Metabolismus, taxonomie a identifikace...
Transcript of Metabolismus, taxonomie a identifikace...
-
Metabolismus, taxonomie Metabolismus, taxonomie a identifikace bakteria identifikace bakteri
Karel HoladaKarel [email protected]@LF1.cuni.cz
-
Klov slova Obligtn aeroby Obligtn anaeroby Aerotolerantn b. Fakultativn anaeroby Mikroaerofiln b. Kapnofiln bakterie Siderofory Mesofiln bakterie Termofililn b. Psychrofiln b.
Genotypizace Rstov kivka Glykolza Fermentace Aerobn respirace Anaerobn respirace Krebsv cyklus Oxidativn fosforylace Glyoxyltov cyklus Taxonomie
-
Dlen mikroorganism
Podle zskvn energie - fototrofn (fotosyntza)
- chemotrofn (oxidace substrt)
Podle zdroje uhlku- autotrofn (oxid uhliit)- heterotrofn(organick ltky)- mixotrofn
Medicnsky dleit - chemoheterotrofn
-
Podle vztahu ke kyslku OBLIGTN x FAKULTATIVN Obligtn aeroby bez kyslku nerostou,
nejsou schopn fermentace Obligtn anaeroby kyslk je zabj,
neprovd oxidativn fosforylaci Aerotolerantn anaeroby toleruj O2 Fakultativn anaeroby maj na vbr Microaerofiln b. potebuj snen O2 Kapnofiln b. potebuj vy tenzi CO2
-
Obligtn aeroby Rostou pouze v ptomnosti kyslku
Pseudomonas, Vibrio, Neisseria, Bordetella, Mycobacterium, kvasinky a plsn
Nejsou schopn fermentace Energii zskvaj oxidativn fosforylac
O2 H2OADP ATP
Elektronov transportn etzec, postupn penos pez intermediln meziprodukty.
-
Obligtn anaeroby Rostou pouze v neptomnosti kyslku
Clostridium, Bacteroides, Treponema
Nejsou schopn oxidativn fosforylace Energii zskvaj fermentac Kyslk toxick - chyb jim enzymy:
Superoxid dismutza O2- + 2H+ H2O2Katalza H2O2 H2O + O2Peroxidza H2O2 +NADH H2O + NAD
-
Aerotolerantn anaeroby
Dchaj anaerobn Toleruj ptomnost kyslku (kyslk je
nezabije)Clostridium perfringens
-
Fakultativn anaeroby Jsou schopn adaptace, um jak
oxidativn fosforylaci, tak fermentaci Oxidativn fosforylace efektivnj
(glukza 30-36 ATP) Fermentace mlo efektivn
(glukza 2 ATP)enterobakterie, hemofily, stafylokoky,
streptokoky, atd. (vtina dleitch bakteri)
-
Mikroaerofiln bakterie
Potebuj nzk mnostv kyslku (mn ne ve vzduchu ten je zabije)
Maj oxidativn fosforylaciCampylobacter, Lactobacillus
-
Kapnofiln bakterie
Potebuj k rstu zven mnostv CO2
gonokoky, meningokoky, Helicobacter pylori
-
Optimln teplota rstu
Mesofily 20 40oCvtina patogen (37oC), nkter
psychrotolerantn (p. Listerie) Psychrofily 0 - 20oC Termofily nad 40oC
-
Optimln pH
Vtina dleitch okolo neutrlnho pH Nkter preferuj kysel (Laktobacily)
i zsadit (Vibrio cholerae) pH
Rst kultury okyselen mdia zastavenrstu
-
iviny
Uhlk Dusk Fosfor Sra Ionty kov (Fe2+)
Fe2+ asto limitujc faktor
Siderofory transportn blkoviny umoujc pjem Fe2+
Fe2+Fe2+
-
Rstov kivka Men bakteriln masy zkal
- CFU
-
Generan doba Udv dlku rstovho cyklu
(doba zdvojen) Escherichia coli - cca 20 min. Mycobacterium tuberculosis - cca 12 hod.
Poet bakteri: x = xox2n
P. Kolik E. coli se pomno z 10 bakteri za 24 hodin? x = 10 x 272 = 4,7 x 10 22
-
Glykolza
tpen (katabolizmus) cukr
NAD NADHGlukza Pyruvt
C6 C3ADP ATP
-
Fermentace (kvaen) elem je regenerace NAD, tak aby
mohla bet dal glykolza Velk rozmanitost, specifick produkty
NADH NADPyruvt Alkoholy, mastn kys.
C3 C2 C4
-
Anaerobn respirace Provd anaerobn bakterie GLYKOLZA + FERMENTACE Glukza C6je rozloena na C2-C4
NAD NADH ATPNADH NAD
Mal innost pomal rst anaerobnch bakteri
-
Aerobn respirace Aerobn a fakultativn anaerobn bakt. GLYKOLZA + KREBSV CYKLUS +
OXIDATIVN FOSFORYLACE Glukza C6je rozloena na C1 (CO2)
NAD NADH ATPNAD NADH NADH NAD ATP
-
Krebsv (citrtov) cyklus Kiovatka katabolismu a anabolismu
Citrt C6 Isocitrt
Alfa keto glutart C4
Fumart
Malt
Oxalacett C4
-CO2, NADH
-CO2, NADHPyruvt
Acett C2-CO2 +
-
Oxidativn fosforylace
NADH NAD O2 H2O
ADP ATP
Elektronov transportn etzec, postupn penos elektron z kyslku na vodk za vzniku vody.
Generuje se velk mnostv ATP a dochz k obnov NAD potebnho pro glykolzu.
-
Glyoxyltov cyklus Uniktn pro bakterie, umouje zvit
mnostv metabolickch intermedit Citrt C6 Isocitrt
Alfa keto glutart C4
Fumart
Malt
Oxalacett C4
Pyruvt
-CO2
GlyoxyltC2Acett
C2+
-
Kultivace bakteri Pdy tekut x pevn Zkladn masov bujn Obohacen krevn agar (nron b.) Selektivn Endova pda,
Deoxycholt citrtov agar (potlauj rst)
Diagnostick zchyt produkce specifickho metabolitu
Transportn
-
Klasifikace bakteri Rozmnouj se nepohlavn pnm
dlenm Klasifikace uml pechody neostr Nzvy bakteri ELE (Enterobacterie)
ROD (Escherichia) DRUH (coli)
KMEN (O157:H7) Identifikace bakteri (kultivace, barven,
genotypizace)
-
Zkladn tvary bakteri
-
Klov slova Obligtn aeroby Obligtn anaeroby Aerotolerantn b. Fakultativn anaeroby Mikroaerofiln b. Kapnofiln bakterie Siderofory Mesofiln bakterie Termofililn b. Psychrofiln b.
Genotypizace Rstov kivka Glykolza Fermentace Aerobn respirace Anaerobn respirace Krebsv cyklus Oxidativn fosforylace Glyoxyltov cyklus Taxonomie
Metabolismus, taxonomie a identifikace bakteriKlov slovaDlen mikroorganismPodle vztahu ke kyslkuObligtn aerobyObligtn anaerobyAerotolerantn anaerobyFakultativn anaerobyMikroaerofiln bakterieKapnofiln bakterieOptimln teplota rstuOptimln pHivinyRstov kivkaGeneran dobaGlykolzaFermentace (kvaen)Anaerobn respiraceAerobn respiraceKrebsv (citrtov) cyklusOxidativn fosforylaceGlyoxyltov cyklusKultivace bakteriKlasifikace bakteriZkladn tvary bakteriSlide 26