Principles & Applications of Magnetic Resonance Imaging · 1 of 226 腦部氫原子磁振頻譜 1H...
Transcript of Principles & Applications of Magnetic Resonance Imaging · 1 of 226 腦部氫原子磁振頻譜 1H...
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腦部氫原子磁振頻譜
1H MR Spectroscopy
鍾孝文 教授
台大電機系 三軍總醫院放射線部
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先回顧一下 MRI
Bo
水 水
信號頻率 = 63.87 MHz
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氫原子核單一共振頻率 ?
同是氫原子核 卻有許多不同頻率
放大數百倍之後 ...
看似單一頻率
頻率
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許多隱藏的訊息
• 任何氫原子核都可能給信號 !
• 頻譜上的 “小尖峰”
– 除了水之外的其他成份氫原子核
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為什麼不同成份頻率不同 ?
• 化學環境不同
• 鍵結的原子不一樣
• 電子雲遮蔽效應使磁場削弱
– 化學位移 (chemical shift)
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Chemical Shift 化學位移現象
電子雲的磁場遮蔽效應
O H C H
氧原子吸引電子雲 使氫原子的遮蔽效應較低
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最明顯的例子
• 水 (O-H) 與脂肪 (-CH2-)
• -CH2- 上的氫核旋進較慢
• 頻率相差 3.5 ppm (220 Hz at 1.5T)
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質子在腿部的 MR 頻譜
水與脂肪的共振頻率不同
水 H2O 脂肪
-CH2-
ppm
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隱藏小尖峰所提供的訊息
• 化學環境 共振頻率 (ok)
• 尖峰頻率 氫的化學環境 ??
• 氫的化學環境 化學成份 ??
• 尖峰高矮 成份多寡 ??
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質子在腿部的 MR 頻譜
水與脂肪可以相對定量了 !
水 H2O 脂肪
-CH2-
ppm
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首先 ...
• 其實這就是核磁共振頻譜 (NMR) 天
天在做的事情之一
• 如果能得知人體內化學成份的分佈、
多寡、變化、 ... ??
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我們先誇張地想像一下
相信是許多人的夢想
解剖結構
腦部功能障礙
生理及病理狀態
生物化學反應
細胞內部活性
治療方式
神奇的透視鏡
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夢想的 “大約” 實現方式
綜合式的 MRI/MRS 檢測
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MRS 的最重要目的
• 提供一部份體內生化反應的訊息
• 幫助診斷,幫助瞭解病因,幫助
持續監督療效
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腦中所看得到的成份
• 氫原子核頻譜 (1H MRS)
• NAA、Cr、Cho、Lac ...
• mI、Glu、Gln、GABA ...
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正常人腦部看得到的 1H 頻譜成份
NA
Cr
Cr
NA
Cho
mI
Glx
Glx
4 3 2 1 0 ppm
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正常人腦部看得到的 1H 頻譜成份
NA
Cr
Cr
NA
Cho
mI
Glx
Glx
4 3 2 1 0 ppm
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N-acetylaspartate (NAA)
NAA : a neuronal marker
2.0 ppm
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NAA
• 一種 neuronal marker
• 至今其作用仍不得而知
• 但是只要神經細胞還活著就有它
• 看不到 NAA 區域死得差不多了
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正常人腦部看得到的 1H 頻譜成份
NA
Cr
Cr
NA
Cho
mI
Glx
Glx
4 3 2 1 0 ppm
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Creatine/Phosphocreatine (Cr/PCr)
磷酸根的提供者
3.0 ppm
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Cr
• Phosphocreatine 是 ADP 轉為
ATP 時所需磷酸根的提供者
• ATP : 細胞代謝的能量來源
• Cr 與細胞代謝能量息息相關
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正常人腦部看得到的 1H 頻譜成份
NA
Cr
Cr
NA
Cho
mI
Glx
Glx
4 3 2 1 0 ppm
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Choline (Cho)
神經傳導物質 acetylcholine 及其他
3.2 ppm
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Cho
• 含於 acetylcholine (乙醯膽鹼) 及
phosphocholine 等成份之中
• Myelin sheath 崩解與 membrane
turnover 的產物
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正常人腦部看得到的 1H 頻譜成份
NA
Cr
Cr
NA
Cho
mI
Glx
Glx
4 3 2 1 0 ppm
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Myo-inositol (mI)
荷爾蒙訊息傳送物的一種儲存形式
3.56 ppm
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mI
• 荷爾蒙訊息傳送物的一種儲存形式
• 新生兒腦中相當多
• 隨腦部發育而減少
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正常人腦部看得到的 1H 頻譜成份
NA
Cr
Cr
NA
Cho
mI
Glx
Glx
4 3 2 1 0 ppm
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Glutamate (Glu)
刺激性神經傳導物質
2.10 ~ 2.45 ppm
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Glutamine (Gln)
Glutamate 的產物
2.10 ~ 2.45 ppm
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Glu & Gln (Glx)
• Glu : 重要的刺激性神經傳導物質
• Gln : Glu 反應後的產物,負責
regulate glutamate 並與解毒有關
• 頻譜重疊故無法區分
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正常人腦部看得到的 1H 頻譜成份
NA
Cr
Cr
NA
Cho
mI
Glx
Glx
4 3 2 1 0 ppm
Lac 應在此成對出現
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Lactate
乳酸 : 無氧代謝的產物
1.3 ppm
間隔 7 Hz
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Lac
• Lactic acid (乳酸) : 無氧代謝產物
• 正常人腦部不會出現
• Lac 存在代表局部缺氧
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Glucose
能量的主要來源
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正常人腦部看得到的 1H 頻譜成份
NA
Cr
Cr
NA
Cho
mI
Glx
Glx
4 3 2 1 0 ppm
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我知道重要性了
• 那麼如何得到頻譜 ?
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單脈衝激發
RF t
RF t
G(slice) t
擷取數據
擷取數據
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自旋迴訊單脈衝激發
RF t
RF t
擷取數據
G(slice) t
擷取數據
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信號 與 頻譜
Fourier transform
FID
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MRS 的擷取方式
• 射頻脈衝激發
• 拿信號
• 傅立葉轉換
• 就這麼簡單 ??
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MRS 的諸多細節
• 信雜比的考量
• 局部化與定位的需求
• 水與脂肪信號的抑制
• Shimming
• Post-processing
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MRS 的諸多細節
• 信雜比的考量
• 局部化與定位的需求
• 水與脂肪信號的抑制
• Shimming
• Post-processing
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信雜比 (SNR) 的考量
• 各化學成份的量極為微小
– 至少比水低上 10,000 倍 !
– SNR 是 MRI 影像的 0.01%
• 需要多次激發以求平均 (64~128)
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SNR 的考量
化學物質濃度低 信號極為微弱
放大數百倍之後 ...
看似單一頻率
頻率
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信雜比 (SNR) 的考量
• 例 : 128 次激發以求平均
• TR = 2.0 sec,掃瞄時間 ~ 4 分鐘
– SNR 也只改進 11 倍而已
• 而且才只得到一個部位的頻譜
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MRS 的諸多細節
• 信雜比的考量
• 局部化與定位的需求
• 水與脂肪信號的抑制
• Shimming
• Post-processing
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局部化的需求 (localization)
• 疾病本身當然未必整個腦袋都是
• MRS 必須能定位在病灶上
• 並且也能定位在正常部位以資比較
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腦中每個部位的代謝物組成
頻譜必須是「局部性」的
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三度空間定位
只取中間體積內的信號 (頻譜)
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單脈衝激發
並未達到三度空間定位的目的
RF t
RF t
G(slice) t
擷取數據
擷取數據
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自旋迴訊單脈衝激發
同樣並未達到三度空間定位的目的
RF t
RF t
擷取數據
G(slice) t
擷取數據
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自旋迴訊的變化
900 脈衝只激發 z 切面 1800 脈衝只聚焦 y 切面
RF
G(z)
G(y)
t
t
t
擷取數據
900 1800
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自旋迴訊頻譜
• 900 激發脈衝配合 z 梯度
– 所有信號只由一個切面出來
• 1800 聚焦脈衝配合 y 梯度
– 只有兩個切面的交集才會聚焦
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“線” 頻譜
已經進一步達到了局部化的要求
z
y
x
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那麼如何做三度空間定位 ?
• 不是有 double echo 嗎 ?
• 多加一個 1800 配合 x 梯度不就得了
• 第二個迴訊 (second echo) 只由三
個切面的交集出來
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利用第二個 echo 的自旋迴訊頻譜
兩個 1800 脈衝只聚焦 x 與 y 切面的交集
RF
G(z)
G(y)
t
t
t
G(x) t
擷取數據
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這下三度空間定位完成了
頻譜只由中間體積內產生
z
y
x
切面選擇
1st echo
2nd echo
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取個名字吧
• Point-Resolved Spectroscopy
• PRESS
• 基本上是利用自旋迴訊的 2nd echo
作傅立葉轉換計算頻譜
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Second echo 的特性
• TE 無法太短太短
• 必然有些許 T2 衰減
• 看不到短 T2 的代謝物
– 如 Glutamate 等
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利用 2nd Echo 的 PRESS 技術
TE 很難降到太短
RF
G(z)
G(y)
t
t
t
G(x) t
擷取數據
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解決之道
• 利用 first echo
– 只有 900 + 1800
• 但是作三方向的切面選擇
– 把 1800 分成兩半
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自旋迴訊的變化
900 脈衝只激發 z 切面 1800 脈衝只聚焦 y 切面
RF
G(z)
G(y)
t
t
t
擷取數據
900 1800
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把 1800 脈衝分開
和原來沒什麼不同
RF
G(z)
G(y)
t
t
t
擷取數據
900 900 900
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其中一個梯度改為 x 方向
現在是三方向選擇了
RF
G(z)
G(y)
t
t
t
G(x) t
擷取數據
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再把 900 脈衝拉開些
一樣有 echo 只是聚焦得不是很道地
RF
G(z)
G(y)
t
t
t
G(x) t
擷取數據
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當然 ...
• 這種 echo 聚焦效果必然較差
• 但是產生原因是一個激發脈衝加兩
個脈衝聯合聚焦的結果
• 信號較弱,但 TE 較短
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Echo 的名稱
• Stimulated echo
– 刺激迴訊
• 特別注意 TE 的計算方式
• TM : 頂多是 T1 弛緩 (比 T2 慢)
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TM 時段的弛緩
z’
y’ x’
TM TE/2 TE/2
RF t
擷取數據
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Stimulated Echo 的形成
一樣有 echo 只是聚焦得不是很道地
TM TE/2 TE/2
RF
G(z)
G(y)
t
t
t
G(x) t
擷取數據
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取個名字吧
• Stimulated Echo Acquisition
Mode (STEAM)
• 基本上是利用類似自旋迴訊的 1st
echo 作傅立葉轉換計算頻譜
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Stimulated Echo 的特性
• TE 可以較短
• 看得到短 T2 的代謝物
• 對長 T2 代謝物而言 SNR 較差
– 因為聚焦不完全
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順便提到短 T2 代謝物
• 短 T2 = 寬譜線
• 譜線寬 ~ 共振頻率分布廣 ~ 快速失
相 ~ 信號衰減 ~ 短 T2
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N-acetylaspartate (NAA) : Long T2
NAA : a neuronal marker
2.0 ppm
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Cr/PCr : Long T2
磷酸根的提供者
3.0 ppm
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Choline (Cho) : Long T2
神經傳導物質 acetylcholine 及其他
3.2 ppm
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Lactate : Long T2
乳酸 : 無氧代謝的產物
1.3 ppm
間隔 7 Hz
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Glutamate (Glu) : Short T2
刺激性神經傳導物質
2.10 ~ 2.45 ppm
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Glutamine (Gln) : Short T2
Glutamate 的產物
2.10 ~ 2.45 ppm
81 of 226
剛才提到短 T2 代謝物
• 短 T2 = 寬譜線
• 譜線寬 ~ 共振頻率分布廣 ~ 快速失
相 ~ 信號衰減 ~ 短 T2
• 譜線寬 : 看起來像是基線不平 ??
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TE 的效果
STEAM TE = 20
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TE 的效果
STEAM TE = 135
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TE 的影響
• 長 TE 頻譜 : 長 T2 (細線) 才看得到
– 頻譜反而比較乾淨
• 短 TE 頻譜 : 大部份成份都看得到
– 頻譜反而較雜亂,難以清晰辨識
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如果就是需要長 TE 頻譜
• 只想知道 NAA、Cho、Cr 的訊息
• 那為什麼不用 PRESS ?
– SNR 比 STEAM 高
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STEAM with TE = 135
87 of 226
PRESS with TE = 135
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小結論
• 先根據病症猜測 TE 之選擇
– 是否需要看 Glu、...
• 需要短 TE : STEAM
• 需要長 TE : PRESS
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不論 STEAM 或 PRESS
• 統稱為 single-voxel spectroscopy
(單一體素頻譜)
– Voxel = volume element
• 病灶做一次、正常部位做一次 …
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解析度如何呢 ?
• 體積的選擇由三個切面構成
• 切面能切多細、體積就可以多小
• 但是受限於 SNR (正比於體積)
– Voxel 體積無法太小 ~ (2cm)3
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但是 MRS 的問題還沒結束
• 如何得到可靠的頻譜 ?
• 如何得到 “可以看” 的頻譜 ?
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MRS 的諸多細節
• 信雜比的考量
• 局部化與定位的需求
• 水與脂肪信號的抑制
• Shimming
• Post-processing
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水分子信號太強了
• 水含量為生化成份的 10,000 倍以上
– 水中氫核濃度 : ~ 100 M
– 其他物質 (NAA) : < 1~10 mM
• 水的信號早就蓋過了頻譜
94 of 226
水含量遠大於生化成份的困擾
少量的生化訊息重疊在很大的背景之上
放大數百倍之後 ...
看似單一頻率
頻率
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水分子 (溶劑) 抑制
• Water (solvent) suppression
– 抑制水信號,才能突顯其他成份
• 方式 : CHESS (似曾相識 ?)
– MR 影像中的 fat-SAT 技術
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CHESS 原理
水
脂肪
900 fat only
RF
Gz
Gy
Gx
t
t
t
t
自旋迴訊 脂肪抑制
ppm
ppm
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Fat-SAT 與 Water-SAT
• 同樣原理,利用頻率的不同
• Chemical shift selective
• 只激發水信號,儘量不動到脂肪
• 開強梯度使激發後的水信號飽和
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“脂肪抑制” 與 “水抑制” 的影像比較
In-phase Fat-SAT Water-SAT
99 of 226
MRS 的 CHESS water-SAT
• 抑制要求比影像嚴苛
• 通常使用窄頻 Gaussian 脈衝
• 可以不只加一個 CHESS 脈衝
• 再配合 PRESS 或 STEAM
100 of 226
MRS 中的 CHESS
900 water only
RF
Gz
Gy
Gx
t
t
t
t
PRESS 水抑制
101 of 226
水分子抑制前後比較
未經水抑制 經過水抑制
放大 200 倍
102 of 226
其實 CHESS 沒那麼神奇
• 經過一個 CHESS 脈衝,通常可以
抑制 50~100 倍的水分子信號
– 濃度差 10,000 倍以上
• 剩餘部份用 post-processing 消除
103 of 226
水分子抑制前後比較
未經水抑制 經過水抑制
放大 200 倍
104 of 226
脂肪信號也有類似的困擾
• 脂肪的含量也遠多於生化成份
• 也需要作 fat-SAT
• 困難 : 脂肪 MRS 信號與 Lac 重疊
– 都在 1.3 ppm 附近
105 of 226
質子在腿部的 MR 頻譜
水與脂肪的含量相差不會特別大
水 H2O 脂肪
-CH2-
ppm
106 of 226
Fat 未經抑制的頻譜
107 of 226
Lactate
乳酸 : 無氧代謝的產物
1.3 ppm
間隔 7 Hz
108 of 226
MRS Fat-SAT 不用 CHESS
• CHESS : 根據頻率抑制信號
• Lac 與 fat 頻率相近
• 一用 CHESS 之後都被抑制
• 得不到有關 Lac 的訊息
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幸好在腦部中問題比較小
• 細胞膜上的 lipid invisible
– 原因與 mobility 有關,複雜
• 看得到的 fat 都在皮下脂肪
– 利用位置來作 fat-SAT
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MRS 檢測一定會先用 MRI 定位
定位求快 通常用 T1 影像
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OVS 的示意圖
用六到八個 SAT-bands 將皮下脂肪信號抑制
Saturation Bands
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外側體積抑制 (OVS)
• Outer Volume Suppression
• 和平常影像中的 SAT-band 或
inflow-SAT 完全一樣
• 切面選擇 + 強梯度強迫失相
113 of 226
做完這些之外還有 ...
• MRS : 希望分辨出各頻譜成份
– 頻譜線寬度 << 頻譜線距離
• 同一成份所感受的磁場須一致
– Shimming
114 of 226
如果 Shimming 做得不好
如何分辨 Cho 與 Cr 的含量 ?
Cr ? Cho ?
115 of 226
MRS 的諸多細節
• 信雜比的考量
• 局部化與定位的需求
• 水與脂肪信號的抑制
• Shimming
• Post-processing
116 of 226
Shim Coil
每一線圈個別由獨立電源控制
電源
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Shimming
• 局部線圈通電流修正磁場使均勻
• 等於是提高頻譜解析度
• Single-voxel spectroscopy
– Voxel shimming
118 of 226
Voxel & Volume Shim
• Voxel shimming : 只使小區域磁場
均勻即可
• 用在 single-voxel spectroscopy
• 體積範圍小,較容易 shim
119 of 226
Voxel & Volume Shim
• Volume shimming : 使全區域 (或
大範圍) 磁場均勻化
• 用在 EPI 或 trueFISP 等影像技術
• 馬上還會再提到
120 of 226
Simming 好壞的比較
好的 Shimming 不好的 Shimming
Cr ? Cho ? Cr
Cho
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頻譜終於拿到了 ...
• 對不起,還沒結束
• 螢幕顯示的可能是類似 ...
122 of 226
尚未經過後處理的頻譜
診斷價值仍然極為有限
123 of 226
MRS 的諸多細節
• 信雜比的考量
• 局部化與定位的需求
• 水與脂肪信號的抑制
• Shimming
• Post-processing
124 of 226
MRS 的後處理技術
• FID 信號的處理
– 進一步的水分子信號抑制
– 頻譜內插 (zero filling)
– 雜訊過濾 (apodization)
125 of 226
MRS 的後處理技術
• 頻譜的處理
– 相位角度修正
– 基線修正
• 頻譜分析與解釋
126 of 226
經過 CHESS 的水信號仍然很強
未經水抑制 經過水抑制
放大 200 倍
127 of 226
進一步的水分子信號抑制
• 我們知道水的頻率 (4.7 ppm)
• 振幅又一定很大 (指數衰減)
• 直接讓程式找出
• 然後把水的信號減掉
128 of 226
進一步抑制水的信號
抑制前 抑制後
強信號必然由水而來
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水信號抑制前後頻譜比較
抑制前 抑制後
130 of 226
頻譜內插 (Zero Filling)
• 請先不要計較名詞翻譯
• 在 FID 之後填入零值
• 增加數據點的數量
131 of 226
Zero Filling 的運算
在 FID 取完之後填入零值
132 of 226
內插的目的
• 傅立葉轉換 : 計算頻譜的數學公式
• 類似解聯立方程式
– 十個方程式可以求十個變數
– 1024 點 FID 可求 1024 點的頻譜
133 of 226
填入零值的作用
• 使時間長度拉長
• 看似可以分辨更多更細頻率
– 相當於在頻譜上做內插
• 讓譜線形狀看起來漂亮些
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Zero Filling 對頻譜線的效果
填零前 (鋸齒) 填零後 (平滑)
注意頻譜放大後的細節差異
135 of 226
請注意 Zero Filling 功用
• 只增加數據點的數量
– 填入零值沒有提供更多訊息
• 頻譜解析度並未真正提高
– 內插也只是一種估計
136 of 226
雜訊過濾
• Apodization, windowing, …
• 將 FID 乘上濾波函數以改變頻譜
– 指數函數、高斯函數
• 通常是為了提高 SNR
137 of 226
濾波 (Apodization, Windowing)
處理前 處理後
138 of 226
為什麼需要如此做 ?
• FID 是隨時間衰減的信號
– 時間愈久信號愈小
– 雜訊不會隨時間變小
• 應該賦予 early FID 較多的比重
139 of 226
濾波 (Apodization, Windowing)
處理前 處理後
140 of 226
濾波前後的頻譜對照
處理前 (雜訊大) 處理後 (雜訊小)
141 of 226
Apodization
• 使用之後 SNR 變好了
• 但注意它也有缺點
– FID 變得衰減較快 (T2 變短)
– 頻譜線會變寬
142 of 226
濾波前後的頻譜對照
處理前 (譜線窄) 處理後 (譜線寬)
143 of 226
同理可以反其道而行
• 故意加重 late FID 使 T2 變長
• 使頻譜變細,區分更多代謝物
– SNR 會明顯降低
• 臨床 MRS 已是低 SNR ,極少用
144 of 226
MRS 的後處理技術
• FID 信號的處理
– 進一步的水分子信號抑制
– 頻譜內插 (zero filling)
– 雜訊過濾 (apodization)
145 of 226
信號 與 頻譜
Fourier transform
FID
146 of 226
傅立葉轉換
• 將 FID 計算為頻譜
• 倒是沒什麼特別的
– 只是算出來的頻譜長得 ...
147 of 226
怎麼頻譜長得那麼奇怪 ?
FID
傅立葉轉換 ??
148 of 226
頻譜的形狀
• 如果 FID 是單一指數衰減
– 頻譜實部 : 吸收譜 (absorption)
– 頻譜虛部 : 分散譜 (dispersion)
• 稱為 Lorentzian line shape
149 of 226
指數衰減的 FID 轉換為吸收與分散譜
稱為 Lorentzian line shape
150 of 226
特點
• 分散譜譜線較寬,不利區分代謝物
– 頻譜分析一律以吸收譜為之
• 但是平常所得頻譜一定是兩者混合
– 需要經由校正算出吸收譜
151 of 226
我們熟悉的射頻激發
y’軸 : 實部 (cos) x’軸 : 虛部 (sin)
RF
x’
y’
z’
152 of 226
實際上 FID 的波形
實部 FID 虛部 FID
153 of 226
這種情況所得的頻譜 ...
注意吸收譜的譜線細 適合分析
RF
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但是如果打歪了一點 …
其實這種狀況每次都會發生
RF
譜線成為吸收與分散譜的綜合
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所計算出的頻譜需要再轉成純吸收譜
否則有了頻譜也無法幫助診斷
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其實就是在做相位的修正
所以稱做 Phase Correction
RF RF
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相位角度修正
• Phase correction
• 目的是希望獲得純吸收譜
– 零級 (zero-order) 修正
– 一級 (first order) 修正
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若是相位不準是一致性的
用 zero-order phase correction 即可
RF
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若是相位與頻率有關
就需要 first order phase correction
RF
耽誤一段時間後
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相位修正前後之頻譜比較
相位修正前 相位修正後
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基線修正
• Baseline correction
• 沒有譜線的地方應該是全平的
– 結果卻不是 ??
• 基線不平將干擾定量分析
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一些不好的基線的例子
不論何者皆將影響譜線定量
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基線不平的來源
• 殘存水或脂肪信號
• 極短 T2 蛋白質大分子信號
– 頻譜中矮胖的譜線
– 尤其在短 TE MRS 中特多
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基線修正之頻譜比較
基線修正前 基線修正後
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但是也不能修正得太離譜
良好的基線修正 太過火的基線修正
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基線修正注意事項
• 蛋白質大分子信號是來源之一
– 畢竟是成分的一部份
– 如何取捨只能靠經驗了
• 過度修正無必要,且影響其他譜線
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正常人腦部看得到的 1H 頻譜成份
NA
Cr
Cr
NA
Cho
mI
Glx
Glx
4 3 2 1 0 ppm
Baseline ?
Metabolite ?
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尚未經過後處理的頻譜
線寬高 雜訊大 基線不平 相位未調 ...
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處理得好的頻譜
這還只是長 TE 頻譜而已
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MRS 的後處理技術
• 頻譜的處理
– 相位角度修正
– 基線修正
• 頻譜定量分析與解釋
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頻譜定量分析
• 代謝物含量計算與比較
• 頻譜線面積積分 ~ 代謝物含量
– 線高不等於含量 !
• 注意 T1 & T2 等的影響
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積分頻譜線求代謝物含量
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頻譜解釋
• 信號太弱時切勿妄加揣測 !
• 從未見過的譜線出現時
– 中毒病因 ? 病理代謝產物 ?
• 超出我目前能力範圍
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很重要的觀念
• 後處理就是後處理
• 沒有訊息就是沒有訊息
• 後處理 : 美化頻譜,不能無中生有
• 所有的美化步驟都有所犧牲
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Liver Proton MRS (Radiology 2001)
Healthy subject
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Liver Proton MRS (Radiology 2001)
Chronic Hepatitis Stage 2
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Liver Proton MRS (Radiology 2001)
Chronic Hepatitis Stage 3
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Liver Proton MRS (Radiology 2001)
Chronic Hepatitis Stage 4 (Cirrhosis)
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國內某醫學中心
抱歉,不是 post-processing 的問題
lipid
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MRS 的諸多細節
• 信雜比的考量
• 局部化與定位的需求
• 水與脂肪信號的抑制
• Shimming
• Post-processing
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不管是 PRESS 或 STEAM
• 統稱為 single-voxel spectroscopy
(單一體素頻譜)
– Voxel : volume element
• 病灶做一次、正常部位做一次 ...
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像這種情形呢 ?
想要知道不同部位的代謝物組成
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若需要多個部位頻譜
• 方法須進一步改進
• 多體素頻譜、化學位移影像
• Chemical shift imaging (CSI)
• Spectroscopic imaging (SI)
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磁振頻譜影像
Spectroscopic Imaging
鍾孝文 教授
台大電機系 三軍總醫院放射線部
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多部位頻譜的重要性
• 病灶與正常側的比較
– 進一步瞭解病因
• 測知形態正常組織之代謝情形
– 預知可能發生之病變
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缺血性中風的 MR 化學位移影像
T1 影像 區域頻譜
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那怎麼做呢 ?
• 先看看 MRI 和 MRS 怎麼做的
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MRI 與 MRS 的比較
G(x)
G(y)
RF
G(z)
讀取數據
t
讀取數據
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MRI 與 MRS 的不同
• MRI 成像的原理
– 頻率編碼 : 信號頻率代表位置
• MRS 的原理
– 信號頻率代表代謝物成份
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MRI 與 MRS 的合併 (不用頻率編碼)
G(x)
G(y)
RF
G(z)
讀取數據
t
讀取數據
t
t
t
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化學位移影像
• 切面選擇射頻激發
• 兩個方向的相位編碼
• 讀取信號時不開梯度
• 三方向傅立葉轉換 (影像 + 頻譜)
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CSI 脈衝序列
G(x)
G(y)
RF
G(z)
t
t
t
t
讀取數據
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化學位移影像
• 影像的每一個點內,都含有一個完
整的 MRS 頻譜
• 也就是 MRI 影像中的每一部份,都
加入了生化代謝的訊息
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做完了嗎 ?
• 沒有,問題還多著呢 !
• 掃瞄時間長到根本行不通
• 頻譜的品質處處不同
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掃瞄時間的問題
• 相位編碼需要重複多次
• 兩方向編碼,時間接近三維影像
• TR 又不能縮短
• TR (1.5 秒) x 32 x 32 ~ 25 分
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25 分鐘的 MRS 檢測
• 別忘了空間解析度只是 32x32 而已
• 和平常 256x256 根本沒得比
• 而且只有一次信號平均
• 還要做其他 T1、T2、MRA、Gd ...
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註 : TR 的選取
• 收信號時間愈長,頻譜解析度愈高
• 1H 通常要一秒鐘左右,才能清楚分
出 Cho 與 Cr
• TR 1.5 sec 已是腦部 1H MRS 下限
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頻譜品質處處不同的問題
• 接近空氣與骨骼處的頻譜都比較差
• 空氣與骨骼之磁化率與腦組織不同,
因而干擾附近磁場
• 譜線太寬而與鄰近重疊,影響判讀
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MRS 品質難以完全掌握
靠近周邊的頭痛部位
頭蓋骨 皮下脂肪
周圍空氣
干擾磁場的因素 : 干擾頻譜的因素 :
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譜線太寬那不能 Shim 嗎 ?
• 注意如果要的話,就是整個 slice 區
域都要 shim
• 比小體積的 voxel shim 困難多了
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更糟的是 …
• 這些周邊部份很多皮下脂肪
• 脂肪本身就會干擾頻譜判讀
• 再加上磁化率產生的磁場扭曲,使
脂肪的強信號干擾頻譜更嚴重
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Fat 未經抑制的頻譜
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解決的方法
• 乾脆靠外側的頻譜都不要算了
– Package 先能賣出去再說
• 限制 volume of interest
• 已經可以猜得出它的缺點了
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乾脆只拿中間的 MRS
把靠近周邊的頭痛部位都除掉
FOV
VOI
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乾脆只拿中間的 MRS
把靠近周邊的頭痛部位都除掉
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和 Single-Voxel MRS 頗像
• 選擇一個很大很扁的 voxel
– 利用三個切面選擇脈衝合併而成
• 再將大 voxel 區分成更小的 voxel
– 利用相位編碼
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三度空間定位
類似單體素頻譜 只是是很扁的 voxel
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PRESS CSI 脈衝序列
2nd echo 頻譜加上相位編碼細分
RF
G(z)
G(y)
t
t
t
G(x) t
擷取數據
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“Hybrid” CSI
• 以 PRESS (長 TE) 或 STEAM
(短 TE) 為基礎做激發
• 只接收經過相位編碼的 echo
• 再以傅立葉轉換求區域頻譜
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常見的使用方式
• 操作員選擇 FOV 與 VOI
• FOV 中分為 16x16 voxels
• 其中實際獲得的頻譜約為 8x8
• 掃瞄時間約為 6 至 13 分鐘
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常用的掃瞄參數
真正拿到的頻譜只有六七十個
FOV : 分為 16x16
VOI : 分為 8x8
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內框與外框的差異
• 內框 : 真正會取得頻譜的部位
• 外框 : 不顯示頻譜以避免誤導
– 近邊緣處原本品質即欠佳
– Aliasing artifacts
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MRS 的 Aliasing
到底 Lactate 是誰的 ?
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MRS 的 Aliasing
• 決不容許 aliasing 發生
– 形態不明顯
– 非常容易導致誤判
– 除非重做,否則無從驗證
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Aliasing 假影
FOV 過小 增大取樣頻率
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代謝物含量影像
• 經由 CSI 所涵蓋的大量訊息,還可
重組多張代謝物含量的影像
• NAA image,Creatine image ...
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神經膠質瘤的 MR 化學位移影像
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神經膠質瘤的 NAA Map
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神經膠質瘤的 Choline Map
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您也許會問 …
• 這些 NAA 影像為什麼這麼粗糙 ?
– 8x8 matrix size 足夠嗎 ?
• 空間解析度需提升 ...
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尚未經過後處理的頻譜
線寬高 雜訊大 基線不平 相位未調 ...
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處理得好的頻譜
這還只是長 TE 頻譜而已
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Hybrid CSI 現有之缺點
• 無法取得靠頭顱邊緣的高品質頻譜
– 大腦皮質 (cortex, gray matter)
• 偏偏有很多時候就是想知道大腦皮
質病變受到的影響
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怎麼辦呢 ?
• CSI 配合精確的 outer volume
suppression 或其他 fat saturation
• 仍屬於積極研究的範疇
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CSI 一些其它的方法
• SLIM, SLASH, EPSI, …
• 原理略為複雜
• 也還沒有商品化
• 有機會再提吧
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腦部氫原子磁振頻譜
1H MR Spectroscopy
鍾孝文 教授
台大電機系 三軍總醫院放射線部