Les champignons microscopiques et les infections qu'ils provoquent …
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Les champignons microscopiques et Les champignons microscopiques et les infections qu'ils provoquent …les infections qu'ils provoquent …
Françoise Dromer,Mycologie Moléculaire, CNRS FRE2849
CNR Mycologie et Antifongiques, Institut Pasteur
Les champignonsLes champignons
Organisme eucaryote Règne à part Développement par filaments
ramifiés (thalle) parfois unicellulaire (levure)
Aérobie stricte Reproduction asexuée ou
sexuée
Peu de champignons pathogènes chez les mammifères non immunodéprimés
≈ 100 000 espèces de champignons≈ 150 pathogènes chez l'homme
Diversité des sources d'infectionDiversité des sources d'infection
Source exogène : ENVIRONNEMENT Prévalence élevée de l'infection dans les zones endémiques (AC+++) Incidence faible de la maladie sauf immunodépression ou inoculum massif Transmission dans les piscines, saunas, salles de bain
Source endogène : TUBE DIGESTIF, PEAU Incidence faible sauf rupture des barrières naturelles (KT, prothèses,
chimiothérapie), déséquilibre de l’écologie microbienne (antibiotiques) Immunodépression Infections nosocomiales
Mycosessystémiques
Transplantation
Diversité des facteurs prédisposants aux Diversité des facteurs prédisposants aux infections fongiques systémiquesinfections fongiques systémiques
CGD
VIH
Neutropénie
Brûlures N-nés
RéanimationChirurgie
Corticoïdes
PulmonaireHépatique
CardiaqueRénale
Diversité des infections produitesDiversité des infections produites
Aspergillose invasive
Cryptococcose
Onychomycose
"Pied d'athlète"
infections superficiellesinfections superficiellesinfections profondesinfections profondes
Diversité par le type de champignon responsableDiversité par le type de champignon responsable
FILAMENTEUXFILAMENTEUX
Aspergillus
Rhizopus
Candida
Cryptococcus neoformans
LEVURESLEVURES DIMORPHIQUESDIMORPHIQUES
Histoplasma capsulatum
La malédiction des PharaonsLa malédiction des Pharaons
Les champignons responsables en partie de Les champignons responsables en partie de l'extinction des dinosauresl'extinction des dinosaures ???
Ere tertiaire : Déforestation globale Prolifération des spores
fongiques (fonction de dégradation)
Aérosols massifs
Survie des mammifères (sang chaud)
Disparition des dinosaures (sang froid) ??? Arturo Casadevall: "fungal virulence, vertebrate endothermy, and dinosaur extinction: is there a connection?" in Fungal Genetics and Biology 2004
Quelques chiffresQuelques chiffres
Septicémies à levures : 27 hôpitaux en Ile de France > 1400 épisodes en 3 ans 37% de décès à J30
Cryptococcose : 2-30% des patients SIDA (Afrique – Sud est
asiatique) 100% décès sans traitement 20% avec traitement
Les champignons que l'on connaît …Les champignons que l'on connaît …
1. Les champignons utiles dans l’agro-alimentaire et en médecine Fromages : Penicillium camembertii – Geotrichum candidum –
Saccharomyces cerevisiae Pénicilline – Penicillium notatum Cyclosporine – Trichoderma polysporum
2. Les champignons néfastes par les toxines : aflatoxine ++
http://www.mycolog.com/fungi.htm
Pourquoi les mycoses sont-elles rares malgré la Pourquoi les mycoses sont-elles rares malgré la fréquence des spores fongiques dans l'environnement ?fréquence des spores fongiques dans l'environnement ?
1. Température corporelle > température de croissance optimale de la plupart des champignons Ex : souris / lapin et C. neoformans
2. Traits de virulence rarement combinés : capsule, mélanine, filamentation, thermotolérance : C. neoformans vs Cryptococcus sp.
3. Pression de sélection par les prédateurs de l'environnement permet la survie chez l'hôte "animal" : Ex : champignons de l'environnement et amibes du sol
4. Défenses immunitaires de l'homme probablement adaptées : Mais …
Les apprentis sorciers ?Les apprentis sorciers ?
Apparition / “création” de nouveaux facteurs de risque : Infection par le VIH : CAOP, cryptococcose, histoplasmose,
aspergillose Chirurgie lourde, transplantation d’organes Traitement antibiotiques : déséquilibre des écosystèmes digestifs Les voyages : mycoses d’importation en métropole
Un constat, les hommes sont plus susceptibles aux infections fongiques : Hormones ? Mode de vie ? Susceptibilité génétique
Les apprentis sorciers ?Les apprentis sorciers ?
Mycoses des muqueuses liées à l’utilisation d’antibiotique : Candidose du TD, muguet, vaginite Déséquilibre écosystèmes
Emergence de nouveaux champignons pathogènes résistants à certains antifongiques=> découverte de la résistance aux antifongiques : Pas d'échange génétique Rôle des biofilms Etude des mécanismes de résistance …
La mycologie n'est plus poussiéreuse !La mycologie n'est plus poussiéreuse !Les outils moléculaires sont disponibles
Génomes de x champignons pathogènes séquencés
Nombreuses découvertes importantes : Analyse des marqueurs de virulence, nouveaux modèles :
drosophiles, nématodes, amibes
Voies de biosynthèse => antifongiques nouveaux Identification des antigènes de surface = > tests diagnostiques Identification de nombreux mécanismes immunitaires Identification de protéines inconnues chez les eucaryotes
supérieurs
5 min 24 hrs
48 hrs6 hrs
Variabilité antigénique au cours de l'infectionVariabilité antigénique au cours de l'infection
L'enjeu principal : une amélioration du L'enjeu principal : une amélioration du pronostic des mycoses invasives pronostic des mycoses invasives
Des tests de diagnostic plus performants Des antifongiques plus efficaces La mise au point de vaccins, L'utilisation de thérapies immunomodulatrices ?
=> Un intérêt plus grand de la communauté scientifique, médicale et des pouvoirs publics