中山大学图书馆Sci finder培训讲座（2010 06-11）

www.cas.org A division of the American Chemical Society

SciFinder检索介绍

CAS 广州代表处

王薇

Tel：020‐83274076

Email：[email protected]

A division of the American Chemical Society

Chemical Abstract Service化学文摘社

我们专注于：

推动研究、发展与创新

为全球科技与创新领域提供领先的、整合的，全面的信息

解决方案

To encourage the increase and diffusion of chemical

knowledge for the benefit of industry and education


Chemical Abstract Service化学文摘社今天：

全球最大的学协会组织

本部拥有800多博士从事文

献编辑工作

为全球超过1200多个学校

提供SciFinder桌面检索平台

在中国,已经有近80家学校

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通过此次培训，您可以掌握

掌握SciFinder中文献检索方法与分析

掌握SciFinder中结构检索的方法与分析

掌握SciFInder中的反应检索与分析

了解SciFinder最新的版本SciFinder Web


提纲

SciFinder介绍

SciFinder中的文献检索与分析

SciFinder中的物质检索与分析

SciFinder中的反应检索与分析

SciFinder Web介绍


SciFinder介绍

由CAS自主开发研究的.

一站式的信息检索平台，可以检索全球最大的，有关生物化学，化学，化学工程，医药等化学相关学科的信息

从中可以检索来自专利，期刊的文献 .

最大的二次文献数据库.

全球最大的物质数据库。

……


期刊专利论文会议报告

溶剂，催化剂，产率等

物质基因合成信息

CAPlus Medline

Registry CASReact

Chemcats

Chemlist

SciFinder介绍


SciFinder介绍----记录数

45003100

1800

11380

52206160

2270

28

3950

0

2000

4000

6000

8000

10000

12000

Literature Registry CASReact Chemlist Chemcats

总量(万) 有机无机物 CAplus 生物序列 Medline


提纲

SciFinder介绍




SciFinder Web介绍


SciFinder包含的文摘数据库

CA plus(1907-至今)• 包含了CA纸本和光盘的所有内容。

• 涵盖了98%世界化学化工文献。

• 10000多种期刊和61个专利发行机构的专利（含专利族）。除此之外，会议

录、技术报告、图书、学位论文、评论、会议摘要、电子期刊、网络预印本；

• 每天更新

Medline• 美国国立医学图书馆出品

• 生命科学医学相关

• 临床报告，毒理、病理学报告

可通过关键词、作者姓名、机构名称等查询，也可通过物质和反应链接


SciFinder文献检索途径

文献

反应物质

主题词

作者名机构名期刊名


主题检索举例

获得针对分子靶点的抗肿瘤药物研究的参考文献

molecular targeted with anti tumor drugs


使用介词来连接关键词

“Concept”表示做了同意词的扩展

“Closely associated with one another”表示同时出现在一个句子中

“were present anywhere in the reference”

表示同时出现在一段话中


用蓝色显示出现的是命中的词条，这里可以看到很多同义词，近意词都被检索出来

文摘信息

全文链接

分析限定


SciFinder文献分析限定工具

系统分类工具


Analyze下的分析工具

一共11种分析手段

分析工具提供11种分析方法，包括索引

词，作者名，机构名，文献类型，期刊名称，出版年限等。

在这些分析工具中，

索引词（Index Term）：可以帮助我们对

文献的内容进行大致的了解

学科分析（CA Section Title）：可以帮助

我们对文献进行学科分类


Analyze-----Index Term分析


Analyze-----Publication Year分析


Refine下的限定工具

一共7种限定手段限定工具提供7种限定方法，包括主

题词，作者名，机构名，文献类型等。

在这些限定工具中，

主题词（Research Topics）：可以让

我们用我们关心的主题词再次限定文献

文献类型（Document Type）：可以

让我们直接获得我们感兴趣的文献类型

通过这种方法，可以获得血管生成抑制剂的参考文献


系统分类工具Categorize

一级目录

二级目录

点击感兴趣的二级分类，在这里可以出现一些索引词条


选择感兴趣的内容，点击Get Reference

获得涉及DNA拓扑异构酶I和II的文献


通过，Save As存储为*.rtf文件，可打印、修改类似word文档，单

次存储文献数量要≤50，千万不要过量下

载

存储文件名称，所属文件夹都要为英文


作者名检索举例

查找中山大学计亮年教授发表的文章


姓必须输入，名只输入首字母。

在列表中将全部的可能性都选择出来


继续使用Analyze和Refine功能，依

据该作者的工作学习经历来获得他所发表的文献


来看一条记录

引文

被引

文献中的物质

文献中的反应


SciFinder文献检索小结

主题检索时，使用介词作为连接

尽量选择包含Concept和Closed Associated with的候选项

通过SciFinder 的Analyze/Refine功能来缩小检索的范围

尝试将不同的Analyze/Refine功能组合起来用，会有更多的收益

使用Categorize可以让系统来实现自动分类

注意作者名检索时的输入规则

通过Get Related来获得更多的信息，可以实现从文献到物质，反应，引文的链接


提纲

SciFinder介绍




SciFinder Web介绍


Registry－－世界上最大的物质数据库

• 5000万个物质；6100万个序列

• 有机、无机、聚合物、混合物、核酸蛋白质序列

• 所有CAS Registry Number 物质

• 日更新4000多个物质

ChemList查询备案/管控化学信息的工具。

Chemcats3000万化学物质提供商的联系信息、价格情况、运送方式、质量等级等信息。

可通过结构式、分子式、物质名称、化学登记号查询，也可通过文献链接

SciFinder包含的物质数据库


SciFinder物质检索途径

文献

反应物质

物质名称，CAS登记号

分子式

结构部分结构相似结构


通过物质名称，CAS登记号检索----Locate

使用SciFinder来检索二茂铁

CAS No：102-54-5 物质名称：ferrocene


通过这种方式，可以实现从物质到文献，或者从物质到反应的连接


获得和制备有关的文献

通过这种方式，获得制备的文献是最全，最精确的


获得和分析有关的文献

获得和物质分析，或者分析应用的文献


通过Categorize分析获得更加细节的内容

精确获得电化学分析的文献


分子式检索举例


分子式输入规则

同一组分中的元素，必须有明确的分割符号，可以用数字和空格来分割

对于不含C的物质，按照字母顺序书写。

对于含C物质，CH写在前面，其他按照字母顺序。

对于多组分物质，用“.” 将不同的组分分开，组分排列顺序按照C数的降序排列，C数相同时，按照H数降序排列，H数一样，按照第三个元素的字母顺序排列，依次类推

聚合物括号表示，括号外用n或x表示，脚标n和x检索到的物质结果不同！

区分大小写


聚合物1

HO O

O

OO

OHn

n

(C3H6O)n(C2H4O)nC8H6O4

Notes: 先写聚合的部分，用括号括住加n；头尾部分元素数

目加在一起写在后面，先写碳、氢和氧的数目，其他元素按照英文字母的排列顺序依次写上。


ABS树脂

N

(C8H8.C4H6.C3H3N)x

Notes: 如果为多种单体聚合而成，分别写出单体的分子式，用 . 间隔开，加上括号，外面加x。单体顺序按照C的数目的多少排列，如果碳的数目相同，H数量大的排在前

面。

聚合物2


检索

BaxCa0.5-xMn Pr0.5O3

直接用以下的分子式检索

Ba.Ca.Mn.O.Pr

分子式检索举例


这些物质出自31篇文献


通过物质结构检索举例---Explore


结构工具


结构相关工具

铅笔

元素周期表

可变基团

重复基团工具

结构模版

橡皮

正电子

选择工具

原子锁定工具

碳链工具

常用基团

R基团定义工具

可变位置连接工具

多元环工具

旋转工具

负电子

环锁定工具

索套选择工具


结构检索举例

通过结构检索磷酸锂铁

要求：

• 检索到所有物质

• 包含不同价位的铁的物质

• Fe2+，Fe3+ ,不同配比的物质

• 查找磷酸锂铁的掺杂情况

使用分子式检索可以满足大部分的要求，但是无法查找原子掺杂情况


精确结构检索

精确结构检索

通过物质类别，来限定检索物质的种类，不选，则返回全部物质


精确结构检索，可以检索到物质的盐，聚合物，混合物，配合物等


SciFinder中的结构的分析和限定


6大分析功能

分析功能提供6大功能，其中

真实原子附属分析（Real-atom attachments):能够分析出原子的修饰情况

可变基团分析（Variable Group composition）：能分析结构中定义的可变基团

R基团分析（R-Group Composition）：可以分析结构中定义的R基团

精确结构分析（Precision）：分析结构中存在的

互变异构或者兼性离子

环骨架分析（Ring Skeletons）：可以分析结构

的环结构，包括环上的原子和环上的单双键。

构象分析（Stereo）：帮助分析结构中存在构象

问题

AnalyzeAnalyze下的分析工具下的分析工具


7大限定功能

限定功能提供结构再次限定，同位素是否包含限定，金属是否包含限定，理化性质限定等。

通常可以通过结构的再次限定（Chemical Structure）去对

结构再次修饰

或者通过理化性质（Property Date）去找到符合理化性质要

求的物质

可以用结构限定来看一下元素参杂情况



用M代表任意金属来做结构限定，并用亚结构检索获得元素参杂情况

亚结构检索


可以使用分析工具，分析M的可能性


使用可变基团分析工具分析

选择感兴趣的参和原子


获得了包含特定原子参和的磷酸锂铁


结构类似物查询举例

查找以下物质的相似物

O

O

这是设计的一个全新的物质，无法通过SciFinder找到，

可以通过查询它的类似物，预测一下这个物质可能的性质，或者应用


相似结构检索


SciFinder只能给出与母体结构相似度在60分以上的物质，通过选择不同阶段的分数，来获得物质。


O

O

区别：

取代基不同取代基位置不同母体结构略有不同


精确结构检索：

获得物质的盐，聚合物，混合物，配合物等，母体结构不能修改，不能修饰

亚结构检索：

所画的结构必须存在，母体结构不能修改，但可以被修饰

相似结构检索：

获得相似度在60分以上的结构，母体结构可以修改，也可以被修饰，用相似度来控制获得的结果

结构检索小结


提纲

SciFinder介绍




SciFinder Web介绍


CAS React（1840－至今）

期刊，专利中涉及的有机、有机金属、无机、生化反应。

2200万单步，多步反应。

周更新。

可通过反应式检索，可通过物质、文献链接。

SciFinder包含的反应数据库


SciFinder反应检索途径

文献

反应物质

结构部分结构

官能团


SciFinder 中的反应检索和分析


反应查询工具


与反应定义有关的功能键

反应位置标记工具

反应箭头

反应官能团列表

反应原子标记工具

反应角色工具


检索特定物质之间的反应

CHO COOH


使用精确反应检索获得特定的反应

精确反应检索


一共10种分析手段

Analyze下的分析工具


一共4种限定手段



获得符合要求的反应类型

点击，可以直接获得包含这条反应的记录

点击，可以直接获得这些反应的记录，实现从反应到文献的连接


反应检索举例---检索对反应位置和原子有特定要求的反应

O原子反应前后必须配对

C=O键必须发生反应

除已有的环外，不能成环


用mapping tool键标示O原子反应

前后位置

用site marking tool键标示C=O键反应的位置。

用Lock out ring tool键锁定环

对反应作出条件限定

亚结构反应检索


看到类似的反应都查询出来

类似的反应物和产物都用红色标记出来


获得从仲醇转换成酮的反应，同时要求反应中的伯纯不能参与反应

R R

O

R R

O H

R OH

检索官能团变化的反应


定义每种不同官能团的角色，Non-reacting只能定义官能团

选择反应中需要出现的官能团

通过官能团定义工具定义反应


获得符合官能团变化的反应


检索类似物的反应

获取反应物为非硫醇的缩醛化反应

CHO S

S

HS

HS

通常使用的一些硫醇,如甲硫醇、乙硫醇和苄硫醇等不但有毒、还具有恶臭气味,不仅对环境造成污染,而且危害使用者的健康。现通过SciFinder来查询不含硫醇的缩醛化反应


使用原子标记工具标记反应前后对应的原子

通过亚结构反应检索将所有的反应都找到

亚结构反应检索


看到类似的反应都查询出来

类似的反应物和产物都用红色标记出来


将所有反应，保存成书签格式


使用结构限定工具，将反应物定义为硫醇

使用重复基团定义工具，定义我们不希望检索到的反应物


这是我们不需要的反应

这些都是我们不想要的反应物

使用Combine工具来去除这些反应


选择刚才保存过的书签

这里可以看到保存的书签的详细情况


选择集合操作类型


获得不含硫醇的缩醛化反应


COMBINE-----组合答案集功能

可以对于任意两个同类型的集合进行AND,OR,NOT的操

作

AND

O R

NOT

NOT


*.SFR格式保存-----书签格式保存功能

将结果保存成书签，可以使用SFS再次打开，继续进行检索，也可以对同类的书签进行COMBINE操作


SciFinder 反应检索小结

多用Analyze/Refine，来获得催化剂，溶剂，产率等信息

如果反应只涉及基团之间的变化，用官能团反应可以获得更多的参考

信息

当无法找到具体反应，或者检索结果并不满意，尝试用亚结构反应查

询，可以获得更多的参考信息

如果没有相关反应结果，可获取产物相关的制备文献

更多有关结构和反应的说明，请参考

http://www.igroup.com.cn/cas/products/download.html

http://www.igroup.com.cn/cas/products/download.html


提纲

SciFinder介绍




SciFinder Web介绍


SciFinder Web介绍

SciFinder Web是通过Web来访问SciFinder数据库的方式

友好的用户界面

良好的沟通协作能力

更加强大的反应检索能力

即时跟踪特定研究领域的全球最新动态

……


SciFinder Web是通过Web来访问SciFinder数据库的方式


文献，物质，反应检索入口，默认开始检索文献

可用的检索方法

保存过的结果集

邮件提醒结果集

在机构中寻找或添加联系人

友好的用户界面


寻找和添加联系人


良好的沟通协作能力

添加对文献的评论（Comments）和标记（Tags），可以和您的联系人

分享评论，或者使用标记检索被标记的文献


设定Email提醒，一旦有新的

记录，会发邮件通知

设置提醒文件名和失效时间

可以通过历史导航条返回历史检索界面

即时跟踪特定研究领域的全球最新动态


强大的反应检索能力---相似反应检索

对于单步反应，可以进行相似反应检索


对于选择是全部反应中检索相似反应，还是在当前结果集中检索相似反应

选择相似反应的相似限制

Broad：仅反应中心相似

Miedum：反应中心及附属原子和健

Narrow：反应中心及扩展的原子和健


强大的反应检索能力---溶剂选择限定工具

可以通过溶剂限定工具限定反应的溶剂


点击下拉双箭头，进行溶剂选择，

或通过查找功能，查找溶剂


强大的反应检索能力---设定不参与反应的基团

可以设定不参与反应的基团


点击下拉双箭头，选择不参与反应的官能团，

通过勾选选择不参与反应的官能团


强大的反应检索能力---获得更多的反应

获得更多的反应


用于查询包含了结构相匹配物质的文献，同时文献中有有关该物质合成制备信息


请合理使用SciFinder !!!

千万不要过量下载!

只下载自己要看的记录（缩小范围）

不要用“迅雷”，“快车”之类的工具下载记录

不使用请关闭客户端程序

一旦发生过量下载，CAS将视情节严重采取不同的限制措施

全IP范围内取消全部下载功能

全IP范围内取消部分检索功能

情况严重的，将暂定SciFinder的使用


那么，当我们遇到大量记录时，该怎么做？

这些记录真的是我们想要的吗？

如果真的都想要，我们需要花多少时间把这些记录全部看完？

所以希望大家能够：

多使用Analyze/Refine工具去分析限定文献

获得最为相关的文献才对他进行下载


SciFinder 的程序安装

SciFinder Scholar 客户端程序：

SciFinder Scholar2007.exe

安装过程中，提示：

Do you have a disk labeled Custom Site Files? （选择 No）

site.prf （site）文件

只需将 site.prf 文件复制粘贴到

X:\ScholarCHLR目录下

还可安装 ViewerLite用于查看3D结构


CAS databases streamline the investigative process allowing you to take an

idea and rapidly find the important and necessary information before you

forget about the idea or it loses its excitement. That really is invaluable."

－Dr. Robert Grubbs

2005 Nobel Laureate in Chemistry

CAS的数据库提高了科研的效率。它能激发你的灵感，使你在灵感

消失或淡忘之前快速找到重要的、必需的信息，这简直就是无价之

宝。

罗伯特·格拉布

2005年诺贝尔化学奖获得者


For more information please contact：http://www.igroup.com.cn/cas/

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