Serviços de genotipagem em plataforma iScan / Illumina : colaboração entre a DEOXI & EMBRAPA
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Serviços de genotipagem em plataforma Serviços de genotipagem em plataforma iScan/Illumina: colaboração entre a iScan/Illumina: colaboração entre a
DEOXI & EMBRAPADEOXI & EMBRAPA
Rodrigo AlonsoRodrigo AlonsoDeoxi BiotecnologiaDeoxi Biotecnologia
Diretor ExecutivoDiretor Executivo
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Empresa Privada – Fundada em Araçatuba/SP – Out/2008Empresa Privada – Fundada em Araçatuba/SP – Out/2008
““Spin Off” Spin Off” Campus de Araçatuba
NOSSA MISSÃO NOSSA MISSÃO Desenvolver produtos e processos inovadores em Desenvolver produtos e processos inovadores em
biotecnologia, através da integração do conhecimento biotecnologia, através da integração do conhecimento científico, tecnologias avançadas e gestão estratégica.científico, tecnologias avançadas e gestão estratégica.
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ServiçosServiços
Soluções em Genômica
Coleta
Armazenamento
Extração de DNA
Rastreabilidade
Elaboração e Gerenciamento
de Projetos
Análises Genômicas
Bioinformática
Teste de Paternidade
por SNP
Farmacogenômica
Diagnóstico Genético Pré -Implantacional
iScan - Illumina
GoldenGate
Infinium
MiSeq (NGS)
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LaboratóriosLaboratórios
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Histórico de P&DHistórico de P&D
• Pesquisa Inovativa em Pequenas Empresas – PIPE/FAPESP (Fase I e II)- Diagnóstico genético pré-implantacional em embriões bovinos produzidos in vitro.
• Programa PRIME – Primeira Empresa Inovadora – FINEP- Aplicação da seleção assistida por marcadores moleculares nos programas detransferência de embriões bovinos.
• Pesquisa Inovativa em Pequenas Empresas – PIPE/FAPESP (FASE I)- Desenvolvimento de teste de DNA para seleção de touros de alta fertilidade.
• Subvenção Econômica - FINEP- DNAids: Diagnóstico rápido da predisposição genética aos efeitos adversos em pacientes HIV+ submetidos à terapia anti-retroviral.
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Histórico de P&DHistórico de P&DHistórico de P&DHistórico de P&D
• RHAE – Pesquisador na Empresa – CNPq- Desenvolvimento de “NanoChips Genômicos” para aplicação em saúde humana, agropecuária e meio ambiente.
• Pesquisa Inovativa em Pequenas Empresas – Subvenção 2012 PAPPE/PIPE – FAPESP/FINEP – Desenvolvimento de linhagem congênica de bovinos da raça Nelore com mutação no gene da miostatina.
• Pesquisa Inovativa em Pequenas Empresas (PIPE – FAPESP)- Uso de arrays genômicos de alta resolução e “Next Generation Sequencing” no diagnóstico de deficiência intelectual e anomalias congênitas – PIPE Fase II.
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Clientes: Genômica AnimalClientes: Genômica Animal
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Clientes: Genômica HumanaClientes: Genômica Humana
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Low to mid-plex molecular testing.
BeadXpress
Sequencing-compatible array
instrument.
HiScan
Dedicated array
instrument.
iScan
Two proven technologies.One powerful platform.
HiScanSQ
Plataformas Illumina…Plataformas Illumina…
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Bead Arrays
Tecnologia Bead Array…Tecnologia Bead Array…
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Tecnologia Bead Chip…Tecnologia Bead Chip…
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iScanBeadArray Technology
INFINIUM GOLDENGATE
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INFINIUMGOLDENGATE
Painéis CustomizadosPainéis CustomizadosDe 96 – 3072 SNPsDe 96 – 3072 SNPs
Diversos produtos prontos Diversos produtos prontos para serem utilizadospara serem utilizados
De 3K – 5 milhões SNPsDe 3K – 5 milhões SNPs
Golden Gate X InfiniumGolden Gate X Infinium
Alta SensibilidadeAlta Sensibilidade
Alto limite de detecçãoAlto limite de detecção
Alta reprodutibilidadeAlta reprodutibilidade
Dados de alta qualidadeDados de alta qualidade
Call Rate > 99%Call Rate > 99%
Plataforma robustaPlataforma robusta
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Aplicações no AgronegócioAplicações no Agronegócio
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PorcineSNP60 BeadChip- 62,163 informative SNP markers
OvineSNP50 BeadChip- 54,241 informative SNP markers
CanineHD- 170,000 SNP markers
Maize SNP50 BeadChip- 56,110 informative SNP markers
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Qual a vantagem de terceirizar Qual a vantagem de terceirizar serviços de genotipagem?serviços de genotipagem?
Alto Custo dos EquipamentosAlto Custo dos Equipamentos
Alta capacidade de análiseAlta capacidade de análise
Mão de obra especializadaMão de obra especializada
Comprometimento com o resultadoComprometimento com o resultado
Comprometimento com prazosComprometimento com prazos
Poder de negociaçãoPoder de negociação
Custo-benefícioCusto-benefício
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PARCERIA DE SUCESSO!!!PARCERIA DE SUCESSO!!!
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- Marcos Vinícius Barbosa da Silva- Maria Gabriela Peixoto- Marta Martins- Marco Antônio Machado- João Cláudio Panetto
- Monica Correa Ledur- Ricardo Zanella- Rodrigo Torres (BRF)
- Fernando Flores Cardoso- Fabiane Siqueira- Andrea do Egito
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““Next-Generation Sequencing”Next-Generation Sequencing”MiSeq/IlluminaMiSeq/Illumina
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