Projeto imagens biomédicas Parte I
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Projeto de Imagens BiomédicasParte I
Bruno Otilio
Felipe Hideki
Paulo Marques
Prof. Matheus Cardoso
•Problemática
•Métodos aplicados
•Resultados
•Conclusão
•Bibliografia
ICT - UNIFESP 2
Sumário
17/06/2016
Objetivos
ICT - UNIFESP 3
Segmentação
Avaliação estatística
VP%, FP%, FN%, OD% e OR%
17/06/2016
Problemática
ICT - UNIFESP 4
Estudo do Lúmen arterial é uma etapa importante no diagnóstico e prognóstico de diversas doenças
http://www.theplc.net/MI.shtml
Lúmen preservado
Aberturas e bordas nãobem definidas
Reflexo e aberturas
17/06/2016
Métodos aplicados
ICT - UNIFESP 517/06/2016
ICT - UNIFESP 6
Parte I – Original Parte II Parte III Parte IV
IOCT_012
Graythresh (Otsu) bwareaopen Imopen
Medfilt2
Métodos aplicados
17/06/2016
ICT - UNIFESP 7
Métodos aplicados
A escolha do filtro medfilt2, comoetapa de pré-processamento, decai sobre o fato de permitir a retirada
de pontos extremos, indicados pelas setas; tais artefatos podem
interferir durante o processo de abertura e fechamento.
Medfilt2
IOCT_01
17/06/2016
ICT - UNIFESP 8
Métodos aplicados
Parte III Parte IV
Aplicando a função “imopen” o
artefato do cateter, que antes
estava conectado a borda, foi
desacoplado.
17/06/2016
ICT - UNIFESP 9
Métodos aplicados
Parte V Parte VI Parte VII Parte VIII
bwareaopen
Imclose ImcoplementImerode
imdilate
bwselect
17/06/2016
ICT - UNIFESP 10
Métodos aplicados
Verdadeiros_positivos: 99.7273Falsos_positivos: 1.4999
Falsos_negativos: 0.2727Overlap_Dice: 99.1191Overlap_Ratio: 1.9678
Raw IOCT_12 Segmentada IOCT_12 Padrão Ouro IOCT_12
17/06/2016
Resultados
ICT - UNIFESP 1117/06/2016
A tabela preenchida se encontraem anexo.
Conclusão
• A função medfilt2 mostrou como a melhor opção de pré-filtragem
• Usando funções como Graythresh, bwareaopen, Imcoplement, Imerode e
Imdilate permitiu o ajuste optimo para aplicação de das funções de abertura e
fechamento.
• O código apresentado mostrou-se eficaz na segmentação de lumen com
bordas definidas ou não.
ICT - UNIFESP 1217/06/2016
Bibliografia
• MathWorks – MatLabhttp://www.mathworks.com/
ICT - UNIFESP 1317/06/2016
Obrigado!
ICT - UNIFESP 1417/06/2016
ICT - UNIFESP 1517/06/2016
Anexo