Le monde Microbien l Bactéries (taille 1-5 µm) monocellulaire –Procaryotes (noyau simplifié,...
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Le monde MLe monde Microbienicrobien Bactéries (taille 1-5 µm) monocellulaire
– Procaryotes (noyau simplifié, paroi)– Multiplication rapide sur milieux (109 <24h)
Virus (taille 10 nm)– Un seul acide nucleïque (ADN ou ARN)– Multiplication dans cellules obligatoire
Prions ou Agent Non Conventionnel– Proteine, accumulation intracellulaire
Parasites-Champignons eucaryotes– monocellulaire Protozoaires (Paludisme..)– ou pluricellulaires: helminthes - Arthropodes
Existence de micro-organismes responsables d'infection
Epidémies et moyens de lutte– Tableaux cliniques identiques– Transmission entre individus
(Peste 25 millions de morts 1347 en Europe) Infection expérimentale
– Agent infectieux responsable– Reproductibilité (Postulats de Koch 1884)
Microscope optique– microscope 17ème s, coloration de Gram fin 19 ème
s Microscopie électronique
– Mise en évidence Virus (agents ultrafiltrables à
travers filtres bactériens 0,25 μm)
Prions ou Agents Transmissibles Non
Conventionnels
Accumulation dans le système nerveux – encéphalopathie spongiformeGrande résistance aux protocoles de base de désinfection
Virus à symétrie hélicoïdale et cubique
Bactéries
Microscopie électronique
Microscopie optique
Coloration de Gram
Champignons
Forme filamenteuse Forme levure
Protozoaires
Ectoparasites
Taille des agents infectieuxTaille des agents infectieux
EpidémiesEpidémies
20ème siècle
TuberculosePaludismeAmibiaseSchistosomiaseFilarioseRougeoleHIV SIDAPoliomyélite
Amérique du sud, Afrique et Asie
19ème siècle
VarioleCholéraDiphtérieLèpreTuberculoseTyphoide
Europe
Culture des Bactéries
“Génération spontanée?” (Pasteur 1861)
Chirurgie antiseptique (Lister 1867)
Lavage mains et réduction fièvre puerpérale (Ignace Semmelweis 1847)
Agents ultra-filtrables-Microscopie électronique
La majorité des micro-organismes ne sont pas pathogènes: notion de niche
écologique Eaux douces,
mer, résiduaires sols propres et
contaminés Végétaux Animaux
Homme: les flores Cutanée tube digestif autres muqueuses
Notion de PathogénicitéNotion de Pathogénicité germes saprophytes
– Danger 0 Bénéfice Hôte (symbiose)
germes commensaux– Danger +/- Bénéfice Hôte +/-
(mutualisme)
germes pathogènes– Danger + Bénéfice parasite (parasitisme)
Flore « normale » ou flore de barrière à préserverFlore « normale » ou flore de barrière à préserverLimiter au maximum le danger de la flore commensaleLimiter au maximum le danger de la flore commensalePrévenir le contact ou la susceptibilité aux germes pathogènesPrévenir le contact ou la susceptibilité aux germes pathogènes
Comment les micro-organismes peuvent ils être responsable
d'infection?
Facteurs de virulence– Adhérence (infection
urinaire)– Toxines (Choléra)– autres facteurs limitant les
défenses de l’organisme ou favorisant la multiplication des germes.
Bactéries
ChromosomePlasmide
Flagelles
Peptidoglycan Membrane externe(endotoxine)
Adhésines
La microscopie électronique montre la structure type
prokaryote
Prokaryotes et Eucaryotes
ont une organisation
cellulaire différentes
Présence d ’appendices externes caractéristiques: pili (fimbriae) et
flagelles
La microscopie électronique révèle des différences
anatomiques importantes entre Bactéries Gram + et Gram -
Classification des bactéries
Morphologie et coloration de Gram– Coques, bacilles, spirilles…– Gram+, Gram-, autres….
Caractéres culturaux– Aérobie, anaérobie, microaérophiles– Exigences nutritionnelles– Profil biochimique
Génétique Pathogénicité
Classification
Morphologie et colonisation
Différentiation des Différentiation des coloniescolonies
Pourquoi tous les individus ne font pas une infection?
Immunité naturelle Immunité acquise les moyens de défense de l'organisme
Mécaniques humoraux immunité cellulaire non spécifique immunité cellulaire spécifique Autres facteurs: fièvre-cytokines
Nutrition
Immunité cellulaire non spécifique
Bactéries intra-cellulairesBactéries intra-cellulaires
Ad
hére
nce
Capsule et phagocytose: Streptococcus pneumoniae
Epidémiologie des infections
Prévention– Hygiène-vaccination-Prévention
transmission
Traitement Nouveaux agents pathogènes
– Adaptation- résistance aux antibiotiques = anciens agents
– nouveaux agents