Licence professionnelle de Génomique Année 2012 – 2013
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Licence professionnelle de Génomique Année 2012 – 2013
Transposons : des gènes anarchiques ?
Olivier SAULNIER
Article publié par Dominique Anxolabéhère et al. Pour la science N°351 – Janvier 2007
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Un transposon ?
Élément transposable (« Jumping gene ») séquence d’ADN « mobile » capable de se déplacer d’une position à l’autre du génome.Présent chez tous les organismes vivants.
≈ 0,5 – 7kb Code pour plusieurs protéines
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Barbara McClintock1902 – 1992 (USA)
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Cold Spring Harbor (1948)
Prix Nobel de médecine (1983)
Þ Éléments mobiles : Ds (dissociation) & Ac (activateur)
Þ Phénomène d’instabilité dans le génome
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Classification
• Classe I => rétrotransposons=> transposition via de l’ARN=> transcriptase-inverse=> mode réplicatif => « copier / coller »
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• Classe II => transposons à ADN=> transposase=> mode non-réplicatif=> « couper / coller »
• Classe ? => MITEs (Miniature Inverted-repeat Transposable Elements)=> « non-autonome »=> pas d’enzymes pour la transposition
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Répartition - 17% du génome d’Arabidopsis thaliana- 45 % du génome de Homo Sapiens- Plus de 50 % du génome de Zea maïs
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Sc: Saccharomyces cerevisiae; Sp: Schizosaccharomyces pombe; Hs: Homo sapiens; Mm: Mus musculus; Os: Oryza sativa; Ce: Caenorhabditis elegans; Dm: Drosophila melanogaster;….
Transposons: The Jumping Genes, Leslie A. Pray et al., Nature, 2008.
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Mode d’action
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transposon
site cible
Inverted repeat
ADN pol Iligase
transposase
flanking sequenceThe Nature of Transposons Chapter 11 pp 300-315
The Nature of Transposons Chapter 11 pp 300-315
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Conséquences
• gènes pertubés => région codante=> promoteur=> séquences régulatrices
=> encombrement spatial
• avantages sélectifs => domaine de fixation à l’ADN (nouveaux facteurs de transcription)=> protéines « hétérologues »
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Chez la drosophile => insertion transposon copia dans le 2ème intron du gène white perturbe la transcription et provoque l’apparition d’yeux orange
Chez la souris => insertion d'un rétrotransposonIAP dans un exon du gène Agouti. Il dérégule l'expression de la protéine ce qui conduit à des souris à poil jaune.
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Conclusion
• provoque de nombreuses mutations (maladies génétiques mais le plus souvent silencieuses..)
• responsable de l’augmentation de la taille des génomes
• outils moléculaire : mutagénèse, vecteur de transfert de gènes
• favorisation d’hétérochromatine par les transposons ?
• héro ? Nombreux transposons aux niveaux des télomères 9
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Merci pour votre attention