)
GR03(M)
(M) GR02 (M) GR21 GR04
GR05 (N) * GR06 (N) *
GR13 GR09 (O) * GR10 (O) *
GR08 (O) * GR11 (N) *
GR07 (O) * GR12 (O) *
GR15 (B) GR14 (B) GR17 GR16 GR20 GR18 GR22 GR19
G01 G02 (C)
G05 (C) G06 (D)
G18 (F) G17
G16 (C) G09 (C)
G12 (C) G20 (C)
G03 (E) G10 (F) G11 (D)
G07 (D,F) G04 (C)
G19 (F) G08 (D) G13 (D)
G15 (E) G14 (D) S01
V01 (I) V03 (I) V09 (J) V10 (H) V15
V02 (I) V06 (I) V16 V17(G)
V12 (G) V04 (I)
V05 (I) V07 (I) V13 (G) V11 (G)
V08 (L) V14
0.005 substitutions/site
93
100
62
100
55
79
100
Tchaicka et al. (in review)
Filogenia (ML) de seis
segmentos
concatenados de
mtDNA (6 kb)
M. Favarini et al. (in prep)
* Adaptado de CENAP/ICMBio ( fevereiro 2012)
Foto: Adriano Gambarini
Foto: Luis Claudio Marigo
Lycalopex vetulus
Lycalopex gymnocercus
F. Garcez et al. (in prep)
* Adaptado de CENAP/ICMBio ( fevereiro 2012)
Foto: Adriano Gambarini
Lycalopex vetulus
Foto: Luis Claudio Marigo
Lycalopex gymnocercus
F. Garcez et al. (in prep)
Foto: Adriano Gambarini
Lycalopex vetulus
F. Garcez et al. (in prep)
L. gymnocercus
L. vetulus
mtDNA
D-loop (614 pb)
Maximum likelihood
F. Garcez et al. (in prep)
7
3
23 4
6
8
Nordeste
Centro-Oeste
Sudeste
Lycalopex gymnocercus
5
F. Garcez et al. (in prep)
Análise de marcadores
nucleares (11 locos de
microssatélites)
Hipótese de trabalho:
Hibridação recente entre L. vetulus e L. gymnocercus,
induzida por ação antrópica
Perspectiva:
Análises populacionais detalhadas em escala genômica.
Warren Johnson
Robert Wayne
Klaus Koepfli
Kris Helgen
Dênis Sana
Ronaldo G. Morato
Flávio Rodrigues
Gitana Cavalcanti
Rogério de Paula
Rodrigo Jorge
Priscilla Villela
Agradecimentos Tatiane C. Trigo
Cristine S. Trinca
Manoel F. Rodrigues
Taiana Haag
Ligia Tchaicka
Renata Bornholdt
Alexsandra Schneider
Lucas Gonçalves
Henrique Figueiró
Taiz L. Simão
Flavia Tirelli
Marina Favarini
Laura Heidtmann
Fabrício Garcez
Isadora França
Gustavo Lorenzana
Fernanda Trindade
Sarah Dias dos Santos
Maria Eduarda Appel
Apoio: CNPq, CAPES, FAPERGS, NIH, NSF, FNMA,
CESP, WCS, WWF, CVRD, PETROBRAS
William Murphy
Mark Springer
Steve O’Brien
Thales R. Freitas
Sandro L. Bonatto
Marilyn Raymond
Fred Lemos
Tadeu Oliveira
Leandro Silveira
Constanza Napolitano