Schema VT16 bima15 mikrobiologi v1.5 - Lunds universitet...BIMA15 mikrobiologi VT16 (v1.5) Vecka 1....
Transcript of Schema VT16 bima15 mikrobiologi v1.5 - Lunds universitet...BIMA15 mikrobiologi VT16 (v1.5) Vecka 1....
BIMA15 mikrobiologi VT16 (v1.5)
Vecka 1. Bakteriella strukturer. FL: Grundläggande bakteriologi FL: Introduktion till examinationsuppgiften WS: Introduktion till TBL (Team Based Learning) FL: Bakteriella strukturer
Vecka 2. Bakteriell cellvägg och uppbyggnad. FL: Cellväggens uppbyggnad TBL: Gruppmöte 1 TBL: Readiness Assurance Tests (RATs)
Vecka 3. Metabolism; förberedelser inför lab FL: Bakteriell metabolism
TBL: Planering för laboration S: Kamratgranskning/Författande S: Riskanalys vid laboration
Vecka 4. Bakteriologilaboration Bakteriologilaboration
Vecka 5. Genreglering i bakterier Laboration uppföljning S: Metabolism FL: Bakteriell genreglering
Inskick delmål 1 för kamratgranskning
Vecka 6. Bakteriella genetiska element FL: Akademiskt skrivande
Inskick feedback kamratgranskning WS: Referenshantering Inskick frågor (Vad är svårt?)
TBL: Gruppmöte 2 TBL: Readiness Assurance Tests (RATs)
Vecka 7. Repetition och Kamratgranskning Tillämpning: Genreglering
EL: Vad var svårt? Inlämning av färdigt arbete för kamratgranskning
Vecka 8. Avslutning Inlämning av Feedback på kamratgranskning
Deadline för slutlig inlämning av examensuppgiften. Skickas in till Moodle.
VT 2016 [CELLBIOLOGI - MIKROBIOLOGI (BIMA15) 22.5HP]
2
Kurslitteratur Flera alternativ av kurslitteratur kan användas och diskuteras med kursledare innan start. I
mikrobiologi rekommenderas Microbiology – An Introduction (10-11th ed) av Tortora, Funke och
Case. Mycket information kommer också att utvinnas via den medicinska datorbasen PubMed.
Lärare EB Eleni Bratanis, IKVL, B14 [email protected]
FP Frida Peterson, IKVL, B14 [email protected]
JD Jonatan Dereke, IKVL, B11 [email protected]
MH Magnus Hillman, IKVL, B11 [email protected]
OS Oonagh Shannon, IKVL, B14 [email protected]
RL Rolf Lood, IKVL, B14 [email protected]
MB Matthias Bank, ITK [email protected]
Lokaler
RG – Rune Grubb
LabBio – lablokaler
C315 - HSC
C218/C217 – Datorsal HSC
VT 2016 [CELLBIOLOGI - MIKROBIOLOGI (BIMA15) 22.5HP]
3
Lokaler för Gruppmöten.
12/2 11/3 Baciller
I1208 I1208
Streptococker
I1211 I1211
Staphylococker
I1212 I1212
Bakteriofager
I1245 I1245
Bdellovibrio
I1250 I1250
Undervisningsmoment FL = Föreläsning
S = seminarium
WS = workshop
TBL = Team based learning
RATs = Readiness Assurance Tests
VT 2016 [CELLBIOLOGI - MIKROBIOLOGI (BIMA15) 22.5HP]
4
Kunskapsmål
Under kursmål 1 – redogöra för human- och bakteriecellers övergripande morfologi och strukturella
organisation samt mekanismer för transport av joner och molekyler över cellmembranet
• Att beskriva olika morfologier för bakterier • Att redogöra för uppbyggnaden av cellväggar för både Gram-positiva och Gram-negativa
bakterier • Att redogöra för strukturella skillnader mellan LPS och LTA • Att beskriva peptidoglykanlagrets uppbyggnad • Att redogöra för skillnader i en bakteries cellstruktur och en human cell • Att redogöra för andra strukturer på bakteriers yta, inkluderande pili och fimbrier
Under kursmål 3 – beskriva hur en gen ser ut och uttrycks samt förklara transkriptions- och
translationsbegreppen och redogöra för likheter och skillnader mellan eu- och prokaryota celler
• Att redogöra för generella skillnader mellan en bakteriell kromosom och humana kromosomer
• Att redogöra för extrakromosomala element i bakterier (plasmider, bakteriofager, mobila genetiska element), samt exemplifiera hur dessa kan påverka bakteriens förmåga att överleva under olika förhållanden
• Att redogöra för generell genreglering i bakterier och uppbyggnaden av operon • Att översiktligt beskriva hur mikrobiella element (plasmider, bakteriofag-DNA) kan användas
inom (molekylärbiologisk) forskning
Under kursmål 6 – redogöra för grundläggande metabola processer i cellen samt hur de samverkar
och regleras
• Att beskriva anaerob och aerob respiration • Att redogöra för bakteriell fermentering • Att beskriva bakteriell fotosyntes och hur detta tillför energi
Under kursmål 7 – redogöra för grundläggande metodik vid rening och analys av DNA, proteiner och
bakterier, samt immunkemiska visualiseringstekniker
• Att redogöra för olika sätt att växa bakterier
• Att känna till hur vi kan använda bakterier för att producera protein
Under kursmål 9 – redogöra för olika skaltyper, deskriptiv statistik, grundläggande statistiska analyser
och hypotesprövningar
• Att känna till begrepp som median, medelvärde och normalfördelning i samband med
mikrobiologiska frågeställningar
VT 2016 [CELLBIOLOGI - MIKROBIOLOGI (BIMA15) 22.5HP]
5
Färdigheter och förmåga
Under mål 1 – planera, utföra, dokumentera och skriftligt sammanfatta laborativt arbete
• Att i samråd med handledare planera, utföra, dokumentera och skriftligt sammanfatta ett
mikrobiologiskt arbete
Under mål 2 – söka vetenskaplig litteratur, samt hantera referenshanteringsprogram
• Att självständigt söka vetenskaplig litteratur till stöd för påståenden i den mikrobiologiska
rapporten, och hantera referenserna med ett referenshanteringsprogram
Under mål 3 – statistiskt analysera och presentera egna data
• Att sammanställa egna data från laborativt arbete i en rapport
• Att använda statistiska tankesätt för att beskriva hur erhållit material är fördelat
VT 2016 [CELLBIOLOGI - MIKROBIOLOGI (BIMA15) 22.5HP]
6
Vecka 1. Bakteriella strukturer
Dag Tid Lektion Grupp Lokal Lärare Mån 1/2
Tis 2/2
10.15-12.00 13.00-14.00 14.00-16.00
FL: Grundläggande bakteriologi Introduktion till examinationsarbetet WS: TBL
RG
RG RG
RL
RL
MH/RL
Ons 3/2
Tors 4/2
10.15-12.00
FL: Bakteriella strukturer
RG
RL
Fre 5/2
VT 2016 [CELLBIOLOGI - MIKROBIOLOGI (BIMA15) 22.5HP]
7
Vecka 2. Bakteriell cellvägg och uppbyggnad
Dag Tid Lektion Grupp Lokal Lärare Mån 8/2
Tis 9/2
10.15-12.00
FL: Cellväggens uppbyggnad
RG
RL
Ons 10/2
Tors 11/2
10.00-12.00 13.00-15.00
Referenshantering och artikelsökning – grupp 1 Referenshantering och artikelsökning – grupp 2
C217
C217
MB
MB
Fre 12/2
10.15-12.00 13.00-16.00
Gruppmöte 1 RATs och diskussion
Grupp
C315
RL
RL
VT 2016 [CELLBIOLOGI - MIKROBIOLOGI (BIMA15) 22.5HP]
8
Vecka 3. Metabolism, förberedelser inför lab
Dag Tid Lektion Grupp Lokal Lärare Mån 15/2
Tis 16/2
10.15-12.00 13.15-15.00
Tillämpning 1 – Mikrobiologisk laboration FL: Bakteriell metabolism
C315
RG
RL
OS
Ons 17/2
Tors 18/2
10.00-12.00 13.00-16.00
S: Kamratgranskning; Författande av texter Laborationen – planering/risker
C315
C315
MH
RL
Fre 19/2
VT 2016 [CELLBIOLOGI - MIKROBIOLOGI (BIMA15) 22.5HP]
9
Vecka 4. Bakteriologilaboration
Dag Tid Lektion Grupp Lokal Lärare Mån 22/2
Tis 23/2
9.00-12.00 13.00-16.00
Lab dag 1 Lab dag 1
1
2
LabBio
LabBio
EB/RL
EB/RL
Ons 24/2
Tors 25/2
9.00-16.00
Lab dag 2
1
LabBio
EB/RL
Fre 26/2
10.00-16.00
Lab dag 2
2 LabBio
EB/RL
VT 2016 [CELLBIOLOGI - MIKROBIOLOGI (BIMA15) 22.5HP]
10
Vecka 5. Genreglering i bakterier
Dag Tid Lektion Grupp Lokal Lärare Mån 29/2
Tis 1/3
9.00-10.00 10.15-12.00
Lab (plattor) S: Metabolism
LabBio RG
RL
OS/FP
Ons 2/3
Tors 3/3
10.00-12.00
FL: Bakteriell genreglering
RG
RL
Fre 4/3
16.00
Deadline inskick första kamrat-granskningen
VT 2016 [CELLBIOLOGI - MIKROBIOLOGI (BIMA15) 22.5HP]
11
Vecka 6. Akademiskt skrivande
Dag Tid Lektion Grupp Lokal Lärare Mån 7/3
☐
Tis 8/3
9.15-12.00 18.00
FL: Akademiskt skrivande; Studieverkstaden Feedback kamrat- granskning
RG
Ons 9/3
Tors 10/3
10.00-12.00 13.00-15.00 16.00
Referenshantering - workshop grupp 1 Referenshantering - workshop grupp 2 Inskick frågor (Vad är svårt)
C218 C218
JD
JD
Fre 11/3
10.00-12.00 13.00-16.00
Gruppmöte 2 RATs och diskussion
Grupp
C315
RL
RL
VT 2016 [CELLBIOLOGI - MIKROBIOLOGI (BIMA15) 22.5HP]
12
Vecka 7. Repetition och Kamratgranskning
Dag Tid Lektion Grupp Lokal Lärare Mån 14/3
Tis 15/3
9.00-12.00
Tillämpning - Genreglering
C315
RL
Ons 16/3
Tors 17/3
10.15-12.00 16.00
EL: Vad var svårt? Deadline: Lämna arbete för kamratgranskning
RG
RL
Fre 18/3
VT 2016 [CELLBIOLOGI - MIKROBIOLOGI (BIMA15) 22.5HP]
13
Vecka 8. Kamratgranskning och Inlämning laborationsrapport
Dag Tid Lektion Grupp Lokal Lärare Mån 21/3
Tis 22/3
16.00
Deadline: Kamratgranskning klar
Ons 23/3
Tors 24/3
Fre 25/3
16.00 Deadline: Inlämning rapport
VT 2016 [CELLBIOLOGI - MIKROBIOLOGI (BIMA15) 22.5HP]
14
Gruppindelning under TBL och kamratgranskare TBL grupper Kamratgranskare Labgrupp
Baciller
Ariana Friberg Hanna Barresjö Johanna Johansson Nikolaos Karabelas Oskar Lundin Elin Meigård
Johanna Johansson Nikolaos Karbelas Oskar Lundin Elin Meigård Ariana Friberg Hanna Barresjö
1a 1a 1b 1b 1c 1c
Streptococker
Lovisa Johansson Alma Thelander Towe Gunnarsson Mathias Boger Louise Grövnes Philip Kanold
Towe Gunnarsson Mathias Boger Louise Grövnes Philip Kanold Lovisa Johansson Alma Thelander
1d 1d 1e 1e 1f 1f
Staphylococker
Sofia Tillgren Helene Jacobsson Sanna Nordberg Tim Benthem Emma Nyberg Kent Johansson
Sanna Nordberg Tim Benthem Emma Nyberg Kent Johansson Sofia Tillgren Helene Jacobsson
1g 1g 1h 1h 2a 2a
Bakteriofager
Zahraa Hassan Hanna Pettersson Tilde Andersson Mohanad Hayatleh Elin Arvidsson David Södergren
Tilde Andersson Mohanad Hayatleh Elin Arvidsson David Södergren Zahraa Hassan Hanna Pettersson
2b 2b 2c 2c 2d 2d
Bdellovibrio
Anni Malm Aida Yifter Lindgren Beatrice Fageräng Eric Lindblad Johanna Olsson Per Hallgren
Beatrice Fageräng Eric Lindblad Johanna Olsson Per Hallgren Anni Malm Aida Yifter Lindgren
2e 2e 2f 2f 2g 2g
VT 2016 [CELLBIOLOGI - MIKROBIOLOGI (BIMA15) 22.5HP]
15
Examination Examination av kunskapsmålen görs framförallt via det skriftliga arbetet (laborations-
rapporten), där även ytterligare frågor ska diskuteras i anknytning till laborationen. I detta
arbete är det viktigt att samtliga kunskapsmål är uppnådda och att det finns en ordentlig
motivering om varför man själv tycker att man uppnått kunskapsmålen. Det är också viktigt
att det är strukturellt välskrivet och vetenskapligt korrekt, dvs att det styrks av vetenskapliga
fakta. Bedömningsmallen ska vara till stor hjälp för att uppnå samtliga kriterier och ni har
också ansvar som kamratgranskare att hjälpa varandra att höja kvaliteten på arbetena. Om
man efter kompletteringen inte uppnår samtliga kriterier ligger ett tillfälle i slutet av augusti
för uppsamlingstentamen av de kursmål som man inte lyckats uppnå.
Vi genomför även tester med flervalsfrågor (så kallade Readiness Assurance Tests)
individuellt och i grupp. Dessa kommer att bedömas formativt och summativt.