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Quels enjeux pour les chauves-souris en Auvergne ? Stage réalisé du 15 Février au 15 Août 2014 Master E2F : Expertise Faune, Flore, Inventaire et Indicateur de la Biodiversité Mémoire de stage Année 2013/2014 Mise en place d’un Indicateur Chiroptères pour la région Auvergne Tony CHEVALIER Sous la direction de : Lilian Girard

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Quels enjeux pour les chauves-souris en Auvergne ?

Stage réalisé du 15 Février

au 15 Août 2014

Master E2F : Expertise Faune,

Flore, Inventaire et Indicateur

de la Biodiversité

Mémoire de stage

Année 2013/2014

Mise en place d’un Indicateur

Chiroptères pour la région Auvergne

Tony CHEVALIER

Sous la direction de :

Lilian Girard

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Table des matières

Présentation de l’association Chauve-Souris Auvergne .......................................................................... 1

Généralités .......................................................................................................................................... 1

Les missions ......................................................................................................................................... 1

Introduction ............................................................................................................................................. 2

Un engouement récent pour la biodiversité ....................................................................................... 2

La démarche auvergnate : une impulsion de la DREAL, des acteurs motivés ..................................... 2

L’indicateur Chiroptères : fruit d’un partenariat entre Etat et association ........................................ 3

Pourquoi les Chiroptères ? .................................................................................................................. 3

Matériel et méthode ............................................................................................................................... 4

Site d’Etude ......................................................................................................................................... 4

Patrimoine naturel .......................................................................................................................... 4

Patrimoine culturel .......................................................................................................................... 4

Modèles biologiques et espèces ......................................................................................................... 5

Généralité ........................................................................................................................................ 5

Régime alimentaire ......................................................................................................................... 6

Particularités biologiques des espèces Françaises .......................................................................... 6

Un cycle vital bien défini ................................................................................................................. 7

Les principaux gîtes auvergnats ...................................................................................................... 8

Le travail du chiroptérologue en Auvergne : différents types de prospection ................................... 9

Prospection des regroupements hivernaux et estivaux .................................................................. 9

La capture temporaire (juin-novembre).......................................................................................... 9

Détection ultrasonore (avril à novembre) ..................................................................................... 10

L’indicateur chiroptères en Auvergne : travail préalable .................................................................. 10

Correction et mise en forme de la Base de données .................................................................... 10

Hiérarchisation des espèces .......................................................................................................... 11

Hiérarchisation et choix des sites .................................................................................................. 13

Intégration de nouveaux sites et pondération .............................................................................. 15

Résultats : l’indicateur chiroptères en Auvergne .................................................................................. 17

L’indicateur Grand Rhinolophe, Rhinolophus ferrumequinum.......................................................... 18

L’indicateur Petit Rhinolophe, Rhinolophus hipposideros ................................................................. 19

L’indicateur Grand Murin, Myotis myotis ......................................................................................... 20

L’indicateur Barbastelle d’Europe, Barbastella barbastellus ............................................................ 21

L’indicateur « toutes espèces » ......................................................................................................... 22

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Discussion .............................................................................................................................................. 24

Grand Rhinolophe ............................................................................................................................. 24

Petit Rhinolophe ................................................................................................................................ 25

Grand Murin ...................................................................................................................................... 25

Focus sur le site de « Morat » ....................................................................................................... 26

Barbastelle d’Europe ......................................................................................................................... 27

« Toutes espèces » ............................................................................................................................ 28

Conclusion ............................................................................................................................................. 29

Bibliographie.......................................................................................................................................... 30

Sommaire des annexes .......................................................................................................................... 31

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Sommaire des illustrations

Figures d’illustration

Illustration de couverture : Femelles Petits Rhinolophes avec jeunes @Lilian Girard

Illustration des remerciements : photographie des membres de l’association (AG 2014) @Chauve Souris Auvergne

Figure 1: Logo de l'association 1

Figure 2: Aile d'une chauve-souris (Grand Murin) observée lors d’une capture temporaire © Claire Desbordes &

Rémi Grignon 6

Figure 3: Illustration de l'hibernation d'un Petit Rhinolophe © Agathe Verilhac 7

Figure 4: Reproduction d'Oreillard gris ©Pierre Rimbaud 8

Figure 5: Cartographie des sites d'études (gîtes, études acoustiques, captures ou SOS) en Auvergne (à gauche) 11

Figure 6: Evolution du nombre de gîtes d'hibernation de Petit Rhinolophe contrôlés par années (à gauche) et

évolution des effectifs de cette même espèce (à droite) 13

Figure 7: Cartographie des sites estivaux (à droite) et hivernaux (à gauche) sélectionnés dans le cadre de la mise en

place de l'indicateur chiroptères en Auvergne 14

Figure 8: Grand Rhinolophe en hibernation ©Samuel Esnouf 18

Figure 9: Evolution de l'effectif pondéré de Grand Rhinolophe (Rhinolophus ferrumequinum) dans les colonies de

mise bas sélectionnées dans le cadre de l'indicateur chiroptères en Auvergne (mise en forme conforme

aux directives DREAL Auvergne). 18

Figure 10: Petit Rhinolophe en gîte estival @Lilian Girard 19

Figure 11:Evolution de l'effectif pondéré de Petit Rhinolophe (Rhinolophus hipposideros) dans les colonies

d’hibernation sélectionnées dans le cadre de l'indicateur chiroptères en Auvergne (mise en forme

conforme aux directives DREAL Auvergne). 19

Figure 12: Grand Murin en gîte estival ©Claire Desbordes 20

Figure 13: Evolution de l'effectif pondéré Grand Murin (Myotis myotis) dans les colonies d’hibernation sélectionnées

dans le cadre de l'indicateur chiroptères en Auvergne (mise en forme conforme aux directives DREAL

Auvergne) 20

Figure 14 : Evolution de l'effectif pondéré de Barbastelle d’Europe (Barbastella barbastellus) dans les colonies

d’hibernation sélectionnées dans le cadre de l'indicateur chiroptères en Auvergne 21

Figure 15: Evolution de l'effectif pondéré des Chiroptères (toutes espèces confondues) dans les colonies

d'hibernation sélectionnées dans le cadre de l'indicateur chiroptères en Auvergne 23

Figure 16:Evolution de l'effectif de grand Murin (Myotis myotis) dans le tunnel de Morat (Allier) en période estival

(mise bas) 26

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Tableaux

Tableau 1: Détail des scores appliqués aux différentes espèces (ou groupe d'espèces) de chiroptères présents en

Auvergne 12

Tableau 2: Critères de hiérarchisation des gîtes à Chiroptères au niveau national et nombre de colonies (parmi les

sites sélectionnés) auvergnates correspondants à ces critères 15

Tableau 3: Critères de hiérarchisation des gîtes à Chiroptères adaptés pour la région Auvergne 16

Tableau 4: Exemple de pondération effectuée pour l'année 2000 sur les sites d'hibernation de Petit Rhinolophe 16

Tableau 5: Liste des espèces (ou groupe d’espèces) contactées dans les sites sélectionnées pour l'Indicateur toutes

espèces en Auvergne de 2000 à 2014 22

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Remerciements

Je tiens à remercier un tout premier lieu Matthieu Bernard (« El présidente ») pour m’avoir accueilli lors de ce stage

de 6 mois et Dieu sait que 6 mois en ma présence restent un challenge. Merci pour sa convivialité, sa bonne humeur

et surtout pour sa passion débordante envers les chauves-souris et les blagues. Je voudrais lui dédier une phrase :

« Dans la vie, y’a pas de grand, y’a pas de petit. La bonne longueur pour les jambes, c'est quand les pieds touchent

par terre. » Coluche.

Merci ensuite à mon maître de stage, Lilian Girard, pour la confiance qu’il m’a accordée. Merci pour tous ces bons

moments au local, comme en balade, pour le prêt de son appartement lorsque Jean Pidoux a quitté le mien (à

chercher Jean Pidoux). Oh j’allais oublier ! Vous qui lisez ce rapport, je n’ai qu’une chose à dire sur Lilian : cet homme

est fou. Et il en faut de la folie pour grimper le Puy de Dôme à 4h du matin pour « voir si y'a des bêtes »… et en plus il

y en a.

David Happe de la DREAL Auvergne, pour avoir suivi le projet d’indicateur avec intérêt. Et je ne le redirai jamais

assez, pour la confiance qu’il m’a accordée.

Héloïse Durand et son Yuka, merci pour toute ces sorties sur le terrain : je crois que j’en ai fait plus avec toi qu’avec

Lilian, d’ailleurs. Une joie de vivre débordante même après une nuit de 3h à capturer dans l’Allier. Des discussions

mythiques sur la vie des fourmis dont Bernard Weber serait jaloux. Et merci pour tes corrections Grand Murin.

Thomas Bernard, petit par la taille mais grand pour le reste. Un grand merci pour toutes les connaissances que tu as

bien voulu me transmettre. Merci pour cette grande vision du terrain que tu as. Si je devais garder un souvenir de toi

se serait bien évidement notre escapade dans le Cantal.

Caitline Lajoie, Madame Animation…plus jamais tu ne me feras faire une animation en Anglais, et par pitié ne

déménage plus.

Pascal Giosa et Rémy Grignon (l’un et grand, l’autre aussi). Même si vous ne me ferez pas dire que la forêt de

Tronçais est l’une des plus belles, la découverte de cette belle région qu’est l’Allier et de ces sites d’exception restera

dans ma mémoire. Pascal, merci pour toutes tes connaissances naturalistes que tu as bien voulu partager avec moi.

Rémy, merci pour la formation capture que tu as bien voulu me livrer.

Mes compères de toujours qui me suivent même en Auvergne :

Claire Desbordes, sans qui je n’aurais pas vécu ce stage d’exception.

Mathieu « kiki » et Audrey « Pompom » pour toutes ces journées naturalistes.

Julie et Weepet pour leur bonne humeur de toujours que j’ai redécouverte avec plaisir.

Et tous les autres que j’ai côtoyés en Auvergne : Solenne et Julien, Samuel, Luc, Romain et tous ceux que j’oublie.

Merci aussi à mon entourage pour leur relecture et pour la semaine qu’ils ont passée en Auvergne sous la pluie.

Enfin, une grosse pensée toute particulière à Manon, qui, même avec les 300km qui nous ont séparés, a su rester

près de moi, me supporter et me redonner confiance. Maintenant j’arrive vers toi et vive Jardiland !

C’est la tête pleine de souvenirs et de connaissances que je quitte l’Auvergne,

mais bien décidé à revenir un jour…

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Présentation de l’association Chauve-souris Auvergne

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Présentation de l’association Chauve-Souris Auvergne

Généralités

Chauve-Souris Auvergne est une association de type loi 1901, créée en

1994 et issue de la passion de quatre naturalistes animés par la découverte du

monde de la nuit. Elle a pour ambition une meilleure connaissance et une prise

en compte de la conservation des chiroptères à l’échelle régionale.

Chauve-Souris Auvergne est la structure correspondante régionale de la

Société Française d’Etude et de Protection des Mammifères (SFEPM) pour le volet « Chiroptères » et

décline, dans ce cadre plusieurs programmes nationaux sur la conservation de ces espèces : recherche,

conservation et animation.

Les missions

L’étude et la recherche : depuis sa création, l’association réalise régulièrement des

inventaires, des études (télémétrie, éthologie) et des suivis réguliers de colonies, de parturition

et d’hibernation. L’amélioration des connaissances sur la biologie, le comportement et la

répartition des différentes espèces de chiroptères en Auvergne est donc mise en avant.

La conservation : l’une des priorités de l’association est la protection active des colonies

connues. Pour cela, Chauve-Souris Auvergne met en place, depuis quelques années, un

important réseau de sites à préserver avec divers partenaires régionaux : maîtrise foncière pour

l’acquisition de site à enjeux, ou maîtrise d’usage avec une gestion tripartite entre le

propriétaire, le Conservatoire d’Espaces Naturels (Auvergne ou Allier) et l’association.

Depuis 2ans, l’association travail aussi sur la mise en place du conventionnement « Refuges

pour les chauves-souris » en lien avec la SFEPM.

La sensibilisation et la communication : depuis la création de l’association de nombreuses

animations sont réalisées sous divers supports : expositions, articles de presse, plaquettes

l’information sur les chauves-souris et principalement par le biais d’interventions grand public

ou scolaire participant grandement à la protection des Chiroptères.

Figure 1: Logo de l'association

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Introduction

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Introduction

L’élaboration d’indicateurs de la biodiversité occupe une place importante de l’actualité dans

le domaine de la connaissance de la biodiversité, mais affiche aussi l’intérêt croissant des politiques

sur les questions d’intégration de l’écologie dans le développement actuel.

Un engouement récent pour la biodiversité

La France, sous la houlette de L’Union Européenne, adopte en 2004 sa première Stratégie

Nationale pour la Biodiversité (SNB). Elle prévoit la mise en place d’Indicateurs Nationaux pour la

Biodiversité (INB). Ces indicateurs publics ont pour mission de permettre aux décideurs, mais aussi

aux populations, de découvrir la diversité de notre patrimoine naturel et les contraintes qu’elle subit

(source, Ministère de l’Ecologie, du Développement Durable et de l’Énergie). Les premiers INB

voient le jour en 2006 mais sont très vite révisés dès 2010 dans le cadre de la deuxième SNB. Entre

temps doté d’un Observatoire National de la Biodiversité (ONB), les nouveaux INB Français, publiés

annuellement, s’intègrent dans la Loi dite « Grenelle I », et ont pour missions de :

comprendre les enjeux de biodiversité et les traduire en questions ;

élaborer des jeux d’indicateurs apportant des éléments de réponse à ces questions ;

renseigner les indicateurs ;

mettre à disposition de tous (décideurs et gestionnaires publics ou privés, citoyens) ces INB.

La démarche auvergnate : une impulsion de la DREAL, des acteurs motivés

Pour la région Auvergne, le Système d’Information sur la Nature et les Paysages (SINP) est

développé par la DREAL dans le cadre de la mission de « connaissance de la biodiversité ».

Aujourd’hui, la mise en place d’un jeu d’indicateurs de biodiversité est donc portée par la DREAL

Auvergne en co-portage avec le Conseil régional Auvergne. Le point de départ d’une réflexion

organisée sur la connaissance de la biodiversité a permis la mise en place en décembre 2009 d’un

Diagnostique de la Biodiversité en Auvergne. Cette démarche a mobilisé pendant un an des experts

naturalistes, des associations et des élus pour aboutir à la rédaction d’un document de référence pour la

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Introduction

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région, qui constitue le fondement de sa stratégie en terme de biodiversité pour les dix années à venir

(DREAL Auvergne).

L’indicateur Chiroptères : fruit d’un partenariat entre Etat et association

Depuis de nombreuses années, l’association Chauve-Souris Auvergne intervient régulièrement

auprès de la DREAL dans le cadre de nombreuses missions (mise en place des Plans Régionaux

d’Action, listes rouges régionales ou divers appuis techniques pour les études d’impacts). De plus,

possédant une base de données à l’échelle régionale, il était tout naturel que cette dernière soit

missionnée afin de mettre en place le futur indicateur Chiroptères pour la région Auvergne.

Pourquoi les Chiroptères ?

Les chauves-souris sont, à l’image des oiseaux, de très bons indicateurs de l’état écologique

des milieux naturels (Kerbiriou et al., 2007). Grandes consommatrices d’insectes, elles sont au

sommet de leur chaine alimentaire et sont directement impactées par l’altération des écosystèmes. Les

populations ont fortement décliné au cours du 20ème

siècle, plaçant 1/3 des espèces métropolitaines

dans un état préoccupant (INPN). Il est souvent facile de signaler une diminution d’effectifs mais les

causes sont plus délicates à mettre en avant :

Disparition des gîtes naturels ou anthropiques : abattage des arbres creux, rénovation des vieux

bâtiments ou infrastructures, sécurisation minière non adaptée,

Utilisation de produits phytosanitaires à large spectre (notamment pour les Rhinolophidae),

Raréfaction des milieux de chasse : la modification du paysage en cours depuis les années

1930 entraine une disparition du milieu bocager, en particulier, très prisé par les chiroptères,

Destruction directe volontaire ou non : le dérangement lors de l’hibernation, la destruction

volontaire des animaux, les transports routiers ou encore l’éolien sont autant de causes à

rajouter au déclin des chauves-souris.

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Matériels et méthodes

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Matériel et méthode

Site d’Etude

Patrimoine naturel

L’Auvergne compte parmi les régions les mieux préservées, avec une variété d’habitats qui la

classe dans les premiers rangs au niveau national (Bouchardy & Lemarchand, 2009). Façonnée par une

activité volcanique et sismique créant de nombreux milieux naturels tels que des lacs de barrages (Lac

Chambon, Lac d’Aydat), des lacs de cratères de type maar (Lac Pavin, Lac du Bouchet), une

multitude de milieux rocheux d’altitude (Crêtes du Sancy ou du Cantal) mais également de faible

altitude (Coulée de Bourriane). La diversité des roches de la région Auvergne, couplée à une

amplitude altitudinale, explique également la présence de nombreux habitats naturels ou semi-naturels

marqués par les précipitations et l’ensoleillement. Cette mosaïque d’habitats très diversifiés, et surtout

très proches et imbriqués, permet de passer d’une forêt thermophile de type chênaie à une lande

subalpine en l’espace de quelques kilomètres.

Le réseau hydrographique auvergnat est accompagné d’une grande diversité de milieux

humides, allant des tourbières de montagne aux prairies humides, des plaines alluviales en passant par

les gorges rocheuses ou les étangs. Ces zones humides et les milieux associés accueillent tout un

cortège d’espèces de mammifères, terrestres ou volants.

La présence de haies anciennes dans certaines régions offre le gîte à coté du couvert et

favorise la présence des mammifères dans le réseau bocager. Ce réseau de haies connectées est

localement bien représenté dans le département de l’Allier et sur toute la frange ouest de la région. En

zone agropastorale la densité d’arbres dépasse parfois les 200 mètres linéaires par hectare.

Patrimoine culturel

La région auvergnate a été, de par sa diversité géologique, l’une des régions minières les plus

fécondes de France. A l’exception du minerai de fer, tous les combustibles, minerais et matériaux

industriels sont présents dans la région. Il en découle de nombreuses exploitations et ce dès l’antiquité

(carrière du temple de Mercure, Puy de Dôme). La construction des premiers monuments d’ampleurs

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Matériels et méthodes

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(édifices religieux en particulier) et la fourniture de pierres et de chaux autour des principales

agglomérations, entrainent le creusement de vastes réseaux de carrières souterraines (Espaly Saint

Marcel en Haute-Loire, Volvic dans le Puy de Dôme). Toutes ces activités exploitant directement le

sous-sol de la région vont offrir des vestiges encore utilisés de nos jours par les mammifères sauvages

et en particulier les Chiroptères (99% des gîtes d’hibernation sont d’origine cavernicole anthropique en

Auvergne).

A partir du Moyen-âge, des habitats de type troglodytiques sont creusés ou aménagés dans de

nombreux secteurs de la région. Ces sites peuvent prendre des allures assez importantes comme les

grottes de Jonas (Saint-Pierre-Colamine dans le Puy de Dôme).

La topologie de l’Auvergne, liée à un rapide développement d’exportation de matière première

(minerais, bois et vins notamment), a rapidement eu raison du développement des voies de chemin de

fer. Les réseaux routiers et le développement des transports routiers ont brusquement rendu le fret

ferroviaire peu compétitif. Aujourd’hui sur les 1390 km de lignes, 231 tunnels ont vu le jour. 132 sont

encore en service, 2 sont détruits et 97 ne sont plus exploités. Ainsi, chaque année, 79 tunnels sont

intégrés au suivi annuel des sites d’hibernation régionaux et plus de 3600 chauves-souris y ont été

observées durant les 15 dernières années.

Enfin, le développement de la culture de la vigne au XIXème

siècle mènera au creusement de

nombreuses caves en particulier autour de Clermont-Ferrand et de Riom (Montaigut-le-Blanc,

Aubière) Ces imposants réseaux de caves se révèlent essentiels pour l’hibernation de certaines

espèces.

Difficile d’accès pour le naturaliste mais pas pour les animaux, cette diversité de sites reste le

symbole de l’Auvergne.

Modèles biologiques et espèces

Généralité

Les chiroptères, ou chauves-souris, sont des mammifères, différenciés de leur paires il y a 70

millions d’années environ (Dietz et al., 2007). Leurs multiples particularités biologiques leur ont

permis la conquête du milieu aérien, essentiellement nocturne ainsi que la diversité spécifique

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Matériels et méthodes

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aujourd’hui observée. En effet, on compte à ce jour plus de 1200 espèces dans le monde. Elles

occupent ainsi le second ordre de mammifères derrière les rongeurs (Arthur & Lemaire, 2009).

Les chiroptères présents sur l’hexagone font parties du sous-ordre des Yangochiroptera (auquel il

faudra ajouter les Rhinolophidae). Ce sont des animaux de taille raisonnable : leur envergure varie de

15 à 40 cm pour un poids allant de 4g à 55g pour les plus grosses espèces. L’Auvergne compte à ce

jour 29 des 35 espèces de chiroptères présents en France, ce qui fait de la région l’une des plus riches.

Ces derniers sont répartis en quatre familles: Rhinolophidés, Minioptéridés, Vespertillionidés et

Molossidés.

Régime alimentaire

En France, la grande diversité d’espèces de chiroptères consomme un large éventail de proies

(coléoptères, lépidoptères, diptères, arachnides… (Whitaker, 1998). C’est d’ailleurs pour cette raison

qu’un si grand nombre d’espèces insectivores peut cohabiter en France (Fenton, 1972). Les techniques

de chasse sont elles aussi très variées. Certaines espèces utilisent les eaux calmes pour pêcher les

insectes tombés à la surface de l’eau (Murin de Daubenton), d’autres apprécient les prairies pâturées

pour la recherche de coléoptères (Rhinolophidés) ou encore les hautes strates arborées (Noctules,

Sérotine) (Arthur & Lemaire, 2009).

Particularités biologiques des espèces Françaises

Le vol : les chauves-souris sont les seuls mammifères

capables du vol actif. A ces fins, leurs membres antérieurs sont

modifiés et possèdent des métacarpes très allongés, reliés entre

eux par une membrane alaire, le patagium (Arthur & Lemaire,

2009).

Cette adaptation leur permet un accès à des sources de nourritures

impossible aux autres espèces terrestres et une rapidité de

déplacement supérieure à la plupart des autres mammifères (plus de

50km/h pour les Noctules) (Bruderer & Popa-Lisseanu, 2005).

Figure 2: Aile d'une chauve-souris (Grand Murin) observée lors d’une

capture temporaire © Claire Desbordes & Rémi Grignon

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Matériels et méthodes

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L’écholocation : les chiroptères ont développé une audition active pour vivre dans l’obscurité.

Ils émettent des ultrasons par la bouche ou le nez suivant les espèces. Ces émissions viennent frapper

les obstacles ou les proies potentielles et reviennent par écho aux oreilles des animaux. C’est

l’intégration de ces données qui leur permet de mettre en place une image de l’environnement. Les

chauves-souris peuvent ainsi se déplacer et chasser aussi naturellement que les animaux diurnes

(Arthur & Lemaire, 2009). Chaque espèce émet dans une gamme de fréquence bien définie permettant

une détermination de l’espèce par l’analyse de ces ultrasons.

Un cycle vital bien défini

Le cycle des chiroptères de nos régions tempérées est principalement basé sur la disponibilité

en proies et donc calqué sur les rythmes saisonniers. A ces fins, les chauves-souris recherchent

plusieurs types d’habitats favorables au cours de l’année variant selon les espèces.

En hiver (novembre à mars), les chauves-souris entrent en hibernation. Elles ont besoin de

conditions thermique et hygrométrique stables et une absence de dérangement. Chaque espèce

possède des besoins différents. Les Rhinolophidés, Murins, Oreillards et Barbastelles

descendent ainsi dans les cavités souterraines.

D’autres, comme les Noctules ou Sérotines, occupent

volontiers de simples fissures, cavités arboricoles ou

ponts. Les chauves-souris en léthargie vont utiliser les

réserves accumulées à l’automne pour passer l’hiver.

Leur rythme cardiaque ralentit de 300 à 400

pulsations par minute en période active, à seulement

11 à 25 (Arthur & Lemaire, 2009).

Au printemps (avril à mai), les animaux renouvellent leurs réserves consommées durant la

période de léthargie. C’est aussi à ce moment là qu’a lieu la fécondation : les spermatozoïdes

sont libérés de l’oviducte où le développement embryonnaire débute. La période de gestation

Figure 3: Illustration de l'hibernation d'un Petit Rhinolophe © Agathe Verilhac

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Matériels et méthodes

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des femelles commence et durera 40 à 70 jours selon les espèces, la disponibilité en nourriture

et la température.

L’été (juin à août) correspond à la période de mise bas et d’élevage des jeunes. Les femelles se

rassemblent en colonies. Lors de la chasse, les jeunes sont sous la garde de certains adultes

restés aux gîtes. Les mâles sont soit solitaires, soit en petits groupes mais leurs exigences

(thermique et hygrométrique) étant plus faibles, on peut les retrouver dans une multiplicité de

gîtes.

L’automne correspond à la période de transit automnal

(septembre à octobre). Les chiroptères constituent leurs

réserves pour l’hiver et s’accouplent. C’est à cette période

que se produit le phénomène de swarming : les animaux se

regroupent dans des cavités en colonies mixtes pouvant

atteindre plusieurs centaines d’individus. Lors de ces

rassemblements, les parades nuptiales et accouplement

sont largement observés.

Les principaux gîtes auvergnats

L’Auvergne, compte tenu de son passé, compte parmi les régions possédant un nombre et des

types de gîtes les plus importants. Ils correspondent à trois grandes catégories :

Les gîtes souterrains : parmi eux, les cavités naturelles issues de l’activité volcanique (Creux

de Soucy), d’anciennes cavités minières ou de vieillissement du vin (site des 140 caves à

Montaigut le Blanc), les anciennes maisons troglodytiques (les grottes de Jonas) ou encore les

tunnels ferroviaires (Tunnel de Présailles). Ces sites seront principalement utilisés en hiver

lors de l’hibernation pour la stabilité thermique qu’ils offrent alors aux animaux.

Les gîtes arboricoles sont plus difficiles à quantifier, localiser ou même prospecter. Ils n’en

restent pas moins d’une grande importance pour certaines espèces telle que la Barbastelle

d’Europe (Barbastella barbastellus) ou la Grande Noctule (Nyctalus lasiopterus). Ils seront

Figure 4: Reproduction d'Oreillard gris ©Pierre Rimbaud

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Matériels et méthodes

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utilisés en été lors de la mise bas (la forêt de Tronçais, dans l’Allier, reste l’exemple le plus

important mais aussi le plus étudié à ce jour pour la région).

Les gîtes anthropiques sont les plus nombreux, à ce niveau de connaissance : ils correspondent

à l’utilisation par les chiroptères des infrastructures humaines tels que les ponts routiers,

centrales hydroélectriques, clochers d’églises ou encore habitations. De nombreuses espèces

dites anthropophiles trouveront ainsi, dans ces nouveaux gîtes, le confort nécessaire à la mise

bas et l’élevage des jeunes. Il est à noter que les nombreuses découvertes de ces sites sont

directement liées à la mise en place du réseau de SOS par l’association. Ce réseau permet au

public de contacter l’association pour tout problème rencontré avec des chiroptères (colonie

dans le bâtiment, animaux blessés, informations diverses).

Le travail du chiroptérologue en Auvergne : différents types de prospection

Trois grands types de prospection sont régulièrement utilisés lors du dénombrement et de

l’identification des animaux présents dans la région :

Prospection des regroupements hivernaux et estivaux

Lors de ces périodes de rassemblement (hibernation ou « pouponnière ») les différents gîtes

sont prospectés une à deux fois l’année en période favorable. Il est ainsi noté pour chaque site connu :

les espèces, le nombre d’individus présents et dans le cas de colonies de mise bas, le statut

reproducteur des femelles et le nombre de jeunes. D’une grande importance pour les animaux, ces sites

sont une priorité pour la conservation des chauves-souris en Auvergne.

A ce jour, l’Auvergne compte un peu plus de 470 sites d’hibernation régulièrement contrôlés

et 260 colonies estivales régulièrement suivies.

La capture temporaire (juin-novembre)

Une fois les animaux remis de l’hibernation, et les mises bas effectuées (mi-juin) les sessions

de capture peuvent débuter. Elles ne sont pas une priorité mais permettent d’obtenir de plus amples

informations sur les chiroptères : taille, masse, statut reproducteur ou encore prélèvement ADN. Les

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Matériels et méthodes

10

captures temporaires permettent aussi la pose d’émetteurs utiles pour la découverte de nouveaux gîtes

de certaines espèces rares en Auvergne (1er gîte de reproduction de Grande Noctule découvert il y a 2

ans en Auvergne par exemple). Ces captures s’effectuent à l’aide de filets posés verticalement sur le

terrain de chasse ou de transit des animaux. Chaque captureur à suivi une formation théorique et

pratique (dispensées par le Muséum d’Histoire Naturelle de Paris : MNHN) et dispose d’une

autorisation spéciale attribuée par le MNHN et la préfecture.

Détection ultrasonore (avril à novembre)

Les ultrasons émis par les chiroptères sont identifiables à condition d’utiliser un appareil

permettant de retranscrire les cris d’écholocation (10 et 120kHz) en sons audibles (2 à 20 kHz). Le

détecteur émet en off une fréquence constante et il retranscrit la différence entre la fréquence du cri de

l’animal et cette constante, cette différence de quelques kHz, est du domaine de l’audible pour l’oreille

humaine. Chaque espèce de Chiroptère émettant un (ou un ensemble) de sons différents, il est

généralement possible de déterminer l’espèce et parfois même le comportement de l’espèce (ou des

espèces) présente(s). (Barataud, 2012)

L’indicateur chiroptères en Auvergne : travail préalable

Correction et mise en forme de la Base de données

Chauve-Souris Auvergne est propriétaire d’une base de données chiroptérologiques, sans cesse

enrichie par les différentes activités (prestations et associatives) réalisées en région depuis près de

vingt ans par les 90 bénévoles. La première étape a donc été le contrôle et le lissage de cette base de

données. Ce sont donc pas moins de 22 000 lignes de données qui ont été inspectées afin de corriger

les erreurs de saisies, souvent liées au grand nombre d’observateurs (nom du site, géolocalisation ou

encore doublons).

Page 19: Mise en place d’un Indicateur - Ministère de la ...

Matériels et méthodes

11

Figure 5: Cartographie des sites d'études (gîtes, études acoustiques, captures ou SOS) en Auvergne (à gauche)

Cartographie des gîtes estivaux et hivernaux en Auvergne (à droite)

Ce travail de fond a permis d’obtenir et de travailler sur une base de données « propre ». Les

cartographies ci-dessus présentent les sites suivis par l’association depuis 1994 avant le travail de

nettoyage (n=2793). Parmi ces sites, ont retrouvera les lieux de captures temporaires, d’études via

détection ultrasonore, les nombreux sites prospectés, les lieux des cas de SOS traités ainsi que les gîtes

estivaux et hivernaux. Ce sont exclusivement ces derniers qui seront pris en compte pour la mise en

place de l’indicateur pour la raison fondamentale de leurs suivis réguliers. La seconde cartographie

présente ce réseau de gîtes sur lesquels la mise en place de l’indicateur s’est ensuite axé. (n=857).

Hiérarchisation des espèces

Parmi les 28 espèces de chiroptères présents en Auvergne, certaines ne sont pas pertinentes

dans la mise en place de l’indicateur : trop peu de données par exemple. Il a donc été mis en place un

système de hiérarchisation prenant en compte les espèces à grands effectifs et d’intérêt conservatoire

fort.

Un score est donné à l’espèce par tranche d’effectif allant de 1 pour les plus faibles jusqu’à 5 pour les

espèces possédant un effectif supérieur à 1000. Cet effectif est calculé sur le total d’individus observés

ces 14 dernières années (Score 1). Ce score permet de prendre en compte les espèces les plus

contactées en Auvergne et donc les plus pertinentes pour la mise en place de l’indicateur.

Page 20: Mise en place d’un Indicateur - Ministère de la ...

Matériels et méthodes

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Espèces effectif cumulé Statut liste rouge score 1 score 2 score final

Rhinolophus ferrumequinum 1564 Coef 4 5 4 20

Myotis myotis/blythii 805 Coef 4 4 4 16

Barbastella barbastellus 697 Coef 4 4 4 16

Rhinolophus hipposideros 2226 Coef 4 5 4 20

Plecotus specie 842 Coef 3 4 3 12

Myotis nattereri 798 Coef 3 4 3 12

Myotis emarginatus 176 Coef 4 2 4 8

Myotis bechsteinii 172 Coef 4 2 4 8 effectif cumulé score 1

Myotis mystacinus/brandtii 386 Coef 3 3 3 9 0-100 1

Rhinolophus euryale 46 Coef 4 1 4 4 100-300 2

Pipistrellus specie 287 Coef 1 2 1 2 300-500 3

Hypsugo savii 26 Coef 2 1 2 2 500-1000 4

Myotis myotis 19 Coef 4 1 4 4 >1000 5

Myotis specie 80 Coef 3 1 3 3

Nyctalus noctula 68 Coef 3 1 3 3 statut liste rouge IUCN score 2

Myotis mystacinus/brandtii/alcathoe 50 Coef 3 1 3 3 coef 1 1

Myotis mystacinus 20 Coef 3 1 3 3 coef 2 2

Nyctalus leisleri 19 Coef 3 1 3 3 coef 3 3

Pipistrellus pipistrellus 15 Coef 1 1 1 1 coef 4 4

Myotis alcathoe 11 Coef 3 1 3 3

Plecotus auritus 10 Coef 3 1 3 3

Plecotus austriacus 8 Coef 3 1 3 3

Pipistrellus nathusii 3 Coef 2 1 2 2

Miniopterus schreibersii 2 Coef 4 1 4 4

Eptesicus nilssonii 1 Coef 2 1 2 2

Nyctalus specie 1 Coef 2 1 2 2

Un score a aussi été attribué à la rareté de l’espèce au niveau national et européen. Ce score est défini

selon les catégories mises en place en 2007 par F. Godineau et D. Pain dans le cadre du plan de

restauration des chiroptères en France métropolitaine. Prenant en compte les statuts nationaux et

européens mais aussi les nouveautés en matière de génétique, il parait le plus à même de catégoriser

les espèces de chiroptères présentes en Auvergne. (Score 2).

Un score final est donc attribué à chaque espèce de chiroptères selon la formule suivante :

Tableau 1: Détail des scores appliqués aux différentes espèces (ou groupe d'espèces) de chiroptères présents en Auvergne

Il est donc retenu les 4 espèces possédant un score final supérieur à 15 à savoir le Grand

Rhinolophe (Rhinolophus ferrumequinum), le Petit Rhinolophe (Rhinolophus hipposideros), le Grand

Murin (Myotis myotis) et la Barbastelle d’Europe (Barbastella barbastelus). A noter que la

différenciation entre le Petit Murin (Myotis blythii) et le Grand Murin (Myotis myotis) n’est pas

toujours réalisable sur le terrain lors d’observation de visu. Le Petit Murin, n’a été contacté, à ce jour,

qu’une seule fois en Auvergne, mais par mesure de prudence la terminologie Myotis myotis/blythii est

utilisée dans la base de données mais ne sera pas explicitement affichée pour l’indicateur.

Ces espèces sont, au dire d’experts, les plus pertinentes, dans l’état actuel des connaissances,

pour la mise en place d’indicateurs en Auvergne. De part leur biologie, elles représentent les espèces

Page 21: Mise en place d’un Indicateur - Ministère de la ...

Matériels et méthodes

13

Figure 6: Evolution du nombre de gîtes d'hibernation de Petit Rhinolophe contrôlés par années (à gauche) et évolution des effectifs de cette même espèce (à droite)

considérées comme les plus exigeantes, dont les effectifs permettent un indicateur fiable vis-à-vis de

l’état des populations de chiroptères en Auvergne.

Ce système de notation a été validé et jugé pertinent par les experts chiroptèrologiques de

l’association. Il a aussi été ajouté un indicateur « toutes espèces ». Ce dernier donnera une vision plus

globale de l’évolution des chiroptères en Auvergne, au sens large de l’ordre taxonomique.

Hiérarchisation et choix des sites

Comme vu précédemment, l’Auvergne est l’une des régions les plus riches en nombre et

diversité de gites. La mise en place de l’indicateur a suscité de nombreuses questions : il était, en effet,

impossible de réaliser un indicateur sur le même modèle que celui des autres régions. En effet, trop

peu de sites majeurs regroupant une importante population de chiroptères ne sont à ce jour connus en

Auvergne. La mise en place d’un indicateur basé sur ces seuls sites est donc impossible. Ce type

d’indicateur reste pourtant l’un des plus représentatifs et des plus simples à mettre en œuvre : en

témoigne celui mis en place par la région Nord Pas de Calais (source, Observatoire Biodiversité du

Nord Pas de Calais).

L’augmentation croissante de l’effort de prospection a permis la découverte de nombreux nouveaux

gîtes (estivaux comme hivernaux). Un indicateur basé sur les effectifs de population de la totalité des

sites Auvergnats serait biaisé par cet effort de prospection variable selon les années.

Page 22: Mise en place d’un Indicateur - Ministère de la ...

Matériels et méthodes

14

En témoigne les graphiques ci-dessus montrant une évolution de la population de Petit

Rhinolophe en hibernation, calqué sur les variations du nombre de gîtes hivernaux contrôlés chaque

années. (Coefficient de corrélation de Pearson = 0.799 ; pValue <0.001).

Il convient donc de mettre en place un indicateur ne prenant un compte que les sites

d’importance et annuellement suivis par l’association. En effet, sur les 857 gîtes estivaux et hivernaux

suivis en Auvergne depuis les années 1994, certains sont prospectés de manière anecdotique (intérêt

faible, impossibilité d’accès par refus propriétaire ou par raisons de sécurité), d’autres sont depuis

fermés ou détruits. L’indicateur débutera donc à partir de l’année 2000. C’est à cette date que

l’association Chauve-Souris Auvergne a instauré le contrôle systématique des colonies hivernales

Seuls les sites hivernaux suivis depuis plus de 10 ans sont pris en compte. Le suivi des colonies de

mise bas étant plus récent, seuls les sites suivis depuis plus de 5 ans seront pris en compte.

Ce travail de hiérarchisation a permis de filtrer, sur la totalité de sites découverts et prospectés

en Auvergne, les seuls sites possédant les critères nécessaires pour intégrer et créer un indicateur

chiroptères d’Auvergne le plus fiable et pertinent possible.

L’indicateur chiroptères d’Auvergne est donc double : un indicateur basé sur les gîtes

d’hibernation (n=55) suivis depuis plus de 10 ans et un indicateur basé sur les gîtes estivaux (n=48)

suivis depuis plus de 5 ans. Le nombre de site, ainsi que leur répartition spatiale sur le territoire

auvergnat permet la mise en place d’un indicateur fiable et robuste.

Figure 7: Cartographie des sites estivaux (à droite) et hivernaux (à gauche) sélectionnés dans le cadre de la mise en place de l'indicateur chiroptères en Auvergne

Page 23: Mise en place d’un Indicateur - Ministère de la ...

Matériels et méthodes

15

Intégration de nouveaux sites et pondération

Les indicateurs biodiversité ont vocation à être régulièrement mis à jour (mise à jour annuelle

pour l’indicateur Chiroptères). Dans cette optique, il a été choisi de réaliser un indicateur chiroptères

simple à actualiser. Le choix du logiciel Excel, pour la mise en forme des graphiques, a donc été

motivé par la facilité de mise à jour et d’exportation des résultats chaque année.

Il était aussi important de permettre, outre les sites sélectionnés, l’ajout de nouveaux gîtes

d’importance découverts sans biaiser la tendance d’évolution des populations. Un système de

pondération par « poids » de site permettra d’uniformiser l’ajout de nouveaux sites au cours des

années mais aussi de pallier au non contrôle de quelques colonies certaines années (en raison de la

difficulté d’accès de certains sites). Pour réaliser cette pondération, il a été utilisé la méthode nationale

de hiérarchisation des gîtes à chiroptères (Godineau & Pain, 2007). Cette méthode nationale semblait

cependant inadaptée à la configuration du réseau de gîtes auvergnat : diversité numérique de sites et

faible effectif. Le système de notation a donc été revu pour s’adapter au mieux au cas auvergnat.

Le tableau suivant présente le nombre de colonies d’hibernation auvergnates (sélectionnées

pour l’indicateur) correspondant au critère de la méthode de hiérarchisation nationale « Importance des

Colonies : IC ».

Tableau 2: Critères de hiérarchisation des gîtes à chiroptères au niveau national et nombre de colonies (parmi les sites sélectionnés) auvergnates correspondants à ces critères

Les critères nationaux ne semblent pas adaptés aux effectifs des colonies d’Auvergne. Aucune

colonie ne compte plus de 1000 individus et seulement une comprend un effectif supérieur à 300 (n=

523 individus).

Importance des colonies (nombre d'individus) score IC

nombre colonies en Auvergne

0 >4 0 11

>5 <20 1 20

>20 <300 2 23

>300 <1000 3 1

>1000 4 0

Page 24: Mise en place d’un Indicateur - Ministère de la ...

Matériels et méthodes

16

Année 2000 score pondération

Carrière de Coucouron 1

Cave route de saint-julien 3

Caves sous l'église 1

Cavité de Beauregard 1

Cavité de l'Ours 2

Cavité principale St Julien 2

Cavité route de Sapchat 1

Egout St Nectaire 0

Galerie 1 du ruisseau des mines (rive gauche) 0

Galerie de Fontcuberte 0

Galerie principale 1

Glacière de la Mège 3

Grande carrière 3

Grotte chez M. Laveine 0

Grotte d'Aubary n°1 1

Sources Galerie principale 3 1

Védrines 1

VT6 2

VT7 0

total 23

Les critères de hiérarchisation ont donc été modifiés afin de mieux prendre en compte les

effectifs des colonies auvergnates.

Tableau 3: Critères de hiérarchisation des gîtes à chiroptères adaptés pour la région Auvergne

Ainsi, pour chaque espèce sélectionnée précédemment (Grand et Petit Rhinolophe, Grand

Murin, Barbastelle d’Europe), et l’indicateur « toutes espèces », un score est associé à chacun de leurs

gîtes estivaux et hivernaux, permettant une pondération annuelle de l’effort de prospection. Cette

pondération permet d’intégrer de nouveaux sites au fil des ans et de pallier à l’absence de données de

certains sites.

L’indicateur sera calculé selon le modèle suivant :

Voici un exemple de pondération effectuée sur les

sites d’hibernation de Petits Rhinolophes pour

l’année 2000. Chaque site possède un score de

pondération. Le score final pour cette espèce à

l’année 2000 est donc la somme des scores de

pondération (ici Pond.An = 23).

Importance des colonies (nbr d'individus)

score colonie

0 >4 0

≥5 <50 1

≥50 <100 2

≥100 <200 3

≥200 4

Tableau 4: Exemple de pondération effectuée pour l'année 2000 sur les sites d'hibernation de Petit Rhinolophe

Page 25: Mise en place d’un Indicateur - Ministère de la ...

Résultats : l’indicateur chiroptères en Auvergne

17

Résultats : l’indicateur chiroptères en Auvergne

L’indicateur chiroptères ou plutôt les indicateurs seront présentés pour chaque espèce

sélectionnée ou groupes d’espèces : Grand Rhinolophe, Petit Rhinolophe, Grand Murin, Barbastelle

d’Europe et toutes espèces confondues. Pour chaque indicateur, deux graphiques ont été créés, l’un

présentant les variations d’effectifs durant les comptages hivernaux et l’autre durant les comptages de

colonies de parturition (période estivale). Il est bien sûr à rappeler que le manque de recul de

comptages estivaux ne permet pas une interprétation fiable mais seulement une indication l’évolution

des populations.

Pour chaque espèce, une seule saison du cycle biologique sera sélectionnée en qualité

d’indicateur. Les motivations de ce choix seront explicitées (traits biologique de l’espèce ou obligation

de prospection) et seul l’indicateur retenu sera exposé et expliqué. Il est renseigné au format défini par

la DREAL Auvergne dans son rapport d’élaboration d’indicateurs régionaux de biodiversité en date

d’octobre 2013.

La demande de la DREAL Auvergne étant que les indicateurs soient mis en ligne sous forme

de fiches (appelée « Fiche Indicateur »), l’intégralité de ces fiches sera présentée en annexe. Sur

chaque fiche seront mentionnés :

les informations de base de l’indicateur ; type d’indicateur, période couverte, fréquence

d’actualisation, comparabilité en France,

la méthode de construction de l’indicateur,

une analyse de ce dernier : interprétation, fiabilité, précision, sensibilité, robustesse,

les améliorations futures.

Page 26: Mise en place d’un Indicateur - Ministère de la ...

Résultats : l’indicateur chiroptères en Auvergne

18

L’indicateur Grand Rhinolophe, Rhinolophus ferrumequinum

Le Grand Rhinolophe est une espèce temporairement mobile en

hiver sur de courte distance, du fait de son inaptitude aux longues périodes

d’hibernation (Athur & Lemaire, 2009). De ce fait, les effectifs recensés

lors des contrôles hivernaux risquent d’être biaisés. A contrario, en

période estivale, les colonies de femelles restent relativement fidèles à leur

gîte de parturition et de nombreux sites sont aujourd’hui contrôlés de

manière régulière. Pour l’indicateur de la population de cette espèce, le

choix le plus pertinent et retenu se concentre donc sur les effectifs

estivants (n= 7 sites sélectionnés en moyenne par année).

Il est constaté une augmentation des effectifs au cours des 10

dernières années. Néanmoins, lors des quatre premières années prises en

compte dans l’indicateur (2000; 2001; 2002 et 2003), le comptage des colonies estivales de cette

espèce reste irrégulier et ne permet pas la prise en compte des effectifs associés. La population de

Grand Rhinolophe suivie par l’association est passée de 682 femelles en mise bas en 2004 à 957 en

2013 (Coefficient de corrélation de Pearson, méthode Spearman = 0.88, Pvalue = 3.7 10-5).

Figure 8: Grand Rhinolophe en hibernation ©Samuel Esnouf

Figure 9: Evolution de l'effectif pondéré de Grand Rhinolophe (Rhinolophus ferrumequinum) dans les colonies de mise bas sélectionnées dans le cadre de l'indicateur chiroptères en Auvergne (mise en forme conforme aux directives DREAL Auvergne).

Page 27: Mise en place d’un Indicateur - Ministère de la ...

Résultats : l’indicateur chiroptères en Auvergne

19

L’indicateur Petit Rhinolophe, Rhinolophus hipposideros

Le Petit Rhinolophe est une espèce phare en Auvergne, véritable espèce parapluie pour la

protection de certains sites. Ses nombreuses colonies

(hivernales comme estivales) sont suivies avec attention

depuis la création de l’association. C’est sans doute l’une des

causes expliquant la fiabilité d’interprétation de ces deux

indicateurs. Possédant une meilleure régularité de suivi, il est

choisi l’indicateur hivernal (n= 32 sites sélectionnés en

moyenne par années). La première année de suivi ne

comprenant pas les sites principaux d’hibernation (découverts

l’année suivante), elle ne sera pas prise en compte.

Une certaine stabilité des populations de Petit

Rhinolophe est observée depuis les années 2000 au sein des colonies sélectionnées dans l’indicateur

chiroptères. Les effectifs passent de 261 à 226 individus entre les années 2001 et 2014. On notera les

grandes fluctuations entre 2007 et 2012 (Coefficient de corrélation de Pearson, méthode Spearman =

0.29, Pvalue = 0.29).

Figure 10: Petit Rhinolophe en gîte estival @Lilian Girard

Figure 11:Evolution de l'effectif pondéré de Petit Rhinolophe (Rhinolophus hipposideros) dans les colonies d’hibernation sélectionnées dans le cadre de l'indicateur chiroptères en Auvergne (mise en forme conforme aux directives DREAL Auvergne).

Page 28: Mise en place d’un Indicateur - Ministère de la ...

Résultats : l’indicateur chiroptères en Auvergne

20

L’indicateur Grand Murin, Myotis myotis

Le cas du Grand Murin est un peu plus complexe que

celui des Rhinolophidés. Cette espèce présente la particularité

de se regrouper en colonies de parturition populeuse. En

Auvergne, on citera, parmi les plus forts effectifs, les colonies

d’Ardes, Ris et Beaux (comptabilisant en moyenne 400

femelles gestantes chacune). Ce sont ces colonies qui

constitueront la majeure partie de l’indicateur estival pour cette

espèce. Il est normal d’observer une variation de quelques centaines d’individus selon la date de

prospection ou le type (sortie de gîte, photographie ou de visu). Ces variations vont affecter de

manière importante les effectifs de l’indicateur estival. Il a donc été choisi de conserver l’indicateur

hivernal, les variations d’effectifs au sein d’un gîte d’hibernation semblant plus stables au cours de

l’hiver (n=17 sites sélectionnés en moyenne par années).

Une diminution importante de l’effectif de Grand Murin dans les sites sélectionnés est

observée entre les années 2000 et aujourd’hui. La population dans ces gîtes est passée de 605 en

2000 à 198 individus en 2014 (Coefficient de corrélation de Pearson, méthode Spearman = -0.79,

Pvalue = 9.8 10-4).

Figure 12: Grand Murin en gîte estival ©Claire Desbordes

Figure 13: Evolution de l'effectif pondéré Grand Murin (Myotis myotis) dans les colonies d’hibernation sélectionnées dans le cadre de l'indicateur chiroptères en Auvergne (mise en forme conforme aux directives DREAL Auvergne)

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Résultats : l’indicateur chiroptères en Auvergne

21

L’indicateur Barbastelle d’Europe, Barbastella barbastellus

En Auvergne, comme dans beaucoup de régions de France, la Barbastelle d’Europe possède

un rythme hivernal assez complexe (Girard-Claudon, 2011). C’est l’une des rares espèces utilisant des

gîtes souvent peu attractifs pour les autres espèces : espaces ventilés, température variable (voire

négative). Cette espèce ne craignant pas les faibles températures se retrouvera, en début d’hiver,

principalement dans des gîtes anthropiques (derrière de volet, comble de maison) ou encore sous les

écorces des arbres (Arthur & Lemaire, 2009). En cas de grand froid, elles migrent vers des refuges

tampons : ancien tunnel ferroviaire, cavité naturelle ou artificielle. En période estivale, les colonies de

femelles se créent un réseau de gîtes assez important. Bien que fidèles à ces derniers, elles alternent

régulièrement au sein du réseau. Ce comportement de l’espèce, aux deux saisons, ne permet pas un

suivi des effectifs précis au sein de ces gîtes, aléatoirement occupés. De ce fait, aucune évolution des

populations de Barbastelle d’Europe en Auvergne ne peut être, de manière rigoureuse, déduit. Cette

espèce, pourtant patrimoniale et bien représentée en Auvergne, ne sera pas retenue dans l’indicateur

chiroptères en Auvergne.

L’indicateur hivernal illustre bien la difficulté de mise en place d’un indicateur pour la

Barbastelle d’Europe. Les nombreuses variations annuelles étant, au dire de la littérature, étroitement

liées aux conditions climatiques lors des contrôles de colonies, les populations dans les gîtes

d’hibernation sélectionnés varient de quelques dizaines d’individus (2004; 2008; 2010 et 2014) à une

centaine d’individus hibernants (2006 et 2009).

Figure 14 : Evolution de l'effectif pondéré de Barbastelle d’Europe (Barbastella barbastellus) dans les colonies d’hibernation sélectionnées dans le cadre de l'indicateur chiroptères en Auvergne

Page 30: Mise en place d’un Indicateur - Ministère de la ...

Résultats : l’indicateur chiroptères en Auvergne

22

L’indicateur « toutes espèces »

Le choix de cet indicateur est grandement motivé par les besoins de la DREAL Auvergne

souhaitant présenter l’évolution des populations de chiroptères en Auvergne. Les indicateurs

précédents ne montrent que l’évolution des espèces phares dans cette région. Cet indicateur présentera

l’évolution des effectifs de la totalité des espèces contactées en période d’hibernation.

Ici, chaque espèces découvertes dans les sites sélectionnés seront prises en compte (tableau 5).

Il convient de signaler que lors des comptages estivaux, seules les

colonies d’espèces classées à l’annexe 2 de la Directive Habitats

(92/43/CEE) sont contrôlées. Il est en effet, impossible de prospecter

l’intégralité des colonies de mise bas présentes en Auvergne

(environ 50 nouvelles colonies de Pipistrelles communes

découvertes chaque année). Souhaitant prendre en compte

l’intégralité des espèces auvergnates, il était impossible de se baser

sur les comptages estivaux. De plus, la diversité extra-spécifique est

bien supérieure dans les gîtes hivernaux. Lors de cette période, les

espèces se mélangent volontiers dans les sites proposant des

conditions d’hibernation favorable.

L’indicateur hivernal est donc choisi pour la rigueur de suivi des

sites depuis les années 2000 et prenant en compte l’intégralité des

espèces présentes dans les sites d’hibernation (n= 134 sites

sélectionnés en moyenne par année).

Cet indicateur sera mis en évidence au sein des « Fiches

Indicateur » bientôt mises en ligne par la DREAL Auvergne. Il présentera donc l’évolution des

populations de chiroptères en Auvergne de manière générale. Les indicateurs « espèces » (Grand, Petit

Rhinolophe et Grand/ Petit Murin) seront mis en ligne, en complément, et permettront aux personnes

intéressées de prendre connaissance de l’évolution des effectifs de ces espèces emblématiques de

l’Auvergne.

Espèces

Barbastella barbastellus

Chiroptera specie

Eptesicus serotinus

Myotis alcathoe

Myotis bechsteinii

Myotis daubentonii

Myotis emarginatus

Myotis myotis

Myotis mystacinus

Myotis mystacinus/brandtii

Myotis mystacinus/brandtii/alcathoe

Myotis nattereri

Myotis specie

Nyctalus specie

Pipistrellus specie

Plecotus auritus

plecotus austriacus

Plecotus specie

Rhinolophus euryale

Rhinolophus ferrumequinum

Rhinolophus hipposideros

Tableau 5: Liste des espèces (ou groupe d’espèces) contactées dans les sites sélectionnées pour l'Indicateur toutes espèces en Auvergne de 2000 à 2014

Page 31: Mise en place d’un Indicateur - Ministère de la ...

Résultats : l’indicateur chiroptères en Auvergne

23

L’indicateur hivernal montre une légère diminution des populations de chiroptères sur le

réseau de sites suivis précédemment sélectionnés en Auvergne depuis les années 2000 (Coefficient de

corrélation de Pearson, méthode Spearman = -0.42, Pvalue = 0.11). Les effectifs passent, néanmoins,

de 990 individus en 2000 à 949 en 2014. On notera tout de même les effectifs maximums en 2002 à

plus de 1500 individus.

Figure 15: Evolution de l'effectif pondéré des chiroptères (toutes espèces confondues) dans les colonies d'hibernation sélectionnées dans le cadre de l'indicateur chiroptères en Auvergne

Page 32: Mise en place d’un Indicateur - Ministère de la ...

Discussion

24

Discussion

Grand Rhinolophe

L’augmentation des effectifs de Grand Rhinolophe est maintenant confirmée en Auvergne.

Cette augmentation de 64% depuis 2004 reste difficile à expliquer. Il est possible tout de même de la

mettre en lien avec l’augmentation du nombre de gîtes de mise bas découverts en Auvergne depuis les

années 2000. Bien que pondérée, l’indicateur ne peut que difficilement effacer le biais lié à l’ajout de

nouveaux sites d’importance, surtout si ces derniers sont nombreux (n= 9 nouveaux sites d’importance

depuis les années 2000) et possèdent un effectif important pour l’espèce (n= 160 individus en

moyenne par site).

Il est aussi possible de mettre en avant les premiers résultats liés aux aménagements des sites

d’importance pour la parturition (n=8 sites en aménagement ou en convention). Ces aménagements se

traduisent par un dérangement moindre de la colonie de mise-bas. En effet, il est constaté une

augmentation des effectifs, post travaux, dans la majorité des sites mis en protection suivis.

Lors de la mise en place de l’indicateur, il a été noté la difficulté de contrôle des populations

hibernantes du Grand Rhinolophe. En se basant sur la littérature, cette difficulté de contrôle est

expliquée par la mobilité des animaux. Mais qu’en est-il réellement ? La région naturelle des Couzes

accueille la majorité des gîtes d’hibernation et, donc, l’effectif de Grand Rhinolophe en hibernation de

la région le plus fort (n= 16 sur les 40 sites sélectionnés en Auvergne). Il a été comparé la température

moyenne de Janvier (station météorologique la plus proche de Clermont-Ferrand) avec les effectifs

hibernants observés de l’espèce. Le coefficient de corrélation est de 0.49 (Pearson, méthode

Spearman ; Pvalue = 0.16). Ainsi lorsque la température descend, les effectifs aussi et inversement.

Une hypothèse possible est qu’il existerait un (ou plusieurs) gîte(s) d’hibernation encore inconnu(s)

mais attirant la majorité des individus en cas de période froide car plus attractif(s) dans ce cas de

figure.

Avec les résultats actuels, le lien entre la température et les effectifs n’est pas certifié. Forte de

ce constat, Chauve-Souris Auvergne se donnera les moyens de répondre à ces questions. Les priorités

étant le relevé systématique des températures extérieures et intérieures lors des contrôles des gîtes;

Page 33: Mise en place d’un Indicateur - Ministère de la ...

Discussion

25

ainsi que des prospections ciblées pour la recherche du/des gîte(s) manquant(s) dans les Couzes.

L’effort est aussi mis sur la protection des sites d’hibernation. Ces derniers permettent aux

individus, et particulièrement aux jeunes de l’année (plus fragiles), de passer leur premier hiver dans

les meilleures conditions de tranquillités possibles. Ces mesures de protection traduisent un

accroissement de la population locale de chiroptères.

Petit Rhinolophe

La stabilité des effectifs du Petit Rhinolophe est probablement liée aux efforts donnés à la

préservation et à la sécurisation des sites d’hibernation importants de cette espèce. Espèce clef pour

l’Auvergne, cette stabilité d’effectif met en avant l’important travail de préservation et de

sensibilisation mis en place par les politiques publiques, Chauve-Souris Auvergne et ses partenaires

sur cette espèce. Les modifications des pratiques agro-pastorales ont affaibli les populations de

Rhinolophes partout en France. Aujourd’hui, les efforts de conservation, alliés à la plasticité relative

de l’espèce, se ressentent dans de nombreuses régions par une augmentation des effectifs de Petits

Rhinolophes. A la lecture de l’indicateur, la motivation de préservation est aujourd’hui mise en avant

au sein de l’association pour continuer la préservation des sites (sécurisation, mise en place de

conventions de gestion Chiroptères) et les prospections.

Grand Murin

Les effectifs de Grands Murins hibernants chutent considérablement en Auvergne depuis les

années 2000. Il est à noter l’influence majeure du plus gros site d’hibernation connu à ce jour en

Auvergne que sont les cavités de Volvic représentant en moyenne 80% des effectifs d’hibernants. La

robustesse de cet indicateur reste donc discutable. Néanmoins, dans l’état actuel des connaissances,

aucune autre sélection de site ne permettrait d’obtenir une indication fiable quant à l’évolution des

populations de Grand Murin en Auvergne.

Page 34: Mise en place d’un Indicateur - Ministère de la ...

Discussion

26

Il est difficile d’expliquer cet effondrement des effectifs de population, deux hypothèses

peuvent être émisent :

Les variations rapides des effectifs (n=60 en 2011 et n=339 en 2012), semblent témoigner

d’un réseau de gîtes plus important qu’il n’y parait. C’est la connaissance du réseau de gîte

dans sa totalité qui permettrait la mise en place d’un indicateur fiable.

Un problème lié à l’estivage (dans le secteur de Volvic). Certains sites de parturition encore

inconnus de l’association ont connus de graves perturbations, entrainant une chute rapide des

effectifs.

La disparition palpable de leur principale ressource alimentaire que sont les coléoptères

saproxiliques et xylophages paraît plausible (Vallauri, Andre & Blondel, 2003). Les travaux

de monoculture forestière et de nettoyage systématique des bois morts se ressentent encore

aujourd’hui. Les Grands Murins ne trouvent plus les ressources alimentaires indispensables à

leur survie, ou au renouvellement des populations (difficultés pour les femelles d’élever les

jeunes dans les meilleures conditions).

Aujourd’hui, peu de mesures peuvent être mises en place pour endiguer cette chute

démographique mais l’état des populations de Grands Murins est devenu une priorité en Auvergne.

L’association travaille régulièrement sur les grosses colonies estivales pour une meilleure

compréhension de leur besoin (thermique, hygrométrique et d’habitat).

Focus sur le site de « Morat »

L’Auvergne possède une

des plus grandes colonies de

parturition de Grand Murin d’

Europe. Le site de Morat

présente chaque année une

population importante de

Figure 16:Evolution de l'effectif de Grand Murin (Myotis myotis) dans le tunnel de Morat (Allier) en période estival (mise bas)

Page 35: Mise en place d’un Indicateur - Ministère de la ...

Discussion

27

femelles (record à 6700 femelles et jeunes). Il n’était pas possible de réaliser un indicateur auvergnat

basé essentiellement sur ce site majeur pour des raisons évidentes de manque de vision régionale. Il est

observé une relative stabilité au sein de ce site de mise bas avec une population moyenne à 4700

individus (3000 femelles et 1700 jeunes). L’augmentation observée en 2007 est probablement liée à un

déplacement et un transfert massif d’individus. En effet, au même moment, le suivi des colonies du

sud Cher (situées à 10km) a démontré une chute des effectifs dans les mêmes proportions (Comm.

Pers. Laurent Arthur). Une étude plus approfondie de l’évolution des effectifs dans un rayon d’action

biologique, et non administratif, est à mettre à jour afin d’obtenir une vision globale et temporelle de

l’évolution de cette population.

Avec les connaissances actuelles, il est impossible de dégager avec certitude une tendance sur

le devenir des populations de Grand Murin en Auvergne.

Barbastelle d’Europe

Comme expliqué dans les résultats, les indicateurs prenant en compte les effectifs de

Barbastelle d’Europe ne peuvent pas être analysés. Intimement liés aux conditions climatiques pour le

choix de leurs gîtes, les effectifs réels de Barbastelle d’Europe ne peuvent être mesurés avec la même

méthodologie que les autres espèces. Il a été choisi de tester une nouvelle méthode pour le contrôle des

colonies estivales de femelles. En effet, l’Auvergne compte aujourd’hui une trentaine de colonies

(contrôlées) dont 23 se trouvent chez des particuliers. Ces derniers seront invités à une formation les

initiant au comptage en sortie de gîte des individus qui ont élu domicile chez eux. Cette méthode

simple et peu intrusive ne permettra pas d’obtenir les informations sur le statut des femelles ou sur la

présence d’autres espèces au sein de la colonie (Murin à Moustaches notamment). Mais les effectifs

mesurés et transmis à l’association permettront d’obtenir un effectif au plus proche de la colonie

maximale.

À l’heure où les sciences participatives commencent à toucher de plus en plus de personnes et

à fournir une nouvelle vision de la biodiversité (mise en place de nombreux indicateurs de la

biodiversité « commune »), cette méthode de comptage ne demande qu’à être testée et apportera des

résultats qui, espérons le, seront utiles.

Page 36: Mise en place d’un Indicateur - Ministère de la ...

Discussion

28

« Toutes espèces »

L’indicateur hivernal présentant l’évolution des populations de chiroptères en Auvergne

montre une légère diminution de 4%. Cette diminution peut sembler insignifiante mais concerne toute

de même une « perte » de 556 individus entre les années 2001 et 2014, seulement au sein des 55 gîtes

d’importance sélectionnés pour l’indicateur. Etant l’indicateur figurant sur la page de présentation des

indicateurs chiroptères en Auvergne, il exposera aux décideurs que l’état des populations de

chiroptères dans leur région pourrait être amélioré, notamment par une participation active des acteurs

locaux.

Bien que de méthodologie différente, il est possible de comparer l’évolution des populations de

chiroptères en Auvergne avec celle au niveau national mise en place par le Muséum National

d’Histoire Naturelle. La chute enregistrée par ce dernier, grâce aux résultats du programme Vigie-

Chiro, est de l’ordre de 57%. L’Auvergne reste donc une région préservée en comparaison de

l’effondrement des espèces communes enregistrées au niveau national.

Page 37: Mise en place d’un Indicateur - Ministère de la ...

Conclusion

29

Conclusion

La mise en place de l’indicateur chiroptères de la région Auvergne a permis d’obtenir un

visuel sur l’évolution des populations de chauves-souris présentes dans la région. Les données

recueillies par Chauve-Souris Auvergne permettent la mise en place d’indicateurs fiables, apportant les

premières conclusions quant à l’avenir des chauves-souris dans la région.

Le « grand public » et les décideurs sont maintenant les premiers maillons qui, en prenant

conscience de l’état des populations de chauves-souris, devront apporter toute leur aide pour conserver

la diversité naturelle de l’Auvergne.

Dans une autre optique, la mise en place de l’indicateur a permis de créer de nouveaux

programmes de recherche pour Chauve-Souris Auvergne :

La recherche de la (ou des) colonie(s) manquante(s) dans le Couzes demandera de nombreuses

journées sur le terrain mais permettra une meilleure vision des effectifs de chiroptères

hibernants en Auvergne et notamment de Grand Rhinolophe.

La nouvelle méthode de comptage des colonies estivales de Barbastelle d’Europe mettant en

avant la participation des propriétaires volontaires découle aussi de l’impossibilité de mettre

en place un indicateur pour cette espèce.

Le travail effectué depuis de nombreuses années pour la préservation du Petit Rhinolophe

reste une priorité et les effectifs stables de la population sont une grande réussite.

Le Grand Murin est maintenant sur la sellette, les grandes colonies de reproduction sont

étudiées avec intérêt. Cette année, le parc animalier d’Ardes (63), abritant une colonie de 500

femelles est contentieusement contrôlé tous les jours afin de mettre en avant les déplacements

des femelles au sein du bâtiment, leurs habitudes alimentaires et leurs effectifs. C’est par une

meilleure connaissance des animaux que Chauve-Souris Auvergne compte œuvrer en faveur

des chiroptères.

Page 38: Mise en place d’un Indicateur - Ministère de la ...

Annexes

30

Bibliographie

Arthur L., Lemaire M., 2009. - Les Chauves-souris de France, Belgique, Luxembourg et Suisse. Biotope, Mèze

(Collection Parthénope) ; Muséum national d’Histoire naturelle, Paris, 544p.

Barataud M., 2012 – Ecologie acoustique des chiroptères d’Europe, identification des espèces, étude de leurs

habitats et comportements de chasse. Biotope, Mèzé (Collection Inventaire et Biodiversité) ; Muséum national

d’Histoire naturelle, Paris, 344p

Bouchardy L., Lemarchand C., 2009 - Sites naturels et faune d’Auvergne. Edition Catiche, Nohanent, 257p.

Bruderer B. & Popa-Lisseanu A.G., 2005 – Radar data on wing-beat frequencies and flight speeds of two bat

species. Acta Chiropt 7, 73-82

Dietz C., Von Helversen O. & Nill D., 2007 – L’encyclopédie des chauves-souris d’Europe et d’Afrique du

Nord. Delachaux et Niestlé, Paris, 399p.

Fauvel B., 2002 – Influence de la fermeture des gîtes sur le comportement des chiroptères hibernants. 5ème

colloque Belge sur les Chauves-souris, LOPPEM Belgique (19 octobre 2002)

Fenton M.B., 1972 – The structure of aerial-feeding bat fauna as indicated by ears and wing elements. Can. J.

Zool. 50, 287-296

Girard-Claudon J., 2011 – Bilan de quatre années d’étude de deux espèces de chauves-souris forestières : la

Barbastelle d’Europe et le Murin de Bechstein. Le Bièvre – tome 25, 67-73

Roué S., Godineau F. & Pain D., 2007 – Plan de restauration des chiroptères en France métropolitaine. Société

Française pour l’Etude et la Protection des Mammifères, Ministère de l’Ecologie, du Développement et de

l’Aménagement Durables, 79p et 18ann

Kerbiriou C., Julien J-F., Ancrenaz K., Gadot A.S., Loïs G., Jiguet F. & Julliard R., 2007 – Suivi des espèces

communes après les oiseaux…les chauves-souris ?. Muséum national d’Histoire naturelle, Paris

Linarès M., 2013 - Elaboration d’indicateurs régionaux de biodiversité pour l’auvergne. DREAL Auvergne

Ministère de l’Ecologie, du Développement Durable et de l’Energie, 2012 - Les populations de chauves-souris

en France métropolitaine. (http://www.statistiques.developpement-durable.gouv.fr/indicateurs-

indices/f/1964/1115/populations-chauve-souris-france-metropolitaine-1.html)

Observatoire de la Biodiversité du Nord Pas de Calais, 2012 – Suivi des populations hibernantes de chauves-

souris dans le Nord Pas de Calais. (http://www.observatoire-biodiversite-

npdc.fr/fichiers/documents/fiches/2012/suivi-des-populations-hivernantes-de-chauves-souris-dans-le-

npdc.pdf?PHPSESSID=fdf744ca9420b8fa71fcb1376410e28a)

Vallauri D., Andre J., Blondel J., 2003 – Le bois mort, une lacune des forêts gérées. Revue forestière française –

vol. 55, n°2, pp. 99-112.

Whitaker J.O., 1988 – Food habit analysis of insectivorous bats. Ecological and behavioral methods for the

study od bats, 171-189

Page 39: Mise en place d’un Indicateur - Ministère de la ...

Annexes

31

Sommaire des annexes

Fiche Indicateur « toutes espèces » .................................................................................................. 32

Fiche Indicateur grand Rhinolophe ................................................................................................... 34

Fiche Indicateur petit Rhinolophe ..................................................................................................... 36

Fiche Indicateur grand Murin ............................................................................................................ 38

Page 40: Mise en place d’un Indicateur - Ministère de la ...

Annexes

32

Fiche Indicateur « toutes espèces »

r.

Abondance de Chiroptères hibernantes (toute espèces

contactées confondues) en Auvergne

Evolution de l’effectif pondéré de chauves-souris dans les sites d’importances en

Auvergne

PRESENTATION DE L’INDICATEUR

Etat

Association Chauve-Souris Auvergne

http://www.chauve-souris-auvergne.fr/

2004 - 2013

Annuelle

Oui

Cet indicateur traduit l’évolution des effectifs de chiroptères dans

les sites d’importances en Auvergne

Type d’indicateur

Producteur de données

Période couverte

Fréquence d’actualisation

Comparabilité France

Descriptif de l’indicateur

CONSTRUCTION DE L’INDICATEUR

Les données utilisées pour la production des indicateurs Chiroptères proviennent de la base de

données régionale de l’association Chauve-Souris Auvergne. Elles sont issues des nombreux comptages de

colonies estivales (femelles en période de mise bas) et hivernales (population mixte en hibernation). Cette

base de données comprend des données collectées depuis 1994 par les bénévoles et les salariés de

l’association. Les effectifs annuels réels observés sont pondérés par poids cumulé de chaque site prospecté.

Le calcul effectué pour obtenir la valeur chiffrée de l’indicateur est :

Page 41: Mise en place d’un Indicateur - Ministère de la ...

Annexes

33

ANALYSE DE L’INDICATEUR

Base scientifique de l’indicateur

Cet indicateur s’intéresse à l’évolution des populations de 21 des 28 espèces de chauve-souris

présentent en Auvergne : la Barbastelle d’Europe, la Sérotine Commune, le groupe des Murins (8 espèces),

le groupe des Noctules (2 espèces), le groupe des Pipistrelles (3 espèces), le groupe des Oreillards (2

espèces) et le groupe des Rhinolophes (3 espèces). L’objectif est de quantifier leur évolution dans les sites

majeurs d’Auvergne en période hivernale (colonie mixte en hibernation), en vue de mesurer les impacts des

pratiques agro-pastorales, forestière ou anthropique. Cet indicateur est basé sur une collecte de données

standardisée au niveau national et un échantillonnage sur la totalité du territoire Auvergnat. Ces deux

caractéristiques garantissent respectivement sa robustesse et sa représentativité. Le caractère synthétique

de l’indice en fait un indicateur opérationnel en facilitant son utilisation pour un public non spécialisé.

Les chauves-souris sont les mammifères les plus menacés d’Europe, mais restent de véritable bio-

indicateurs de notre environnement. De part leur régime alimentaire strictement insectivore, les chauves-

souris sont de véritable régulatrices d’insectes nuisibles, en agriculture mais également en milieu urbain.

Elles restent pourtant fortement dépendante des activités humaines.

Domaine d’interprétation et limites

L’indicateur présente une tendance à la baisse des populations au sein des gîtes suivies chaque

année par l’association. Bien que statistiquement non vérifié, les populations de chiroptère sont en léger

déclin en Auvergne. Il est donc important de surveiller et de mettre en œuvre les moyens nécessaires pour

inverser cette tendance nationale.

Fiabilité

Le nombre d’années de suivi des colonies (14 ans) permet d’obtenir une indication fiable sur

l’évolution des effectifs de chiroptères en Auvergne.

Sensibilité

L’indicateur reste extrêmement sensible aux variations d’effectifs, l’actualisation annuelle permet

une vision rapprochée de l’évolution de la population.

Robustesse

L’échantillonnage sélectionné en Auvergne est réalisé sur l’ensemble du territoire. Ce réseau de gîte

suivie s’étend d’années en années, il est donc toujours possible que l’ajout de nouveaux site d’importance

vienne biaiser l’indicateur (la pondération effectuée ne permettant pas l’ajout de grand site). Il sera alors

indiqué dans l’indicateur la ou les années à ne pas prendre en compte.

Complément

Parmi les 28 espèces de chiroptères présentent en Auvergne, il a été sélectionné sur des critères de

représentativité 3 espèces clefs, possédant des traits biologiques distincts afin de mieux prendre en compte

la diversité des Chauves-souris en Auvergne :

-lien vers Grand Rhinolophe

-lien vers Petit Rhinolophe

-lien vers Grand Murin

Page 42: Mise en place d’un Indicateur - Ministère de la ...

Annexes

34

Fiche Indicateur « grand Rhinolophe »

Abondance de Grand Rhinolophe (Rhinolophus

ferrumequinum) hibernant en Auvergne

Evolution de l’effectif pondéré de grand Rhinolophe dans les sites d’importances en

Auvergne

PRESENTATION DE L’INDICATEUR

Etat

Association Chauve-Souris Auvergne

http://www.chauve-souris-auvergne.fr/

2004 - 2013

Annuelle

Oui

Cet indicateur traduit l’évolution des effectifs de Grands

Rhinolophes dans les sites d’importances en Auvergne

Type d’indicateur

Producteur de données

Période couverte

Fréquence d’actualisation

Comparabilité France

Descriptif de l’indicateur

CONSTRUCTION DE L’INDICATEUR

Les données utilisées pour la production des indicateurs Chiroptères proviennent de la base de

données régionale de l’association Chauve-Souris Auvergne. Elles sont issues des nombreux comptages de

colonies estivales (femelles en période de mise bas) et hivernales (population mixte en hibernation). Cette

base de données comprend des données collectées depuis 1994 par les bénévoles et les salariés de

l’association. Les effectifs annuels réels observés sont pondérés par poids cumulé de chaque site prospecté.

Le calcul effectué pour obtenir la valeur chiffrée de l’indicateur est :

Page 43: Mise en place d’un Indicateur - Ministère de la ...

Annexes

35

ANALYSE DE L’INDICATEUR

Base scientifique de l’indicateur

Cet indicateur s’intéresse à l’évolution des populations d’une des 28 espèces de chauve-souris

présentent en Auvergne : le Grand Rhinolophe. L’objectif est de quantifier leur évolution dans les sites

majeurs d’Auvergne en période de mise bas (colonie de femelles), en vue de mesurer les impacts des

pratiques agro-pastorales, forestière ou anthropique. Cet indicateur est basé sur une collecte de données

standardisée au niveau national et un échantillonnage sur la totalité du territoire Auvergnat. Ces deux

caractéristiques garantissent respectivement sa robustesse et sa représentativité. Le caractère synthétique

de l’indice en fait un indicateur opérationnel en facilitant son utilisation pour un public non spécialisé.

Chassant principalement en milieu bocager, et gîtant au plus proche de l’homme, les Rhinolophidae

(dont font partie les Grands Rhinolophes) restent l’une des espèces les plus sensibles aux modifications de

leurs environnements.

Domaine d’interprétation et limites

L’indicateur présente une tendance à la hausse des populations au sein des gîtes suivies chaque

année par l’association (n= 7 sites d’importances en moyenne par année). Bien que de bonne augure, cette

tendance reste à prendre avec prudence. En effet, lors des 4 premières années (2000; 2001; 2002 et 2003),

le comptage des colonies estivales ne peut être réellement pris en compte (manque de régularité dans le

suivi). Le nombre d’années réel de suivi des colonies (10 ans) permet d’obtenir une indication sur l’évolution

des effectifs du Grand Rhinolophe en Auvergne.

Fiabilité

Si une tendance commençant à s’exprimer, elle est encore à consolider. Le peu d’année de recul, ne

permet pas une certitude quand à l’augmentation des effectifs.

Sensibilité

L’indicateur reste extrêmement sensible aux variations d’effectifs, l’actualisation annuelle permet

une vision rapprochée de l’évolution de la population.

Robustesse

L’échantillonnage sélectionné en Auvergne est réalisé sur l’ensemble du territoire. Ce réseau de gîte

suivie s’étend d’année en année, il est donc toujours possible que l’ajout de nouveaux sites d’importance

vienne biaiser l’indicateur (la pondération effectuée ne permettant pas l’ajout de grand site à fort effectif).

Il sera alors indiqué dans l’indicateur la ou les années à ne pas prendre en compte.

Autres indicateurs chiroptères

Parmi les 28 espèces de chiroptères présentent en Auvergne, il a été sélectionné, sur des critères de

représentativité, 3 espèces clefs, possédant des traits biologiques distincts afin de mieux prendre en

compte la diversité des Chauves-souris en Auvergne :

-lien vers le Petit Rhinolophe

-lien vers le Grand Murin

Un indicateur « toutes espèces » présente l’évolution des populations de Chauves-souris de

manière générale en Auvergne.

-lien vers indicateur Toute Espèces.

Page 44: Mise en place d’un Indicateur - Ministère de la ...

Annexes

36

Fiche Indicateur « petit Rhinolophe »

Abondance de Petit Rhinolophe (Rhinolophus

hipposideros) hibernant en Auvergne

Evolution de l’effectif pondéré du Petit Rhinolophe dans les sites d’importances en

Auvergne

PRESENTATION DE L’INDICATEUR

Etat

Association Chauve-Souris Auvergne

http://www.chauve-souris-auvergne.fr/

2004 - 2013

Annuelle

Oui

Cet indicateur traduit l’évolution des effectifs du Petit

Rhinolophes dans les sites d’importances en Auvergne

Type d’indicateur

Producteur de données

Période couverte

Fréquence d’actualisation

Comparabilité France

Descriptif de l’indicateur

CONSTRUCTION DE L’INDICATEUR

Les données utilisées pour la production des indicateurs Chiroptères proviennent de la base de

données régionale de l’association Chauve-Souris Auvergne. Elles sont issues des nombreux comptages de

colonies estivales (femelles en période de mise bas) et hivernales (population mixte en hibernation). Cette

base de données comprend des données collectées depuis 1994 par les bénévoles et les salariés de

l’association. Les effectifs annuels réels observés sont pondérés par poids cumulé de chaque site prospecté.

Le calcul effectué pour obtenir la valeur chiffrée de l’indicateur est :

Page 45: Mise en place d’un Indicateur - Ministère de la ...

Annexes

37

ANALYSE DE L’INDICATEUR

Base scientifique de l’indicateur

Cet indicateur s’intéresse à l’évolution des populations d’une des 28 espèces de chauve-souris

présentent en Auvergne : le Petit Rhinolophe. L’objectif est de quantifier leur évolution dans les sites

majeurs d’Auvergne en période hivernale (colonie mixte en hibernation), en vue de mesurer les impacts des

pratiques agro-pastorales, forestière ou anthropique. Cet indicateur est basé sur une collecte de données

standardisée au niveau national et un échantillonnage sur la totalité du territoire Auvergnat. Ces deux

caractéristiques garantissent respectivement sa robustesse et sa représentativité. Le caractère synthétique

de l’indice en fait un indicateur opérationnel en facilitant son utilisation pour un public non spécialisé.

Chassant principalement en milieu bocager, et gîtant au plus proche de l’homme, les Rhinolophidae

(dont font partie les Petits Rhinolophes) restent l’une des espèces les plus sensibles aux modifications de

leurs environnements.

Domaine d’interprétation et limites

L’indicateur présente une tendance stable des populations au sein des gîtes suivies chaque année

par l’association (n= 32 sites d’importances en moyenne par année). Il est tout de même à noter la légère

diminution de 3% des effectifs. Bien que statistiquement non vérifié, les populations de Petit Rhinolophes

sont à surveiller avec prudence. Il est aussi à noter que la première année de comptage (2000) n’est pas

prise en compte dans l’indicateur, les colonies majeures ayant été découverte l’année suivante.

Fiabilité

Le nombre d’années réel de suivi des colonies (13 ans) permet d’obtenir une indication fiable sur

l’évolution des effectifs du Petit Rhinolophe en Auvergne.

Sensibilité

L’indicateur reste extrêmement sensible aux variations d’effectifs, l’actualisation annuelle permet

une vision rapprochée de l’évolution de la population.

Robustesse

L’échantillonnage sélectionné en Auvergne est réalisé sur l’ensemble du territoire. Ce réseau de gîte

suivie s’étend d’années en années, il est donc toujours possible que l’ajout de nouveaux site d’importance

vienne biaiser l’indicateur (la pondération effectuée ne permettant pas l’ajout de grand site à fort effectif).

Il sera alors indiqué dans l’indicateur la ou les années à ne pas prendre en compte.

Autres indicateurs chiroptères

Parmi les 28 espèces de chiroptères présentent en Auvergne, il a été sélectionné sur des critères de

représentativité 3 espèces clefs, possédant des traits biologiques distincts afin de mieux prendre en compte

la diversité des Chauves-souris en Auvergne :

-lien vers le Grand Rhinolophe

-lien vers le Grand Murin

Un indicateur « toutes espèces » présente l’évolution des populations de Chauves-souris de

manière générale en Auvergne.

-lien vers indicateur Toute Espèces.

Page 46: Mise en place d’un Indicateur - Ministère de la ...

Annexes

38

Fiche Indicateur « grand Murin »

Abondance de Grand Murin (Myotis myotis) en colonies

de mise bas en Auvergne

Evolution de l’effectif pondéré du Grand Murin dans les sites d’importances en

Auvergne

PRESENTATION DE L’INDICATEUR

Etat

Association Chauve-Souris Auvergne

http://www.chauve-souris-auvergne.fr/

2004 - 2013

Annuelle

Oui

Cet indicateur traduit l’évolution des effectifs de grand Murin

dans les sites d’importances en Auvergne

Type d’indicateur

Producteur de données

Période couverte

Fréquence d’actualisation

Comparabilité France

Descriptif de l’indicateur

CONSTRUCTION DE L’INDICATEUR

Les données utilisées pour la production des indicateurs Chiroptères proviennent de la base de

données régionale de l’association Chauve-Souris Auvergne. Elles sont issues des nombreux comptages de

colonies estivales (femelles en période de mise bas) et hivernales (population mixte en hibernation). Cette

base de données comprend des données collectées depuis 1994 par les bénévoles et les salariés de

l’association. Les effectifs annuels réels observés sont pondérés par poids cumulé de chaque site prospecté.

Le calcul effectué pour obtenir la valeur chiffrée de l’indicateur est :

Page 47: Mise en place d’un Indicateur - Ministère de la ...

Annexes

39

ANALYSE DE L’INDICATEUR

Base scientifique de l’indicateur

Cet indicateur s’intéresse à l’évolution des populations d’une des 28 espèces de chauve-souris

présentent en Auvergne : le Grand Murin. L’objectif est de quantifier leur évolution dans les sites majeurs

d’Auvergne en période hivernale (colonie mixte en hibernation), en vue de mesurer les impacts des

pratiques agro-pastorales, forestière ou anthropique. Cet indicateur est basé sur une collecte de données

standardisée au niveau national et un échantillonnage sur la totalité du territoire Auvergnat. Ces deux

caractéristiques garantissent respectivement sa robustesse et sa représentativité. Le caractère synthétique

de l’indice en fait un indicateur opérationnel en facilitant son utilisation pour un public non spécialisé.

Domaine d’interprétation et limites

L’indicateur présente une tendance à la baisse des populations au sein des gîtes suivies chaque

année par l’association (n=17 sites d’importances en moyenne par année). Statistiquement vérifié, les

populations du Grand Murin sont en déclin en Auvergne et deviennent donc une espèce prioritaire. La

chute démographique pourrait s’expliquer par les pratiques de monoculture forestière et de gestion du

bois mort (voir indicateur GB et TGB : Lien vers indicateur GB et TGB)

Fiabilité

Le nombre d’années de suivi des colonies (14 ans) permet d’obtenir une indication fiable sur

l’évolution des effectifs du Grand Murin en Auvergne.

Sensibilité

L’indicateur reste extrêmement sensible aux variations d’effectifs, l’actualisation annuelle permet

une vision rapprochée de l’évolution de la population.

Robustesse

L’échantillonnage sélectionné en Auvergne est réalisé sur l’ensemble du territoire. Il est a noté,

l’influence majeure du plus gros site d’hibernation connu à ce jour en Auvergne que sont les cavités de

Volvic représentant en moyenne 80% des effectifs d’hibernant. La Robustesse de cet indicateur reste donc

discutable. Ce réseau de gîte suivi s’étend d’année en année, il est donc toujours possible que l’ajout de

nouveaux sites d’importance vienne biaiser l’indicateur (la pondération effectuée ne permettant pas l’ajout

de site de grand effectif). Il sera alors indiqué dans l’indicateur la ou les années à ne pas prendre en

compte.

Autres indicateurs chiroptères

Parmi les 28 espèces de chiroptères présentent en Auvergne, il a été sélectionné sur des critères de

représentativité 3 espèces clefs, possédant des traits biologiques distincts afin de mieux prendre en compte

la diversité des Chauves-souris en Auvergne :

-lien vers le Grand Rhinolophe

-lien vers le Petit Rhinolophe

Un indicateur « toutes espèces » présente l’évolution des populations de Chauves-souris de

manière générale en Auvergne.

-lien vers indicateur Toute Espèces.

Page 48: Mise en place d’un Indicateur - Ministère de la ...
Page 49: Mise en place d’un Indicateur - Ministère de la ...

Résumé

La Stratégie National pour la Biodiversité prévoit la mise en place d’un jeu d’indicateurs de

biodiversité national et régional. Ces indicateurs publics ont pour mission de permettre aux

décideurs, mais aussi aux populations, de découvrir la diversité de notre patrimoine naturel et les

contraintes qu’elle subit. Les chauves-souris sont de très bons indicateurs de l’état écologique d’un

milieu naturel. Elles se posent au sommet de leur chaine alimentaire et sont directement impactées

par l’altération des écosystèmes. Il est aujourd’hui certifié que leurs populations ont fortement

décliné au cours du 20ème siècle, plaçant 1/3 des espèces métropolitaine dans un état préoccupant.

Ce rapport, présente le cheminement permettant la mise en place d’indicateur fiable

permettant une meilleure vision de l’état des populations de chauve-souris pour la région Auvergne.

Mots clés : chiroptères ; chauves-souris ; indicateur ; Myotis myotis ; Rhinolophus hipposideros ;

Rhinolophus ferrumequinum

Abstract

The National Biodiversity Strategy provides the creation of a national and regional indicator

set for biodiversity. These public notices are mandated to allow decision makers, and also people, to

discover biodiversity of our natural heritage. Bats are very good indicators of the ecological status of

the environment. They are on the top of their food web and directly impacted by the alteration of

ecosystems. It’s now certified that their populations have declined dramatically during the 20th

century, placing 1/3 of metropolitan species in a worrying state.

This report presents the methodology for created a reliable indicator for a better view of

bats’ populations in Auvergne.

Keywords: Chiroptera ; bats ; indicator ; Myotis myotis ; Rhinolophus hipposideros ; Rhinolophus

ferrumequinum