1

Projekt EU na Lékařské fakultě UP v Olomouci

TENTO PROJEKT JE SPOLUFINANCOVÁNEVROPSKÝM SOCIÁLNÍM FONDEM A STÁTNÍM ROZPOČTEM ČESKÉ REPUBLIKY

„Zavádění principů medicíny založené na důkazu do výuky na vysokých školách“

Řešitelské pracoviště: Lékařská fakulta UP v Olomouci

Garant: Prof. MUDr. Vladimír Mihál, CSc.

URL: http://ebm.upol.cz

2

Získávání informací Získávání informací pro obor zubní pro obor zubní

lékařstvílékařstvíZdroje & PostupyZdroje & Postupy

Mgr. Jarmila PotomkováMgr. Jarmila PotomkováLékařská knihovna & Ústav lékařské biofyziky LF UP v OlomouciLékařská knihovna & Ústav lékařské biofyziky LF UP v Olomouci

potomkov@tunw.upol.czpotomkov@tunw.upol.cz

Odborná spolupráce: Odborná spolupráce:

Doc. MUDr. Dagmar Koukalová, CSc.Doc. MUDr. Dagmar Koukalová, CSc.

Ústav mikrobiologie LF UP v OlomouciÚstav mikrobiologie LF UP v Olomouci

Technická spolupráce:Technická spolupráce:

RNDr. Dana ŠubováRNDr. Dana Šubová

Lékařská knihovna UP v OlomouciLékařská knihovna UP v Olomouci

3

Získávání informací Co potřebujeme vědět: Kde vyhledávat (multizdrojový přístup)

Jak vyhledávat Rešeršní strategie (terminologie) Logické vazby mezi termíny (Booleovské

operátory – AND, OR, NOT)

Jak hodnotit kvalitu vyhledaných informací

4

Kde vyhledávat ?Vyhledávací služby „search engines“ Google

Vyhledávací postupyPokročilé vyhledávání

Klasifikace a hodnocení informací

www.google.comInformace z různých zdrojů

www.scholar.google.comInformace z časopiseckých článků

5

Google zvyšuje kvalitu obsahu Tang H., Hwee Kwoo Ng, J. Googling for

diagnosis – use of Google as a diagnostic aid: internet based study. BMJ 2006, published online 10 November.

Giustini D., How Google is changing medicine. BMJ 2005, 331:1487-8.

6

Odborné téma pro vyhledávání:Autorka: Doc. MUDr. D. Koukalová, CSc

Zubní plak jako faktor vzniku zubního kazu

7

* Googlewww.google.com Pokročilé vyhledávání

Výběr terminologie Jazykové vymezení

V jakémkoliv jazyce

Se všemi slovy: plaque caries S přesnou frází: Alespoň s jedním ze slov: dental tooth teeth Výskyt: v názvu stránky

Možné kombinace: dental plaque, plaque on teeth, dental caries, tooth caries, caries of (primary) teeth

8

*Googlewww.google.com Pokročilé vyhledávání

Výběr terminologie Jazykové vymezení

čeština

Se všemi slovy: zubní kaz plak S přesnou frází: Alespoň s jedním ze slov: Výskyt: kdekoliv na stránce

9

GoogleVýsledky vyhledávání Články z odborných časopisů

Citace Abstrakta Plné texty

Přímo od nakladatelů nebo prostřednictvím poskytovatelů (ScienceDirect, Blackwell Publishing, Ovid Technologies, EBSCO, HighWirePress, Proquest aj.)

Odkazy na jiné databáze / katalogy/ vyhledávací služby

PubMed (Medline) – „zlatý standard„zlatý standard“ pro medicínu včetně zubního lékařství

LookSmart Find Articles Journal Watch INIST

10

GoogleVýsledky vyhledávání Webové stránky

Institucí Univerzit Odborných společností Zdravotnických zařízení Farmaceutických firem Médií Obchodních společností Soukromých osob Aj.

Ostatní dokumenty Pacientské informace Obrazová dokumentace Prezentace v powerpointu Bibliografické soupisy Patenty A mnoho dalších…….

11

Hodnocení kvality vyhledaných informací eEurope 2002: Quality Criteria for

Health related Websites

Communication from the Commission to the Council, the European Parliament, the Economic and Social Committee and the Committee of the Regions

12

eEurope 2002: Kvalitativní kritéria pro webové stránky se zdravotnických obsahem Transparentnost obsahu, důvody pro

zveřejnění, příp. zdroje financování; AutorstvíAutorství obsahuobsahu včetně citací použitých

informačních zdrojů; Ochrana pacientských dat; Aktualizace obsahuAktualizace obsahu; Zajištění validity a spolehlivosti

pacientských informací; Technická podpora přístupu k informacím

s ohledem na cílovou skupinu.

13

*Odborné časopisy pro zubní lékařství„Dentistry Journals“ Ulrich´s Periodicals Directory

www.ulrichsweb.com Browse by Subject

Medicine ---MEDICAL SCIENCE-DENTISTRY

Celkový počet časopisů z oboruCelkový počet časopisů z oboru = 1213 Odborné (scholarly) = 424

Recenzované (peer-reviewed, refereed) = 165 ČR=69/LF=10

S impakt faktorem = 4949 ČR=37/LF=7ČR=37/LF=7

Elektronická verze = Elektronická verze = 167167 Recenzované =Recenzované = 100 100

14

*Odborné časopisy pro zubní lékařstvíDostupnost v ČR Síť lékařských a zdravotnických knihoven

Souborný katalog Národní lékařské knihovny v Praze

www.nlk.cz/Katalogy,Databáze/Medvik Roky odběru v souborném katalogu (kód knihovny =

„sigla“) LFUP (OLD002) VKOL (OLA001)

Registrace pro vzdálený přístup (200,- Kč/rok) Lékařská knihovna UP v Olomouci

www.upol.cz/Lékařská fakulta/Pracoviště/IS/Časopisy Vědecká knihovna v Olomouci

www.vkol.cz Např. DENTAL ABSTRACTS Registrace pro prezenční studium (100,- Kč/rok)

15

DENTAL ABSTRACTS Vychází 6x ročně od r. 1955 Stručné informace o obsahu kolem

klíčových článků ze světových stomatologických časopisů Rozsah: ca. 50 článků Záběr: ca. 100 časopisů

Šetří čas nutný pro vyhledávání, získání a studium původní literatury.

Vědecká knihovna v Olomouci Prezenčně ve studovně časopisů

16

Odborné časopisy:Které jsou ty dobré? Recenzování („peer-review“) Měření kvality časopisů podle

citačního ohlasu „„impakt faktor“ (IF)impakt faktor“ (IF)

Bibliometrie 60. léta 20. st. …..aplikace matematických a

statistických metod pro hodnocení vědeckého dopadu psané literatury a ostatních komunikačních médií“

17

*Institute for Scientific Information Ústav pro vědecké informace Philadelphia, Penn., USA

Zakladatel Eugene Garfield www.garfield.library.upenn.edu/ 1960

ISI Citační analýza (Science Citation Index) Impakt faktor časopisů (Journal Citation Reports)

Databáze WEB OF KNOWLEDGE URL: isiknowledge.com

Špála M. Impakt faktor – Dobrý sluha, ale špatný pán. Ikaros [online]. 2006, roč. 10, č. 4 [cit. 2007-01-24]. Dostupný na World Wide Web: http://www.ikaros.cz

18

Impakt faktorZpůsob výpočtu Citovanost v průběhu 3 let IF pro rok 2005 se zjistí takto:

A = kolikrát byly články z daného časopisu publikované v letech 2003 + 2004 citovány jinými sledovanými časpisy v průběhu r. 2005

B = kolik vyšlo v daném časopise za roky 2003 + 2004 článků celkem

IF daného časopisu pro rok 2005 = A : B

19

*Impakt faktor : příklad výpočtu „JOURNAL OF DENTAL RESEARCH“

AA = kolikrát byly články z daného časopisu publikované v letech 2003 + 2004 citovány jinými sledovanými časopisy v průběhu r. 2005

2003: 176 2004: 163 03+04=339

B = kolik vyšlo v daném časopise za roky 2003 + 2004 článků celkem

2003: 666 2004: 416 03+04=1082

IF daného časopisu pro rok 2005 = A : BA : B 1082 : 339 = 3,1923,192

20

Dostupnost časopisů v ČR Caries Research

21

*Časopisy pro zubní lékařstvípodle IF: srovnání s jinými obory

WEB OF KNOWLEDGE http://isiknowledge.com Journal Citation Reports

View a group of journals by Subject Category – Dentistry, Oral Surgery

Abecední řazení změnit podle IF Sorted by: Impact Factor --- Sort again

View all journals Sorted by: Impact Factor --- Sort again

22

*Kde vyhledávat ?Databáze MEDLINE

via PubMed

URL:www.pubmed.com

23

DATABÁZE MEDLINE„Zlatý standard“ pro biomedicínuCharakteristikaCharakteristika

National Library of Medicine /Bethesda, USA Bibliografické citace a autorské souhrny

4,600 časopisů publikovaných v USA a 70 dalších zemích více než 14 mil. záznamů od r. 1966

OldMedline od r. 1950 Většina záznamů z anglicky psaných zdrojů (nebo s anglickým

abstraktem) MEDLINE na platformě PubMed (www.pubmed.com)

originálním obsahem je citace + abstrakt plné texty dokumentů jsou poskytovány hypertextově od nakladatelů

(LinkOut) Přístup k citacím + abstraktům zdarma Plné texty

zdarma licence

24

Odborné téma pro vyhledávání:Autorka: Doc. MUDr. D. Koukalová, CSc

Zubní plak jako faktor vzniku zubního kazu

25

Příprava rešeršní strategie Plán pro vyhledání požadovaných informací Jak na to:

Rozdělte rešeršní dotaz na logické celky Specifikujte hlavní termíny (klíčová slova, víceslovné pojmy) Určete alternativní termíny (synonyma, hierarchii pojmů) Použijte logické operátory pro kombinaci termínů Upřesněte dotaz

Výskyt hledaných termínů v různých částech dokumentu (název, název + abstrakt, text…)

Věkové skupiny Typologie dokumentů (pyramida důkazu) Stáří dokumentu

Praktické zkušenosti, intuice ……

26

Booleovská logika Symbolicky vyjadřuje vztahy mezi pojmy Booleovské operátory:

AND Dokumenty obsahují oba (nebo více) hledaných

terminů dental plaque AND AND dental caries

OR Dokumenty obsahují jeden (nebo všechny) hledané

termíny. Synonyma

dental caries OROR tooth decay

NOT Vylučuje daný termín.

dental caries NOTNOT fluoride

27

Praktické vyhledávání

MEDLINEvia

PUBMED

28

*MEDLINE (PubMed)www.pubmed.comSearch PubMed for:KROK 1(caries OR decay*) AND plaque

Limits: Title

29

Pravostranné rozšířeníTruncation, Wildcard PubMed vyhledá všechny termíny od

slovního základu, za nímž je znak * Příklad:

decay*PubMed vyhledá:decay,decays,

decayed,,,,,,,,

30

*MEDLINE (PubMed)www.pubmed.com

Search PubMed for:KROK 2tooth OR teeth OR dent*

Limits: Title

31

*MEDLINE (PubMed) www.pubmed.comSearch PubMed for:KROK 3 Combine searches - kombinace (AND operator)

#1 AND #2

Limits – další možnosti omezení dotazu Age – věkové kategorie Type of articles – typy publikací

Review – přehledové články Clinical trials – klinické studie aj.

Publication date – kdy článek vyšel Languages – v jakém jazyce byl publikován

32

*Jak PubMed zobrazuje výsledky? Formáty

Summary AbstractPlus MEDLINE Aj.

Zpracování výsledků Send to

Clipboard (vytvoření podmnožiny vybraných záznamů)

Text (převedení do textové podoby) File (uložení do souboru)

33

Přehledové články (review) Klasické review subjektivní a nekvantitativní souhrn dvou a více vědeckých studií. Systematické review kvantitativní kombinace dvou nebo více

souvisejících studií, která umožní získat souhrnnou odpověď na studovanou otázku.

Meta-analýza systematické review, které používá statistické

metody pro hodnocení studií

Potomková J., Význam systematických přehledů pro medicínu založenou na důkazu. Pediatrie pro Praxi 2004(2):105-106. www.solen.cz

34

Randomizované kontrolované pokusy

Kohortové studie

Studie případů a kontrol

Kazuistiky

Laboratorní výzkum

Odborné posudky, konzultace

Systematické přehledy, meta-analýza

Pyramida důkazů

Hierarchické uspořádání vědeckých důkazů v biomedicíně zahrnuje kromě výsledků primárního výzkumui formy sekundárního výzkumu (systematické přehledy a meta-analýzu).

35

Zubní lékařství založené na

důkazu

Vyhledávání a kritická analýza poznatků

36

Archibald L. Cochrane (1909-1988)

Effectiveness and Efficiency.Effectiveness and Efficiency.Random Reflexions on Health Random Reflexions on Health Services. London, 1972.Services. London, 1972.

„Naše povolání bychom měli Naše povolání bychom měli nepochybně podrobit velké kritice. nepochybně podrobit velké kritice. Nebyli jsme zatím schopni Nebyli jsme zatím schopni nabídnout kritický přehled nabídnout kritický přehled (průběžně (průběžně AKTUALIZOVANÝAKTUALIZOVANÝ))všech významných randomizovanýchvšech významných randomizovanýchkontrolovaných studií.“kontrolovaných studií.“

Cochrane CollaborationCochrane CollaborationCochrane LibraryCochrane Library

URL: www.cochrane.org/

37

Randomizovaná kontrolovaná studieCo to je? Klinické studie

Observační (žádným způsobem se nezasahuje do „chodu událostí“, zaznamenávají se zjištění)

Intervenční (výzkumníci určují kdo a jaké léčbě bude podroben)

Randomizované kontrolované

Porovnání dvou skupin osob, z nichž jedna je např. léčena klasickým (kontrolním způsobem) a druhá postupem novým (testovaným).

Zařazení do skupin může být prováděno náhodně nebo nenáhodně.

Náhodné přiřazení (randomizace) omezuje možnost vzniku interpretačních chyb.

38

Randomizované kontrolované pokusy

Kohortové studie

Studie případů a kontrol

Kazuistiky

Laboratorní výzkum

Odborné posudky, konzultace

Systematické přehledy, meta-analýza

Pyramida důkazů

Hierarchické uspořádání vědeckých důkazů v biomedicíně zahrnuje kromě výsledků primárního výzkumui formy sekundárního výzkumu (systematické přehledy a meta-analýzu).

39

Pyramida důkazů : Komentáře

Systematické přehledy a meta-analýzy.

Randomizované kontrolované studie (RCT). RCT s  validními výsledky (tj. intervaly spolehlivosti, jež se

nepřekrývají s prahem klinicky významného účinku, méně než 20% ztrát probandů).

RCT s  méně validními výsledky (tj. výstup ze studie naznačuje klinicky významný účinek, ale  intervaly spolehlivosti se překrývají s prahem pro tento účinek).

Kohortové studie.

Studie případů a kontrol.

Kazuistiky.

Odborné posudky, úvodníky, názory…..

40

Pro další vzdělávání http://ucebnice.euromise.cz

Statistické metody v epidemiologii

41

Téma pro vyhledání důkazůAutor: Prof. MUDr. V.Mihál, CSc

Význam fluoridů v prevenci zubního kazu u dětí a adolescentů z pohledu medicíny založené na důkazu

42

*MEDLINE (PubMed)www.pubmed.comSearch PubMed for:KROK 1(caries OR decay*) AND fluori*

Limits: Title

43

*MEDLINE (PubMed)www.pubmed.com

Search PubMed for:KROK 2tooth OR teeth OR dent*

Limits: Title

44

*MEDLINE (PubMed) www.pubmed.comSearch PubMed for:KROK 3 Combine searches - kombinace (AND operator)

#1 AND #2

Limits – další možnosti omezení dotazu Age – věkové kategorie

Child: 6-12 years, Adolescent: 13-18 years Type of articles – typy publikací

Randomized Controlled Trials – randomizované kontrolované studie

NEBO Subsets

Systematic reviews – systematické přehledy

45

Randomizovaná kontrolovaná studie Příklad Truin GJ, van't Hof MA. Caries prevention by professional

fluoride gel application on enamel and dentinal lesions in low-caries children.

Caries Res. 2005;39(3):236-40.

46

Subsets : Systematic reviewsPříklady přehledových článků Časopisecký přehledMarinho VC, Higgins JP, Logan S, Sheiham A.

Systematic review of controlled trials on the effectiveness of fluoride gels for the prevention of dental caries in children.

J Dent Educ. 2003;67(4):448-58. Review. „Cochrane“ reviewMarinho VC et al. Fluoride gels for preventing

dental caries in children and adolescents. Cochrane Database Syst Rev. 2002, Issue 2.

47

1993 – 50 skupin Zaměření činnosti

„Cochrane Database of Systematic Reviews „

http://www.cochrane.org Access Cochrane Library/AdvancedCochrane Library/Advanced

Přístup do plných verzí systematických přehledů je za poplatek

48

COCHRANE LIBRARYADVANCED SEARCH fluori* Record TitleAND "dental caries" OR "dental decay*„ Record Title

Restrict Search by Product: The Cochrane Database of Systematic Reviews

(Cochrane Reviews - CDSR)

49

Systematický přehledPříklad (CDSR)

Fluoride gels for preventing dental caries in children and adolescents

The record should be cited as: ………….. Datum poslední aktualizace CDSR: ……….

Strukturovaný abstraktBackground(úvod)-Objectives(cíl)–Search strategy

(vyhledávání)–Selection criteria(kritéria výběru studií)-Data collection & analysis(sběr a analýza dat)-Main results(hlavní výsledky)-Authors´conclusions(závěry autorů)-Plain language summary(závěr pro laiky).

50

Systematický přehledPříklad: rozbor (CDSR) Výběr studií

Randomizované studie Výsledky

25 zařazených studií /7747 dětí Meta-analýza Jednoznačný důkaz inhibičního účinku

fluoridového gelu na tvorbu zubního kazu 2 studie popisovaly negativní účinky

Závěry autorů Nutnost dalších klinických studií

51

COCHRANE REVIEWSPřístup k dokumentu v síti LF UP Marinho VCC et al.

Fluoride gels for preventing dental caries in children and adolescents.

Cochrane Database of Systematic Reviews 2002, Issue 1.

http://www.upol.cz/Lékařská fakulta/Pracoviště/Knihovna LF/Databáze

52

Syntetická databáze DynaMedKriticky hodnocené poznatky

http://search.epnet.com

53

Standardní struktura tématv databázi DynaMed

– Popis nemoci (včetně kódu MKN-9)– Příčiny a rizikové faktory– Komplikace– Anamnéza– Fyzikální nález– Diagnóza– Prognóza– Terapie– Prevence & Screening– Použitá literatura (včetně přehledových

článků a praktických postupů - guidelines)

– Pacientské informace

54

Klinická otázka pro dnešní den

P = zubní kaz u dětíI = fluoridyC = bez fluoridůO = prevence zubního kazu

55

Vyhledání tématu v databázi DynaMed

Find dental caries fluorides Text

Dental caries (MKN)

Prevention and Screening

Kvalitativní hodnocení „Levels of evidence“ – úrovně důkazu

56

Pro další vzdělávání http://ucebnice.euromise.cz

Statistické metody v epidemiologii

http://isiknowledge.com WEB OF KNOWLEDGE

57

Zubní lékařství založené na

důkazu

Multizdrojové vyhledávání informací

& bibliometrie

58

Přehled online zdrojů SCHOLAR GOOGLEhttp://www.scholar.google.com

Jen časopisecké články + citační ohlasy (pokud existují)

MEDLINE (PubMed)http://www.pubmed.com

COCHRANE LIBRARYhttp://www.cochrane.org

59

Přehled online zdrojů WEB OF SCIENCEhttp://isiknowledge.com

General Search (multidisciplinární DB) Cited Reference Search (citační ohlasy) Journal Citation Reports (impakt faktor)

NÁRODNÍ LÉKAŘSKÁ KNIHOVNAhttp://www.nlk.cz

Katalogy a databáze (Souborný katalog zahr.časopisů) Bibliographia Medica Čechoslovaca (české články) Česko-anglický tezaurus termínů z lékařství a

zdravotnictví MeSH CZ

60

Klinická otázka pro dnešní den

Minimálně invazivní léčba v parodontologii

Návrh terminologie: [periodontal disease, periodontitis]

periodont* nonsurg* OR noninvasive therap* OR treat* OR manag*

61

SCHOLAR GOOGLE

http://www.scholar.google.com

With all the words: periodontal nonsurgical

At least one of the words: treatment therapy management

Where my words occur: in the title of the article

Articles published between: 2002 2007

62

MEDLINE - PubMed http://www.pubmed.comKrok 1periodont*/Title

Krok 2(nonsurg* OR noninvasive) AND (therap* OR treat* OR

manag*)/Title

Krok 31 AND 2

Krok 4Randomized controlled trial

63

Kritická analýzaRandomizovaná kontrolovaná studie1:Loesche WJ, Giordano JR, Soehren S,

Kaciroti N. The nonsurgical treatment of patients with

periodontal disease: results after five years.

J Am Dent Assoc. 2002 Mar;133(3):311-20.

Kvalita studie: 90/ztráta 46

64

Kritická analýzaRandomizovaná kontrolovaná studie2. Kasaj A, Willershausen B, Berakdar M,

Tekyatan H, Sculean A.Effect of an oily calcium hydroxide

suspension on early wound healing after nonsurgical periodontal therapy.

Clin Oral Investig. 2006 Mar;10(1):72-6.

Kvalita studie: jednoduše zaslepená,19/ ztráta 0, trvání 3 týdny

65

Kritická analýzaSystematický přehledLabriola A, Needleman I, Moles DR. Systematic review of the effect of smoking

on nonsurgical periodontal therapy. Periodontol 2000. 2005;37:124-137.

Comment in: Evid. Based Dent. 2005; 6(2):37-8.

66

COCHRANE LIBRARY http://www.cochrane.orgSearch for: periodont*/Record TitleANDnon-surg* OR noninvasive/

Title,Abstract,Keywords

Restrict Search by Product: CD Systematic Reviews

67

WEB OF SCIENCE http://isiknowledge.com

Cited Reference Search (citační ohlasy)

RCT č.1: Loesche WJ /JADA/ 2002 Times cited: 10x

Journal Citation Reports (impakt faktor)

RCT č.1: Journal of the American Dental Association Impact Factor: 0,935

68

WEB OF SCIENCE http://isiknowledge.com

General Search (multidisciplinární DB)

Postup vyhledávání stejný jako v PubMed

69

VýsledkySrovnání PubMed x Web of Science Počty záznamů: PubMed……..…………………..68

Web of Science ………………59 z toho unikáty……………31

70

NÁRODNÍ LÉKAŘSKÁ KNIHOVNA http://www.nlk.czKatalogy a databáze MEDVIK Vyhledávání časopisůOvěřit dostupnost časopisu:Loesche WJ, Giordano JR, Soehren S, Kaciroti N. The nonsurgical treatment of patients with periodontal

disease: results after 6.4 years.

Gen Dent 2005 Jul-Aug;53(4):298-306

71

NÁRODNÍ LÉKAŘSKÁ KNIHOVNA http://www.nlk.czKatalogy a databáze Tezaurus MeSH (řízený slovník) Bibliographia Medica Čechoslovaca (články v českých časopisech) Medical Subject Headings

72

NÁRODNÍ LÉKAŘSKÁ KNIHOVNATezaurus MeSH Vyhledávání

parodontVyhledá výraz tezauru: periodont

73

NÁRODNÍ LÉKAŘSKÁ KNIHOVNABáze BMC

Vyhledávání: Rejstřík: Název

parodont? and ter? Výsledek: 16 záznamů

Rejstřík: Deskr MeSH periodont and terapie

Výsledek: 50 záznamů

Rejstřík: Všechny parodont? and ter?

Výsledek:127 záznamů