一、 PubMed 数据库简介 PubMed 是美国国家医学图书馆 (NLM) 下

属的国家生物技术信息中心 (NCBI) 开发的、基于 WWW 的医学数据库查询系统。

PubMed 的网址： http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed

特点：收录范围广、内容全、检索途径多、检索体系完备，可少部分获取原文。

P75

二、通过 PubMed 可检索到如下的信息

MEDLINE

PreMedline

出版商提供的书目信息 NCBI 其它数据库的相关记录

MEDLINE

MEDLINE ：是美国国立医学图书馆MEDLARS 系统中最大的生物医学数据库，收录 1966 年以来 70 多个国家近 4300 种生物医学期刊的书目信息和著者文摘，每周更新。每条记录均带有 [PubMed--Indexed for MEDLINE] 标志。

PreMedline ：收集未正式给予 MeSH词、出版类型等深度标引信息的一个临时库。 NLM 每天把最新记录加入到 PreMedline 库中，每条记录均带有 [PubMed--in Process] 标志。工作人员在一周内将这些记录标引，然后转入 MEDLINE ，同时从 PreMedline 中删去。

PreMedline

Pre-Medline Medline

New Data

Collect

PubMed

Process

PubMed

出版商提供的书目信息：出版商提供的是整本期刊的信息，若有部分没有被 MEDLINE 收录， PubMed 仍保存，在记录中做 [PubMed--as supplied by publisher] 的标记。

图 1以下是几条 PubMed 的记录，标记不同，其出自的分库也不同

NCBI 其它数据库的相关记录：PubMed 建立了与 NCBI 其他数据库之间联系。它们是双向网络互连的关系（见下页图）。

其它库

NCBI 中通过 Entrez 可互查的数据库

三、 PubMed 页面的结构 登录 PubMed 主页http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgihttp://www.ncbi.nlm.nih.gov/PubMed/

PubMed 页面的结构 检索提问区相关数据库链接、 检索提问框 、辅助检索工具

检索提示区对各项检索功能的简单描述辅助功能区Entrez 简介、 PubMed 服务、特有检索、相关资源

NCBI 数据库Nucleotide ： DNA序列数据库Protein ：蛋白质序列数据库Genome ：基因组序列数据库Structure ：分子结构模型数据库Popset ：种群、种系发生或突变序列数据库Taxonomy ：微生物类别数据库OMIM ：人类孟德尔遗传学在线数据库。

PubMed 辅助检索工具

Limits （限制功能）Preview/Index （预览 / 索引）History （检索史）Clipboard （剪贴板或文件夹）Details （明细栏）

Journal Browser- 杂志浏览器•MeSH Browser- 主题词浏览器•Citation Matcher- 在表格输入刊物的引文信息来定位特定文章。•Clinical Queries- 与临床相关的疗法，诊断，病因，预后•Cubby- 提供检索策略存储空间•Order Documents- 购买原文•Grateful Med- 连接到 NLM 提供的其他服务。•Clinical Alerts-公布 NIH 资助重要临床研究结果•Clinical Trials- 对公众提供临床科研的当前信息•PubMed Central- 可免费提供全文生命科学文献

服务功能

四、 PubMed 的基本检索功能词语检索及自动词语匹配作者姓名检索杂志名称检索截词检索短语检索逻辑运算符检索

四、 PubMed 的基本检索功能（一）词语检索及自动词语匹配 在检索框中键入一到多个检索词，按“

GO”键，即显示检索结果。 “ clear”按钮可以帮你清除查询框中的内容，然后开始一个新的查询。

四、 PubMed 的基本检索功能（一）自动词语匹配 PubMed 能自动利用它的“自动词语匹配”功能将重要的词语结合在一起，并将不规范的词语转换成规范的用词。如：输入 vitamin c common cold ，系统会将自动转换成 (“ascorbic acid”[MeSH Terms] OR vitam

in c[Text Word]) AND (“common cold”[MeSH Terms] OR common cold [Text Word]) 进行检索。这种处理能使检索结果更精确和全面。

四、 PubMed 的基本检索功能（二）作者姓名检索 在检索框内按照姓 +名缩写 ( 不用标点

) 的格式键入作者姓名，如 Smith ja ，系统会自动在作者字段内进行检索。 如果想进行更精确的检索，可以用双引号将作者名引起来，再加 [au] ，如“ smit

h j”[au]

四、 PubMed 的基本检索功能（三）杂志名检索 在检索框中键入杂志全名molecular biol

ogy of the cell 也可以直接键入 Medline 的期刊标准缩写形式，如： mol boil cell ， 键入刊物的 ISSN( 国际标准出版物代码）进行检索，如 1059-1524 。 Cell transplantation [ta]

四、 PubMed 的基本检索功能（四）截词检索 可利用系统的截词功能获取更多的相关文献，这与 Medline光盘中截词检索的用法是相同的：截词符“ *” 可代表多个字符，将 * 加在检索词后可以表示对所有以该词开头的词进行检索；如： bacter* ，可以检出 bacter, bacteria, ba

cterium, bacteriophage 等词。 PubMed 一次最多可以检索出 150 个词形变异词。如 staph* ，可以产生 150 个起作用，可以采取加长词根的方法进行检索。

四、 PubMed 的基本检索功能（五）短语检索 PubMed 首先将键入的检索词（词组）视为合理的短语在短语索引中进行查找。如： poison i

vy ， PubMed 将其视为词组进行查找。当 PubMed 没有找到该词组时，系统将自动把两个词分开进行检索；

如果不希望系统将两词分开，则需要用“”把检索词括起来，即强迫 PubMed进行词组检索。如“ single cell” 。 当用双引号括起词语时， PubMed 将不执行自动词语匹配功能。

四、 PubMed 的基本检索功能（六）逻辑运算符检索 在检索框中输入逻辑运算符，注意要大写，执行顺序从左向右，可用括号来改变此顺序。 如： lung cancer AND smok* #1 OR #2 (#1 OR #2) AND #3

五、 PubMed 辅助检索工具（一）

1. Limits （限制功能） : 对检索词的限定和修饰，包括字段、年龄、性别、研究对象、出版类型、语种、出版或输入日期以及子字段等。

All Field （字段选择）：共有 23 个字段可供选择Publication Types （出版物类型选择）：有 8 种类型Languages （语种选择）：提供常用的 7 种语种Ages （年龄组选择）：共有 12 个年龄段Gender （性别选择）：男性、女性Human or Animal （人或动物实验选择）Subsets （子集）： 8 个子集Dates （日期）

limited

五、 PubMed 辅助检索工具（二）2. Preview/Index ：Preview 是对检索结果进行预览，显示检索结果的条数和最近三次检索式，用户可根据具体情况在检索提问框中用逻辑运算符组配新的检索式。Index 是对提交的检索词列出按字顺排列的某一字段的索引词表的位置和数量（括弧内），可用流动条来回进行查看列表。选中的词高亮显示，然后选择合适的逻辑运算符进行检索。

preview1检索 Common Cold AND Vitamin C

3. History: 保留所有的检索策略和结果，只有在执行了一次检索后， History才能有记录。显示检索序号、检索词、检索时间以及检索结果数量。可在检索序号之间添加逻辑运算符进行检索，如 #2 AND #6单击记录条数超级链接可以重新显示检索结果。点击 Clear History按键可以清除 History 和 Preiew/Index 中的信息。最多存贮检索式数为 100 个，检索式的存贮时间为 1小时。

五、 PubMed 辅助检索工具（三）

五、 PubMed 辅助检索工具（四）4. Clipboard ：剪贴板或文件夹。用于用户将检索选中记录的暂时保存，方便用户集中打印、下载或索取原文。剪贴板中可存的最多记录为 500 条，如果一小时内无作何操作，记录将自动消失。 将文献添加到 Clipboard 在检索结果界面点击记录左侧的复选框，再点

Add Clip 。被添加到 Clipboard 中的记录，检索记录的数字将变成绿色。

五、 PubMed 辅助检索工具（五）5. Details ：了解PubMed通过自动词语匹配功能、句法规则转换出的实际检索策略和调整、保存检索策略。在检索框下面，显示出检索结果的总数。可以在检索框中修改检索策略，再点击Search按键重新执行检索。点 URL按钮，检索策略将显示在 URL框中，再用浏览器的书签收藏功能保存该策略。

六、特别检索服务Journal Browser ：期刊浏览器MeSH Browser ： 主题词浏览器Citation Matcher ：单篇 / 多篇 引文匹配器 Clinical Queries ： 临床咨询

1. Journal Browser ：期刊浏览器 查找指定期刊上发表的文章。可分别以期刊的全名或名称某个词、期刊名称在 MEDLINE 的缩写或 ISSN号来检索；若点击超链 journals with links to full-text web sites ，可获取与 PubMed 链接提供全文的期刊名单。

2. MeSH Browser ：主题词浏览器 帮助用户查找MeSH 词进行检索，浏览器提供了每个主题词的信息和层次结构，此外，用户可以直接选用副主题词来限制主题词的主要领域。如果输入的词在 MeSH 词表中没有， MeSH 浏览器将显示相关的 MeSH 词。

3. Citation Matcher单篇 / 多篇引文匹配器 单篇引文匹配器可通过已知的刊名、日期、卷、期、论文首页码、作者名等任一项信息查找论文的题录。经常用于核对参考文献的著录细节。 多篇引文匹配器是给出版商用的，一般用户不使用。

4. Clinical Queries 临床咨询 ( 一) 为了帮助临床医生更有效地获取 Pu

bMed 数据库中一般疾病的病因学、预后、诊断、预防以及治疗等方面的信息，PubMed 系统设置了 Clinical queries 功能项。该项具备特殊的过滤器装置能将上述主题文献集中提供检索，这样可以滤除部分不相关或相关性差的文献。

4. Clinical Queries 临床咨询（二） 治疗（ therapy)研究范畴 诊断 (diagnosis) (Category) 病因 (etiology) 预后 (prognosis) 强调程度 灵敏度 Sensitivity(Emphasis) 专指度 Specificity

七、检索结果的处理（一）显示检索结果 (Display) ： PubMed 可用6种不同的格式显示检索结果，默认Summary格式。可通过 Display下拉菜单选择其它显示方式： Brief ， Abstract ， Citation ， MEDL

INE and ASN.1 等，可以根据需要进行选择。 点击 Text键， 系 统显示 记 录 的 纯文本形式 。 点击 Show键，可选择每页显示的记录条数。 点击 Select Page的数字，显示相应Web页的记录点击 Sort键，可以分类显示。

Display

text

text1

show

page

sore

各种显示方式的主要内容Summary—— 作者姓名、文章题目、出处、记录状态、语种、出版物类型、 PMID 。Brief—— 作者姓名、文章题目的前 30 个字母、 PMIDAbstract—— 出处、记录状态、文章题目、作者姓名、作者单位、文摘、出版物类型、缩写、注释、 PM

ID 等。Citation—— 出处、记录状态、文章题目、作者姓名、作者单位、文摘、出版物类型、缩写、注释、 MeS

H 、化学物质名称、 SI 数据库索取号、基金号、 PMID 等。

MEDLINE——所有记录字段都是以两个字目格式显示，应用该格式保存套录记录可以用文献管理者软件保存。

七、检索结果的处理（二）保存 (Save) 浏览器提供的保存功能可保存当前屏幕上的结果； 点击sent to file，可以保存所有的检索结果或选择保存；系统允许以不同的显示格式保存检索结果；最多一次可以保存 10000 条。

可以保存 Clipboard 中的记录， Clipboard 中最多可有 500 条记录。

存盘时 PubMed默认文件名为“ query.fcgi”。该文件名可以修改，文件格式也可在“ .fcgi” 和“ .txt” 中选择。

save

直接全部存在本地盘

save1

save2

七、检索结果的处理（三）打印 (Print) 可以利用浏览器的打印键进行屏幕上内容的打印。 如果要选择打印，可以先将所选的文献添加到 Clipboard ，然后再打印。

七、检索结果的处理（四）链接 (Links)链接相关文献 (Related Articles Links)PubMed 系统中的每条文献记录均有一个相关文献链接，在检索结果的显示状态下，每条记录的右边均有“ Related Articles”超链接。点击该链接，系统按文献的相关度从高到低显示相关文献。链接 NCBI 数据库Protein 数据库、 Nucleutide 数据库、 PopSet数据库、分子三维结构模型数据库（ MMDB）、 Genome数据库。

七、检索结果的处理（四）链接 (Links) 之二链接外部资源—— LinkOut LinkOut 是链接到本站点外部信息的出口。可以与出版商

、信息集成者、图书馆、生物学数据库、序列中心等链接来获取更多的相关信息。

链接带星号的 LinkOut 是表明提供者需要订阅、会员资格或需要交费进入。

链接相关图书—— Books 为帮助用户解决对检索结果中不熟悉的要领提供背景资料

八、 PubMed 与 MEDLINE光盘检索比较

PubMed MEDLINE

收录范围 √数据更新 √检索的规范性 √提供相关链接 √速度及费用 √

实 习 近十年维生素 C 在普通感冒中的作用的文献（带有文摘）

Vitamin C Common cold

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