Generation Time

12

description

Generation Time. and. Genomic Evolution. in Primates. Vincent M. Sarich & Allan C. Wilson. Science, Volume 179: 1144-1147, 1973. מנחה: דר' טל פופקו. מציג: עמרם שי. היום נדון באבולוציה ברמה המולקולרית בהיבט הזמן, אופן מדידת הזמן והשפעותיו. - PowerPoint PPT Presentation

Transcript of Generation Time

Page 1: Generation Time
Page 2: Generation Time

AbstractAbstract

היום נדון באבולוציה ברמה המולקולרית בהיבט הזמן, אופן מדידת הזמן והשפעותיו.

אל Generation-Timeבעיקר נדון בגישת ה-מול

Astronomical Timeגישת ה-

Page 3: Generation Time

Generation TimeGeneration Time

?Generation-Timeמה זה בעצם

PresentTime

A (Human)

B (Tree-Shrew)

מספר השינויים (החלפות בסיסים) פרופורציונלי למספר הדורות.

:תחזית יותר החלפות בסיסים יותר דורות מאז ההתפצלות זמן-דור קצר

כיצד ניתן לנצל זאת כדי לאתר כיצד ניתן לנצל זאת כדי לאתר ?....?....אירועי התפצלותאירועי התפצלות

Page 4: Generation Time

במה מתבטא השוני בין המינים?במה מתבטא השוני בין המינים?מה הבסיס לשוני זה?מה הבסיס לשוני זה?

גנים שונים

חלבונים שוניםחלבונים שונים

Hemoglobin - a Protein

DNA

Page 5: Generation Time

כימות ההבדלים ומדידתםכימות ההבדלים ומדידתם

?באילו שיטות נשתמש כדי לבחון את ההבדל

רצפי חלבונים של מינים שהתפצלו מוקדם יותר, מראים רצפי חלבונים של מינים שהתפצלו מוקדם יותר, מראים הבדלים גדולים יותרהבדלים גדולים יותר

PCR ,זכה בפרס נובל על 1983 (פותח ע"י קארי מוליס .כך).

DNA Hybridization.

Precipitin Reaction.

MC’F (Micro-Complement Fixation).

Page 6: Generation Time

סיכום בינייםסיכום ביניים

הנחת Generation-Time טוענת שזמן דור קצר ייגרום

מאז ההתפצלות..D.N.A ליותר שינויים ב-

השוני בין מינים מתבטא, בין השאר, באופן מולקולרי בדנ"א שלהם ולכן בחלבונים.

את השוני ניתן למדוד בשיטות שונות, במקרה הזה MC’F.

אם כן – כיצד נעצב את העץ הפילוגנטי...?

Page 7: Generation Time

בניית העץ הפילוגנטיבניית העץ הפילוגנטי

x -ו y מייצגים את מספר החלפות-הבסיסים שחלו בין

מאז שחלקו B ו-Aמינים לאחרונה אב-קדמון

משותף.

x+yהשוני בין המינים יהיה

A

B

C

x

yT1T1

PresentTimeMillions of years

z

Page 8: Generation Time

בניית העץ הפילוגנטיבניית העץ הפילוגנטי

באופן דומה משווים .B-C ובין A-Cמרחקים בין

לדוגמא....x+y=30x+z=43y+z=47

כיצד ייראה העץ הפילוגנטי...?

A

B

C

x

yT1T1

PresentTimeMillions of years

z

A

B

C

x

yT1T1

PresentTimeMillions of years

z

Page 9: Generation Time

בניית העץ הפילוגנטיבניית העץ הפילוגנטי

A

B

C

x

yT1T1

T2T2

PresentTimeMillions of years

z

3ניצור מהמרחקים משוואות:

x+y=30x+z=43y+z=47

y-x=42y=34

x=13x=13;; y=17y=17;; z=30z=30

A

B

C

13

17T1T1

T2T2

PresentTimeMillions of years

30

Page 10: Generation Time

תוצאותתוצאות\Primates\Primates לבין לבין CarnivoraCarnivora בין כמה מיני בין כמה מיני ..I.DI.Dנערכה השוואת נערכה השוואת

ProsimianProsimian

Immunological Dist.

Homo sapiens 162

Macaca mulatta (Rhesus Monkey) 166

Ateles geoffroyi (Spider Monkey) 149

Nycticebus coucang (Slow Loris) 125

Lemur fulvus (Brown Lemur) 135

Tarsius spectrum (Tarsier) 137

Tupaia glis (Tree Shrew) 156

Pro

simian

Pro

simian

Page 11: Generation Time

תוצאותתוצאותI.DI.D..-של האדם גבוה יותר מה- של האדם גבוה יותר מה I.DI.D..-של כ"א מה- של כ"א מה ProsimianProsimian..

אין קורולציה בין זמן דור ובין המרחקים – אין קורולציה בין זמן דור ובין המרחקים –

זמן דור הקצר ביותר, ולאדם הארוך ביותר! זמן דור הקצר ביותר, ולאדם הארוך ביותר!Tree ShrewTree Shrewל-ל-

Immunological Dist.

Homo sapiens 162

Tupaia glis (Tree Shrew) 156

Pro

simian

Pro

simian

??Generation-TimeGeneration-Timeמה המשמעות של זה לגבי מה המשמעות של זה לגבי

Page 12: Generation Time

Prosimians