Gérer ses références bibliographiques avec Mendeley · Mendeley - 23/03/12 Citer les...
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Gérer ses références bibliographiquesavec Mendeley
Pôle Formation IST
Dominique Fournier, Inra, ERIST MontpellierApérodoc IRD, 26 juin 2012
Objectifs de la présentation� Découvrir les principales fonctionnalités du logiciel
� la collecte des références bibliographiques (import àpartir de différentes sources et/ou autres logiciels, saisie manuelle, …)
� la gestion des références (dossier, tag, …)� leur utilisation dans un document (citation, bibliographie,
style)� Le partage de références bibliographiques
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Caractéristiques de Mendeley
� Projet créé en 2008 par des chercheurs et pour des chercheurs
� Ce n’est pas un logiciel libre (open source), mais la version gratuite offre beaucoup de fonctionnalités
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Inspiré des outils collaboratifs
Mendeley, c’est …� Un outil de :
� gestion de références bibliographiques et d’aide à la publication
� lecture et annotation (pdf)
� découverte (plateforme web, papers, groups, tendance des
disciplines, …)
� … qui vous permet de :� Ajouter et organiser les résultats de vos recherches
bibliographiques (import de références bibliographiques et de pdf,
liens avec EndNote, Zotero, JabRef)
� Collaborer avec des collègues en partageant des références et
annotations
� Accéder à votre environnement de travail à partir de n’importe où
(accès web, mobile) 4
Mendeley, c’est aussi …
� Plateforme web de partage de références bibliographiques � + de 30 millions de Papers (références bibliographiques
avec lien vers le texte intégral et qqs OA). Possibilité de les sauvegarder vers Mendeley
� groupes thématiques publics (Groups) que l’on peut suivre (RSS), rejoindre (Join, Follow) et interagir (ask a question or comment)
� profils de scientifiques (People)
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Données 28/10/11
Données 25/06/12
Une communauté très active� Des développeurs qui répondent aux demandes des
utilisateurs (votes, …): Support / Feedback
� Blog, Upcoming Events & Webinars, Advisors, …
� Répartition des usagers et des formateurs
http://mapmyfield.com/ http://www.mendeley.com/advisors/
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Une version gratuite avec des limites …
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1 GB pour espace personnel sur le web (My Library)100 MB pour les espaces partagés (Groupes)
Avant 15/06/12 :
500 MB
Shared Web Space
Avant 15/06/12 :
5 groupes privés
avec 10 membres
Mendeley Institutional Edition� http://www.swets.com/mendeley
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Nouveauté
Pas encore testé à l’IRD et à
l’Inra
� Nécessité de se créer un compte (� People)
� Télécharger le logiciel
Mendeley Desktop My Library
Gestion basique des références
Fonctionnalités plus complètes
(doublons, annotations pdf, …),
Lien vers le traitement de texte,
Déclenchement de la synchronisation
avec le serveur
Paramétrage des transferts (pdf)
Gestion basique des références
(ajouts de références, création de
dossiers et de groupes)
Import direct des références à
partir des sites web
Pour utiliser Mendeley
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Collections, listes
de publications,
collections
partagées
Détail du contenu des
références (infos
bibliographiques, tags, notes)
Liste des références (documents)
Affichage des références sous forme de citations /
tableau (View Library as citation / table)
Filtrage des références par année, auteurs,
revues ou tags (= mots-clés)
Interface Mendeley DesktopMoteur de recherche
Barre d’outils
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Collecter des références� Ajouts de documents
� Add File (ou glisser déposer) d’un fichier pdf
� génération automatique de la référence bibliographique + PDF
� Add File d’un fichier contenant plusieurs références
bibliographiques (export RIS de ScienceDirect, Export
EndNote XML, …)
� Add Folder (dossier contenant plusieurs pdf)
� Watch Folder (créer une référence dès que nouveau pdf
dans le dossier « surveillé)
� Saisie manuelle assistée (index de termes existants,
Mendeley – 26/06/1211
Importer à partir du WebDans ce cas, les références sont sauvegardées dans My
Library (synchroniser pour les retrouver en local DeskTop)
�Sauvegarder des références de la plateforme Mendeley
(Papers, Groups)
�A partir d’un site « compatible », cliquer sur barre de
navigation personnelle
�Au préalable, Installer Web Importer
� Tools > Install web Importer
� Dashboard Mendeley – 26/06/1212
My library sur Mendeley Web� Onglet My Library� Dossiers permanents� Possibilité de créer des dossiers (Folder) dans lesquels
les références pourront être classées (multipositionnement possible).
� On retrouve le même contenu et le même classement que dans la version locale
Références les +
récentes
Références
nécessitant une
relecture
Mes publications
(que je peux afficher
dans mon profil)
Toutes les références
de ma bibliothèque
Mes références
que je préfère
Dossiers personnels
(Create Folders)13
My library sur iPhone, iPad et iPod
� Voir démo à la pause
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Gérer les références
� Toutes les références ajoutées dans Mendeley sont
dans All Documents
� Créer des Folders (dossiers, collections)
� Les références peuvent être supprimées
du Folder (remove from collection) ou
définitivement (Delete)
� Elles peuvent être multipositionnées dans plusieurs
folders 15
Gérer les références (2)
� Détection de doublons (Tools > Chek duplicates)
� Recherche (par titre, mots clés, notes, revue)
� Recherche par filtre (auteurs, tags, mots clés,
revues)
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Personnaliser les références
� Favoris / à lire
� « Fiche de lecture » dans Notes
� « tags » : marqueurs personnels (classement, …)
� Annoter les pièces jointes (pdf)
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Sauvegarde et échanges avec d’autres applications
� Possibilité de sauvegarder toute la librairie ou collection(s) ou quelques documents sélectionnés
� File > Export � Format : RIS, BibTex, EndNote XML
� Help > Create Backup � Sauvegarde sur Mendeley Web par synchronisation
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Sélectionner le format d’export
RIS � Zotero, EndNote
BibTex � JabRef
EndNote XML � EndNote X
Mendeley - 23/03/12
Lien avec les traitements de texte
� Application compatible avec les différents traitements de texte
� Windows Word 2003, 2007, 2010
� Mac Word 2008, 2011
� Open Office 3,2
� BibTex
� Installation d’un plug-in
19Mendeley - 23/03/12
Citer les références dans un fichier word 2010 (1)
� L’application Mendeley Desktop doit être ouverte
� La barre d’outils Mendeley Cite-o-Matic est accessible dans
l’Onglet References de Word 2010
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Insert Citation : pour
sélectionner les
références à insérer
dans le texte
Style : détermine le format
pour la mise en forme de la
citation et de la référence
dans la bibliographie
Insert Bibliography :
met en forme la
bibliographie du
documentMendeley - 23/03/12
Citer les r éférences dans un fichier word 2010 (2)
� Cliquer sur l’icône « Insert Citation »
� Recherche dans la base Mendeley (ou dans une collection spécifique)
� Aller dans Mendeley en cliquant sur « Go to Mendeley » ou en ouvrant
l’application
� Sélectionner la (ou les) référence(s) et cliquer sur « Send Citation to Word
Processor »
� Pas de possibilité d’insérer les références par un simple Glisser-
Déposer ou Copier-Coller
21Mendeley - 23/03/12
Le partage de références avec MendeleyCréation de groupes à partir de Mendeley Desktop ou de
Mendeley web Create group
Propriétés du groupe : Edit settings (Private, Public)
Invitation des invités par mail : Edit settings > Members
Droits des invités : admin (= owner), member, follower
Les membres ont tous le droit d’écriture et de lecture (travail
collaboratif)
Transfert du contenu des dossiers gérés localement avec Mendeley
Desktop Settings > Synchronisation des pièces jointes
Affichage de ses publis dans son profil personnel Mendeley
(People): se fait automatiquement à partir de la collection « My
Publications »
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Création d’un groupe� Dans la version gratuite : possibilité de créer 1 seul groupe
avec au maximum 3 membres (dont vous !)
Groupe sur invitation : seuls les
membres ont le droit
d’alimenter le contenu du
groupe
Private :
Groupe privé dans lequel on peut partager des
fichiers et dont le contenu n’est visible qu’aux
personnes que vous avez invitées
Adapté à un programme de recherche et un
travail à distance.
Public
Groupe public bénéficiant d’une grande
visibilité sur Mendeley Web (et sur les
moteurs de recherche)
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Gestion des références d’un groupe� Les références du groupe peuvent être ajoutées par:
� un ajout de document (Add documents) à partir de Desktop ou My
Library
� un simple glisser-déposer (Desktop) (1)
� un déplacement à partir d’un autre groupe (sélectionner la référence
puis Add to) à partir de My Library (2)
� un import sur le web (avec le plug-in Import to Mendeley) et classer ensuite la référence Recently Added dans le groupe 24
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Accès aux références d’un groupe
� Le contenu du groupe est accessible à partir de leur espace
Mendeley sur le web (My library > Groups) et en local (Groups)
� Seuls les membres du groupe (member) peuvent y ajouter des
références au groupe
� Les followers peuvent copier les références dans leurs
dossiers personnels et les utiliser dans leur bibliographie
Accès au groupe à
partir de My
Library (web)
Accès au groupe à
partir de Mendeley
Desktop 25
Les options de Mendeley (Desktop)
� Tools > Options > General
� Paramétrage des options pour synchronisation des pièces
jointes des différents folders et groupes
� Visualisation de vos « espaces » alloués
Mendeley – 14/06/1226
Indiquer vos identifiants
Mendeley pour
synchronisation
Espace comparable à
celui offert par Zotero
Espace x 10 par rapport à
celui offert par Zotero
Nombre de groupes et
membres à inviter
Pour en savoir plus sur Mendeley
� Pour en savoir plus : http://www.mendeley.com/ Videos / Tutorials
� Pour se former http://www.mendeley.com/ Upcomings events & Webinars
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Des questions ?
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Merci pour votre attention
� Support réalisé par Dominique Fournier, 25 juin 2012
� Accessible avec les autres supports Apéro Doc
https://www.mpl.ird.fr/documentation/formation_historique.html
� Comparatif Zotero, EndNote X4, JabRef et Zotero
http://www.ist.agropolis.fr/images/PDF/grille-comparative-zotero-jabref-mendeley-endnote.pdf
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