Concepción Campos Asensio Octubre 2016 BibliotecariaHospital Universitario de Getafeccampos@salud.madrid.orgTwitter: @biblioGETAFEBlog: http://ccamposhugf.wordpress.com/

PubMed

Iniciación Avanzado

Qué es PubMed

Historia

Acceso

Búsqueda sencilla:Mapeo automáticoFiltrosOperadores booleanos

Visualización de los resultados

Manejo de los resultados

Búsqueda avanzada Personalización

Pantalla de búsqueda avanzada

Búsqueda booleana con etiquetas de campos

Búsqueda con descriptores MeSH

Configuración de una cuenta

personal en PubMed

Definición de filtros para los resultados

Salvar los resultadosde mis búsquedas

Salvar estrategias yCreación de alertas

•La mayor base de datos mundial de ciencias de la salud, producidapor la NLM•Indiza 5.642 revistas de ámbito mundial (30.000 revistas editadas en todo el mundo) en 40 idiomas (91% en inglés)•La cobertura temática de ciencias de la salud, especialmente de biomedicina, abarcando los campos de la medicina, enfermería, odontología, veterinaria, sistemas de salud, ciencias preclínicas, salud pública,…•Recoge unos 21 millones de referencias bibliográficas, desde 1946 hasta el presente•83% con resumen escrito por los autores de los artículos•Los artículos son indizados con el tesauro MeSH

• PubMed es un motor de búsqueda de libre acceso a la base de datos MEDLINE • PubMed (24 millones de citas) ofrece servicios añadidos para optimizar las

búsquedas como:Artículos de revistas del repositorio de PMC con acceso al texto completo de artículos No solo citas de artículos… ahora también incluye referencias de libros y sus capítulos de libros de NCBI BookshelfOpciones de búsqueda:

Básica y avanzada Filtros metodológicos (“Clinical Queries” y “Special Queries”)Buscador de citas (“Single Citation Matcher”)

Personalización con MyNCBI que permite:Salvar búsquedasGuardar resultadosRecibir actualizaciones automática de las búsquedas por correo electrónico Personalizar preferencias creando filtros propiosIdentificar suscripciones y enlazar al texto completoGestionar la actividad reciente

• Es la plataforma de acceso a MEDLINE más utilizada

http://m-hug.c17.es/

Sistema de acceso unificado a los recursos de la Biblioteca

Ventana de búsqueda básica

999

Clinical Queries: Buscador especializado que tiene incorporados filtros metodológicos: - Clinical Study Category- Systematic Reviews- Medical Genetics

Pantalla Advanced Search Builder

OTROS RECURSOS / More ResourcesMESH Database: permite buscar por descriptores/ palabras clave (MESH) que la base de datos ha asignado a los referencias.

Journal Database: incluye todas las revistas indizadas en PubMed, y se pueden localizar por: título, abreviatura, ISSN, especialidades…

• Acrónimo de Medical Subject Headings (MeSH) • Vocabulario controlado de términos biomédicos que describen el

contenido de cada artículo que se ingresa en la base de datosMedline

• Es una característica distintiva de MEDLINE• Aproximadamente 27.500 términos médicos• Revisados anualmente• Organizados de manera polijerárquica• Major/minor terms• 1 referencia bibliográfica = 12 términos del Tesauro

MeSH Browser disponible en: http://www.nlm.nih.gov/mesh/MBrowser.html

MeSH Browser disponible en: http://www.nlm.nih.gov/mesh/MBrowser.html

Coletti MH, Bleich HL. Medical subject headings used to search the biomedical literature. J Am Med Inform Assoc. 2001 Jul-Aug;8(4):317-23. Erratum in: J Am Med Inform Assoc 2001 Nov-Dec;8(6):597. PubMed PMID: 11418538; PubMed Central PMCID: PMC130076.Coletti MH, Bleich HL. Medical subject headings used to search the biomedical literature. J Am Med Inform Assoc. 2001 Jul-Aug;8(4):317-23. Erratum in: J Am Med Inform Assoc 2001 Nov-Dec;8(6):597. PubMed PMID: 11418538; PubMed Central PMCID: PMC130076.

1 Identificar los conceptos claves de nuestra búsqueda

2 Escribir nuestros términos o conceptos claves (en inglés) en la ventana de búsqueda.

3 Pinchar en botón Search

4 Borrar

Colon cancer

Localiza cualquier término/s presente/s en las referencias

(título, resumen, materia… y mapea)

BÚSQUEDA BÁSICA

Colon cancer

171717

Search details: Nos muestra la verdadera estrategia de búsqueda

181818

Estrategia de búsqueda con mapeo del término

Lo que hemos escrito en la ventana de búsqueda

191919

Mapeo automático de términos

Colon cancer

Introducir la palabra o palabras dentro de la ventana de búsqueda y pulsar el botón SEARCH o la tecla ENTER

Recupera los registros en los que encuentra correspondencia con el término

Similar ArticlesLas referencias tienen el enlace “Similar Articles”

Es un algoritmo de búsqueda en el que PubMed compara palabras del Title y Abstract de cada cita, así como los encabezamientos MeSH asignados.Los resultados se muestra en orden de relevancia y no por fecha

Hay muchas razones para refinar nuestra estrategia. Si queremos:

Excluir idiomas que no entendemosBuscamos artículos que han sido publicados en cierto periodo de tiempoRecuperar artículos referentes a una población específica Buscar sólo estudios de investigación clínica

Sólo los filtros más populares aparecen por defecto. Si queremos ver mas:Show additional filters

Usando operadores BooleanosAND, OR, NOT

stress AND depressiondepression OR sadness OR unhappy depression NOT manic

En PubMed el operador AND es el que aplica por defecto

Se procesan de izquierda a derecha

Los operadores booleanos se escriben en mayúsculas

ESTRUCTURA TESAURO

Parte alfabética:

todos términos desde A a Z

Parte jerárquica o arbórea:

T. genérico

T. específico

T. específico

T. + específico T. + específico

Revised 2013/09PubMed for Trainers

Entry Terms:

� Neoplasms, Pulmonary � Neoplasm, Pulmonary � Pulmonary Neoplasm � Neoplasms, Lung � Lung Neoplasm � Neoplasm, Lung � Pulmonary Neoplasms � Lung Cancer

� Cancer, Lung � Cancers, Lung � Lung Cancers � Cancer of Lung � Pulmonary Cancer � Cancer, Pulmonary � Cancers, Pulmonary � Pulmonary Cancers � Cancer of the Lung

Lung NeoplasmsTumors or cancer of the LUNG.

Subheadings / Subencabezamientos o cualificadores

n Describen un aspecto (cualificadores) particular de un encabezamiento MeSH

n En total hay 83 subheadings organizados por categorías:

Administration & dosage Adverse effects Complications Diagnosis Drug therapy Epidemiology Organization & administrationPharmacokineticsPrevention & controlSurgeryTherapeutic use

OTROS RECURSOS / More ResourcesSeleccionamos MeSH dentro del menú More Resources de la página de inicio de PubMed

MeSH Database

n Es el nombre de una base de datos que ayuda a los usuarios de PubMed a localizar los términos apropiados para la búsqueda

n Esta base de datos proporciona información de los términos MeSH incluyendo:¨ Definiciones¨ Sinónimos del concepto¨ Subencabezamientos¨ Términos relacionados¨ La posición del encabezamiento dentro de la estructura

jerárquica MeSH

Indización con encabezamientos MeSH

n Los indizadores de MEDLINE de la NLM examinan los artículos y asignan los encabezamientos MeSH apropiados más específicos que describan los conceptos principales que se tratan en el artículo.

n El indizador asigna tantos encabezamientos como sean apropiados para cubrir los temas del artículo: generalmente de 5 a 15.

n El término MeSH que refleja los puntos principales o Major MeSH de un artículo es señalado con un asterisco (*) por los indizadores.

MeSH Database

Una vez en la pantalla de MeSH Database, escribimos Eye y pulsamos Search:

En el resultado encontrado, pinchamos en Eye

Subheadings o subencabezamientos

MeSH Major Topic y Do Not Explode

Nos aparece el registro completo para Eye

Este término está situado en dos ramas

Posición del término en la estructura jerárquica

Términos relacionados de posible interés

Ejercicio con MeSH: diagnóstico de la bursitis

En la ventana de búsqueda escribimos Bursitis

Seleccionamos el subheading Diagnosis

Add to search builder

Search PubMed

434343

Pregunta clínica para la que buscaremos una respuesta

empleando la búsqueda por MeSH

En niños con diarrea ¿la administración de probióticos produce una disminución

de la Intensidad y/o de la duración de la diarrhea?

444444

Consideraciones finales• Realizar búsquedas mediante la opción MeSH

Database es sólo una de las múltiples formas de buscar en PubMed

• Las búsquedas son mas precisas pero menos sensibles

• Deberemos tener en cuenta que si buscamos por MeSH la búsqueda es más precisa pero se pierde todas aquellas referencias más recientes no incorporadas a MEDLINE

o Esta página muestra las estrategias de búsqueda y el número de elementos encontrados para cada búsqueda.

o Los números de búsqueda se pueden combinar entre sí o con los nuevos términos de búsqueda con la lógica booleana (por ejemplo, # 1 y # 2).

464646

474747

484848

494949

505050

o Cada campo de un registro bibliográfico, se identifica mediante una etiqueta de dos o más letras (calificadores de campo), que podemos añadir a continuación de cada término entre corchetes: ej.: mycobacterium bovis[mh].

o Tanto los términos de búsqueda como los calificadores de campo, no importa si se escriben en mayúscula o minúscula ni el espacio ej.: cysticercosis [mh] = Cysticercosis[mh] = CYSTICERCOSIS [MH]

Ejemplos de Búsquedas Booleanas con calificadores de campo

• Etiquetas de los campos más utilizados:• MeSH Headings [MH]• Subheadings [SH]• Pharmacologic Action [PA]• Text Words [TW]• Affiliation [AD]• Title [TI]• Language [LA]• Author [AU]• Journal title [TA]• Publication type [PT]• Year [DP]

• Citas que contengan a Perlman como autor, que trate de tuberculosis y publicado en 1999:Tuberculosis[mh] AND perlman [au] AND 1999 [dp]

• Artículos que traten de la fiebre o hipertermia en la tuberculosis pulmonar:Tuberculosis, pulmonary [mh] AND (hyperthermia OR fever)

• Artículos de revisiones en inglés que traten sobre la terapéutica del asma en niños preescolares:asthma/therapy [mh] AND review [pt] AND child, preschool [mh] AND english [la]

54

Es una herramienta que permite guardar/recuperar en un servidor remoto (accesible en cualquier momento con solo conectarse a Internet) estrategias de búsqueda, crear alertas, guardar referencias bibliográficas e incluso personalizar, mediante la elección de filtros, el uso de PubMed.

•Es necesario un registro previo

• Entrar cada uno a su correo para validar el e-mail y poder recibir alertas.

• Hacerlo antes de las 24 horas del registro en MyNCBI

Solo marcar casilla de “Filter”

Visualizamos la referencia en formato Abstract

Pinchamos sobre el icono “Localizar en mi Biblioteca”

Acceso al texto completo desde MEDLINE/PubMed

Aparece el texto completo del artículo

Pinchando sobre el icono PDF, veremos el artículo en este

formato

Acceso al texto completo desde MEDLINE/PubMed

Aparece el texto completo del artículo en formato PDF

• Últimos 5 años: "published last 5 years"[Filter]• ARTÍCULOS ESCRITOS EN INGLÉS, FRANCÉS Y ESPAÑOL:

ENGLISH[LA] OR SPANISH[LA] OR FRENCH[LA]

• ECC Y RS(randomized controlled trial[Publication Type] OR (randomized[Title/Abstract] AND controlled[Title/Abstract] AND trial[Title/Abstract])) OR systematic[sb]

• Atención Primaria("primary care" OR “Primary Healthcare” OR "family practice" OR "family physician" OR "family physicians" OR “Primary Care Physician” OR “Primary Care Physicians” OR "general practice" OR "general practitioners" OR "general practitioner" OR “family medicine” OR "Primary Health Care"[Mesh] OR "Physicians, Primary Care"[Mesh] OR "Primary Care Nursing"[Mesh])

• Escritos por enfermer*(randomi* OR cohort OR systematic OR RCT) AND (nurse* OR nursing OR LVN OR LPN OR RN OR BSN OR MSN OR ND OR DNSc OR DNP OR enfermer*)

• Crear el filtro de las 5 revistas más relevantes de medicina general e interna

• Entramos en MyNCBI > Filters > Manage Filters > Create custom filter

"N Engl J Med"[Journal] OR "Ann Intern Med"[Journal] OR "Lancet"[Journal] OR "BMJ"[Journal] OR "JAMA"[Journal]

"N Engl J Med"[Journal] OR "Ann Intern Med"[Journal] OR "Lancet"[Journal] OR "BMJ"[Journal] OR "JAMA"[Journal]

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University of Texas Health Science Centerhttp://libguides.sph.uth.tmc.edu/pubmed_filtersISSG Search Filters Resource (Filtros por diseño de studio)https://sites.google.com/a/york.ac.uk/issg-search-filters-resource/homePubMed Clinical Queries (Filtros por diseño de studio)http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/clinicalMcMaster Hedges (Filtros por diseño de studio)http://hiru.mcmaster.ca/hiru/HIRU_Hedges_home.aspxNLM Resources for Informing Comparative Effectivenesshttps://www.nlm.nih.gov/nichsr/cer/cerqueries.htmlSIGN Filtershttp://www.sign.ac.uk/methodology/filters.htmlBMJ Clinical Evidencehttp://clinicalevidence.bmj.com/x/set/static/ebm/learn/665076.htmlCADTH’s Database Search Filtershttps://www.cadth.ca/resources/finding-evidence/strings-attached-cadths-database-search-filtersFliders Search Filtershttp://www.flinders.edu.au/clinical-change/research/flinders-filters/search-filters/search-filters_home.cfmFlinder filtershttp://www.flinders.edu.au/clinical-change/research/flinders-filters/Cindy Schmidt's Blog: PubMed Search Strategieshttp://pubmedsearches.blogspot.com.es/

ATRIAL FIBRILLATION AND DABIGATRAN

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