Rech doc msa 2009
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La recherche documentaire en médecine sur l’Internet
Philippe EveillardINMA – Tours
5 et 6mai 2010
Seattle Library par fimoculous Licence CC - Paternitéhttp://www.flickr.com/photos/fimoculous/54700092/
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Programme de la formation
Les moteurs de recherche – GoogleLangage, syntaxe, ressources.Exercices avec Google.Google Scholar : caractéristiques et exercices.
Les répertoires médicaux – CISMeFLangage, syntaxe, ressources.Exercices avec le module Terminologie.Exercices avec le module de recherche avancée.
MEDLINE/PubMedMEDLINE (banque de données) et PubMed (interface).Le langage MeSH – L’affiliation descripteur/qualificatif.Les champs – l’explosion – la pondération.La formulation des débutants (Limits)La formulation des experts (« linéaire »)Les filtres – le coffre-fort My NCBI
Les utilitairesLes sites Internet « utiles » et « accessibles »
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Google et Google Scholar
Einstein Google Logo AT Google Kirkland par dannysullivan Licence CC - Paternitéhttp://www.flickr.com/photos/dannysullivan/272645770/
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Le langage des moteurs de recherche (et de Google) est le langage courant = votre langage
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Les moteurs de recherche – Google – le langage
Philippe EveillardINMA - Tours5 et 6 mai 2010
Dans Google, comparer les réponses obtenues dans la première page de résultat avec les requêtes :Polyarthrite chronique évolutivePolyarthrite rhumatoïde
Exercice
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Les moteurs de recherche – Google – le langage
Philippe EveillardINMA - Tours5 et 6 mai 2010
CommentairesChacune des 2 requêtes affiche des notices différentes.Un outil de recherche comme Google ne prend pas en compte les synonymies, mais uniquement une chaîne de caractères (y compris les fautes d’orthographe et les erreurs de saisie).
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La syntaxe est élémentaire +++ et se résume à : mettre des guillemets pour les mots composés remplacer l’opérateur AND par un espace
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Les moteurs de recherche – Google – la syntaxe
Philippe EveillardINMA - Tours5 et 6 mai 2010
ExemplesRéanimation « arrêt cardiaque »Recommandations « traitement de l’hépatite C »« Diagnostic clinique » appendicite« Hémorragie méningée » « examen TDM »
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Les moteurs de recherche – Google – la syntaxe – exemple
Philippe EveillardINMA - Tours5 et 6 mai 2010
Rechercher des documents sur le traitement de l’insuffisance cardiaque par les bêta-bloquants
Exercice
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Les moteurs de recherche – Google – la syntaxe – exemple
Philippe EveillardINMA - Tours5 et 6 mai 2010
CommentaireVous obtenez un résultat différent si :-les guillemets de sont pas mis en place ;- bêta-bloquant est au singulier ou au pluriel
Bêta-bloquants « insuffisance cardiaque »
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Documents de la Toile et articles de la presse
CIMG2977 par David Boyle Licence CC – Paternitéhttp://www.flickr.com/photos/beglen/151943525/
![Page 12: Rech doc msa 2009](https://reader035.fdocument.pub/reader035/viewer/2022062303/5586f03cd8b42afa4b8b469f/html5/thumbnails/12.jpg)
Analyser la première page de résultat de la requête bêta-bloquants « insuffisance cardiaque ».Distinguer parmi les résultats les documents et les articles.
Les moteurs de recherche – Google – les ressources
Philippe EveillardINMA - Tours5 et 6 mai 2010
Exercice
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Les moteurs de recherche – Google – les ressources
Philippe EveillardINMA - Tours5 et 6 mai 2010
CommentaireGoogle recense principalement des documents de la Toile et plus rarement des articles de la presse médicale.Ces derniers sont plus volontiers hébergés dans les banques de données bibliographiques type Google Scholar ou MEDLINE.
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Les moteurs de recherche – Google – exercices
Rechercher des documents sur le traitement chirurgical du syndrome du canal carpien.
Exercice
Philippe EveillardINMA Tours 5 et 6 mai 2010
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Les moteurs de recherche – Google – exercices
Philippe EveillardINMA - Tours5 et 6 mai 2010
CommentairesLes résultats diffèrent selon la formulation de la requête :« traitement chirurgical » « syndrome du canal carpien »« traitement chirurgical du syndrome du canal carpien »« traitement chirurgical » « canal carpien »Chirurgie « canal carpien »« chirurgie du canal carpien »
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Exercice
Rechercher des documents sur l’inertie clinique dans la prise en charge du diabète de type 2
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Les moteurs de recherche – Google – exercices
Philippe EveillardINMA Tours5 et 6 mai 2010
CommentairesL’interrogation de Google sur un thème médical est d’autant plus performante et adéquate qu’elle est faite dans un langage médical.
« inertie clinique » « diabète de type 2 »
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Exercice
Rechercher des documents sur les types d’organisation des soins primaires
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Les moteurs de recherche – Google – exercices
Philippe EveillardINMA - Tours5 et 6 mai 2010
CommentairesDans Google, les requêtes médico-administratives ou médico-économiques obtiennent plus souvent des réponses satisfaisantes que les requêtes spécifiquement médicales
« types d’organisation » « soins primaires »
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Les moteurs de recherche – Google Scholar – définition
Philippe EveillardINMA - Tours5 et 6 mai 2010
Google Scholar est l’interface de recherche d’une banque de données bibliographiques dont le « fonds » reste indéfini.
Documents +++
Articles+
Articles+++Livres +
Google Scholar
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Les moteurs de recherche – Google Scholar – utile ?
Philippe EveillardINMA - Tours5 et 6 mai 2010
Utile ?OUI, sous réserve : de l’utiliser comme un « coup de sonde » sur un thème de sélectionner les articles récents.
En termes de « précision de la requête », Google Scholar est nettement moins performant que MEDLINE (PubMed)
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Comparer les résultats obtenus en interrogeant CISMeF avec : PR, Polyarthrite rhumatoïde, Polyarthrite chronique évolutive
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Les répertoires médicaux – CISMeF – Le langage
Philippe EveillardINMA - Tours5 et 6 mai 2010
Langage de CISMeF = langage MeSH
Polyarthrite rhumatoïde est un mot clé (descripteur) du langage MeSH (en version française).Il a pour synonyme PR et polyarthrite rhumatoïde.Une requête dans CISMeF donne sensiblement les mêmes résultats quand un descripteur ou ses synonymes sont utilisés.
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Les termes (descripteurs) du langage MeSH appartiennent à un thésaurus dont les particularités sont d’avoir une structure arborescente (les termes ont entre eux des relations hiérarchiques) de rassembler des termes non ambigus (un descripteur = un concept et un seul)
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Les répertoires médicaux – CISMeF – Le langage
Philippe EveillardINMA - Tours5 et 6 mai 2010
La structure arborescente du MeSH
Dans le module terminologie de CISMeF :- entrer « asthme » dans la fenêtre recherche- cliquer sur OK- sélectionner l’onglet « navigation », ce qui affiche le descripteur asthme dans son arborescence.
« asthme » dans la fenêtre « recherche »
L’arborescence du descripteur avec ses
relations hiérarchiques (de niveau supérieur et
de niveau inférieur)
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Les répertoires médicaux – CISMeF – Le langage
Philippe EveillardINMA - Tours5 et 6 mai 2010
La traduction du langage courant en langage MeSH (VF)
1. Entrer le mot clé « décomposé »
(bloquant pour bêta bloquant) dans la
fenêtre2. Ne pas cocher la
case « sans troncature
3. Sélectionner le « bon » descripteur
dans le cadre « réponse »
Confirmation de la sélection
![Page 28: Rech doc msa 2009](https://reader035.fdocument.pub/reader035/viewer/2022062303/5586f03cd8b42afa4b8b469f/html5/thumbnails/28.jpg)
Les répertoires médicaux – CISMeF – Le langage - exercices
Philippe EveillardINMA - Tours5 et 6 mai 2010
Exercices de traduction langage courant – langage MeSH (VF)
Traduire :
• embolie pulmonaire
• maladie de Kahler
• ostéochondrite de hanche
• vitesse de sédimentation
• anti-TNF alpha
![Page 29: Rech doc msa 2009](https://reader035.fdocument.pub/reader035/viewer/2022062303/5586f03cd8b42afa4b8b469f/html5/thumbnails/29.jpg)
Les répertoires médicaux – CISMeF – Le langage - exercices
Philippe EveillardINMA - Tours5 et 6 mai 2010
Corrigé des exercices de traduction langage courant – langage MeSH (VF)
• embolie pulmonaire embolie embolie pulmonaire
• maladie de Kahler Kahler myélome multiple
• ostéochondrite de hanche ostéochondrite maladie de Legg-Calvé-Perthes
• vitesse de sédimentation sédimentation vitesse sédimentation globulaire
• anti-TNF alpha TNF-alpha Facteur de nécrose tumorale-alpha (pour « anti », ajouter un qualificatif… voir plus loin)
![Page 30: Rech doc msa 2009](https://reader035.fdocument.pub/reader035/viewer/2022062303/5586f03cd8b42afa4b8b469f/html5/thumbnails/30.jpg)
Les répertoires médicaux – CISMeF – Le langage – l’affiliation
Philippe EveillardINMA - Tours5 et 6 mai 2010
L’affiliation descripteur/qualificatif +++
Des qualificatifs peuvent s’affilier (se marier) aux descripteurs si (et seulement si) ils ont entre eux des « affinités* ».
Qualificatif = terme qui précise le sens d’un descripteur.
MeSH 2010 :83 qualificatifs
Exemples :Asthme/diagnosticArthrose/complicationsAnalgésiques/effets indésirables
* Affinités
Certains qualificatifs s’affilient : - aux maladies, - d’autres aux médicaments, - d’autres encore aux investigations diagnostiques ou aux protocoles thérapeutiques…
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Les répertoires médicaux – CISMeF – Le langage – l’affiliation
Philippe EveillardINMA - Tours5 et 6 mai 2010
L’affiliation descripteur/qualificatif +++Exemple : épidémiologie de la polyarthrite rhumatoïde
1. Entrée de polyarthrite
dans la fenêtre
2. Sélection de polyarthrite
rhumatoïde dans le cadre de
réponse
3. Sélection de épidémiologie dans la page « accès aux ressources »
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Les répertoires médicaux – CISMeF – Le langage – l’affiliation - exercices
Philippe EveillardINMA - Tours5 et 6 mai 2010
Exercices sur l’affiliation descripteur/qualificatif
Traduire en affiliation descripteur/qualificatif :
• les complications de la sarcoïdose
• la chirurgie du cancer du pancréas
• le régime de la maladie de Crohn
• les indications des bêta-bloquants
• le diagnostic de l’asthme d’effort
![Page 33: Rech doc msa 2009](https://reader035.fdocument.pub/reader035/viewer/2022062303/5586f03cd8b42afa4b8b469f/html5/thumbnails/33.jpg)
Les répertoires médicaux – CISMeF – Le langage – l’affiliation - exercices
Philippe EveillardINMA - Tours5 et 6 mai 2010
Corrigé des exercices sur l’affiliation descripteur/qualificatif
• les complications de la sarcoïdose sarcoïdose sarcoïdose sarcoïdose/complications
• la chirurgie du cancer du pancréas pancréas tumeurs du pancréas tumeurs du pancréas/chirurgie
• le régime de la maladie de Crohn Crohn maladie de Crohn maladie de Crohn/diétothérapie
• les indications des bêta-bloquants bloquant antagonistes beta-adrénergiques antagonistes beta-adrénergiques/usage thérapeutique
• le diagnostic de l’asthme d’effort effort asthme à l’effort asthme à l’effort/diagnostic
![Page 34: Rech doc msa 2009](https://reader035.fdocument.pub/reader035/viewer/2022062303/5586f03cd8b42afa4b8b469f/html5/thumbnails/34.jpg)
Les répertoires médicaux – CISMeF – la recherche documentaire
Philippe EveillardINMA - Tours5 et 6 mai 2010
Simple si réduite à une affiliation descripteur/qualificatif : recours au module Terminologieexemples : complications de l’hépatite C ; contre-indications des anti-émétiques…
Plus complexe si l’équation comporte plusieurs membres : recours au module de recherche avancéeexemples : traitement antibiotique de l’otite moyenne aiguë ; indications des IEC dans l’hypertension…
La requête dans CISMeF
![Page 35: Rech doc msa 2009](https://reader035.fdocument.pub/reader035/viewer/2022062303/5586f03cd8b42afa4b8b469f/html5/thumbnails/35.jpg)
Les répertoires médicaux – CISMeF – la recherche documentaire
Philippe EveillardINMA - Tours5 et 6 mai 2010
Le débit expiratoire de pointe dans le diagnostic de l’asthme de l’enfant
La recherche se fait dans le module de recherche avancée
![Page 36: Rech doc msa 2009](https://reader035.fdocument.pub/reader035/viewer/2022062303/5586f03cd8b42afa4b8b469f/html5/thumbnails/36.jpg)
Les répertoires médicaux – CISMeF – la recherche documentaire
Philippe EveillardINMA - Tours5 et 6 mai 2010
Exercices sur les requêtes dans CISMeF
Rechercher :
• les recommandations sur le traitement de la maladie de Parkinson
• les causes rénales de l’hypertension artérielle
• le traitement antibiotique de l’otite moyenne aiguë
• les effets secondaires des antiviraux dans le traitement de l’hépatite C
• les aides financières pour les personnes handicapées
![Page 37: Rech doc msa 2009](https://reader035.fdocument.pub/reader035/viewer/2022062303/5586f03cd8b42afa4b8b469f/html5/thumbnails/37.jpg)
Les répertoires médicaux – CISMeF – la recherche documentaire
Philippe EveillardINMA - Tours5 et 6 mai 2010
Corrigé des exercices sur les requêtes dans CISMeF
• les recommandations sur le traitement de la maladie de Parkinsonmaladie de Parkinson – thérapie – recommandation pour la pratique clinique
• les causes rénales de l’hypertension artériellemaladies du rein – étiologie - hypertension
• le traitement antibiotique de l’otite moyenne aiguëotite moyenne suppurée – traitement médicamenteux - antibactériens
• les effets secondaires des antiviraux dans le traitement de l’hépatite Bantiviraux – effets indésirables – hépatite B
Les aides financières pour les personnes handicapées aide financière – personnes handicapées
![Page 38: Rech doc msa 2009](https://reader035.fdocument.pub/reader035/viewer/2022062303/5586f03cd8b42afa4b8b469f/html5/thumbnails/38.jpg)
Utilité et « usability »
Dusan ‘s User Interface Challenge par moggs oceanlane Licence CC – Paternitéhttp://www.flickr.com/photos/moggsoceanlane/3008417302/
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Usability– Administratif
Philippe EveillardINMA – Tours5 et 6 mai 2010
Recherche de la loi du mars 2002 relative aux droits des malades
Les autres textes législatifs et réglementaireshttp://www.legifrance.gouv.fr/initRechTexte.do
![Page 40: Rech doc msa 2009](https://reader035.fdocument.pub/reader035/viewer/2022062303/5586f03cd8b42afa4b8b469f/html5/thumbnails/40.jpg)
Usability– Administratif
Formulaireshttp://www.service-public.fr/formulaires/index.html
Demande d'autorisation d'un traitement de recherche dans le domaine de la santé
![Page 41: Rech doc msa 2009](https://reader035.fdocument.pub/reader035/viewer/2022062303/5586f03cd8b42afa4b8b469f/html5/thumbnails/41.jpg)
Usability– Administratif
Philippe EveillardMSA12 et 13 mai 2009
Rapports publicshttp://www.ladocumentationfrancaise.fr/rapports/index.shtml
Recherche du rapport Legmann sur la médecine libérale.
Philippe EveillardINMA – Tours5 et 6 mai 2010
![Page 42: Rech doc msa 2009](https://reader035.fdocument.pub/reader035/viewer/2022062303/5586f03cd8b42afa4b8b469f/html5/thumbnails/42.jpg)
Usability– Administratif
Philippe EveillardMSA12 et 13 mai 2009
Afficher la dernière circulaire en date
Santé-solidaritéhttp://www.circulaires.gouv.fr/index.php?action=rechercher&domaine=Santé,%20solidarité
Philippe EveillardINMA – Tours5 et 6 mai 2010
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Usability– Administratif
Philippe EveillardMSA12 et 13 mai 2009
Recherche d’un établissement pour personnes âgées dépendantes dans la région d’Egletons (Corrèze)
Philippe EveillardINMA – Tours5 et 6 mai 2010
Espace professionnelshttp://www.sanitaire-social.com/rech_pro_001.php
![Page 44: Rech doc msa 2009](https://reader035.fdocument.pub/reader035/viewer/2022062303/5586f03cd8b42afa4b8b469f/html5/thumbnails/44.jpg)
Usability– Médecine du travail
Philippe EveillardMSA12 et 13 mai 2009
Recherche des maladies professionnelles dans le régime agricole pouvant être à l’origine d’une neuropathie périphérique.
Philippe EveillardINMA – Tours5 et 6 mai 2010
CRAMIF – site maladies professionnelleshttp://maladies-professionnelles.cramif.fr/maladies-professionnelles-reperer.php
![Page 45: Rech doc msa 2009](https://reader035.fdocument.pub/reader035/viewer/2022062303/5586f03cd8b42afa4b8b469f/html5/thumbnails/45.jpg)
Usability– Médecine du travail
Philippe EveillardMSA12 et 13 mai 2009
Afficher la fiche du métier de bûcheron
Philippe EveillardINMA – Tours5 et 6 mai 2010
Fiches de métiershttp://www.bossons-fute.fr/index.php?option=com_content&view=category&id=2&Itemid=3
![Page 46: Rech doc msa 2009](https://reader035.fdocument.pub/reader035/viewer/2022062303/5586f03cd8b42afa4b8b469f/html5/thumbnails/46.jpg)
Usability– Médecine du travail
Philippe EveillardMSA12 et 13 mai 2009
Afficher la fiche « espaces verts »
Philippe EveillardINMA – Tours5 et 6 mai 2010
Métiers et activitéshttp://www.travailler-mieux.gouv.fr/-Metiers-et-Activites-.html
![Page 47: Rech doc msa 2009](https://reader035.fdocument.pub/reader035/viewer/2022062303/5586f03cd8b42afa4b8b469f/html5/thumbnails/47.jpg)
Usability– Médecine
Philippe EveillardMSA12 et 13 mai 2009
Afficher la fiche de la paraparésie spastique familiale
Philippe EveillardINMA – Tours5 et 6 mai 2010
Liste alphabétique des maladies rareshttp://www.orpha.net/consor/cgi-bin/Disease_Search_List.php?lng=FR
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Usability– Médecine
Philippe EveillardMSA12 et 13 mai 2009
Recherche des recommandations pour la pratique relatives à la toux prolongée de l’enfant
Philippe EveillardINMA – Tours5 et 6 mai 2010
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