QGISへのHomerangeツールのインストールマニュアル

2013秋

農工大Ｍ２ 石井宏章

概要

Pythonというプログラム言語による仲介「プラグイン」

Rのパッケージ・rgdal・gpclib

・shapefiles・adehabitat

を用いて計算・作図

側位点のシェープファイル（.shp）

行動圏のシェープファイル（.shp）

Home range analysisプラグイン

GISデータを描画するソフト:QGIS・QGISの中で動くプラグインプラグインを介して投げられたデータの統計計算をするソフト：Ｒ

プラグインはQGISの中に入っているので、RとQGISをインストールします。

用意するファイル

①QGIS1.7.1 インストールファイル

“QGIS‐OSGeo4W‐1.7.1‐c58071d‐Setup”（1.7.4と1.8.0だと動かなかった。2.0.1にはプラグインが無い？）

②R 2.11.0 インストールファイル

“R‐2.11.0‐win32”

インストール・設定の流れ

1. QGIS1.7.1をインストール

2. R2.11.0をインストール

3. Rにてパッケージをインストール

“rgdal” ,“gpclib”,“shapefiles”,“adehabitat”

4. パソコンのシステム環境の設定

5. QGISでプラグインをインストール

①QGISのインストール

• http://qgis.org/downloads/

から“QGIS‐OSGeo4W‐1.7.1‐c58071d‐Setup.exe”

を選んでダウンロード

基本的にyesを押していればOK

２－１．RのダウンロードGoogleで”R”で検索すると二番目に出てくる“The R Project for Statistical Computing”に行きますhttp://www.r‐project.org/

“dounload R”をクリック

いろんな国からダウンロードできますがとりあえず一番近いJapanのhttp://cran.ism.ac.jp/をクリック

２－１．Rのダウンロード

パソコンのＯＳを選択

“install R for the first time.”をクリック

“Previous releases”から旧バージョンのダウンロード画面へ進みR2.11.0 を選択、ＯＳを選択してダウンロード

初めに出てくるのは最新バージョン（3.0.2）ですが、旧バージョン（2.11.0）が欲しいので旧バージョンのダウンロード画面まで行き、ＯＳに合ったものをダウンロードします。

２－２．Rのインストール

ダウンロードしたセットアップファイルをクリックし言語を選んであとはYes連打でとりあえずインストール完了

※Rのインストール先をメモしておいてください。

大抵は “C:¥Program Files (x86)¥R¥R‐2.11.0”

３－１．Rにてパッケージのインストール

Rを起動し、4つのパッケージをインストールします

install.packages("rgdal",dep=TRUE)install.packages("gpclib",dep=TRUE)install.packages("shapefiles",dep=TRUE)install.packages("adehabitat",dep=TRUE)

• コンソールにこの↑4行をコピペすると、インストールが始まります。

• 言語は日本語、パッケージのダウンロード元は一番近いTokyoを選択してください

※Rのインストール先とは別の場所にパッケージはインストールされますので、インストール先をメモしておいてください。

大抵は “C:¥Users¥ユーザ名¥Documents¥R¥win‐library¥2.11”

３－２．Rにてパッケージのインストール

インストールされたパッケージを、インストール先から別のフォルダにコピーします“C:¥Users¥ユーザ名¥Documents¥R¥win‐library¥2.11”

の中身を“C:¥Users¥ユーザ名¥R¥win‐library¥2.11”

というファイルを作ってコピーします。

• Documentと同じ階層に”R”というフォルダを作ります。

4－1．パソコンのシステム環境の設定QGISのホームレンジプラグインが、Rのパッケージを認識するようにするため、環境設定を行います。

• コントロールパネルを開き、クラシック表示またはアイコン表示にする

• システムを選択

• システムの先はシステム→システムの詳細設定→システム環境変数

まで行き、そこから詳細の設定を行います

4－2．システム環境変数の変更

• 「システム環境変数」の中から”Path”を選択、編集をクリックします。

• 「システム変数の編集」が開きます• Rのソフトがインストールされているフォ

ルダのうち、binフォルダのあるアドレス“; C:¥Program Files (x86)¥R¥R‐2.11.0¥bin”を変数値の最後に追加。“;”を忘れないでください。入力したらOKをクリック

4－3．システム環境変数の変更

• 「システム環境変数」の新規をクリック

• 「新しいシステム変数」が空欄で出てくるので

変数名に“R_HOME”

変数値に“C:¥Program Files (x86)¥R¥R‐2.11.0”（Rのソフトがインストールされているフォルダのアドレス）

を入力して、OKをクリック

• 最後に、環境変数までもどったらOKを押して終了、パソコンを再起動してQGISでのプラグインインストールに移ります。

5－1．QGISでプラグインをインストール• QGISを起動します

• プラグインをインストールするにはネットに接続する必要があるので、ネットにつなげてください

• メニューにある“プラグイン”にある“Pythonプラグインを呼び出す”をクリック

• 「リポジトリの取得」というウィンドウが出てきます。ちゃんとネットにつながっていると、“状態”の部分に“成功”と表示されます（左図）

• いくつかのリポジトリには接続できませんが、虫して進めると、右図のようなプラグインの一覧が出てくるはずです。

5－1．QGISでプラグインをインストール• 左の欄が「未インストール」のプラ

グインが一覧で出ない場合は、ウィンドウ内

“リポジトリ”

のタブに移動し、“サードパーティーのリポジトリを追加”

をクリックして、サードパーティー（QGISの開発者以外の開発者）が

公開しているプラグインを取得できるようにしてください。

それが完了したら“プラグイン”のタブに戻ります。

5－1．QGISでプラグインをインストール

• プラグインインストーラから

「HomeRange_Plugin」をインストール

• 未インストール状態の”HomeRange_Plugin”があると思いますので、それをクリックして、インストールしてください。

• “壊れています”などのメッセージが出る場合は、一度プラグインをアンインストールした後、リポジトリの追加をして、再びインストールをすればできたりします。