Obrada slike u digitalnoj mamografiji.pptlis.irb.hr/KDSA2009/presentations/mustra.pdf ·...

21
Obrada slike u digitalnoj mamografiji Mario Muštra Sveučilište u Zagrebu, Fakultet elektrotehnike i računarstva Zavod za radiokomunikacije E-mail: [email protected]

Transcript of Obrada slike u digitalnoj mamografiji.pptlis.irb.hr/KDSA2009/presentations/mustra.pdf ·...

Page 1: Obrada slike u digitalnoj mamografiji.pptlis.irb.hr/KDSA2009/presentations/mustra.pdf · 2009-11-13 · Obrada slike u digitalnoj mamografiji Mario Muštra Sveu čilište u Zagrebu,

Obrada slike u digitalnoj

mamografiji

Mario Muštra

Sveučilište u Zagrebu, Fakultet elektrotehnike i računarstva

Zavod za radiokomunikacije

E-mail: [email protected]

Page 2: Obrada slike u digitalnoj mamografiji.pptlis.irb.hr/KDSA2009/presentations/mustra.pdf · 2009-11-13 · Obrada slike u digitalnoj mamografiji Mario Muštra Sveu čilište u Zagrebu,

Sažetak

� Uvod

� Pretprocesiranje

2

� Detekcija mikrokalcifikacija i tumora

� Formati zapisa i baze slika

� Zaključak

Page 3: Obrada slike u digitalnoj mamografiji.pptlis.irb.hr/KDSA2009/presentations/mustra.pdf · 2009-11-13 · Obrada slike u digitalnoj mamografiji Mario Muštra Sveu čilište u Zagrebu,

Uvod

Mamografija

� neinvazivna pretraga

� utvrđivanje promjena na tkivu dojke jednu do dvije godine ranije od pojave kliničkih simptoma

3

dvije godine ranije od pojave kliničkih simptoma

� uređaji za snimanje imaju visoku prostornu razlučivost

� analogna (filmska) i digitalna mamografija

� digitalna mamografija omogućava računalnu analizu bez potrebe za skeniranjem filmova

Page 4: Obrada slike u digitalnoj mamografiji.pptlis.irb.hr/KDSA2009/presentations/mustra.pdf · 2009-11-13 · Obrada slike u digitalnoj mamografiji Mario Muštra Sveu čilište u Zagrebu,

Uvod

� razvoj CAD sustava omogućava dobivanje drugog mišljenja

� kvaliteta CAD sustava još nije na dovoljnoj razini

� ispravan put razvoja CAD algoritama je njihovo

4

� ispravan put razvoja CAD algoritama je njihovo testiranje i međusobna usporedba na standardnoj bazi slika

� standardne baze danas su prilično zastarjele (MIAS, DDSM)

Page 5: Obrada slike u digitalnoj mamografiji.pptlis.irb.hr/KDSA2009/presentations/mustra.pdf · 2009-11-13 · Obrada slike u digitalnoj mamografiji Mario Muštra Sveu čilište u Zagrebu,

Uvod

5

MIAS

DDSM

Page 6: Obrada slike u digitalnoj mamografiji.pptlis.irb.hr/KDSA2009/presentations/mustra.pdf · 2009-11-13 · Obrada slike u digitalnoj mamografiji Mario Muštra Sveu čilište u Zagrebu,

Pretprocesiranje

Segmentacija

� izdvajanje područja interesa (ROI)

6

interesa (ROI)

� uklanjanje šuma i objekata koji ne pripadaju slici tkiva koje želimo analizirati

Page 7: Obrada slike u digitalnoj mamografiji.pptlis.irb.hr/KDSA2009/presentations/mustra.pdf · 2009-11-13 · Obrada slike u digitalnoj mamografiji Mario Muštra Sveu čilište u Zagrebu,

Pretprocesiranje

Detekcija prsnog mišića

� nalazi se samo u MLO projekciji

7

projekciji

� cilj je uklanjanje mišića kako amplitudne komponente ne bi unosile statističku pogrešku

� Houghova transformacija, Gaborovi waveleti,…

Page 8: Obrada slike u digitalnoj mamografiji.pptlis.irb.hr/KDSA2009/presentations/mustra.pdf · 2009-11-13 · Obrada slike u digitalnoj mamografiji Mario Muštra Sveu čilište u Zagrebu,

Pretprocesiranje

8

Page 9: Obrada slike u digitalnoj mamografiji.pptlis.irb.hr/KDSA2009/presentations/mustra.pdf · 2009-11-13 · Obrada slike u digitalnoj mamografiji Mario Muštra Sveu čilište u Zagrebu,

Pretprocesiranje

Detekcija gustoće dojke

� podjela u 4 kategorije prema BI-RADS normi

� unatoč podjeli podliježe subjektivnoj ocjeni

9

� međusobno neslaganje radiologa

� točnost automatske klasifikacije u pojedinu kategoriju uglavnom ne prelazi 70%

� dobra mogućnost klasifikacije u 2 kategorije

� mogućnost optimizacije parametara automatske detekcije uz poznatu gustoću

Page 10: Obrada slike u digitalnoj mamografiji.pptlis.irb.hr/KDSA2009/presentations/mustra.pdf · 2009-11-13 · Obrada slike u digitalnoj mamografiji Mario Muštra Sveu čilište u Zagrebu,

Pretprocesiranje

Primjer četiri kategorije

različite gustoće prema

10

različite gustoće prema

BI-RADS normi

Page 11: Obrada slike u digitalnoj mamografiji.pptlis.irb.hr/KDSA2009/presentations/mustra.pdf · 2009-11-13 · Obrada slike u digitalnoj mamografiji Mario Muštra Sveu čilište u Zagrebu,

Pretprocesiranje

Detekcija bradavica na slikama

11

Page 12: Obrada slike u digitalnoj mamografiji.pptlis.irb.hr/KDSA2009/presentations/mustra.pdf · 2009-11-13 · Obrada slike u digitalnoj mamografiji Mario Muštra Sveu čilište u Zagrebu,

Pretprocesiranje

Detekcija bilateralne asimetrije

� bilateralna asimetrija je razlika u tkivu lijeve i desne dojke

� upućuje na mogućnost

12

� upućuje na mogućnost postojanja tumora u razvoju

� za detekciju potrebna je kvalitetna registracija slike što zahtjeva kvalitetnu segmentaciju

� drugi važan dio je postavljanje praga osjetljivosti detekcije

Page 13: Obrada slike u digitalnoj mamografiji.pptlis.irb.hr/KDSA2009/presentations/mustra.pdf · 2009-11-13 · Obrada slike u digitalnoj mamografiji Mario Muštra Sveu čilište u Zagrebu,

Detekcija mikrokalcifikacija

� mikrokalcifikacije – male nakupine kalcija

� vidljive su kao točkice visokog intenziteta

13

� ukazuju na mogućnost postojanja karcinoma u nastajanju

� detekcijom se bavi najveći dio znanstvenih radova iz područja mamografije

Page 14: Obrada slike u digitalnoj mamografiji.pptlis.irb.hr/KDSA2009/presentations/mustra.pdf · 2009-11-13 · Obrada slike u digitalnoj mamografiji Mario Muštra Sveu čilište u Zagrebu,

Detekcija mikrokalcifikacija

� najzastupljenije su metode koje koriste wavelet

transformaciju

� wavelet transformacija omogućava izdvajanje

određenih prostornih frekvencija

14

određenih prostornih frekvencija

� mikrokalcifikacije imaju visoku prostornu

frekvenciju pa je kod detekcije problem u

odjeljivanju šuma

� klasifikacija je zahtjevniji problem od detekcije

Page 15: Obrada slike u digitalnoj mamografiji.pptlis.irb.hr/KDSA2009/presentations/mustra.pdf · 2009-11-13 · Obrada slike u digitalnoj mamografiji Mario Muštra Sveu čilište u Zagrebu,

Klasifikacija mikrokalcifikacija

� klasifikacija se

provodi analizom

15

provodi analizom

oblika i međusobne

udaljenosti

(a) (b) (c)

(d) (e)

Page 16: Obrada slike u digitalnoj mamografiji.pptlis.irb.hr/KDSA2009/presentations/mustra.pdf · 2009-11-13 · Obrada slike u digitalnoj mamografiji Mario Muštra Sveu čilište u Zagrebu,

Detekcija tumora

� mnogo zahtjevniji problem od detekcije mikrokalcifikacija

� vjerojatno najvažniji cilj CAD sustava

� problem neodređenosti granica

16

� problem neodređenosti granica

� mala razlika u kontrastu

� velik broj lažno pozitivnih i lažno negativnih rezultata

� klasifikacija po obliku uporabom različitih naprednih klasifikatora

Page 17: Obrada slike u digitalnoj mamografiji.pptlis.irb.hr/KDSA2009/presentations/mustra.pdf · 2009-11-13 · Obrada slike u digitalnoj mamografiji Mario Muštra Sveu čilište u Zagrebu,

Klasifikacija tumora

17

Page 18: Obrada slike u digitalnoj mamografiji.pptlis.irb.hr/KDSA2009/presentations/mustra.pdf · 2009-11-13 · Obrada slike u digitalnoj mamografiji Mario Muštra Sveu čilište u Zagrebu,

Formati zapisa i baze slika

� niska kompresija ili bez kompresije

� digitalne slike – DICOM

� analogne slike (TIFF, JPEG, LJPEG, PNG)

18

� analogne slike (TIFF, JPEG, LJPEG, PNG)

� dimenzije cca. 3000×4000

� 8-16 bita

� velike dimenzije datoteka

� jedna pacijentica = 4 slike

Page 19: Obrada slike u digitalnoj mamografiji.pptlis.irb.hr/KDSA2009/presentations/mustra.pdf · 2009-11-13 · Obrada slike u digitalnoj mamografiji Mario Muštra Sveu čilište u Zagrebu,

DICOM standard

� Digital Imaging and Communications in

Medicine

� definiran je za sve medicinske primjene

19

� standard razvija veliki broj radnih skupina

� mamografske primjene zahtijevaju visoku

razlučivost bez kompresije

� problem predstavlja velik broj polja u kojima

unos nije obvezan

Page 20: Obrada slike u digitalnoj mamografiji.pptlis.irb.hr/KDSA2009/presentations/mustra.pdf · 2009-11-13 · Obrada slike u digitalnoj mamografiji Mario Muštra Sveu čilište u Zagrebu,

Zaključak

� digitalna mamografija donijela je velik napredak

u računalnoj obradi slike

� CAD sustavi još uvijek nisu dovoljno razvijeni

20

� problem razvijanja algoritama je nemogućnost

kompetentnog testiranja zbog nepostojanja

kvalitetne baze digitalnih slika

� potreban je napredak klasifikacijskih tehnika uz

korištenje dodatnog znanja o pacijentici

Page 21: Obrada slike u digitalnoj mamografiji.pptlis.irb.hr/KDSA2009/presentations/mustra.pdf · 2009-11-13 · Obrada slike u digitalnoj mamografiji Mario Muštra Sveu čilište u Zagrebu,

Obrada slike u digitalnoj

mamografiji

Mario Muštra

Sveučilište u Zagrebu, Fakultet elektrotehnike i računarstva

Zavod za radiokomunikacije

E-mail: [email protected]