Évolution des répertoires géniques Équipe Bioinformatique et Génomique Évolutive BBE.
Génomique des Plantes Spécificités des plantes Pourquoi les étudier Génomes des Plantes...
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Génomique des Plantes
Spécificités des plantes
Pourquoi les étudier
Génomes des Plantes
Génomique des régulations postranscriptionelles
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Les plantes ne sont pas des animaux…
Différences plantes/animaux:- paroi rigide- clivage cellulaire incomplet, continuité cytoplasmique (plasmodesmes)- pas de migrations cellulaires- différenciation cellulaire déterminée par l’environnement (position) plutôt que par l’appartenance à une lignée clonale- morphogenése modulaire et indeterminée
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Multicellularity occurs independently in the plant and animal lineages
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Plant cells: Totipotency• Most plant cells and tissues can be cultured and organize in new plants
• somatic embryogenesis or organogenesis (shoots and roots)
• zygote not necessary
• not in vitro artefact but exists in nature
Embryon somatique
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Cell proliferation
Cell expansion
Specific features of Plant growth: continuous organ production
La production de cellules se fait continuellement dans les meristémes qui produisent des organes de facon iterativeLes cellules subissent ensuite une croissance tres importante par expansion et deviennent photosynthétiques (différenciation) A la floraison, les meristemes végétatifs se transforment en meristemes d’inflorescence -> pas de lignée germinale
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plasmodesmata forms symplasmic connections by trapping the endoplasmic reticulum by the cell plate:
Specific features of plant cells: division
Construction de la paroi a milieu de la cellule en division
Cytoplasmic connections: macromolecular (RNA, proteins trafic
promoteur GFP
protein-GFP
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Biotechnologie végétale
Les végétaux (algues, plantes terrestres) sont, avec les bactéries photosynthétiques, les seuls organismes capables de faire rentrer le
carbone dans les chaînes trophiques: ils sont donc à la base de toute la production alimentaire (y compris élevage), et d’une bonne partie des
productions énergétiques (bois, énergies fossiles, huiles) et industrielles (bois, papier, fibres, composites, sous-produits divers)
Biocarburants: colza, palmier à huile, microalgues
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Domestication ex: le maïs (zea mays)
La domestication à porté sur la sélection de peu de caractéres et s’est accompagnée d’une importante réduction de diversité génétique.Souvent sélection de polyploïdes (plus grande taille des organes) -> perte de la capacité de croisement avec variétés sauvages (blé, hexaploïde; pomme de terre: tétraploïde)