Resolucao Exercicios Aa e Pept

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Aminoácidos e Peptídeos Resolução de Exercícios

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Aminoácidos e Peptídeos

Resolução de Exercícios

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• Escreva as estruturas das várias formas de alanina, ácido aspártico e lisina que podem ser obtidas. Mostre como cada forma ioniza em água.

Exercício 1 - Aminoácidos

Alanina: pKa1 = 2,35

pKa2 = 9,87 COOH

H - C - CH3

NH3+

COO-

H - C - CH3 + H+

NH3+

pKa1

pKa2

COO-

H - C - CH3 + H+

NH2

COO-

H - C - CH3

NH3+

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Exercício 1 - AminoácidosÁcido aspártico: pKa1 = 1,99 pKa2 = 9,90 pKaR = 3,90

COO-

H - C - CH2 - COO- + H+

NH2

COOH

H - C - CH2 - COOH

NH3+

pKa1COO-

H - C - CH2 - COOH + H+

NH3+

COO-

H - C - CH2 - COO- + H+

NH3+

COO-

H - C - CH2 - COOH

NH3+

pKaR

COO-

H - C - CH2 - COO-

NH3+

pKa2

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Exercício 1 - AminoácidosLisina: pKa1 = 2,16 pKa2 = 9,06 pKaR = 10,54

COOH

H - C - CH2 - CH2 - CH2 - CH2 - NH3+

NH3+

COO-

H - C - CH2 - CH2 - CH2 - CH2 - NH3+ + H+

NH3+

COO-

H - C - CH2 - CH2 - CH2 - CH2 - NH3+

NH3+

pKa1

pKa2

COO-

H - C - CH2 - CH2 - CH2 - CH2 - NH3+ + H+

NH2

COO-

H - C - CH2 - CH2 - CH2 - CH2 - NH3+

NH2

pKaR

COO-

H - C - CH2 - CH2 - CH2 - CH2 – NH2 + H+

NH2

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Exercício 2 - Aminoácidos

Titulação de Cloridrato de alanina

0

2

4

6

8

10

12

0 0,5 1 1,5 2

OH- (equivalentes)

pH

pK2=9,6

pKa1=2,4

pI=6,0

. Desenhe a curva de titulação de cloridrato de alanina com KOH. Indique pI. São dados: pK1 = 2,4 pK2 = 9,6

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Exercício 3 - Aminoácidos. Conhecidos os valores de pKas, discuta as curvas de titulação do ácido aspártico e lisina.

Ácido apártico: pK1 = 1,99 pK2 = 9,90 pKR = 3,90 Lisina: pK1 = 2,16 pK2 = 9,06 pK3 = 10,54

pKaR=3,90

OH- (equivalentes)

pKa2=9,90

pI=2,94

pKa1=1,99

pI=9,79

Ácido áspartico possui pI entre os pKas dos grupos carboxilícos e lisina possui pI entre os pKas dos grupos amídicos.

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Exercício 4 - Aminoácidos

• Quais são as mobilidades eletroforéticas relativas de glicina, leucina, ácido aspártico, ácido glutâmico e lisina a pH4,7?

mobilidade eletroforética (me) = k . [(pH –pI)/PM]

me(Lys) = -0.034kme(Gly) = -0.016kme(Leu) = -0.009kme(Glu) = 0.010kme(Asp) = 0.012k

Origem +-

Lys Gly Leu AspGlu

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Exercício 1 - Peptídeos

Para o tripeptídeo: Ala-Lys-Ser• a)Classificar os grupos R segundo suas polaridades.

Não polar alifático

Polar carga positiva

Polarsem carga

=

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Exercício 1 - PeptídeosPara o tripeptídeo: Ala-Lys-Ser• b)Diga para que tipo de ligação esses grupos poderiam contribuir na estrutura

terciária de uma proteína.

Ponte de hidrogênio

Interação iônica

interação hidrofófica

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Exercício 1 - Peptídeos

Para o tripeptídeo: Ala-Lys-Ser• c) Calcule o PI sabendo que:

Ala Lys Ser GlupKa1 2,34 2,18 2,21 2,19pKa2 9,69 8,95 9,15 9,67pKa R 10,53 4,25

pI = pKa2 (Ala) + pKa3 (Lys) / 2 = 10,11

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Exercício 1 - Peptídeos

Para o tripeptídeo: Ala-Lys-Ser• d)Para que polo migraria o tripeptídeo numa eletroforese feita a pH=7?

pI = 10,11

Em valores de pH acima do pI o tripeptídeo possui carga negativa e em valores de pH abaixo do pI o tripeptídeo possui carga positiva, portanto, em pH 7 o tripeptídeo possui carga positiva e migraria para o polo negativo.

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Exercício 1 - Peptídeos

Para o tripeptídeo: Ala-Lys-Ser• e) Discuta a capacidade do peptídeo de atuar como tampão.

Esse tripeptídeo possui capacidade tamponante em pHs próximos dos pkas dos grupos ionízaveis, portanto em pHs, entre:

pKa1(Ser) = 2,21 1,21 e 3,21

pKa2(Ala) = 9,69 8,69 e 10,69

pKa R(Lys) = 10,53 9,53 e 11,53

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Exercício 1 - Peptídeos

f) Para o tripeptídeo: Ala-Glu-Ser

• a) Classificar os grupos R segundo suas polaridades

Não polar alifático

Polarsem carga

Polar carga negativa =

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f) Para o tripeptídeo: Ala-Glu-Ser

• Diga para que tipo de ligação esses grupos poderiam contribuir na estrutura terciária de uma proteína.

Exercício 1 - Peptídeos

Ponte de hidrogênio

Interação iônica

interação hidrofófica

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f) Para o tripeptídeo: Ala-Glu-Serc) Calcule o PI sabendo que:

Ala Lys Ser GlupKa1 2,34 2,18 2,21 2,19pKa2 9,69 8,95 9,15 9,67pKa R 10,53 4,25

pI = pKa1(Ser) + pKaR (Glu) / 2 = 3.23

Exercício 1 - Peptídeos

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Exercício 1 - Peptídeos

f) Para o tripeptídeo: Ala-Glu-Ser

Para que polo migraria o tripeptídeo numa eletroforese feita a pH=7?

pI = 3.23

Em valores de pH acima do pI o tripeptídeo possui carga negativa e em valores de pH abaixo do pI o tripeptídeo possui carga positiva, portanto, em pH 7 o tripeptídeo possui carga negativa e migraria para o polopositivo.

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Exercício 1 - Peptídeos

f) Para o tripeptídeo: Ala-Glu-Ser

Discuta a capacidade do peptídeo de atuar como tampão.

Esse tripeptídeo possui capacidade tamponante em pHs próximos dos pkas dos grupos ionízaveis, portanto em pHs, entre:

pKa1(Ser) = 2,21 1,21 e 3,21

pKa2(Ala) = 9,69 8,69 e 10,69

pKa R(Glu) = 4,25 3,25 e 5,25