Permaculture merupakan sistem pertanian dengan model ekosistem alami melalui berbagai rekayasa ekologi. Permaculture meliputi pembentukan lingkungan yang sangat produktif dan stabil, menyediakan makan, tempat tinggal, energi dan lain sebagainya yang dibutuhkan oleh manusia, serta infrastruktur sosial dan ekonomi yang mendukung. Sistem pertanian permaculture dapat dikembangkan hampir disemua jenis lahan pertanian, namun tanaman yang dipilih dan digunakan dibatasi oleh kesesuaian lahan dengan kebutuhan varietas yang digunakan. Dalam pembangunan sistem permaculture dibutuhkan suatu perencanaan dan perancangan. Faktor-faktor seperti iklim, bentuk lahan, tanah, vegetasi dan air yang ada perlu dipertimbangkan. Salah satu penerapan sistem permaculture adalah agroforesty. Salah satru agroforestry yang ada di Indonesia adalah perkebunan kopi didesa Sidomulyo kabupaten Jember. Permasalahan utama dalam menanam kopi adalah pemilihan lokasi tanam dan kondisi iklim karena tanaman kopi berasal dari daerah afrika yang memerlukan perlakuan khusus untuk menyesuaikan pertumbuhannya dengan iklim dan kondisi alam di Indonesia. Petani kopi didesa Sidomulyo menanam kopi didataran lereng gunung yang memiliki ketinggian 500 mdpl yang sudah sesuai dengan syarat tumbuh tanaman kopi. Kopi ditanam dengan naungan yang bertujuan menyesuaikan lingkungan hidup tanaman kopi. Naungan digunakan untuk mengurangi intensitas cahaya matahari yang masuk selain itu juga dapat digunkan untuk mengurangi erosi akibat tetesan air hujan. Naungan yang dipilih oleh petani kebanyakan dari tanaman jenis legum yang mampu mengikat nitrogen selain itu tanaman naungan juga harus menjadi tempat tumbuhnya musuh alami dari hama dan penyakit tanaman kopi. Keuntungan dari tanaman kopi didesa Sidomulyo adalah kopi organik sehingga memiliki harga jual yang tinggi. Indonesia yang memiliki wilayah pegunungan dapat digunakan untuk pertanaman kopi. Kopi yang ditanam disetiap wilayah yang berbeda memberikan hasil keragaman kopi diIndonesia, selain itu pasar kopi yang luas sampai keluar negeri menjadi peluang yang cukup terbuka bagi petani kopi di Indonesia. Menurut Novita dkk (2012) indikator keberlanjutan kopi rakyat didesa sido mulyo dari empat dimensi yakni ekologi, ekonomi, sosial kelembagaan dan teknologi menunjukkan keberlanjutan KUPK.