KBC/BPOL - molbio.upol.cz. Struktura proteinu.pdf · Stérickáomezení proúhly phi apsi ......
Transcript of KBC/BPOL - molbio.upol.cz. Struktura proteinu.pdf · Stérickáomezení proúhly phi apsi ......
![Page 1: KBC/BPOL - molbio.upol.cz. Struktura proteinu.pdf · Stérickáomezení proúhly phi apsi ... Každý takovýto modul je typickou strukturní jednotkou, která může být nalezena](https://reader033.fdocument.pub/reader033/viewer/2022051718/5a7106e47f8b9abb538c76e1/html5/thumbnails/1.jpg)
Struktura a funkce biomakromolekul
KBC/BPOL
1. Typy proteinových struktur
Ivo Frébort
![Page 2: KBC/BPOL - molbio.upol.cz. Struktura proteinu.pdf · Stérickáomezení proúhly phi apsi ... Každý takovýto modul je typickou strukturní jednotkou, která může být nalezena](https://reader033.fdocument.pub/reader033/viewer/2022051718/5a7106e47f8b9abb538c76e1/html5/thumbnails/2.jpg)
Architektura proteinů
Tvar - globulání nebo fibrilární
Úrovně proteinové struktury
Primární - sekvenceSekundární - lokální struktury - H-vazbyTerciární - celková 3-D strukturaKvarterní – podjednotky
![Page 3: KBC/BPOL - molbio.upol.cz. Struktura proteinu.pdf · Stérickáomezení proúhly phi apsi ... Každý takovýto modul je typickou strukturní jednotkou, která může být nalezena](https://reader033.fdocument.pub/reader033/viewer/2022051718/5a7106e47f8b9abb538c76e1/html5/thumbnails/3.jpg)
Interakce vytvářející jednotlivé úrovně struktur
Primární struktura – kovalentní vazby
Sekundární, terciární a kvarterní strukturyvytvořené slabými interakcemi:
H-vazby, iontové interakce, van der Waalsovy síly, hydrofobní interakce
![Page 4: KBC/BPOL - molbio.upol.cz. Struktura proteinu.pdf · Stérickáomezení proúhly phi apsi ... Každý takovýto modul je typickou strukturní jednotkou, která může být nalezena](https://reader033.fdocument.pub/reader033/viewer/2022051718/5a7106e47f8b9abb538c76e1/html5/thumbnails/4.jpg)
Interakce vytvářející jednotlivé úrovně struktur
![Page 5: KBC/BPOL - molbio.upol.cz. Struktura proteinu.pdf · Stérickáomezení proúhly phi apsi ... Každý takovýto modul je typickou strukturní jednotkou, která může být nalezena](https://reader033.fdocument.pub/reader033/viewer/2022051718/5a7106e47f8b9abb538c76e1/html5/thumbnails/5.jpg)
Interakce postranních řetězců aminokyselin
![Page 6: KBC/BPOL - molbio.upol.cz. Struktura proteinu.pdf · Stérickáomezení proúhly phi apsi ... Každý takovýto modul je typickou strukturní jednotkou, která může být nalezena](https://reader033.fdocument.pub/reader033/viewer/2022051718/5a7106e47f8b9abb538c76e1/html5/thumbnails/6.jpg)
Další chemické skupiny v proteinech
Pokud existuje skupina jiná než aminokyselina důležitá pro funkci proteinu, nazývá seprosthetická skupina
Glykoproteiny, lipoproteiny, nukleoproteiny, fosfoproteiny, metaloproteiny, hemoproteiny, flavoproteiny.
![Page 7: KBC/BPOL - molbio.upol.cz. Struktura proteinu.pdf · Stérickáomezení proúhly phi apsi ... Každý takovýto modul je typickou strukturní jednotkou, která může být nalezena](https://reader033.fdocument.pub/reader033/viewer/2022051718/5a7106e47f8b9abb538c76e1/html5/thumbnails/7.jpg)
Geometrie peptidové vazby
![Page 8: KBC/BPOL - molbio.upol.cz. Struktura proteinu.pdf · Stérickáomezení proúhly phi apsi ... Každý takovýto modul je typickou strukturní jednotkou, která může být nalezena](https://reader033.fdocument.pub/reader033/viewer/2022051718/5a7106e47f8b9abb538c76e1/html5/thumbnails/8.jpg)
Roviny peptidové vazby
![Page 9: KBC/BPOL - molbio.upol.cz. Struktura proteinu.pdf · Stérickáomezení proúhly phi apsi ... Každý takovýto modul je typickou strukturní jednotkou, která může být nalezena](https://reader033.fdocument.pub/reader033/viewer/2022051718/5a7106e47f8b9abb538c76e1/html5/thumbnails/9.jpg)
Stérická omezení pro úhly phi a psi
Překryv orbitalů neumožňuje některé kombinace úhlů phi = 180, psi = 0 phi = 0, psi = 0 phi = 0, psi = 180
G. N. Ramachandran demonstroval význam grafického znázornění těchto úhlů pro známé prosteinové struktury
Stéricky výhodné kombinace jsou základem preferovaných sekundárních struktur
![Page 10: KBC/BPOL - molbio.upol.cz. Struktura proteinu.pdf · Stérickáomezení proúhly phi apsi ... Každý takovýto modul je typickou strukturní jednotkou, která může být nalezena](https://reader033.fdocument.pub/reader033/viewer/2022051718/5a7106e47f8b9abb538c76e1/html5/thumbnails/10.jpg)
Úhly phi a psi
![Page 11: KBC/BPOL - molbio.upol.cz. Struktura proteinu.pdf · Stérickáomezení proúhly phi apsi ... Každý takovýto modul je typickou strukturní jednotkou, která může být nalezena](https://reader033.fdocument.pub/reader033/viewer/2022051718/5a7106e47f8b9abb538c76e1/html5/thumbnails/11.jpg)
Ramachandranův diagram
![Page 12: KBC/BPOL - molbio.upol.cz. Struktura proteinu.pdf · Stérickáomezení proúhly phi apsi ... Každý takovýto modul je typickou strukturní jednotkou, která může být nalezena](https://reader033.fdocument.pub/reader033/viewer/2022051718/5a7106e47f8b9abb538c76e1/html5/thumbnails/12.jpg)
Třídy sekundárních struktur
a-helix Další helixy b-skládaný list b-otočka (b-ohyb, těsná otočka) b-výduť
Všechny tyto struktury jsou stabilizovány vodíkovými vazbami
![Page 13: KBC/BPOL - molbio.upol.cz. Struktura proteinu.pdf · Stérickáomezení proúhly phi apsi ... Každý takovýto modul je typickou strukturní jednotkou, která může být nalezena](https://reader033.fdocument.pub/reader033/viewer/2022051718/5a7106e47f8b9abb538c76e1/html5/thumbnails/13.jpg)
a-Helix
Strukturu předpověděli Linus Pauling a Robert Corey in 1951
Identifikována v keratinu (Max Perutz) Všudypřítomná složka proteinů Stabilizována H-vazbami Residuí na otočku: 3.6 Stoupání na jedno residuum: 1.5 Å Stoupání na otočku: 3.6 x 1.5 Å = 5.4 Å Smyčka kostry, která je uzavřena vodíkovou
vazbou v alfa helix obsahuje 13 atomů phi = -60 stupňů, psi = -45 stupňů
![Page 14: KBC/BPOL - molbio.upol.cz. Struktura proteinu.pdf · Stérickáomezení proúhly phi apsi ... Každý takovýto modul je typickou strukturní jednotkou, která může být nalezena](https://reader033.fdocument.pub/reader033/viewer/2022051718/5a7106e47f8b9abb538c76e1/html5/thumbnails/14.jpg)
a-Helix
![Page 15: KBC/BPOL - molbio.upol.cz. Struktura proteinu.pdf · Stérickáomezení proúhly phi apsi ... Každý takovýto modul je typickou strukturní jednotkou, která může být nalezena](https://reader033.fdocument.pub/reader033/viewer/2022051718/5a7106e47f8b9abb538c76e1/html5/thumbnails/15.jpg)
b-skládaný list
Složený z b-vláken
Také navrhli Pauling a Corey, 1951 Vlákna mohou být paralelní nebo
antiparalelní Stoupání (délka) na residuum:
3.47 Å pro antiparalelní řetězec 3.25 Å pro paralelní řetězec
![Page 16: KBC/BPOL - molbio.upol.cz. Struktura proteinu.pdf · Stérickáomezení proúhly phi apsi ... Každý takovýto modul je typickou strukturní jednotkou, která může být nalezena](https://reader033.fdocument.pub/reader033/viewer/2022051718/5a7106e47f8b9abb538c76e1/html5/thumbnails/16.jpg)
b-skládaný list
![Page 17: KBC/BPOL - molbio.upol.cz. Struktura proteinu.pdf · Stérickáomezení proúhly phi apsi ... Každý takovýto modul je typickou strukturní jednotkou, která může být nalezena](https://reader033.fdocument.pub/reader033/viewer/2022051718/5a7106e47f8b9abb538c76e1/html5/thumbnails/17.jpg)
Antiparalelní a paralelní b-skládaný list
![Page 18: KBC/BPOL - molbio.upol.cz. Struktura proteinu.pdf · Stérickáomezení proúhly phi apsi ... Každý takovýto modul je typickou strukturní jednotkou, která může být nalezena](https://reader033.fdocument.pub/reader033/viewer/2022051718/5a7106e47f8b9abb538c76e1/html5/thumbnails/18.jpg)
Umožňuje otočení směru peptidového řetězce Kyslík karbonylové skupiny jednoho residua je
vázán H-vazbou na amidový proton o 3 residua dále
V těchto strukturách převažují prolin a glycin
b-otočka
![Page 19: KBC/BPOL - molbio.upol.cz. Struktura proteinu.pdf · Stérickáomezení proúhly phi apsi ... Každý takovýto modul je typickou strukturní jednotkou, která může být nalezena](https://reader033.fdocument.pub/reader033/viewer/2022051718/5a7106e47f8b9abb538c76e1/html5/thumbnails/19.jpg)
b-výduť (bulge)
![Page 20: KBC/BPOL - molbio.upol.cz. Struktura proteinu.pdf · Stérickáomezení proúhly phi apsi ... Každý takovýto modul je typickou strukturní jednotkou, která může být nalezena](https://reader033.fdocument.pub/reader033/viewer/2022051718/5a7106e47f8b9abb538c76e1/html5/thumbnails/20.jpg)
Způsoby zobrazení proteinových struktur
![Page 21: KBC/BPOL - molbio.upol.cz. Struktura proteinu.pdf · Stérickáomezení proúhly phi apsi ... Každý takovýto modul je typickou strukturní jednotkou, která může být nalezena](https://reader033.fdocument.pub/reader033/viewer/2022051718/5a7106e47f8b9abb538c76e1/html5/thumbnails/21.jpg)
Fibrilární proteiny
Většina polypetidového řetězce je organizována paralelně k jediné ose
Fibrilární proteiny jsou často mechanicky pevné Fibrilární proteiny jsou často nerozpustné V přírodě zastávají strukturní funkce
a- keratin - součást vlasů, nehtů, drápů, rohů a zobáku Kolagen - klouby, kosti, zuby b- keratin – hedvábí
![Page 22: KBC/BPOL - molbio.upol.cz. Struktura proteinu.pdf · Stérickáomezení proúhly phi apsi ... Každý takovýto modul je typickou strukturní jednotkou, která může být nalezena](https://reader033.fdocument.pub/reader033/viewer/2022051718/5a7106e47f8b9abb538c76e1/html5/thumbnails/22.jpg)
a- keratin
Sekvence 311-314 amk a-helix segmentů Motiv 7 opakujících se residuí (a-b-c-d-e-f-
g)n, kde residua a a d jsou hydrofobní Umožňuje to spojení řetězců.
![Page 23: KBC/BPOL - molbio.upol.cz. Struktura proteinu.pdf · Stérickáomezení proúhly phi apsi ... Každý takovýto modul je typickou strukturní jednotkou, která může být nalezena](https://reader033.fdocument.pub/reader033/viewer/2022051718/5a7106e47f8b9abb538c76e1/html5/thumbnails/23.jpg)
Kolagen – trojitý helix
Strukturní jednotka je tropokolagen: Tři polypeptidové řetězce (každý 1000 residuí) MW = 285.000, délka 300 nm, průměr 1.4 nm
Každá třetí aminokyselina je Gly, vysoký obsah Pro Obsahuje neobvyklé aminokyseliny: 3 a 4-hydroxyprolin, 5-hydroxylysin
Prolin a jeho hydroxyderiváty tvoří 30% aminokyselin Neobvyklé složení aminokyselin je nevhodné pro tvorbu alfa helixů a
beta skládaných listů, je však ideální pro trojšroubovici kolagenu: Tři svinutá helikální vlákna, širší než a- helix
stoupání 2.9 Å na residuu 3.3 residuí na otočku dlouhé úseky Gly-Pro-Pro/HyP
![Page 24: KBC/BPOL - molbio.upol.cz. Struktura proteinu.pdf · Stérickáomezení proúhly phi apsi ... Každý takovýto modul je typickou strukturní jednotkou, která může být nalezena](https://reader033.fdocument.pub/reader033/viewer/2022051718/5a7106e47f8b9abb538c76e1/html5/thumbnails/24.jpg)
Struktura kolagenu
![Page 25: KBC/BPOL - molbio.upol.cz. Struktura proteinu.pdf · Stérickáomezení proúhly phi apsi ... Každý takovýto modul je typickou strukturní jednotkou, která může být nalezena](https://reader033.fdocument.pub/reader033/viewer/2022051718/5a7106e47f8b9abb538c76e1/html5/thumbnails/25.jpg)
Strukturní základy trojšroubovice kolagenu Každé třetí residuum je směrováno do středu trojšroubovice –
pouze Gly se tam vejde Meziřetězcové H-vazby hydroxyprolinů stabilizují helix Vlákna jsou dále zpevněna interakcemi v rámci řetězce mezi
lysiny a hydroxy-pyridiniovými vazbami mezi řetězci
![Page 26: KBC/BPOL - molbio.upol.cz. Struktura proteinu.pdf · Stérickáomezení proúhly phi apsi ... Každý takovýto modul je typickou strukturní jednotkou, která může být nalezena](https://reader033.fdocument.pub/reader033/viewer/2022051718/5a7106e47f8b9abb538c76e1/html5/thumbnails/26.jpg)
Kolagenová vlákna Opakující se strukturní motiv 68 nm dlouhý Tropokolagenové jednotky jsou 300 nm dlouhé, existuje 40 nm
mezera mezi sousedícími tropokolageny Tyto mezery obsahují sacharidy a jsou považována za
zárodečná místa pro tvorbu kostí
![Page 27: KBC/BPOL - molbio.upol.cz. Struktura proteinu.pdf · Stérickáomezení proúhly phi apsi ... Každý takovýto modul je typickou strukturní jednotkou, která může být nalezena](https://reader033.fdocument.pub/reader033/viewer/2022051718/5a7106e47f8b9abb538c76e1/html5/thumbnails/27.jpg)
b-keratin Střídající se sekvence: Gly-Ala/Ser-Gly-Ala/Ser.... Residua b-skládaného listu jsou střídavě umístěna nad
a pod rovinou, dochází k umístění všech Gly na jednu a Ala a Ser na druhou stranu!
To umožnuje Gly na jedné straně spojení s Gly na straně druhé (stejné platí pro Ala/Ser)
![Page 28: KBC/BPOL - molbio.upol.cz. Struktura proteinu.pdf · Stérickáomezení proúhly phi apsi ... Každý takovýto modul je typickou strukturní jednotkou, která může být nalezena](https://reader033.fdocument.pub/reader033/viewer/2022051718/5a7106e47f8b9abb538c76e1/html5/thumbnails/28.jpg)
b-keratin
![Page 29: KBC/BPOL - molbio.upol.cz. Struktura proteinu.pdf · Stérickáomezení proúhly phi apsi ... Každý takovýto modul je typickou strukturní jednotkou, která může být nalezena](https://reader033.fdocument.pub/reader033/viewer/2022051718/5a7106e47f8b9abb538c76e1/html5/thumbnails/29.jpg)
Globulární proteiny Většina polárních residuí směřuje vně proteinu a je v
kontaktu s rozpouštědlem Většina hydrofobních residuí se nachází uvnitř proteinu,
kde dochází k jejím vzájemným interakcím Poměr součtu objemů všech residuí k celkovému objemu je
0.72 až 0.77-- existují prázdné prostory - dutiny
![Page 30: KBC/BPOL - molbio.upol.cz. Struktura proteinu.pdf · Stérickáomezení proúhly phi apsi ... Každý takovýto modul je typickou strukturní jednotkou, která může být nalezena](https://reader033.fdocument.pub/reader033/viewer/2022051718/5a7106e47f8b9abb538c76e1/html5/thumbnails/30.jpg)
Obojetná helix veflavodoxinu
Nepolární helix vcitrátsynthase
Polární helix vcalmodulinu
Polarita a-helixu
![Page 31: KBC/BPOL - molbio.upol.cz. Struktura proteinu.pdf · Stérickáomezení proúhly phi apsi ... Každý takovýto modul je typickou strukturní jednotkou, která může být nalezena](https://reader033.fdocument.pub/reader033/viewer/2022051718/5a7106e47f8b9abb538c76e1/html5/thumbnails/31.jpg)
Globulární proteiny- strukturní principy
Složení proteinu není náhodné Strukturní elementy a domény se mohou do určité
míry pohybovat Některé segmenty jsou velmi flexibilní a
neuspořádané Pro pochopení funkce proteinu je důležité znát
způsoby a rychlosti změn
Typy globulárních proteinů Antiparalelní alfa helixy Paralelní a smíšené beta skládané listy Antiparalelní beta skládané listy Metaloproteiny a proteiny obsahující disulfidové
vazby
![Page 32: KBC/BPOL - molbio.upol.cz. Struktura proteinu.pdf · Stérickáomezení proúhly phi apsi ... Každý takovýto modul je typickou strukturní jednotkou, která může být nalezena](https://reader033.fdocument.pub/reader033/viewer/2022051718/5a7106e47f8b9abb538c76e1/html5/thumbnails/32.jpg)
Antiparalelní a-helixy Nejjednodušší způsob skládání helixů – krátké spojovací
smyčky a antiparalelní struktury Svazek helixů se často stáčí mírně doleva (15 stupňů) Příklady - myoglobin a hemoglobin
![Page 33: KBC/BPOL - molbio.upol.cz. Struktura proteinu.pdf · Stérickáomezení proúhly phi apsi ... Každý takovýto modul je typickou strukturní jednotkou, která může být nalezena](https://reader033.fdocument.pub/reader033/viewer/2022051718/5a7106e47f8b9abb538c76e1/html5/thumbnails/33.jpg)
Antiparalelní a-helixy
![Page 34: KBC/BPOL - molbio.upol.cz. Struktura proteinu.pdf · Stérickáomezení proúhly phi apsi ... Každý takovýto modul je typickou strukturní jednotkou, která může být nalezena](https://reader033.fdocument.pub/reader033/viewer/2022051718/5a7106e47f8b9abb538c76e1/html5/thumbnails/34.jpg)
Paralelní a smíšené b-skládané listy
Paralelní b-skládané listy obsahují nepolární residua na obou stranách listu
Obě strany listu musí být chráněny před kontaktem s rozpouštědlem - jedná se o vnitřní struktury
Paralelní b-barely Dvojitě vinuté paralelní b-skládané listy
![Page 35: KBC/BPOL - molbio.upol.cz. Struktura proteinu.pdf · Stérickáomezení proúhly phi apsi ... Každý takovýto modul je typickou strukturní jednotkou, která může být nalezena](https://reader033.fdocument.pub/reader033/viewer/2022051718/5a7106e47f8b9abb538c76e1/html5/thumbnails/35.jpg)
Paralelní beta barelParalelní b-barel
![Page 36: KBC/BPOL - molbio.upol.cz. Struktura proteinu.pdf · Stérickáomezení proúhly phi apsi ... Každý takovýto modul je typickou strukturní jednotkou, která může být nalezena](https://reader033.fdocument.pub/reader033/viewer/2022051718/5a7106e47f8b9abb538c76e1/html5/thumbnails/36.jpg)
Dvojitě vinuté paralelní b-skládané listy
![Page 37: KBC/BPOL - molbio.upol.cz. Struktura proteinu.pdf · Stérickáomezení proúhly phi apsi ... Každý takovýto modul je typickou strukturní jednotkou, která může být nalezena](https://reader033.fdocument.pub/reader033/viewer/2022051718/5a7106e47f8b9abb538c76e1/html5/thumbnails/37.jpg)
Antiparalelní b-skládané listy
Antiparalelní b-skládané listy obsahují nepolární residua pouze na jedné straně listu
Pouze jedna strana musí být chráněna před kontaktem s rozpouštědlem
Antiparalelní b-skládané listy můžou tedy obsahovat pouze dvě vrstvy
Struktury: barel, beta sandwich a listy pokryté helixy na jedné straně
![Page 38: KBC/BPOL - molbio.upol.cz. Struktura proteinu.pdf · Stérickáomezení proúhly phi apsi ... Každý takovýto modul je typickou strukturní jednotkou, která může být nalezena](https://reader033.fdocument.pub/reader033/viewer/2022051718/5a7106e47f8b9abb538c76e1/html5/thumbnails/38.jpg)
Antiparalelní b-skládané listy: barel
![Page 39: KBC/BPOL - molbio.upol.cz. Struktura proteinu.pdf · Stérickáomezení proúhly phi apsi ... Každý takovýto modul je typickou strukturní jednotkou, která může být nalezena](https://reader033.fdocument.pub/reader033/viewer/2022051718/5a7106e47f8b9abb538c76e1/html5/thumbnails/39.jpg)
Antiparalelní b-skládané listy: sandwich
![Page 40: KBC/BPOL - molbio.upol.cz. Struktura proteinu.pdf · Stérickáomezení proúhly phi apsi ... Každý takovýto modul je typickou strukturní jednotkou, která může být nalezena](https://reader033.fdocument.pub/reader033/viewer/2022051718/5a7106e47f8b9abb538c76e1/html5/thumbnails/40.jpg)
Antiparalelní b-skládané listy: list pokrytý helixy
![Page 41: KBC/BPOL - molbio.upol.cz. Struktura proteinu.pdf · Stérickáomezení proúhly phi apsi ... Každý takovýto modul je typickou strukturní jednotkou, která může být nalezena](https://reader033.fdocument.pub/reader033/viewer/2022051718/5a7106e47f8b9abb538c76e1/html5/thumbnails/41.jpg)
Metaloproteiny a proteiny obsahující disulfidové vazby
Většinou méně než 100 residuí Struktura značně ovlivněna koordinační vazbou
na kov a/nebo disulfidovými můstky Nestabilní když je kov odstraněn nebo disulfid
chemicky redukován
![Page 42: KBC/BPOL - molbio.upol.cz. Struktura proteinu.pdf · Stérickáomezení proúhly phi apsi ... Každý takovýto modul je typickou strukturní jednotkou, která může být nalezena](https://reader033.fdocument.pub/reader033/viewer/2022051718/5a7106e47f8b9abb538c76e1/html5/thumbnails/42.jpg)
![Page 43: KBC/BPOL - molbio.upol.cz. Struktura proteinu.pdf · Stérickáomezení proúhly phi apsi ... Každý takovýto modul je typickou strukturní jednotkou, která může být nalezena](https://reader033.fdocument.pub/reader033/viewer/2022051718/5a7106e47f8b9abb538c76e1/html5/thumbnails/43.jpg)
Proteinové moduly Řada proteinů je tvořena jako skládačka dvou či více
modulů (domén) Každý takovýto modul je typickou strukturní jednotkou,
která může být nalezena i v jiných proteinech Někdy jsou moduly použity opakovaně v rámci jednoho
proteinu Použití modulů v přírodě má genetický základ
![Page 44: KBC/BPOL - molbio.upol.cz. Struktura proteinu.pdf · Stérickáomezení proúhly phi apsi ... Každý takovýto modul je typickou strukturní jednotkou, která může být nalezena](https://reader033.fdocument.pub/reader033/viewer/2022051718/5a7106e47f8b9abb538c76e1/html5/thumbnails/44.jpg)
Proteinové moduly
![Page 45: KBC/BPOL - molbio.upol.cz. Struktura proteinu.pdf · Stérickáomezení proúhly phi apsi ... Každý takovýto modul je typickou strukturní jednotkou, která může být nalezena](https://reader033.fdocument.pub/reader033/viewer/2022051718/5a7106e47f8b9abb538c76e1/html5/thumbnails/45.jpg)
Proteinové domény v různých organismech
![Page 46: KBC/BPOL - molbio.upol.cz. Struktura proteinu.pdf · Stérickáomezení proúhly phi apsi ... Každý takovýto modul je typickou strukturní jednotkou, která může být nalezena](https://reader033.fdocument.pub/reader033/viewer/2022051718/5a7106e47f8b9abb538c76e1/html5/thumbnails/46.jpg)
Funkční a evoluční význam domén
fibronectin DNA-binding proteins
![Page 47: KBC/BPOL - molbio.upol.cz. Struktura proteinu.pdf · Stérickáomezení proúhly phi apsi ... Každý takovýto modul je typickou strukturní jednotkou, která může být nalezena](https://reader033.fdocument.pub/reader033/viewer/2022051718/5a7106e47f8b9abb538c76e1/html5/thumbnails/47.jpg)
Kvarterní struktury
Stabilita: redukce poměru povrch k objemu Efektivita uložení genetické informace Sdružování katalytických míst - kooperativita
![Page 48: KBC/BPOL - molbio.upol.cz. Struktura proteinu.pdf · Stérickáomezení proúhly phi apsi ... Každý takovýto modul je typickou strukturní jednotkou, která může být nalezena](https://reader033.fdocument.pub/reader033/viewer/2022051718/5a7106e47f8b9abb538c76e1/html5/thumbnails/48.jpg)
Kvarterní struktury: oligomery
![Page 49: KBC/BPOL - molbio.upol.cz. Struktura proteinu.pdf · Stérickáomezení proúhly phi apsi ... Každý takovýto modul je typickou strukturní jednotkou, která může být nalezena](https://reader033.fdocument.pub/reader033/viewer/2022051718/5a7106e47f8b9abb538c76e1/html5/thumbnails/49.jpg)
Kvarterní struktury: asociace
![Page 50: KBC/BPOL - molbio.upol.cz. Struktura proteinu.pdf · Stérickáomezení proúhly phi apsi ... Každý takovýto modul je typickou strukturní jednotkou, která může být nalezena](https://reader033.fdocument.pub/reader033/viewer/2022051718/5a7106e47f8b9abb538c76e1/html5/thumbnails/50.jpg)
Kvarterní struktury: imunoglobuliny
![Page 51: KBC/BPOL - molbio.upol.cz. Struktura proteinu.pdf · Stérickáomezení proúhly phi apsi ... Každý takovýto modul je typickou strukturní jednotkou, která může být nalezena](https://reader033.fdocument.pub/reader033/viewer/2022051718/5a7106e47f8b9abb538c76e1/html5/thumbnails/51.jpg)
Literatura
Garett, R. and Grisham, C.: Biochemistry 2nd ed., Harcourt Brace & Company, Orlando, FL, USA 1999
Alberts, B.: Molecular Biology of the Cell, 5th ed., Garland Science, New York, NY, USA 2008