La Diagnosi Colture appropriate devono essere sempre ottenute prima di iniziare la terapia...
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La Diagnosi
Colture appropriate devono essere sempre ottenute prima di iniziare la terapia antibiotica.Per ottimizzare l'identificazione degli organismi che causano l'infezione, devono essere prelevate almeno due emocolture di cui una per via percutanea ed una prelevata attraverso ciascun catetere vascolare. E’ raccomandato il prelievo prima della terapia antibiotica e secondo quanto richiesto dalla clinica, di colture da altri siti come urina, fluido cerebrospinale, ferite, secrezioni delle vie respiratorie o altri fluidi corporei.La modifica della terapia, da empirica a mirata, è raccomandata appena si ottiene l’isolamento del microrganismo dal sangue o dalla sorgente d’infezione (urina, mat.respiratorio, liquor, ferita, mat.addominale... )
Percorso diagnostico sepsi attuale
Paziente “settico”
Esecuzione dei prelievi
Invio al laboratorio
Incubazione
Emocoltura positiva
Crescita su piastra
Identificazione ed antibiogramma
Risultato diagnostico
Colorazione di Gram
Mediamente 72-96 ore
Mediamente 48 h prima del risultato diagnostico
0
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20
30
40
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100
0 8 16 24 32 40 48 56 64 72Incubation time (hrs)
% P
osi
tive
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s
BACTEC 9240
BacT/Alert
Urinocoltura e/o altri materiali positivi
Oggetto e scopo...................................................................................................................... 2 Indicatori applicabili: ................................................................................................................ 2 Responsabilità:........................................................................................................................ 2 Premessa................................................................................................................................ 2 Suggerimenti per una corretta esecuzione dell’esame ............................................................ 3 Modalità di esecuzione dell’emocoltura ................................................................................... 4 Preparazione dell’operatore e del paziente.............................................................................. 5 Tipologia di flaconi da utilizzare............................................................................................... 7 Volumi raccomandati ............................................................................................................... 7 Invio e Conservazione ............................................................................................................. 8 Protocolli di prelievo ................................................................................................................ 8 Protocollo. 1 = Pazienti Neutropenici /Oncologici ....................................................................8 Protocollo .2 = Unità Intensiva .................................................................................................8 Protocollo 3 = Pazienti Oncologici ........................................................................................... 8 Protocollo 4 = Malattie Infettive ............................................................................................... 8 Protocollo 5 = Chirurgia Trapianti ............................................................................................ 8 Protocollo 6 = Nefrologia ........................................................................................................ 8 Protocollo 7 = Nido-Neonatologia. ........................................................................................... 8 Protocollo 8 =Tab riepilogo......................................................................................................8 Principali modalità diverse dalla routine................................................................................... 8 Trasmissione dei risultati .........................................................................................................8 Interpretazione dei risultati (criteri per escludere i contaminanti) ............................................. 8
Procedura per la gestione delle emocolture dal paziente al laboratorio
Lab di Microbiologia LG01-M Rev.07
Appropriatezza
Emocolture dal 2005 al 2010: Emocolture dal 2005 al 2010: Indicatori Indicatori
N° SET % Set POS N° Pz con emo POS
% contaminanti *
2005 9117 14,6% 1003 N.R
2006 8691 13,6% 927 N.R
2007 9674 13,3% 899 N.R
2008 9162 14,4% 971 1,2%
2009 8450 14,9% 936 0,9%
2010 10 mesi
7723 15,3% 872 1,6%
* < 3% : standard di accettabilità
Osservatorio microbiologico
• prevenzione e controllo delle infezioni, in collaborazione con la Direzione Sanitaria e nell’ambito del Comitato Infezioni Ospedaliere mediante :
• realizzazione di un osservatorio microbiologico • monitoraggio della diffusione delle resistenze batteriche• segnalazione informatica dell’isolamento di microrganismi ad alta
pericolosità (alert) ai Reparti e al Gruppo Operativo del Servizio di Prevenzione e Sorveglianza Infezioni
• tipizzazione molecolare dei batteri responsabili di infezione• elaborazione delle informazioni archiviate (risultati delle indagini
microbiologiche) per monitorare nel tempo la circolazione dei patogeni e dei pattern di antibiotico resistenza
• ricerca dei portatori o colonizzati di microrganismi di rilevanza epidemiologica
• mantenimento di ceppo-teca per ricostruire "a posteriori" eventi epidemici e tipizzazione ceppi
12,3%
45,7%7,5%
20,2%
3,4%
3,2%2,8%2,6%2,1%TOT 4605
Trend % MRSA emocolture Pz/annoTrend % MRSA emocolture Pz/anno
Numero di pazienti con infezioni invasive (sangue e liquor) di Escherichia coli e frequenza di resistenza a fluorchinoloni e cefalosporine di III gen
Regione Emilia-Romagna 2005-2008
29,731,8
34,4
38,9
11,714,6 15,4
21,7
1.5561.457
1.158
1.882
0
10
20
30
40
50
60
2005 2006 2007 2008
Prev
alen
za R
+I
(%)
0
500
1000
1500
2000
N. d
i paz
ient
i
Resistenza a fluorochinoloni Resistenza a cefalosporine III gen. N. pazienti con infez. invasive
RER 2009ESAMI RESISTENTI INTERMEDI
N. N. % N. %
Emocolture 416 129 31,01 0 0,00
Klebsiella pneumoniae: numero di pazienti con infezioni invasive e frequenza di resistenza a fluorochinoloni e cefalosporine di III gen.
(Regione Emilia-Romagna 2005-2008)
16,4 16,0
27,729,9
26,6 25,2
30,8 31,3
424
214
294315
0
10
20
30
40
50
60
70
80
2005 2006 2007 2008
Anno
Pre
vale
nza
R+I
(%)
0
50
100
150
200
250
300
350
400
450
N. d
i paz
ient
i
Resistenza a fluorochinoloni Resistenza a cefalosporine III gen. N. pazienti con infez. invasive
RER 2009 ESAMI RESISTENTI INTERMEDI
N. N. % N. %
Emocolture 416 65 15,63 10 2,40
P. aeruginosa, Acinetobacter, altri GNNF, Enterobacteriaceae P. aeruginosa, Acinetobacter, altri GNNF, Enterobacteriaceae
VIM-1 a 18IMP-1 a 23
METALLO-BETA-LATTAMASI: UN PROBLEMA GLOBALE
Acinetobacter SIM-1
P. aeruginosaP. aeruginosa
SPM-1GIM-1
P. aeruginosaAIM-1
KHM-1 Citrobacter freundii
Emocolture: diagramma di flusso: punti di miglioramento
Paziente “settico”
Esecuzione dei prelievi
Invio al laboratorio
Incubazione
Emocoltura positiva
Crescita su piastra
Identificazione ed antibiogramma
Risultato diagnostico
Colorazione di Gram
Mediamente 24-48 ore
Mediamente 48 h prima del risultato diagnostico
0
10
20
30
40
50
60
70
80
90
100
0 8 16 24 32 40 48 56 64 72Incubation time (hrs)
% P
osi
tive
sam
ple
s
BACTEC 9240
BacT/Alert
Urinocoltura e/o altri materiali positivi
1 pre-analitica modalità prelievo:riduzione contaminanti
4 Postazione incubatore/lettore satellite alle urgenze del Lab Chimico-Clinico: 24
H
2 Maldi-Toff: Identificazione rapida in 15 min di batteri /miceti da emocoltura
positiva
5 Microscopia PNA-FISH
6 Ricerca DNA da sangue : casi concordati con il Clinico
3 Up-date al software per l’epidemiologia
7 Identificazione rapida delle beta-lattamasi da colonia con microarray
Innovazione nel Work-flow identificazione –
antibiogramma-epidemiologia
VITEK MSVITEK MS
Laboratory Laboratory Information Information
SystemSystem
VIGIguardVIGIguard
Risultati ID Risultati ID
Risultati ASTRisultati AST
OppureOppure
VILINKVILINK
(Assistenza (Assistenza
da remoto)da remoto)
SmartSmartCarrierCarrierSystemSystem
Lettura barcode:Lettura barcode:• CampioniCampioni• Card AST VTK2Card AST VTK2• Piastrina VTK MSPiastrina VTK MS
ID/AST Prep stationID/AST Prep station
VTK MS VTK MS PCPC
VITEK 2 VITEK 2 (V2S v 5.01)